4CJ2A

Crystal structure of hewl in complex with affitin h4
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/de novo protein
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Potent and Specific Inhibition of Glycosidases by Small Artificial Binding Proteins (Affitins)
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus acidocaldarius
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4cj2A00
1G7MC 1FLWA 2LHMA 4WG1A 2LYMA 1BB4A 1D0LA 2XJWA 1NBZC 2Z39A 2BQGA 3A92A 3M18B 1YL1X 3G3BB 4DD0A 1JIYA 1IC4Y 4NHTA 1LJGA 4TUNA 5B1FA 5KKIA 1FKVA 1LHLA 1T6VL 3F6ZA 1BGIA 1B5ZA 1OP9B 5KKJA 2D4IA 5HLLA 4CFOA 4LT2A 1JPOA 5FDJA 4LYOA 1BB6A 3FI7A 3GXKA 4O34A 4KXIA 1LHKA 1NMMA 2XTHA 3TMWA 5D5CA 1GBXA 4NGKA 1IC5Y 1LCNA 4NGYA 4ANRA 3J6KA 5LA8A 1YKXX 4NSGA 4G4HA 1LHHA 1IX0A 4NY5A 3WVXA 3CQLA 4W96A 2CDSA 1VAUA 3A6BY 5FHWA 1IP6A 1NDGC 1YKZX 4L41A 4OWCA 2Z12A 5HNLA 1C08C 2HU1A 1CKHA 1JJ0A 4J0LA 4ETEA 1FBIX 1LZSA 4MCKA 3WPKA 4PGJB 3WUAA 3ATNA 2DQEY 2EIZC 2DBTA 3EO5A 1UIFA 1GD6A 1LMOA 1HELA 1JKBA 3WXUA 4C5FA 3TXGA 1B5XA 4H8YA 1IP7A 3LYMA 2BQIA 2CWIA 4HJVA 3A8ZA 2IFFY 3B6LA 1LYSA 1LJ3A 2N5ZA 1GE2A 2VB1A 3EMSA 4II8A 4NHSA 3W6DA 1B5WA 2I26L 1UCOA 1UICA 4G4CA 1LYYA 1GBWA 3WPLA 1GF9A 1WTNA 4R6CA 9LYZA 1ZV5L 5B07A 3W6EA 3AZ6A 4NSIA 5LVKA 5KXZA 4B0DA 2C8OA 1GF6A 4H9FA 4NFVA 1PS5A 1LSFA 1GFRA 1OUJA 3ATOA 3P66A 3W6CA 1GFJA 1LJIA 2ZIKA 5L3HA 1CKDA 1LSEA 1GBZA 4YEOA 1HF4A 4NHIA 4H9BA 1LMNA 5LYMA 1REYA 1VEDA 4HV1A 1JJ1A 1IWXA 2BQCA 2I6ZA 1OUHA 1REXA 1IY4A 3A6CY 3LHMA 2DQJY 2PC2A 4AGAA 1G7HC 2W1MA 3FE0A 2YBLA 4GLVA 1CKCA 1F0WA 1NKHA 2B5ZA 3ZVQB 4H94A 5KXWA 1C10A 4Z98A 1LZRA 1VDSA 1YANA 4RLMA 1JSEA 1YIKA 4H9HA 3LZTA 4KL7A 1GXV2 2Z19A 1G7JC 2DQAA 4YOPA 3LYZA 1LHMA 3AW6A 5I53A 193LA 5APFA 1IWWA 2AUBA 1QUTA 1GB2A 4H1PA 1YAPA 2D4KA 4QDNA 3CB7A 3AZ4A 1FDLY 1WVUA 2BQJA 4BS7A 3TXIA 3TXBA 1AM7A 3A93A 1B7SA 1EL1A 1HEPA 1VDQA 1B7OA 1IOCA 3OJPA 3WH1A 1HC0A 4UWVA 1KIPC 135LA 1KXXA 2BQAA 1LSBA 1YL0X 1GBSA 4MSTA 3WL2A 3WUNA 3WW6A 1NF5A 3IJVA 1IP2A 4RDSA 4H9IA 4NGZA 1WQOA 3TXHA 1EQEA 2RSCA 3CT1A 4HTKA 1WQNA 5KXSA 4OWHA 1LZ5A 2Y8PA 5LVGA 2C8PA 3QNGA 3B0OA 4N5RA 1LYZA 4WLXA 1LMTA 1RJCB 2DKVA 5T3FA 5FSTA 1FLQA 1LJEA 2ZQ3A 3WMKA 5KJ9A 153LA 1YILA 4NSJA 4GLAA 3RT5X 5IHGA 1W6ZA 1LSDA 2FYCA 1RCMA 1ZVYB 4G9SA 4HPIA 1F6SA 4XJFA 1AT5A 3AGGG 6LYTA 3AGIA 1JWRA 4IJ4A 2ZYCA 4TX7A 1GFGA 132LA 4B49A 1IP1A 3RNXA 4GCEA 4WM3A 1LZCA 2HECA 4WM2A 3AZ7A 4ET9A 4BADA 4CGEA 4DD2A 3KAMA 1LZDA 2MEDA 2Q0MX 1DXJA 4R0FA 2ZNWY 5HMJA 2G4PA 2H9KA 5KXTA 1GB3A 1BB5A 1SLYA 3MGWA 1WVVA 1GAYA 1GFUA 1EQ5A 1INUA 1YROA 1C7PA 1B7QA 1GB8A 1UIGA 1J1PY 1B7LA 2BQKA 3WU7A 4WLDA 3WULA 1B7NA 2HEFA 2ZIJA 8LYZA 7LYZA 1D6PA 3HBHA 1LJKA 5C6IA 3N9EA 1RFPA 4H93A 5APDA 3OK0A 3WPJA 1TDYA 1CJ8A 4NGWA 5KXNA 1LSCA 1LZ6A 1G7IC 1YKYX 1C43A 1GB9A 3B72A 1JJ3A 1UIAA 1VDPA 5JENB 1YAOA 2Z2EA 1B2KA 3N9AA 4PRUA 3W6FA 1DI5A 2HEBA 2MECA 4XJIA 1HEQA 1LJHA 1LZ8A 1QDRA 4W94A 5F9UA 4H91A 3RW8A 5I4XA 1D0KA 1NBYC 2DQCY 5B59A 1CNSA 3LYOA 2MEIA 1WQQA 207LA 4NGVA 4XJBA 3A94A 5KXYA 4B4IA 5F16A 4H9AA 2X0AA 4NGOA 4LFPA 5B05A 4IATA 1JKDA 1TAYA 5LXWA 1IWTA 1I20A 1XGPC 2D91A 1B7MA 4I0CA 5KXPA 3A3RX 4N1EI 4QY9A 3AZ5A 5J7CA 1HENA 3IJUA 1GDWA 4DWXA 3BKHA 4LT0A 5LA5A 2D6BA 1I1ZA 1QSWA 1XGUC 4GCCA 5D5FA 4OOOA 4C3WA 4LYTA 2DQGY 4NG8A 4DDBA 3CSQA 4HTQA 2BQEA 1JKCA 2NWDX 1HEMA 5LYZA 4EOFA 1FLUA 4MR1A 2XBRA 4DD7A 1AZFA 1GFHA 1HEWA 3WYHA 1LMQA 1LSYA 5EBHA 4HSFA 1XGQC 4RW2A 1IWYA 4WG7A 2YVBA 2BPUA 4NHPA 4LT1A 1D6QA 1QIOA 4EMNA 4YENA 1B0DA 4N9RA 2BAAA 2ZILA 1LZEA 3TXDA 1CKGA 3P64A 4NEBA 4UWNA 4OW1A 1H6MA 3A34A 1JHLA 1GF3A 1IO5A 1CKFA 2G4QA 4RLNA 3A67Y 1GXXA 2EQLA 4CJ2A 1LOZA 4WL7A 4DC4A 2MEFA 3TXEA 3TXJA 1UACY 4LYBA 1HFXA 1LYOA 1REMA 4QGZA 1HFZA 1LSGA 2DQFC 2HUBA 2DQIY 2ZYPA 1GPQC 1QDTA 4B1AA 1FLYA 4XENA 1J1XY 1IR7A 1LJ4A 4BAPA 5LIOA 1YQVY 3EXDA 2ZQ4A 1KXYA 1LZGA 5B1GA 4NIJA 1MELL 3E3DA 3LN2A 4TTDA 3CT0A 4ETBA 1CJ9A 1GEVA 1UIEA 4XYYA 1BB7A 2HEEA 2H9JA 3AYQA 4H92A 4Z3MA 4GN5C 2D4JA 4H9EA 3ZVQA 1XGTC 1NQIA 1LZYA 3TMVA 3LZ2A 3RU5A 1XFPL 4B4JA 1GFTA 1OUIA 4WM4A 2IHLA 3A3QA 4WLTA 3CSRA 1UIDA 1DPWA 2W1XA 4LT3A 4ETAA 1P2CC 4GCBA 2MEEA 4HPEA 5LVIA 4ETDA 1IWVA 1LHIA 4Z41A 1G7LC 1FKQA 1GF7A 5KXLA 1JEFA 1HMKA 3A90A 1LAAA 4NHQA 4DD3A 2BQLA 1Z55A 4IASA 1IWUA 1IR8A 3EBAB 5AMYA 5KXXA 1GFAA 1UUZC 1IR9A 2BQDA 4XJHA 3QY4A 1D9UA 3HBEX 3RZ4A 1IOQA 2FBBA 4H8XA 4LYCA 5KXKA 1LHJA 1LKSA 1GB5A 1IOSA 4B4EA 1LSNA 3CT5A 1HNLA 1GE3A 1B9OA 5LVJA 2CJLA 1A2YC 1KIQC 1GF5A 1YAQA 2Z37A 3M3UA 2Z2FA 1B7PA 4PRQA 2BQFA 1AKIA 1I56A 2LYZA 1UIHA 1BHZA 3SP3A 5C6LA 5I4WA 4M4OA 1QUSA 4OOTA 1KIRC 4YEMA 1IP5A 1LZ1A 3WVYA 4NGLA 5F9XA 2HTXA 4NGJA 4Z46A 4H90A 4H8ZA 1LZAA 2EKSC 3AB6A 5IELA 1GE4A 4HJZA 1VATA 1OUEA 1DI4A 3B0KA 4PJ2C 2Z38A 4ETCA 1LJNA 1TEWA 3ZEKA 4KT3A 1LZTA 3GXRA 1B5UA 5FEKA 4YM8A 3WXTA 1RI8B 2YBJA 5FELA 1GAZA 3D3DA 5HQ1A 2XBSA 3J4GA 4J1BA 1DKKA 4LZTA 1GE1A 1JTPL 4HTNA 4WM1A 1UC0A 2BQHA 1IOTA 4WL6A 5HMVA 1GHLA 5KXMA 1DQJC 4J1AA 3N9CA 1IIZA 1BWIA 4WOAA 2YBNA 2FYDA 1JUGA 4N8ZA 4M6DA 4ZFPA 1JTTL 4NSHA 1FN5A 1GF8A 4TSBA 3CSZA 1PZYA 5LAFA 5A3ZA 3BKVA 1LMAA 1V7SA 1LSPA 5DM9A 1JKAA 1OUGA 1OUFA 1DI3A 4CFPA 1ZVHL 1BWJA 5ILFA 2LZ2A 2DQDY 4LYZA 1HEOA 4LGKA 1JISA 1F6RA 5M1YA 1JSFA 4WO9A 1IEEA 4X3BA 1HFYA 4ET8A 1T3PA 5IDDA 4WO6A 4PHIA 3WU9A 4FJRA 4OWAA 1NWGA 1HSWA 2YSSC 4H9CA 1GBYA 3W6BA 5II3A 1B5YA 1XSFA 1GB7A 1MLCE 5L9JA 1IWZA 4D9ZA 1UIBA 1OUCA 1GEZA 4GN3A 4DYGA 2MEBA 2Z18A 2A7FA 4OWEA 4DD1A 1EQ4A 4DT3A 1O23A 2A7DA 3LYTA 1LJFA 1LMPA 1GE0A 4KPMA 4LYMA 5I54A 4WM5A 1ALCA 4I8SA 1IY3A 1GFVA 1XEIA 2F2NA 133LA 1GB0A 4ML7A 3TMXA 1RE2A 4N1CC 3WUMA 3P68A 1V7TA 5C6JA 1LZ9A 5FCPA 2HEAA 5DL9A 2MEGA 3AW7A 1H87A 2HEDA 5LYTA 1QSAA 1GFEA 1IVMA 1LKRA 1GF4A 1WQMA 3D9AC 1N4FA 1OUAA 3P4ZA 5KXOA 3W3EA 1GDXA 1CJ7A 1IORA 1XEJA 1HERA 3ULRA 4RW1A 2BQMA 2H5ZA 5E4PA 1DZBX 3AGHA 5A3EA 5L3IA 4P2EA 4HV2A 1OQMA 1AT6A 2MEAA 4DD9A 5F81A 194LA 3A91A 4HJYA 5KXRA 1E8LA 4DDCA 1C45A 3QE8A 2HU3A 1DPXA 1OUBA 1BB3A 1GF0A 4XADA 4J7VA 4BAFA 1GBOA 1IP3A 4TSCA 3IWRA 5HNCA 5ILCA 1QTEA 3A96A 1GB6A 2F4GA 2FBDA 1KXWA 1LPIA 4TWSA 1QTKA 4U3XB 1NHEA 1BVXA 6LYZA 1REZA 2LZTA 4DDAA 154LA 2GV0A 1IC7Y 1XEKA 5LINA 1GFKA 1TBYA 2I25L 5B06A 1UBZA 5I5QA 1XGRC 2G4NA 2LYOA 3HBDA 4GCDA 2DQHY 1A4VA 1LSZA 5APEA 1IP4A 1CJ6A 1J1OY 2MEHA 3A95A 3WU8A 134LA 2YBMA 1WQPA 4QEQA 1SQ2L 1LMCA 1B5VA 4CHXA 5F14A 4A7DA 1UA6Y 4XN6A 2YBIA 5DN4A 1HMLA 4ZIXA 1YAMA 4WM6A 1HSXA 2EPEA 2ZNXY 3WW5A 2BLXA 1QQYA 4E3UA 3TMUA 3TXKA 5KY1A 5E9RA 2W1LA 4HP0A 2ZWBA 1JITA 5LVHA 3TXFA 2YBHA 5APCA 1LZNA 208LA 1OUDA 2F4AA 2YDGA 4GCFA 2BQBA 4G4BA 1LTMA 4NG1A 1ZMYL 1LSAA 1BQLY 1WQRA 4XJGA 4UWUA 2BLYA 1NDMC 4OWBA 4YF2A 1TCYA 3W6AA 3T6UA 1LZ4A 4G49A 3K3TA 4PPOA 4WMGA 5DN5A 4LFXA 3VWOA 1B7RA 1HHLA 3P65A 1LZBA 3HFMY 5DLAA 2W1YA 5I4YA 1LJJA 1D0MA 1BWHA 1VDTA 2BQOA 1WTMA 3G3AB 5K7OA 4WLYA 5LAGA 4N0JA 4NWEA 4AXTA 2CGIA 1GWDA 3T36A 1JTOL 2WARA 1DKJA 4FDYA 4GN4A 2BQNA 1W08A 1LSMA 3AJNA 2F30A 1BVKC 1VFBC 4ZEEA 4NWHA 4XJDA 1F10A 4NGIA 3B0IA 1C46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OWZA 2LHMA 3HT6A 1YL1X 197LA 5B1FA 1LHLA 4YXAC 240LA 3SB7A 1OP9B 2B74A 4LYOA 1LHKA 2XTHA 4NGYA 4NSGA 4EXMA 5FHWA 1NDGC 4OWCA 1LWKA 1FBIX 1LZSA 1QS5A 4ARPA 4PGJB 3WUAA 2DBTA 1HELA 2O7AA 1IP7A 1CU3A 4HJVA 1P56A 3A8ZA 3B6LA 2VB1A 3EMSA 4II8A 1UCOA 4DQ7A 1GBWA 1GF9A 1WTNA 1L41A 1PQKA 1L99A 4NSIA 5KXZA 107LA 144LA 2C8OA 4H9FA 1LSFA 1GFRA 2ZIKA 1L54A 1L47A 1LSEA 1LMNA 5LYMA 4DQJA 4ZPUA 1L21A 4HV1A 1IWXA 4W57A 1G0PA 1IY4A 3LHMA 4AGAA 2PC2A 1G7HC 2YBLA 1NKHA 3ZVQB 1L26A 5KXWA 1YIKA 2DQAA 3UONA 3LYZA 1LI3A 3AW6A 1IWWA 2AUBA 4H1PA 1FDLY 1WVUA 1AM7A 1EL1A 4UWVA 4W55A 2BQAA 1LSBA 1GBSA 3IJVA 1QT7A 1QT5A 2RSCA 1WQNA 166LA 3QNGA 3B0OA 1P37A 1LMTA 5FSTA 1LJEA 153LA 4GRVA 4NSJA 243LA 1SSWA 1F6SA 4XJFA 2ZYCA 4TX7A 1IP1A 4WM3A 1LZCA 2HECA 3RZEA 4CGEA 2Q0MX 2G4PA 5KXTA 5LZMA 1L76A 1L68A 1INUA 1ZWNA 3WU7A 4WLDA 1B7NA 103LA 5C6IA 1C6AA 1B2KA 1DI5A 1LJHA 3C7YA 261LA 1LWGA 1L63A 212LA 1WQQA 5KXYA 3A94A 4NGOA 4IATA 1JKDA 1TAYA 3HDEA 1IWTA 1I20A 5LXWA 112LA 2ANXA 1GDWA 1QUGA 5LA5A 2D6BA 169LA 4GCCA 2OU9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7M C;  1FLW A;  2LHM A;  4WG1 A;  2LYM A;  1BB4 A;  1D0L A;  2XJW A;  1NBZ C;  2Z39 A;  2BQG A;  3A92 A;  3M18 B;  1YL1 X;  3G3B B;  4DD0 A;  1JIY A;  1IC4 Y;  4NHT A;  1LJG A;  4TUN A;  5B1F A;  5KKI A;  1FKV A;  1LHL A;  1T6V L;  3F6Z A;  1BGI A;  1B5Z A;  1OP9 B;  5KKJ A;  2D4I A;  5HLL A;  4CFO A;  4LT2 A;  1JPO A;  5FDJ A;  4LYO A;  1BB6 A;  3FI7 A;  3GXK A;  4O34 A;  4KXI A;  1LHK A;  1NMM A;  2XTH A;  3TMW A;  5D5C A;  1GBX A;  4NGK A;  1IC5 Y;  1LCN A;  4NGY A;  4ANR A;  3J6K A;  5LA8 A;  1YKX X;  4NSG A;  4G4H A;  1LHH A;  1IX0 A;  4NY5 A;  3WVX A;  3CQL A;  4W96 A;  2CDS A;  1VAU A;  3A6B Y;  5FHW A;  1IP6 A;  1NDG C;  1YKZ X;  4L41 A;  4OWC A;  2Z12 A;  5HNL A;  1C08 C;  2HU1 A;  1CKH A;  1JJ0 A;  4J0L A;  4ETE A;  1FBI X;  1LZS A;  4MCK A;  3WPK A;  4PGJ B;  3WUA A;  3ATN A;  2DQE Y;  2EIZ C;  2DBT A;  3EO5 A;  1UIF A;  1GD6 A;  1LMO A;  1HEL A;  1JKB A;  3WXU A;  4C5F A;  3TXG A;  1B5X A;  4H8Y A;  1IP7 A;  3LYM A;  2BQI A;  2CWI A;  4HJV A;  3A8Z A;  2IFF Y;  3B6L A;  1LYS A; 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 1KXW A;  1LPI A;  4TWS A;  1QTK A;  4U3X B;  1NHE A;  1BVX A;  6LYZ A;  1REZ A;  2LZT A;  4DDA A;  154L A;  2GV0 A;  1IC7 Y;  1XEK A;  5LIN A;  1GFK A;  1TBY A;  2I25 L;  5B06 A;  1UBZ A;  5I5Q A;  1XGR C;  2G4N A;  2LYO A;  3HBD A;  4GCD A;  2DQH Y;  1A4V A;  1LSZ A;  5APE A;  1IP4 A;  1CJ6 A;  1J1O Y;  2MEH A;  3A95 A;  3WU8 A;  134L A;  2YBM A;  1WQP A;  4QEQ A;  1SQ2 L;  1LMC A;  1B5V A;  4CHX A;  5F14 A;  4A7D A;  1UA6 Y;  4XN6 A;  2YBI A;  5DN4 A;  1HML A;  4ZIX A;  1YAM A;  4WM6 A;  1HSX A;  2EPE A;  2ZNX Y;  3WW5 A;  2BLX A;  1QQY A;  4E3U A;  3TMU A;  3TXK A;  5KY1 A;  5E9R A;  2W1L A;  4HP0 A;  2ZWB A;  1JIT A;  5LVH A;  3TXF A;  2YBH A;  5APC A;  1LZN A;  208L A;  1OUD A;  2F4A A;  2YDG A;  4GCF A;  2BQB A;  4G4B A;  1LTM A;  4NG1 A;  1ZMY L;  1LSA A;  1BQL Y;  1WQR A;  4XJG A;  4UWU A;  2BLY A;  1NDM C;  4OWB A;  4YF2 A;  1TCY A;  3W6A A;  3T6U A;  1LZ4 A;  4G49 A;  3K3T A;  4PPO A;  4WMG A;  5DN5 A;  4LFX A;  3VWO A;  1B7R A;  1HHL A;  3P65 A;  1LZB A;  3HFM Y;  5DLA A;  2W1Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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