177LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWCEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFCTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 57
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 177lA00
109LA 3DN3A 111LA 1G0PA 1L13A 4DAJA 1L71A 1L75A 1I6SA 1P7SA 231LA 1D2YA 1G07A 1L94A 1CU5A 1C64A 1L51A 1D3JA 1L64A 245LA 1LW9A 1C6PA 1L87A 3OE9A 1L84A 3HTGA 3RZEA 5I14A 1PQOA 1L08A 115LA 1PQKA 4PK0A 210LA 3UONA 3C83A 217LA 3C7ZA 1G0KA 1L40A 2OEAX 1DYGA 1LI6A 4ARMB 3G3WA 3SB7A 1P2RA 1LYHA 141LA 3HU8A 1L42A 1L93A 1L54A 1L68A 220LA 3L2XA 1QT8A 4IAPA 1G0MA 1P2LA 1L88A 148LE 4ARQA 1L92A 3PDSA 2IGCA 1D2WA 1P37A 3EMLA 1QTVA 1L90A 1QSBA 3HUAA 1OWYA 254LA 1L26A 3CDVA 173LA 4W56A 2OE9X 1CV5A 2HUMA 1G0QA 261LA 2HUKA 1L96A 243LA 1C6EA 1XJTA 1P5CA 212LA 7LZMA 3DN6A 2B6ZA 112LA 1KW5A 2RBOA 1C6TA 4LDLA 223LA 1QUDA 4E97A 1L52A 1CUPA 1OV5A 1C6LA 1LYIA 1DYDA 166LA 1LWKA 2RAZX 1L34A 1C62A 1QT7A 3HH5A 3C7YA 188LA 3HUQA 4EKQA 2RB2X 125LA 230LA 1L72A 3DMXA 1L73A 2HULA 3HDEA 4EJ4A 3HTBA 1C67A 176LA 236LA 3GUNA 118LA 1L39A 1C6QA 1L20A 253LA 144LA 1B6IA 4LZMA 3GUJA 1G1VA 3C8RA 1SSYA 2B6YA 3HU9A 262LA 145LA 3HTFA 1C6IA 120LA 1NHBA 1L19A 2B73A 1L07A 1C65A 239LA 127LA 1LI2A 4EXMA 4YXAC 1C6KA 160LA 3HDFA 3NY8A 1CVKA 1C63A 1C6NA 1QTBA 1G1WA 1KY0A 3C8SA 3F9LA 3C8QA 1D9WA 259LA 3CDTA 4I7QA 3SB6A 1P64A 2B75A 1OWZA 2RBSA 177LA 126LA 1L99A 250LA 1L24A 1L56A 2NTHA 3CDQA 123LA 3RUNA 1TLAA 149LA 1T8AA 211LA 168LA 1L44A 4OO9A 3HT9A 2B70A 2OTYX 1C6JA 146LA 3VW7A 2RAYX 4EKRA 1QTHA 1L66A 224LA 150LA 1L67A 1L46A 1PQMA 1L80A 1L28A 1P6YA 2OTZX 1L62A 3HT7A 128LA 198LA 1C61A 1CV0A 3C81A 3GUIA 1OYUA 1LPYA 1LYJA 1SWYA 1C6MA 1LYGA 4I7OA 1CV1A 1L11A 4I7LA 3DMZA 4I7TA 1L69A 1L86A 4EKPA 258LA 2RBQA 1L89A 232LA 1L36A 3G3VA 1P36A 3SBAA 181LA 2Z6BA 3DN8A 2B6TA 1L77A 2B74A 155LA 1PQIA 4W53A 1P56A 4EPFA 104LA 1L12A 5LZMA 1LGXA 3JR6A 4W57A 247LA 130LA 113LA 159LA 4EPIA 252LA 2O79A 1OVJA 1C6DA 1OVHA 1L81A 2B72A 3HH4A 184LA 237LA 2OU0X 191LA 214LA 1L29A 226LA 3DNAA 139LA 1LGWA 1L74A 4YX7C 167LA 1OVKA 1L49A 190LA 244LA 1L17A 1T8FA 2Q9EA 2LC9A 241LA 3HT8A 1KY1A 4DJHA 240LA 238LA 3FA0A 1L09A 1G0JA 1L45A 3DN4A 161LA 2NTGA 1L04A 1JQUA 2B6WA 1QTZA 4PJZA 165LA 3D4SA 2O7AA 3GUPA 3PBLA 1CX6A 4W54A 3GUMA 140LA 1DYAA 229LA 227LA 1C6BA 1L02A 1T8GA 138LA 213LA 1L63A 4YXCA 1C66A 4ARQB 1L53A 143LA 1QS5A 4ARPA 3LZMA 1LYEA 1L22A 1L85A 1QTCA 2OE7X 1G0LA 1QUHA 1L21A 1LYDA 1CV6A 1L37A 3CDOA 137LA 1L82A 1SX2A 2ANXA 2OU8A 1T6HA 235LA 1LGUA 1L33A 3G3XA 2F47A 4ARMA 1L0KA 187LA 1QT5A 233LA 186LA 1QUOA 163LA 249LA 225LA 1C69A 1T97A 1L65A 3SB9A 215LA 4S0WA 1L10A 222LA 162LA 1L03A 1QT4A 256LA 3CDRA 1DYCA 119LA 4LDOA 158LA 1L25A 4LDEA 1LI3A 151LA 2O4WA 1L55A 4I7RA 3SB5A 3C82A 164LA 196LA 156LA 1KS3A 2LZMA 1XEPA 201LA 3DN1A 1L15A 192LA 1QTDA 3HH6A 4I7SA 1L43A 2RBRA 183LA 255LA 4I7JA 185LA 1PQDA 1LWGA 1CU2A 1D3FA 1L32A 1L59A 1CV3A 3F8VA 3L64A 3OE0A 1L58A 129LA 1L98A 216LA 2Q9DA 4I7PA 197LA 4ARLA 2OE4X 3FI5A 1G0GA 246LA 2F2QA 4W58A 3HUKA 234LA 172LA 189LA 3SB8A 1L95A 1L61A 4W52A 221LA 3HH3A 1DYBA 1QT6A 1KW7A 251LA 219LA 3DKEX 1DYEA 2F32A 3GUOA 3DN0A 4I7KA 2ANVA 4AQNA 260LA 1C68A 1CUQA 1C6HA 157LA 1D3MA 2RB1X 1L30A 3K2RA 1L01A 1L38A 175LA 3C80A 4ARJA 4W51A 3HTDA 114LA 1C6FA 4ZPUA 248LA 3V2WA 4W55A 1WTHA 1K28A 1L79A 2RBNA 242LA 1CU6A 1ZURA 108LA 3OE8A 3SBBC 1L35A 1D3NA 1P3NA 1PQJA 2RH1A 1SX7A 209LA 1L16A 1EPYA 3NYAA 1L57A 1KNIA 102LA 1L05A 3GULA 1L91A 257LA 122LA 4I7MA 1L60A 3DMVA 4DKLA 2RB0X 1L00A 1C6AA 1QT3A 131LA 110LA 2LCBA 3DN2A 3SN6R 2L78A 182LA 1L18A 1L27A 3HT6A 1L31A 147LA 103LA 174LA 2B7XA 4W59A 206LA 1JTMA 170LA 107LA 199LA 1C60A 1LYFA 1QUGA 169LA 2QARC 1CV4A 1L41A 3GUKA 3HWLA 1OV7A 142LA 4GRVA 1G06A 1L97A 4EKSA 205LA 2A4TA 180LA 3FADA 3QAKA 1L76A 2OU9A 2QB0B 1CTWA 171LA 1L70A 228LA 1L23A 1DYFA 1JTNA 1P46A 3ODUA 4GBRB 1LLHA 1L47A 178LA 195LA 2B6XA 1L06A 1SWZA 1C6CA 2CUUA 3OE6A 1CX7A 3NY9A 1ZWNA 6LZMA 3C7WA 1QS9A 1L14A 1QSQA 200LA 218LA 4I7NA 3V2YA 1L0JA 1L50A 1L48A 1SSWA 1XJUA 1CU3A 1CU0A 152LA 4K5YA 1L83A 1ZYTA 2RBPA 1C6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MEHA 1LSYA 1VDTA 1GEVA 4GN3A 1J1OY 1L94A 4M6DA 1LSAA 4H90A 4RW1A 1GFUA 1L87A 3OE9A 1L84A 3HTGA 1LYYA 5I14A 1IP5A 1PQKA 210LA 2BQMA 1A2YC 4GN4A 3C7ZA 1UC0A 1DYGA 4NHTA 1UBZA 4KT3A 2BQNA 4LYZA 1JJ3A 1IR9A 2EKSC 1L42A 1REMA 3G3BB 3TMWA 1CJ7A 1GHLA 1G0MA 1I20A 4ARQA 3TXDA 4NGVA 1QTVA 1L90A 8LYZA 1YQVY 1L26A 4WG1A 173LA 4W56A 2MEBA 1CV5A 1JIYA 1CNSA 261LA 1V7SA 2HUKA 1P5CA 4WO9A 1GFKA 4WM6A 2B6ZA 2HEEA 4LYCA 4LDLA 223LA 1OUDA 1CUPA 1GBYA 1DYDA 1LZ8A 5KXWA 2ZYCA 2BQBA 5LINA 3HH5A 2CWIA 3M3UA 1L72A 5KXPA 4B4JA 3EMSA 1C67A 1F6RA 236LA 1IY3A 3GUNA 3AZ7A 118LA 5KKIA 3W6AA 5I53A 2N5ZA 253LA 144LA 4DD0A 1JKBA 4LZMA 5AMYA 262LA 1C6IA 1IP4A 1L07A 5F81A 1C65A 239LA 1JJ1A 2H9JA 1D9UA 4EXMA 1GBWA 1UIHA 4NG1A 5DLAA 3NY8A 1B7SA 1C63A 5LYZA 1RI8B 4XJFA 4Z46A 3C8SA 4HJZA 154LA 1IIZA 2YBLA 4I7QA 2B75A 4M4OA 1OUGA 1EQEA 126LA 4EOFA 1L99A 250LA 1L24A 5C6LA 2F2NA 3CDQA 3RUNA 1TLAA 211LA 1OP9B 2LZ2A 3CT0A 1C6JA 2Z37A 1GF3A 1HFYA 2RAYX 3WW5A 7LYZA 4X3BA 3TMXA 224LA 4B0DA 1L46A 1L80A 1L28A 3HT7A 1L62A 4KL7A 1GF6A 4FJRA 3TXEA 3GUIA 5B1FA 1B7NA 4NHQA 1CV1A 4I7TA 1L69A 1VDPA 4ZFPA 2RBQA 232LA 3G3VA 1ZV5L 1GD6A 1P36A 4OWAA 3DN8A 2EQLA 2D4JA 4II8A 1BB6A 4XJGA 1B7MA 1GEZA 1GE4A 3AYQA 1L12A 4XJDA 1GWDA 3WU8A 1DPWA 3LYTA 2HU3A 1GB8A 159LA 2LZTA 252LA 1PZYA 1L81A 4PHIA 184LA 4NHSA 1L74A 4YX7C 1OVKA 1L49A 1LTMA 4OOOA 2Q9EA 2LC9A 1BWJA 5APEA 5DL9A 1KY1A 1LZRA 238LA 4I8SA 4J0LA 5B05A 4NGYA 5LXWA 1YANA 4NFVA 4BADA 3D4SA 2O7AA 1UIBA 3B6LA 4TUNA 3GUMA 1DYAA 1KXYA 1WVVA 1HFXA 4MCKA 138LA 5LAFA 213LA 1L63A 3MGWA 1C66A 5LAGA 1WVUA 1QS5A 2HEBA 4YEOA 1G0LA 1T6VL 1L21A 1LOZA 5A3EA 137LA 1L82A 4HPIA 1LZYA 1LZEA 1HHLA 3LYZA 1LGUA 1L33A 2Z2FA 3AZ4A 3G3XA 1HEOA 1NDMC 2B5ZA 4WMGA 186LA 1Z55A 225LA 3SB9A 1UICA 1IO5A 2DKVA 3CDRA 256LA 4LDOA 119LA 158LA 1L25A 5LVHA 1JEFA 1WQRA 1T3PA 5APFA 2O4WA 4I7RA 3SB5A 164LA 4LYOA 156LA 4LT0A 1LJIA 1CJ8A 1QTDA 4I7SA 5LVGA 3HBDA 1D6QA 2ZIKA 1JKDA 1CV3A 3TXBA 1GFAA 1KXWA 3WU9A 3OE0A 129LA 1L98A 216LA 1UIGA 2OE4X 3TXIA 2F2QA 4G4HA 4XN6A 2RSCA 189LA 3DKEX 1DYEA 4ETCA 4DQ7A 4H8XA 4I7KA 1DI5A 260LA 5KXOA 1C6HA 2DQHY 1GAYA 2BLXA 3K2RA 4FDYA 4PJ2C 175LA 1GFTA 1HSWA 1B7PA 5HMVA 2RBNA 1D0MA 1XEIA 1LSGA 1CU6A 1GBSA 1GFVA 3OE8A 4O34A 3SBBC 1L35A 1P3NA 5JENB 3T6UA 1L16A 3LHMA 2X0AA 4LYMA 4Z3MA 4E3UA 1L05A 1H87A 1QUSA 5D5CA 4I7MA 2H5ZA 4GLVA 4GLAA 3W6CA 1L60A 2GV0A 3DMVA 3P65A 1L00A 3AGHA 131LA 110LA 3DN2A 4H9HA 2YDGA 1L27A 3EO5A 103LA 4DDAA 3WW6A 1QSAA 3WYHA 1OUIA 1CKCA 199LA 4ET8A 3BKHA 1QUGA 1GBXA 2C8OA 2DQEY 3GUKA 5B06A 1LZAA 5FHWA 4DD2A 1GE3A 142LA 4H9FA 1L97A 3FADA 1B7OA 1L76A 4DD1A 1TEWA 2QB0B 3AW6A 1L23A 1DZBX 3ZVQA 2YBNA 5FEKA 4CJ2A 3AZ6A 1FKVA 4WM1A 1L06A 5LA5A 1LJFA 5T3FA 3OE6A 3QNGA 3NY9A 1ZWNA 4WM3A 3LYOA 4LZTA 218LA 3WL2A 1L48A 1SSWA 1XJUA 1CU3A 3W6EA 5I5QA 1BVXA 1C6GA 3TXKA 3DN3A 4QDNA 4HTKA 4DAJA 1P7SA 1HEPA 1OUFA 1D2YA 1G07A 3B0OA 1CU5A 245LA 3A90A 4WL6A 1NMMA 1YIKA 1FLUA 1PQOA 4RLMA 1AT6A 1YL1X 1MELL 1GF4A 5LYMA 4TTDA 217LA 4CGEA 1G0KA 1L40A 4W96A 1LI6A 4ARMB 4WM5A 3SB7A 141LA 1IP2A 1KIPC 1L54A 220LA 3L2XA 1QT8A 5HNCA 2D91A 1P2LA 2FBDA 4NGZA 1CKDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2MEH A;  1LSY A;  1VDT A;  1GEV A;  4GN3 A;  1J1O Y;  1L94 A;  4M6D A;  1LSA A;  4H90 A;  4RW1 A;  1GFU A;  1L87 A;  3OE9 A;  1L84 A;  3HTG A;  1LYY A;  5I14 A;  1IP5 A;  1PQK A;  210L A;  2BQM A;  1A2Y C;  4GN4 A;  3C7Z A;  1UC0 A;  1DYG A;  4NHT A;  1UBZ A;  4KT3 A;  2BQN A;  4LYZ A;  1JJ3 A;  1IR9 A;  2EKS C;  1L42 A;  1REM A;  3G3B B;  3TMW A;  1CJ7 A;  1GHL A;  1G0M A;  1I20 A;  4ARQ A;  3TXD A;  4NGV A;  1QTV A;  1L90 A;  8LYZ A;  1YQV Y;  1L26 A;  4WG1 A;  173L A;  4W56 A;  2MEB A;  1CV5 A;  1JIY A;  1CNS A;  261L A;  1V7S A;  2HUK A;  1P5C A;  4WO9 A;  1GFK A;  4WM6 A;  2B6Z A;  2HEE A;  4LYC A;  4LDL A;  223L A;  1OUD A;  1CUP A;  1GBY A;  1DYD A;  1LZ8 A;  5KXW A;  2ZYC A;  2BQB A;  5LIN A;  3HH5 A;  2CWI A;  3M3U A;  1L72 A;  5KXP A;  4B4J A;  3EMS A;  1C67 A;  1F6R A;  236L A;  1IY3 A;  3GUN A;  3AZ7 A;  118L A;  5KKI A;  3W6A A;  5I53 A;  2N5Z A;  253L A;  144L A;  4DD0 A;  1JKB A;  4LZM A;  5AMY A;  262L A;  1C6I A;  1IP4 A;  1L07 A;  5F81 A;  1C65 A;  239L A;  1JJ1 A;  2H9J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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