3W6EA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471 (e162q)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVQPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Ralstonia
total genus 59
structure length 158
sequence length 158
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6eA00
5LYZA 5KXLA 5LVHA 194LA 1TAYA 1GB7A 1LSNA 1LSMA 2EPEA 2VB1A 4DD1A 5LAGA 154LA 4I8SA 8LYZA 1NQIA 3A6BY 1W08A 1DQJC 1GFVA 1UIDA 3WUAA 5APEA 1UIHA 1VDSA 4ZEEA 1WTMA 4ETCA 1IP4A 1LHHA 1REMA 2GV0A 1LYSA 4PPOA 1UIAA 4H9BA 5C6IA 3WVYA 2DQFC 1OUAA 1ZV5L 4H92A 3P68A 5EBHA 3WPKA 4C5FA 3TXBA 4WM4A 2F2NA 4R0FA 1J1PY 2DQHY 3LYOA 1IVMA 5AMYA 1KIQC 2F4AA 1HNLA 2CWIA 1GBWA 1CNSA 3WW6A 4YF2A 4Z3MA 1GXV2 3K3TA 1C7PA 3IWRA 4BADA 1NMMA 4LYOA 4YOPA 4DD3A 1T6VL 5KKIA 3ULRA 4DWXA 3G3BB 1UIEA 5B05A 4DYGA 1LZRA 4NWEA 2W1MA 4H8ZA 1IEEA 3AYQA 4HTQA 4YM8A 5HLLA 3A95A 4HV2A 3EO5A 1A2YC 4LT3A 3A91A 4D9ZA 4Z98A 2MEBA 3AZ6A 1TEWA 1T3PA 1IWWA 5LAFA 1CJ7A 4B1AA 1GF6A 1W6ZA 4RDSA 1DKKA 2BQMA 1GXXA 1YIKA 1IR8A 1LAAA 1LSDA 1IY3A 1TDYA 4RLNA 7LYZA 1B7PA 1SQ2L 3WPJA 193LA 4WG1A 1DXJA 1GWDA 2Z2FA 3J4GA 2BQBA 2BQGA 4QDNA 4N1EI 5I4YA 1B0DA 3A6CY 1INUA 5KXNA 5APCA 2IHLA 2ZYPA 5LXWA 1GF7A 4OOTA 4ZFPA 2BQNA 5F81A 1LKSA 3AB6A 2F30A 1JTTL 2ZIKA 3KAMA 1OUBA 3W6DA 1UIGA 2Z2EA 1CJ9A 1KXXA 1LJFA 4H8XA 1LSCA 3CQLA 5HNLA 1BB6A 1LJ4A 2HECA 1BVKC 1GFUA 1QDTA 1RI8B 1UIFA 5F9XA 5LA8A 1IOCA 4ETEA 1GB9A 1GFJA 3WU9A 3M18B 3WVXA 2MEIA 3AGIA 5LVGA 1B7LA 4GCCA 2HEFA 3A8ZA 3OK0A 4HPIA 4HTNA 1BVXA 4LYMA 1GF0A 4W94A 3WU7A 3LHMA 3P64A 2C8PA 1IR7A 4CFPA 1HMLA 3QY4A 2W1LA 4NY5A 2ZILA 1HERA 1GAZA 3AGGG 2ZNXY 1GBXA 4H9IA 5T3FA 2PC2A 2YBIA 1EQ4A 1B7RA 4N8ZA 1GE3A 1LZAA 2BQCA 3TMWA 3IJVA 2MEEA 4G49A 3P66A 5KJ9A 1PZYA 3A34A 1B7SA 1LHLA 1GB6A 3A90A 1OUIA 5F9UA 3A94A 1B5WA 3LYZA 5IHGA 4PRQA 3EMSA 3HBDA 4II8A 1QIOA 4MR1A 4WM5A 4LYCA 1VAUA 4H9FA 4LYTA 4XJHA 4WOAA 1FN5A 5LVIA 2LYZA 1D0LA 1IWVA 1D9UA 1QSAA 2W1XA 4NHPA 4RW2A 1XEJA 4EOFA 1GF4A 2YBMA 1WTNA 3SP3A 1DPXA 4ETDA 4E3UA 1JKDA 3ZVQB 5D5CA 2BQFA 1VEDA 1OP9B 3LZ2A 2AUBA 1OUFA 2ZQ3A 1QSWA 1NF5A 3TMXA 1NBZC 3T36A 1BGIA 4NGZA 5B06A 5C6JA 5L9JA 1YKYX 1NKHA 3G3AB 2DQCY 1HC0A 4B4IA 3AGHA 2FBBA 1XGQC 2FYDA 4H9EA 3WH1A 4NIJA 1E8LA 1JIYA 2BQDA 1IP3A 1HENA 4DDBA 5M1YA 1IORA 4PRUA 2Z39A 1LZ6A 2YBNA 2BLYA 5FELA 4B4EA 4B49A 2A7FA 3GXKA 1LSAA 1G7HC 2Z19A 1DZBX 2YSSC 4WL7A 1GFEA 4XJBA 1IP2A 1G7LC 1GBSA 3TXHA 1KXYA 2DQDY 1JKAA 3AW7A 3P65A 1CKDA 1GPQC 1BB7A 4NG8A 4WL6A 3T6UA 2DQAA 5B07A 1YAQA 4BAPA 2Z38A 2BQHA 1LJNA 3HBHA 4TTDA 5LINA 1HHLA 1FKVA 5ILFA 1GE2A 4FJRA 4RLMA 5B1FA 1IC5Y 3EBAB 5B1GA 1GFGA 4P2EA 4NGYA 1LOZA 1B7MA 1B5ZA 2G4PA 3M3UA 1B5YA 4HJYA 4DD2A 4GCFA 1WQNA 4H9HA 2LYOA 3B6LA 3WUMA 1LKRA 2ZNWY 1HSWA 2MEGA 3B72A 1AM7A 1IO5A 1GB2A 3LN2A 3TXDA 5KKJA 4LGKA 1LSBA 1HEMA 1GDWA 1YAOA 2DBTA 5LVKA 5KY1A 1J1XY 4HJZA 2CGIA 5IELA 1IY4A 1LJHA 2DKVA 3LZTA 4N0JA 3A67Y 1JKBA 1GFAA 4OWBA 1F0WA 3RT5X 4N5RA 1D6PA 1JSEA 1FLWA 1UICA 2HU1A 1WQRA 2MEFA 4GLVA 1EQ5A 1GF9A 2N5ZA 1LYOA 3MGWA 5LYMA 1F6RA 1GE1A 2HTXA 4I0CA 1B5XA 1C46A 1H6MA 1B2KA 4ETAA 1XGUC 5F16A 1JTOL 1B5UA 4G9SA 4NSGA 4XADA 2CJLA 2EIZC 1IIZA 2NWDX 4H9AA 1LSYA 4H9CA 4H94A 2RSCA 1LHKA 1IC7Y 1ZMYL 4RW1A 1AZFA 2Q0MX 3HBEX 4N9RA 1UIBA 1WQMA 1LSFA 5KXZA 3BKHA 5KXKA 4MSTA 5HQ1A 1UC0A 1GFHA 1MELL 1GFTA 5I5QA 1HELA 2HEAA 1ZVYB 1IWZA 4GN4A 1VDTA 4TX7A 1JPOA 4G4CA 2ZWBA 4WLXA 4X3BA 3WXUA 3TXGA 5L3IA 4WM3A 1EQEA 4DD9A 2C8OA 4HTKA 5DLAA 1GF3A 1REXA 1GBYA 1WVUA 1GFKA 2YBJA 3A92A 4G4BA 5LYTA 1IP7A 1YKXX 5E4PA 1B9OA 1OUJA 2HUBA 3D3DA 4Z41A 1JKCA 1LZCA 2BPUA 2FBDA 1J1OY 5DN5A 1BWIA 1LJIA 5II3A 1JEFA 2XBRA 4LZTA 4ET9A 3RNXA 5ILCA 1LMTA 4WO6A 1IWUA 2BQIA 1DI4A 1HSXA 1UACY 3ATOA 1LJ3A 2ZQ4A 3CT0A 4GCDA 4NGKA 5KXYA 3WMKA 2HEEA 4NSHA 2XTHA 4KPMA 3TXFA 3WXTA 4CHXA 1GE4A 1LZEA 1LSEA 1UUZC 3AW6A 1LZNA 3CT5A 3LYTA 4NGIA 4DDCA 1C08C 4WG7A 1GB5A 4BS7A 133LA 1UA6Y 4TWSA 4WLYA 1LYZA 2X0AA 4HSFA 4PHIA 2W1YA 3LYMA 2BQKA 2YBLA 3W6AA 1LHMA 1GB3A 4KXIA 4NFVA 5I53A 1B7QA 4NSIA 2CDSA 1OUEA 1AT6A 1BWHA 3N9CA 1DKJA 1XGRC 3E3DA 4NG1A 4UWVA 3WULA 4DD0A 1D0KA 2I6ZA 4J7VA 4GN5C 1BQLY 4LT0A 4B4JA 1C45A 5A3EA 4LFPA 1FBIX 1O23A 1XEKA 1B5VA 4NWHA 1GEVA 5B59A 4AGAA 3FE0A 2EQLA 1I1ZA 3TMVA 4XJDA 1NHEA 4LFXA 5L3HA 5LIOA 1C43A 1LMQA 4Z46A 1LPIA 2IFFY 1LZTA 4LT2A 1IOTA 1GE0A 4XJFA 4NGVA 1LSPA 1IP5A 1YQVY 4R6CA 4NGJA 5E9RA 4QY9A 1QTEA 3TXJA 4CFOA 6LYZA 1JSFA 2LYMA 3J6KA 1HEWA 4IATA 3RZ4A 4NGWA 1REZA 3N9AA 153LA 1ALCA 1LMNA 4U3XB 1F10A 5KXMA 1GHLA 4WLTA 5KXXA 1LZ8A 1HEOA 1OUHA 2I26L 1VDPA 3CSRA 4ML7A 3TXKA 2Y8PA 1WQOA 4H91A 4HP0A 5APDA 1OUGA 1QUSA 1P2CC 3RU5A 3AZ7A 2BQLA 1GB0A 4XJGA 4DC4A 4UWUA 1BB4A 1BHZA 5KXOA 4LYBA 5I4WA 4G4HA 2D4KA 4OWAA 4ETBA 5FDJA 5IDDA 1D6QA 3N9EA 1YL1X 1LMAA 4IJ4A 2I25L 4UWNA 3W6CA 5LVJA 2MECA 1LCNA 1ZVHL 1GDXA 4AXTA 2MEAA 3A93A 3QE8A 4H8YA 1FLQA 1JTPL 1B7NA 1Z55A 1I20A 2XJWA 2B5ZA 2D91A 5APFA 5JENB 2LZTA 4ZIXA 3RW8A 1HMKA 1DI3A 1YROA 5FCPA 1UCOA 4DT3A 2HEDA 4IASA 1OUDA 3W6BA 1FLYA 5DM9A 3VWOA 1AKIA 1HF4A 2H9KA 4XENA 4DD7A 1F6SA 3WU8A 1REYA 1LHJA 2WARA 3CSZA 1XGTC 2BQJA 1NDGC 1DI5A 3CB7A 3OJPA 4A7DA 5KXTA 5DL9A 1AT5A 1LZDA 2MEHA 135LA 1KXWA 1VDQA 4N1CC 4W96A 1LTMA 3A3RX 3B0OA 3WUNA 1LSZA 1YL0X 1JJ0A 1LZ1A 2ZIJA 1LMOA 4GN3A 4YEOA 1LZGA 1LSGA 4MCKA 5A3ZA 2LZ2A 4ET8A 4YENA 1CJ8A 4XJIA 1JJ3A 3W6EA 1GF8A 4TUNA 4OW1A 4O34A 2H5ZA 5K7OA 5C6LA 5KXSA 4FDYA 4B0DA 4GCBA 3W6FA 1IWTA 1LZYA 1LMCA 1RFPA 2HEBA 4WLDA 1IP1A 2DQGY 3IJUA 4NHIA 4WM2A 5J7CA 5KXRA 2ZYCA 4L41A 1CJ6A 4PJ2C 1FLUA 5D5FA 5LA5A 1QDRA 4CJ2A 1BWJA 1VFBC 3A96A 1KIRC 5KXPA 3ZVQA 1XFPL 2DQIY 3D9AC 4NGOA 4EMNA 208LA 3HFMY 4KT3A 1LZSA 3WW5A 1YANA 1QQYA 1D0MA 4OWHA 4WM1A 5FHWA 1V7TA 1YAMA 1GFRA 1GBOA 2Z37A 1MLCE 4LT1A 1C10A 4YEMA 5I54A 132LA 1A4VA 1HFYA 5I4XA 3P4ZA 3BKVA 4J1AA 1IWXA 2HU3A 3AJNA 2EKSC 1WQQA 1I56A 1QTKA 1GB8A 2H9JA 3TMUA 4NEBA 1OQMA 1G7MC 6LYTA 207LA 1CKCA 2D4IA 3A3QA 5FSTA 3CT1A 2BAAA 4HV1A 1QUTA 1N4FA 5HNCA 1YKZX 3W3EA 1JJ1A 1OUCA 2LHMA 2DQJY 3QNGA 2G4QA 1XGPC 134LA 2A7DA 1JITA 4HJVA 1RCMA 1GBZA 5DN4A 4PGJB 1IOQA 1WQPA 2D4JA 3AZ5A 3GXRA 1DPWA 4XYYA 1VATA 1CKHA 1CKFA 1LJGA 2YVBA 1LZ4A 4LYZA 1FKQA 2Z18A 1G7IC 5HMJA 4HPEA 1SLYA 2BQAA 2D6BA 4NHSA 1CKGA 4WMGA 5FEKA 5HMVA 4XN6A 4NGLA 2MEDA 1IP6A 1NDMC 4NHQA 2YDGA 4OWCA 4TSBA 1JISA 1JWRA 4BAFA 3ATNA 1LYYA 4GCEA 4NHTA 1IX0A 4J1BA 4QGZA 4M4OA 1B7OA 3EXDA 4OWEA 1HEPA 1UBZA 2Z12A 3FI7A 1XSFA 1BB5A 1HFXA 4J0LA 4M6DA 4WO9A 1RJCB 3B0KA 3TXIA 1LJKA 1GD6A 1LHIA 3WL2A 5KXWA 2YBHA 2F4GA 4NSJA 5F14A 2FYCA 1LMPA 1NBYC 3CSQA 4OOOA 4TSCA 1KIPC 1YAPA 1TBYA 1NWGA 1IOSA 3F6ZA 1JHLA 4H1PA 1LJEA 1WVVA 3B0IA 3WPLA 4ANRA 1LZBA 1IR9A 1HFZA 1LZ5A 4H90A 3WYHA 1GAYA 1GF5A 1PS5A 1TCYA 2BQOA 1H87A 1HEQA 1FDLY 1IWYA 1V7SA 4C3WA 4DDAA 4CGEA 2BLXA 1RE2A 1YILA 1G7JC 4H93A 4WM6A 2G4NA 1BB3A 9LYZA 1GEZA 2XBSA 1XEIA 3ZEKA 1LZ9A 2DQEY 1JUGA 4QEQA 1EL1A 4GLAA 1IC4Y 4KL7A 1LJJA 3TXEA 3AZ4A 2BQEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LVHA 1TAYA 2VB1A 154LA 3GUPA 1NQIA 1GFVA 5APEA 1IP4A 5C6IA 1OUAA 1G0LA 3P68A 3HUQA 1LGXA 3D4SA 1L94A 1KIQC 2F4AA 187LA 3HDEA 4YF2A 1L66A 1GXV2 4LYOA 1L98A 5KKIA 3ULRA 5B05A 2RBQA 1UIEA 2W1MA 4H8ZA 1LW9A 1CX6A 3A91A 4Z98A 2MEBA 1L33A 1CJ7A 112LA 1IR8A 1QT6A 4LDEA 1TDYA 4RLNA 233LA 7LYZA 1B7PA 1ZURA 1GWDA 2BQGA 4QDNA 1B0DA 5LXWA 206LA 1D2WA 2RB2X 2F30A 1C68A 2LC9A 1UIGA 2Z2EA 4ARMA 2HUKA 1LSCA 4I7KA 1BVKC 1GB9A 1GFJA 3M18B 3WVXA 1B7LA 1QSBA 4HPIA 1GF0A 1IR7A 4GBRB 2ZNXY 107LA 4H9IA 238LA 1I6SA 1L46A 3IJVA 2MEEA 1L86A 3P66A 5KJ9A 1CU6A 1D3NA 1B7SA 1L95A 5F9UA 1QUHA 1QIOA 1VAUA 4H9FA 4XJHA 4WOAA 1FN5A 2RBOA 1IWVA 1D9UA 4NHPA 1KW7A 4ETDA 1T8FA 3DN2A 3ZVQB 2AUBA 2ZQ3A 2ANXA 1YKYX 141LA 4DQJA 4B4IA 4NIJA 1L27A 1IP3A 4DDBA 1CUPA 2Z39A 130LA 2YBNA 4B4EA 2A7FA 1L28A 1LSAA 2Z19A 1DZBX 4WL7A 1GFEA 2RBPA 1QSQA 3TXHA 1QT3A 4NG8A 3T6UA 4BAPA 1YAQA 2Z38A 5LINA 1CV0A 1HHLA 5ILFA 1JTNA 1B7MA 1B5ZA 3M3UA 246LA 4DD2A 4GCFA 4H9HA 2LYOA 2O79A 2ZNWY 3TXDA 1LSBA 1YAOA 1GDWA 2DBTA 5KY1A 1J1XY 4W59A 1IY4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LYZ A;  5KXL A;  5LVH A;  194L A;  1TAY A;  1GB7 A;  1LSN A;  1LSM A;  2EPE A;  2VB1 A;  4DD1 A;  5LAG A;  154L A;  4I8S A;  8LYZ A;  1NQI A;  3A6B Y;  1W08 A;  1DQJ C;  1GFV A;  1UID A;  3WUA A;  5APE A;  1UIH A;  1VDS A;  4ZEE A;  1WTM A;  4ETC A;  1IP4 A;  1LHH A;  1REM A;  2GV0 A;  1LYS A;  4PPO A;  1UIA A;  4H9B A;  5C6I A;  3WVY A;  2DQF C;  1OUA A;  1ZV5 L;  4H92 A;  3P68 A;  5EBH A;  3WPK A;  4C5F A;  3TXB A;  4WM4 A;  2F2N A;  4R0F A;  1J1P Y;  2DQH Y;  3LYO A;  1IVM A;  5AMY A;  1KIQ C;  2F4A A;  1HNL A;  2CWI A;  1GBW A;  1CNS A;  3WW6 A;  4YF2 A;  4Z3M A;  1GXV 2;  3K3T A;  1C7P A;  3IWR A;  4BAD A;  1NMM A;  4LYO A;  4YOP A;  4DD3 A;  1T6V L;  5KKI A;  3ULR A;  4DWX A;  3G3B B;  1UIE A;  5B05 A;  4DYG A;  1LZR A;  4NWE A;  2W1M A;  4H8Z A;  1IEE A;  3AYQ A;  4HTQ A;  4YM8 A;  5HLL A;  3A95 A;  4HV2 A;  3EO5 A;  1A2Y C;  4LT3 A;  3A91 A;  4D9Z A;  4Z98 A;  2MEB A;  3AZ6 A;  1TEW A;  1T3P A;  1IWW A;  5LAF A;  1CJ7 A;  4B1A A;  1GF6 A;  1W6Z A;  4RDS A;  1DKK A;  2BQM A;  1GXX A; 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 1LSG A;  4MCK A;  5A3Z A;  2LZ2 A;  4ET8 A;  4YEN A;  1CJ8 A;  4XJI A;  1JJ3 A;  3W6E A;  1GF8 A;  4TUN A;  4OW1 A;  4O34 A;  2H5Z A;  5K7O A;  5C6L A;  5KXS A;  4FDY A;  4B0D A;  4GCB A;  3W6F A;  1IWT A;  1LZY A;  1LMC A;  1RFP A;  2HEB A;  4WLD A;  1IP1 A;  2DQG Y;  3IJU A;  4NHI A;  4WM2 A;  5J7C A;  5KXR A;  2ZYC A;  4L41 A;  1CJ6 A;  4PJ2 C;  1FLU A;  5D5F A;  5LA5 A;  1QDR A;  4CJ2 A;  1BWJ A;  1VFB C;  3A96 A;  1KIR C;  5KXP A;  3ZVQ A;  1XFP L;  2DQI Y;  3D9A C;  4NGO A;  4EMN A;  208L A;  3HFM Y;  4KT3 A;  1LZS A;  3WW5 A;  1YAN A;  1QQY A;  1D0M A;  4OWH A;  4WM1 A;  5FHW A;  1V7T A;  1YAM A;  1GFR A;  1GBO A;  2Z37 A;  1MLC E;  4LT1 A;  1C10 A;  4YEM A;  5I54 A;  132L A;  1A4V A;  1HFY A;  5I4X A;  3P4Z A;  3BKV A;  4J1A A;  1IWX A;  2HU3 A;  3AJN A;  2EKS C;  1WQQ A;  1I56 A;  1QTK A;  1GB8 A;  2H9J A;  3TMU A;  4NEB A;  1OQM A;  1G7M C;  6LYT A;  207L A;  1CKC A;  2D4I A;  3A3Q A;  5FST A;  3CT1 A;  2BAA A;  4HV1 A;  1QUT A;  1N4F A;  5HNC A;  1YKZ X;  3W3E A;  1JJ1 A;  1OUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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