1E8LA

Nmr solution structure of hen lysozyme
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title A refined solution structure of hen lysozyme determined using residual dipolar coupling data.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 24
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1e8lA00
1JITA 3B6LA 1LZGA 1J1OY 2ZNXY 1W08A 3D3DA 4KPMA 5B05A 1EQ4A 1KXXA 2MEGA 3WUAA 4B4IA 5LVIA 1OUHA 4NFVA 1OUBA 2ZILA 1LSFA 1J1PY 4UWNA 3SP3A 1GWDA 4QGZA 1LYZA 4L41A 1FKVA 1CJ6A 2BPUA 5B07A 3QNGA 1B7PA 1OUFA 3TXIA 3F6ZA 1A2YC 1LYSA 4DC4A 4H90A 1IR8A 1IWYA 1QDTA 1FLYA 1Z55A 4N1EI 3WUNA 2BQKA 2EPEA 1HFZA 3P64A 1VDSA 3A91A 194LA 1GXV2 2FYDA 1LJEA 3HBHA 2HU1A 1UIHA 1LZ4A 2W1XA 3WVXA 1F6RA 1XEJA 1OQMA 1JKBA 4GCDA 3BKHA 5FHWA 5LA5A 3AB6A 5B1GA 5KKIA 3LYMA 3TXGA 2ZNWY 3CB7A 3WL2A 3TXHA 1FLWA 1YAMA 1LZ1A 1TEWA 1GFGA 1C10A 2YBIA 4HPEA 1CKGA 1DI5A 1LZEA 4WO9A 1IY4A 5E9RA 4XJHA 5KXPA 154LA 1JSFA 4LYZA 1IO5A 1GB5A 2A7DA 2FYCA 2W1YA 1DKKA 2XTHA 1XGRC 1RFPA 2BQOA 1LMQA 1JIYA 1UIDA 5C6JA 1AZFA 2LYOA 5DLAA 4B49A 3EMSA 4WL6A 1HERA 1LMTA 4GCBA 5KY1A 4DDAA 3CSZA 1BB5A 3E3DA 3WW5A 4XJIA 1SLYA 4NWEA 1GFJA 1QTKA 3T36A 5LIOA 4XYYA 5HLLA 1GE2A 4NSGA 5LINA 1JISA 2A7FA 1JSEA 1REXA 2F4GA 5I53A 5M1YA 2DBTA 1LOZA 1B7QA 2DQGY 4MR1A 3ZVQB 1KIRC 4I8SA 1IEEA 2YBNA 4DD1A 1JKDA 4NHQA 4KT3A 1QIOA 5KXYA 2DQEY 4PRUA 4W94A 2IHLA 2YSSC 3G3BB 3W6DA 1LMCA 2XBRA 2BQBA 2F2NA 2ZWBA 3OK0A 4J7VA 3W3EA 1RE2A 2C8PA 4A7DA 1IP6A 2D6BA 4H9EA 1HNLA 1P2CC 4CJ2A 5LVHA 1D6PA 5HNLA 4RLMA 2DQDY 5I5QA 1GFRA 4DYGA 1RI8B 1HEOA 3CSRA 4B4JA 1YL0X 1HELA 1JPOA 4X3BA 5KXOA 1GF4A 3WPJA 1IORA 1GEVA 1LZ9A 4G4HA 4LGKA 1LHJA 3TXFA 1MELL 4LFXA 2N5ZA 2ZYPA 1GFTA 2YBMA 1IR7A 1V7SA 2I25L 1HSXA 1QSAA 5KXMA 2Z39A 1RCMA 1W6ZA 1CKDA 3AGHA 2ZIJA 4N8ZA 2CWIA 1VDQA 1UBZA 4ML7A 5JENB 2MEAA 4XENA 4DD7A 4ET8A 1CKCA 1GXXA 5KXLA 5DN4A 4NGVA 4XJGA 5B59A 1VEDA 3LZTA 1JJ0A 3WXUA 3B0IA 1YILA 5A3EA 2YDGA 1GAYA 3GXRA 4LT1A 2BQEA 4WLYA 4WO6A 1HMKA 4RLNA 4B1AA 2D4JA 2Z38A 4OW1A 3AYQA 4DWXA 4HV1A 1JUGA 1GB2A 2G4NA 1INUA 4QY9A 1HENA 4LYCA 4G4BA 4DD3A 1HC0A 4HP0A 5FCPA 3EBAB 1LKSA 4ANRA 1WQPA 2ZQ4A 1LJKA 4Z98A 3WMKA 5APEA 5KXZA 1NMMA 4OWEA 2HEEA 3LZ2A 2BQNA 1GB7A 3QY4A 1NHEA 1LZBA 1B5ZA 1GHLA 5IELA 1IR9A 1JHLA 3ATOA 3CT5A 3CSQA 1T3PA 2I6ZA 1LHHA 4WM3A 1LZAA 4NSJA 1GE4A 4BADA 3TXEA 1D9UA 1B9OA 1JKCA 3AJNA 1IWVA 1LJGA 1SQ2L 4WLDA 4C5FA 4DDCA 1GFAA 1HEMA 1TCYA 1GFEA 4OWBA 2W1LA 5KXSA 3B0KA 1LSMA 4HPIA 2IFFY 4O34A 1BHZA 2ZIKA 5KXRA 5KJ9A 4FJRA 2MEEA 2B5ZA 2RSCA 3P66A 4LYBA 4J0LA 4NHPA 1D6QA 4WM1A 4H8ZA 2D91A 3P65A 3FI7A 4N1CC 4NGIA 1IY3A 2HEDA 1G7LC 4G49A 2BQCA 4UWUA 1UICA 3M3UA 1IOQA 4BAFA 3AZ4A 1HSWA 4R0FA 1D0LA 4H9HA 3HBEX 3WVYA 1IWZA 1G7IC 1BB3A 1GE3A 1YAQA 4HJZA 4OOTA 5LAFA 1TAYA 4LFPA 3W6CA 4ET9A 1AM7A 2Z2EA 2H9JA 1B7OA 1LHMA 4LT2A 1LMAA 1LTMA 1LZDA 5T3FA 1KIQC 3IJVA 1LPIA 1GFHA 4H9FA 2EKSC 3AZ7A 3N9CA 4CGEA 4EOFA 4NGOA 5A3ZA 3A96A 3KAMA 3TXDA 1LSAA 4R6CA 1GFKA 1NKHA 5EBHA 3AZ5A 3HFMY 4H9CA 4OWCA 2Z2FA 3A6BY 3WU9A 4HV2A 1GPQC 1B7SA 1XEKA 1VATA 1FBIX 5DN5A 1GBOA 4KXIA 4N9RA 3TMVA 1GBYA 4Z3MA 1UIGA 4GLAA 1IC5Y 4H8XA 1IC4Y 5I4YA 1XEIA 2H9KA 4YENA 4NY5A 5F9UA 4IASA 1DKJA 4ETDA 3OJPA 4I0CA 4WL7A 1LZTA 4WG1A 5HMJA 1KXYA 2BQIA 4DD9A 1CNSA 1REMA 134LA 2BLYA 4B4EA 4RW2A 1FLUA 3TXJA 5FDJA 1VDTA 3QE8A 5F9XA 1GF6A 4NWHA 3M18B 2MEIA 4FDYA 1GB9A 4ETBA 4II8A 1QUTA 4WMGA 2HEFA 1LZRA 4Z46A 2BAAA 4G4CA 1OUEA 4XJFA 1B7RA 4NGLA 1GF3A 1JJ3A 2DQFC 2XBSA 3AZ6A 1DPWA 1BB4A 4N0JA 3WU8A 3LYOA 4CFOA 1HFXA 4AGAA 3A6CY 4LYMA 2Z19A 1MLCE 6LYTA 5LYTA 1LSGA 1QQYA 3ZEKA 5D5CA 5DM9A 3RU5A 4ETCA 1VDPA 1B7NA 1BB7A 2HU3A 5FSTA 4TUNA 2D4KA 1WVUA 4GCFA 3ZVQA 2I26L 3A34A 2G4PA 4GCCA 5FELA 1O23A 1YIKA 1YAPA 4TSCA 4W96A 4ETAA 1B5VA 1LJJA 4HTNA 1GBWA 2MEHA 1BVXA 4NGWA 1IC7Y 3A93A 4ZFPA 1LZYA 3J6KA 4NGZA 3TXKA 1ZVYB 1LYYA 3EO5A 1JTPL 3MGWA 4GLVA 1IVMA 1UCOA 4LYOA 3WYHA 1OUGA 5LXWA 4MSTA 4TWSA 4WLTA 1GFUA 2ZQ3A 1C45A 5KKJA 2HECA 5D5FA 5F81A 3WU7A 2MEDA 5C6IA 1UIAA 5LYZA 3A8ZA 4H8YA 1DQJC 4NSIA 1H87A 4OOOA 4DD0A 132LA 1GBXA 1GE0A 1QUSA 3IJUA 5B1FA 3N9AA 5L3HA 5I54A 5K7OA 3A3QA 1GEZA 1T6VL 3A92A 1GB6A 4H1PA 1IP4A 1IWUA 4PRQA 4XJDA 1FDLY 1LSYA 1F6SA 1IP1A 133LA 2F30A 3CT0A 4NGJA 4WOAA 4HTKA 1D0MA 4PJ2C 1LZ5A 4H92A 5B06A 2Z37A 3A94A 4HJVA 3TMUA 1YKZX 4QDNA 1IP5A 3N9EA 5APFA 3G3AB 4U3XB 1HEQA 1WQOA 2F4AA 1GAZA 1BB6A 1DPXA 1LSNA 5I4XA 1UUZC 2WARA 2Z12A 1IP3A 1HEPA 1YKYX 1GB3A 2GV0A 3RNXA 4NHSA 2EIZC 1NDMC 1LJIA 1LHLA 2DQAA 1TDYA 2MEFA 1BWHA 1LJ4A 1YL1X 5HQ1A 5LYMA 135LA 1JEFA 1LZ6A 3W6AA 4ETEA 4YEOA 1ALCA 1B2KA 1OUCA 2HEAA 3BKVA 3IWRA 4YOPA 4YEMA 4NGKA 1AT6A 1RJCB 4N5RA 4H9IA 4KL7A 1OUDA 193LA 1XSFA 1GDWA 1IWTA 1AKIA 2LZTA 1DI3A 1DZBX 1EQEA 1C7PA 1GD6A 1I20A 4RW1A 4YF2A 2H5ZA 7LYZA 4YM8A 1B5UA 4LT3A 4GN3A 2MEBA 5ILFA 1N4FA 3P4ZA 3ATNA 1F10A 4LT0A 1WQQA 3CQLA 1LMNA 5HMVA 4H91A 1BWIA 4PHIA 1WQRA 1LJ3A 3K3TA 1GF0A 1LKRA 5IHGA 4WM6A 4WLXA 4NHTA 1IP2A 2C8OA 4HSFA 3EXDA 4AXTA 1IWXA 5FEKA 4BAPA 1NBYC 5I4WA 1WTMA 4NSHA 2HTXA 1LJHA 3TMWA 5LAGA 4H93A 1HHLA 1VFBC 1B7MA 4J1AA 4B0DA 2CDSA 2DQIY 1FN5A 3GXKA 1UIBA 3W6EA 1GF9A 1QTEA 1TBYA 1UA6Y 1XFPL 4Z41A 1JWRA 2YBLA 1LAAA 1LZSA 4NHIA 1LCNA 3WW6A 1IWWA 5KXWA 2BQGA 1BGIA 1UIFA 1XGTC 4XADA 3LYZA 4H94A 2G4QA 4D9ZA 1GFVA 1I1ZA 4CFPA 1JKAA 1KIPC 1UC0A 4ZIXA 4PPOA 2ZYCA 1NWGA 3TXBA 1C46A 1LSCA 4DT3A 5F14A 3WPKA 4QEQA 1UACY 1EQ5A 1NDGC 2DQJY 4TSBA 1IOCA 4P2EA 4GN4A 2D4IA 5F16A 3LN2A 1NBZC 4GCEA 4C3WA 1BVKC 2EQLA 2AUBA 4WM4A 1LSEA 1B7LA 1FLQA 5LVKA 1OUAA 1G7HC 1ZMYL 2FBBA 4LYTA 4TX7A 1B5XA 1YKXX 3ULRA 1YROA 4PGJB 2LYZA 9LYZA 1DI4A 4HJYA 2NWDX 3WH1A 4GN5C 4RDSA 2BLXA 1NQIA 1LSDA 3TMXA 1ZV5L 1E8LA 1HEWA 3J4GA 4DDBA 4MCKA 1IOTA 1BWJA 1H6MA 1AT5A 2BQLA 5APCA 2BQDA 4XJBA 1OP9B 1GB0A 3VWOA 6LYZA 8LYZA 1KXWA 1LSZA 4UWVA 1YQVY 4J1BA 3WULA 1OUJA 1C43A 4IJ4A 5LA8A 5II3A 1BQLY 1G7MC 1JJ1A 1PZYA 5KXXA 2BQFA 1JTOL 3WXTA 1IOSA 1XGQC 3LHMA 5APDA 4OWAA 3RT5X 2HUBA 4WG7A 4HTQA 1GB8A 2HEBA 4DD2A 1QDRA 4NIJA 5LVGA 1YAOA 2W1MA 4H9AA 5HNCA 1LJFA 1LSPA 3AGGG 3A90A 1LMOA 1GF7A 3W6FA 5L9JA 4H9BA 2YBHA 1EL1A 1LZ8A 1LMPA 1A4VA 2FBDA 3AW7A 5DL9A 1WQMA 2YBJA 1I56A 1GF5A 1V7TA 3P68A 2CGIA 1HMLA 4WM5A 3A67Y 5C6LA 1DXJA 1OUIA 2YVBA 4IATA 3WPLA 4WM2A 3AW6A 1IP7A 5IDDA 4EMNA 2CJLA 208LA 3W6BA 4TTDA 5KXKA 2DQCY 1LSBA 4NGYA 1HFYA 1LZNA 1UIEA 5KXTA 207LA 1GBSA 3B0OA 3WUMA 1LZCA 1LHIA 2MECA 2Q0MX 1G7JC 3A3RX 3AGIA 1QSWA 1XGUC 1GF8A 1HF4A 2PC2A 5E4PA 1ZVHL 1REYA 3RZ4A 5ILCA 4G9SA 1GDXA 4M4OA 1XGPC 4LZTA 1FKQA 1WTNA 1LHKA 2BQAA 1CKFA 3B72A 1CJ8A 3RW8A 3LYTA 5KXNA 1WVVA 3FE0A 1YANA 5L3IA 1IX0A 1GE1A 1JTTL 1NF5A 2VB1A 2X0AA 2DKVA 4ZEEA 2XJWA 2LYMA 1C08C 4XN6A 4CHXA 1LJNA 2BQJA 2LHMA 4M6DA 4E3UA 1PS5A 4BS7A 2BQHA 1CJ9A 2Z18A 4NG8A 1B5YA 1B5WA 1D0KA 2Y8PA 1CKHA 1LYOA 5J7CA 5LVJA 2LZ2A 4NEBA 4NG1A 2DQHY 1GBZA 1J1XY 4OWHA 153LA 5AMYA 3CT1A 3D9AC 3A95A 2BQMA 1REZA 1IIZA 1CJ7A 1F0WA 3HBDA 3T6UA 1VAUA 1B0DA 1WQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZNXY 1W08A 1OUHA 1LSFA 1L75A 232LA 1L29A 5B07A 3TXIA 1B7PA 236LA 1C6GA 1Z55A 3GUNA 1SSWA 1VDSA 194LA 3HBHA 2HU1A 1UIHA 3WVXA 1JKBA 3BKHA 1DYAA 5LA5A 1QUDA 1L38A 4DJHA 3CB7A 1C10A 141LA 2L78A 1JSFA 2A7DA 107LA 1XGRC 1RFPA 2BQOA 1SLYA 4NWEA 4E97A 4LDOA 5LINA 2F4GA 1REXA 2RBPA 251LA 1L39A 5M1YA 2DBTA 3NYAA 3ZVQB 4PRUA 3W6DA 4EKSA 1LMCA 2BQBA 3W3EA 1P3NA 4CJ2A 5HNLA 4EKRA 2DQDY 3GUIA 2OTYX 1L32A 1JPOA 3C7YA 3WPJA 197LA 3TXFA 4LGKA 2N5ZA 2YBMA 4K5YA 216LA 2I25L 4EXMA 3AGHA 2CWIA 148LE 2MEAA 4ET8A 5DN4A 1GAYA 4WLYA 1CV0A 1HMKA 2D4JA 211LA 1GB2A 2G4NA 183LA 5FCPA 4S0WA 1WQPA 4Z98A 3WMKA 5APEA 1L31A 1GHLA 1IR9A 3CSQA 1T3PA 1PQOA 1LZAA 4NSJA 3SB8A 4BADA 247LA 1B9OA 1IWVA 4WLDA 1L41A 1QTZA 4I7PA 4DDCA 3D4SA 1TCYA 1QT7A 1LSMA 1BHZA 4ARLA 5KJ9A 2MEEA 1D3JA 3P66A 4J0LA 1D6QA 4H8ZA 3P65A 3FI7A 2HEDA 2BQCA 176LA 3M3UA 4I7SA 1G0JA 1YAQA 3W6CA 3GULA 250LA 2H9JA 1LI6A 4H9FA 3AZ7A 4NGOA 3DN1A 4GBRB 3A96A 3KAMA 170LA 5EBHA 3HFMY 4OWCA 2B6XA 1XEKA 5DN5A 3HTDA 1GBOA 4KXIA 4N9RA 3TMVA 5I4YA 4H8XA 1IC4Y 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JIT A;  3B6L A;  1LZG A;  1J1O Y;  2ZNX Y;  1W08 A;  3D3D A;  4KPM A;  5B05 A;  1EQ4 A;  1KXX A;  2MEG A;  3WUA A;  4B4I A;  5LVI A;  1OUH A;  4NFV A;  1OUB A;  2ZIL A;  1LSF A;  1J1P Y;  4UWN A;  3SP3 A;  1GWD A;  4QGZ A;  1LYZ A;  4L41 A;  1FKV A;  1CJ6 A;  2BPU A;  5B07 A;  3QNG A;  1B7P A;  1OUF A;  3TXI A;  3F6Z A;  1A2Y C;  1LYS A;  4DC4 A;  4H90 A;  1IR8 A;  1IWY A;  1QDT A;  1FLY A;  1Z55 A;  4N1E I;  3WUN A;  2BQK A;  2EPE A;  1HFZ A;  3P64 A;  1VDS A;  3A91 A;  194L A;  1GXV 2;  2FYD A;  1LJE A;  3HBH A;  2HU1 A;  1UIH A;  1LZ4 A;  2W1X A;  3WVX A;  1F6R A;  1XEJ A;  1OQM A;  1JKB A;  4GCD A;  3BKH A;  5FHW A;  5LA5 A;  3AB6 A;  5B1G A;  5KKI A;  3LYM A;  3TXG A;  2ZNW Y;  3CB7 A;  3WL2 A;  3TXH A;  1FLW A;  1YAM A;  1LZ1 A;  1TEW A;  1GFG A;  1C10 A;  2YBI A;  4HPE A;  1CKG A;  1DI5 A;  1LZE A;  4WO9 A;  1IY4 A;  5E9R A;  4XJH A;  5KXP A;  154L A;  1JSF A;  4LYZ A;  1IO5 A;  1GB5 A;  2A7D A;  2FYC A;  2W1Y A;  1DKK A;  2XTH A;  1XGR C;  1RFP A;  2BQO A;  1LMQ A;  1JIY A;  1UID A; 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 1YAO A;  2W1M A;  4H9A A;  5HNC A;  1LJF A;  1LSP A;  3AGG G;  3A90 A;  1LMO A;  1GF7 A;  3W6F A;  5L9J A;  4H9B A;  2YBH A;  1EL1 A;  1LZ8 A;  1LMP A;  1A4V A;  2FBD A;  3AW7 A;  5DL9 A;  1WQM A;  2YBJ A;  1I56 A;  1GF5 A;  1V7T A;  3P68 A;  2CGI A;  1HML A;  4WM5 A;  3A67 Y;  5C6L A;  1DXJ A;  1OUI A;  2YVB A;  4IAT A;  3WPL A;  4WM2 A;  3AW6 A;  1IP7 A;  5IDD A;  4EMN A;  2CJL A;  208L A;  3W6B A;  4TTD A;  5KXK A;  2DQC Y;  1LSB A;  4NGY A;  1HFY A;  1LZN A;  1UIE A;  5KXT A;  207L A;  1GBS A;  3B0O A;  3WUM A;  1LZC A;  1LHI A;  2MEC A;  2Q0M X;  1G7J C;  3A3R X;  3AGI A;  1QSW A;  1XGU C;  1GF8 A;  1HF4 A;  2PC2 A;  5E4P A;  1ZVH L;  1REY A;  3RZ4 A;  5ILC A;  4G9S A;  1GDX A;  4M4O A;  1XGP C;  4LZT A;  1FKQ A;  1WTN A;  1LHK A;  2BQA A;  1CKF A;  3B72 A;  1CJ8 A;  3RW8 A;  3LYT A;  5KXN A;  1WVV A;  3FE0 A;  1YAN A;  5L3I A;  1IX0 A;  1GE1 A;  1JTT L;  1NF5 A;  2VB1 A;  2X0A A;  2DKV A;  4ZEE A;  2XJW A;  2LYM A;  1C08 C;  4XN6 A;  4CHX A;  1LJN A;  2BQJ A;  2LHM A;  4M6D A;  4E3U A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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