1CU5A

T4 lysozyme mutant l91m
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSMDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cu5A00
1QTCA 4LZMA 1C63A 3HTFA 232LA 4IAPA 3G3VA 4I7LA 4OO9A 1OVHA 1CU5A 1L44A 1L49A 149LA 1L01A 1OVKA 1L80A 1L30A 1CV0A 1D3JA 1L27A 1L43A 248LA 249LA 1L61A 1QT3A 3OE9A 1L68A 1CU6A 142LA 4W58A 3HTBA 2OTYX 240LA 1QUGA 2OE4X 1L40A 2RB2X 199LA 182LA 120LA 126LA 2RBNA 1TLAA 3C7ZA 4ARJA 1G0LA 1L67A 2LC9A 201LA 1C6DA 1L06A 2O7AA 1LGUA 174LA 1DYCA 236LA 259LA 3C8QA 1L28A 4YX7C 4I7NA 1P7SA 3DN4A 4I7PA 2O79A 158LA 1XJTA 242LA 1L37A 235LA 3C8RA 1KW7A 1L11A 4EKRA 257LA 3C7YA 161LA 127LA 4I7QA 1L33A 1L50A 3SB7A 1LYEA 163LA 2OU0X 1L85A 1L74A 3OE0A 238LA 1XJUA 145LA 2HUKA 4LDOA 3FA0A 167LA 1C6GA 196LA 2RAYX 2OE9X 3FADA 3UONA 1L98A 1QTHA 1L79A 1L92A 1L0KA 1K28A 1QUHA 144LA 1LWGA 1OV7A 200LA 4ARMB 1L57A 1CVKA 2RBSA 1C6HA 1L34A 1ZURA 164LA 1LYIA 3G3WA 3ODUA 2OU9A 252LA 1OVJA 1LGWA 1PQOA 155LA 1QT4A 1PQIA 2RBQA 1QS9A 2A4TA 3C8SA 3C80A 4GRVA 1LYDA 3HH5A 112LA 1LI6A 3GUJA 1XEPA 2B75A 3HTGA 2B6ZA 1DYBA 215LA 1L16A 2Q9DA 4EKQA 3HTDA 2F32A 4ARLA 1LW9A 1DYGA 1G0JA 212LA 1G1WA 146LA 151LA 1L22A 260LA 175LA 4I7KA 3HT8A 1L76A 2B6TA 3CDQA 170LA 115LA 1LYHA 1G06A 4EKPA 171LA 3PDSA 1CV3A 1L02A 1L07A 156LA 180LA 2O4WA 4YXAC 227LA 1D3NA 262LA 3NYAA 217LA 1C6NA 3CDRA 1G0MA 1T8GA 1L56A 1OWYA 3GUKA 1L99A 1P37A 5LZMA 1T97A 1L42A 125LA 1PQMA 1T8FA 1L19A 1LI2A 119LA 186LA 4EKSA 1PQKA 4W52A 195LA 166LA 251LA 4W59A 1LLHA 1QSQA 4S0WA 1L39A 3RUNA 1CTWA 1L97A 147LA 1L75A 1CV5A 4DKLA 1G07A 1QSBA 172LA 1T6HA 3DN2A 3V2YA 1L29A 178LA 1PQJA 1L71A 233LA 1DYFA 129LA 1KY1A 1CUPA 198LA 4I7TA 3CDOA 1L12A 1D2YA 1C6FA 1B6IA 1QT8A 1D3FA 139LA 137LA 3C81A 152LA 4DJHA 1G0QA 4W56A 1G0GA 1L05A 220LA 4PJZA 1P64A 4K5YA 1JTNA 3EMLA 1L20A 2B6YA 1KNIA 1L00A 1OV5A 1ZYTA 3K2RA 4LDEA 3DN8A 3SB8A 1L82A 1L87A 176LA 110LA 3SBBC 1SSYA 109LA 1LYFA 3HDFA 231LA 1P46A 4ARQA 162LA 1QT7A 1L88A 130LA 1L58A 1C62A 1CU2A 2B73A 7LZMA 1L46A 1L47A 1QUOA 1C6LA 216LA 211LA 2Z6BA 1L52A 1P56A 3DMXA 1C6KA 2B72A 3HH4A 1L15A 255LA 128LA 3G3XA 3D4SA 1C6EA 143LA 3DN3A 1L14A 1L60A 1L63A 122LA 3QAKA 3PBLA 1L95A 1EPYA 3HT9A 1I6SA 1CUQA 3NY8A 4W54A 1T8AA 4DAJA 3FI5A 1L26A 2F2QA 1KW5A 123LA 1L55A 254LA 157LA 184LA 1C6QA 239LA 1L62A 1L31A 1L51A 1L64A 1LI3A 187LA 224LA 3C7WA 3DN6A 160LA 3GUPA 1L10A 2OTZX 1NHBA 3DNAA 1L24A 2B6WA 138LA 1L65A 1C61A 4EPIA 4ARMA 1L59A 221LA 2RB0X 1JTMA 1L90A 1L32A 229LA 228LA 111LA 3JR6A 4YXCA 1L54A 1G0KA 1L72A 4I7RA 246LA 223LA 3HH3A 4ARPA 1KS3A 1KY0A 1L35A 209LA 3SB9A 1CU0A 1C67A 1L45A 3F9LA 1ZWNA 1L48A 159LA 226LA 1LGXA 1C6JA 2RAZX 4W53A 1P36A 219LA 4I7MA 1SX7A 2RBPA 250LA 1P3NA 3HDEA 1PQDA 4LDLA 3L2XA 225LA 3OE6A 2IGCA 3F8VA 1L83A 1JQUA 2OU8A 4EJ4A 102LA 2HUMA 1P2LA 197LA 1OYUA 2L78A 206LA 1QS5A 3HUQA 188LA 1QT6A 1L93A 256LA 3DN1A 1L84A 1D9WA 1L25A 1D2WA 3HWLA 1L69A 4EXMA 107LA 1QTDA 1P2RA 1CV1A 2B6XA 218LA 1L70A 1L86A 4AQNA 4E97A 1QTBA 4EPFA 234LA 4PK0A 3GUIA 230LA 1DYEA 1L04A 261LA 2RB1X 1QT5A 1OWZA 148LE 3GUOA 2B7XA 150LA 1L17A 1DYAA 1CX6A 1DYDA 169LA 1L21A 4ARQB 118LA 1SWYA 1CV4A 3HT6A 2NTHA 1L53A 3LZMA 4ZPUA 3NY9A 1CU3A 1G1VA 3DN0A 1L94A 3C82A 3L64A 1L89A 1QTZA 1C6PA 4W51A 168LA 2ANXA 191LA 1C64A 1LYJA 2B70A 2F47A 1QUDA 2B74A 1CX7A 4I7OA 3SB5A 210LA 4GBRB 104LA 1C60A 1LPYA 3RZEA 3HT7A 185LA 4W55A 222LA 165LA 183LA 1C6TA 1L18A 2RBRA 244LA 3HH6A 1CV6A 1L96A 1P5CA 1L66A 3SN6R 3GULA 192LA 1L09A 1L03A 114LA 173LA 103LA 2ANVA 1LYGA 3HU9A 1D3MA 1SWZA 5I14A 140LA 1QTVA 1SSWA 1C65A 4I7JA 177LA 2RH1A 2RBOA 131LA 1L13A 258LA 3OE8A 1C6MA 1L91A 1C66A 141LA 3GUMA 3VW7A 1L38A 1G0PA 181LA 1WTHA 1L73A 3C83A 205LA 113LA 1LWKA 2OE7X 1C68A 3HUKA 245LA 3CDVA 2NTGA 2QB0B 190LA 214LA 4I7SA 1P6YA 2LZMA 2QARC 2Q9EA 241LA 6LZMA 1L0JA 1L23A 2HULA 1SX2A 4W57A 3SB6A 213LA 2LCBA 1L36A 247LA 237LA 108LA 3DKEX 189LA 1C6AA 1L08A 243LA 1L77A 3GUNA 3SBAA 3CDTA 3V2WA 1L81A 3DMVA 3DMZA 3HUAA 1C69A 1C6IA 1C6BA 1C6CA 2OEAX 1L41A 253LA 2CUUA 3HU8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QTCA 3WUNA 4OWEA 1C63A 1OQMA 4IAPA 1LZBA 4I7LA 1OVHA 4RLMA 1T6VL 4XJBA 4CFPA 4H92A 1OVKA 1L80A 1CV0A 1D3JA 1QTKA 1B7PA 4WLTA 248LA 1LZ5A 4XENA 5LVKA 1CU6A 4HP0A 1GB9A 2OTYX 4WLXA 5L3HA 2MEAA 1L40A 4DD7A 3J4GA 199LA 120LA 4A7DA 126LA 1VDQA 1IP2A 3ATOA 4MR1A 3IJUA 5E9RA 4ARJA 1XEKA 2YBNA 4YF2A 3CT0A 1XGTC 1P7SA 4B0DA 4I7PA 158LA 132LA 1L37A 235LA 1HEPA 1IP6A 2MEFA 1LYEA 163LA 1L74A 3OE0A 1D6QA 1HHLA 1C6GA 2DQFC 4ANRA 4NGJA 1QTHA 4LYCA 144LA 1YQVY 4DC4A 1INUA 1C10A 4WM1A 1CVKA 3B6LA 1C6HA 4G9SA 1ZURA 1UIGA 1BWJA 1GE0A 1LYIA 1CKFA 1LJNA 2A4TA 1LYDA 2B75A 2B6ZA 1CKHA 1BGIA 1IWXA 4UWNA 3HTDA 2F32A 5B59A 3AW6A 5IDDA 212LA 1OUDA 4MCKA 260LA 1L76A 4QEQA 4XJDA 5L3IA 3WYHA 4EKPA 4LGKA 2ZYPA 1CV3A 1L02A 156LA 5ILCA 3N9EA 1UIAA 1NDMC 262LA 1C46A 3NYAA 217LA 1G0MA 2C8PA 1T8GA 1L56A 3GUKA 3ATNA 1HF4A 4N8ZA 4NHTA 1PQMA 2YDGA 1T8FA 1PQKA 1HEWA 195LA 1LMOA 3TXIA 4W59A 2LYZA 5KXSA 3RUNA 1JWRA 4WG7A 1G07A 1QSBA 4WLDA 3DN2A 3V2YA 1L29A 1GF9A 1DYFA 1J1OY 1LZDA 129LA 1KY1A 198LA 5HQ1A 1GDXA 3A6BY 1C6FA 2MEDA 1OUHA 1D3FA 2DQDY 3C81A 152LA 3M18B 1KXYA 4NFVA 2F4AA 2H5ZA 1L05A 1LZAA 1P64A 1WQMA 3EMLA 4LYTA 5LAFA 2B6YA 5DN5A 1ZYTA 3EO5A 3DN8A 2ZWBA 1OUEA 4NHPA 1FLQA 176LA 1GXV2 1GEZA 4H8YA 1P46A 1VEDA 4DT3A 1DI4A 1L88A 1LHIA 1LSNA 5ILFA 4FJRA 4E3UA 2ZIKA 211LA 2Z6BA 3K3TA 1BQLY 2MEHA 3DMXA 1C6KA 1HMKA 1LHLA 2G4NA 3D4SA 1L60A 3QAKA 1NMMA 3HT9A 3AGIA 1T8AA 4HSFA 1UIDA 4LZTA 4Z41A 2GV0A 1L26A 184LA 1LYYA 1LYSA 1LSYA 1C6QA 239LA 5KXYA 4TSCA 1L31A 5F16A 2FYDA 4NHIA 160LA 5I4XA 2OTZX 1G7JC 4LYZA 138LA 5KXPA 1IX0A 4GN5C 1GB0A 1XEIA 4EPIA 1DI5A 2C8OA 3D9AC 111LA 4WM5A 1GFVA 5KXMA 1L35A 209LA 2IHLA 3SB9A 1GPQC 1C67A 159LA 1LGXA 4GN4A 1P36A 1SX7A 2DQEY 2AUBA 1DKKA 4H9EA 3OE6A 4ZFPA 3F8VA 4LYMA 1EQ4A 102LA 2HUMA 1AT6A 3A96A 4NGYA 1CJ7A 206LA 3HUQA 188LA 2HEEA 1L93A 3WPJA 1D9WA 1L25A 1L84A 1L69A 2MEBA 2B6XA 4AQNA 1QTBA 4N1EI 4PK0A 1REMA 1VDPA 230LA 2F30A 1N4FA 1GAYA 1DYDA 169LA 1L21A 1RJCB 1IP5A 2A7DA 118LA 1OP9B 4H9FA 3HT6A 1B7SA 4HJZA 2Q0MX 1L53A 1LZ1A 5LYMA 1G1VA 1L94A 1HEQA 1QTZA 1C6PA 4ML7A 4W51A 168LA 1C08C 4XJFA 1LYJA 1CKDA 5KXZA 5I4YA 2F47A 1QUDA 1BB5A 1IWVA 4W96A 4DD0A 4G4CA 1JJ0A 3HT7A 185LA 1L18A 1LMAA 1VDTA 1GB5A 3HH6A 3GULA 192LA 1L09A 1L03A 173LA 103LA 4G4HA 1JIYA 1LZ9A 1QIOA 177LA 4Z3MA 2EKSC 4XN6A 4HV2A 1PS5A 1FDLY 1L73A 3C83A 1LWKA 2OE7X 1C68A 4RLNA 3HUKA 245LA 1BB4A 3CDVA 2NTGA 3A95A 1NBZC 1LHMA 1W08A 4OWBA 1LJIA 1L23A 4ET9A 1YKZX 3SB6A 1LSCA 1JTPL 4B1AA 247LA 1ZV5L 3CB7A 3DKEX 5DM9A 3T6UA 1IWYA 3IWRA 4GCFA 1OUBA 1L81A 1CKCA 4DDAA 5FCPA 2BQDA 3HUAA 5LAGA 253LA 4H94A 2MECA 3G3VA 4UWUA 4WO6A 1GE3A 1LHHA 149LA 1L01A 1GEVA 1JISA 4H91A 1B0DA 3B72A 3WVYA 1QT3A 4PJ2C 4DQ5A 1IWTA 3OE9A 4W58A 3WW5A 1QUGA 2HU1A 2RB2X 3RNXA 1AT5A 1JKBA 2BQOA 5E4PA 1TBYA 1LSPA 1IY3A 3C7ZA 1G0LA 1L67A 4NY5A 1C6DA 1HEMA 1ALCA 3AYQA 3TXKA 5F9UA 4GN3A 4I7NA 3DN4A 1OUCA 4YENA 1JKDA 1JEFA 4EKRA 4BAFA 4DD9A 127LA 2LYOA 4I7QA 1TCYA 1L50A 4B4IA 5DN4A 1GFUA 1IC7Y 2OU0X 1G7IC 4I0CA 3FA0A 3TMWA 5T3FA 3BKHA 5FELA 2BQGA 2OE9X 1LSFA 1FLUA 1NF5A 2HEAA 3WU7A 2LZ2A 1XEJA 4CGEA 1L57A 4Z46A 2RBSA 1DXJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QTC A;  3WUN A;  4OWE A;  1C63 A;  1OQM A;  4IAP A;  1LZB A;  4I7L A;  1OVH A;  4RLM A;  1T6V L;  4XJB A;  4CFP A;  4H92 A;  1OVK A;  1L80 A;  1CV0 A;  1D3J A;  1QTK A;  1B7P A;  4WLT A;  248L A;  1LZ5 A;  4XEN A;  5LVK A;  1CU6 A;  4HP0 A;  1GB9 A;  2OTY X;  4WLX A;  5L3H A;  2MEA A;  1L40 A;  4DD7 A;  3J4G A;  199L A;  120L A;  4A7D A;  126L A;  1VDQ A;  1IP2 A;  3ATO A;  4MR1 A;  3IJU A;  5E9R A;  4ARJ A;  1XEK A;  2YBN A;  4YF2 A;  3CT0 A;  1XGT C;  1P7S A;  4B0D A;  4I7P A;  158L A;  132L A;  1L37 A;  235L A;  1HEP A;  1IP6 A;  2MEF A;  1LYE A;  163L A;  1L74 A;  3OE0 A;  1D6Q A;  1HHL A;  1C6G A;  2DQF C;  4ANR A;  4NGJ A;  1QTH A;  4LYC A;  144L A;  1YQV Y;  4DC4 A;  1INU A;  1C10 A;  4WM1 A;  1CVK A;  3B6L A;  1C6H A;  4G9S A;  1ZUR A;  1UIG A;  1BWJ A;  1GE0 A;  1LYI A;  1CKF A;  1LJN A;  2A4T A;  1LYD A;  2B75 A;  2B6Z A;  1CKH A;  1BGI A;  1IWX A;  4UWN A;  3HTD A;  2F32 A;  5B59 A;  3AW6 A;  5IDD A;  212L A;  1OUD A;  4MCK A;  260L A;  1L76 A;  4QEQ A;  4XJD A;  5L3I A;  3WYH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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