4DQJA

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (in complex with chitotetraose)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
137
structure length
137
Chain Sequence
SRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 47
structure length 137
sequence length 137
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dqjA00
4DQ5A 4DQJA 4DQ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUGA 3CSQA 1FN5A 3A94A 2NWDX 1L23A 233LA 1IR8A 4J7VA 1C6MA 3GUOA 1L19A 1IR9A 1FLUA 149LA 160LA 4GCEA 4LZMA 1CV3A 1LW9A 1CU3A 224LA 4K5YA 3M3UA 1T3PA 5B06A 4NFVA 1G1VA 1UICA 3C80A 1IY3A 4QDNA 1LMCA 148LE 1IP5A 1JTMA 131LA 1HEPA 3CDVA 4L41A 3C8RA 5HNLA 3BKVA 2YBMA 3RNXA 1HHLA 5DM9A 4EPIA 1HENA 1L94A 1OWZA 144LA 2HU1A 3IJVA 3WW5A 4NHTA 4H9EA 1CKCA 4DD7A 3GUIA 2MEIA 137LA 1GDXA 3AW7A 5C6IA 2D4KA 3DN8A 4DD0A 1DYEA 1L58A 3W6DA 1GF4A 174LA 5EBHA 5KXZA 2RB0X 1JKCA 1KY1A 1FKQA 180LA 3FI7A 1WQMA 4B4JA 1OVHA 3FE0A 4HTQA 123LA 4II8A 1LMNA 3SB6A 1DYBA 2RBNA 5HNCA 2HUBA 4NHIA 1L43A 2DQEY 1PQKA 1KS3A 4YEOA 4I7QA 5FCPA 1DYDA 1CU5A 4UWUA 1NDMC 1P5CA 189LA 5LYMA 2F2NA 1B5YA 4NGIA 1VDTA 1JKDA 4NWEA 2C8OA 4LFXA 3LN2A 2D6BA 1VDPA 1L75A 4DD3A 3W6CA 1WQRA 1CKDA 3E3DA 3F6ZA 4WM3A 242LA 1T8GA 102LA 4H9AA 4NHQA 4EMNA 4YM8A 1QTZA 2MEDA 1GFUA 1NBZC 4Z3MA 1CJ8A 1B7LA 1L12A 4LYBA 1L0KA 1H87A 1LHKA 1QSQA 5KY1A 1LZ5A 3TXJA 4I8SA 216LA 1CV5A 1UIEA 2IHLA 135LA 1IP1A 3L2XA 2BQBA 152LA 3DN1A 3SP3A 3FA0A 1IP4A 4G49A 5L3HA 4LYOA 1BWJA 1LZNA 2HULA 4MSTA 3AB6A 1LSMA 246LA 2RBSA 3C83A 1W6ZA 5HQ1A 2HEBA 5APFA 5L3IA 1IP7A 1C6NA 5FELA 1L66A 1QT7A 5F9XA 1T6HA 4H8ZA 232LA 4OOTA 4N9RA 1L80A 1RE2A 4I7KA 1XEJA 1L68A 219LA 3HH4A 3DKEX 1REXA 4ARMA 1D3MA 1EQ5A 3CT1A 4WG7A 234LA 4PK0A 1PS5A 1LZ1A 2DQFC 1GXXA 4XJGA 1RFPA 1G07A 173LA 1WVVA 4NSIA 1LTMA 2WARA 4YXCA 2IGCA 2YBLA 194LA 3K3TA 1HFYA 3HT9A 2OTZX 3NYAA 5KXRA 1I1ZA 1XEKA 3PBLA 2MEHA 1IY4A 3GXRA 1UIBA 3ATNA 1LHHA 1L22A 2YSSC 1LWGA 3IJUA 1FKVA 1GB0A 2XBSA 1L67A 3WH1A 1GB6A 5B1FA 2HEAA 1C6GA 2BQDA 1C6PA 1L92A 1WQNA 1P6YA 3MGWA 1B0DA 1HEWA 3WW6A 3HT6A 1YAPA 4W51A 1D9WA 4ZEEA 4OWHA 4GCDA 4OWAA 1LJHA 3N9EA 1GE4A 161LA 1LSCA 1LGWA 3HT8A 2ANXA 3B72A 3CT0A 1L31A 2EPEA 1G0QA 1SQ2L 1GE1A 1DKJA 155LA 1EQEA 1LGXA 1L37A 1QUDA 153LA 4NGZA 1DKKA 4IASA 3TXKA 2H9KA 5IDDA 3WUAA 4ZIXA 1LSGA 3TMUA 1NBYC 2CUUA 1IWXA 5F14A 4DD1A 1AZFA 4H93A 132LA 1QT8A 4OO9A 2DQJY 1QT4A 1LJJA 3HFMY 2EQLA 1QUOA 1KXWA 1L82A 2I25L 1LYIA 3BKHA 3CDQA 1VFBC 4WM5A 5KXXA 4H9CA 4HV1A 205LA 2ZNXY 4LYZA 2LZ2A 4N5RA 4HP0A 3A3RX 5LVKA 5LIOA 170LA 4ET8A 1UACY 230LA 2DQAA 2XQOA 4PJ2C 4GLVA 1CUPA 4LDLA 2HEDA 254LA 128LA 4UWVA 201LA 2XJWA 3V2WA 4J1BA 5E4PA 1L21A 5F81A 2LZMA 114LA 145LA 4PGJB 1C45A 3C8SA 164LA 4KL7A 1QTDA 4NEBA 3AJNA 1LGUA 1QUSA 3HTDA 4BS7A 1WVUA 9LYZA 1JWRA 1LYSA 2DKVA 218LA 1B7OA 1L02A 1LMTA 3LZMA 1GF9A 1C6LA 4EKPA 1GBSA 4DWXA 4W52A 4LT1A 1QTVA 4E97A 1C69A 4U3XB 3P64A 1LMAA 4Z46A 1AKIA 1UIDA 1G0LA 2QARC 1LZCA 4OWEA 229LA 165LA 1QTEA 4LYCA 5HMJA 4N1CC 3HTGA 5B1GA 1L53A 4GCFA 240LA 1P2CC 4KT3A 1C6CA 1GEVA 3L64A 249LA 2F47A 4QY9A 3SB5A 1QT3A 3OK0A 2B75A 150LA 1L32A 1LJEA 1OUCA 2FBBA 3WXUA 211LA 4XN6A 1P7SA 1LJ4A 1C62A 3SB9A 4DYGA 1JJ1A 4NHSA 3F9LA 1LLHA 257LA 1LYOA 1IC7Y 5DN4A 1L15A 1L88A 4XJHA 4GBRB 4W57A 1L65A 111LA 1C6FA 1TAYA 1IR7A 1I56A 3G3WA 5KXPA 1CKHA 1MLCE 1L86A 231LA 1WTMA 1L10A 4EXMA 1L34A 1MELL 4C5FA 129LA 4ANRA 1L57A 2YBIA 1GEZA 213LA 239LA 5DL9A 1DQJC 1BHZA 4H94A 2D4JA 5LAFA 1GBZA 4DDBA 1QSAA 1L60A 3LHMA 3B0OA 2B70A 3C81A 5LVJA 1B7NA 1PQDA 3WL2A 1FLYA 178LA 3LZ2A 3DNAA 4B4EA 4H9FA 5T3FA 4C3WA 1JISA 5LVHA 2CGIA 2O4WA 1JHLA 1GAYA 1L06A 1LSPA 1DXJA 1XEIA 184LA 3T36A 1IP2A 1L62A 3LYZA 1OV7A 208LA 4LT3A 4E3UA 2O7AA 2HU3A 4H9HA 1LJNA 3HUQA 1JSEA 1G0GA 1XEPA 2ZQ4A 5LZMA 1ZURA 1L84A 4S0WA 226LA 4NSJA 2DQHY 1F6RA 1PZYA 1GF5A 3SB7A 3D4SA 4NGYA 4EOFA 1IP3A 4I7RA 1OWYA 1D6PA 4P2EA 1LMPA 4HSFA 4W53A 1JITA 1UIHA 1L59A 3RU5A 1NHEA 5LA5A 5IHGA 2RBPA 4O34A 5KXSA 2MEBA 3DN4A 4ETEA 5LVGA 5E9RA 4DT3A 163LA 3EO5A 1GBOA 1HMKA 2MEEA 1CV4A 4EKSA 2N5ZA 104LA 1KY0A 2HUMA 3VWOA 1N4FA 4BAFA 1NF5A 1L85A 3VW7A 1GFVA 3ATOA 4J0LA 3HUKA 4ETAA 1LYJA 1JEFA 1KXXA 1IWWA 1D6QA 2B6WA 1L63A 255LA 4H8YA 4GLAA 5JENB 3OE9A 3F8VA 1FDLY 4H90A 1XGQC 4ARPA 1C64A 2Q9EA 1L20A 1E8LA 1UIFA 3AYQA 3WU8A 1LJGA 1LZGA 2W1XA 3SBBC 3HTBA 1D0LA 2F2QA 1PQJA 1XFPL 1XSFA 1G7LC 5APEA 1QS5A 112LA 1L11A 4WO6A 4YOPA 1HF4A 1HMLA 1UBZA 1GE3A 3A95A 1YILA 3QNGA 2EKSC 2XBRA 3EMLA 220LA 2OU0X 4ETCA 2B6YA 1L93A 5KXYA 1KIRC 1IOQA 1I20A 1KNIA 4NGWA 1A4VA 1NHBA 4XJFA 2ANVA 4I7MA 2OEAX 4A7DA 1C60A 3A6CY 1CUQA 1BGIA 1BB6A 1C6KA 1QTBA 1GF0A 5DLAA 2YVBA 4DQ5A 1AT5A 4LFPA 3HU8A 192LA 3D9AC 1GB9A 1BB4A 4WG1A 4XJIA 2RH1A 1VAUA 4MCKA 1L77A 1LSFA 4EKRA 1LSBA 3A96A 5HLLA 1C7PA 4XJDA 1LJFA 1T6VL 1QSBA 5C6LA 4WM1A 1JTOL 2YBNA 1SLYA 5D5FA 1BB5A 4ARQA 195LA 1L33A 1DPWA 1BQLY 260LA 1F6SA 1L17A 4HTNA 1G7HC 5F16A 3TMVA 4RW2A 4ET9A 4I7PA 1L04A 3B0KA 1XJTA 1L69A 4B1AA 193LA 1LAAA 2ZYCA 1LSZA 1WTHA 4RW1A 1IWYA 167LA 3DN3A 235LA 1G06A 4UWNA 4HV2A 1LZAA 4ETBA 2OE4X 1IIZA 2HEEA 3NY9A 156LA 1LKSA 1YKZX 1L47A 4R0FA 1LZYA 2D4IA 1C6JA 228LA 1LZEA 2W1MA 3W6BA 4I0CA 1B7RA 4NGOA 5DN5A 3WVYA 1GF3A 3OE8A 3A90A 1L13A 1G1WA 5ILFA 1ZVHL 1L73A 4TX7A 3CSRA 3AGIA 1L87A 5APDA 3DMVA 1DI5A 134LA 1L45A 1CV6A 4DQJA 1QTKA 3HDEA 1CKFA 1IP6A 1P2LA 1QSWA 1PQMA 3LZTA 1C61A 1F10A 1B6IA 1L50A 3C7ZA 4RLNA 4NSHA 1YQVY 1B5XA 1LZ6A 2BQKA 5FDJA 4HPIA 2H9JA 2DQIY 159LA 3B6LA 1WTNA 1XGPC 3UONA 215LA 1HC0A 4DC4A 221LA 2DBTA 1OUEA 5KXOA 2NTGA 1LYFA 1XGUC 1L95A 1XJUA 261LA 1CU2A 115LA 4TTDA 4CFOA 1TEWA 3HT7A 3J6KA 5KXNA 1ZV5L 3CDTA 223LA 5KKIA 1G0PA 1HSWA 1C6DA 1YIKA 2ZNWY 1EL1A 2RBOA 2OE9X 3G3VA 1L56A 1L52A 120LA 3HH5A 1CX6A 1B7MA 1QUHA 169LA 1LZ9A 1C65A 1L64A 3TXGA 1L0JA 2RB1X 3TXEA 5LA8A 4NHPA 3N9CA 1V7SA 1LPIA 199LA 1QTCA 3WUMA 2BQHA 1GFHA 2O79A 1GFEA 118LA 4H92A 2YBHA 1W08A 1QQYA 4WM6A 2PC2A 2BQEA 4LZTA 1YKYX 1D2YA 3B0IA 1DYFA 4LT0A 2IFFY 3C8QA 2BQFA 1OUAA 4CHXA 1LSYA 1P46A 182LA 4DDCA 200LA 3AZ5A 4PHIA 3GULA 6LYZA 5F9UA 2NTHA 1V7TA 2B6XA 2BQLA 1AM7A 1L35A 3A8ZA 1PQIA 1B5UA 1L74A 5LVIA 2Q9DA 2XTHA 1C6EA 5FEKA 5KXWA 1BWHA 5FHWA 2F32A 162LA 4NWHA 1C6BA 4N8ZA 2ZIJA 127LA 251LA 5I14A 4H91A 1GE0A 5LAGA 1KW7A 3IWRA 4YENA 1L55A 3RW8A 1LZ4A 5J7CA 2RSCA 3W6AA 207LA 4XENA 2MEFA 6LYTA 4W55A 1D3JA 4Z98A 1J1XY 2W1YA 4WMGA 5I53A 1LMQA 1IWZA 4EJ4A 1LZ8A 1IOCA 1CNSA 2ZYPA 3A67Y 1L42A 4ML7A 2B6TA 1VDSA 4HJVA 1YL1X 142LA 1LMOA 3NY8A 2G4QA 3WYHA 4PPOA 1L38A 4I7JA 4OW1A 1C6AA 4W59A 5I54A 4OOOA 1OUIA 4WLTA 187LA 1PQOA 1SX2A 1NQIA 2Q0MX 243LA 2LYZA 1P36A 3G3BB 2ZWBA 1L46A 2HTXA 1GE2A 1O23A 3PDSA 2HEFA 1LPYA 3OE0A 4ETDA 1P37A 146LA 1C6TA 4NIJA 1L79A 4IAPA 1G7MC 1L48A 3AGGG 1KIPC 1C10A 3P68A 1JTPL 4LYMA 3RT5X 141LA 238LA 253LA 1GF8A 1IEEA 2BQOA 3TXFA 2I26L 1B5ZA 2RBRA 4GCCA 1C68A 1L00A 1P64A 1C43A 3EMSA 1L49A 210LA 1C46A 1JUGA 1XGRC 2DQCY 1FLQA 212LA 4DD9A 3CSZA 4NG1A 1IORA 1OP9B 4G4CA 4TUNA 5L9JA 2A7DA 4I7SA 1IOSA 262LA 2LYOA 4ARLA 5LYTA 3D3DA 103LA 1P56A 4HPEA 2RAYX 3G3AB 2RAZX 4XADA 140LA 119LA 4QEQA 2YBJA 3DMZA 237LA 3LYOA 4BAPA 5KXKA 1L54A 4NG8A 4J1AA 7LYZA 1YAMA 5D5CA 5B07A 4M6DA 2VB1A 1L99A 1DYGA 3WMKA 3C7YA 1P2RA 2Z12A 1RJCB 1HEMA 3GUJA 3RZEA 3W6FA 177LA 1GHLA 1YL0X 3FI5A 1REMA 1D9UA 110LA 2F4GA 4G9SA 3RUNA 1IC4Y 2D91A 2L78A 1GFRA 1SWYA 1GB8A 1QUTA 1HEQA 7LZMA 1JKAA 2Z19A 4TWSA 166LA 4D9ZA 3ODUA 3FADA 3HUAA 2B74A 1LHLA 2CWIA 3P4ZA 4RDSA 1L76A 1YKXX 2BQJA 1L91A 4NGVA 4WL7A 3A6BY 1GDWA 217LA 2OE7X 2MEAA 1REYA 1C67A 4IATA 1BVKC 3A3QA 1L89A 1I6SA 1CJ7A 1L08A 2LZTA 3EXDA 4EPFA 2RBQA 3WXTA 3EBAB 4H9BA 3AZ7A 3CDRA 3SN6R 1LHIA 5I4YA 4NGJA 1JTNA 181LA 5HMVA 2F30A 1BVXA 1LI3A 5I4XA 1BB7A 1JSFA 2LYMA 1JJ3A 2B73A 214LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DQ5 A;  4DQJ A;  4DQ7 A; 
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 1OUG A;  3CSQ A;  1FN5 A;  3A94 A;  2NWD X;  1L23 A;  233L A;  1IR8 A;  4J7V A;  1C6M A;  3GUO A;  1L19 A;  1IR9 A;  1FLU A;  149L A;  160L A;  4GCE A;  4LZM A;  1CV3 A;  1LW9 A;  1CU3 A;  224L A;  4K5Y A;  3M3U A;  1T3P A;  5B06 A;  4NFV A;  1G1V A;  1UIC A;  3C80 A;  1IY3 A;  4QDN A;  1LMC A;  148L E;  1IP5 A;  1JTM A;  131L A;  1HEP A;  3CDV A;  4L41 A;  3C8R A;  5HNL A;  3BKV A;  2YBM A;  3RNX A;  1HHL A;  5DM9 A;  4EPI A;  1HEN A;  1L94 A;  1OWZ A;  144L A;  2HU1 A;  3IJV A;  3WW5 A;  4NHT A;  4H9E A;  1CKC A;  4DD7 A;  3GUI A;  2MEI A;  137L A;  1GDX A;  3AW7 A;  5C6I A;  2D4K A;  3DN8 A;  4DD0 A;  1DYE A;  1L58 A;  3W6D A;  1GF4 A;  174L A;  5EBH A;  5KXZ A;  2RB0 X;  1JKC A;  1KY1 A;  1FKQ A;  180L A;  3FI7 A;  1WQM A;  4B4J A;  1OVH A;  3FE0 A;  4HTQ A;  123L A;  4II8 A;  1LMN A;  3SB6 A;  1DYB A;  2RBN A;  5HNC A;  2HUB A;  4NHI A;  1L43 A;  2DQE Y;  1PQK A;  1KS3 A;  4YEO A;  4I7Q A;  5FCP A;  1DYD A;  1CU5 A;  4UWU A;  1NDM C;  1P5C A;  189L A;  5LYM A;  2F2N A;  1B5Y A;  4NGI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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