1L68A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKAELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l68A00
1D9WA 168LA 4ARLA 3C82A 201LA 1L92A 3L2XA 1QTHA 212LA 213LA 1L04A 3FI5A 2RB2X 1L05A 125LA 243LA 1C69A 4GBRB 1QTVA 1ZWNA 2IGCA 159LA 1C6CA 2ANVA 3DMXA 1CVKA 2NTGA 209LA 1QUDA 1C6DA 1L18A 143LA 1C60A 2B6YA 1L16A 1LYDA 1QT7A 3SBBC 1C6IA 3DMZA 2OTYX 218LA 1L69A 1C6PA 4LZMA 1L64A 122LA 3QAKA 1KW5A 3HT8A 4EKSA 120LA 1C6TA 1L17A 2RBSA 2LZMA 1PQJA 1L36A 161LA 129LA 1L76A 1G0QA 1L08A 3DKEX 4GRVA 4W55A 1B6IA 177LA 3GUMA 3DNAA 1CUQA 2OTZX 1L75A 3SN6R 240LA 4W59A 4PK0A 1CU2A 157LA 1L29A 3HT7A 3NY8A 231LA 4ARQB 200LA 2RBPA 221LA 1KY1A 3HUAA 1L38A 223LA 1QT6A 184LA 3NYAA 111LA 1L82A 1P37A 227LA 2F2QA 2LC9A 2O4WA 2O79A 1CU3A 3PDSA 1L90A 2Z6BA 187LA 1PQMA 1QUOA 1L27A 1L58A 247LA 1L30A 170LA 1C6FA 253LA 4I7JA 1C6QA 1C66A 3HUQA 1T6HA 1KS3A 2Q9EA 1QUHA 1I6SA 1SSYA 4I7SA 230LA 108LA 1L07A 3GUKA 196LA 3OE6A 1SSWA 1NHBA 3G3VA 1L11A 174LA 1L87A 172LA 1CX6A 141LA 1L95A 5LZMA 1L63A 3C8RA 256LA 3HH6A 225LA 3CDVA 3C81A 4W56A 180LA 1L51A 4ARPA 1L0JA 1D2WA 1LYFA 1XEPA 3UONA 1L65A 4I7QA 1OVHA 1L47A 1D3FA 1WTHA 1OVKA 4OO9A 3EMLA 3HUKA 1L73A 1CU6A 102LA 4I7TA 2NTHA 3SB7A 214LA 3GUIA 210LA 1C6HA 160LA 1OWZA 1L99A 1CTWA 241LA 1DYCA 1LYJA 3DN4A 1PQDA 1C6GA 217LA 1L48A 1QS5A 232LA 2RB0X 2O7AA 1PQOA 152LA 3HT6A 1L46A 4EKPA 1CV1A 3HU8A 1KNIA 1C65A 3CDRA 1L15A 4DKLA 4IAPA 139LA 3K2RA 150LA 1G0JA 1L83A 181LA 226LA 175LA 257LA 173LA 211LA 3G3WA 6LZMA 4ARMA 1JQUA 3DN2A 1L37A 238LA 1L13A 233LA 1K28A 1L94A 1L59A 1CV3A 2B6WA 1L34A 1OV7A 158LA 191LA 1L68A 1L89A 1L54A 1P36A 197LA 165LA 1L28A 2OE9X 2F47A 1JTMA 4I7PA 1L03A 3HTFA 4K5YA 1T97A 1D3MA 195LA 1QT4A 1L01A 1C6BA 2CUUA 185LA 1LYHA 1G06A 1QT5A 1L84A 1KY0A 107LA 110LA 1G0KA 2Q9DA 103LA 1L33A 255LA 1QTBA 224LA 1LYGA 1LGUA 4EPIA 228LA 4S0WA 4PJZA 1L25A 3HDFA 4W54A 219LA 1LWKA 1P64A 114LA 3C7WA 3HTBA 1CUPA 1C6KA 1L96A 1LWGA 1P2LA 249LA 1L93A 3FA0A 4EKQA 169LA 1KW7A 1QTZA 3HDEA 3HWLA 151LA 1L39A 1L88A 1LI6A 1C68A 1L14A 3C8QA 1LGWA 3C83A 3CDQA 4ARQA 1D3NA 5I14A 3DN6A 4I7MA 2RH1A 1L62A 3DN0A 4ARJA 1LGXA 3C8SA 1G07A 1CV6A 1C63A 127LA 1L06A 3GUOA 118LA 115LA 1L40A 216LA 4I7LA 1G0PA 254LA 1L85A 4E97A 183LA 2B70A 182LA 1C64A 1QS9A 1L31A 244LA 3DMVA 1C6NA 4EPFA 1DYEA 1L0KA 1XJUA 1P5CA 162LA 1L19A 260LA 3OE0A 2OU0X 192LA 2ANXA 1CV5A 1OWYA 1CV0A 4I7OA 4DJHA 1PQKA 3G3XA 3DN8A 1L79A 1L71A 198LA 1L20A 1QTDA 3SB8A 163LA 2B73A 1L55A 262LA 3C7YA 235LA 3GUJA 1L91A 1SWZA 1OVJA 138LA 1P46A 199LA 2F32A 1L32A 3VW7A 4EKRA 164LA 1SX7A 1QUGA 2RBNA 4I7KA 1DYDA 2HUKA 2RAYX 4YXAC 1L80A 1L52A 1LI2A 4ZPUA 167LA 1ZYTA 222LA 1TLAA 156LA 1ZURA 109LA 4W57A 1L61A 1L50A 1L70A 171LA 1C6LA 123LA 2RB1X 220LA 2L78A 4W58A 1LYIA 188LA 1L86A 1G1VA 1JTNA 1PQIA 259LA 3JR6A 1L45A 1QTCA 2RBQA 3C7ZA 3SB6A 1L74A 4I7NA 4YXCA 3F8VA 258LA 144LA 2B6TA 3SBAA 3HTGA 130LA 1CV4A 112LA 2HULA 3C80A 1T8FA 1LW9A 1L66A 246LA 3PBLA 2RAZX 1L26A 1L23A 1P2RA 3RUNA 3ODUA 4EXMA 3CDOA 3HT9A 1L35A 3NY9A 1DYFA 1DYBA 1QT3A 1OV5A 1T8GA 245LA 206LA 1LPYA 3DN3A 1XJTA 147LA 2B6ZA 1T8AA 1C62A 1OYUA 4LDLA 176LA 215LA 155LA 126LA 178LA 2B7XA 3F9LA 113LA 1L41A 2B74A 2RBRA 1QSBA 142LA 239LA 3DN1A 1QSQA 1SX2A 1L67A 1L43A 1G1WA 1P56A 4AQNA 3SB9A 1C6MA 119LA 3D4SA 1LYEA 149LA 1L60A 2A4TA 2OEAX 3SB5A 166LA 1L77A 3HU9A 1P7SA 1L24A 3GUPA 1P6YA 4LDOA 237LA 3V2WA 1C67A 3HH5A 7LZMA 4DAJA 2LCBA 2OU9A 205LA 1L02A 1L42A 104LA 1QT8A 1DYGA 4W53A 2B75A 2RBOA 1D2YA 1L00A 261LA 146LA 234LA 1G0GA 1C6AA 3LZMA 3OE8A 1C6JA 3OE9A 1L81A 250LA 2OE7X 1LI3A 1L22A 1CU5A 1DYAA 3HH3A 1CX7A 1L44A 1L49A 4W52A 3GUNA 128LA 3FADA 3HTDA 189LA 1C61A 1L57A 186LA 131LA 1L09A 1C6EA 1EPYA 1L10A 251LA 190LA 2OE4X 4YX7C 236LA 1L97A 1L98A 1L53A 229LA 4W51A 1LLHA 252LA 1G0MA 248LA 3V2YA 3CDTA 1L21A 4I7RA 1L12A 1SWYA 4ARMB 3HH4A 137LA 2QARC 1L56A 3GULA 140LA 145LA 1G0LA 148LE 4LDEA 2QB0B 2B6XA 1P3NA 2HUMA 3RZEA 242LA 1L72A 3L64A 2OU8A 4EJ4A 2B72A 1D3JA 1CU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KXXA 4LZTA 1KIPC 2F2NA 1GF4A 3M3UA 1BWIA 1GF5A 3LN2A 243LA 4XADA 1C69A 1REZA 5KXWA 2G4QA 1C6CA 1EL1A 1TEWA 5M1YA 2NTGA 1WTNA 4DDAA 2B6YA 4ZEEA 1C6IA 4DD1A 218LA 1C6PA 1AT5A 4M6DA 1L64A 3LHMA 5FHWA 4PHIA 5KXTA 5KKIA 2RBSA 2LZMA 1PQJA 5I53A 1C10A 1B5ZA 2LZTA 1G0QA 1B6IA 1B7LA 4A7DA 4NHSA 240LA 1LZ8A 4XJIA 5A3EA 1CU2A 1YAOA 1LMNA 1N4FA 4ARQB 4C3WA 5D5CA 3HUAA 223LA 2MEFA 9LYZA 1CU3A 4H9IA 4NHIA 1PQMA 1D0MA 3EBAB 1L30A 2BQOA 3A93A 2Q9EA 4Z46A 1LZAA 4I7SA 4N5RA 4XJDA 1OUBA 1E8LA 1F6SA 1L11A 172LA 1CX6A 5LZMA 1L63A 256LA 1LJHA 225LA 3CDVA 1IC4Y 5II3A 1REXA 1DPWA 1L51A 4ARPA 2BPUA 1B0DA 1SLYA 5B06A 4E3UA 3HUKA 1L73A 1CU6A 2NTHA 1LZEA 4HJYA 5I4WA 1LZGA 1OWZA 241LA 1LJKA 1C43A 2ZIKA 2XBSA 2RB0X 1LZ1A 1BHZA 1UBZA 1CV1A 1XGQC 4LYCA 5F81A 1G0JA 5APEA 257LA 6LZMA 4BAFA 4ARMA 1JQUA 4NGJA 2DKVA 3WU7A 2N5ZA 1OUHA 5LYZA 3A6CY 4TSCA 1K28A 1L34A 3WMKA 4HTNA 1RE2A 4WM5A 1BWHA 1L68A 2AUBA 1HMLA 1NDMC 4GCFA 1L03A 4LYTA 1QT4A 1L01A 4HSFA 1C6BA 4FJRA 185LA 4ETDA 3LZTA 1L84A 1IP4A 2Q9DA 4H91A 1C46A 1L33A 1QTBA 1LSFA 1LYGA 4PJZA 3C7WA 4MR1A 1C6KA 1GD6A 1LWGA 1P2LA 4AXTA 1L93A 4EKQA 151LA 1L39A 1DPXA 4LYOA 1GPQC 1LHMA 4G4BA 3CDQA 2ZQ3A 1D3NA 1LYSA 1AZFA 1G07A 1BB5A 4H9BA 1G0PA 2BQLA 3CSZA 254LA 182LA 244LA 1IWZA 3A94A 5B05A 5F14A 1J1PY 1XJUA 162LA 1L19A 1OUCA 260LA 3G3AB 3MGWA 2OU0X 1ALCA 2LHMA 1CV5A 4DJHA 1CV0A 2ZYCA 3J4GA 1PQKA 4LGKA 1L79A 5HNCA 1YAQA 3CSRA 5IELA 1L20A 1LJIA 4B0DA 4LT2A 1GB0A 1L55A 1L91A 1SWZA 2Q0MX 5IDDA 208LA 2BQBA 2BQAA 164LA 4M4OA 1QUGA 2HUKA 1T6VL 4ZPUA 2LYOA 3TMWA 1L50A 1L70A 3IWRA 1VEDA 2L78A 188LA 1LHHA 1L86A 3LYZA 1HEWA 4ML7A 4YOPA 3TXGA 1JTNA 1L45A 1LHKA 3SB6A 4NHTA 5ILFA 258LA 1IWVA 130LA 1TBYA 3W6FA 1LW9A 1L66A 1HEOA 2RAZX 1L26A 5I5QA 1GXV2 1IWUA 4WL6A 3WU9A 1L35A 1H87A 1JKCA 4WO6A 1DYBA 1QT3A 3TXFA 4H1PA 3WVXA 1LPYA 1IY3A 3DN3A 2B6ZA 4NGZA 4ANRA 4NIJA 1OYUA 155LA 2BQIA 1IWWA 2RBRA 4B4EA 5K7OA 1GB6A 2ZNXY 1HF4A 119LA 4GLVA 2BQKA 4H8XA 2A4TA 2OEAX 2ZWBA 5KXSA 166LA 1LMTA 3WVYA 1L24A 1A2YC 1IOQA 3D3DA 1UICA 2MEBA 4LDOA 3V2WA 1C67A 3TMXA 1GF8A 2LCBA 1QUSA 1L02A 1L42A 1BVXA 4W53A 3OJPA 2LYMA 2ZILA 2YBHA 2ZNWY 1G0GA 3WXTA 1VATA 1LI3A 2HEFA 5LIOA 1GFJA 1L44A 3GUNA 2DQDY 4OWAA 4J1BA 3HTDA 1L09A 3A95A 3ATOA 1L97A 3AW7A 3VWOA 229LA 248LA 2DQIY 3CDTA 1HEMA 1SWYA 4ARMB 5LVGA 1L56A 1A4VA 1GE2A 140LA 4OOTA 4LDEA 1IP5A 4W94A 4WLXA 5KXYA 2OU8A 3WUAA 2MEAA 1LHIA 4XENA 1HENA 5LINA 3C82A 3L2XA 1B5UA 1QTHA 212LA 213LA 1L04A 3FI5A 1LJEA 2YBMA 1L05A 5KXRA 1NKHA 4GBRB 1QTVA 5ILCA 1CVKA 3WYHA 1LSEA 4NSGA 3G3BB 1QUDA 4KXIA 1LYDA 2W1XA 2OTYX 1OQMA 2IFFY 1LJFA 3QAKA 4BAPA 2A7DA 1XGRC 1JPOA 1F0WA 5HNLA 1LCNA 1VDPA 3A3RX 4LT0A 1UC0A 161LA 1D6PA 129LA 1UIHA 5FEKA 1YANA 3HBHA 3AW6A 4GRVA 1LPIA 2YBIA 3DNAA 1GF7A 1L75A 3SN6R 1ZV5L 1OUDA 4W59A 1G7MC 1NDGC 2LZ2A 4PK0A 1B7QA 1G7HC 1HSXA 4HP0A 2RBPA 1KY1A 1QT6A 1JJ1A 3NYAA 1VDTA 1ZVHL 1P37A 227LA 4OW1A 2LC9A 2O4WA 3P4ZA 2Z6BA 1XGUC 1GB7A 1QUOA 4N1EI 1LZRA 1L58A 247LA 4I7JA 1C6QA 4NGVA 1C66A 2EIZC 4DDBA 1T6HA 1LHJA 1GFHA 1KS3A 1DZBX 1I6SA 2Z12A 230LA 196LA 3OE6A 1SSWA 3CT5A 1NHBA 4TWSA 1L87A 3B0KA 3C8RA 1C7PA 4O34A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KXX A;  4LZT A;  1KIP C;  2F2N A;  1GF4 A;  3M3U A;  1BWI A;  1GF5 A;  3LN2 A;  243L A;  4XAD A;  1C69 A;  1REZ A;  5KXW A;  2G4Q A;  1C6C A;  1EL1 A;  1TEW A;  5M1Y A;  2NTG A;  1WTN A;  4DDA A;  2B6Y A;  4ZEE A;  1C6I A;  4DD1 A;  218L A;  1C6P A;  1AT5 A;  4M6D A;  1L64 A;  3LHM A;  5FHW A;  4PHI A;  5KXT A;  5KKI A;  2RBS A;  2LZM A;  1PQJ A;  5I53 A;  1C10 A;  1B5Z A;  2LZT A;  1G0Q A;  1B6I A;  1B7L A;  4A7D A;  4NHS A;  240L A;  1LZ8 A;  4XJI A;  5A3E A;  1CU2 A;  1YAO A;  1LMN A;  1N4F A;  4ARQ B;  4C3W A;  5D5C A;  3HUA A;  223L A;  2MEF A;  9LYZ A;  1CU3 A;  4H9I A;  4NHI A;  1PQM A;  1D0M A;  3EBA B;  1L30 A;  2BQO A;  3A93 A;  2Q9E A;  4Z46 A;  1LZA A;  4I7S A;  4N5R A;  4XJD A;  1OUB A;  1E8L A;  1F6S A;  1L11 A;  172L A;  1CX6 A;  5LZM A;  1L63 A;  256L A;  1LJH A;  225L A;  3CDV A;  1IC4 Y;  5II3 A;  1REX A;  1DPW A;  1L51 A;  4ARP A;  2BPU A;  1B0D A;  1SLY A;  5B06 A;  4E3U A;  3HUK A;  1L73 A;  1CU6 A;  2NTH A;  1LZE A;  4HJY A;  5I4W A;  1LZG A;  1OWZ A;  241L A;  1LJK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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