1L34A

High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, arg 96 (right arrow) his
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRHCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title High-resolution structure of the temperature-sensitive mutant of phage lysozyme, Arg 96----His.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1989-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l34A00
1LYEA 1P64A 1L36A 180LA 131LA 3HH5A 253LA 192LA 118LA 3VW7A 4EKRA 1C6BA 3HTBA 3JR6A 167LA 1G1VA 1L17A 1L89A 4DJHA 245LA 1L12A 1T8GA 1L91A 1QS5A 254LA 1G0MA 3SBAA 115LA 1C60A 4W59A 1L77A 1DYGA 3SB9A 2O4WA 2QARC 4LZMA 2HUKA 3G3WA 142LA 4I7LA 2RAZX 2OTZX 4EKPA 197LA 4W57A 170LA 1KY0A 4LDEA 1L75A 1P56A 1C6JA 3C7YA 1L84A 1LWKA 216LA 2OU9A 176LA 238LA 3HT7A 3LZMA 3NYAA 158LA 1L13A 1G06A 3GUKA 1OWZA 1L01A 3C8RA 4IAPA 1SX2A 1L70A 1L59A 1L27A 2NTHA 146LA 2ANVA 2O7AA 1P6YA 138LA 235LA 3CDQA 239LA 2RBPA 2RB2X 2IGCA 1L47A 1LGUA 1DYDA 2B6TA 1D3JA 3DN4A 2OU8A 3RUNA 1LWGA 1QT8A 4ZPUA 1CU5A 1L08A 1L0JA 130LA 1L40A 149LA 1L42A 1L32A 233LA 1L30A 1LYJA 5I14A 4EXMA 2F2QA 1QT5A 187LA 3HT6A 1C66A 1QT6A 1L39A 246LA 3HT9A 4W58A 1L11A 2CUUA 3OE9A 4YX7C 1LYDA 3D4SA 1OVJA 174LA 3HU8A 1L50A 1CV4A 1JTMA 2B73A 3SB8A 1L26A 1L03A 3HWLA 102LA 3K2RA 1L68A 3HU9A 1OWYA 3C83A 129LA 251LA 1T8FA 145LA 4I7TA 1C6PA 1DYAA 123LA 1CX7A 1L65A 1PQJA 1L97A 201LA 242LA 224LA 1L71A 113LA 1DYBA 231LA 189LA 198LA 186LA 199LA 1T97A 1L64A 2B70A 3HH6A 1L83A 1P7SA 1L94A 2B72A 1L52A 161LA 1L79A 157LA 1L25A 1QTZA 1QTCA 1C6MA 3HDFA 1LYFA 1L90A 137LA 2Q9DA 1SWZA 1L09A 1L20A 2B74A 3L64A 143LA 1C6DA 4ARMB 1G1WA 1L38A 1L28A 1CV5A 1ZYTA 1C61A 1DYEA 1KY1A 1WTHA 3C81A 3V2WA 110LA 1QUHA 4I7RA 4EJ4A 3NY9A 1B6IA 1L04A 122LA 1L87A 1LLHA 4ARLA 159LA 4S0WA 219LA 244LA 3DMVA 4I7MA 141LA 4AQNA 3SB5A 3C7WA 261LA 1P37A 3L2XA 1OV7A 195LA 1L69A 155LA 1L74A 1JQUA 1L05A 1L73A 225LA 2RBNA 2LCBA 1LGXA 4I7PA 3HTGA 1D9WA 144LA 1CV6A 1KS3A 3G3XA 1G0KA 7LZMA 2B75A 4EKSA 177LA 119LA 150LA 1L06A 160LA 1L62A 3F8VA 3HUQA 3GUJA 1QSQA 1G0PA 1D2YA 200LA 181LA 1LI2A 1G0LA 126LA 1PQDA 3C8SA 108LA 3G3VA 1L57A 171LA 1L49A 1L54A 210LA 214LA 241LA 3HTDA 128LA 3DN6A 1L00A 1L67A 226LA 1L81A 1CU2A 1P2RA 2RBOA 152LA 1QT4A 3UONA 1C68A 1CVKA 1L93A 3FADA 173LA 1L24A 1C6LA 1QTVA 165LA 1G0GA 4I7NA 3DN3A 1L18A 206LA 4I7OA 1L72A 3GUPA 164LA 2HULA 4DKLA 2Q9EA 260LA 1L46A 1ZURA 162LA 2RBSA 2F32A 1PQKA 3GUMA 156LA 2HUMA 3OE0A 1C6CA 4GRVA 3DKEX 1QTDA 190LA 4K5YA 184LA 1L0KA 258LA 3F9LA 3SBBC 1CV0A 223LA 191LA 1C6HA 3HTFA 250LA 4ARPA 1L61A 183LA 1KW5A 2A4TA 4GBRB 252LA 1CX6A 1C6EA 3DN2A 2RB0X 1LYIA 1ZWNA 1L21A 1QT7A 1KW7A 222LA 1K28A 1D3MA 2RAYX 1L95A 4PJZA 2OEAX 1L43A 1C6AA 4ARQB 188LA 1CU0A 147LA 1QUDA 228LA 1CV1A 1L41A 3HUAA 1P2LA 1L16A 1SSWA 1OYUA 209LA 4I7JA 236LA 3HH4A 3EMLA 3CDVA 248LA 2OE9X 175LA 104LA 3C7ZA 221LA 218LA 255LA 4I7SA 2O79A 1SX7A 262LA 1L19A 1L15A 2RBQA 1D2WA 1L88A 1LPYA 3DMZA 3RZEA 2OU0X 3DN1A 1L85A 1D3FA 1PQIA 2QB0B 3C80A 1C64A 230LA 3CDRA 1L63A 4EKQA 1KNIA 1C69A 1LW9A 1L99A 2ANXA 1CUPA 1CV3A 1P36A 1L35A 172LA 178LA 109LA 1LGWA 168LA 2RBRA 1C6QA 3DN0A 4ARMA 1DYCA 1L98A 3PDSA 2B7XA 1CUQA 4OO9A 4W56A 1CU3A 4PK0A 1P3NA 3SB6A 1LYHA 1T8AA 4YXCA 4W53A 3CDTA 4E97A 120LA 1LI6A 3GULA 247LA 4LDOA 112LA 1LI3A 2RB1X 220LA 1QTBA 1DYFA 1QTHA 3QAKA 4W55A 1L45A 1L34A 229LA 140LA 237LA 1C62A 3HUKA 3SN6R 1C6GA 2B6YA 3C82A 1QUGA 1L07A 259LA 1XJUA 3ODUA 1OVHA 1C6NA 2RH1A 1L48A 1L82A 1L86A 2L78A 3FA0A 4W54A 3OE8A 1C6IA 1OV5A 103LA 1L58A 5LZMA 1L14A 2NTGA 1XJTA 3HH3A 1T6HA 125LA 2OTYX 2LZMA 1C67A 232LA 1EPYA 1L02A 2LC9A 2B6XA 234LA 3C8QA 212LA 4ARJA 1NHBA 211LA 1L44A 2B6WA 1L37A 1L51A 4W51A 1QT3A 1L66A 4I7KA 213LA 1QSBA 148LE 3NY8A 205LA 1P46A 4DAJA 107LA 4YXAC 1L53A 1C65A 1SSYA 1QS9A 3DMXA 215LA 249LA 1G0QA 1JTNA 1L96A 114LA 1CTWA 3FI5A 3PBLA 1I6SA 1C63A 1LYGA 2OE7X 1L29A 1TLAA 163LA 169LA 1L22A 3GUNA 3DN8A 2F47A 1L10A 3GUOA 182LA 1OVKA 166LA 3GUIA 1P5CA 3V2YA 2B6ZA 196LA 1L60A 185LA 111LA 3HDEA 4ARQA 1C6FA 257LA 4EPIA 3OE6A 2OE4X 1G07A 1C6KA 2Z6BA 1CU6A 3HT8A 243LA 1L56A 1L80A 1C6TA 1L92A 3CDOA 1XEPA 227LA 4LDLA 1G0JA 127LA 217LA 1L55A 4EPFA 4W52A 1D3NA 139LA 1L31A 1QUOA 256LA 3DNAA 240LA 1L33A 1PQMA 151LA 1SWYA 6LZMA 3SB7A 1PQOA 1L76A 1L23A 4I7QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UWUA 4G4CA 2N5ZA 253LA 4XJDA 3TXHA 192LA 1KXXA 118LA 4UWNA 3TXJA 4WG7A 5II3A 1L89A 3A96A 4QEQA 1L12A 5KXRA 2BLYA 115LA 1C60A 1OQMA 4W59A 1LSZA 4WM4A 2HUBA 1L77A 1LSNA 3A95A 1JHLA 5I54A 2HUKA 3IWRA 2OTZX 5B1FA 5KKIA 1L84A 1LWKA 3LZMA 238LA 5FSTA 158LA 5KJ9A 1VFBC 3CSQA 134LA 3C8RA 3IJUA 2G4NA 2ANVA 4DDAA 1P6YA 2G4PA 239LA 2RBPA 1YL0X 1F6RA 5C6JA 3QNGA 2B6TA 4BADA 4Z41A 2FBBA 1LMTA 3W6FA 1L08A 1L0JA 1L40A 1L32A 2ZNXY 1HEPA 5F81A 4WO9A 5IDDA 4N5RA 5I4WA 3GXKA 1IWWA 2BQNA 3ZEKA 1GB7A 3HU8A 4ET9A 2B73A 3HWLA 2ZYCA 4GCCA 1L68A 1IOQA 3OK0A 5LVGA 4I7TA 1QIOA 1D0KA 3TXKA 1L97A 1LZ8A 1LJIA 201LA 5B1GA 4ETEA 189LA 1CKGA 198LA 4N8ZA 199LA 1D0LA 1VATA 2B70A 1BGIA 5LYTA 1GF8A 1N4FA 1L79A 157LA 1L25A 2ZIKA 2DQFC 4HJYA 4C3WA 2LYMA 3EBAB 1LZ9A 3A92A 1XEIA 2BQCA 2B74A 194LA 2ZILA 2LZTA 4ANRA 2LYOA 5B06A 1DYEA 4LFPA 5L3HA 4I7RA 3NY9A 1LSFA 1GFKA 244LA 3P4ZA 4J0LA 1L05A 1OUGA 1LMQA 1LZTA 1GPQC 2LCBA 1IO5A 4I7PA 1B9OA 144LA 3G3XA 7LZMA 1SQ2L 1WQPA 4HV1A 4LZTA 1L62A 1IOCA 154LA 5KXZA 4WM6A 2MEEA 2ZNWY 1L54A 4B4JA 5KY1A 208LA 1G7LC 1LMCA 1L67A 5APFA 1DZBX 1CU2A 1P2RA 2RBOA 3WXUA 1C68A 1YIKA 173LA 1QTVA 4NHSA 1XGUC 1NBZC 260LA 1ZURA 1FKQA 1DPXA 2RBSA 1B5UA 3CSZA 1RI8B 1REXA 2D4KA 3OE0A 1C6CA 3DKEX 4RW2A 1JSFA 184LA 2BQIA 4GCDA 258LA 2Z2FA 1JWRA 1NDGC 1VDQA 2A4TA 1XGRC 1T3PA 4TWSA 1L21A 5HNLA 1D3MA 4LYBA 1NDMC 5KXXA 193LA 1REYA 5I4YA 4PPOA 1WQMA 1JUGA 1I1ZA 1OUBA 236LA 4H8YA 4TX7A 3HH4A 3EMLA 2H9KA 248LA 3HBHA 175LA 255LA 4M6DA 2O79A 2GV0A 1L19A 1D2WA 4W94A 1LYYA 4LYCA 1JEFA 1QUTA 1IP2A 1D0MA 1QDTA 1C69A 3QY4A 4WMGA 1ALCA 1LW9A 1CUPA 1BHZA 1C6QA 3DN0A 4ARMA 4NSHA 1LMOA 4MSTA 1CU3A 4PK0A 4LYOA 2ZIJA 1GF7A 1V7SA 2IHLA 1A4VA 1UUZC 3J4GA 1C10A 112LA 220LA 1OUFA 5HNCA 3QAKA 1L45A 4NGVA 1C62A 2Z19A 1B0DA 1C6GA 2B6YA 4NEBA 4TSCA 2D4JA 1QUGA 1GB8A 5AMYA 1KIQC 1C6NA 1GBOA 5KXKA 5F9UA 1L82A 4H9BA 2DQGY 1LSPA 1C6IA 2BQAA 4GN3A 5LZMA 1L14A 2DQHY 1XJTA 125LA 2VB1A 2OTYX 1JJ0A 1LSYA 1C67A 1HEMA 1FLQA 1QSAA 3WXTA 5F14A 2D91A 4ARJA 1L44A 1L66A 148LE 3NY8A 1RE2A 205LA 2Z38A 2I25L 1DI3A 2YBLA 1L53A 4CGEA 3GXRA 1E8LA 1G7IC 3DMXA 4OWHA 1LJEA 1G0QA 2FYDA 3AGIA 4DDBA 1I6SA 3K3TA 4U3XB 2H5ZA 1TLAA 1UICA 169LA 2IFFY 5HMJA 2F47A 5ILFA 4QDNA 4FDYA 4BAPA 166LA 1JTTL 2DKVA 3CSRA 2F30A 111LA 1GB0A 1C6KA 1WQOA 1HEOA 243LA 1AT5A 3A34A 3AJNA 4YEMA 217LA 4W52A 2F2NA 3DNAA 3HBDA 1BWJA 5KXPA 1W08A 2XTHA 1LYEA 2DQCY 131LA 1WTMA 4HPEA 1UIFA 5KXYA 4EKRA 1C6BA 2YVBA 3HTBA 167LA 1L17A 4G9SA 4OWAA 4DJHA 1IP7A 2I6ZA 2D6BA 3SBAA 4NGWA 1IY4A 1LZ1A 4IATA 1YQVY 170LA 4FJRA 1BB4A 2YBMA 1L75A 1YILA 1C6JA 3LN2A 3C7YA 1XEJA 4B1AA 3LYZA 2RSCA 1OUEA 4N0JA 1SX2A 1LJHA 5KXTA 2NTHA 146LA 4KXIA 4W96A 138LA 1IWTA 1C45A 1GXV2 1XGPC 1JTPL 1DI5A 4X3BA 2IGCA 1L47A 4H8XA 1LJJA 3RUNA 4ZPUA 1QT8A 4ETBA 3TMXA 132LA 2W1YA 1UC0A 1LYJA 4EXMA 5FHWA 2F2QA 1QT5A 187LA 246LA 4W58A 2CUUA 3OE9A 5LIOA 3D4SA 1L50A 1CV4A 4DC4A 1IP5A 1ZMYL 1L03A 102LA 2YBNA 1AT6A 4HP0A 5JENB 1LSBA 123LA 1PQJA 3EMSA 224LA 1LJKA 1GF4A 1LZEA 1L71A 1DYBA 4N1CC 1GB3A 186LA 1YKXX 3LYMA 1JPOA 1P7SA 4H1PA 4A7DA 1L94A 2B72A 1L52A 3TXGA 161LA 4DD3A 1TEWA 5FCPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UWU A;  4G4C A;  2N5Z A;  253L A;  4XJD A;  3TXH A;  192L A;  1KXX A;  118L A;  4UWN A;  3TXJ A;  4WG7 A;  5II3 A;  1L89 A;  3A96 A;  4QEQ A;  1L12 A;  5KXR A;  2BLY A;  115L A;  1C60 A;  1OQM A;  4W59 A;  1LSZ A;  4WM4 A;  2HUB A;  1L77 A;  1LSN A;  3A95 A;  1JHL A;  5I54 A;  2HUK A;  3IWR A;  2OTZ X;  5B1F A;  5KKI A;  1L84 A;  1LWK A;  3LZM A;  238L A;  5FST A;  158L A;  5KJ9 A;  1VFB C;  3CSQ A;  134L A;  3C8R A;  3IJU A;  2G4N A;  2ANV A;  4DDA A;  1P6Y A;  2G4P A;  239L A;  2RBP A;  1YL0 X;  1F6R A;  5C6J A;  3QNG A;  2B6T A;  4BAD A;  4Z41 A;  2FBB A;  1LMT A;  3W6F A;  1L08 A;  1L0J A;  1L40 A;  1L32 A;  2ZNX Y;  1HEP A;  5F81 A;  4WO9 A;  5IDD A;  4N5R A;  5I4W A;  3GXK A;  1IWW A;  2BQN A;  3ZEK A;  1GB7 A;  3HU8 A;  4ET9 A;  2B73 A;  3HWL A;  2ZYC A;  4GCC A;  1L68 A;  1IOQ A;  3OK0 A;  5LVG A;  4I7T A;  1QIO A;  1D0K A;  3TXK A;  1L97 A;  1LZ8 A;  1LJI A;  201L A;  5B1G A;  4ETE A;  189L A;  1CKG A;  198L A;  4N8Z A;  199L A;  1D0L A;  1VAT A;  2B70 A;  1BGI A;  5LYT A;  1GF8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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