4DQ5A

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (wt)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
173
structure length
164
Chain Sequence
LQALSRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYPKQSEAAVAAVAAARNQHVKESWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5wt
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 59
structure length 164
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dq5A00
4DQJA 4DQ7A 4DQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L75A 4N0JA 1GD6A 2Q9DA 3CDQA 1GE3A 1AT5A 2G4PA 3AJNA 1LZAA 4G9SA 4UWVA 2BQMA 2C8PA 3P4ZA 1LJGA 3WYHA 4WG7A 1L69A 3HDEA 1C6BA 1JTOL 4ARQB 3GUPA 2F32A 3DN6A 1LJEA 236LA 120LA 1OQMA 4I7NA 2RBRA 1LJJA 1L94A 1LZCA 3HH3A 1L81A 3C82A 2Z38A 1L40A 3AZ5A 1LI2A 2MEHA 4NGVA 4I7RA 1C6CA 1Z55A 1WVUA 2ZQ3A 5LVKA 4DC4A 1YAOA 1G0GA 1L00A 2HEEA 3ATOA 3SBAA 4I7SA 4UWNA 1HFZA 5KXKA 131LA 2AUBA 1GE0A 1L49A 1L05A 5HMJA 1C6GA 1L62A 4OWAA 1L99A 4DD1A 3EMSA 3GUJA 2BQCA 1IY4A 1C6LA 1WTHA 1CV6A 5B1FA 2DQCY 2LZ2A 1TLAA 1WQMA 4HV1A 1UACY 1C6AA 2RB0X 235LA 5HMVA 2LHMA 4M4OA 4NGJA 2CJLA 3OE6A 4XJHA 5LINA 1L58A 1QT6A 3OE0A 3HUQA 1L36A 2B7XA 4QGZA 1L37A 2ZYPA 4I7LA 208LA 3C7WA 4W96A 1T8FA 1J1XY 1C6QA 147LA 5KXWA 1B7MA 1JJ1A 3TXFA 2OU8A 3FI5A 2RAYX 4GCFA 4DJHA 1QUTA 1J1PY 1QTEA 1CV3A 1LZDA 4NGLA 4M6DA 4MR1A 224LA 1L43A 1LJFA 4ARMA 1QUGA 4Z46A 1JKAA 1V7TA 1KIRC 1OYUA 1HEOA 3F6ZA 246LA 1IOCA 2F2QA 4IATA 1IO5A 1C64A 3GUMA 233LA 5FELA 1D9UA 1JTTL 1C6KA 4YF2A 1GBYA 4ML7A 4H90A 1YANA 4H93A 2F30A 1LYHA 4LYTA 5L3IA 1CKGA 1D9WA 2HEBA 2XJWA 3W6EA 1C67A 4DQ5A 1LSYA 1QS9A 109LA 2CUUA 1L23A 1L73A 1GF9A 3SB8A 1BVKC 5APDA 2MECA 4I7MA 138LA 1OUAA 4XYYA 1UCOA 2YDGA 9LYZA 3A8ZA 1LWKA 1GFEA 1GFTA 112LA 2D4JA 2FYDA 1XEIA 1XGQC 4E97A 2OTYX 4NIJA 3E3DA 1GFGA 229LA 2D4KA 1H6MA 4J1AA 1B5UA 2RB1X 1L02A 2H9KA 1QQYA 3RU5A 4LDEA 2HUMA 3TXHA 1REMA 3GUIA 2BQAA 1LSEA 1FDLY 177LA 4GN5C 134LA 1G06A 4LYCA 3B6LA 1DXJA 5LXWA 107LA 4YOPA 205LA 3SBBC 1L46A 1B7QA 1SWYA 1P5CA 1L90A 1HEPA 1CKFA 4MSTA 1DI4A 1JIYA 4HJYA 4H8YA 1TBYA 3TXBA 1CUPA 1D6PA 1T6HA 4RLMA 4XJBA 1GBOA 1VEDA 2Z39A 3RUNA 5LYZA 1DZBX 162LA 130LA 2XBRA 3WXUA 4QDNA 3HH6A 2OTZX 1L57A 3ODUA 1QTDA 1D3MA 4ZEEA 3WW5A 3TXDA 1IP1A 3K3TA 4NGKA 5KXOA 1QT3A 1P64A 1C6JA 1OUHA 1L39A 4HSFA 1LJKA 1IWUA 1XGPC 238LA 193LA 141LA 2O4WA 4I7PA 1LHMA 2HUKA 2RH1A 3AYQA 4NWHA 4NHIA 216LA 3HDFA 1P36A 4LT0A 3P64A 4EKRA 1TEWA 1JTNA 1VDQA 1ZMYL 1GXXA 3V2WA 2OU0X 1L82A 4S0WA 1CV1A 1QUDA 2HU3A 125LA 1IC5Y 1PQMA 4GBRB 4YENA 4NGZA 3A90A 5B59A 4IAPA 1JISA 2OE9X 4W58A 5F81A 2VB1A 4PRUA 1OUIA 4N1EI 251LA 3G3AB 1IC7Y 3W6BA 1CJ9A 4ARLA 1DPXA 4ETEA 4GCEA 1AKIA 1B9OA 4ARJA 247LA 102LA 2Z2FA 1B5VA 1JKDA 4G4HA 4NHQA 3WU8A 1BB3A 2LYOA 4GN3A 3A95A 3D3DA 1WQOA 4H8ZA 2MEIA 104LA 1L55A 5ILFA 2F47A 230LA 1HSWA 1LMNA 1B5XA 2B6YA 1C6MA 2Z19A 6LYZA 1UIHA 1B7OA 3CDOA 2ANVA 5I54A 1BB6A 1EQ5A 129LA 1YAQA 1QT7A 3WUAA 3HUAA 185LA 1MLCE 1GFRA 1LZ8A 3A6BY 4IJ4A 5KXZA 3J6KA 1SWZA 1JQUA 4EMNA 4DT3A 1KNIA 1G0KA 3QAKA 4PHIA 5EBHA 4A7DA 1RJCB 4RDSA 4BADA 1C68A 1CU6A 196LA 1G7LC 1IOTA 1GBZA 3B0OA 1LYIA 249LA 4WLDA 1C6PA 1WQRA 174LA 3A94A 195LA 1GFJA 1JTMA 1LPIA 4DD9A 1PQDA 2I26L 1REZA 1CJ7A 3CDRA 4J1BA 1LKRA 1GBXA 2RBNA 5HNLA 5FEKA 4DD3A 1I56A 3D4SA 4W52A 3HU9A 1L89A 1L18A 1C6FA 1LSZA 5A3ZA 198LA 4LFXA 4YXCA 164LA 1HMLA 1C08C 5LVHA 1HF4A 1IWYA 3A34A 1GXV2 1WTNA 2MEAA 5LA5A 4HJVA 1UC0A 1L97A 168LA 1G0LA 4LT3A 5LYMA 1JPOA 1L83A 3N9EA 1HEWA 1VDPA 3WMKA 2CWIA 1LI6A 1LSGA 2PC2A 4RW2A 4WL7A 4GCCA 260LA 3AB6A 4TSBA 1P37A 2HULA 1GF7A 1LGUA 3QNGA 1TCYA 186LA 4RLNA 5APCA 1LSFA 171LA 1D0LA 4J0LA 1HNLA 1RFPA 4YX7C 4G4BA 1KY0A 2ZYCA 1YAPA 3FADA 1QTHA 1C10A 5DN5A 1L79A 2BAAA 4W53A 3CT1A 4Z41A 1OVKA 1L29A 3OJPA 2BQKA 3W3EA 3HTDA 3LZ2A 1IP7A 3HT9A 1B7SA 1I20A 1QTZA 1C6TA 259LA 1JJ0A 145LA 1L50A 1DYDA 3GUNA 2DQEY 1LZTA 1LZBA 2O79A 2RBSA 4ETDA 1LZ6A 5FHWA 2I25L 2ZQ4A 1GB9A 1L86A 1LJNA 4ARQA 1B6IA 4TWSA 5HNCA 3BKHA 4WM5A 215LA 4WM2A 1QUSA 3RW8A 1IR7A 1IP6A 3AZ4A 3G3WA 4U3XB 5HLLA 5C6IA 1XGUC 1QSQA 3GULA 1JSEA 1L25A 3P68A 4LT1A 3HBEX 1HMKA 1GF5A 4DKLA 3C81A 1IR9A 4CGEA 1EQ4A 4OOOA 4TX7A 1C63A 1L33A 1L31A 1D3FA 3WVXA 2BQNA 1QUHA 4W57A 3RT5X 3TMXA 1LSCA 1F6SA 1HENA 1LMTA 4WO6A 1G7HC 4PPOA 3W6AA 3WULA 2D91A 5B06A 1IWXA 3WL2A 2YBLA 4DDBA 1L24A 5L9JA 2YBNA 1BB5A 3MGWA 1L13A 1EQEA 1GB0A 1ZURA 4XN6A 1RCMA 1T8AA 1L74A 1QSAA 4HV2A 108LA 1G1VA 2W1YA 1B7PA 5LVGA 3GUKA 3HT8A 182LA 1LSPA 2Q9EA 4E3UA 1JJ3A 1L51A 209LA 3GXKA 5T3FA 2XTHA 1AT6A 5KJ9A 3SB9A 2DQHY 4H9BA 2LZMA 1LLHA 2BQGA 1L84A 1C6IA 3CT0A 1C6DA 3EO5A 219LA 3WU9A 3JR6A 4YM8A 3C83A 1WQQA 6LZMA 4WOAA 4ETAA 1QDRA 137LA 167LA 1L66A 3NY9A 1OUFA 1C45A 2YBJA 5F16A 4LT2A 4GN4A 1L71A 1NKHA 5LZMA 2BPUA 5B1GA 2C8OA 1SX2A 1L08A 1JTPL 1KW7A 1XGRC 2ZILA 4Z3MA 3OE9A 1FLYA 2A7FA 2B73A 1DI5A 1L52A 1VDTA 1LYOA 3RZEA 2ZIKA 4AXTA 1C66A 4HTQA 4AGAA 217LA 1LCNA 3DN3A 3B72A 4RW1A 4EPIA 1L44A 2QB0B 4ET9A 5KXLA 4OO9A 261LA 225LA 4OOTA 5K7OA 3TXJA 1I1ZA 1L42A 4B4EA 1NF5A 242LA 155LA 1C69A 4ARMB 133LA 2F2NA 2W1MA 1F6RA 1JKCA 4HJZA 1LMAA 1B7NA 2A7DA 1P2LA 1LYFA 218LA 4TSCA 4NG1A 4NY5A 2MEBA 1LHHA 231LA 4HPIA 169LA 4XJIA 1P3NA 227LA 4LZTA 2DQFC 4UWUA 1NMMA 122LA 1LZSA 3IWRA 207LA 5HQ1A 3ZVQB 1QTBA 4YXAC 1GE4A 1LI3A 245LA 5C6JA 3N9AA 1DPWA 1CJ8A 5AMYA 1CX6A 3C8QA 3CB7A 1GF8A 2BQHA 2ZNXY 4OWEA 3A67Y 1GF4A 5FCPA 1L16A 3CSRA 5LVIA 4HTKA 1L95A 165LA 175LA 254LA 1BB7A 2ZNWY 4Z98A 7LZMA 2H9JA 1UUZC 4NSGA 5LIOA 4PGJB 1QS5A 3NYAA 2LZTA 2BLXA 4EPFA 1IIZA 157LA 1GF0A 5LA8A 3AW6A 1UBZA 2B6WA 1OWZA 1C61A 5E4PA 1LYSA 4IASA 4QEQA 3HWLA 3AGGG 139LA 2HU1A 132LA 4DQ7A 1L12A 1LYZA 1OUCA 1GAYA 2MEGA 248LA 1GE2A 148LE 2NWDX 4H9AA 2OE4X 2OEAX 2B5ZA 1LZ9A 113LA 1FLWA 1L80A 1OUBA 1L0KA 1L60A 5F9XA 1LMQA 2EPEA 3RNXA 153LA 4WM3A 2BQBA 1GDWA 1KXXA 1JSFA 4BAFA 4HPEA 1GB8A 1L92A 210LA 103LA 3A92A 5KXPA 2NTGA 1OUEA 4KPMA 4GCDA 4NG8A 1JKBA 176LA 2D4IA 4I8SA 1AZFA 4YEOA 1UIEA 2GV0A 5I4YA 1FKVA 5LVJA 1D3NA 1L30A 3WXTA 2FYCA 1NWGA 214LA 5APEA 3HBDA 4GLVA 255LA 2EKSC 3T36A 5J7CA 4NFVA 3C80A 1L61A 3GUOA 5LYTA 3WVYA 1V7SA 4XJFA 1DYBA 5KKJA 4NSHA 1PQJA 4XJGA 4LYBA 2DBTA 3DKEX 3ZEKA 2B70A 170LA 3FA0A 2HECA 3DN0A 1UICA 4N9RA 2RB2X 1L27A 4HTNA 150LA 1YILA 1L77A 4QY9A 1NDMC 262LA 4CHXA 1IORA 2RSCA 1KXYA 4I7TA 149LA 3AZ6A 1QT5A 2WARA 1LW9A 3UONA 2N5ZA 1HERA 2BQJA 5A3EA 4W59A 191LA 5E9RA 5KXSA 5D5FA 4R0FA 1GFVA 4DQJA 2Z6BA 3OK0A 4H9HA 1UIAA 1GB3A 1CNSA 1L64A 1A2YC 1OUDA 3GXRA 4O34A 5KXXA 1LMCA 4KT3A 4CFPA 1QTKA 1YL0X 181LA 237LA 1LZ1A 1LHLA 3AGIA 4LZMA 1C62A 146LA 5JENB 1L91A 1NBYC 226LA 160LA 1LHJA 3SP3A 5DN4A 2ANXA 1L48A 1D0KA 3FE0A 2EQLA 4ETCA 178LA 5KXYA 4ANRA 1LZ5A 4B1AA 3QY4A 1OP9B 1XFPL 1GF3A 1GFUA 4DD2A 3PBLA 3P65A 161LA 1L04A 1OWYA 1L26A 1EPYA 1LTMA 1C6HA 1UA6Y 187LA 1PQKA 1LGXA 4EOFA 5IDDA 1IWWA 1HSXA 3CSQA 2A4TA 2MEEA 1L38A 5IHGA 2YBIA 4MCKA 1P46A 221LA 1C60A 199LA 1QSBA 1OUGA 3HBHA 4BAPA 4PRQA 2RBQA 4NHSA 2MEDA 5I4XA 4ZPUA 127LA 1CV5A 1QIOA 1MELL 4WO9A 2IHLA 1IC4Y 5IELA 3WUMA 4EJ4A 158LA 1LYJA 1L41A 1LHKA 1HFXA 2HUBA 1LKSA 2RAZX 1LMPA 4N1CC 5I5QA 2Z12A 1BQLY 5I53A 1IWZA 1FBIX 1DYCA 3HFMY 151LA 3CT5A 1GPQC 4N8ZA 5B07A 4H9EA 3HH4A 1GEZA 1BVXA 1NDGC 4NGIA 4N5RA 3HH5A 1T97A 142LA 4W54A 1RI8B 3EBAB 1IOSA 1HHLA 1ZV5L 3C7YA 3A93A 3WPLA 5C6LA 5F14A 4H1PA 3RZ4A 1ZVYB 1L0JA 1SX7A 1FKQA 1C43A 1GE1A 1C6NA 2BQIA 1JITA 3CQLA 4WM1A 1GFHA 5M1YA 2B6ZA 2G4QA 1GWDA 253LA 4HP0A 4ETBA 1G0PA 4NSJA 1L22A 1OVHA 3QE8A 3M18B 2XBSA 4OWBA 5I14A 1QTVA 1XEKA 4LYZA 5APFA 3A91A 1YKZX 1QT4A 1D6QA 3WPKA 1IP3A 4P2EA 1HEMA 1KW5A 2LYMA 1NHBA 126LA 1L93A 211LA 4OWCA 1L59A 1LYYA 3SN6R 3TXGA 1FN5A 1GHLA 1GB2A 1LSBA 3DN8A 2YBMA 4NWEA 1QT8A 1LSAA 1CVKA 1L07A 3G3VA 1WTMA 1G0QA 2BLYA 1L14A 4W56A 3LZMA 4D9ZA 1XGTC 1LJ4A 4C3WA 1F10A 2RBOA 5FSTA 1L96A 1UIBA 1IP5A 4CFOA 1D0MA 2D6BA 4I7QA 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