3W6BA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVEPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRYSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Ralstonia
total genus 61
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6bA00
4WM3A 1VDTA 194LA 1BWJA 4IJ4A 5L9JA 2LHMA 1REZA 1LZEA 1VAUA 4H94A 5LXWA 1TDYA 4N1EI 4HTQA 1GBWA 4MSTA 2Z12A 1CKFA 4NHQA 4OWCA 1FLWA 1J1OY 1BWHA 1NMMA 208LA 3N9AA 4LT0A 5FSTA 1ZVYB 2YBMA 1HEMA 1LZ4A 2Z2FA 2W1LA 3A91A 1YKZX 2HEBA 3IJVA 2DQGY 1RFPA 3WUMA 2BQHA 3A6CY 2MEHA 2YBHA 3A96A 4NG1A 4NGKA 2Y8PA 1LSMA 3A3RX 4HJVA 2C8OA 5F9XA 1GBSA 1TCYA 2PC2A 1GB6A 4YEMA 1REYA 4NHIA 1B7OA 3OK0A 4II8A 5I4YA 1BB4A 4XJBA 1B7SA 1DPWA 4RLNA 3RU5A 4HJYA 5LA5A 5KXMA 3TMXA 1B5WA 4NHTA 4DC4A 4ETDA 2W1MA 2YBJA 3CT0A 5LIOA 4R6CA 3RNXA 5HQ1A 1WQNA 1N4FA 2ZIKA 1CNSA 1D6QA 4KPMA 1AM7A 5KKIA 1UBZA 5E4PA 2AUBA 3OJPA 3EXDA 1YILA 5I5QA 2H9JA 1GBZA 4GCBA 1EQ4A 2D6BA 1JTTL 4XJHA 1MLCE 4N0JA 2ZNXY 1IWYA 3WUNA 3TMWA 3RW8A 3P66A 4WO6A 3WVYA 4NWEA 1FKVA 4YOPA 1IOTA 2YBIA 3LN2A 3AW7A 4N1CC 3EMSA 5KXZA 1DZBX 1AKIA 1AT6A 1BB3A 1UIEA 8LYZA 4H8YA 1YIKA 5IHGA 1C08C 3LHMA 4G4HA 5DN5A 1CJ6A 1T3PA 1BB5A 2D4IA 1YROA 4GN4A 4ZEEA 1LJEA 1LJKA 2F30A 1KXXA 3AGGG 4WG7A 4GCCA 3A34A 4ETBA 5B1GA 4NSHA 1HMLA 4H9EA 1DXJA 4XJIA 5DM9A 2FYDA 1IOSA 1DQJC 1LZAA 1QIOA 1GFJA 1IP7A 1NKHA 2BLYA 2Q0MX 1LJIA 3KAMA 2B5ZA 5F81A 4IASA 1GB7A 1ZMYL 2MECA 4QEQA 1JTPL 2MEIA 1GE3A 1NBZC 2XJWA 4LT1A 4LZTA 1GF6A 4H9AA 4NHPA 3WPLA 1LMAA 3BKHA 1GEZA 1HEOA 4B1AA 3WMKA 2DQCY 1IR9A 1HELA 4NSGA 4Z41A 1DKKA 4D9ZA 2BQEA 1GFEA 2C8PA 4CFOA 3RZ4A 4DYGA 1YAQA 1Z55A 2HEEA 5LA8A 1LSBA 3LYZA 1LZYA 5B1FA 4YF2A 1LOZA 4H9IA 2YBNA 4KT3A 3EBAB 4DD0A 2XBSA 5KXXA 5KY1A 1JKBA 1IVMA 1DI4A 3WU8A 3MGWA 1JTOL 1XSFA 1JSEA 4TSBA 4J1AA 1GBXA 1NF5A 4ETCA 2EIZC 2ZILA 3QY4A 3WL2A 3J4GA 1YQVY 1OUJA 2D4JA 134LA 4YENA 1LZ5A 6LYTA 5LVKA 5D5CA 2BQCA 1GF9A 4NGOA 1RE2A 1UIAA 2YDGA 1LJGA 3TMUA 3TXKA 3WU9A 2FYCA 2Z18A 1BQLY 4GLAA 5I4XA 1UA6Y 4BS7A 4G49A 1VDSA 4P2EA 1JJ0A 1KXYA 1NQIA 4MR1A 1FDLY 2BQBA 2IHLA 2F2NA 1IP6A 1LHIA 2DQEY 4YM8A 2XBRA 5KXLA 1IEEA 1IP2A 3AB6A 4NGVA 1JSFA 1QUSA 1G7IC 2EPEA 1VEDA 1IP3A 2FBBA 2G4QA 2W1XA 2CDSA 4YEOA 1BB6A 3WH1A 153LA 4LYCA 3EO5A 3W3EA 1G7MC 1REMA 2D91A 3TXBA 1OP9B 2FBDA 1JJ3A 1LSEA 5APCA 1JKDA 1GBOA 4EMNA 5I53A 1H6MA 3LZTA 1OUBA 2YVBA 1D0MA 4WM2A 4Z98A 4HPIA 4L41A 4NGJA 4H91A 1B5XA 4XADA 4BAFA 1GAYA 2ZYCA 3TXEA 4HV1A 1LJFA 1GXXA 2ZIJA 1LZ9A 4TWSA 1NDMC 1GFRA 1LMQA 3N9EA 4Z3MA 1OUAA 4A7DA 1HENA 3BKVA 1HFXA 4DD1A 132LA 3GXRA 1AT5A 1LSNA 3A90A 1OUHA 1B0DA 1B7RA 1LHMA 4J0LA 2CWIA 1LMTA 4TX7A 5K7OA 4PGJB 4J7VA 1B5VA 1BB7A 3A67Y 4NSJA 1GB0A 3A8ZA 4OW1A 1OUCA 2MEAA 1GEVA 4M6DA 4C3WA 1INUA 1LHJA 4HSFA 4WLXA 1RI8B 1XGPC 2Z37A 1YL1X 3LZ2A 1JKCA 3LYTA 1FLYA 5C6IA 2H9KA 5ILCA 1OUFA 4WL6A 5HNLA 1LSDA 2IFFY 1LZNA 5LVIA 1IX0A 4H90A 4M4OA 2ZQ3A 4W96A 4N9RA 1LZ8A 3WULA 1HHLA 3LYMA 1KIQC 5KXOA 2HEFA 1F0WA 1RCMA 2I25L 4DD3A 1J1PY 4OWBA 1GFGA 1GE0A 3FI7A 4HV2A 2RSCA 5LAGA 5KXPA 1IWWA 1LYYA 4GCEA 2DQJY 4NEBA 5KXSA 5E9RA 1D6PA 207LA 3W6CA 5B06A 2ZYPA 1JJ1A 3M18B 1B9OA 5J7CA 4KL7A 5LYZA 1XEJA 3A92A 1WVVA 4RW2A 7LYZA 2MEFA 4DDBA 1QTEA 1IY4A 5F9UA 2HU3A 1GF8A 1IWXA 3P65A 3QNGA 1W08A 4NGLA 1VDPA 1GB5A 1GF3A 1GE2A 1LZCA 3CT5A 1EL1A 4XN6A 1QSWA 1IOQA 1IWVA 4XENA 1RJCB 2BPUA 4GCDA 3ZVQA 2BQIA 3AGIA 5APFA 5II3A 2YBLA 1GF7A 2Z38A 4WLDA 4WL7A 4CJ2A 2GV0A 1GBYA 1UIHA 4NGZA 3P4ZA 5LYMA 5KXNA 1IC5Y 3A3QA 2NWDX 4TTDA 1VATA 2HEAA 3K3TA 1DKJA 1FLQA 1LZSA 1C46A 1CKHA 3AZ6A 1C43A 1LZRA 1EQEA 1JKAA 1H87A 1E8LA 3AZ4A 4LYBA 2DKVA 4WOAA 4CFPA 4HTNA 1LJ4A 1B7NA 4WM5A 4DWXA 1P2CC 2MEGA 4B49A 1WTMA 1WVUA 1JUGA 4LYZA 4AGAA 135LA 1HEQA 1VDQA 4LYTA 1B5YA 1LZDA 1JHLA 4LYOA 4ZIXA 4NSIA 1UCOA 3TXGA 2F4AA 1HERA 4UWVA 5DL9A 4H92A 1FLUA 1B5ZA 1KXWA 5F16A 1XFPL 3HBDA 2ZQ4A 3E3DA 4GN3A 1JPOA 3WVXA 3B0OA 1QQYA 1GFHA 1HMKA 2XTHA 4NG8A 1GFAA 1WQPA 2F4GA 2BQNA 3TXFA 5DLAA 1WQMA 3TXIA 5KXYA 1OUGA 2H5ZA 4OOOA 1C10A 1B5UA 1LZBA 1JWRA 2DBTA 1G7JC 5L3IA 1WQOA 1IY3A 1GF0A 4ML7A 4H93A 4DD9A 1WTNA 4R0FA 1QTKA 4J1BA 1CKGA 2CJLA 1GDWA 5DN4A 1A4VA 1OUDA 4XJGA 5LVGA 4LGKA 1LSGA 1HF4A 2ZNWY 1NWGA 3G3BB 1LMNA 3T36A 2W1YA 1GPQC 2BQOA 2DQIY 3WW6A 4DDAA 1GD6A 1LZ1A 1LMPA 1OQMA 3IJUA 1LYSA 1LJNA 2MEDA 4WO9A 3J6KA 1WQRA 2BQMA 3WYHA 1IWTA 1FKQA 193LA 1IP4A 1REXA 2DQAA 1D9UA 2X0AA 2CGIA 1LKRA 3AYQA 1FBIX 5IDDA 4TSCA 4ANRA 4E3UA 4UWNA 2Z2EA 3ATOA 1ALCA 1LJJA 3M3UA 1LSAA 2HTXA 4NHSA 6LYZA 4ET9A 2DQDY 1CJ9A 4TUNA 3AZ7A 1LJHA 1LKSA 4PJ2C 1GHLA 3LYOA 4LFPA 1B7MA 1GB9A 1GE4A 1YKYX 3VWOA 3WU7A 4B4IA 5APEA 4QDNA 4B4EA 1NDGC 1IOCA 4BAPA 4QY9A 1HC0A 2MEBA 1CKDA 5FHWA 3WPJA 4WMGA 5AMYA 4HPEA 2HECA 1UACY 2BLXA 4HP0A 1B2KA 1UICA 1GXV2 2HEDA 3B0IA 9LYZA 1CJ8A 1QSAA 1BGIA 4LT2A 4OWEA 1XGUC 4NGWA 1YANA 1GFVA 1IORA 4CGEA 2D4KA 3SP3A 3T6UA 2N5ZA 4FDYA 3RT5X 5FCPA 1T6VL 1GB2A 4H9BA 1PZYA 133LA 5KXTA 3CT1A 3WUAA 1YAPA 3CSQA 4LYMA 3WW5A 1ZV5L 4LT3A 5KXRA 5M1YA 1JITA 1XGRC 5HMVA 4N8ZA 1QDTA 3B0KA 1GB8A 1XEIA 3B6LA 3WXUA 4Z46A 2DQFC 2Z19A 5KXKA 1GF5A 1LZGA 3AZ5A 1C7PA 2YSSC 1IP5A 4NWHA 4N5RA 1C45A 4QGZA 4XYYA 1G7HC 2LYOA 1V7SA 5B05A 1CKCA 1LYZA 2LYZA 1HEPA 4FJRA 1IC4Y 4DD2A 4OWAA 3TXDA 1BHZA 1KIPC 3D3DA 1LHLA 1DI3A 4CHXA 3P64A 1JISA 5JENB 5LYTA 4H8ZA 1O23A 3WXTA 1HNLA 4H9CA 2LZ2A 3F6ZA 1IR8A 5FELA 4EOFA 1HSWA 4RDSA 5KKJA 1G7LC 5T3FA 1OUIA 4OOTA 4U3XB 5EBHA 4HJZA 1XGQC 1D0KA 1TAYA 1A2YC 4X3BA 1LSFA 2BQJA 4H1PA 4I8SA 1CJ7A 4G9SA 4B0DA 1NHEA 1PS5A 3A94A 5B07A 1IR7A 1GAZA 2Z39A 5HLLA 5LINA 1FN5A 4NGYA 4PRUA 3ZVQB 3G3AB 1LZTA 1F10A 1TBYA 3IWRA 1LYOA 3A95A 3CSZA 2BQAA 3AJNA 1B7PA 1IP1A 2A7DA 3A6BY 4HTKA 4RLMA 4WM4A 1WQQA 2G4PA 1XEKA 1VFBC 3W6EA 2A7FA 4RW1A 1HEWA 5F14A 2G4NA 2BQKA 5A3ZA 1LPIA 1SQ2L 1OUEA 4XJFA 4KXIA 3FE0A 2LZTA 4B4JA 2MEEA 154LA 1HFYA 1UIDA 1F6SA 1LMCA 1V7TA 5KXWA 1GE1A 1MELL 1JIYA 4DD7A 1LSCA 1XGTC 2I26L 3W6FA 4BADA 1IC7Y 1UIFA 4PPOA 1LMOA 4DDCA 2BQGA 4PHIA 1GFTA 5HMJA 1QUTA 4H8XA 4ETAA 1LHKA 1LAAA 4ET8A 2ZWBA 4LFXA 3ATNA 3HFMY 2BQLA 5B59A 4IATA 1YKXX 1TEWA 1UC0A 2EKSC 1I20A 1I56A 4WLYA 1BVXA 4WM1A 5I54A 1KIRC 5ILFA 5FDJA 1QDRA 4GCFA 1IIZA 1GFKA 1GFUA 2HUBA 1BVKC 1W6ZA 2BQDA 2VB1A 1IWUA 3A93A 4WG1A 1F6RA 3WPKA 2HU1A 4ZFPA 5D5FA 1UUZC 1ZVHL 4AXTA 5HNCA 1NBYC 3AGHA 3D9AC 4O34A 1GF4A 1IO5A 5A3EA 3ULRA 4OWHA 3W6AA 3W6BA 4DT3A 1YL0X 3ZEKA 2BQFA 2DQHY 3AW6A 3W6DA 2EQLA 5IELA 4GLVA 5LVJA 5C6LA 1D0LA 1J1XY 1UIGA 1YAMA 1UIBA 3HBEX 3CSRA 4WLTA 1LHHA 1LSYA 3P68A 3GXKA 3QE8A 4H9FA 1BWIA 1HFZA 1B7QA 5APDA 4W94A 4PRQA 1SLYA 1AZFA 3CB7A 1YAOA 3TXJA 3N9CA 3TMVA 5I4WA 4C5FA 1LZ6A 1HSXA 4G4CA 5LVHA 1B7LA 3CQLA 4WM6A 4XJDA 1LCNA 1LTMA 5L3HA 4I0CA 1JEFA 4GN5C 1GWDA 1GDXA 4UWUA 2I6ZA 5C6JA 2LYMA 1EQ5A 1DPXA 1GB3A 4G4BA 4NY5A 4NGIA 1LJ3A 1LSPA 2WARA 3B72A 2BAAA 1IWZA 4NFVA 4NIJA 5FEKA 4H9HA 5LAFA 4ETEA 1DI5A 5KJ9A 1I1ZA 3HBHA 3TXHA 1LSZA 4MCKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
194LA 5L9JA 1TDYA 4N1EI 1BWHA 1NMMA 3N9AA 1L38A 4LT0A 5FSTA 2Z2FA 2L78A 1L01A 2HEBA 2Y8PA 1LSMA 1GBSA 1REYA 4II8A 170LA 3TMXA 3F8VA 4DC4A 2W1MA 3CT0A 128LA 1L53A 4ARMB 1WQNA 1N4FA 2ZIKA 3L2XA 1AM7A 2OU9A 1UBZA 2AUBA 3EXDA 2B6WA 1DYBA 1G0LA 1C64A 1L74A 1LYEA 3TMWA 3RZEA 3RW8A 3P66A 1FKVA 2YBIA 3LN2A 3DKEX 5KXZA 1BB3A 1C6FA 1T3PA 1BB5A 4ZEEA 2F30A 180LA 3HH5A 1HMLA 1P2LA 4XJIA 1KW5A 1DQJC 1C6JA 1ZMYL 119LA 3SB8A 1JTPL 236LA 1NBZC 2OE9X 3WPLA 1LMAA 1IR9A 4NSGA 3DN8A 1DKKA 1YAQA 1Z55A 5LA8A 1LZYA 4I7JA 1LOZA 225LA 2YBNA 4H9IA 3EBAB 1SWYA 2XBSA 5KY1A 4EKSA 1NF5A 4ETCA 1I6SA 4W58A 134LA 3WU9A 1LJGA 3TXKA 1SWZA 1QSQA 2FYCA 4GLAA 168LA 4G49A 1VDSA 4P2EA 1JJ0A 1LHIA 5KXLA 3CDVA 4NGVA 1G7IC 182LA 1IP3A 3HT8A 4YEOA 2RBNA 3WH1A 3K2RA 4EMNA 1GBOA 1C6GA 1OUBA 1D0MA 206LA 4Z98A 4L41A 4H91A 1D9WA 1L12A 1L77A 2ZYCA 172LA 1LJFA 2ZIJA 1LMQA 176LA 1OUAA 1HFXA 132LA 3GXRA 3T6UA 1L23A 1L24A 1QT5A 1B5VA 4C3WA 1G06A 3DNAA 1JKCA 3C83A 1CV0A 1L97A 1LSDA 1IX0A 1QS5A 4N9RA 173LA 3OE8A 1J1PY 1LI2A 1QT3A 1LYYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WM3 A;  1VDT A;  194L A;  1BWJ A;  4IJ4 A;  5L9J A;  2LHM A;  1REZ A;  1LZE A;  1VAU A;  4H94 A;  5LXW A;  1TDY A;  4N1E I;  4HTQ A;  1GBW A;  4MST A;  2Z12 A;  1CKF A;  4NHQ A;  4OWC A;  1FLW A;  1J1O Y;  1BWH A;  1NMM A;  208L A;  3N9A A;  4LT0 A;  5FST A;  1ZVY B;  2YBM A;  1HEM A;  1LZ4 A;  2Z2F A;  2W1L A;  3A91 A;  1YKZ X;  2HEB A;  3IJV A;  2DQG Y;  1RFP A;  3WUM A;  2BQH A;  3A6C Y;  2MEH A;  2YBH A;  3A96 A;  4NG1 A;  4NGK A;  2Y8P A;  1LSM A;  3A3R X;  4HJV A;  2C8O A;  5F9X A;  1GBS A;  1TCY A;  2PC2 A;  1GB6 A;  4YEM A;  1REY A;  4NHI A;  1B7O A;  3OK0 A;  4II8 A;  5I4Y A;  1BB4 A;  4XJB A;  1B7S A;  1DPW A;  4RLN A;  3RU5 A;  4HJY A;  5LA5 A;  5KXM A;  3TMX A;  1B5W A;  4NHT A;  4DC4 A;  4ETD A;  2W1M A;  2YBJ A;  3CT0 A;  5LIO A;  4R6C A;  3RNX A;  5HQ1 A;  1WQN A;  1N4F A;  2ZIK A;  1CNS A;  1D6Q A;  4KPM A;  1AM7 A;  5KKI A;  1UBZ A;  5E4P A;  2AUB A;  3OJP A;  3EXD A;  1YIL A;  5I5Q A;  2H9J A;  1GBZ A;  4GCB A;  1EQ4 A;  2D6B A;  1JTT L;  4XJH A;  1MLC E;  4N0J A;  2ZNX Y; 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 4PHI A;  1GFT A;  5HMJ A;  1QUT A;  4H8X A;  4ETA A;  1LHK A;  1LAA A;  4ET8 A;  2ZWB A;  4LFX A;  3ATN A;  3HFM Y;  2BQL A;  5B59 A;  4IAT A;  1YKX X;  1TEW A;  1UC0 A;  2EKS C;  1I20 A;  1I56 A;  4WLY A;  1BVX A;  4WM1 A;  5I54 A;  1KIR C;  5ILF A;  5FDJ A;  1QDR A;  4GCF A;  1IIZ A;  1GFK A;  1GFU A;  2HUB A;  1BVK C;  1W6Z A;  2BQD A;  2VB1 A;  1IWU A;  3A93 A;  4WG1 A;  1F6R A;  3WPK A;  2HU1 A;  4ZFP A;  5D5F A;  1UUZ C;  1ZVH L;  4AXT A;  5HNC A;  1NBY C;  3AGH A;  3D9A C;  4O34 A;  1GF4 A;  1IO5 A;  5A3E A;  3ULR A;  4OWH A;  3W6A A;  3W6B A;  4DT3 A;  1YL0 X;  3ZEK A;  2BQF A;  2DQH Y;  3AW6 A;  3W6D A;  2EQL A;  5IEL A;  4GLV A;  5LVJ A;  5C6L A;  1D0L A;  1J1X Y;  1UIG A;  1YAM A;  1UIB A;  3HBE X;  3CSR A;  4WLT A;  1LHH A;  1LSY A;  3P68 A;  3GXK A;  3QE8 A;  4H9F A;  1BWI A;  1HFZ A;  1B7Q A;  5APD A;  4W94 A;  4PRQ A;  1SLY A;  1AZF A;  3CB7 A;  1YAO A;  3TXJ A;  3N9C A;  3TMV A;  5I4W A;  4C5F A;  1LZ6 A;  1HSX A;  4G4C A;  5LVH A;  1B7L A;  3CQL A;  4WM6 A;  4XJD A;  1LCN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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