1L97A

Structure of a hinge-bending bacteriophage t4 lysozyme mutant, ile3-> pro
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNPFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Structure of a hinge-bending bacteriophage T4 lysozyme mutant, Ile3-->Pro.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 53
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l97A00
1KW5A 171LA 1OYUA 1L10A 1L06A 2Q9DA 1D2YA 209LA 1L01A 1C6DA 1SSYA 1L25A 232LA 2RBPA 1L60A 159LA 227LA 4DAJA 1QT4A 1L13A 4W55A 122LA 1WTHA 1L62A 218LA 1L00A 1PQOA 3CDTA 3CDVA 1D3MA 1P5CA 199LA 3SBBC 1QUHA 4ARJA 243LA 1CU3A 164LA 2RBOA 156LA 195LA 1QT3A 1L97A 2RBQA 1JQUA 258LA 2OEAX 1XJTA 113LA 1L43A 137LA 1G0JA 3RZEA 5I14A 3V2YA 1OVJA 167LA 4I7LA 1G07A 1TLAA 1C66A 2F47A 1L84A 4GRVA 1L98A 1L96A 2NTHA 4ARQA 1P36A 7LZMA 4ARMA 1EPYA 125LA 4W52A 197LA 250LA 1C6CA 1L36A 1C6EA 1SX2A 4I7RA 2OU8A 3SN6R 1L74A 1C63A 1QT6A 1QUGA 3HH6A 3CDOA 3SBAA 1L26A 1C6BA 1L85A 4EPFA 2OU9A 1KNIA 4LZMA 3C83A 226LA 1LYHA 3HTBA 248LA 1QTBA 1C6NA 3HT6A 1L82A 2OTZX 1G0LA 2QB0B 241LA 3UONA 1L0JA 220LA 184LA 2OE4X 1L90A 1CUQA 1CV4A 1T8AA 4W56A 1L51A 3DKEX 3SB7A 191LA 1L67A 160LA 189LA 246LA 2RBNA 3HDFA 1CU5A 1L44A 2O7AA 2RB0X 1P2RA 205LA 2RB1X 3HH4A 1LYGA 3K2RA 1PQMA 4DJHA 225LA 148LE 4IAPA 176LA 234LA 1L83A 3HH5A 3GUIA 1QS5A 1QT7A 1T8FA 1XJUA 3F9LA 3DN2A 3HT8A 3NYAA 2QARC 1QTHA 3C7YA 2B7XA 4W57A 4EJ4A 2B6ZA 3HTDA 3HT7A 187LA 196LA 256LA 4EKRA 1L27A 3DN1A 1L87A 3G3XA 1C6FA 1P2LA 146LA 1C6IA 1CX7A 4S0WA 4W59A 3L64A 251LA 239LA 1OV7A 1L33A 3HU8A 261LA 1OV5A 2F2QA 1L50A 149LA 219LA 1D3FA 4PK0A 151LA 1C6PA 1P64A 1L09A 182LA 1L77A 1LYEA 4W51A 174LA 4EKSA 1C6GA 1LWGA 262LA 1L64A 1LYJA 2A4TA 3C7ZA 200LA 1OVHA 3G3VA 3HUQA 1T97A 1L12A 3GUMA 1L86A 1C68A 1L24A 1K28A 1L76A 1LWKA 1L91A 4ZPUA 1D2WA 4YXCA 1CX6A 1C6QA 150LA 1L89A 3NY8A 1T8GA 1CVKA 216LA 1D9WA 1L35A 2B75A 3G3WA 114LA 1P6YA 3OE8A 1DYDA 145LA 213LA 228LA 1LLHA 2LCBA 1T6HA 3GUJA 4K5YA 165LA 3DN8A 1L55A 1L70A 1CV6A 1G0PA 1L66A 2B6TA 1L02A 211LA 129LA 1B6IA 3GUOA 1SWYA 1C6MA 131LA 109LA 178LA 229LA 1QSQA 1L57A 142LA 190LA 2OE7X 1KY0A 2CUUA 231LA 3HT9A 1CV0A 2B74A 172LA 4EXMA 1L47A 118LA 3GUKA 1XEPA 3OE9A 120LA 1L75A 249LA 1L38A 4LDOA 5LZMA 1CV5A 1LI2A 1QUOA 214LA 260LA 1L53A 1L58A 2F32A 3C82A 1CU0A 222LA 161LA 1G0GA 3C81A 1L03A 140LA 1C61A 215LA 1L0KA 253LA 4W54A 1CU6A 1G1VA 252LA 3CDRA 245LA 128LA 163LA 1L99A 1L59A 1OWYA 1L22A 1L19A 1G06A 1L15A 123LA 1D3JA 1L04A 107LA 1JTNA 1L16A 1SSWA 3JR6A 244LA 2LC9A 168LA 3HUAA 173LA 2NTGA 162LA 1DYAA 6LZMA 3GUPA 138LA 1L95A 242LA 259LA 1CV1A 2B73A 112LA 141LA 4OO9A 4I7SA 1PQJA 166LA 1LPYA 1C60A 185LA 2RAZX 1L20A 1LGWA 2IGCA 1C6LA 3OE0A 1G0MA 4ARLA 3C8QA 186LA 1L17A 3DMZA 3PDSA 2HULA 1C6HA 236LA 4GBRB 1C6KA 1ZURA 1CV3A 1JTMA 1L08A 115LA 4ARPA 221LA 2B72A 4AQNA 143LA 1L72A 3DN6A 1L34A 1QSBA 1G0QA 1CU2A 1LGXA 108LA 1DYCA 2ANXA 1L81A 3ODUA 152LA 175LA 1G0KA 1L41A 224LA 1L21A 1L39A 1NHBA 1QS9A 2HUKA 217LA 2RAYX 192LA 1L56A 2O4WA 1C65A 1L71A 1L11A 1L05A 1D3NA 2Q9EA 1L94A 3SB5A 3HTFA 4E97A 230LA 1L45A 2B70A 3C8SA 255LA 1CTWA 4LDLA 1C6AA 1OWZA 4I7TA 1L32A 1C64A 198LA 1DYFA 3DMVA 1G1WA 1L37A 2Z6BA 3DN4A 155LA 147LA 1L68A 2OTYX 1C6TA 254LA 206LA 3HWLA 1QT5A 169LA 1C6JA 1L61A 3EMLA 1I6SA 1QTZA 3LZMA 4YX7C 1QUDA 3QAKA 3DN0A 3GUNA 3D4SA 2B6YA 1L92A 3SB6A 1L46A 3FA0A 240LA 210LA 4W58A 1KS3A 1LGUA 1QTDA 1P56A 3PBLA 2RH1A 3FADA 2RB2X 3C8RA 2OU0X 2B6XA 1L73A 1P46A 1L52A 1L54A 103LA 188LA 1PQDA 1L65A 1LW9A 1DYBA 212LA 1KW7A 130LA 1L80A 2LZMA 126LA 3CDQA 1DYGA 1L88A 3HU9A 4W53A 4I7PA 3VW7A 4I7QA 1L48A 144LA 102LA 4YXAC 223LA 111LA 4I7JA 2RBRA 1P3NA 1SWZA 257LA 119LA 1L49A 1C67A 238LA 127LA 1L42A 1ZYTA 2O79A 2L78A 237LA 3HTGA 201LA 1L69A 1LI6A 1L93A 3L2XA 4I7KA 104LA 4EPIA 3FI5A 139LA 170LA 1KY1A 1LYDA 1QT8A 2RBSA 3SB9A 3V2WA 3F8VA 1L31A 1LYFA 4EKPA 1QTCA 1L23A 3HUKA 1L79A 3DMXA 2B6WA 1LYIA 1SX7A 110LA 3RUNA 3C7WA 235LA 4EKQA 247LA 1LI3A 2OE9X 1L30A 1L18A 1ZWNA 3HDEA 157LA 3HH3A 158LA 1PQIA 177LA 4I7OA 3C80A 3NY9A 4PJZA 1L07A 4I7NA 1CUPA 181LA 1QTVA 4ARQB 4ARMB 1OVKA 183LA 233LA 4LDEA 3SB8A 1L63A 1C62A 1P7SA 1C69A 2ANVA 1L29A 1L14A 1PQKA 3GULA 4I7MA 3DN3A 2HUMA 4DKLA 180LA 3DNAA 1L40A 1P37A 1DYEA 1L28A 3OE6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LZTA 1OYUA 5ILCA 4D9ZA 1I56A 1CJ8A 1WQMA 1L25A 232LA 4DAJA 4W55A 1WQQA 1WTHA 1L62A 4UWNA 4ETBA 3CDVA 3SBBC 1DPXA 1JJ0A 2RBOA 156LA 1QT3A 4BAPA 1WVUA 1L43A 3RZEA 1XGRC 4L41A 167LA 3TMWA 1LMAA 1TLAA 1GF3A 4GLAA 4NGYA 1UIEA 1WQRA 4X3BA 4ARQA 7LZMA 125LA 3WH1A 3A90A 3ZVQB 1HSXA 1LHIA 3A3QA 1C6EA 1OUCA 4BAFA 3SN6R 1C63A 3CSZA 3CDOA 2DQAA 3SBAA 1C6BA 4YENA 1KNIA 5KXPA 6LYTA 2MEEA 3C83A 5L3HA 4B0DA 2A7DA 1IY3A 1G0LA 4OWEA 1DI5A 1TCYA 3OJPA 1OUHA 2OE4X 1FLYA 1T8AA 191LA 1L67A 1LJNA 1CU5A 1L44A 3IJVA 4H9CA 1P2RA 2YBJA 4NGOA 3HH4A 1LYGA 4WM5A 1B5XA 1VDSA 4GCBA 2BQBA 234LA 3GUIA 2YSSC 4UWUA 3A91A 3F9LA 3WYHA 1SLYA 4W57A 3HFMY 4QEQA 1L87A 1P2LA 4NWHA 1JKDA 4S0WA 1WQPA 5LVKA 1L33A 261LA 4NSHA 2W1LA 4TX7A 1L09A 182LA 1LMTA 2HEFA 1LWGA 1JIYA 1IWTA 262LA 1LYJA 1NDMC 1L12A 3WUAA 3ULRA 3J6KA 1L76A 1EL1A 1EQ5A 2DQCY 4ZPUA 4R6CA 5KXOA 4NG1A 1L89A 3FI7A 1QUTA 1T8GA 216LA 1GF9A 2B75A 1GEVA 5F14A 1UIHA 5FELA 4LYTA 213LA 228LA 4OOTA 3LYOA 3W6DA 1LLHA 3GUJA 165LA 5DN5A 1L70A 1GB5A 1JHLA 2YBNA 3GUOA 5HQ1A 2Z2FA 229LA 1LHKA 4N1CC 4NSIA 142LA 4OWCA 2CUUA 2B74A 2F30A 3TXDA 1D0KA 1YL0X 4H92A 1L38A 5LZMA 2MEIA 1CV5A 1LI2A 1IC7Y 2EQLA 2BQMA 4G49A 260LA 1L53A 1JWRA 3N9CA 1JITA 5KKIA 3WU9A 3QE8A 253LA 1AT6A 3W6EA 2YVBA 252LA 3CDRA 3VWOA 1GBSA 1L22A 4ETDA 1NDGC 5FHWA 1JTNA 168LA 2HEDA 5LYZA 1L95A 3A6CY 2B73A 1C45A 1YIKA 1GF0A 4DDAA 4I7SA 166LA 3W6FA 1C6LA 4ARLA 1L17A 2HU1A 3J4GA 5LYMA 1G7HC 1IWVA 4LYCA 4GBRB 4NSJA 1L08A 2Z12A 1DI4A 3DN6A 3T36A 1HEWA 1HMLA 4PPOA 4IASA 108LA 3IWRA 2ANXA 3WMKA 1L81A 1LZEA 2BQLA 152LA 175LA 2G4NA 1G0KA 1YAQA 2H9KA 1QS9A 4OWAA 4RW1A 2D91A 1IR8A 1UUZC 4H9AA 1L94A 3AZ6A 2FBDA 1IP6A 1NBZC 3CSRA 4KT3A 4NHSA 4TTDA 3DMVA 155LA 147LA 2OTYX 1LJ3A 206LA 1TDYA 3LZTA 4ZIXA 2DQIY 1LZAA 1VFBC 4GN4A 4ET9A 3GUNA 3D4SA 3FA0A 1LMOA 2DQGY 1TAYA 132LA 1GE3A 1GFEA 1LYOA 1P56A 4B4IA 1IEEA 1HC0A 2RH1A 2RB2X 2ZIKA 3C8RA 1UACY 1GB3A 1LZDA 1GBWA 4WO9A 188LA 1LW9A 1JTPL 1GFAA 1L80A 4H9HA 2LZMA 1DYGA 1W08A 4WG1A 4I7PA 144LA 1GF8A 102LA 1HFZA 223LA 4HPEA 2RBRA 3AGHA 4QY9A 1IORA 119LA 1L49A 5I53A 4HV1A 2ZIJA 2L78A 3L2XA 1XGQC 4H9IA 1KY1A 3GXRA 4NFVA 3TMXA 3SB9A 4QDNA 1SX7A 2GV0A 3C7WA 2N5ZA 1D0LA 4EOFA 3A96A 1B7MA 2OE9X 1OQMA 5KJ9A 1LZ4A 1NQIA 4HSFA 4I7OA 1GF7A 1IP7A 1HF4A 4ARQB 181LA 5D5FA 1IO5A 4LYMA 4WLDA 1LJEA 3SB8A 1L63A 1B7NA 3WU7A 3AZ4A 4WLXA 1C69A 2ANVA 1L29A 4RW2A 3DNAA 5E4PA 1P37A 3TXFA 2LHMA 1YANA 4WL6A 1LZ6A 5LA5A 3TMVA 2AUBA 5IDDA 1F6SA 171LA 1KW5A 1GFUA 2I26L 4XJIA 2Q9DA 1LZRA 5KXLA 1BGIA 5B06A 4PGJB 2BQCA 2BQEA 1UIBA 1L60A 2RBPA 1HNLA 1JKBA 4LT0A 4C5FA 1L00A 2DQDY 3CDTA 1D3MA 243LA 5KY1A 2RBQA 1HFXA 113LA 3WPJA 4WG7A 4Z41A 3V2YA 1ZVHL 1OVJA 2G4PA 1G07A 1L84A 4N5RA 1L96A 4DD9A 2NTHA 1RFPA 3A6BY 4WM2A 250LA 1L36A 1LOZA 2OU8A 2HEAA 2LZTA 4EPFA 2OU9A 2A7FA 5HMVA 2XBSA 4J1AA 4DDCA 1YKZX 7LYZA 1C6NA 1GDXA 2BQNA 2BPUA 2OTZX 5APEA 1GFTA 3P68A 5DL9A 1CV4A 1CKDA 4XN6A 3DKEX 2H5ZA 2RBNA 3GXKA 2O7AA 1GB7A 1JSFA 1LJHA 1NKHA 2RB1X 5F9XA 5DM9A 148LE 4IAPA 4MCKA 1L83A 3HH5A 5KXMA 1XJUA 4NHPA 3WUNA 3NYAA 1NMMA 2B7XA 2W1XA 4B4JA 4EJ4A 3HTDA 3HT7A 4YF2A 3AGGG 1J1XY 1XGUC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LZT A;  1OYU A;  5ILC A;  4D9Z A;  1I56 A;  1CJ8 A;  1WQM A;  1L25 A;  232L A;  4DAJ A;  4W55 A;  1WQQ A;  1WTH A;  1L62 A;  4UWN A;  4ETB A;  3CDV A;  3SBB C;  1DPX A;  1JJ0 A;  2RBO A;  156L A;  1QT3 A;  4BAP A;  1WVU A;  1L43 A;  3RZE A;  1XGR C;  4L41 A;  167L A;  3TMW A;  1LMA A;  1TLA A;  1GF3 A;  4GLA A;  4NGY A;  1UIE A;  1WQR A;  4X3B A;  4ARQ A;  7LZM A;  125L A;  3WH1 A;  3A90 A;  3ZVQ B;  1HSX A;  1LHI A;  3A3Q A;  1C6E A;  1OUC A;  4BAF A;  3SN6 R;  1C63 A;  3CSZ A;  3CDO A;  2DQA A;  3SBA A;  1C6B A;  4YEN A;  1KNI A;  5KXP A;  6LYT A;  2MEE A;  3C83 A;  5L3H A;  4B0D A;  2A7D A;  1IY3 A;  1G0L A;  4OWE A;  1DI5 A;  1TCY A;  3OJP A;  1OUH A;  2OE4 X;  1FLY A;  1T8A A;  191L A;  1L67 A;  1LJN A;  1CU5 A;  1L44 A;  3IJV A;  4H9C A;  1P2R A;  2YBJ A;  4NGO A;  3HH4 A;  1LYG A;  4WM5 A;  1B5X A;  1VDS A;  4GCB A;  2BQB A;  234L A;  3GUI A;  2YSS C;  4UWU A;  3A91 A;  3F9L A;  3WYH A;  1SLY A;  4W57 A;  3HFM Y;  4QEQ A;  1L87 A;  1P2L A;  4NWH A;  1JKD A;  4S0W A;  1WQP A;  5LVK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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