3W6FA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471 (e162q) in complex with disaccharide
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
150
structure length
150
Chain Sequence
VTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVQPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
source organism Ralstonia
total genus 61
structure length 150
sequence length 150
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6fA00
1RCMA 1GFAA 1JTOL 4HJZA 5B07A 1VFBC 1BGIA 4PPOA 3WXTA 3IWRA 3LZ2A 4GN4A 1G7MC 1DQJC 4WG7A 1I56A 4G49A 1BB4A 1FKVA 1H87A 4N1CC 2BQIA 4H9CA 5LYZA 3CB7A 1GB5A 1QDTA 3E3DA 1INUA 4RLMA 5LA5A 4FJRA 1IWTA 5C6JA 1IOCA 3A92A 1VEDA 1UIGA 5I4WA 1REZA 1YANA 4Z41A 3LN2A 4WM1A 4YEOA 1NBYC 1OUFA 3WU7A 1GFVA 2BQKA 2BQBA 1JISA 4NHQA 4TX7A 1CJ7A 1FBIX 3A6CY 2H5ZA 1YKXX 4BS7A 3TMUA 3A6BY 3RNXA 1HHLA 1BVKC 1P2CC 2Z18A 1WQMA 1XEKA 3N9AA 4OWBA 4J1AA 4ANRA 5A3EA 1FLUA 4HJYA 5FELA 4BAFA 4DWXA 5A3ZA 4H8XA 2ZIKA 3QE8A 5DN4A 1OUCA 4LZTA 4EMNA 4BAPA 1FDLY 3OK0A 4GCDA 1YKZX 5M1YA 3WUAA 1LSZA 134LA 1I20A 1XGTC 1IR7A 2DQAA 1JSFA 2I26L 4YEMA 2EIZC 4PHIA 1WQPA 4E3UA 4WO9A 1IOQA 5LYTA 1LKSA 3HBDA 5KY1A 2DQDY 4LYOA 3P68A 4LYZA 4NG8A 3TMWA 3ZVQA 2LHMA 5IELA 1GB3A 1G7IC 1J1OY 1B7PA 1FN5A 2ZWBA 4LFPA 3AGGG 1DI5A 4N5RA 5LVIA 1ZV5L 1UUZC 1YAOA 2HU1A 4GCFA 4TSCA 4OW1A 2BPUA 1E8LA 1B7QA 2W1MA 4NWHA 1ALCA 3FI7A 1KIRC 1GFKA 2IHLA 2Q0MX 4HPEA 1UIEA 1YAQA 1GF6A 3MGWA 4WM6A 2YBIA 3WVXA 4ET8A 1JHLA 1RJCB 2ZYPA 4HTQA 3WUMA 1GDXA 1GF4A 1DZBX 4NSJA 2CJLA 4AGAA 5B1FA 1B5YA 1HMLA 1V7SA 1TBYA 4XN6A 5D5FA 1IP1A 4J0LA 5K7OA 1GFGA 5LIOA 1GBXA 2HEBA 4H94A 1LSFA 2FBBA 4H8YA 1LYOA 5KKJA 4QY9A 2BQJA 1LMPA 3P4ZA 4ETDA 5IDDA 1YAMA 3N9EA 3W6AA 153LA 2Z2EA 1W08A 1IP2A 1VDPA 1B7LA 5LINA 3P64A 4DD1A 1BWHA 4DT3A 5D5CA 4GN5C 1JITA 2YBNA 1GHLA 4PRUA 4DD7A 1B0DA 1LSMA 3QY4A 4XYYA 1B2KA 1LSPA 1LHIA 1LSBA 4GN3A 5HMJA 4NGZA 2W1LA 1AZFA 5KXSA 1LJFA 3HBEX 1LKRA 5B59A 2ZYCA 4DD0A 2C8OA 4OOOA 4AXTA 5II3A 1GF8A 2A7FA 3TXDA 1CNSA 5KXLA 1GBOA 4QDNA 5I54A 3TXKA 3EO5A 1CJ8A 1JTPL 1LHLA 1LSGA 1FKQA 1TEWA 3A3RX 4W94A 4WM5A 3D3DA 4UWVA 4DD9A 1HEQA 4I0CA 1B5WA 2YBJA 1LMNA 1VDTA 2BQHA 1JKBA 1EL1A 4TWSA 5FEKA 3WW5A 1LZYA 5KXXA 1ZVHL 2XTHA 3VWOA 1PS5A 1LZGA 4KPMA 3CQLA 2BQDA 5APFA 5E9RA 5KXYA 4B0DA 1XGRC 5LXWA 1D0MA 4WMGA 4M6DA 3TXJA 5B06A 1Z55A 1RE2A 1YL0X 1GE0A 2LYMA 2Z39A 1LHHA 1GE2A 1HC0A 3HFMY 135LA 1WQNA 1IWXA 3A8ZA 4MCKA 2F2NA 3WPLA 7LYZA 4D9ZA 5DM9A 3W6EA 1AM7A 2MEFA 3A93A 3F6ZA 3AZ6A 4OWEA 5F9UA 4YOPA 1IC4Y 4NGOA 1C10A 3KAMA 3TXHA 5KXTA 1LHJA 1GAYA 4WLDA 4WM4A 1YKYX 5T3FA 3WU9A 4DC4A 1IY4A 2ZILA 1DPWA 4NGKA 1QUTA 4H92A 3ULRA 5LAFA 2BQLA 1MLCE 3W6BA 1PZYA 2MECA 1DKKA 2EQLA 4G4BA 5FHWA 4HTNA 1B7OA 1BB3A 1T6VL 1UIAA 1F6RA 1CKCA 4WLYA 1XGPC 2HEDA 4KT3A 1GFEA 4DDAA 3QNGA 2Z2FA 4PJ2C 3D9AC 2DKVA 1OUBA 1VAUA 3WL2A 4WOAA 4H1PA 1LMTA 5LVKA 1LJJA 2LZ2A 1AT5A 2HU3A 4LT1A 1GBYA 2H9KA 1XEJA 2CGIA 1IP6A 3TXEA 4O34A 1I1ZA 1LZSA 3P65A 3TXFA 3B0IA 4OWCA 1GB2A 2ZNWY 3IJVA 5I4YA 3BKVA 1HENA 5L9JA 1XGUC 3TXIA 1FLQA 4WL6A 4XADA 5KXWA 2BQAA 2I6ZA 3B0KA 3A91A 194LA 4B49A 1YL1X 4CJ2A 1GF0A 1IP5A 1F6SA 3EXDA 4HP0A 2DBTA 4WL7A 4NHTA 1OP9B 5IHGA 2G4NA 2GV0A 4RLNA 4UWNA 2EKSC 4H91A 1REYA 4HV2A 2YBHA 1HEOA 1LZ5A 1D6QA 2PC2A 4C3WA 4PRQA 1CKGA 2A7DA 3P66A 1GFJA 2DQFC 4YM8A 1HELA 2DQGY 1GFRA 1LSDA 1LYZA 1XSFA 2Z19A 2Y8PA 2Z12A 4GCCA 1DI4A 1GFUA 4GLAA 4H90A 1RI8B 2VB1A 1F10A 4H9FA 1LMOA 4GCEA 1HNLA 4XJDA 5KXMA 1D0KA 2G4QA 4NGIA 1GB8A 1FLYA 4GCBA 4NGWA 4TTDA 4CFPA 1HEPA 1GAZA 1HSXA 1SQ2L 4NSGA 1B7MA 1B7RA 1B5VA 4NHSA 4WLTA 5F9XA 4QGZA 1ZVYB 5FDJA 5LYMA 1LAAA 1HF4A 1OUGA 1WQQA 1HFXA 1A2YC 3LYOA 1N4FA 1LYSA 1GFTA 1HFZA 1CKFA 1D9UA 1NBZC 2W1YA 5F81A 4B4EA 3T36A 3HBHA 2XBSA 1GEVA 4CFOA 1C7PA 1C46A 3RT5X 3WYHA 4DDBA 5KXRA 1G7HC 4DD2A 3LYMA 3AJNA 4WM3A 8LYZA 2IFFY 4RW1A 3AGHA 5AMYA 3WH1A 1FLWA 5HLLA 1LJ3A 1C43A 4ZFPA 4G4CA 1RFPA 2DQIY 1GB7A 4HTKA 4XJHA 207LA 2BQNA 2BQCA 1OQMA 3CSZA 1B5ZA 1GE3A 1HFYA 4GLVA 1LZ1A 2NWDX 3CT0A 3TXGA 1C45A 1C08C 1JKCA 2MEBA 3RZ4A 2RSCA 4J1BA 4ZEEA 2DQJY 3A94A 1MELL 5LA8A 4CGEA 2MEGA 1LYYA 3G3BB 2XJWA 3AB6A 3B6LA 3ZVQB 9LYZA 4UWUA 1UACY 2F30A 2Z38A 2FYCA 2BQGA 1UCOA 4NG1A 5J7CA 4LYTA 5ILCA 1JEFA 1GB9A 1YILA 3K3TA 3LHMA 4TSBA 4WO6A 1B5UA 1JKDA 4QEQA 3WMKA 3GXRA 3AYQA 1LJKA 1UBZA 1VDQA 3B72A 2D6BA 3B0OA 4KL7A 1LZBA 3M18B 2YBMA 5KXPA 1DXJA 3J4GA 4ZIXA 4NIJA 1A4VA 2F4AA 1LSAA 4LGKA 1NQIA 1LJIA 1LOZA 1YIKA 5KKIA 1B9OA 1QTKA 1XFPL 5F14A 2HTXA 2AUBA 4R0FA 1IY3A 4NHIA 1XGQC 2BQMA 1LZCA 1LSNA 1VATA 1LZDA 5HNCA 1G7JC 1EQEA 5LVJA 1CJ9A 2BQFA 1DPXA 1QSAA 1SLYA 1LJGA 3J6KA 5APCA 4G4HA 1IP7A 1XEIA 1ZMYL 2Z37A 1IWVA 1GB6A 1GPQC 3ATNA 3G3AB 4H9IA 2YBLA 1LZNA 1BB5A 1OUJA 1QDRA 1JTTL 1OUAA 5ILFA 3W6CA 4WG1A 4WLXA 4NWEA 1GE1A 1W6ZA 3M3UA 5KXZA 4HJVA 1TCYA 5LAGA 4L41A 1EQ5A 3RW8A 1KXWA 1IWZA 1IOSA 4YF2A 3GXKA 1IP4A 1IEEA 2ZNXY 4MSTA 3OJPA 2BLXA 2W1XA 5I5QA 2D4KA 2F4GA 3WPKA 6LYZA 1DKJA 2WARA 4MR1A 3W6FA 2D4JA 4ETEA 1OUHA 1LCNA 4NY5A 5FCPA 2N5ZA 1IX0A 4HV1A 4NFVA 1J1PY 1WQOA 3AGIA 4XJBA 1HSWA 1GF3A 1J1XY 1REXA 1WVVA 2LYZA 3WPJA 4H9HA 1LZRA 4DYGA 2H9JA 1OUDA 1JPOA 1LJNA 4N0JA 5I53A 2HEAA 1KIQC 5KJ9A 1WQRA 4C5FA 1YROA 3SP3A 5L3IA 4II8A 4LYCA 1LSEA 4ET9A 4ETCA 2YSSC 5E4PA 154LA 1QQYA 1B5XA 2LYOA 1BHZA 1GE4A 5L3HA 1LZ6A 1CKDA 1IC7Y 1NMMA 1HEMA 2ZQ3A 4N8ZA 4RDSA 3AZ4A 1O23A 4EOFA 3BKHA 4B4IA 1WTNA 4CHXA 1GBZA 1G7LC 4XJGA 1IORA 1QUSA 3FE0A 1F0WA 1HERA 4KXIA 4NHPA 3WU8A 2MEIA 3WW6A 1JJ1A 1IOTA 1KXXA 4P2EA 4NGYA 4LYMA 1LSYA 4DD3A 1H6MA 2MEEA 1UIDA 3EBAB 4LT0A 1NDMC 1IIZA 2EPEA 4LT2A 1JSEA 4NGJA 3W3EA 4ETBA 1LJ4A 2HECA 1LHMA 4Z46A 4Z98A 1JKAA 5DL9A 3AW6A 5C6LA 4B1AA 1LMQA 193LA 1CKHA 1LTMA 4NGLA 3LYZA 1JWRA 2B5ZA 1WVUA 5DN5A 4WM2A 1BWIA 4IATA 4FDYA 1IVMA 3CSRA 3A3QA 2MEAA 4OWHA 1UIBA 2YDGA 1NKHA 5APDA 1TDYA 1UC0A 3CT1A 5HQ1A 2LZTA 3WVYA 3RU5A 2C8PA 1GD6A 4IASA 1JJ3A 4LFXA 1JUGA 1VDSA 4HPIA 3ZEKA 4YENA 2D91A 4XENA 5I4XA 132LA 1LZAA 5KXOA 1AKIA 1UIHA 1GF5A 1KIPC 2I25L 1LMAA 1NWGA 5JENB 1NHEA 5HMVA 4H8ZA 4H9AA 2XBRA 2FYDA 4U3XB 1B7NA 1WTMA 4BADA 2MEDA 3TMXA 4B4JA 1V7TA 4LT3A 2BQOA 5B05A 1BB7A 3TXBA 4OWAA 1IO5A 1LHKA 1QTEA 1LJHA 1BB6A 1IWYA 2G4PA 3A95A 4N1EI 2ZIJA 1GF7A 1HEWA 4W96A 4X3BA 1IC5Y 3EMSA 5KXNA 4IJ4A 1GWDA 1AT6A 1IWWA 1UICA 3A67Y 5EBHA 4M4OA 3WXUA 1UA6Y 1BWJA 2BLYA 2DQCY 4I8SA 133LA 3WUNA 4G9SA 3LYTA 3WULA 3T6UA 1EQ4A 1LJEA 4A7DA 2HEFA 4ML7A 5C6IA 1NDGC 1BQLY 1OUEA 1GXV2 3AZ7A 1LZ8A 2ZQ4A 3TMVA 1YAPA 1HMKA 4XJIA 1CJ6A 4H9EA 1LZ9A 1LZEA 1IP3A 1IWUA 1JIYA 3W6DA 1GDWA 1LPIA 1LZ4A 1IR9A 1GBWA 5LVHA 1LSCA 1B7SA 4NEBA 5LVGA 4H9BA 1OUIA 3IJUA 3LZTA 1BVXA 4OOTA 4TUNA 4XJFA 4ETAA 2X0AA 1IR8A 2CWIA 1D0LA 4N9RA 1YQVY 3AW7A 1DI3A 5HNLA 5DLAA 5F16A 5FSTA 2FBDA 3AZ5A 1JJ0A 1REMA 2HEEA 2DQEY 3CT5A 4RW2A 4R6CA 4PGJB 2MEHA 1TAYA 1KXYA 4Z3MA 208LA 1GEZA 1LZTA 3CSQA 1GF9A 1T3PA 1D6PA 1NF5A 4HSFA 4J7VA 2CDSA 6LYTA 4DDCA 2HUBA 3A90A 1GFHA 1GBSA 1GXXA 2BAAA 5B1GA 1QSWA 5APEA 1QIOA 3A96A 1GB0A 2D4IA 2BQEA 2DQHY 3A34A 3ATOA 1LMCA 2YVBA 1UIFA 4NGVA 4NSIA 5KXKA 3N9CA 4NSHA 4H93A 4LYBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GFAA 246LA 1VFBC 2OU8A 3WXTA 1T8GA 1G7MC 4H9CA 1C6HA 3E3DA 1IOCA 3A92A 5I4WA 1REZA 1YANA 1L67A 4WM1A 1GFVA 3A6CY 1YKXX 3RNXA 1P2CC 2OTZX 1XEKA 5FELA 151LA 4DWXA 1T8AA 1L05A 5LZMA 1OUCA 4EMNA 4GCDA 1D3NA 1QUHA 1JSFA 1L17A 2RAYX 1LKSA 4LYOA 237LA 4W55A 1FN5A 3AGGG 1DI5A 5LVIA 139LA 1ZV5L 1YAOA 4GCFA 3HTGA 2RBOA 4NWHA 4I7SA 7LZMA 2IHLA 2Q0MX 1UIEA 1SWZA 1GF6A 2YBIA 170LA 3F8VA 4NSJA 1L40A 1KS3A 224LA 217LA 4J0LA 1L20A 2HEBA 4H94A 5LIOA 218LA 5LINA 1VDPA 4DD1A 1BWHA 183LA 1P6YA 1C6EA 1B2KA 1CV4A 5HMJA 2W1LA 5B59A 227LA 2ZYCA 1LLHA 2C8OA 4I7OA 1L49A 5I54A 1L62A 1LSGA 1TEWA 3D3DA 4UWVA 4DD9A 1HEQA 4I0CA 4EKRA 1LMNA 1L35A 5FEKA 1L13A 1LYIA 1G0KA 3VWOA 1PS5A 3RZEA 1LZGA 5APFA 1L74A 5LXWA 4WMGA 4M6DA 3TXJA 4GRVA 1LHHA 1GE2A 1IWXA 4MCKA 7LYZA 1DYCA 2LZMA 1L25A 1L65A 1GAYA 4WM4A 1YKYX 5T3FA 4DC4A 3DN3A 1DPWA 4NGKA 4H92A 1PZYA 2MECA 1DKKA 107LA 1BB3A 2HEDA 3PDSA 4DDAA 3WL2A 4H1PA 215LA 198LA 4GBRB 185LA 1XEJA 1L94A 1IP6A 4O34A 1CU2A 5I4YA 1HENA 4WL6A 1NHBA 2B6YA 2I6ZA 3A91A 1YL1X 2RB0X 5KXLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RCM A;  1GFA A;  1JTO L;  4HJZ A;  5B07 A;  1VFB C;  1BGI A;  4PPO A;  3WXT A;  3IWR A;  3LZ2 A;  4GN4 A;  1G7M C;  1DQJ C;  4WG7 A;  1I56 A;  4G49 A;  1BB4 A;  1FKV A;  1H87 A;  4N1C C;  2BQI A;  4H9C A;  5LYZ A;  3CB7 A;  1GB5 A;  1QDT A;  3E3D A;  1INU A;  4RLM A;  5LA5 A;  4FJR A;  1IWT A;  5C6J A;  1IOC A;  3A92 A;  1VED A;  1UIG A;  5I4W A;  1REZ A;  1YAN A;  4Z41 A;  3LN2 A;  4WM1 A;  4YEO A;  1NBY C;  1OUF A;  3WU7 A;  1GFV A;  2BQK A;  2BQB A;  1JIS A;  4NHQ A;  4TX7 A;  1CJ7 A;  1FBI X;  3A6C Y;  2H5Z A;  1YKX X;  4BS7 A;  3TMU A;  3A6B Y;  3RNX A;  1HHL A;  1BVK C;  1P2C C;  2Z18 A;  1WQM A;  1XEK A;  3N9A A;  4OWB A;  4J1A A;  4ANR A;  5A3E A;  1FLU A;  4HJY A;  5FEL A;  4BAF A;  4DWX A;  5A3Z A;  4H8X A;  2ZIK A;  3QE8 A;  5DN4 A;  1OUC A;  4LZT A;  4EMN A;  4BAP A;  1FDL Y;  3OK0 A;  4GCD A;  1YKZ X;  5M1Y A;  3WUA A;  1LSZ A;  134L A;  1I20 A;  1XGT C;  1IR7 A;  2DQA A;  1JSF A;  2I26 L;  4YEM A;  2EIZ C;  4PHI A;  1WQP A;  4E3U A;  4WO9 A;  1IOQ A;  5LYT A;  1LKS A;  3HBD A; 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 4OWA A;  1IO5 A;  1LHK A;  1QTE A;  1LJH A;  1BB6 A;  1IWY A;  2G4P A;  3A95 A;  4N1E I;  2ZIJ A;  1GF7 A;  1HEW A;  4W96 A;  4X3B A;  1IC5 Y;  3EMS A;  5KXN A;  4IJ4 A;  1GWD A;  1AT6 A;  1IWW A;  1UIC A;  3A67 Y;  5EBH A;  4M4O A;  3WXU A;  1UA6 Y;  1BWJ A;  2BLY A;  2DQC Y;  4I8S A;  133L A;  3WUN A;  4G9S A;  3LYT A;  3WUL A;  3T6U A;  1EQ4 A;  1LJE A;  4A7D A;  2HEF A;  4ML7 A;  5C6I A;  1NDG C;  1BQL Y;  1OUE A;  1GXV 2;  3AZ7 A;  1LZ8 A;  2ZQ4 A;  3TMV A;  1YAP A;  1HMK A;  4XJI A;  1CJ6 A;  4H9E A;  1LZ9 A;  1LZE A;  1IP3 A;  1IWU A;  1JIY A;  3W6D A;  1GDW A;  1LPI A;  1LZ4 A;  1IR9 A;  1GBW A;  5LVH A;  1LSC A;  1B7S A;  4NEB A;  5LVG A;  4H9B A;  1OUI A;  3IJU A;  3LZT A;  1BVX A;  4OOT A;  4TUN A;  4XJF A;  4ETA A;  2X0A A;  1IR8 A;  2CWI A;  1D0L A;  4N9R A;  1YQV Y;  3AW7 A;  1DI3 A;  5HNL A;  5DLA A;  5F16 A;  5FST A;  2FBD A;  3AZ5 A;  1JJ0 A;  1REM A;  2HEE A;  2DQE Y;  3CT5 A;  4RW2 A;  4R6C A;  4PGJ B;  2MEH A;  1TAY A;  1KXY A;  4Z3M A;  208L A;  1GEZ A;  1LZT A;  3CSQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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