2B6WA

T4 lysozyme mutant l99a at 200 mpa
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b6wA00
4W56A 3SN6R 4I7MA 1P5CA 1L07A 1DYGA 109LA 3ODUA 123LA 1G0PA 4I7NA 241LA 3HT6A 2RAZX 1SSYA 1L30A 3L2XA 1QT5A 3GUKA 1CU0A 3HUKA 3C82A 3DMZA 1L74A 1QSQA 1KNIA 1L99A 3C83A 1P6YA 4LDEA 177LA 3HWLA 1PQOA 1L06A 3DMVA 1L49A 1DYFA 1L58A 3NYAA 4EKRA 1C66A 1C6BA 3SBBC 1P3NA 1QT4A 1C64A 1L20A 158LA 1L25A 1L88A 2B6YA 156LA 1L72A 2QB0B 1LYJA 3NY8A 1CV3A 3SB9A 1CU2A 2F2QA 175LA 4I7QA 167LA 1C62A 1L02A 2B74A 1L00A 3GUNA 3HUAA 1CV4A 1L61A 6LZMA 2NTHA 3C80A 1L44A 4YX7C 102LA 142LA 1CV0A 1P37A 1OWYA 4W57A 3SB8A 111LA 104LA 1T6HA 196LA 237LA 1LI6A 3CDQA 240LA 2RB2X 1OYUA 1L26A 147LA 214LA 3C7WA 251LA 3DN4A 3GUOA 1PQMA 1L40A 168LA 2ANXA 2HUMA 1L33A 1ZYTA 2F47A 222LA 246LA 3DN2A 1D2YA 3C8QA 1C6QA 5I14A 1L71A 1L83A 233LA 1CV5A 200LA 2OE9X 143LA 2B70A 2OU9A 3HH4A 1QUDA 1KY0A 1LGXA 1D2WA 2RH1A 1QUGA 3DN0A 4I7RA 163LA 1L56A 3C8SA 1L36A 1SWYA 2Q9DA 2RB0X 1LWGA 141LA 1L98A 1B6IA 183LA 1P46A 1L10A 2NTGA 2RBOA 1DYCA 218LA 226LA 254LA 4DAJA 4W58A 3RZEA 4LZMA 1OV7A 1CX6A 1XEPA 2B6ZA 1DYDA 4EXMA 3SB7A 185LA 1G07A 4ARPA 3C7ZA 1L17A 1L70A 4GBRB 2ANVA 4W51A 1G0JA 1SSWA 164LA 213LA 2LC9A 1T8AA 2IGCA 1L09A 1LWKA 4EJ4A 3GULA 216LA 1L65A 1P2RA 220LA 1QUOA 110LA 119LA 4I7PA 205LA 1L47A 4ARQB 2B6WA 1L13A 2HULA 4K5YA 1D3JA 3HH6A 3G3VA 122LA 146LA 4GRVA 3FADA 2B72A 1L73A 1L57A 3DKEX 1L37A 3DNAA 2HUKA 198LA 1QTVA 2O4WA 1L18A 2LCBA 1P36A 4W59A 2B6TA 3GUPA 1L68A 1LI3A 1LYHA 3JR6A 1C6FA 3DN1A 4ARMA 1L53A 149LA 1QTCA 3C81A 197LA 1QT8A 2B73A 2B75A 3HU9A 212LA 2OU8A 4I7TA 4EPFA 2OEAX 1SWZA 1C6TA 2OE7X 1JQUA 4I7KA 139LA 2CUUA 1L27A 1L24A 4I7OA 232LA 128LA 1CV6A 1LYFA 253LA 2RBNA 247LA 118LA 3DMXA 1OWZA 3HH3A 3V2YA 145LA 1L67A 1CU5A 3C8RA 1CTWA 150LA 1P56A 236LA 1LLHA 1C6DA 230LA 2RBQA 1CUPA 1LPYA 1L66A 1ZURA 3HTBA 5LZMA 1LGWA 1C6NA 4EKSA 238LA 4I7JA 170LA 3OE8A 1LW9A 171LA 1L21A 1QS5A 178LA 4LDLA 223LA 1CVKA 4DJHA 2QARC 120LA 3HTGA 4S0WA 176LA 228LA 138LA 1L35A 1L29A 1C6GA 1C6AA 1LYEA 1QTDA 1L94A 2OE4X 244LA 3HTFA 3CDRA 4LDOA 4YXCA 2OTYX 1L31A 1T97A 103LA 1L08A 2RBRA 1XJUA 1QT3A 2B7XA 3GUIA 151LA 4I7LA 1QTBA 1C6HA 4ARMB 242LA 1L39A 3NY9A 4PK0A 1L60A 7LZMA 189LA 1QSBA 2RBSA 219LA 1L90A 1DYBA 1L38A 1L81A 1L59A 3FI5A 4PJZA 1L0KA 221LA 1OVHA 4AQNA 211LA 1L15A 140LA 1L12A 235LA 1JTMA 1C6IA 229LA 129LA 1L46A 1KW7A 172LA 3OE9A 3G3WA 161LA 1L97A 1C68A 1L82A 2RAYX 4I7SA 1C69A 3DN3A 206LA 1L52A 108LA 1L50A 1L77A 1D3FA 259LA 1T8FA 1G1WA 1C6KA 3CDOA 1P2LA 1QS9A 1OVKA 1L32A 3V2WA 1L42A 3RUNA 190LA 1L28A 3GUMA 1KW5A 4ZPUA 3FA0A 1L43A 1JTNA 257LA 1C6CA 1P7SA 1L48A 2OU0X 3F8VA 1CUQA 1L16A 182LA 1QUHA 215LA 152LA 4EKQA 173LA 1L84A 1ZWNA 1G0LA 1C6MA 1G0GA 1QT6A 4W52A 3DN6A 3CDVA 1L62A 195LA 1G0QA 1L54A 1C6PA 1D9WA 1L89A 1LYGA 1NHBA 1L0JA 250LA 1QTHA 1G0MA 160LA 113LA 3PDSA 3C7YA 1L63A 1L93A 261LA 174LA 2O79A 1PQJA 181LA 3HDFA 1L64A 159LA 1L22A 234LA 3HDEA 1LGUA 3SB6A 1EPYA 255LA 1L69A 3DN8A 201LA 3HT9A 1DYEA 227LA 1L05A 1LYDA 148LE 1L76A 1WTHA 3CDTA 225LA 1L34A 248LA 1D3MA 107LA 1TLAA 4ARQA 1XJTA 1L23A 144LA 4W55A 112LA 125LA 192LA 186LA 1T8GA 262LA 3UONA 260LA 3HU8A 258LA 2B6XA 3GUJA 3QAKA 1L87A 1G1VA 3HUQA 126LA 245LA 199LA 1L14A 1CU6A 217LA 1L41A 1KS3A 2Z6BA 4EPIA 188LA 115LA 1L86A 1D3NA 2RBPA 1C6LA 1C63A 1L45A 3HH5A 1CX7A 3G3XA 1L55A 4IAPA 2RB1X 4E97A 2L78A 1LYIA 2F32A 1L91A 157LA 243LA 1SX7A 3EMLA 1L19A 169LA 231LA 1CU3A 1CV1A 1L85A 131LA 1L01A 1PQKA 162LA 165LA 1I6SA 1KY1A 1SX2A 2LZMA 1C60A 4W53A 3VW7A 1C6JA 4ARLA 180LA 1L03A 1OVJA 1L51A 184LA 1G0KA 256LA 1PQDA 187LA 3F9LA 1L92A 252LA 2A4TA 3HTDA 4ARJA 224LA 3D4SA 130LA 1P64A 1C61A 1LI2A 1QTZA 4W54A 191LA 127LA 210LA 3SB5A 114LA 1G06A 239LA 3OE6A 3OE0A 4EKPA 137LA 209LA 3L64A 1L80A 1L04A 155LA 2Q9EA 1QT7A 3HT8A 1C65A 1L75A 3SBAA 1L95A 4OO9A 1K28A 1OV5A 4DKLA 1PQIA 1L79A 3LZMA 1C6EA 1L11A 1C67A 3PBLA 3HT7A 3K2RA 2O7AA 2OTZX 166LA 1L96A 4YXAC 1DYAA 249LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BAAA 2EPEA 4W56A 3SN6R 4I7MA 1P5CA 1L07A 2I25L 5J7CA 1YKYX 1WQPA 5ILFA 1LZ6A 3LYMA 4GCFA 2G4NA 1YKXX 1QT5A 4KXIA 3LZ2A 3RT5X 3C82A 1QSQA 3C83A 177LA 4WLXA 1LJJA 4ETEA 1L06A 1OUCA 1E8LA 3B0KA 1L58A 3LZTA 158LA 1HSWA 2B6YA 1IWZA 1L72A 1UC0A 1LYJA 1G7LC 1CV3A 1DPXA 4DDBA 1TCYA 1GF7A 4YEOA 2HEAA 1CNSA 3A91A 102LA 142LA 1CV0A 132LA 5HMVA 5L3HA 2W1XA 4G49A 196LA 240LA 2MEDA 1N4FA 2BQMA 3DN4A 3GUOA 1GE2A 3A95A 3VWOA 1PQMA 4D9ZA 1LJGA 5AMYA 4ETCA 3C8QA 1C6QA 4ET9A 1L83A 233LA 2MEAA 5LINA 1LHLA 1KY0A 1W6ZA 3DN0A 4I7RA 1BQLY 1L56A 1EL1A 4DD9A 183LA 1L10A 4UWUA 1F0WA 135LA 4W58A 3RZEA 3WW6A 4NGWA 1JPOA 3OK0A 4DD1A 1GE3A 2B6ZA 1JJ1A 1RFPA 3A34A 4NIJA 1DKJA 3RW8A 1UUZC 1LMNA 1ZV5L 1G0JA 4W51A 164LA 1LAAA 213LA 1UA6Y 4EJ4A 3GULA 5LIOA 216LA 2ZNWY 5DN5A 1NQIA 119LA 4RLNA 2HEBA 2HULA 4HTNA 1XGTC 122LA 146LA 4OWAA 4GRVA 2B72A 4LYTA 1VDTA 1CKDA 1L37A 5KXLA 1QTVA 2O4WA 1P36A 3CSZA 4NGVA 2D4IA 4HJYA 1L68A 1LYHA 1GF0A 1L53A 4QY9A 1QUSA 5II3A 3G3BB 4DDAA 1LYOA 3C81A 4NHIA 1LZAA 1TEWA 4HTKA 3WUMA 3MGWA 4EPFA 1XGUC 3CT5A 1SWZA 2Q0MX 4I7KA 5IELA 1GFGA 2CUUA 2F4GA 1L24A 4I7OA 1CV6A 1LYFA 2HU1A 5IDDA 1CTWA 1P56A 1GB6A 236LA 2DQJY 4HV2A 4B4JA 1LTMA 1ZURA 4LYBA 2CJLA 1LGWA 1LJ4A 1HNLA 1V7SA 170LA 2YVBA 2ZILA 4H9AA 2AUBA 3EBAB 4LDLA 1GBWA 4OWHA 223LA 1XGQC 5HLLA 4DJHA 3F6ZA 4G4HA 1HELA 5FDJA 138LA 4NHQA 4TSCA 1XGRC 4XJBA 1NF5A 3WU8A 1JKBA 1LYEA 1GBOA 1HEOA 1QTDA 4M4OA 244LA 4Z41A 4IASA 4WM5A 1GFTA 5LVIA 3LYTA 4GN4A 5DM9A 1GFRA 5E9RA 1HENA 1QT3A 3P65A 5I4XA 1JHLA 1B5XA 1OUAA 2CGIA 4PK0A 1L60A 1LMAA 1QSBA 4OWCA 1IIZA 2XTHA 1L38A 2F2NA 4I8SA 1B7QA 4QGZA 221LA 3TXHA 1OVHA 4GN3A 1YIKA 1REZA 1NKHA 1G7HC 1GE1A 1WQNA 1BB4A 1JTMA 1KW7A 3TXGA 1D6PA 172LA 1IWTA 4I0CA 3G3WA 4TSBA 2RAYX 3DN3A 3WL2A 1G1WA 3CDOA 1GF5A 1L42A 1LZSA 4NGLA 190LA 1L28A 5HQ1A 1TDYA 1JTNA 1OUJA 3F8VA 4C3WA 1CUQA 1L16A 1IY3A 3LN2A 5HNLA 3TMUA 2X0AA 4FJRA 3A3RX 1QDTA 1GB0A 3CDVA 1BB6A 1L89A 1LYGA 3W6DA 1FKQA 1NHBA 1L0JA 1FLWA 2EQLA 5LVJA 1T6VL 3AW7A 1P2CC 113LA 2Z37A 4RDSA 4WM3A 5M1YA 1LSAA 1GFKA 1IEEA 4RW1A 1PQJA 3TXDA 4H94A 3SB6A 255LA 1L69A 1GB7A 1DYEA 227LA 148LE 1L76A 4W94A 3A67Y 107LA 1GFVA 4ARQA 5KXSA 1Z55A 2HUBA 1O23A 1T8GA 1UBZA 3WPKA 1IP4A 4N0JA 1GEZA 4II8A 1J1OY 1L87A 3HUQA 1AZFA 2Y8PA 1C08C 3CSRA 2RBPA 1B5YA 1CX7A 4IAPA 1GB2A 1D9UA 1L91A 2BPUA 1SX7A 1JKDA 2Z38A 1IWYA 2GV0A 1PQKA 9LYZA 4H91A 165LA 194LA 1HEWA 1L03A 5L9JA 256LA 2WARA 187LA 5APEA 224LA 1LI2A 1AKIA 3SB5A 239LA 3B0OA 3OE6A 4H92A 4H9FA 2Q9EA 4GCCA 2VB1A 3AZ5A 1L75A 4KPMA 5KXOA 1L95A 2F30A 4OOTA 4DKLA 4DD3A 1C67A 1IX0A 3HT7A 2O7AA 5HNCA 2OTZX 1LJKA 1LZGA 4ETDA 4NSHA 2DQEY 1IOQA 5KJ9A 109LA 4TX7A 3ODUA 1CKCA 1G0PA 4DQJA 241LA 3FE0A 3E3DA 1L30A 3HUKA 5KKJA 3DMZA 3A6CY 1L74A 1KNIA 4QEQA 4DQ5A 2W1YA 1LZ1A 1LZ8A 2MEIA 3AGIA 1DYFA 1P3NA 1C64A 1L20A 3QE8A 1GFAA 1WTNA 3WYHA 156LA 4LYOA 5HMJA 4NG1A 3W6BA 1IC4Y 4U3XB 1TAYA 1L00A 3GUNA 4TWSA 4N1EI 4YX7C 2C8PA 1FBIX 1LSZA 1P37A 5FEKA 3TMWA 4NGJA 3SB8A 4CFOA 4L41A 2DQAA 1LI6A 6LYTA 2RB2X 3ZVQB 251LA 5DL9A 1YKZX 168LA 222LA 246LA 3DN2A 1D2YA 3HBDA 1GXXA 1L71A 4XJHA 4WL6A 4HTQA 1B7PA 1CV5A 2OE9X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BAA A;  2EPE A;  4W56 A;  3SN6 R;  4I7M A;  1P5C A;  1L07 A;  2I25 L;  5J7C A;  1YKY X;  1WQP A;  5ILF A;  1LZ6 A;  3LYM A;  4GCF A;  2G4N A;  1YKX X;  1QT5 A;  4KXI A;  3LZ2 A;  3RT5 X;  3C82 A;  1QSQ A;  3C83 A;  177L A;  4WLX A;  1LJJ A;  4ETE A;  1L06 A;  1OUC A;  1E8L A;  3B0K A;  1L58 A;  3LZT A;  158L A;  1HSW A;  2B6Y A;  1IWZ A;  1L72 A;  1UC0 A;  1LYJ A;  1G7L C;  1CV3 A;  1DPX A;  4DDB A;  1TCY A;  1GF7 A;  4YEO A;  2HEA A;  1CNS A;  3A91 A;  102L A;  142L A;  1CV0 A;  132L A;  5HMV A;  5L3H A;  2W1X A;  4G49 A;  196L A;  240L A;  2MED A;  1N4F A;  2BQM A;  3DN4 A;  3GUO A;  1GE2 A;  3A95 A;  3VWO A;  1PQM A;  4D9Z A;  1LJG A;  5AMY A;  4ETC A;  3C8Q A;  1C6Q A;  4ET9 A;  1L83 A;  233L A;  2MEA A;  5LIN A;  1LHL A;  1KY0 A;  1W6Z A;  3DN0 A;  4I7R A;  1BQL Y;  1L56 A;  1EL1 A;  4DD9 A;  183L A;  1L10 A;  4UWU A;  1F0W A;  135L A;  4W58 A;  3RZE A;  3WW6 A;  4NGW A;  1JPO A;  3OK0 A;  4DD1 A;  1GE3 A;  2B6Z A;  1JJ1 A;  1RFP A;  3A34 A;  4NIJ A;  1DKJ A;  3RW8 A;  1UUZ C;  1LMN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2BAA A;  2EPE A;  4W56 A;  3SN6 R;  4I7M A;  1P5C A;  1L07 A;  2I25 L;  5J7C A;  1YKY X;  1WQP A;  5ILF A;  1LZ6 A;  3LYM A;  4GCF A;  2G4N A;  1YKX X;  1QT5 A;  4KXI A;  3LZ2 A;  3RT5 X;  3C82 A;  1QSQ A;  3C83 A;  177L A;  4WLX A;  1LJJ A;  4ETE A;  1L06 A;  1OUC A;  1E8L A;  3B0K A;  1L58 A;  3LZT A;  158L A;  1HSW A;  2B6Y A;  1IWZ A;  1L72 A;  1UC0 A;  1LYJ A;  1G7L C;  1CV3 A;  1DPX A;  4DDB A;  1TCY A;  1GF7 A;  4YEO A;  2HEA A;  1CNS A;  3A91 A;  102L A;  142L A;  1CV0 A;  132L A;  5HMV A;  5L3H A;  2W1X A;  4G49 A;  196L A;  240L A;  2MED A;  1N4F A;  2BQM A;  3DN4 A;  3GUO A;  1GE2 A;  3A95 A;  3VWO A;  1PQM A;  4D9Z A;  1LJG A;  5AMY A;  4ETC A;  3C8Q A;  1C6Q A;  4ET9 A;  1L83 A;  233L A;  2MEA A;  5LIN A;  1LHL A;  1KY0 A;  1W6Z A;  3DN0 A;  4I7R A;  1BQL Y;  1L56 A;  1EL1 A;  4DD9 A;  183L A;  1L10 A;  4UWU A;  1F0W A;  135L A;  4W58 A;  3RZE A;  3WW6 A;  4NGW A;  1JPO A;  3OK0 A;  4DD1 A;  1GE3 A;  2B6Z A;  1JJ1 A;  1RFP A;  3A34 A;  4NIJ A;  1DKJ A;  3RW8 A;  1UUZ C;  1LMN A; 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