1QT6A

E11h mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDHGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt6A00
186LA 4EKQA 1G1WA 3DN3A 1L05A 5I14A 1L73A 3DN4A 215LA 199LA 4W51A 256LA 1LYIA 1P7SA 1QT7A 1L15A 119LA 1L82A 1OV5A 1G0JA 178LA 112LA 111LA 3GUOA 156LA 1C6BA 1SX2A 2RBNA 2B72A 4EJ4A 225LA 1L03A 1QSBA 149LA 2RH1A 182LA 1LPYA 4ARJA 1EPYA 1P37A 1L06A 4I7TA 1G0LA 2O4WA 1L19A 3OE6A 1CV4A 1L97A 2HULA 3CDOA 158LA 3CDVA 4EKPA 4EKSA 3DMZA 3HUKA 1CUPA 145LA 3V2YA 3C8RA 196LA 1L55A 3SB5A 3GUPA 3GUMA 1L10A 1C6DA 1L46A 1C69A 4I7MA 1OVHA 4W53A 104LA 1L94A 4PK0A 137LA 1L63A 1P5CA 1DYBA 1L76A 220LA 107LA 1G0PA 3HWLA 2RAZX 2RBSA 4ARQA 3DN6A 1LGUA 113LA 2B6YA 224LA 2F32A 3HT8A 125LA 1L45A 130LA 1JTMA 1L68A 3C7ZA 3SBAA 1L40A 1QT5A 164LA 247LA 3F8VA 1L83A 4ARMB 1B6IA 4I7NA 3QAKA 259LA 260LA 1KY1A 159LA 230LA 235LA 1L81A 2B6WA 2LC9A 262LA 3HTFA 1L61A 185LA 4W59A 1L74A 3V2WA 3DNAA 3L2XA 231LA 233LA 4K5YA 4W58A 1L91A 2Q9EA 3SBBC 4I7PA 1CV3A 4AQNA 1CV0A 3G3WA 1L86A 4S0WA 188LA 1L90A 1L99A 1T97A 1D3JA 1C6IA 1L93A 1I6SA 1L50A 4ARPA 1TLAA 150LA 1L24A 2F2QA 1QS5A 3C7WA 1C6GA 1PQIA 2LZMA 1LWKA 147LA 1DYFA 1L0KA 1XJUA 1L31A 4ARLA 1WTHA 148LE 3K2RA 2OE4X 200LA 1C62A 3LZMA 2QB0B 1CU0A 3OE0A 167LA 1LYEA 1G0MA 1QUGA 1D3NA 222LA 1OYUA 248LA 1P6YA 4I7KA 103LA 1DYDA 138LA 1P36A 3HH6A 1G0QA 1L43A 4YXAC 126LA 3VW7A 1QSQA 3L64A 1KNIA 2OEAX 4LZMA 1G0GA 2RAYX 1KS3A 1C65A 1NHBA 187LA 1XJTA 189LA 151LA 1L13A 1L30A 210LA 195LA 1D3MA 2F47A 3SN6R 1L57A 2NTHA 3HDEA 115LA 2A4TA 213LA 234LA 1L70A 1L34A 4EPFA 1LI3A 2Q9DA 238LA 3CDRA 1C68A 1CU6A 1OVKA 2OU9A 4LDLA 4EXMA 1G07A 3HTGA 1L49A 1L60A 4I7QA 1L25A 4I7SA 161LA 1DYAA 6LZMA 192LA 2B6ZA 1LLHA 221LA 3NY8A 2LCBA 1OWYA 4W56A 1D2YA 1L79A 177LA 2IGCA 2L78A 183LA 250LA 143LA 172LA 3HH3A 227LA 163LA 1CUQA 1QTBA 3C7YA 190LA 1L16A 3CDTA 1L11A 229LA 3HUAA 1LI2A 4YXCA 243LA 3C82A 1C6AA 239LA 139LA 1L00A 4IAPA 157LA 1ZWNA 114LA 1K28A 108LA 1L07A 218LA 1CV6A 3HH4A 1L72A 1QUHA 4GBRB 2ANXA 1L04A 1G06A 1QS9A 3FADA 3SB8A 2RBOA 2OTZX 3HH5A 123LA 165LA 1D9WA 1QTCA 1L35A 1L42A 1L98A 1C6FA 257LA 3GUNA 1XEPA 3OE8A 141LA 2O79A 169LA 244LA 2OE7X 1P64A 1C6NA 4W57A 152LA 3DMXA 3EMLA 3NY9A 1QTDA 3JR6A 3FI5A 4ARMA 211LA 2HUKA 3HT6A 232LA 3HT7A 131LA 226LA 1L96A 1DYGA 197LA 217LA 162LA 4GRVA 142LA 1P46A 2OU8A 1L12A 205LA 1C6TA 4I7RA 1L88A 1KW5A 1L95A 1G1VA 3ODUA 2B6XA 252LA 1LYHA 242LA 4W54A 1C6LA 3RZEA 1L08A 3C81A 2OTYX 129LA 1L29A 1L02A 3HU8A 3DKEX 1L0JA 1L20A 170LA 1SX7A 3FA0A 3G3XA 254LA 4W55A 1L85A 1C6CA 2Z6BA 1L58A 1L41A 236LA 180LA 1L69A 1L67A 1L87A 1L48A 1QT8A 4PJZA 258LA 240LA 1CU2A 1CX6A 4E97A 128LA 2RB0X 3HDFA 4DKLA 118LA 4DJHA 1D3FA 3F9LA 1SWZA 3HUQA 1LW9A 1L33A 4I7JA 1PQOA 3NYAA 1JQUA 3C8QA 1LYDA 2O7AA 3DN0A 1L92A 1CX7A 173LA 1JTNA 1CVKA 3HTBA 1L80A 1CU5A 1SSWA 2B6TA 3OE9A 1PQDA 3GULA 228LA 2B7XA 109LA 246LA 1QUDA 174LA 1L44A 3PDSA 1KY0A 144LA 3DN2A 1L01A 3D4SA 4LDEA 1P2LA 1PQKA 2B70A 1C6EA 1P56A 1L28A 2ANVA 3CDQA 166LA 1L22A 175LA 4EKRA 4I7LA 122LA 1CU3A 2CUUA 3C80A 1CV1A 4ARQB 155LA 1OVJA 198LA 1ZYTA 181LA 1PQMA 2RB2X 261LA 1C61A 245LA 1L36A 201LA 2RBPA 1P3NA 1QUOA 1L75A 4LDOA 4W52A 1L52A 4DAJA 1QT6A 1L47A 1SWYA 1T8GA 1L21A 110LA 2OU0X 184LA 1T6HA 3G3VA 223LA 3UONA 1QT4A 255LA 4ZPUA 1LYFA 1L56A 3DN1A 1T8AA 1T8FA 3SB9A 140LA 2RBRA 2RBQA 249LA 1SSYA 4I7OA 127LA 2B74A 1L23A 3C83A 1C6QA 1L54A 1LI6A 2RB1X 3GUIA 1L59A 1ZURA 1LGWA 214LA 1L89A 120LA 1PQJA 212LA 3HT9A 3DMVA 4EPIA 3C8SA 1C6JA 209LA 1L18A 1C64A 102LA 1L09A 251LA 1L84A 1CV5A 4OO9A 2B75A 176LA 146LA 1C6MA 1P2RA 253LA 7LZMA 1L17A 191LA 1L32A 1L14A 3SB6A 1D2WA 1G0KA 3HU9A 1QTZA 216LA 1L26A 1L71A 1C63A 237LA 1OWZA 171LA 1L27A 3SB7A 2NTGA 3DN8A 3RUNA 3PBLA 1LYJA 4YX7C 2QARC 2HUMA 1C6KA 2OE9X 1QT3A 1L62A 168LA 1LGXA 1QTHA 3GUJA 1C6HA 1L66A 1C6PA 1C67A 1OV7A 1L53A 5LZMA 2B73A 3HTDA 1QTVA 1DYEA 1L51A 3GUKA 1L37A 1LWGA 1L64A 1L39A 1C66A 1KW7A 1C60A 1DYCA 160LA 219LA 206LA 1L65A 1L38A 241LA 1LYGA 1L77A 1CTWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQJA 4UWVA 186LA 5I14A 4YOPA 1XGQC 4TSBA 4B0DA 1HEOA 1P7SA 1QT7A 4R0FA 2ZYPA 178LA 3ZVQA 3GUOA 4YEOA 1UIFA 1BVKC 156LA 4NG1A 4EJ4A 1L03A 2H5ZA 2EKSC 1EPYA 4ZEEA 3WVYA 4C5FA 1LHKA 1OUEA 3OE6A 4MSTA 3T6UA 1IWWA 3W6AA 2ZNWY 145LA 3V2YA 2Z12A 3SB5A 1B7NA 1JKAA 2D4JA 4W53A 1OVHA 5LVHA 5FELA 1YKYX 1G0PA 5KXLA 2RAZX 2RBSA 3DN6A 4WM5A 5J7CA 3M3UA 4H9AA 1L68A 2BLXA 3SBAA 2BQCA 1QT5A 4NGIA 1L83A 1D0MA 1B6IA 1YL0X 5KXKA 2EPEA 1DI3A 260LA 3W6CA 1L81A 2B6WA 5KXZA 3DNAA 1B5WA 5EBHA 4GLVA 231LA 2DQIY 1BWHA 233LA 4LT2A 4I7PA 1TDYA 1UIDA 1VATA 1L86A 1GFRA 1MLCE 1YAOA 1WVVA 1HFXA 1T97A 4GCBA 1LSYA 1DQJC 5LVIA 1LWKA 1EQ4A 133LA 1DYFA 1HSXA 4YM8A 1B5UA 1FKQA 3TXHA 2F2NA 3K2RA 4CGEA 2BQOA 3W6EA 1GWDA 2QB0B 1F6RA 4NG8A 1REYA 1CU0A 4ETAA 4UWUA 248LA 3B72A 1QIOA 1IP2A 1DYDA 138LA 3ATOA 1G0QA 1Z55A 126LA 4DDAA 3VW7A 1LAAA 3L64A 1LSZA 4LT1A 1CKCA 3KAMA 1KS3A 1LMNA 2DQDY 1YL1X 3LZTA 5LVKA 210LA 2F47A 2BQFA 3GXRA 2A4TA 1IWYA 4TWSA 2Q9DA 238LA 1C68A 3QE8A 4GCFA 1L49A 1L60A 161LA 4H8YA 3W6BA 3D9AC 1B7OA 4B49A 2LCBA 2XQOA 1D2YA 2IFFY 1L79A 1J1OY 177LA 1CJ6A 227LA 1F6SA 1FDLY 1RJCB 1LJ3A 229LA 1GF7A 4II8A 243LA 3C82A 1IWVA 4IAPA 157LA 1GB2A 1BB6A 1CV6A 4DT3A 2MEFA 1L04A 5KXXA 1DPWA 1QS9A 2YVBA 1AM7A 1D9WA 1L35A 1LSDA 1L98A 1LJJA 1DI4A 4W57A 1P64A 4Z98A 3A93A 3EMLA 4HJVA 1N4FA 1GF4A 4HSFA 3N9EA 1XEKA 131LA 226LA 1L96A 217LA 3OK0A 142LA 1INUA 1PZYA 1HMLA 205LA 1LSFA 4LYZA 4I7RA 5L9JA 1CKHA 1L88A 1UIHA 1PS5A 1LYHA 4BAFA 1OUCA 4WG1A 1C6LA 4NSHA 4WO9A 129LA 3A3QA 3HU8A 1LZDA 170LA 3G3XA 4YENA 1L58A 4ETEA 258LA 3W3EA 240LA 3BKHA 1D3FA 4BS7A 3ZEKA 4NSIA 3HUQA 5IHGA 3A91A 2HEDA 1L33A 1EQEA 4NSGA 3NYAA 4AXTA 1G7MC 1GF9A 1CX7A 4NGJA 173LA 3TXDA 1H6MA 1L80A 1CU5A 1SSWA 2B6TA 4XADA 4DD9A 2XJWA 3TXIA 2YDGA 246LA 4E3UA 1GFGA 1QUDA 1KY0A 144LA 1L01A 1DPXA 4CFPA 1PQKA 1C6EA 1P56A 4ETDA 4TSCA 1MELL 4CFOA 1LJGA 1BGIA 4EKRA 4WL7A 2N5ZA 2A7FA 1OVJA 5DL9A 1LJIA 1IP6A 1C61A 1KIPC 2YBMA 3M18B 4U3XB 201LA 1KIQC 2RBPA 4LDOA 4W52A 1CKGA 3A94A 3QY4A 1LMCA 4NSJA 1L47A 1SWYA 2EIZC 4NWHA 4I0CA 2OU0X 3AJNA 223LA 2BQKA 1TCYA 1GAYA 3W6DA 1A4VA 1IC5Y 1LYFA 1L56A 1T8AA 3WW5A 4DWXA 1IOSA 1SSYA 127LA 1EQ5A 1L23A 2HEAA 1L59A 214LA 4ML7A 1L89A 1PQJA 3HT9A 2MEDA 209LA 102LA 1L09A 1LYYA 1GFHA 3G3AB 1CV5A 5E9RA 176LA 1CJ9A 1D2WA 4HTKA 3A90A 5HNLA 1LSNA 1L26A 2MEEA 1L71A 1B7RA 2FYDA 1HERA 2DQEY 3RUNA 3PBLA 1V7TA 3AGHA 1C6KA 1LZBA 1BVXA 4N9RA 1IY4A 1YAPA 2LZ2A 4RW2A 1OV7A 4HJZA 4QDNA 3AB6A 3A34A 4IATA 3WMKA 5B1GA 1IP7A 5APCA 1QTVA 1L51A 3GUKA 1LWGA 2BQDA 1NBZC 2DKVA 1C66A 1GE4A 2Q0MX 5D5CA 5II3A 4WMGA 1KW7A 2CWIA 4G49A 2ZQ4A 219LA 3CT1A 1LYGA 4HP0A 250LA 1CTWA 2BQIA 4WO6A 4HJYA 4ANRA 3A6BY 5F81A 1QSWA 3CB7A 5DN5A 1C10A 119LA 1L15A 2I26L 1L82A 2BQNA 3FE0A 1QUTA 2ZQ3A 112LA 1JKCA 1C6BA 2RBNA 1W6ZA 5C6LA 1LJKA 1QSBA 2RH1A 2BAAA 3AGIA 1P37A 1L06A 3AZ7A 1G0LA 2O4WA 3CSRA 1CV4A 2Z38A 158LA 4EKPA 3C8RA 196LA 1L10A 1JSEA 104LA 1L94A 1L76A 1LYOA 1BB5A 1LGUA 3AZ6A 132LA 2NWDX 3HT8A 3C7ZA 5I4XA 1IP4A 2PC2A 5KXSA 1L40A 247LA 3WH1A 4J1AA 3B6LA 1C08C 4ARMB 1SLYA 4WLYA 1G7HC 2LYMA 5LIOA 2LC9A 1GFKA 262LA 1L61A 4W59A 1GE1A 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1GBXA 2HEBA 1FBIX 3HBEX 4MCKA 4NGOA 1L67A 1L48A 1QT8A 134LA 3W6FA 4FDYA 1LHJA 1CX6A 2YBLA 4XJBA 128LA 3HDFA 4DKLA 1GF5A 5T3FA 2HU3A 1SWZA 1JKDA 5ILFA 4I8SA 4RLNA 3TXKA 5FCPA 194LA 1PQOA 1HEPA 3WUMA 5JENB 3DN0A 1L92A 4OOTA 1GEVA 1CJ8A 3P66A 1GFVA 4BADA 4NGKA 4KL7A 3ZVQB 3HTBA 2D91A 3OE9A 2Z37A 1HSWA 174LA 5A3EA 3PDSA 1LJFA 4TX7A 3WW6A 1LJNA 4LGKA 2HTXA 3BKVA 1LHHA 1V7SA 1CU3A 1GE2A 1B5YA 4LYTA 181LA 1PQMA 1LSBA 1GEZA 1NDGC 1REZA 1P3NA 2W1MA 5E4PA 1I1ZA 3WPLA 1LZ9A 1GF6A 3UONA 1GDXA 4XENA 4ZPUA 1QUSA 1T8FA 140LA 1UIEA 2HUBA 4KPMA 1OUJA 1L54A 1VAUA 4NGZA 1XEIA 4C3WA 1YQVY 212LA 5LVGA 3DMVA 4XJFA 4GN5C 251LA 4WM3A 1L84A 4OO9A 2H9KA 4WLDA 3RNXA 2HEEA 3A6CY 1L14A 1G0KA 1GD6A 3HU9A 3AZ5A 216LA 3HFMY 1BB7A 1UACY 1C63A 1WTMA 3MGWA 5KJ9A 3SB7A 2NTGA 5F9UA 4YX7C 1J1PY 1GAZA 4CHXA 1WQOA 1WQNA 4D9ZA 4N0JA 1LGXA 4DC4A 1HEQA 1L66A 1BB3A 1GB0A 1UIGA 4DD3A 1DYEA 4J7VA 3A67Y 1L37A 3TXGA 3TXEA 1L64A 1L39A 2BQEA 3LYZA 1UUZC 4LZTA 1LZ5A 1LHIA 3N9CA 206LA 1L65A 4WLTA 4GN3A 1ZMYL 3AW7A 1NHEA 1GPQC 4EOFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BQJ A;  4UWV A;  186L A;  5I14 A;  4YOP A;  1XGQ C;  4TSB A;  4B0D A;  1HEO A;  1P7S A;  1QT7 A;  4R0F A;  2ZYP A;  178L A;  3ZVQ A;  3GUO A;  4YEO A;  1UIF A;  1BVK C;  156L A;  4NG1 A;  4EJ4 A;  1L03 A;  2H5Z A;  2EKS C;  1EPY A;  4ZEE A;  3WVY A;  4C5F A;  1LHK A;  1OUE A;  3OE6 A;  4MST A;  3T6U A;  1IWW A;  3W6A A;  2ZNW Y;  145L A;  3V2Y A;  2Z12 A;  3SB5 A;  1B7N A;  1JKA A;  2D4J A;  4W53 A;  1OVH A;  5LVH A;  5FEL A;  1YKY X;  1G0P A;  5KXL A;  2RAZ X;  2RBS A;  3DN6 A;  4WM5 A;  5J7C A;  3M3U A;  4H9A A;  1L68 A;  2BLX A;  3SBA A;  2BQC A;  1QT5 A;  4NGI A;  1L83 A;  1D0M A;  1B6I A;  1YL0 X;  5KXK A;  2EPE A;  1DI3 A;  260L A;  3W6C A;  1L81 A;  2B6W A;  5KXZ A;  3DNA A;  1B5W A;  5EBH A;  4GLV A;  231L A;  2DQI Y;  1BWH A;  233L A;  4LT2 A;  4I7P A;  1TDY A;  1UID A;  1VAT A;  1L86 A;  1GFR A;  1MLC E;  1YAO A;  1WVV A;  1HFX A;  1T97 A;  4GCB A;  1LSY A;  1DQJ C;  5LVI A;  1LWK A;  1EQ4 A;  133L A;  1DYF A;  1HSX A;  4YM8 A;  1B5U A;  1FKQ A;  3TXH A;  2F2N A;  3K2R A;  4CGE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2BQJ A;  4UWV A;  186L A;  5I14 A;  4YOP A;  1XGQ C;  4TSB A;  4B0D A;  1HEO A;  1P7S A;  1QT7 A;  4R0F A;  2ZYP A;  178L A;  3ZVQ A;  3GUO A;  4YEO A;  1UIF A;  1BVK C;  156L A;  4NG1 A;  4EJ4 A;  1L03 A;  2H5Z A;  2EKS C;  1EPY A;  4ZEE A;  3WVY A;  4C5F A;  1LHK A;  1OUE A;  3OE6 A;  4MST A;  3T6U A;  1IWW A;  3W6A A;  2ZNW Y;  145L A;  3V2Y A;  2Z12 A;  3SB5 A;  1B7N A;  1JKA A;  2D4J A;  4W53 A;  1OVH A;  5LVH A;  5FEL A;  1YKY X;  1G0P A;  5KXL A;  2RAZ X;  2RBS A;  3DN6 A;  4WM5 A;  5J7C A;  3M3U A;  4H9A A;  1L68 A;  2BLX A;  3SBA A;  2BQC A;  1QT5 A;  4NGI A;  1L83 A;  1D0M A;  1B6I A;  1YL0 X;  5KXK A;  2EPE A;  1DI3 A;  260L A;  3W6C A;  1L81 A;  2B6W A;  5KXZ A;  3DNA A;  1B5W A;  5EBH A;  4GLV A;  231L A;  2DQI Y;  1BWH A;  233L A;  4LT2 A;  4I7P A;  1TDY A;  1UID A;  1VAT A;  1L86 A;  1GFR A;  1MLC E;  1YAO A;  1WVV A;  1HFX A;  1T97 A;  4GCB A;  1LSY A;  1DQJ C;  5LVI A;  1LWK A;  1EQ4 A;  133L A;  1DYF A;  1HSX A;  4YM8 A;  1B5U A;  1FKQ A;  3TXH A;  2F2N A;  3K2R A;  4CGE A; 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