4ET9A

Hen egg-white lysozyme solved from 5 fs free-electron laser pulse data
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography.
pubmed doi rcsb
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4et9A00
3WL2A 4H92A 1LSGA 1XGUC 3A67Y 1NKHA 1C10A 193LA 1JKCA 1GWDA 3AGIA 4R0FA 4WLXA 2XBRA 1D6QA 2YBNA 2YDGA 4WM5A 4D9ZA 4TWSA 1YIKA 1LZEA 1WQQA 5E4PA 2MEFA 4H8YA 1LHLA 153LA 1HELA 1LMTA 1WTNA 2XBSA 3KAMA 5LXWA 1TDYA 1GEZA 1QUTA 4OWEA 4Z46A 4LYOA 1LMPA 4H9IA 3W6FA 3TXIA 2EKSC 1AKIA 1BB6A 1NHEA 1VDPA 5FSTA 5LINA 3A93A 2D4IA 4XENA 3LHMA 2EQLA 3WW6A 1G7IC 1GFJA 135LA 1QQYA 1LJKA 1NF5A 1GBXA 5F81A 3T6UA 3TXDA 2BQKA 1LZ5A 1A2YC 1REXA 1BB3A 1GE2A 1D9UA 2DQFC 4N5RA 3QNGA 5B59A 4FJRA 4OWCA 1IWXA 4PHIA 1CJ9A 1LZAA 3A95A 8LYZA 1SQ2L 4NY5A 4TSCA 3K3TA 5KXSA 3AZ7A 3QE8A 3P64A 2FBBA 4B49A 4KL7A 1HF4A 4ETDA 5I4WA 5DN4A 3N9CA 5LYMA 3TXGA 4WM3A 1BB7A 2HU3A 1HEQA 1FLQA 1J1PY 3AGHA 5KXNA 5LVIA 1GXXA 154LA 4XJFA 1IOSA 4LT1A 4WO6A 3A6BY 3WU7A 1B5WA 5DN5A 4ETAA 5KKJA 1LMOA 3HBEX 1LCNA 2LYOA 4RW2A 4ET9A 1EL1A 5L3IA 2D6BA 1LZYA 2Z38A 5KJ9A 4OOOA 3BKVA 2A7FA 4PRQA 1GF8A 1KXXA 1UA6Y 2F4AA 3AZ4A 1T3PA 4N1EI 1B5VA 3LYZA 4WMGA 4CFOA 5K7OA 4A7DA 1XEKA 4QEQA 3CSZA 2ZILA 3TXFA 2Z19A 3GXRA 4NSGA 5LVKA 1CKDA 2BQLA 4WM4A 5LYZA 1J1XY 1RFPA 2FYDA 3F6ZA 3N9EA 4QGZA 1GB5A 2HTXA 1YQVY 1NDGC 5FELA 1LHJA 3LYTA 4NHSA 1HERA 3D3DA 4H9AA 2D4JA 2CGIA 3A91A 2W1LA 2HECA 1D0LA 3A8ZA 2YBJA 2C8PA 1O23A 5E9RA 5I5QA 1BWJA 133LA 1LAAA 3IJUA 4L41A 3CQLA 3W6BA 1GFTA 1UACY 1B7PA 1UCOA 5FCPA 2LZTA 1UUZC 2HEFA 1WQOA 1I20A 4GCFA 4NSJA 4AXTA 5A3ZA 2BQEA 4AGAA 1GFRA 4XJDA 2Z18A 5LAGA 4HJYA 1WQMA 1NMMA 1OQMA 4MSTA 1BGIA 2YVBA 132LA 1LZRA 1GB8A 2IFFY 2LHMA 2Z39A 1DPXA 1B7MA 3IWRA 4MR1A 2BQJA 2Z37A 2DQEY 1XGTC 3ZVQB 2MEEA 3B6LA 1LOZA 2BQHA 6LYZA 2MEDA 3W6EA 1BWIA 1LJ3A 1G7HC 4QDNA 2BQFA 1YAOA 1C45A 1UBZA 1KXYA 3LYOA 1VDTA 1BB5A 1XEJA 4BS7A 2H5ZA 1GFHA 4IJ4A 5APCA 1H87A 1F6SA 1D6PA 2MEGA 1FLYA 4GN3A 5LA5A 2G4QA 1JPOA 1CJ6A 2DQJY 1YAMA 4RDSA 2Z2FA 3A34A 1IVMA 4ZEEA 1YANA 3OK0A 1HFXA 5APEA 5B06A 5B1GA 1VFBC 3RNXA 2ZIJA 2Y8PA 2A7DA 1ZVHL 1GXV2 1UC0A 1LHHA 5FEKA 4CFPA 1JSFA 4NGOA 1UIHA 2G4PA 1IP6A 4ANRA 4B4IA 1GFAA 5F14A 2LYMA 4KT3A 4N9RA 6LYTA 5KXOA 1N4FA 1GB0A 5I53A 4WO9A 5DLAA 1PS5A 1YILA 4WOAA 1B7LA 3N9AA 1H6MA 4ETEA 1REZA 1GF7A 1LSYA 1HEPA 4H1PA 4J1BA 2DQIY 5AMYA 4NIJA 4CHXA 1LJNA 1MLCE 1LSDA 1WQRA 4I8SA 5FDJA 2F2NA 3IJVA 5I4XA 3WULA 2ZNWY 5C6JA 2CJLA 4TTDA 3RU5A 5F9UA 4NFVA 1C08C 1DKJA 1JHLA 1LSPA 4UWVA 1BHZA 2HUBA 4UWNA 1E8LA 4NGWA 4ML7A 4XADA 4H93A 2FBDA 5KXYA 5KXKA 3QY4A 3A92A 3LN2A 4WM6A 1LZNA 4GN4A 4WM2A 4KPMA 2DQAA 3TMWA 4HPEA 4NGIA 4NGLA 4H9HA 5HNCA 4DWXA 4OW1A 1VDSA 3EO5A 1HENA 4IATA 5L9JA 1DI4A 1JKDA 3A3RX 5HMVA 1IOQA 1GBYA 4R6CA 1LHKA 4DYGA 5F9XA 1YROA 1GD6A 1IWTA 3AGGG 1LPIA 1IWZA 3OJPA 3ULRA 4B4JA 1JIYA 1FN5A 2BQAA 1JWRA 5LYTA 1AT5A 1JTOL 2XTHA 3EBAB 4RLMA 1W6ZA 1GDXA 1FLWA 3AJNA 4HTNA 4W96A 5KXTA 3FI7A 1LHIA 4CJ2A 2IHLA 1QTEA 1OUCA 207LA 1JKBA 2RSCA 1IWVA 1I56A 3TMVA 4LYTA 3SP3A 2HEEA 1B7NA 5KXXA 2Z12A 3WU8A 5II3A 1LTMA 1IEEA 2MEAA 3HFMY 4YOPA 5D5CA 1EQ5A 5T3FA 3VWOA 1B0DA 4CGEA 1UIGA 4NHPA 4OWAA 1FLUA 1LSCA 2ZIKA 2MECA 3GXKA 4GCEA 1DKKA 1BVKC 1G7JC 4YM8A 1GF4A 5APFA 4NEBA 2YBHA 4U3XB 4Z98A 1GFVA 3WVXA 1CKGA 1RCMA 4B4EA 1GF5A 1LSBA 1OUEA 1B5YA 2DQCY 1VAUA 4GCBA 4NG1A 4NGYA 1IOTA 1IY4A 1KXWA 5DL9A 5APDA 2PC2A 5C6IA 4M6DA 4HTKA 3TMUA 1BVXA 4G4HA 3WPLA 1WVVA 3B0OA 2BQMA 1GE0A 1B5XA 5A3EA 5L3HA 1CKCA 4OWHA 4NGKA 1CJ7A 4RW1A 1J1OY 4GLVA 1UIEA 2BAAA 5I4YA 4DDAA 4ETCA 1G7MC 3AZ5A 3CT1A 1UIFA 2YBLA 4LYCA 1V7SA 4LZTA 1WQNA 1IC4Y 4NHIA 3FE0A 1IWYA 5B05A 1JKAA 3A94A 1UIAA 2W1MA 3W6DA 2D4KA 4DDCA 4ET8A 1LKRA 1OUBA 3A96A 4TSBA 2CDSA 2DKVA 5IHGA 1QDRA 1GAYA 1C7PA 1LSZA 3B0IA 3BKHA 5B1FA 2HEDA 1KIPC 5C6LA 1W08A 4DT3A 4E3UA 2ZWBA 1GB7A 4HPIA 1SLYA 3CSRA 4BAFA 1OUGA 3AZ6A 5IDDA 3WW5A 1T6VL 2NWDX 1RE2A 3T36A 2I6ZA 3RZ4A 1NWGA 5HQ1A 1ZMYL 2ZYPA 3EXDA 1OUHA 3J4GA 1EQ4A 4PGJB 5JENB 3P66A 2MEIA 1LZGA 1CKFA 1BQLY 4OOTA 2BLXA 4XN6A 2AUBA 1PZYA 1HEOA 1LHMA 4LT2A 2G4NA 4LYBA 4WG1A 4H91A 5KXMA 1IIZA 1F10A 4IASA 1GF0A 4NSHA 1IP4A 4XJIA 1DXJA 1HMLA 1OUJA 3G3AB 1LYZA 3TXKA 1GF9A 4LFPA 1BWHA 2EPEA 3AB6A 3CT5A 3LYMA 1GHLA 4NWHA 4H94A 3B0KA 3M3UA 5DM9A 1P2CC 2HEAA 3ATOA 4N8ZA 1ZVYB 4HV2A 3P4ZA 1FKQA 1GBWA 1QIOA 2F30A 2LYZA 134LA 4LFXA 1IP3A 1HSWA 4TUNA 1LSMA 5B07A 2ZQ4A 4X3BA 1LZ1A 2BQDA 1NDMC 1AT6A 1LSAA 1TCYA 1CKHA 3HBDA 4LYZA 3RT5X 3TXHA 4DD9A 1AZFA 1GB6A 2EIZC 1IR8A 2C8OA 1OP9B 4G4BA 3B72A 1EQEA 3W3EA 1XGRC 1IP7A 1LJEA 4LT0A 4DD7A 5KY1A 1LZSA 1LJIA 1XFPL 4DDBA 4ETBA 2XJWA 1LJHA 3E3DA 3G3BB 2H9KA 4WL7A 2D91A 4BAPA 1GF3A 5KXWA 1GE1A 2GV0A 1B5ZA 5ILFA 1GAZA 1GFGA 4NG8A 4H9EA 4XJHA 1LJGA 1V7TA 3WXUA 2BQOA 2I25L 1LZ8A 2ZYCA 3AYQA 1HNLA 3P68A 1GE3A 1YKYX 4FDYA 5EBHA 1IOCA 4Z41A 1GBZA 1KIRC 4HP0A 4EMNA 1LKSA 5LVGA 3WVYA 1REYA 1IC5Y 1DZBX 1LYSA 1LZDA 3W6AA 1LYOA 4MCKA 4HJZA 3D9AC 5FHWA 4TX7A 1TEWA 1CJ8A 1OUIA 1TBYA 1B7QA 1C46A 1IR7A 2DQDY 2YBMA 4J7VA 4LGKA 5LAFA 5J7CA 4EOFA 4DD1A 1QSAA 2LZ2A 5ILCA 5KKIA 4P2EA 1LJFA 4NGVA 1YL1X 4LYMA 3RW8A 4NGJA 1LMCA 4NGZA 3TMXA 4J0LA 5M1YA 1C43A 5KXLA 1FDLY 4NSIA 4WLDA 2I26L 4WG7A 1ALCA 4G49A 2BQNA 4H8ZA 1JJ1A 1IP1A 1GFEA 4NHQA 4HJVA 3TXEA 1LZ6A 1RJCB 1CNSA 1IO5A 1LMNA 2N5ZA 3WYHA 4PJ2C 1B2KA 4QY9A 3LZTA 1JISA 3TXJA 1A4VA 1VEDA 4H90A 1OUFA 2YBIA 4DD0A 4YEOA 4C5FA 1LSFA 4GCDA 1JJ3A 1GFUA 4UWUA 4ZFPA 3WUAA 4RLNA 1GDWA 4GN5C 4B1AA 1UICA 4DC4A 1OUDA 1B9OA 1XSFA 1VATA 1HFYA 1REMA 2ZNXY 2ZQ3A 1I1ZA 1D0KA 1JEFA 4YENA 4LT3A 1GBOA 1LJ4A 2BQGA 3EMSA 1QTKA 1YKZX 2CWIA 4WL6A 1HHLA 1GPQC 2WARA 5HNLA 5IELA 1B7OA 3WXTA 4DD2A 1WTMA 4BADA 1LSNA 7LYZA 3WU9A 1JITA 2HU1A 1LZ4A 194LA 2Q0MX 1GE4A 4WM1A 3MGWA 1D0MA 4HTQA 2HEBA 5F16A 3WMKA 4I0CA 1LMQA 1IX0A 5KXPA 1IR9A 2BQBA 4YF2A 2VB1A 2Z2EA 5LIOA 4DD3A 4NWEA 1ZV5L 1IY3A 2BPUA 2W1YA 1IP2A 2DBTA 1VDQA 3WPKA 1BB4A 1B5UA 1NBZC 1YAPA 4OWBA 2FYCA 1IORA 5D5FA 3ATNA 9LYZA 1FKVA 1UIDA 1LMAA 2BLYA 4HV1A 1IWUA 1XGQC 3WH1A 2W1XA 3A90A 2F4GA 1MELL 3LZ2A 1GFKA 3ZEKA 3A6CY 1DQJC 1HEWA 4GCCA 5LA8A 1LZCA 3CT0A 4J1AA 4M4OA 4II8A 5LVHA 1TAYA 3W6CA 1YL0X 4NHTA 2YSSC 4XYYA 3CB7A 3CSQA 2BQIA 1LZBA 4B0DA 1UIBA 1JJ0A 4N1CC 208LA 4GLAA 3WUNA 1GB2A 4WLTA 1LZTA 1LZ9A 1YKXX 4XJBA 1AM7A 1QSWA 3AW6A 1NQIA 3WPJA 1DI5A 1GEVA 3AW7A 4XJGA 5HMJA 2BQCA 1IP5A 1KIQC 4N0JA 1LYYA 4PPOA 1HSXA 3J6KA 4G4CA 1Z55A 4PRUA 1DPWA 4KXIA 1FBIX 1JTTL 4G9SA 2X0AA 1HEMA 1INUA 1XEIA 1IWWA 1IC7Y 1G7LC 3M18B 4H9FA 5KXRA 1GB3A 1GBSA 1JUGA 4YEMA 4HSFA 1DI3A 1WQPA 1F0WA 1NBYC 3ZVQA 3P65A 1JSEA 1JTPL 2DQGY 1GB9A 3A3QA 5HLLA 5LVJA 3WUMA 1OUAA 1HC0A 1WVUA 4Z3MA 1QDTA 2MEBA 1B7RA 3HBHA 1LJJA 1HMKA 4H8XA 5I54A 4WLYA 5KXZA 4H9CA 1YAQA 2DQHY 1RI8B 4H9BA 4O34A 1F6RA 2H9JA 1XGPC 1B7SA 4W94A 4ZIXA 2B5ZA 1GF6A 1QUSA 3TXBA 4C3WA 2MEHA 1HFZA 1LSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LI2A 1LSGA 3A67Y 3K2RA 1L71A 1D6QA 4WM5A 186LA 1LZEA 1WQQA 156LA 1LHLA 1LMTA 165LA 5LXWA 4OWEA 1LMPA 3W6FA 2EKSC 1VDPA 3LHMA 2EQLA 1GFJA 135LA 2B6ZA 5F81A 3T6UA 1LZ5A 3GUJA 1XJTA 3QNGA 3A95A 8LYZA 1SQ2L 4NY5A 4TSCA 3K3TA 5KXSA 4ETDA 4KL7A 3DN2A 4WM3A 2HU3A 2O79A 154LA 4XJFA 1L73A 3SB9A 5KKJA 2LYOA 5L3IA 3BKVA 4PRQA 4W51A 1DYDA 4K5YA 3AZ4A 2L78A 3GXRA 2F2QA 1TLAA 1L48A 4EJ4A 1L15A 2HTXA 4ARPA 1L90A 3LZMA 4H9AA 2D4JA 2HECA 1L46A 1L27A 3EMLA 2YBJA 1UUZC 1I20A 5A3ZA 5LAGA 206LA 1D2YA 1L65A 2Z39A 4MR1A 2OE9X 2Z37A 2DQEY 3ZVQB 232LA 3ODUA 1L28A 2MEDA 4QDNA 1BB5A 1C63A 1L72A 1F6SA 4RDSA 3A34A 2Q9EA 1HFXA 5B06A 1VFBC 1DYFA 2ZIJA 4PJZA 4CFPA 4NGOA 1IP6A 148LE 4B4IA 1GFAA 1N4FA 3C81A 5I53A 5DLAA 1PS5A 4ETEA 2RAZX 1REZA 1LSYA 4J1BA 2DQIY 2F2NA 5C6JA 3DN1A 3RU5A 1C08C 4UWVA 4XADA 2RBSA 3A92A 3LN2A 4WM2A 1D2WA 4NGIA 1L40A 4DWXA 4OW1A 152LA 5F9XA 169LA 1GD6A 4EKRA 1PQKA 5LZMA 4LDEA 1JIYA 2BQAA 5LYTA 1L75A 3FI7A 4CJ2A 1L04A 1OUCA 207LA 1JKBA 210LA 130LA 1B6IA 1LTMA 2MEAA 3HFMY 200LA 1B0DA 2RB1X 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WL2 A;  4H92 A;  1LSG A;  1XGU C;  3A67 Y;  1NKH A;  1C10 A;  193L A;  1JKC A;  1GWD A;  3AGI A;  4R0F A;  4WLX A;  2XBR A;  1D6Q A;  2YBN A;  2YDG A;  4WM5 A;  4D9Z A;  4TWS A;  1YIK A;  1LZE A;  1WQQ A;  5E4P A;  2MEF A;  4H8Y A;  1LHL A;  153L A;  1HEL A;  1LMT A;  1WTN A;  2XBS A;  3KAM A;  5LXW A;  1TDY A;  1GEZ A;  1QUT A;  4OWE A;  4Z46 A;  4LYO A;  1LMP A;  4H9I A;  3W6F A;  3TXI A;  2EKS C;  1AKI A;  1BB6 A;  1NHE A;  1VDP A;  5FST A;  5LIN A;  3A93 A;  2D4I A;  4XEN A;  3LHM A;  2EQL A;  3WW6 A;  1G7I C;  1GFJ A;  135L A;  1QQY A;  1LJK A;  1NF5 A;  1GBX A;  5F81 A;  3T6U A;  3TXD A;  2BQK A;  1LZ5 A;  1A2Y C;  1REX A;  1BB3 A;  1GE2 A;  1D9U A;  2DQF C;  4N5R A;  3QNG A;  5B59 A;  4FJR A;  4OWC A;  1IWX A;  4PHI A;  1CJ9 A;  1LZA A;  3A95 A;  8LYZ A;  1SQ2 L;  4NY5 A;  4TSC A;  3K3T A;  5KXS A;  3AZ7 A;  3QE8 A;  3P64 A;  2FBB A;  4B49 A;  4KL7 A;  1HF4 A;  4ETD A;  5I4W A;  5DN4 A;  3N9C A;  5LYM A;  3TXG A;  4WM3 A;  1BB7 A;  2HU3 A;  1HEQ A;  1FLQ A;  1J1P Y;  3AGH A;  5KXN A; 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 1BB4 A;  1B5U A;  1NBZ C;  1YAP A;  4OWB A;  2FYC A;  1IOR A;  5D5F A;  3ATN A;  9LYZ A;  1FKV A;  1UID A;  1LMA A;  2BLY A;  4HV1 A;  1IWU A;  1XGQ C;  3WH1 A;  2W1X A;  3A90 A;  2F4G A;  1MEL L;  3LZ2 A;  1GFK A;  3ZEK A;  3A6C Y;  1DQJ C;  1HEW A;  4GCC A;  5LA8 A;  1LZC A;  3CT0 A;  4J1A A;  4M4O A;  4II8 A;  5LVH A;  1TAY A;  3W6C A;  1YL0 X;  4NHT A;  2YSS C;  4XYY A;  3CB7 A;  3CSQ A;  2BQI A;  1LZB A;  4B0D A;  1UIB A;  1JJ0 A;  4N1C C;  208L A;  4GLA A;  3WUN A;  1GB2 A;  4WLT A;  1LZT A;  1LZ9 A;  1YKX X;  4XJB A;  1AM7 A;  1QSW A;  3AW6 A;  1NQI A;  3WPJ A;  1DI5 A;  1GEV A;  3AW7 A;  4XJG A;  5HMJ A;  2BQC A;  1IP5 A;  1KIQ C;  4N0J A;  1LYY A;  4PPO A;  1HSX A;  3J6K A;  4G4C A;  1Z55 A;  4PRU A;  1DPW A;  4KXI A;  1FBI X;  1JTT L;  4G9S A;  2X0A A;  1HEM A;  1INU A;  1XEI A;  1IWW A;  1IC7 Y;  1G7L C;  3M18 B;  4H9F A;  5KXR A;  1GB3 A;  1GBS A;  1JUG A;  4YEM A;  4HSF A;  1DI3 A;  1WQP A;  1F0W A;  1NBY C;  3ZVQ A;  3P65 A;  1JSE A;  1JTP L;  2DQG Y;  1GB9 A;  3A3Q A;  5HLL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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