1QT3A

T26d mutant of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYDIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 Lysozyme)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt3A00
1CV5A 234LA 1C68A 228LA 2ANVA 4EJ4A 1CU6A 1C64A 3V2YA 2RB2X 156LA 4W56A 3HUQA 1C6JA 1CV0A 231LA 1CU3A 1LGUA 3HT8A 1G06A 4W52A 3FA0A 1C6DA 1L49A 1LWKA 1L15A 1L44A 3PDSA 1L90A 1LW9A 1SSYA 2LCBA 1KW7A 1KY0A 3C8RA 1OV5A 3CDRA 1D2WA 1L25A 1L13A 155LA 138LA 253LA 1PQMA 1L54A 130LA 1L06A 1L85A 4I7NA 4ARQA 1ZYTA 1L73A 1L37A 4ARJA 4LZMA 3C82A 160LA 187LA 215LA 1SX7A 192LA 1T8FA 3DN8A 3JR6A 1L41A 201LA 1G1WA 166LA 1KY1A 1L18A 2OTYX 1CVKA 125LA 3QAKA 5I14A 123LA 2B6XA 176LA 1L94A 4I7PA 4EPIA 149LA 1D3JA 1XJUA 1QT7A 1L08A 246LA 1I6SA 1DYFA 214LA 2OE4X 217LA 4LDEA 1L53A 120LA 1PQJA 1L86A 2OE9X 180LA 178LA 4YXAC 3DNAA 4W57A 1L67A 1CUQA 1QUDA 1CU5A 206LA 1L24A 3SBBC 1L64A 1QSQA 1C6PA 2B72A 3GUNA 168LA 1C66A 1OVKA 4DJHA 3CDTA 3GULA 1K28A 3HT7A 119LA 1ZWNA 2HUMA 172LA 258LA 4W53A 4I7KA 2B6WA 1L39A 1L52A 1L07A 1L22A 3OE9A 2LC9A 1L04A 1OV7A 1L12A 2L78A 4ARQB 115LA 4YXCA 260LA 3LZMA 1L03A 3HT6A 148LE 1LYJA 114LA 235LA 108LA 144LA 2RB0X 219LA 1P7SA 1L47A 1QT3A 3GUIA 1L26A 4ARLA 2B73A 1SWYA 198LA 111LA 1P6YA 3DN0A 1L93A 3CDOA 1QTZA 3NY8A 1C6NA 3D4SA 227LA 3C7WA 165LA 1L65A 2RAYX 1P2RA 2A4TA 3HUAA 1L82A 113LA 3F8VA 1L43A 158LA 3GUOA 2HULA 1L57A 1L99A 3HH6A 1QTCA 189LA 141LA 200LA 1L29A 213LA 1L71A 226LA 1L11A 3G3VA 1P37A 107LA 3ODUA 183LA 3DMVA 261LA 1C6FA 1LYIA 242LA 167LA 4I7LA 1LI2A 110LA 3RZEA 4LDLA 1DYGA 188LA 1L21A 1C6IA 1L09A 128LA 1LI6A 1L66A 1D2YA 4I7SA 1LYEA 1QT5A 1QT6A 104LA 2B6TA 1L31A 150LA 2RBNA 1L63A 2F2QA 161LA 4DAJA 239LA 3GUJA 112LA 1C62A 4K5YA 1QS5A 247LA 1QUHA 1T97A 4I7MA 1LYGA 4DKLA 162LA 1T8GA 157LA 2RBRA 1C6KA 1C6MA 1L75A 3G3WA 4ARMB 205LA 103LA 256LA 1G0QA 1CX7A 1CUPA 139LA 3HDFA 1KS3A 2O4WA 3DKEX 127LA 1C6HA 254LA 1LLHA 3UONA 1D3FA 197LA 1L79A 3C81A 1G1VA 3HT9A 1C6LA 1QSBA 1XEPA 159LA 3CDVA 1G0MA 3FADA 1L87A 1LWGA 2O79A 1C6AA 1L10A 2O7AA 3DN4A 1C6QA 3SB5A 1L40A 3OE0A 1QUOA 4EPFA 1OVHA 1TLAA 2RBOA 140LA 2OEAX 3PBLA 190LA 1L60A 1WTHA 152LA 3HU8A 1OVJA 1G0GA 1LGXA 3OE6A 211LA 137LA 4ARPA 1L83A 218LA 249LA 243LA 1PQKA 3SB7A 232LA 221LA 1L96A 4E97A 2B70A 3GUKA 196LA 3CDQA 1LYHA 1G0JA 3GUPA 1L97A 146LA 1P46A 1L00A 1L70A 222LA 4YX7C 2NTHA 1L19A 1L0JA 1P2LA 1C60A 4S0WA 1QT4A 3HH5A 109LA 3DN2A 1DYCA 2RH1A 1PQDA 4EXMA 2F47A 1L51A 3NY9A 3C83A 1JQUA 3DN6A 1L20A 1ZURA 2OU8A 1QTVA 2LZMA 1CV6A 1CX6A 1L32A 223LA 250LA 182LA 2RBSA 1SSWA 163LA 1P64A 1L62A 3FI5A 4EKQA 1OWYA 2Q9DA 1L34A 1DYBA 1L74A 1C6EA 1LYFA 1C6CA 1D3MA 2B6ZA 1L17A 212LA 2CUUA 230LA 2OE7X 4PK0A 252LA 4W59A 2IGCA 1CV4A 1QUGA 1L23A 4GRVA 2Z6BA 1D3NA 5LZMA 3SB9A 147LA 1L42A 2RBQA 2NTGA 1G0LA 1L05A 4I7OA 255LA 244LA 2B6YA 1SX2A 236LA 4EKSA 2OU9A 1KNIA 1C65A 143LA 1L84A 3RUNA 195LA 3SN6R 3GUMA 4PJZA 3K2RA 199LA 1L59A 1L16A 1L95A 145LA 1L30A 1C67A 2B74A 1JTMA 2OTZX 3HUKA 4GBRB 3HWLA 2B75A 233LA 3HTDA 1CU2A 1P3NA 1L56A 1G0KA 229LA 4AQNA 3OE8A 257LA 224LA 237LA 1EPYA 1L0KA 4LDOA 3L64A 4W58A 1D9WA 3C7YA 3DN1A 2OU0X 122LA 1L72A 1L48A 3HTFA 2HUKA 4W51A 1JTNA 1KW5A 4EKRA 118LA 4EKPA 3SB6A 1L36A 1L01A 4I7RA 1T6HA 181LA 2RB1X 3F9LA 173LA 4OO9A 1CU0A 1L89A 1LYDA 241LA 1P56A 209LA 170LA 240LA 1C6BA 3NYAA 1NHBA 1L68A 1LPYA 4W55A 245LA 3DN3A 1QTBA 3DMZA 3G3XA 4I7QA 3SB8A 1L91A 1DYEA 1QTDA 1L76A 2QB0B 3SBAA 259LA 1P36A 1L61A 1L28A 4ZPUA 4I7JA 1PQOA 102LA 151LA 1C6TA 3HTBA 1QTHA 4IAPA 3C80A 1L35A 1LGWA 1XJTA 3HTGA 1L92A 2ANXA 1CV1A 1OWZA 2B7XA 1C61A 1L77A 262LA 1L46A 1T8AA 169LA 1L14A 3HDEA 1L27A 3HU9A 2Q9EA 2RAZX 1PQIA 1L02A 238LA 184LA 225LA 210LA 1L98A 7LZMA 1QS9A 1L88A 1OYUA 2RBPA 220LA 1G0PA 1L45A 248LA 3C7ZA 129LA 1DYAA 1L81A 142LA 1L69A 1QT8A 3VW7A 3HH4A 186LA 175LA 1C63A 3HH3A 1C6GA 3C8QA 1L55A 6LZMA 3EMLA 4ARMA 164LA 2F32A 1C69A 4W54A 185LA 174LA 171LA 131LA 3V2WA 191LA 216LA 3C8SA 1CV3A 2QARC 1B6IA 3DMXA 1LI3A 1G07A 1SWZA 251LA 1L38A 126LA 1CTWA 1DYDA 1L50A 1P5CA 4I7TA 1L80A 1L58A 1L33A 177LA 3L2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LT3A 1C68A 1BB3A 1CU6A 1GBXA 1C64A 156LA 1HEOA 1UIGA 1CV0A 4DT3A 1C6DA 2XBRA 1DQJC 3A67Y 1AKIA 1GAYA 3C8RA 1GB2A 2DQCY 1D2WA 4WO6A 4W96A 253LA 2FBBA 1PQMA 1L54A 130LA 1YL0X 4XJIA 1L85A 1ZYTA 5FDJA 1XSFA 187LA 192LA 1T8FA 1NHEA 1G1WA 1KY1A 4H9AA 3QAKA 1L94A 4G4HA 1GE2A 2D91A 1J1XY 1DYFA 4PJ2C 154LA 1JIYA 1IP4A 178LA 1L67A 1QUDA 2F30A 3RT5X 1OVKA 2XQOA 4WM4A 4I0CA 2DQEY 1ZWNA 1GWDA 4LT1A 4ET9A 1LZEA 1YKYX 2HUMA 4I7KA 1L39A 1L52A 1L22A 3OE9A 1LAAA 1JJ3A 1L12A 4ARQB 4NY5A 260LA 148LE 1D0LA 1LYJA 108LA 5KKIA 198LA 2W1XA 1L93A 5A3EA 1QTKA 1C7PA 2A4TA 5LVIA 4B4JA 158LA 1IP1A 1CKDA 2YBJA 5I54A 213LA 3LN2A 1P37A 1OUIA 183LA 3DMVA 1JWRA 1LSPA 4DDAA 2LZ2A 4WM1A 1LI2A 3P68A 4LDLA 4LFXA 1L21A 3A3RX 1L09A 4HTKA 4NFVA 1L66A 1D2YA 2Z12A 3IWRA 1IC4Y 1LHJA 4WM3A 4YM8A 4DQ7A 3WUAA 2B6TA 1GF7A 4AXTA 2G4NA 2RBNA 4DAJA 239LA 1C62A 2EIZC 1LZCA 1QS5A 1QUHA 4OOTA 3B0OA 1C6MA 205LA 4FJRA 1G0QA 1CX7A 1CUPA 1LZ5A 3T36A 3WL2A 1D3FA 4CGEA 1IP5A 1G1VA 1C6LA 1XEPA 4WM2A 1GE3A 4ETEA 1LJKA 1B7NA 1B7QA 2O7AA 3DN4A 1C6QA 1CKCA 1L40A 1FLWA 1CJ6A 1TLAA 5LYTA 3WPJA 3ATOA 4NHPA 3PBLA 1REYA 3HU8A 4LYOA 4NWEA 1CKGA 4ARPA 1L83A 1PQKA 3SB7A 1QDTA 232LA 2HEEA 4E97A 2B70A 1EQEA 4PRUA 1G0JA 1L97A 3WW5A 5L3IA 2Z2FA 1XEJA 1QT4A 3HH5A 1REXA 4Z98A 1LMAA 1LMCA 1DYCA 1LSFA 1KIQC 4EXMA 5EBHA 2F47A 1LSMA 1VAUA 3NY9A 3C83A 1LMNA 1QTVA 2LZMA 3MGWA 4TWSA 1CX6A 4D9ZA 2RBSA 1BB4A 1L62A 4OWCA 1LKSA 1DYBA 2BQHA 3TXGA 3W6AA 3LYTA 1W08A 1HSWA 4IATA 1JUGA 4ZIXA 3N9AA 4LGKA 1CV4A 1GPQC 1L23A 4LT2A 1KXYA 1B5YA 1D3NA 2G4PA 1GF8A 4KL7A 4ETCA 5LVJA 1OUFA 5LVKA 3CT5A 4LT0A 4OW1A 4EKSA 1LYSA 2OU9A 4GLVA 1L84A 5I4WA 195LA 3CSZA 4N9RA 3GUMA 1IVMA 199LA 1L95A 3A6BY 1L30A 1LJEA 5LA5A 1OUCA 1JTMA 3HUKA 1AZFA 4DD7A 1O23A 2DQIY 1P3NA 3AZ4A 2YSSC 2W1LA 1IC7Y 3A96A 257LA 3OE8A 5FHWA 3AYQA 1D9WA 1IWVA 122LA 1L72A 1L48A 1QDRA 3HTFA 4W51A 1IWZA 1YQVY 1L36A 1T6HA 181LA 173LA 4O34A 3W6EA 1CU0A 1HNLA 5K7OA 1IR9A 1L68A 1GFUA 1LPYA 1LZ4A 3DN3A 3DMZA 2HEDA 3G3XA 1GB3A 4HJYA 3AGHA 1L76A 4G4BA 1DPWA 3SBAA 5IDDA 1PQOA 4Z3MA 1QTHA 4EOFA 5IELA 1L35A 5B1FA 2I6ZA 2ZNWY 1L92A 3D3DA 1LSZA 1OWZA 2FYCA 1NKHA 4OWHA 2RAZX 1LZ8A 1XEIA 1B5UA 225LA 210LA 7LZMA 2ZYCA 4H8ZA 2BQKA 1HMKA 4PRQA 2RBPA 4X3BA 4LYMA 2DQGY 1DPXA 4TTDA 1LJ3A 207LA 3W6CA 129LA 1LMTA 2DBTA 3AGIA 4J1BA 153LA 5LYZA 1WTMA 1CJ9A 3C8QA 6LZMA 3RU5A 4ARMA 5HQ1A 185LA 3A6CY 1YAPA 3WU8A 4WO9A 5KXTA 1NDMC 2BQAA 2Z2EA 1CTWA 1WQNA 1L50A 1BB6A 4I7TA 1ZV5L 1L33A 4CHXA 228LA 1GB8A 2LYMA 2D4JA 3CQLA 4DD2A 5KXPA 4CFOA 1D6PA 3HUQA 5FCPA 1CU3A 1FLQA 4LYTA 1VDTA 4W52A 3FA0A 1L49A 5M1YA 2VB1A 1L90A 1LW9A 2LCBA 1KY0A 1HFXA 1Z55A 1A4VA 5AMYA 5LINA 4BAPA 1JKCA 4ARQA 1L73A 2BQCA 4ARJA 4KT3A 1L41A 2BQEA 201LA 1IOTA 1NBZC 4YEOA 2OTYX 1CVKA 2H5ZA 125LA 1VDSA 1UUZC 1GBOA 4I7PA 4GLAA 1B5ZA 3CT1A 1QT7A 4H93A 4H90A 1L08A 4LDEA 5J7CA 4W94A 120LA 1C43A 2OE9X 1UC0A 2Z37A 3DNAA 4HTNA 3ULRA 4LYCA 1L64A 2B72A 4YENA 4HJVA 1IWWA 4DJHA 5DN5A 3A95A 2A7FA 2A7DA 5KXRA 4H91A 1F6RA 1FKVA 1G7MC 135LA 2WARA 2YVBA 5FSTA 1LSBA 4YXCA 3B0IA 114LA 235LA 4NGKA 2RB0X 2D6BA 1WQOA 3LZ2A 1B9OA 1DI3A 2YDGA 2B73A 1QSWA 1QTZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LT3 A;  1C68 A;  1BB3 A;  1CU6 A;  1GBX A;  1C64 A;  156L A;  1HEO A;  1UIG A;  1CV0 A;  4DT3 A;  1C6D A;  2XBR A;  1DQJ C;  3A67 Y;  1AKI A;  1GAY A;  3C8R A;  1GB2 A;  2DQC Y;  1D2W A;  4WO6 A;  4W96 A;  253L A;  2FBB A;  1PQM A;  1L54 A;  130L A;  1YL0 X;  4XJI A;  1L85 A;  1ZYT A;  5FDJ A;  1XSF A;  187L A;  192L A;  1T8F A;  1NHE A;  1G1W A;  1KY1 A;  4H9A A;  3QAK A;  1L94 A;  4G4H A;  1GE2 A;  2D91 A;  1J1X Y;  1DYF A;  4PJ2 C;  154L A;  1JIY A;  1IP4 A;  178L A;  1L67 A;  1QUD A;  2F30 A;  3RT5 X;  1OVK A;  2XQO A;  4WM4 A;  4I0C A;  2DQE Y;  1ZWN A;  1GWD A;  4LT1 A;  4ET9 A;  1LZE A;  1YKY X;  2HUM A;  4I7K A;  1L39 A;  1L52 A;  1L22 A;  3OE9 A;  1LAA A;  1JJ3 A;  1L12 A;  4ARQ B;  4NY5 A;  260L A;  148L E;  1D0L A;  1LYJ A;  108L A;  5KKI A;  198L A;  2W1X A;  1L93 A;  5A3E A;  1QTK A;  1C7P A;  2A4T A;  5LVI A;  4B4J A;  158L A;  1IP1 A;  1CKD A;  2YBJ A;  5I54 A;  213L A;  3LN2 A;  1P37 A;  1OUI A;  183L A;  3DMV A;  1JWR A;  1LSP A;  4DDA A;  2LZ2 A;  4WM1 A;  1LI2 A;  3P68 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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