4WOAA

Lysozyme multiple crystals after surface acoustic wave alignment
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Precise Manipulation and Patterning of Protein Crystals for Macromolecular Crystallography Using Surface Acoustic Waves.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4woaA00
3ATNA 4DC4A 1WQRA 3HBDA 3RT5X 153LA 1JKDA 3GXKA 3A67Y 3A34A 1RCMA 1LJJA 4G4BA 5FEKA 4OWEA 4MSTA 4M6DA 1LHHA 6LYTA 4YEMA 1LTMA 4OWBA 5AMYA 2BQEA 4DD2A 3LZ2A 3M3UA 4NY5A 1QUSA 3T6UA 2A7FA 1FDLY 1YKXX 3AZ4A 2HEDA 1VFBC 2BQOA 4DT3A 3WH1A 4NGOA 5C6IA 1LZEA 208LA 1LZRA 1B5ZA 4H93A 4YM8A 1TDYA 1HMKA 2D4KA 1LJNA 1GF3A 1OUEA 1CJ8A 3SP3A 4QDNA 4TUNA 1YAPA 1DKJA 2DQCY 2W1XA 4WLDA 4WM3A 4B49A 1HSWA 1YL1X 2D4JA 1LJ4A 1KXXA 2EQLA 3AYQA 4XYYA 4UWNA 1YIKA 1LZDA 4BS7A 1LSZA 2BAAA 4NHSA 2BQHA 1UIGA 1AT6A 2YBJA 5I4WA 2DKVA 3P4ZA 1C46A 1WTNA 2H9KA 4HV1A 1GFRA 4II8A 4PRUA 1D6QA 1CKDA 5KXMA 1JSFA 4DD1A 2I6ZA 4R6CA 1VDTA 1YQVY 1LYSA 1VATA 3D3DA 1EQ4A 1IOSA 5DLAA 2MEGA 1TCYA 2VB1A 2ZYPA 2XBRA 4DYGA 1G7HC 1LYOA 193LA 2MEHA 3RNXA 3WYHA 1BHZA 1IP4A 5FHWA 4W94A 1ZV5L 5B59A 4N9RA 3AZ5A 4R0FA 1IORA 4LYCA 1LZCA 4MCKA 1FN5A 1OUAA 1IC4Y 1OUFA 1UCOA 2XTHA 3B0KA 3LYMA 4G49A 4NGIA 2ZQ3A 1LJFA 4XENA 3TMUA 3WXTA 1UICA 4GCEA 1NDMC 1BB4A 1WQNA 3T36A 2HEAA 1FLWA 4WMGA 4LGKA 3TXEA 4EOFA 1HF4A 1HMLA 1LSEA 1QDRA 2DQHY 4BADA 2FYCA 4H92A 1GEZA 1IO5A 1AM7A 1GF8A 2DQFC 2DQDY 2FBDA 5IDDA 4AXTA 4NEBA 1B7SA 4H8ZA 4NGYA 1J1PY 4NG8A 1RI8B 3LYZA 1LZNA 1EQ5A 3LYOA 1B9OA 4KXIA 4TTDA 1J1XY 2LYMA 3RW8A 5C6JA 9LYZA 2YSSC 1IR8A 1YL0X 1REMA 4ETAA 3IJVA 1IOCA 3RZ4A 3WUNA 1FLYA 2FYDA 3KAMA 1LZ9A 1VDQA 4N1EI 2BQFA 2W1MA 2ZWBA 4DDAA 4ET9A 2W1YA 1IP3A 1NKHA 4HJZA 3A90A 3K3TA 1LMNA 2F4AA 4H8XA 1KIRC 1UIBA 4ETEA 4B4JA 2HEBA 3J6KA 1W08A 2LYOA 1BVXA 4Z3MA 4IJ4A 4XJHA 1B7PA 1DI4A 1G7JC 3VWOA 2WARA 3HBHA 1LZ4A 1WVUA 2F4GA 1JJ3A 5LYZA 3WUAA 1JEFA 1GXXA 2YBHA 4M4OA 1GBWA 1LSNA 1GB0A 4P2EA 2D91A 1BWHA 1IP6A 4DD3A 3GXRA 2F30A 1OQMA 1XEKA 2MEEA 1GF5A 4FDYA 1PZYA 1IX0A 1IP2A 3A6BY 4HJYA 1UUZC 4LT3A 1P2CC 3CT1A 3IJUA 5KXPA 1C7PA 5LA8A 132LA 1LMPA 1HEMA 4PJ2C 3AGGG 5APEA 1HNLA 5LIOA 2BQLA 4N1CC 3W3EA 1IP5A 1GAYA 1RFPA 1UIHA 1LZ6A 5APFA 4PHIA 5J7CA 3RU5A 1UIAA 3AZ6A 4NHIA 3ZEKA 2Z19A 1BVKC 2DQAA 3TXBA 1IOTA 1F0WA 3D9AC 5KXTA 1BB7A 1DXJA 1REXA 3B0IA 1YAQA 1IWXA 1YKYX 5L9JA 1YAOA 1D0LA 1WVVA 4QEQA 1GFVA 4NWEA 5HQ1A 2DBTA 1BWIA 5FELA 4ETCA 1GFJA 1IY4A 1AKIA 4XN6A 4DD0A 3WW5A 3AZ7A 1H6MA 5KXWA 1D0MA 5E4PA 2ZNXY 135LA 5DN4A 2MECA 1GB2A 1GB5A 3TMWA 3B72A 1BB5A 4OOTA 4RDSA 4LT2A 1LMCA 4DDBA 4XJDA 2YBNA 1LSFA 1QUTA 1F6SA 5KXSA 5DM9A 1G7MC 2HTXA 4HTNA 4PPOA 3ULRA 4GCCA 4C3WA 4NIJA 1HEOA 1KXYA 2YVBA 4HPEA 4NGLA 1N4FA 1UIFA 3CT0A 1QIOA 4J1AA 2ZIJA 1CKHA 2EKSC 4TWSA 4HSFA 5II3A 1LJKA 2H5ZA 3A3QA 1GEVA 3BKVA 2HUBA 3EBAB 4OWHA 4TSCA 4D9ZA 1LSDA 1LHJA 2MEDA 4KL7A 2YBMA 2BQGA 4NSJA 5B06A 5LA5A 4AGAA 1KIQC 2ZYCA 1XEJA 4HPIA 2Z2EA 4N8ZA 3A96A 2YBLA 4YEOA 1LPIA 4HV2A 1NMMA 1XGUC 2HU3A 5ILFA 1GBZA 1LHIA 3LZTA 5B05A 5FCPA 2HEFA 4CJ2A 1EQEA 3OK0A 1JPOA 3WVYA 4NSHA 2HU1A 7LYZA 2CGIA 1CJ7A 1GF7A 1IWZA 1VAUA 5E9RA 4ETBA 3LHMA 1NHEA 1REYA 1LZGA 4X3BA 3HBEX 3A6CY 1WQQA 1IEEA 3OJPA 3A94A 1LSBA 1GXV2 5LVGA 2MEBA 1B7QA 3LYTA 1LJIA 1B5WA 1GDWA 5KKJA 2BQJA 2F2NA 1WTMA 1LZTA 1C43A 1JJ1A 4XJFA 1HSXA 5F9UA 4C5FA 5D5FA 1JSEA 1D6PA 4PGJB 4IATA 1O23A 4YOPA 4N5RA 4N0JA 2Q0MX 2A7DA 3AGHA 2W1LA 3MGWA 1IR7A 1DPXA 3P65A 4XJBA 5EBHA 1HEQA 1I20A 2CWIA 1GE1A 1AZFA 1YANA 4NG1A 3W6FA 1GFKA 5IELA 1HFXA 5APDA 4J7VA 1LHKA 4YENA 1JITA 1FKVA 5I53A 5LINA 5FDJA 4ET8A 4ZEEA 1LZAA 1PS5A 1IC7Y 1E8LA 1JTPL 1GB7A 4LZTA 1DPWA 3F6ZA 4J1BA 1JWRA 1BQLY 1GE2A 1HHLA 4QGZA 4WM5A 5KXZA 1JUGA 4TX7A 3TXKA 4B4IA 5M1YA 4WLYA 2IFFY 3A93A 3AJNA 4XJIA 5LYTA 1LAAA 1W6ZA 3CSZA 4NHQA 1D0KA 5F9XA 3WU7A 3WULA 1B7LA 3G3AB 1LZ5A 1YAMA 3M18B 1TEWA 4H8YA 3CB7A 2G4QA 1NWGA 3N9CA 5D5CA 4Z46A 1UACY 1B7OA 3W6DA 4QY9A 1IWVA 1GBOA 1JIYA 1B5XA 5LVKA 2NWDX 1CJ9A 1V7TA 4ETDA 1D9UA 1GB9A 1KXWA 1XFPL 1IOQA 4LYTA 4TSBA 4H9CA 4XJGA 1JHLA 3TMVA 4DDCA 1JKCA 1LJGA 1OUJA 3FE0A 1FLQA 1MELL 4GN5C 4GLVA 1GE4A 4H9EA 2LYZA 3W6CA 2EPEA 1GB6A 1NBYC 3A3RX 5KY1A 1LSMA 2XJWA 4NGJA 1B2KA 1OUHA 4WO9A 1C08C 3AGIA 2EIZC 4WLTA 5LVIA 2BQMA 2Z37A 3ZVQA 1DI5A 1HEWA 1GPQC 1LJ3A 1QQYA 3WPLA 4OOOA 4WM4A 1IC5Y 1ZMYL 1FBIX 4HTKA 1LKSA 4GN4A 4RLNA 3QNGA 1GFEA 4U3XB 1UA6Y 1QDTA 2G4PA 1QTKA 1ZVHL 4KPMA 1DZBX 1IR9A 3CSQA 1HENA 3AB6A 4H91A 5A3ZA 4GCFA 6LYZA 5L3HA 1IVMA 1VDPA 194LA 1GDXA 2N5ZA 4BAPA 1NDGC 5KXKA 2BQAA 5FSTA 1JKBA 1IWYA 1DKKA 4H9AA 5F16A 1GE3A 1GF9A 1NBZC 3P68A 4UWVA 5HMJA 5I5QA 1RJCB 4MR1A 1C10A 3CSRA 5F14A 4NGWA 2Z38A 133LA 1LZ1A 1LYYA 1UBZA 3EO5A 4A7DA 4G9SA 2D4IA 2ZQ4A 3B6LA 2Y8PA 3WU8A 3WUMA 4RW1A 1T6VL 5KXYA 1GHLA 1ZVYB 1GAZA 4BAFA 8LYZA 5I54A 5KXXA 4GCBA 2BQDA 2DQEY 1LSPA 1IWWA 1LSCA 2DQIY 4CFOA 2BQKA 1LJEA 3A91A 1WQMA 2AUBA 2BLYA 3TXHA 1YILA 1GFUA 5LAGA 2C8PA 1A2YC 3CT5A 3FI7A 4O34A 3W6AA 5KXNA 1BWJA 3HFMY 5KJ9A 1HC0A 1TAYA 4OWAA 1CKGA 1TBYA 1BB3A 5B07A 1G7IC 5KXLA 2Z39A 4CHXA 4WO6A 4WG1A 1XGPC 1IP7A 1F6RA 154LA 1GBSA 1HERA 4HP0A 1WQOA 4LFPA 5B1GA 4ML7A 1B7NA 2X0AA 4L41A 1XGQC 1H87A 1B5VA 3EMSA 4G4CA 4ZFPA 5HNCA 5DN5A 1DI3A 4NSGA 3N9AA 1JKAA 1XEIA 2HEEA 1HFYA 1YROA 5L3IA 4WLXA 4H9BA 1LSYA 2DQJY 5C6LA 1C45A 2IHLA 2LZTA 1NQIA 4NHPA 1REZA 1GFHA 3WMKA 1VDSA 4B4EA 1SLYA 1QTEA 1B5YA 1XGTC 134LA 3WU9A 2MEAA 4WM6A 1RE2A 1CJ6A 4B0DA 5A3EA 1ALCA 3A8ZA 4NWHA 2BQBA 4LT1A 5IHGA 1B5UA 3A92A 1GB8A 1OUDA 1F10A 2BQCA 4B1AA 4G4HA 1J1OY 1Z55A 5T3FA 1I56A 1GB3A 1BGIA 4DWXA 3QE8A 3TXDA 2G4NA 3WW6A 1VEDA 1GF6A 1UC0A 2DQGY 1LKRA 4LYBA 2BQIA 4RLMA 3TXJA 1QSWA 4UWUA 1JJ0A 2LHMA 3W6BA 4ZIXA 5HMVA 4HTQA 4LYMA 4ANRA 3BKHA 2Z12A 3TXIA 2Z2FA 1LOZA 2RSCA 4NGZA 5LAFA 1IIZA 3EXDA 1WQPA 3P66A 1HEPA 3P64A 1CNSA 5ILCA 1B0DA 2CJLA 207LA 5KKIA 1INUA 4FJRA 5LVJA 1GF0A 2ZIKA 2CDSA 4IASA 3A95A 2C8OA 1BB6A 4H9HA 4KT3A 1B7RA 4GLAA 2MEFA 4DD9A 4NHTA 3QY4A 1FLUA 4I0CA 4W96A 1JTTL 1LMOA 4LYOA 3W6EA 2D6BA 1OUIA 1LYZA 4WM1A 3CQLA 3WVXA 5I4YA 5HLLA 1GF4A 4NFVA 2I26L 4Z98A 3ZVQB 3B0OA 4J0LA 3WXUA 4GCDA 2GV0A 5KXOA 1UIEA 1LZ8A 4WOAA 1DQJC 4LYZA 5F81A 1LMTA 1GBYA 5LYMA 4XADA 2BPUA 3TMXA 4WM2A 1CKFA 2B5ZA 4I8SA 1GD6A 1KIPC 1QSAA 2YDGA 3AW6A 2YBIA 4NGKA 4DD7A 4LT0A 2BQNA 2ZILA 1IP1A 5LXWA 2ZNWY 3ATOA 1JISA 5JENB 3G3BB 4CGEA 4OWCA 5I4XA 1HELA 1OUGA 1CKCA 4H90A 3WPKA 1AT5A 2Z18A 1IWUA 4CFPA 1YKZX 3IWRA 1GFAA 2BLXA 5LVHA 1G7LC 1GWDA 5K7OA 4H1PA 4H9FA 1LMQA 1LZSA 1FKQA 1NF5A 4GN3A 4NSIA 1UIDA 1T3PA 1A4VA 2XBSA 4WL6A 3TXFA 1I1ZA 1B7MA 1OUBA 1OUCA 4RW2A 2I25L 4EMNA 2PC2A 4H9IA 1MLCE 1LSGA 3J4GA 3WL2A 1XSFA 1LSAA 2H9JA 1XGRC 5KXRA 3E3DA 1OP9B 4HJVA 2HECA 5HNLA 1EL1A 4E3UA 4YF2A 3LN2A 1V7SA 1LZYA 1SQ2L 1LJHA 3WPJA 1LZBA 1IWTA 1LHMA 1LHLA 4Z41A 3AW7A 3TXGA 2LZ2A 1HFZA 4NGVA 4WL7A 1LMAA 4OW1A 3N9EA 4WG7A 5APCA 4PRQA 1JTOL 1GFGA 5DL9A 1GFTA 4LFXA 5B1FA 1GE0A 1LCNA 2MEIA 1GBXA 2FBBA 4H94A 1IY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B74A 146LA 219LA 3A67Y 1LJJA 4I7TA 4OWBA 1L96A 4DD2A 2A7FA 1FDLY 3WH1A 5C6IA 1LZEA 4I7MA 123LA 3NYAA 1G06A 1HMKA 2D4KA 1GF3A 118LA 4TUNA 1YAPA 2OE4X 4WLDA 1HSWA 1YL1X 1LJ4A 2EQLA 4UWNA 1QTVA 1LSZA 1L81A 2DKVA 1KY0A 4HV1A 4PRUA 1GFRA 1D6QA 1LYSA 1VATA 177LA 1G7HC 193LA 3RNXA 1L36A 1L33A 4W94A 137LA 3AZ5A 165LA 1OUAA 2XTHA 245LA 4GCEA 1D3JA 2HEAA 1FLWA 2DQHY 4BADA 4LDLA 4AXTA 1C6JA 1C60A 1J1PY 1QT4A 1RI8B 4YXCA 1LZNA 1EQ5A 1QT5A 1DYFA 3RW8A 1IR8A 1IOCA 2FYDA 1LZ9A 3OE9A 226LA 2BQFA 4N1EI 3NY9A 1QTZA 1IP3A 4HJZA 3A90A 176LA 3C8SA 1W08A 1CV3A 4DQ7A 3VWOA 2WARA 1WVUA 3C83A 1JJ3A 3WUAA 4M4OA 1GB0A 155LA 1L20A 218LA 1C6BA 1PZYA 1IX0A 1L42A 1P2CC 1QUDA 3CT1A 3IJUA 4PJ2C 1HEMA 1QT6A 1HNLA 3RU5A 1UIAA 1L48A 4NHIA 1F0WA 5KXTA 1DXJA 1REXA 3B0IA 1YAQA 5L9JA 1KY1A 4NWEA 5HQ1A 1L47A 5FELA 4XN6A 3WW5A 1H6MA 5KXWA 1D0MA 3FA0A 1GB2A 1L10A 1XEPA 3B72A 1LMCA 1L95A 2YBNA 1LSFA 1L56A 2HTXA 4PPOA 111LA 4GCCA 262LA 3CT0A 215LA 4J1AA 1CKHA 2EKSC 4TWSA 1CU5A 3EBAB 4TSCA 1LSDA 4KL7A 1L49A 230LA 2HU3A 254LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ATN A;  4DC4 A;  1WQR A;  3HBD A;  3RT5 X;  153L A;  1JKD A;  3GXK A;  3A67 Y;  3A34 A;  1RCM A;  1LJJ A;  4G4B A;  5FEK A;  4OWE A;  4MST A;  4M6D A;  1LHH A;  6LYT A;  4YEM A;  1LTM A;  4OWB A;  5AMY A;  2BQE A;  4DD2 A;  3LZ2 A;  3M3U A;  4NY5 A;  1QUS A;  3T6U A;  2A7F A;  1FDL Y;  1YKX X;  3AZ4 A;  2HED A;  1VFB C;  2BQO A;  4DT3 A;  3WH1 A;  4NGO A;  5C6I A;  1LZE A;  208L A;  1LZR A;  1B5Z A;  4H93 A;  4YM8 A;  1TDY A;  1HMK A;  2D4K A;  1LJN A;  1GF3 A;  1OUE A;  1CJ8 A;  3SP3 A;  4QDN A;  4TUN A;  1YAP A;  1DKJ A;  2DQC Y;  2W1X A;  4WLD A;  4WM3 A;  4B49 A;  1HSW A;  1YL1 X;  2D4J A;  1LJ4 A;  1KXX A;  2EQL A;  3AYQ A;  4XYY A;  4UWN A;  1YIK A;  1LZD A;  4BS7 A;  1LSZ A;  2BAA A;  4NHS A;  2BQH A;  1UIG A;  1AT6 A;  2YBJ A;  5I4W A;  2DKV A;  3P4Z A;  1C46 A;  1WTN A;  2H9K A;  4HV1 A;  1GFR A;  4II8 A;  4PRU A;  1D6Q A;  1CKD A;  5KXM A;  1JSF A;  4DD1 A;  2I6Z A;  4R6C A;  1VDT A;  1YQV Y;  1LYS A;  1VAT A;  3D3D A;  1EQ4 A;  1IOS A;  5DLA A;  2MEG A;  1TCY A;  2VB1 A;  2ZYP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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