205LA

How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
165
structure length
159
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTAAKSAAAELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 159
sequence length 165
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 205lA00
1QUHA 1DYEA 3HT6A 2OTYX 4I7MA 2L78A 4I7KA 1L94A 3F8VA 1L13A 3UONA 1L70A 3HT7A 1C67A 237LA 195LA 3GUMA 1L24A 3HUKA 3JR6A 222LA 4LDEA 144LA 1L87A 1L28A 4W54A 1L14A 109LA 1P37A 4ARQB 3GULA 126LA 4I7TA 128LA 145LA 6LZMA 1G0KA 1L03A 4W53A 255LA 3HH3A 1L98A 1EPYA 3C7YA 3HTDA 199LA 2HUMA 259LA 1T8FA 130LA 2B6ZA 3RUNA 1QTVA 104LA 1C6BA 168LA 1LYFA 1CX6A 1L36A 1LYEA 1L07A 1L30A 190LA 3C80A 3NY9A 3V2WA 1L65A 1WTHA 1C6DA 4YXCA 1LGWA 143LA 3DNAA 1LYJA 1D3NA 3VW7A 1OV7A 112LA 3HH5A 1XJUA 1SSWA 1LWGA 1L89A 4OO9A 3OE6A 4YXAC 3DN3A 1P2RA 261LA 3HT9A 1XJTA 1L04A 1OYUA 214LA 5I14A 4ZPUA 122LA 3C8RA 235LA 1LYIA 1PQOA 240LA 4PJZA 239LA 123LA 151LA 232LA 1LYDA 4ARMA 181LA 4EKPA 178LA 1L51A 1L84A 4I7RA 247LA 1P7SA 3GUNA 1L11A 1L52A 1KW5A 2F2QA 1L23A 246LA 2OE7X 114LA 2OU9A 1DYDA 3HT8A 3DN0A 1C60A 234LA 2Q9DA 1SWYA 3CDTA 1QT4A 1T8GA 1G07A 2RB2X 1JQUA 225LA 1L59A 1P64A 2Z6BA 1QS5A 1NHBA 152LA 2B70A 1SSYA 1SX7A 1L22A 4ARJA 1C6NA 233LA 155LA 1L39A 1CU2A 4EXMA 125LA 189LA 1L61A 1QTZA 4W56A 4ARLA 1L66A 1OV5A 4DJHA 1L85A 1L92A 238LA 158LA 1P56A 2RBNA 3DN4A 1LYGA 3DN8A 1OVJA 1C6GA 1SWZA 4LDOA 1SX2A 4ARQA 1CTWA 252LA 224LA 4YX7C 111LA 2B6XA 157LA 1C6EA 1C6FA 1G0MA 1PQKA 1L05A 4IAPA 1L88A 175LA 221LA 1G0LA 4DKLA 2B75A 1L01A 163LA 167LA 1KY0A 1L72A 2RB1X 4W59A 115LA 1L0KA 1C61A 1L0JA 1L99A 1C6AA 200LA 257LA 2B6TA 2B74A 1L76A 3CDRA 1LPYA 1QT3A 162LA 1L62A 131LA 3DN1A 3SN6R 1L10A 1L48A 1L74A 1T6HA 7LZMA 3G3WA 118LA 1D9WA 3GUOA 1L90A 142LA 1CU5A 3HDEA 3HUAA 260LA 1G0QA 1LGUA 1C6KA 1C69A 1DYAA 3D4SA 1D3MA 2RB0X 1K28A 1D3FA 1QUOA 184LA 1ZURA 1T97A 1L20A 223LA 3SB9A 3G3VA 2HUKA 2RH1A 183LA 182LA 171LA 1QTBA 1G0JA 1P2LA 4S0WA 213LA 1JTNA 1L97A 2RBOA 1L29A 1L53A 1LI2A 3L2XA 1L41A 1CUPA 1L67A 185LA 3SBBC 188LA 1C63A 1L40A 1QT5A 210LA 1QSQA 2OEAX 4GBRB 1D3JA 1QT6A 1C6QA 1QUGA 1L63A 3CDOA 1PQJA 1C6MA 3FADA 218LA 236LA 129LA 1L21A 197LA 2IGCA 3HUQA 241LA 2B6YA 174LA 1DYGA 3K2RA 107LA 2OU0X 4LZMA 2A4TA 1JTMA 1QS9A 1L86A 3HU9A 3SBAA 2LZMA 3C8SA 205LA 2OTZX 1LI3A 4EPIA 3GUJA 250LA 1C6IA 1C6HA 1L38A 1CV5A 1L43A 253LA 1L44A 262LA 1P36A 1QT7A 3NY8A 1CU0A 1L75A 1DYFA 3HH4A 3DN2A 1LI6A 1CV3A 1LYHA 169LA 4W51A 147LA 140LA 1OWYA 1QSBA 3C82A 3QAKA 1B6IA 2ANVA 2LC9A 1CVKA 1L02A 2B6WA 1L17A 256LA 1C6JA 2ANXA 2B73A 2RBQA 2Q9EA 1L69A 2HULA 4E97A 1LLHA 1D2WA 1P3NA 1L49A 3FI5A 4EKQA 2RAZX 201LA 1PQDA 1L25A 1L81A 3OE8A 3GUKA 1G0GA 1KS3A 1L83A 1C6CA 243LA 4PK0A 160LA 1C65A 4I7QA 1L34A 102LA 1L82A 1L60A 248LA 1L50A 228LA 3C7WA 3SB6A 3C7ZA 108LA 3C83A 4LDLA 138LA 1ZYTA 4W58A 187LA 2CUUA 170LA 2F47A 3HWLA 3NYAA 258LA 219LA 1L08A 3HDFA 226LA 3DMZA 1XEPA 1DYBA 2B72A 4I7SA 1G0PA 4W57A 2OE9X 1OWZA 3FA0A 1D2YA 1L80A 1ZWNA 173LA 4I7OA 1L96A 3SB5A 1CV0A 3GUIA 2F32A 2RBPA 172LA 2QB0B 1C62A 2RBSA 2QARC 1QT8A 3HTBA 110LA 1L33A 3DKEX 1L26A 177LA 4I7NA 254LA 137LA 3C8QA 4W52A 141LA 1L71A 1CV6A 1QTDA 3V2YA 2RBRA 216LA 1TLAA 251LA 4I7LA 3HH6A 1L09A 3C81A 3EMLA 1L37A 103LA 186LA 1L95A 244LA 4I7PA 209LA 1L54A 3OE9A 227LA 5LZMA 1L47A 245LA 2O79A 192LA 4DAJA 1P5CA 2RAYX 1L46A 1L16A 249LA 2OE4X 119LA 4EPFA 1L00A 2OU8A 4ARPA 1L31A 2NTGA 230LA 1CU6A 3OE0A 4EKSA 191LA 1OVKA 2O7AA 3SB8A 1PQMA 1C6TA 1C6PA 1L93A 3HTFA 3ODUA 1LW9A 1C68A 3LZMA 229LA 1L79A 166LA 1L73A 1L18A 215LA 3CDVA 161LA 159LA 1C64A 3CDQA 1CX7A 1L68A 4EJ4A 1LGXA 148LE 180LA 1L15A 150LA 1DYCA 1C66A 3GUPA 3PDSA 4I7JA 1QTHA 1L77A 1QTCA 165LA 1G1WA 2O4WA 1L19A 1OVHA 220LA 1L06A 3HTGA 1CUQA 1T8AA 217LA 4AQNA 156LA 4K5YA 3L64A 2B7XA 3DMXA 176LA 3G3XA 1CV4A 212LA 1KY1A 3PBLA 146LA 1L57A 1L12A 206LA 1I6SA 196LA 1KW7A 1L58A 1L42A 1G06A 4EKRA 3DMVA 1LWKA 1KNIA 1CU3A 3F9LA 211LA 4GRVA 1P46A 3HU8A 127LA 1G1VA 1P6YA 4W55A 3RZEA 4ARMB 1L91A 1L32A 139LA 1L45A 3SB7A 113LA 3DN6A 164LA 1L35A 231LA 149LA 1L64A 1PQIA 198LA 1L55A 1CV1A 1QUDA 1C6LA 1L27A 120LA 2LCBA 2NTHA 242LA 1L56A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OTYX 4MR1A 4HV2A 4I7MA 1IVMA 1L94A 4L41A 3UONA 2LHMA 1LMAA 195LA 1L24A 1YAOA 4R6CA 1JJ1A 3JR6A 1LZYA 222LA 2Y8PA 144LA 4W54A 1L14A 1P37A 1BB4A 5APEA 3TXEA 126LA 1W6ZA 6LZMA 1GE3A 2Z2FA 1LZAA 1OUIA 1EPYA 5LVHA 2MEEA 3C7YA 5KXYA 3WPLA 199LA 2Q0MX 3WU7A 1XEJA 259LA 1T8FA 4LYBA 2NWDX 4NSJA 4H8YA 1CJ9A 1L30A 1OUDA 4NGLA 1L65A 4B4IA 1GF5A 1C6DA 1GBWA 2DBTA 4NGWA 3WW6A 1D3NA 3VW7A 4FJRA 2W1MA 1T3PA 4WO9A 261LA 2W1XA 4IASA 4NHSA 235LA 1LYIA 4WLTA 232LA 2DQAA 2BAAA 1L84A 1L11A 2OE7X 246LA 4ETDA 1C60A 234LA 1SWYA 1G07A 4X3BA 1SX7A 1DI3A 233LA 155LA 1JTTL 1GBYA 1CU2A 189LA 1L61A 1QTZA 4ARLA 1LJIA 1OV5A 238LA 1JJ0A 1FLUA 1HMLA 1JWRA 1OVJA 2XBRA 1AM7A 1C6GA 3P4ZA 4LYZA 1VDTA 111LA 2YBIA 157LA 1PQKA 3LYTA 4ZIXA 1L88A 1I20A 3K3TA 2XQOA 3ZVQB 2B75A 1LZEA 1CKCA 3W6BA 1L72A 4W59A 3AGHA 1L0KA 1EQ4A 1L99A 1C6AA 1GHLA 3P64A 1J1PY 1UBZA 1KXWA 1QT3A 4OWBA 1GWDA 3DN1A 2X0AA 1L48A 5FEKA 1LJGA 4DD9A 1D9WA 5ILFA 142LA 1CU5A 3HUAA 1DYAA 1B5VA 2G4PA 1IOCA 1LMOA 2A7FA 4BAPA 1LSZA 184LA 1UIFA 1ZURA 4N0JA 183LA 182LA 171LA 1DZBX 1XGPC 1G0JA 1P2LA 5LVKA 5L9JA 3B0IA 3AGIA 1GB3A 3WW5A 3L2XA 4NY5A 4I8SA 1JUGA 1JTOL 1EQEA 4GBRB 4NHPA 3WXUA 4N8ZA 1JKAA 5J7CA 1YAPA 129LA 4KPMA 2IGCA 3HUQA 2B6YA 1DPXA 2DQCY 1LZTA 2OU0X 2A4TA 1JTMA 1QS9A 4QDNA 1L86A 2LZMA 3C8SA 1FLQA 1GXV2 250LA 1CJ6A 4NSIA 1YKYX 1L44A 262LA 1QT7A 3NY8A 4WM6A 3GXKA 1CU0A 5KXOA 3DN2A 1LI6A 1LYHA 2Z12A 3ZVQA 4B0DA 1XGUC 3J4GA 1G7IC 4PHIA 1B6IA 5HNLA 1LZGA 1GE4A 1NDMC 4Z3MA 1YKXX 1C6JA 4NSGA 3WU8A 2B73A 1MLCE 2RBQA 4AGAA 1UIAA 2EPEA 3FE0A 4Z98A 3A93A 2HULA 4PRQA 5L3HA 4LYOA 1LLHA 1ZVHL 4EKQA 3RZ4A 1LSAA 3AW6A 3BKVA 5E9RA 4OWHA 1WTMA 1GFUA 243LA 160LA 1B7MA 1L34A 4G49A 108LA 1QDRA 5DM9A 1GBZA 1DI4A 2CUUA 4NGVA 258LA 3HDFA 2A7DA 5M1YA 4G4HA 2EKSC 4W57A 1OWZA 5LYZA 4B49A 4Z41A 5KXXA 1P2CC 1D0LA 1B5UA 2RBPA 1LKSA 1JIYA 4GLAA 1GF4A 2RBSA 2QARC 4HPIA 110LA 1GB7A 4BADA 177LA 5LVGA 3C8QA 4PRUA 1LPIA 3A67Y 4GN3A 4RW1A 5I54A 1W08A 1L09A 2FYCA 1L37A 186LA 2DQDY 1L95A 4XJHA 2ZWBA 1GF7A 1L47A 1LZ6A 1HEWA 4DAJA 1LJKA 5C6JA 5LYTA 1L46A 1L16A 119LA 5L3IA 2B5ZA 5KXRA 3LZ2A 1NKHA 1CU6A 1UACY 1FN5A 2ZNWY 3KAMA 3ODUA 4DDAA 1C68A 229LA 1LJEA 1HEMA 1GFVA 3IJUA 1OUCA 166LA 1L18A 1CKGA 161LA 1IP4A 4W94A 1FDLY 3CDQA 4EJ4A 1XGRC 3QNGA 1LGXA 1IP7A 4H1PA 2BQJA 1DQJC 1B7RA 4DD3A 2G4QA 5KXLA 1IC4Y 1IOTA 3EBAB 3DMXA 2CWIA 1JTPL 212LA 3PBLA 1LZ4A 1HNLA 206LA 1KW7A 1QTKA 4EKRA 1GF0A 1LWKA 1CU3A 1MELL 5KXKA 4XJDA 1G1VA 2HU3A 4W55A 3RZEA 2BQNA 1V7TA 3A8ZA 3SB7A 5B59A 2W1YA 4H91A 4H9IA 1JISA 4M6DA 1GBSA 3HBHA 5HLLA 4WLYA 5I4WA 2NTHA 4HJZA 1DYEA 1B7SA 2GV0A 4LT2A 2HECA 4I7KA 4EOFA 3F8VA 1L13A 1L70A 3HT7A 4U3XB 1NF5A 237LA 1D0KA 3D9AC 4LDEA 1L87A 1L28A 1KIPC 1UIDA 109LA 3TXGA 3GULA 128LA 1G0KA 3HH3A 4RW2A 1B5WA 134LA 4ET9A 1FKVA 1AT6A 1I56A 1NHEA 2DQJY 2HU1A 130LA 2B6ZA 1QTVA 1C6BA 168LA 2I25L 4J0LA 1LHJA 1WTHA 4ANRA 1LJNA 2DQGY 1OUEA 3G3AB 2BQHA 4OW1A 3B6LA 1OV7A 1SSWA 2Z37A 4OO9A 5B06A 4A7DA 1P2RA 4I0CA 1J1XY 3WPKA 122LA 1B7PA 1WTNA 4PJZA 123LA 1H6MA 181LA 3WMKA 4QY9A 1KW5A 1L23A 114LA 5DN5A 1GEVA 3HT8A 1QT4A 1JQUA 1P64A 1LHHA 1QS5A 4LYTA 2B70A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OTY X;  4MR1 A;  4HV2 A;  4I7M A;  1IVM A;  1L94 A;  4L41 A;  3UON A;  2LHM A;  1LMA A;  195L A;  1L24 A;  1YAO A;  4R6C A;  1JJ1 A;  3JR6 A;  1LZY A;  222L A;  2Y8P A;  144L A;  4W54 A;  1L14 A;  1P37 A;  1BB4 A;  5APE A;  3TXE A;  126L A;  1W6Z A;  6LZM A;  1GE3 A;  2Z2F A;  1LZA A;  1OUI A;  1EPY A;  5LVH A;  2MEE A;  3C7Y A;  5KXY A;  3WPL A;  199L A;  2Q0M X;  3WU7 A;  1XEJ A;  259L A;  1T8F A;  4LYB A;  2NWD X;  4NSJ A;  4H8Y A;  1CJ9 A;  1L30 A;  1OUD A;  4NGL A;  1L65 A;  4B4I A;  1GF5 A;  1C6D A;  1GBW A;  2DBT A;  4NGW A;  3WW6 A;  1D3N A;  3VW7 A;  4FJR A;  2W1M A;  1T3P A;  4WO9 A;  261L A;  2W1X A;  4IAS A;  4NHS A;  235L A;  1LYI A;  4WLT A;  232L A;  2DQA A;  2BAA A;  1L84 A;  1L11 A;  2OE7 X;  246L A;  4ETD A;  1C60 A;  234L A;  1SWY A;  1G07 A;  4X3B A;  1SX7 A;  1DI3 A;  233L A;  155L A;  1JTT L;  1GBY A;  1CU2 A;  189L A;  1L61 A;  1QTZ A;  4ARL A;  1LJI A;  1OV5 A;  238L A;  1JJ0 A;  1FLU A;  1HML A;  1JWR A;  1OVJ A;  2XBR A;  1AM7 A;  1C6G A;  3P4Z A;  4LYZ A;  1VDT A; 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 1NKH A;  1CU6 A;  1UAC Y;  1FN5 A;  2ZNW Y;  3KAM A;  3ODU A;  4DDA A;  1C68 A;  229L A;  1LJE A;  1HEM A;  1GFV A;  3IJU A;  1OUC A;  166L A;  1L18 A;  1CKG A;  161L A;  1IP4 A;  4W94 A;  1FDL Y;  3CDQ A;  4EJ4 A;  1XGR C;  3QNG A;  1LGX A;  1IP7 A;  4H1P A;  2BQJ A;  1DQJ C;  1B7R A;  4DD3 A;  2G4Q A;  5KXL A;  1IC4 Y;  1IOT A;  3EBA B;  3DMX A;  2CWI A;  1JTP L;  212L A;  3PBL A;  1LZ4 A;  1HNL A;  206L A;  1KW7 A;  1QTK A;  4EKR A;  1GF0 A;  1LWK A;  1CU3 A;  1MEL L;  5KXK A;  4XJD A;  1G1V A;  2HU3 A;  4W55 A;  3RZE A;  2BQN A;  1V7T A;  3A8Z A;  3SB7 A;  5B59 A;  2W1Y A;  4H91 A;  4H9I A;  1JIS A;  4M6D A;  1GBS A;  3HBH A;  5HLL A;  4WLY A;  5I4W A;  2NTH A;  4HJZ A;  1DYE A;  1B7S A;  2GV0 A;  4LT2 A;  2HEC A;  4I7K A;  4EOF A;  3F8V A;  1L13 A;  1L70 A;  3HT7 A;  4U3X B;  1NF5 A;  237L A;  1D0K A;  3D9A C;  4LDE A;  1L87 A;  1L28 A;  1KIP C;  1UID A;  109L A;  3TXG A;  3GUL A;  128L A;  1G0K A;  3HH3 A;  4RW2 A;  1B5W A;  134L A;  4ET9 A;  1FKV A;  1AT6 A;  1I56 A;  1NHE A;  2DQJ Y; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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