1LHIA

Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with x-ray structure analysis of proline mutants
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTGGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Role of proline residues in human lysozyme stability: a scanning calorimetric study combined with X-ray structure analysis of proline mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1lhiA00
1YQVY 4YOPA 4NGJA 3W6EA 1LSCA 3A6BY 2N5ZA 5K7OA 3CSRA 5KXLA 5KKIA 1XEKA 5F9XA 3BKHA 2MEFA 4NWHA 1LJ3A 4MR1A 2Z2EA 5APCA 1F6RA 1NKHA 1LZ4A 2GV0A 4E3UA 4J1AA 2Z19A 5KXNA 4ZIXA 2YBMA 2YSSC 2DQDY 3BKVA 4LFXA 4TUNA 4XJDA 4DD1A 1E8LA 2ZIJA 1LSPA 3W6FA 2I6ZA 1BVKC 3LZTA 3W6AA 1GF7A 4HTNA 4GCEA 1LZGA 1BWJA 1YAPA 4ETDA 1KIQC 1HSXA 4H1PA 2HTXA 4CHXA 5FDJA 1IWXA 1LMNA 1N4FA 1YAOA 2D4IA 1HNLA 3B0KA 4NGWA 5LYTA 4M4OA 5FSTA 4OWBA 4HPIA 4HV2A 1I20A 1IVMA 1JKAA 4J1BA 3AGGG 4NGLA 3EXDA 4UWVA 1GPQC 1JEFA 1OUHA 3IJUA 4B49A 1UIDA 3TXHA 1YROA 5C6JA 1LMAA 1UCOA 1YL1X 2YBIA 3B0OA 4N0JA 4PJ2C 4PRQA 5HMJA 3TXKA 1DI3A 4KXIA 3AW6A 1C08C 4CFOA 5F14A 4NGIA 4RLMA 5LVKA 3ATNA 1GE4A 1NHEA 4B0DA 3OK0A 1HENA 1JTPL 1ZVHL 3AW7A 3CT5A 3TXIA 1IOTA 1J1PY 2RSCA 4XJBA 4WO9A 1GE1A 1SLYA 4WM1A 4C5FA 1PS5A 1GAZA 1PZYA 4NGVA 3LYMA 1XGPC 2NWDX 4NGKA 4H9BA 1IOCA 3CSZA 4DC4A 1GBOA 4TTDA 4NG1A 1IEEA 4QEQA 4G4CA 5I54A 3TMWA 1D0KA 4CJ2A 4M6DA 1TAYA 1QDTA 4BADA 1GB6A 1GF0A 1GFTA 1TDYA 1YIKA 1GFVA 5I5QA 1BB4A 1GBSA 1F0WA 1IP3A 1LZSA 4H9HA 3ULRA 4J7VA 4OWCA 1LYOA 4GLVA 1GB2A 1GF8A 1OUFA 4H9FA 1HF4A 3AGHA 2A7DA 3F6ZA 1LZYA 2ZNXY 1FDLY 3A3RX 1OUJA 3AB6A 3AZ5A 4ETCA 4YEMA 4DYGA 5LYZA 1B7RA 2IHLA 4OWHA 2Z39A 3CSQA 1QTEA 4CFPA 5KJ9A 4BS7A 4LYTA 5LVGA 1D6QA 154LA 1ZMYL 193LA 1DPXA 1HC0A 3ZVQA 2Z12A 3RW8A 4ML7A 1AT6A 2W1MA 1LHKA 4UWNA 1BQLY 1HMLA 3N9CA 2A7FA 4H9EA 3A93A 4IASA 1B7LA 1BB3A 1CKHA 1RFPA 1A2YC 2LYZA 2ZWBA 1IP5A 1HSWA 1UIGA 1UIFA 1YAQA 2MEAA 2F2NA 4Z3MA 5KXWA 2HEAA 1JUGA 1RE2A 1BGIA 3HBDA 1NQIA 4RDSA 5KKJA 1YKZX 4WMGA 1G7MC 1G7JC 1LJIA 4PRUA 3LHMA 3W3EA 4LT2A 1LMCA 5E4PA 4TWSA 1QQYA 4WL7A 1AKIA 3WW5A 1CKGA 1YILA 2X0AA 4W96A 2DBTA 1GF3A 2YBJA 1JJ0A 1MELL 1RJCB 1YKYX 2IFFY 1AZFA 4GCCA 2MEIA 1IOSA 1VFBC 2FBDA 4XJGA 1YAMA 2VB1A 5DN5A 1IP4A 4I8SA 4EMNA 1AT5A 1LKSA 3LN2A 4G49A 1TBYA 2YBHA 5IELA 2Q0MX 3FI7A 4H9AA 4H94A 1LZBA 4GLAA 4HV1A 4WM5A 3WVXA 2C8PA 2ZQ3A 3W6DA 3D3DA 4QDNA 1LZTA 1WQMA 5LINA 5APEA 5HMVA 5B1GA 3KAMA 2YBNA 4NEBA 2ZIKA 3RU5A 1IWUA 3WPLA 1FLQA 1C45A 1D0LA 2LHMA 2HU1A 3AZ7A 6LYTA 1WTMA 3W6CA 1JKCA 2MECA 4LFPA 3T36A 3TXFA 1IP6A 2ZYCA 3A90A 4TSCA 1CNSA 1D0MA 1B9OA 4XJIA 2LYOA 1JISA 3G3BB 4GCFA 5DM9A 1IO5A 4DD3A 4Z46A 3WUNA 3A95A 2BLYA 3LYZA 2HU3A 1GF5A 4XENA 1F6SA 3A34A 5LXWA 1DPWA 1UIEA 1LJJA 1WTNA 3AYQA 1QSAA 3A8ZA 4OOTA 1REZA 2BQGA 3G3AB 5A3ZA 4HJYA 5IHGA 1BHZA 4WG1A 4KL7A 1IWWA 4NGZA 1IP2A 3A96A 1GB9A 1I56A 4YF2A 5FCPA 3IWRA 1Z55A 1LHIA 2FBBA 4H8YA 1LSDA 1LZCA 4NSIA 4G9SA 1AM7A 2DQAA 1IR8A 1GFGA 4D9ZA 1YKXX 3RT5X 2EQLA 5FHWA 2AUBA 3WU9A 3LZ2A 4BAPA 1IIZA 1CJ6A 4LYZA 1BB5A 4WM2A 3T6UA 5HQ1A 2MEEA 1QUSA 1XGQC 1YL0X 5DLAA 4X3BA 2FYCA 3A67Y 1LTMA 1REMA 1WQQA 4TSBA 1FKVA 1JJ3A 1XEJA 2H9JA 2DQIY 5EBHA 1GAYA 2DQGY 1LSAA 1OUCA 2BQKA 1GXXA 1LZNA 2YDGA 4Z98A 5HLLA 2D4JA 3B0IA 1C10A 3ZEKA 4IATA 1GD6A 5ILCA 4WOAA 3W6BA 1KIPC 1GB7A 1VDPA 3EBAB 1GFUA 1JSEA 1XFPL 3CB7A 4N1CC 208LA 133LA 1OUGA 4FJRA 4B4EA 3VWOA 5ILFA 5L3IA 5LVHA 2BPUA 4PPOA 1KXXA 1WQPA 4LT3A 5T3FA 2ZILA 1D6PA 4NHSA 1VAUA 1H6MA 5KXRA 1QIOA 4WLDA 4B4IA 4OOOA 4R0FA 4NGYA 3CT1A 1XGRC 2D4KA 1GE0A 1XSFA 1EQEA 5LVJA 1LSNA 4P2EA 3P66A 4QGZA 1C43A 3ATOA 3RZ4A 1HEMA 1LHLA 4YENA 5I4YA 153LA 1LHMA 5AMYA 1A4VA 4H93A 4G4HA 5C6IA 1IC5Y 4NIJA 3N9EA 1CKFA 3TXJA 1LZRA 1KIRC 5LYMA 2DQEY 132LA 1RI8B 1BWHA 4GCDA 5B59A 5L9JA 4L41A 3MGWA 2BQJA 135LA 5KXTA 4LZTA 1JSFA 2G4QA 1IP1A 1LZAA 2HEFA 4DD2A 5KXMA 1BWIA 1B7OA 4N9RA 3WXUA 1GXV2 3IJVA 1V7TA 4W94A 2MEDA 4LYBA 2XTHA 1IR9A 3WU7A 4DD0A 8LYZA 2Z18A 4NHPA 4LYCA 3J4GA 2C8OA 4N5RA 3TMXA 2CGIA 3OJPA 1B5XA 3WXTA 1P2CC 1J1XY 1C46A 2DQHY 2BLXA 2ZQ4A 3M18B 2MEBA 1V7SA 1VDQA 5IDDA 1B7PA 4AGAA 1CKDA 1UIHA 4H8ZA 2ZNWY 3AZ4A 3WU8A 4ET8A 5A3EA 4KPMA 1BVXA 4HJZA 2XBRA 4WM3A 1JWRA 1IWTA 5FEKA 2BQOA 1CJ8A 3P4ZA 1XGUC 1JJ1A 4ETAA 1EL1A 1B7MA 1LSMA 3HFMY 1WVUA 2FYDA 1LZ1A 1LZEA 1LAAA 1OQMA 1H87A 3CT0A 1B7SA 1MLCE 2LZ2A 4PHIA 3ZVQB 3AZ6A 1QSWA 4UWUA 1HELA 1QUTA 1ALCA 1QDRA 1JKBA 1GE2A 3WH1A 1UICA 1GF4A 5LA5A 5DN4A 1T3PA 1UIAA 4C3WA 2BQCA 4OWAA 1KXWA 5KXOA 4CGEA 1G7IC 4WG7A 5HNLA 2W1LA 1HEWA 4H91A 1B5YA 1VDSA 4NG8A 3A6CY 134LA 3TMVA 4KT3A 3D9AC 5I4WA 2BQEA 1ZV5L 1I1ZA 2BAAA 5KXZA 4XJHA 2EIZC 5LAFA 4IJ4A 1LZ9A 3EO5A 2F30A 4DWXA 2EKSC 3WL2A 1LKRA 4RW2A 3J6KA 2HEEA 2PC2A 2W1XA 4HTKA 3WPJA 4ANRA 1O23A 1OP9B 1LSGA 4U3XB 1HEOA 1DZBX 4NWEA 1IX0A 1KXYA 1GEVA 4HJVA 4NHTA 1CJ7A 1B5VA 1SQ2L 1HEQA 1GFHA 2CWIA 1LMPA 1NWGA 2HUBA 4GN4A 5F81A 5L3HA 2DQCY 2F4GA 1VATA 4LYMA 1HERA 3B6LA 4XADA 4MSTA 1DI4A 2BQHA 1IORA 1IOQA 1HEPA 1GHLA 1LPIA 4G4BA 4ZFPA 1LZ5A 1LHJA 1GBZA 4DDAA 1LJ4A 1FLWA 1LYSA 1WQNA 4NY5A 7LYZA 1LJEA 2YBLA 1B0DA 1GFAA 5F16A 1NDMC 2W1YA 3FE0A 1GF9A 2XBSA 4RLNA 1W6ZA 207LA 4J0LA 5FELA 1LSZA 1TCYA 4OWEA 1LZDA 2Z38A 3WPKA 1INUA 1GDXA 2H9KA 4WLYA 3WVYA 3WULA 2H5ZA 4B4JA 5APFA 3WMKA 1DXJA 4NSJA 1GFRA 1UC0A 2DKVA 5II3A 5E9RA 1IWYA 1EQ4A 1HFXA 1OUAA 1TEWA 2G4PA 4ETBA 1LJKA 4LT0A 1JTOL 4XYYA 2BQDA 1VDTA 4WM6A 4NHIA 1XEIA 1B5WA 1CKCA 3A94A 4O34A 5DL9A 1LJNA 5J7CA 1DKKA 4LT1A 1GF6A 4YEOA 5M1YA 5KXYA 5KY1A 3QY4A 1B2KA 2BQLA 2BQIA 1LSFA 2HEBA 4GN3A 5I53A 5B06A 1NF5A 5D5FA 1IC4Y 1GB3A 1UA6Y 2Y8PA 3QE8A 4GN5C 4WL6A 5LA8A 1G7HC 3M3UA 4H9IA 1REXA 4OW1A 3N9AA 3E3DA 4NSHA 1JKDA 1OUBA 1IWVA 1XGTC 5F9UA 1C7PA 1LYYA 1HMKA 2YVBA 2Z37A 1LJHA 3WW6A 3GXKA 1LJFA 4EOFA 3WUMA 1LMOA 1LCNA 4WM4A 1UUZC 4H90A 4QY9A 4H8XA 1LSEA 4H9CA 1JHLA 4H92A 3B72A 5KXPA 1BB7A 1LYZA 4ETEA 4HSFA 5D5CA 9LYZA 4WLXA 4XJFA 3WUAA 1NBYC 1YANA 1GFJA 1OUIA 3A91A 4I0CA 3QNGA 1LMTA 4AXTA 1D9UA 1G7LC 1IC7Y 3RNXA 1UACY 2D91A 1HFZA 1FKQA 1REYA 3GXRA 1JITA 4HTQA 4BAFA 1LSBA 1IY3A 3WYHA 5C6LA 5APDA 1FN5A 1LJGA 1GBWA 5HNCA 5JENB 2MEHA 2BQAA 3SP3A 5B05A 4DT3A 3A3QA 2HECA 3HBHA 4A7DA 1LHHA 5LVIA 4II8A 1B7NA 1W08A 1FLYA 1WVVA 5KXSA 4HP0A 1VEDA 4WO6A 4NGOA 3TXGA 3LYTA 3TMUA 2F4AA 1F10A 2BQFA 1NBZC 4Z41A 1IR7A 4WLTA 4DD9A 1GE3A 4ZEEA 4B1AA 4DD7A 5KXXA 1B5ZA 1GBXA 1DI5A 2Z2FA 2I26L 1GDWA 4MCKA 3A92A 4DDCA 1IWZA 1OUDA 1JPOA 3AGIA 5B1FA 4HPEA 1DQJC 2BQBA 1RCMA 2XJWA 4R6CA 2D6BA 2LZTA 4PGJB 4NHQA 1WQOA 1GFEA 2B5ZA 5B07A 2CDSA 1CJ9A 1GWDA 2LYMA 4XN6A 4TX7A 5LIOA 2BQMA 5KXKA 1LMQA 1J1OY 1EQ5A 1B5UA 3TXEA 1FBIX 4N8ZA 4GCBA 1HHLA 1GEZA 1WQRA 2DQJY 5I4XA 1ZVYB 4ET9A 4LGKA 1NMMA 4LYOA 1GB0A 1IP7A 2G4NA 3HBEX 1QTKA 3AJNA 2ZYPA 2CJLA 2BQNA 3P64A 2HEDA 1LZ8A 1GB5A 1T6VL 1JTTL 1IY4A 2MEGA 3P68A 4NFVA 1LZ6A 4N1EI 3TXDA 3P65A 2DQFC 1GBYA 4RW1A 1JIYA 1HFYA 3EMSA 2EPEA 3K3TA 1BB6A 3CQLA 4FDYA 3LYOA 5LAGA 4DDBA 1FLUA 6LYZA 1GB8A 4NSGA 194LA 1NDGC 1LSYA 1UBZA 1B7QA 3TXBA 2WARA 1UIBA 4YM8A 1LOZA 1OUEA 1DKJA 1GFKA 2I25L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LSCA 1LYIA 2N5ZA 5K7OA 4ARMB 1C67A 5F9XA 2MEFA 1L26A 3FI5A 1LZ4A 4E3UA 1L48A 240LA 1L85A 2YBMA 2YSSC 4DD1A 2XQOA 4I7MA 1CU5A 1L52A 3LZTA 3W6AA 1DYGA 4HTNA 1C62A 1IWXA 1N4FA 257LA 245LA 5LYTA 1L95A 5FSTA 1D2YA 1WTHA 4HPIA 4HV2A 262LA 4J1BA 2B6TA 3EXDA 1GPQC 1OUHA 4B49A 1UIDA 1YROA 3DN4A 1UCOA 2YBIA 120LA 1L20A 4NGIA 1GE4A 1NHEA 4B0DA 3OK0A 3CT5A 4WO9A 1PS5A 1C6GA 1XGPC 4DC4A 4H9BA 3CSZA 1IEEA 5I54A 1GFTA 5I5QA 1I6SA 1QUOA 1OUFA 4H9FA 1LZYA 4ETCA 3AB6A 3HDFA 1G0JA 3PDSA 4DYGA 2IHLA 2Z39A 2F2QA 196LA 4BS7A 5LVGA 1D6QA 1L34A 154LA 1CU0A 1DPXA 3ZVQA 4ML7A 1L59A 4UWNA 1BQLY 4H9EA 1QTVA 1B7LA 1CKHA 2LYZA 1RFPA 1UIGA 4Z3MA 1C6CA 1UIFA 2F2NA 2ANVA 3HBDA 1G7MC 2F47A 3G3WA 3LHMA 1L08A 1L35A 3WW5A 4W96A 1MELL 2IFFY 4GCCA 1VFBC 3HUQA 1L12A 4AQNA 1LKSA 4WM5A 1JTNA 157LA 1QT8A 1QTDA 3AZ7A 1L50A 1L79A 6LYTA 1C6AA 4LFPA 1IP6A 151LA 1CNSA 242LA 1L86A 1T97A 1JISA 4GCFA 4Z46A 2BLYA 110LA 224LA 1UIEA 4I7RA 1WTNA 3AYQA 4OO9A 4OOTA 1REZA 1BHZA 1PQDA 1L15A 4KL7A 1IP2A 1I56A 1KW5A 1Z55A 1IR8A 186LA 1QUDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YQV Y;  4YOP A;  4NGJ A;  3W6E A;  1LSC A;  3A6B Y;  2N5Z A;  5K7O A;  3CSR A;  5KXL A;  5KKI A;  1XEK A;  5F9X A;  3BKH A;  2MEF A;  4NWH A;  1LJ3 A;  4MR1 A;  2Z2E A;  5APC A;  1F6R A;  1NKH A;  1LZ4 A;  2GV0 A;  4E3U A;  4J1A A;  2Z19 A;  5KXN A;  4ZIX A;  2YBM A;  2YSS C;  2DQD Y;  3BKV A;  4LFX A;  4TUN A;  4XJD A;  4DD1 A;  1E8L A;  2ZIJ A;  1LSP A;  3W6F A;  2I6Z A;  1BVK C;  3LZT A;  3W6A A;  1GF7 A;  4HTN A;  4GCE A;  1LZG A;  1BWJ A;  1YAP A;  4ETD A;  1KIQ C;  1HSX A;  4H1P A;  2HTX A;  4CHX A;  5FDJ A;  1IWX A;  1LMN A;  1N4F A;  1YAO A;  2D4I A;  1HNL A;  3B0K A;  4NGW A;  5LYT A;  4M4O A;  5FST A;  4OWB A;  4HPI A;  4HV2 A;  1I20 A;  1IVM A;  1JKA A;  4J1B A;  3AGG G;  4NGL A;  3EXD A;  4UWV A;  1GPQ C;  1JEF A;  1OUH A;  3IJU A;  4B49 A;  1UID A;  3TXH A;  1YRO A;  5C6J A;  1LMA A;  1UCO A;  1YL1 X;  2YBI A;  3B0O A;  4N0J A;  4PJ2 C;  4PRQ A;  5HMJ A;  3TXK A;  1DI3 A;  4KXI A;  3AW6 A;  1C08 C;  4CFO A;  5F14 A;  4NGI A;  4RLM A;  5LVK A;  3ATN A;  1GE4 A;  1NHE A;  4B0D A; 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 5JEN B;  2MEH A;  2BQA A;  3SP3 A;  5B05 A;  4DT3 A;  3A3Q A;  2HEC A;  3HBH A;  4A7D A;  1LHH A;  5LVI A;  4II8 A;  1B7N A;  1W08 A;  1FLY A;  1WVV A;  5KXS A;  4HP0 A;  1VED A;  4WO6 A;  4NGO A;  3TXG A;  3LYT A;  3TMU A;  2F4A A;  1F10 A;  2BQF A;  1NBZ C;  4Z41 A;  1IR7 A;  4WLT A;  4DD9 A;  1GE3 A;  4ZEE A;  4B1A A;  4DD7 A;  5KXX A;  1B5Z A;  1GBX A;  1DI5 A;  2Z2F A;  2I26 L;  1GDW A;  4MCK A;  3A92 A;  4DDC A;  1IWZ A;  1OUD A;  1JPO A;  3AGI A;  5B1F A;  4HPE A;  1DQJ C;  2BQB A;  1RCM A;  2XJW A;  4R6C A;  2D6B A;  2LZT A;  4PGJ B;  4NHQ A;  1WQO A;  1GFE A;  2B5Z A;  5B07 A;  2CDS A;  1CJ9 A;  1GWD A;  2LYM A;  4XN6 A;  4TX7 A;  5LIO A;  2BQM A;  5KXK A;  1LMQ A;  1J1O Y;  1EQ5 A;  1B5U A;  3TXE A;  1FBI X;  4N8Z A;  4GCB A;  1HHL A;  1GEZ A;  1WQR A;  2DQJ Y;  5I4X A;  1ZVY B;  4ET9 A;  4LGK A;  1NMM A;  4LYO A;  1GB0 A;  1IP7 A;  2G4N A;  3HBE X;  1QTK A;  3AJN A;  2ZYP A;  2CJL A;  2BQN A;  3P64 A;  2HED A;  1LZ8 A;  1GB5 A;  1T6V L;  1JTT L;  1IY4 A;  2MEG A;  3P68 A;  4NFV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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