1OWZA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 4-fluorophenethyl alcohol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owzA00
2RB2X 1L40A 2Q9DA 1QUDA 2NTGA 1QUGA 3HU9A 3DN2A 128LA 3F8VA 4PK0A 225LA 180LA 158LA 2RAZX 1OV7A 184LA 3HUQA 2LC9A 3HTDA 3HWLA 4ARQA 3FADA 4DJHA 4W58A 1XEPA 3CDQA 1TLAA 3HTBA 3CDOA 3GUKA 112LA 131LA 1L66A 256LA 126LA 216LA 1L76A 1P46A 1L08A 206LA 2O4WA 1PQJA 182LA 156LA 3F9LA 172LA 3C8QA 4EKQA 190LA 1L65A 1LYIA 114LA 142LA 178LA 1CU6A 1C6GA 4YX7C 4W57A 1QTDA 166LA 1LYFA 197LA 1L18A 4ARLA 1T8GA 1ZWNA 3HT8A 3C82A 1CV1A 1L0JA 195LA 4ARMB 2B73A 1L71A 2B70A 2B75A 1L98A 1G0JA 3DMVA 3GUMA 120LA 4DKLA 161LA 1C6IA 1L57A 170LA 1L54A 1L26A 1L21A 188LA 1DYFA 221LA 1OVKA 1JTNA 2RH1A 4EKSA 3HT7A 4LDOA 1C6QA 1KY0A 110LA 1PQDA 1LI6A 2A4TA 1OVJA 1G1VA 1OYUA 191LA 1L87A 228LA 196LA 226LA 6LZMA 1LWKA 147LA 3GULA 3GUNA 1CUQA 3HUKA 1G0PA 1SSYA 181LA 261LA 1C64A 169LA 242LA 1L14A 1L99A 1L94A 257LA 253LA 258LA 1KY1A 1K28A 1L62A 151LA 1L19A 1L22A 150LA 1L89A 4I7NA 1L44A 1LYGA 2OTZX 1L90A 1L75A 3SB9A 1OVHA 1L64A 251LA 237LA 1C63A 2RAYX 3OE0A 186LA 2HUMA 165LA 3CDRA 2OE9X 215LA 123LA 1P37A 4E97A 2RBRA 249LA 1C6FA 3C7YA 1PQIA 1L43A 1L51A 2OTYX 1L12A 1DYGA 1G06A 222LA 3DMXA 1L46A 4W53A 1L97A 1LLHA 230LA 160LA 1P6YA 1L68A 240LA 1QTZA 248LA 102LA 1PQKA 220LA 1P2LA 3D4SA 4I7JA 1L81A 2Q9EA 122LA 1L60A 1QSQA 2O7AA 113LA 1T8AA 2OEAX 223LA 1PQOA 2ANXA 1C6CA 212LA 1CX6A 3DN6A 1D3MA 200LA 198LA 3G3VA 1L23A 108LA 1SX7A 3HU8A 3V2YA 4EJ4A 162LA 1G07A 4EKRA 2QARC 241LA 104LA 1L63A 205LA 1L07A 1B6IA 1L15A 1L20A 1QT7A 1C6AA 2LCBA 1L17A 1LYDA 1L92A 2NTHA 1T97A 3CDVA 3VW7A 211LA 1KNIA 262LA 2B6YA 1ZYTA 3HH3A 1L69A 3C81A 4I7PA 1L24A 1QTBA 3HT6A 4EKPA 163LA 1C6NA 1LGUA 1C6DA 3HUAA 185LA 4DAJA 260LA 218LA 103LA 2Z6BA 1P2RA 2B72A 143LA 1C60A 3C7WA 199LA 1OWZA 2OE4X 2L78A 259LA 3EMLA 1P5CA 1SWYA 1L88A 239LA 1CV5A 3L64A 1PQMA 1G1WA 235LA 1D2YA 3HH6A 3DN8A 1L06A 4ARQB 4I7RA 1KS3A 125LA 139LA 4I7SA 1T6HA 1KW7A 3HH4A 1P36A 1CU2A 1P7SA 4EXMA 167LA 3SBAA 2B6ZA 1DYCA 175LA 3G3XA 1CU5A 1L47A 2OU8A 1L82A 1L61A 1L45A 1LYHA 234LA 4ZPUA 1OV5A 1CX7A 1L30A 1L16A 1LWGA 1G0KA 1G0GA 1L73A 3DKEX 1L85A 227LA 4I7OA 250LA 4W52A 3C8RA 3DNAA 4W56A 1L52A 2RB1X 1JTMA 1L91A 1L37A 1L77A 245LA 2RBQA 1C6MA 1L42A 1LI3A 1QTCA 1C69A 1LGXA 3GUPA 1L11A 1QTVA 1LW9A 1L02A 1L36A 1C67A 146LA 1CV4A 3FI5A 1L48A 3GUOA 1CU3A 4ARMA 1QUOA 3HDEA 183LA 243LA 3NY8A 1C6PA 3ODUA 137LA 1DYEA 3C80A 2F32A 164LA 1QS5A 152LA 1QT3A 173LA 217LA 129LA 1P64A 1L96A 1SWZA 214LA 1CVKA 1L29A 189LA 3UONA 3G3WA 1C61A 3HTGA 1CUPA 2HUKA 3C7ZA 1LGWA 2ANVA 3DN1A 4IAPA 246LA 4PJZA 3NYAA 3HT9A 4W59A 1LI2A 3SBBC 140LA 1L35A 1XJUA 229LA 145LA 3L2XA 1C6LA 1L41A 1L50A 1DYBA 174LA 3QAKA 1L01A 3SB7A 3GUJA 4ARPA 2RBOA 219LA 149LA 176LA 144LA 4GBRB 1SX2A 1CU0A 1L28A 1L58A 2F2QA 2LZMA 1L70A 1D3NA 1DYDA 1D3JA 4I7QA 4K5YA 3PBLA 168LA 1C6HA 213LA 192LA 1CV6A 115LA 4LDEA 3C8SA 3HH5A 2RBPA 2O79A 1QT4A 3SB6A 171LA 1NHBA 2B7XA 4YXCA 3CDTA 4GRVA 1C65A 119LA 1C6KA 4EPFA 1L86A 1G0MA 1L83A 3RZEA 4I7KA 118LA 1WTHA 1LPYA 210LA 1P56A 2QB0B 2F47A 1L49A 1QUHA 1QT8A 1JQUA 1DYAA 1L55A 4ARJA 1L79A 1LYEA 3RUNA 1CV3A 236LA 157LA 2B6WA 127LA 2RBSA 4LZMA 1L03A 252LA 138LA 5I14A 1L32A 1ZURA 2OE7X 4LDLA 159LA 4EPIA 209LA 1L59A 231LA 3SN6R 1QT5A 1C68A 1L39A 3OE9A 177LA 3JR6A 1C62A 3DN0A 155LA 2OU0X 1L10A 1L67A 3C83A 141LA 3GUIA 3K2RA 1QT6A 1C6TA 3OE6A 1L31A 1L56A 7LZMA 1KW5A 1P3NA 254LA 2IGCA 1D2WA 1L95A 2B6TA 1T8FA 1L00A 224LA 2CUUA 3NY9A 130LA 1C6JA 1L93A 1QTHA 3DN3A 5LZMA 233LA 232LA 1L84A 1L05A 1L25A 1L53A 1G0QA 3OE8A 3LZMA 107LA 1CV0A 3HTFA 1SSWA 247LA 1QSBA 3SB8A 1L72A 1XJTA 3V2WA 1L74A 1C6EA 4OO9A 4W55A 109LA 2RBNA 244LA 148LE 2B6XA 1D9WA 1C6BA 4W51A 1G0LA 1L04A 1L27A 2HULA 4S0WA 1L80A 4YXAC 1L34A 255LA 3DN4A 3DMZA 3FA0A 4I7MA 1L13A 4W54A 2B74A 3SB5A 4I7LA 1QS9A 1OWYA 1D3FA 3HDFA 1L09A 111LA 4I7TA 1L0KA 1LYJA 1CTWA 1EPYA 1L38A 3PDSA 1C66A 1L33A 1I6SA 201LA 2RB0X 187LA 238LA 4AQNA 2OU9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5B07A 2ZNWY 1QUGA 1GPQC 4PK0A 4WLXA 1GAYA 225LA 180LA 1AZFA 3FI7A 2RAZX 5FDJA 3P65A 2BQFA 3WULA 1GB2A 1LHMA 3RW8A 4ARQA 1VAUA 4NHIA 4WLYA 5E4PA 3MGWA 4G4CA 3CDOA 131LA 126LA 1L76A 1EQ4A 2DQHY 1I56A 182LA 4RW1A 1B7MA 2H9KA 4B1AA 190LA 1LYZA 142LA 2BQOA 4WM3A 4P2EA 1XFPL 1IP1A 1L18A 1T8GA 3HT8A 4L41A 3C82A 2NWDX 5KY1A 1LOZA 5C6JA 4MSTA 4DD2A 1IY3A 188LA 1DYFA 4XJBA 1DKJA 2LZ2A 4H93A 1JTNA 4EKSA 4LDOA 5IDDA 2DQIY 4YEOA 1L87A 3B0IA 4GN5C 4H8ZA 1B9OA 1VEDA 3ATNA 1NHEA 3HUKA 1C46A 261LA 169LA 3AZ5A 4KT3A 3LYMA 1GFJA 1L94A 1XEKA 4NEBA 2HEDA 1L62A 1TAYA 1B2KA 1L22A 4NFVA 1JUGA 1GFRA 4LGKA 1I20A 3SB9A 1OVHA 1C63A 1N4FA 1UUZC 2HUMA 4ZEEA 5LVIA 1OUGA 3C7YA 222LA 1L46A 1GB5A 4W53A 4H9IA 2DQFC 4NGLA 4XJGA 5LYZA 3N9AA 1L68A 240LA 1ZV5L 248LA 3WW6A 1LJJA 3RU5A 1CKFA 4J1AA 2Q9EA 4XADA 223LA 2H9JA 3TXEA 1HEMA 3DN6A 208LA 200LA 1WQOA 4CFOA 2LZTA 3G3VA 1IP6A 1LMPA 108LA 2EQLA 4J1BA 207LA 4EKRA 1YAOA 5F14A 205LA 1B5YA 1LZSA 1L07A 3LYTA 1G7JC 1L15A 1YKYX 2YBIA 4ANRA 5ILCA 1QT7A 4W96A 5T3FA 4OOTA 1UBZA 2NTHA 5KXTA 1HERA 2YBHA 2ZILA 4G49A 1GF0A 1DI3A 1LHIA 1MELL 2Z37A 1JHLA 1WQQA 5LAFA 3C81A 1A2YC 3SP3A 3HBHA 3HUAA 3W3EA 2HU3A 1GWDA 2DKVA 1GB6A 2Z6BA 1F0WA 5I53A 2YBJA 5KJ9A 3AJNA 1C60A 4YOPA 3A67Y 1OWZA 4NY5A 2L78A 1OUDA 1OQMA 5KXRA 3L64A 2ZNXY 2LYMA 3EBAB 3DN8A 2BPUA 3ULRA 2BQGA 1T6HA 1KW7A 3HH4A 1BWJA 175LA 1L45A 1LYHA 4ZPUA 4DD7A 1L30A 4PHIA 1L16A 2FBDA 4WM1A 1L73A 1L85A 1IR9A 250LA 3DNAA 1L52A 1LMOA 2RB1X 5I4YA 1JTOL 3OJPA 4YM8A 1L91A 2RBQA 2DQEY 5L3HA 1C69A 1LJEA 1UIEA 1L11A 1LSYA 1LW9A 4NGJA 1BB6A 1CV4A 132LA 4IATA 1QUOA 1UIAA 3HDEA 4QY9A 183LA 2Z39A 1RE2A 3AZ6A 2F32A 4B4IA 164LA 1QS5A 4WOAA 1OUAA 4NWEA 1LPIA 4PPOA 2DQGY 1P64A 1GD6A 1UACY 1L96A 214LA 4R0FA 3UONA 1IEEA 1C61A 2HUKA 3DN1A 4PJZA 1LI2A 3SBBC 140LA 1XJUA 229LA 145LA 1LZCA 3L2XA 1LYSA 1DYBA 3HFMY 4DQ5A 1J1PY 2Z19A 1YROA 4GBRB 1D6PA 1B7OA 4NSJA 1SX2A 1CU0A 5HMVA 2ZWBA 5I5QA 1D3NA 1HSXA 4K5YA 1LZEA 1LZ4A 192LA 4ETEA 2O79A 1QT4A 3SB6A 1F6SA 4WM5A 2FBBA 4GLAA 1GBYA 2N5ZA 3CB7A 2QB0B 4HJVA 2F47A 4GN3A 1DYAA 1LYYA 1GBZA 1DI4A 3IWRA 2EIZC 4H91A 4Z98A 252LA 4DT3A 138LA 4EPIA 1BB3A 231LA 5I4WA 3OE9A 1C62A 3TXBA 4N5RA 4WLTA 4D9ZA 4ZFPA 1FLQA 1QT6A 4ETBA 1C6TA 1IC7Y 7LZMA 2IGCA 1L95A 2B6TA 1FDLY 1L00A 1LZ8A 4NGVA 1BHZA 3KAMA 2Z2FA 2H5ZA 233LA 2HEBA 1L05A 4QGZA 2MEAA 1CV0A 4N0JA 247LA 3ATOA 1QUSA 1L74A 3OK0A 109LA 244LA 3CT0A 1RI8B 5DN4A 1G0LA 1YL1X 4S0WA 3WUMA 4OWBA 1LJ4A 5F81A 4B49A 5KXOA 3CQLA 2C8OA 1L13A 2BQNA 1VDTA 5JENB 3HDFA 1B7PA 1GF7A 4I7TA 1L0KA 3D9AC 1NBYC 1BB5A 1C66A 1I6SA 201LA 2MEEA 1OUIA 238LA 4AQNA 1GFGA 1L40A 1MLCE 4IJ4A 3HU9A 4WO9A 4DC4A 1GE4A 1GBSA 3TMXA 3HTDA 3FADA 2A7FA 1D6QA 1XEPA 1BGIA 3WPJA 1LZAA 1OUCA 4E3UA 1JTPL 3CDQA 1UCOA 112LA 256LA 1NWGA 206LA 2BQAA 1PQJA 4TWSA 2EPEA 5ILFA 3C8QA 1JISA 1GFVA 4EKQA 1XGUC 1CKGA 1L65A 1LYIA 2DQJY 178LA 1C6GA 4YX7C 4W57A 1JKDA 1QTDA 3LZ2A 4ARLA 4BAPA 3VWOA 1IOCA 1L71A 5LA8A 1L98A 4XJHA 2BQCA 161LA 1L57A 5EBHA 1F10A 170LA 1L26A 4N1CC 4DWXA 1GBXA 221LA 4HSFA 1OVKA 2RSCA 3J6KA 4QEQA 4H9HA 3HT7A 2XTHA 1LI6A 1DXJA 1OVJA 1OYUA 5APEA 196LA 1DPWA 1RFPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5B07 A;  2ZNW Y;  1QUG A;  1GPQ C;  4PK0 A;  4WLX A;  1GAY A;  225L A;  180L A;  1AZF A;  3FI7 A;  2RAZ X;  5FDJ A;  3P65 A;  2BQF A;  3WUL A;  1GB2 A;  1LHM A;  3RW8 A;  4ARQ A;  1VAU A;  4NHI A;  4WLY A;  5E4P A;  3MGW A;  4G4C A;  3CDO A;  131L A;  126L A;  1L76 A;  1EQ4 A;  2DQH Y;  1I56 A;  182L A;  4RW1 A;  1B7M A;  2H9K A;  4B1A A;  190L A;  1LYZ A;  142L A;  2BQO A;  4WM3 A;  4P2E A;  1XFP L;  1IP1 A;  1L18 A;  1T8G A;  3HT8 A;  4L41 A;  3C82 A;  2NWD X;  5KY1 A;  1LOZ A;  5C6J A;  4MST A;  4DD2 A;  1IY3 A;  188L A;  1DYF A;  4XJB A;  1DKJ A;  2LZ2 A;  4H93 A;  1JTN A;  4EKS A;  4LDO A;  5IDD A;  2DQI Y;  4YEO A;  1L87 A;  3B0I A;  4GN5 C;  4H8Z A;  1B9O A;  1VED A;  3ATN A;  1NHE A;  3HUK A;  1C46 A;  261L A;  169L A;  3AZ5 A;  4KT3 A;  3LYM A;  1GFJ A;  1L94 A;  1XEK A;  4NEB A;  2HED A;  1L62 A;  1TAY A;  1B2K A;  1L22 A;  4NFV A;  1JUG A;  1GFR A;  4LGK A;  1I20 A;  3SB9 A;  1OVH A;  1C63 A;  1N4F A;  1UUZ C;  2HUM A;  4ZEE A;  5LVI A;  1OUG A;  3C7Y A;  222L A;  1L46 A;  1GB5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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