3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
110LA 1G0LA 1L0JA 1BM1A 3A7KA 4GYCA 141LA 1L41A 5BR5A 4NC3A 1UAZA 2PEDA 1FBKA 3C80A 2YCYA 1JQUA 1KS3A 4PK0A 1L61A 1G0MA 252LA 3VVKA 2Q9EA 3FI5A 1L24A 1LGWA 1L43A 3AM6A 1C64A 5AWZA 5H2KA 3CDTA 2I21A 115LA 3NY9A 5B6YA 1L65A 1QS5A 4MD1A 4AMJA 1L17A 1T8AA 4UHRA 2B74A 156LA 221LA 1QSBA 1L40A 157LA 1P56A 3C7ZA 1PY6A 3ABWA 1LYDA 137LA 3HH6A 4GPOA 3MBVA 1C6FA 1L12A 236LA 2HUMA 259LA 3UTVA 4BV0A 5G54A 1G06A 3F8VA 178LA 1LW9A 1P5CA 1L86A 3HTDA 1KY1A 4J4QA 4IB4A 3HAQA 3C8RA 1LYIA 3HWLA 1C3WA 210LA 130LA 1L82A 2J4YA 4PXFA 1KNIA 107LA 1QTBA 258LA 2KSYA 1L57A 1L98A 3SB7A 2AT9A 140LA 3EH3B 142LA 1L44A 1L55A 1L18A 3C9LA 4WW3A 3CDQA 2ANXA 1LYGA 125LA 143LA 3DQBA 3PQRA 1L29A 5I14A 4GBRA 4JQ6A 1JTNA 1L10A 2RBSA 1L53A 163LA 1L13A 251LA 2EI4A 3X3BA 1C8SA 1L93A 214LA 2O4WA 2B75A 218LA 4IAQA 3UZCA 4XT1A 1L85A 1P3NA 3GUNA 1C6MA 186LA 1B6IA 1D2WA 3HH3A 4GP4B 4BEZA 243LA 4EKRA 1P8HA 1DYGA 1C6BA 169LA 190LA 4I7JA 3SB6A 1L91A 2I35A 3RUNA 2YCZA 5G2DA 1SWYA 1L66A 109LA 254LA 1BRDA 3GULA 4JR8A 4MD2A 1L0KA 4HWLA 3C8QA 230LA 1CV0A 3G3WA 4I7NA 3C9MA 4FA7B 5A8EA 2OTZX 1CTWA 1PQJA 112LA 2LNLA 3DN6A 3EH5B 2RB0X 3OE8A 1L73A 3GUIA 4YXAC 4QRYA 174LA 155LA 1HZXA 1L27A 3DN3A 3NYAA 2LC9A 1SWZA 3DMVA 2I1XA 5AZDA 2QB0B 192LA 2G87A 2Y01A 1P7SA 1QTZA 1T6HA 1CWQA 172LA 1C6LA 1AT9A 228LA 1TN5A 227LA 2YDVA 4DKLA 3HARA 1P2RA 4UG2A 2I20A 3QJSB 1XJIA 1OWZA 2F2QA 2RB2X 3HH5A 3ZPQA 5B6XA 3UTXA 5JJEA 200LA 1CU2A 239LA 114LA 4JKVA 1C61A 1P64A 3PXOA 2HUKA 181LA 1CUQA 3K2RA 1C66A 3NSBA 4KNFA 4WAVA 5DYSA 187LA 1L74A 126LA 4YXCA 199LA 2OTYX 215LA 1C6PA 1QT5A 3UONA 4G71B 5H2NA 1KG8A 4XTNA 1S54A 1DYDA 4W56A 1D3NA 1L76A 3HAPA 4N4WA 1LN6A 1C6QA 1G07A 3WQJA 185LA 1L45A 4N4YB 3SB9A 5DHHA 5JJJA 1QKOA 3V2WA 3DN0A 1P2LA 1L71A 4N6HA 7LZMA 3GUKA 5ITCA 1T97A 3CDVA 2OU9A 1P8IA 5EN0A 4MQTA 1K28A 4LZMA 3HT8A 1QUHA 3RFMA 5H2OA 159LA 3C7WA 2Y03A 3ZEVA 4FAAB 4EIYA 232LA 2L6XA 223LA 2Y00A 4EKPA 1D9WA 1QTHA 1OV7A 4G70B 196LA 1L51A 4I7MA 1C6EA 4AQNA 3GUJA 1KGBA 3NY8A 4PXKA 4MQSA 1SX2A 1CV5A 5A44A 3S8FB 1XEPA 1QSQA 1L16A 1L31A 5B6ZA 3HUQA 3HTGA 244LA 4W53A 209LA 1DYFA 1QHJA 4GRVA 3HDFA 4ARPA 191LA 1OYUA 1EHKB 3FADA 2HPYA 1L39A 2B6XA 1JFPA 2JAFA 180LA 1L62A 3EMLA 152LA 4I7QA 2Z73A 1L77A 1CUPA 1G0QA 1L92A 1PQMA 1QTDA 2NTGA 5ETZA 3HASA 3VGAA 150LA 5DHGA 205LA 5JJNA 4PJZA 1L42A 1DYCA 220LA 2B6ZA 3S8GB 1PQDA 1ZWNA 5H2MA 4I7OA 1P37A 5C1MA 1UCQA 4G7SB 5ITEA 2Q9DA 1LYEA 2F95A 3CODA 3V2YA 5B2NA 103LA 1C69A 3VHZA 2RH1A 5G53A 1L33A 182LA 4EJ4A 5AX0A 1G0GA 1E12A 4K5YA 2OU8A 3QBGA 4BWBA 3GUMA 1L09A 1L49A 1L28A 1OVJA 2RB1X 3CDOA 1NHBA 4L35A 4S0WA 122LA 261LA 3HU8A 1WTHA 1SSYA 4ARMB 1VGOA 2QARC 173LA 246LA 211LA 177LA 3OAXA 2RBNA 212LA 3GUPA 226LA 1L81A 5H2IA 2B7XA 1C6DA 1GZMA 1P8UA 123LA 1L67A 4W52A 3QDCA 1L97A 2OE7X 3HANA 1DYEA 1LYHA 222LA 3HT7A 4W57A 1L04A 256LA 3HT9A 4MBSA 3T45A 1C6KA 1QT4A 2L78A 1IW9A 171LA 3EH4B 1LI2A 248LA 1PQIA 2Z6BA 1S8LA 1JV6A 1LGUA 1M0KA 5AHZA 4G7RB 257LA 5H2HA 4I7TA 4LDOA 3DN1A 5G28A 3L64A 1M0MA 1MGYA 1ZYTA 231LA 3DMXA 3AYNA 1P6YA 5AX1A 3FA0A 245LA 4IAPA 138LA 1LI3A 195LA 1SX7A 3QJQB 1CX7A 4X32A 1L9HA 1XIOA 3S3CB 4W55A 2B73A 1L47A 3C7YA 237LA 3BVDB 3PWHA 4BVNA 2WJKA 1QT7A 189LA 1QUOA 4I7KA 1C65A 1QTCA 250LA 3LZMA 241LA 1P36A 201LA 4HYXA 1L72A 1QUGA 1C6JA 3G3VA 224LA 1KG9A 1SSWA 1KW5A 1C62A 1PQKA 3QAKA 1CV1A 4I7RA 1CV6A 4W54A 2RAYX 3C81A 4QIDA 3UG9A 1QT3A 1KMEA 1L89A 1QT6A 3D4SA 3VG9A 1QT8A 3DMZA 4DAJA 1X0I1 260LA 2KSBA 5FJGA 1LGXA 2A4TA 2RBQA 3SBAA 104LA 1CX6A 3DN4A 3HAOA 4G72B 1M0LA 4XXJA 1L20A 4ARLA 175LA 3SB5A 3OE0A 3VI0A 1QTVA 144LA 4EKSA 4EPFA 162LA 4DJHA 183LA 1L58A 2IGCA 1F50A 1CU5A 2OU0X 3CAPA 1C6HA 2RBPA 3HUAA 3SN6R 3X3CA 2KS9A 6LZMA 3S3BB 1Q5IA 5AHYA 4EKQA 235LA 2JAGA 1L68A 2F47A 1L95A 1L80A 3SBBC 1ZURA 120LA 4KLYA 1G1WA 1C60A 1L64A 3DN2A 5G36A 2KSAA 4L6RA 147LA 3VW7A 4XT3A 2YDOA 2O79A 5B34A 5H2LA 234LA 2ZZLA 3UTWA 1L99A 4ARMA 4BUOA 149LA 2LCBA 1C6AA 2ZIYA 4ARQB 1P46A 146LA 5J7AA 1L00A 4ZPUA 2B70A 2BRDA 1L50A 1T8GA 4XTLA 1Q5JA 1D3MA 2YCXA 1L03A 1LWKA 242LA 253LA 3F9LA 4HYJA 4A4MA 1CU0A 2RAZX 1F4ZA 129LA 1L23A 2YCWA 1L32A 1CV3A 3HH4A 1L01A 184LA 3PBLA 3DDLA 160LA 1L88A 1QUDA 1G0JA 1KW7A 4LDEA 1L02A 1LYFA 3DKEX 4FBZA 4Y9HA 2RBOA 1U19A 167LA 176LA 4I7LA 1QKPA 4OV0A 1S8JA 229LA 4XTOA 2OEAX 1LPYA 118LA 1L60A 255LA 128LA 3ODUA 4X1HA 1XMEB 1L25A 3AYMA 1H68A 139LA 1L90A 1D3JA 198LA 3QJUB 1PQOA 1LWGA 3QAPA 2OE9X 4W59A 3C82A 2F93A 1C6TA 5G2AA 2M3GA 3SB8A 1L15A 1I6SA 1DZEA 1L05A 3COCA 217LA 1LLHA 119LA 1L87A 3HT6A 1BRRA 1L06A 3UZAA 3S3DB 108LA 1F88A 1X0SA 1L69A 1QM8A 2Y04A 2RBRA 4YX7C 1T8FA 1L52A 1C8RA 1VJMA 3HUKA 3RZEA 4AMIA 5B35A 5KKHA 3KJ6A 1L63A 3HU9A 4GP5B 4QI1A 2Y02A 5F8UA 164LA 3JR6A 3UTYA 1L59A 2QPEB 5BR2A 1L54A 1IW6A 3L2XA 1CU6A 1C63A 206LA 4EXMA 166LA 4W51A 1L30A 3OE9A 1L08A 2ZFEA 113LA 1L36A 3GUOA 2OE4X 1GUEA 2B72A 4FPDA 4IARA 1L70A 249LA 1AP9A 1XJTA 4I7PA 1TN0A 2Z55A 1CVKA 1L56A 1XJUA 262LA 1L07A 1L26A 5B6VA 3HDEA 1L48A 1LI6A 2NTUA 2CUUA 3DNAA 4ARJA 1S53A 3NS0A 5H2PA 4EA3A 1CU3A 3OE6A 247LA 4EPIA 188LA 1C6GA 1TLAA 216LA 1GU8A 1L11A 1DYBA 161LA 1CV4A 1O0AA 1G1VA 127LA 1DYAA 2F32A 2QPDB 3HTBA 2B6YA 158LA 165LA 131LA 2O7AA 1OVHA 2HULA 1FBBA 1L94A 5H2JA 1D3FA 1L96A 1OWYA 197LA 3HTFA 4ARQA 1BRXA 238LA 1L38A 2ANVA 4GBRB 1L37A 225LA 1JGJA 1L75A 1L34A 3C83A 1IXFA 1E0PA 5G2CA 1S52A 1QS9A 3P0GA 2B6TA 2B6WA 1EPYA 1L22A 151LA 1KY0A 3C8SA 1JV7A 168LA 1L46A 3G3XA 4GP8B 148LE 1C6NA 1L14A 1L84A 1C68A 1LYJA 1R2NA 4X31A 5A45A 102LA 1OV5A 4BEYA 213LA 5LWEA 1G0KA 4E97A 1G0PA 1X0K1 233LA 1L0MA 219LA 2LZMA 1C6IA 2X72A 4LDLA 3CDRA 2WJLA 1JTMA 4OO9A 4W58A 5B0WA 2NTHA 3QBIA 3QBKA 1PXRA 1S51A 3QJTB 3QJVB 1D2YA 2VT4A 1R84A 145LA 4I7SA 5LZMA 3REYA 170LA 1L83A 2NTWA 5TGZA 1C67A 1PXSA 3ZPRA 1C6CA 1L35A 1OVKA 240LA 3QBLA 3DN8A 2R4SA 3QJRB 1L79A 4G7QB 4TL3A 1H2SA 5B6WA 3PDSA 1L19A 111LA 1L21A 2R4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JITA 4GYCA 141LA 4NC3A 1GFRA 4RLNA 2YCYA 4NHIA 3P4ZA 1KS3A 2ZIKA 4PK0A 4N1EI 3VVKA 1REYA 1L24A 1LGWA 1C64A 2EQLA 3NY9A 1FLWA 1L17A 1T8AA 2C8PA 1DI3A 1LSEA 4UWVA 1L40A 2Z39A 1P56A 3ABWA 3W6EA 1BWHA 4H91A 4KL7A 2Z19A 1YAMA 236LA 2HUMA 259LA 3WU7A 1G06A 3F8VA 1LW9A 1L86A 4XYYA 1KY1A 4NGJA 4IB4A 3C8RA 4AGAA 1B7RA 1B5WA 1HMLA 4HV1A 1QTBA 2IFFY 2AT9A 140LA 1L18A 3P66A 1JJ0A 143LA 3PQRA 1L29A 4GBRA 1L10A 3OJPA 3LZTA 4B0DA 1L13A 3K3TA 251LA 1B7MA 214LA 3WPJA 1LJ3A 3GUNA 1JKCA 1HMKA 243LA 3M3UA 4I7JA 169LA 1G7LC 1L91A 5M1YA 2YCZA 1SWYA 1L66A 3GULA 4JR8A 4NFVA 4FA7B 5A8EA 2OTZX 5LVJA 1YIKA 112LA 3DN6A 3EH5B 4WLTA 1L73A 3GUIA 1GE0A 3DN3A 3SP3A 2LC9A 2LZTA 2QB0B 2ZNWY 4NGYA 1J1OY 5LYMA 1TN5A 1JSEA 2YDVA 4UG2A 2I20A 2CDSA 4LT1A 1XJIA 1TCYA 3IJVA 3HH5A 5B6XA 1IR8A 200LA 239LA 2YBJA 1C66A 2F4AA 187LA 199LA 1EQ5A 3W6CA 1I20A 1NKHA 3HBHA 1MLCE 1S54A 1GE3A 1F0WA 1LN6A 2EPEA 1ALCA 1SQ2L 3V2WA 1L71A 7LZMA 1BVKC 2OU9A 3HT8A 1BWJA 4EIYA 2ZQ4A 223LA 3AGGG 4WM2A 1HENA 2D4IA 4G70B 196LA 1L51A 1C6EA 1IC4Y 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1L56 A;  1XJU A;  262L A;  1L07 A;  1L26 A;  5B6V A;  3HDE A;  1L48 A;  1LI6 A;  2NTU A;  2CUU A;  3DNA A;  4ARJ A;  1S53 A;  3NS0 A;  5H2P A;  4EA3 A;  1CU3 A;  3OE6 A;  247L A;  4EPI A;  188L A;  1C6G A;  1TLA A;  216L A;  1GU8 A;  1L11 A;  1DYB A;  161L A;  1CV4 A;  1O0A A;  1G1V A;  127L A;  1DYA A;  2F32 A;  2QPD B;  3HTB A;  2B6Y A;  158L A;  165L A;  131L A;  2O7A A;  1OVH A;  2HUL A;  1FBB A;  1L94 A;  5H2J A;  1D3F A;  1L96 A;  1OWY A;  197L A;  3HTF A;  4ARQ A;  1BRX A;  238L A;  1L38 A;  2ANV A;  4GBR B;  1L37 A;  225L A;  1JGJ A;  1L75 A;  1L34 A;  3C83 A;  1IXF A;  1E0P A;  5G2C A;  1S52 A;  1QS9 A;  3P0G A;  2B6T A;  2B6W A;  1EPY A;  1L22 A;  151L A;  1KY0 A;  3C8S A;  1JV7 A;  168L A;  1L46 A;  3G3X A;  4GP8 B;  148L E;  1C6N A;  1L14 A;  1L84 A;  1C68 A;  1LYJ A;  1R2N A;  4X31 A;  5A45 A;  102L A;  1OV5 A;  4BEY A;  213L A;  5LWE A;  1G0K A;  4E97 A;  1G0P A;  1X0K 1;  233L A;  1L0M A;  219L A;  2LZM A;  1C6I A;  2X72 A;  4LDL A;  3CDR A;  2WJL A;  1JTM A;  4OO9 A;  4W58 A;  5B0W A;  2NTH A;  3QBI A;  3QBK A;  1PXR A;  1S51 A;  3QJT B;  3QJV B;  1D2Y A;  2VT4 A;  1R84 A;  145L A;  4I7S A;  5LZM A;  3REY A;  170L A;  1L83 A;  2NTW A;  5TGZ A;  1C67 A;  1PXS A;  3ZPR A;  1C6C A;  1L35 A;  1OVK A;  240L A;  3QBL A;  3DN8 A;  2R4S A;  3QJR B;  1L79 A;  4G7Q B;  4TL3 A;  1H2S A;  5B6W A;  3PDS A;  1L19 A;  111L A;  1L21 A;  2R4R A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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