4QY9A

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and auoxo3, a cytotoxic gold(iii) compound
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Interactions of gold-based drugs with proteins: the structure and stability of the adduct formed in the reaction between lysozyme and the cytotoxic gold(iii) compound Auoxo3.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4qy9A00
3A96A 3W6EA 1IX0A 2DBTA 1JJ3A 1B7MA 1NDGC 4YM8A 1GFGA 1B5WA 1XGQC 5F81A 1LJFA 1LHHA 4NGOA 1GF5A 4B1AA 1GFEA 1LMAA 4I8SA 1OUCA 4WM5A 4ZFPA 1BB3A 1FN5A 135LA 1LSGA 2BQDA 1F6RA 1GFVA 2W1MA 3CT5A 4WM4A 5HMVA 5HQ1A 3N9EA 5LVJA 1HHLA 2Z19A 4HJZA 3OK0A 4NHPA 3HBHA 4NHSA 3WL2A 4XJGA 4BADA 1C43A 2Z38A 2DQJY 3BKVA 1JSFA 3AGHA 1GAYA 3RT5X 1GPQC 4WG1A 1FLYA 4DD1A 2HUBA 1JEFA 3WW6A 5C6JA 1LMNA 1GXV2 3LYMA 1B2KA 1WTNA 1YROA 3AZ6A 2D4JA 1OUGA 2NWDX 4B49A 4RLNA 2BQMA 1LSAA 3WUMA 4ET8A 2FBDA 3A94A 1REZA 3CT0A 1GDWA 2MECA 2BQLA 1ZVHL 4RW1A 5L3IA 1OP9B 4WL7A 4ETDA 4ETCA 1YAQA 4H9FA 2F2NA 4YF2A 1VATA 2HU3A 1GHLA 2HU1A 2A7FA 1IR7A 1XEJA 5LYMA 4H9IA 1LZ5A 1UIDA 5FSTA 4WM6A 1A2YC 2DQHY 5ILFA 2H9KA 3A67Y 133LA 1LHKA 1GFKA 1LJEA 3N9CA 4N1CC 1OUAA 2LHMA 4XADA 1EL1A 1WQMA 8LYZA 2ZIJA 3TMUA 1TCYA 1BQLY 4J0LA 1UA6Y 1LZEA 2LYMA 3GXRA 1IP5A 5APFA 1LYYA 2DQCY 1LSBA 5C6IA 1EQEA 5B06A 1HNLA 4C5FA 1LSZA 4WLTA 1IWVA 4H93A 208LA 2HEBA 1QQYA 4CGEA 1TAYA 3WXTA 1IORA 2A7DA 4ANRA 3W6AA 1XGRC 4UWVA 4B4IA 4H90A 194LA 1YQVY 1FLUA 1QSWA 2YDGA 1NDMC 4B0DA 3P66A 4LYMA 1LZCA 4NGIA 4WL6A 4DYGA 1G7MC 2W1XA 5D5CA 1C7PA 1BWIA 4RDSA 1GE0A 4XN6A 3A3RX 1LZ9A 5E4PA 4H1PA 5T3FA 1LSDA 3P65A 5IDDA 4P2EA 4G49A 4IJ4A 3CSRA 4YEMA 1JKCA 1IOCA 3WU7A 4BAFA 1XGPC 1JISA 2DKVA 4LZTA 1KIQC 4NG8A 3W6BA 1GB6A 1NBYC 3B6LA 5FHWA 1VEDA 3G3BB 1VDSA 1UIAA 3AJNA 1LSNA 1GE4A 1F0WA 4XJDA 5HMJA 5LAFA 1IWWA 4C3WA 2DQGY 4U3XB 5LVIA 1WVUA 3QNGA 1HEMA 3AZ5A 1D0MA 4Z98A 1QIOA 2BQIA 5IELA 3LZ2A 4AXTA 1UUZC 5APCA 3W6CA 1D9UA 2D4KA 3M18B 153LA 2BQJA 6LYZA 3MGWA 1IWXA 3LZTA 3TXDA 1ALCA 2BQOA 3A6BY 1REXA 2ZQ4A 4NWHA 1LZRA 2Z2EA 4CHXA 1KIPC 2LYZA 5II3A 4DD9A 4W94A 3KAMA 4HP0A 134LA 3WU8A 1XGTC 1ZMYL 1G7HC 4MCKA 4YEOA 4H9EA 4ZEEA 1DI3A 1HERA 1JPOA 1OUJA 1YILA 1Z55A 3A8ZA 5HLLA 1JUGA 1QDRA 4N5RA 4DWXA 1UIGA 4QDNA 1ZVYB 2F4AA 3D9AC 4OWHA 1BVKC 3BKHA 5KJ9A 2RSCA 4PRUA 5M1YA 1VFBC 1RI8B 1HSWA 3J4GA 2IHLA 1J1OY 4H94A 1LKSA 1UACY 4LGKA 4NSIA 5LINA 2Y8PA 1IP3A 1DI4A 1IEEA 1LHMA 1GFJA 3AZ7A 4CFPA 1LCNA 1RCMA 4B4EA 2XBSA 3WUAA 1D6QA 1JKBA 3WPKA 3FE0A 4A7DA 2C8OA 1AZFA 1B5YA 1BHZA 3B0IA 2DQFC 1F10A 1HSXA 1GB0A 1OUFA 3A3QA 1LSEA 1LMPA 1D6PA 2BQEA 2I6ZA 1LSPA 2LYOA 1GF0A 1DPXA 3A93A 4LYCA 3T6UA 1B7RA 1QDTA 3AGIA 5KXSA 1GAZA 4DC4A 1LZ4A 2HEDA 3QE8A 1A4VA 1HF4A 1JTPL 1LOZA 1WVVA 2BQCA 2F4GA 2CJLA 2XBRA 2ZILA 2ZNWY 4CJ2A 4GLVA 5FCPA 4GN3A 3P4ZA 1GF7A 5KXWA 2Z2FA 1GWDA 4NHTA 1B7PA 1IC5Y 1CKGA 1NBZC 1IP4A 2EPEA 1GFRA 2BQAA 4LT2A 1FKVA 3ULRA 2D91A 4KXIA 3TXHA 5A3EA 4NSJA 5LXWA 2VB1A 1MLCE 4J1AA 3G3AB 4WLDA 1LMOA 1WQQA 3M3UA 1GB2A 1LZDA 1UICA 4XJFA 4HV1A 4LT1A 5DL9A 1OQMA 1BB4A 1VDTA 5LVGA 5ILCA 1CKDA 5B59A 1GE1A 1H6MA 4TTDA 5JENB 1EQ4A 3LN2A 1OUBA 1WQRA 3B72A 4I0CA 5C6LA 5KXLA 3W3EA 1GB3A 3LYOA 193LA 1UIEA 2EKSC 4PHIA 1D0LA 4GCFA 4G4HA 1IVMA 1LZ1A 4IASA 5KXNA 4QGZA 1NQIA 5LYZA 2N5ZA 2FBBA 5AMYA 1GBWA 3RW8A 1HC0A 2CWIA 1JKDA 4IATA 4N1EI 5IHGA 2YBLA 1NF5A 1LJIA 1JWRA 1XSFA 2YVBA 1V7SA 5I5QA 3CB7A 1IWYA 3F6ZA 1HEWA 4GCCA 3TXEA 1BWHA 1DQJC 1PZYA 1ZV5L 1CNSA 3RZ4A 4DDAA 2G4PA 4FJRA 3TXBA 2ZWBA 4EMNA 3IWRA 1FLWA 1B5XA 5I4YA 1GF6A 5LA5A 3TMXA 3WULA 1LYOA 4EOFA 4RW2A 3K3TA 5DN5A 1LMCA 1BWJA 3D3DA 1SQ2L 1JTOL 1LJJA 4ETAA 1GBSA 4M4OA 1DKKA 4J7VA 2YSSC 5LA8A 4YENA 1B7OA 3ATOA 4HV2A 1YAOA 4HJVA 1C08C 5KXPA 3WUNA 1TDYA 2DQIY 4PJ2C 4UWUA 1YL1X 5J7CA 1IY3A 4WOAA 1GBYA 5LAGA 4AGAA 1HMKA 1LYZA 2BQKA 3CSQA 2D6BA 3P64A 4DDBA 1JSEA 1JHLA 3A91A 2C8PA 5K7OA 1VDQA 1HFYA 1LHIA 1HMLA 4LT0A 2Z39A 1GB8A 4II8A 1IC7Y 4HSFA 5A3ZA 2DQDY 4G9SA 1LSMA 4TSBA 5B1FA 5KXRA 1LTMA 1IY4A 1LSYA 4OWCA 2YBHA 1D0KA 1T3PA 1UIBA 2XTHA 4WO6A 4E3UA 1CJ6A 1WQPA 1B7SA 1LJNA 1B7QA 1LZAA 4H8YA 4KT3A 4XYYA 3HBDA 4GN5C 1UIFA 4PRQA 5APEA 5KXTA 5LVKA 4ET9A 1FLQA 4NGJA 5I53A 1TEWA 1UIHA 4NSGA 3LYZA 5LVHA 3AW6A 4NSHA 3ZVQB 2B5ZA 4DDCA 4NGYA 1UBZA 3WPJA 1GFTA 4L41A 4B4JA 4ETBA 4WLYA 4NEBA 3A92A 4NGLA 2HEAA 4WM1A 207LA 4ETEA 3TXFA 2ZNXY 3W6FA 2CGIA 1GE3A 1HEQA 2MEHA 3HBEX 4XJBA 2EQLA 4NIJA 4OWEA 1XGUC 1YKZX 2MEBA 4GCDA 1QSAA 4WG7A 1INUA 1IWZA 1B5VA 1GBOA 1REMA 3WXUA 1GEVA 1G7LC 4TX7A 4PGJB 1J1XY 5B05A 1GB7A 1BB7A 1OUDA 4KPMA 1LHLA 2IFFY 4H8ZA 1JJ1A 1XEIA 1KIRC 4NGWA 1BB5A 2YBMA 4NY5A 4J1BA 3VWOA 4D9ZA 1YL0X 1C10A 3AB6A 1DXJA 1SLYA 1GEZA 1G7JC 1LZ8A 5I4WA 1I20A 5KXKA 1LJHA 4TSCA 2BQBA 4WLXA 3TXJA 2BLYA 2ZIKA 2W1YA 1DKJA 5KKIA 1WQOA 2LZTA 1MELL 4KL7A 7LYZA 4M6DA 1IC4Y 1B5ZA 1GB9A 4OOOA 4NG1A 3ZEKA 2FYDA 1DI5A 1LPIA 1GXXA 4GN4A 1G7IC 1IOSA 1HEPA 2X0AA 4G4BA 1LJ4A 4DD7A 2MEDA 2GV0A 1AKIA 3ZVQA 1BGIA 1IOQA 1KXXA 4MSTA 4WM3A 1JJ0A 2H5ZA 4OOTA 1KXYA 2HEEA 4CFOA 1YANA 4HPIA 4HTKA 2I25L 2PC2A 6LYTA 4Z41A 1HEOA 3J6KA 2W1LA 1I1ZA 2H9JA 4QEQA 2HEFA 3EMSA 1YKYX 1JKAA 2DQAA 1LZNA 3B0KA 1UC0A 1XFPL 1GFAA 2MEFA 3A90A 1P2CC 2BQGA 3A95A 1I56A 1RFPA 1LYSA 1NWGA 2AUBA 2BQHA 5KXOA 3LHMA 1CJ9A 4XJHA 4N0JA 2CDSA 1GBXA 2MEAA 4OWBA 1GF3A 5D5FA 1EQ5A 3TMWA 1LZTA 3HFMY 5APDA 4TUNA 5E9RA 2Q0MX 5LYTA 2XJWA 2I26L 4H9AA 5KXZA 1LZSA 3OJPA 1AT5A 4H8XA 4RLMA 4TWSA 1DPWA 4ZIXA 1IO5A 4YOPA 1YKXX 1OUIA 4NGKA 3TXIA 5L9JA 1RE2A 4FDYA 5KXXA 1GD6A 1GF9A 3T36A 9LYZA 5KXMA 1LMTA 1LZ6A 1REYA 1RJCB 1UCOA 3IJUA 4BAPA 4H92A 2HTXA 1C46A 1H87A 4LYBA 2Z37A 1OUEA 2G4QA 2MEGA 4GLAA 2WARA 5KY1A 1GDXA 3B0OA 4LYOA 1IP2A 4Z3MA 4DD2A 4LT3A 1FDLY 4DT3A 2YBIA 4H91A 132LA 2Z12A 3EXDA 4NHIA 3WU9A 1LAAA 4XJIA 1JITA 1CJ8A 1QUTA 1GE2A 1NKHA 2BQNA 2EIZC 3CT1A 5HNLA 4O34A 1PS5A 4WO9A 4W96A 4GCEA 5B07A 5DM9A 1CKCA 4H9HA 2BLXA 4UWNA 3WW5A 3WVXA 2YBNA 4R6CA 1GF8A 1HENA 1LHJA 1WTMA 1N4FA 2ZQ3A 3QY4A 5F16A 5B1GA 5F9UA 1CJ7A 1B9OA 1BVXA 1WQNA 5FEKA 5KXYA 1FBIX 1B5UA 1VAUA 1W08A 4QY9A 5F9XA 4ML7A 1GFUA 2ZYCA 1E8LA 1V7TA 1VDPA 1NMMA 3AW7A 1IOTA 3IJVA 4H9BA 2BAAA 1CKFA 1LZYA 4HJYA 4GCBA 1HELA 2MEEA 4MR1A 1TBYA 3WVYA 4NHQA 5KKJA 3WYHA 1IWTA 1GF4A 2BPUA 1B0DA 4N9RA 2MEIA 3RNXA 2D4IA 154LA 3GXKA 2HECA 2G4NA 4NWEA 3AGGG 2Z18A 5LIOA 4LYTA 1QUSA 5L3HA 4NFVA 4DD0A 5I54A 1AT6A 4G4CA 1YIKA 4WMGA 1GBZA 4DD3A 1JIYA 4NGZA 1BB6A 1O23A 1LKRA 4H9CA 3TXGA 4LFPA 3SP3A 5F14A 1IR8A 3WMKA 1XEKA 2YBJA 1QTKA 3EO5A 3P68A 4R0FA 1GFHA 1DZBX 4XENA 5DLAA 1B7LA 1GB5A 4HPEA 1B7NA 1J1PY 2DQEY 2FYCA 4BS7A 5HNCA 1IP6A 1QTEA 3WH1A 4HTNA 3LYTA 4LYZA 1T6VL 5FDJA 3CSZA 1HFXA 3E3DA 4X3BA 1F6SA 1AM7A 1LSFA 4HTQA 1LZGA 1LZBA 3A6CY 3AZ4A 3EBAB 3A34A 1LMQA 1LJ3A 2F30A 3N9AA 1KXWA 3AYQA 4LFXA 3WPLA 1JTTL 1IR9A 1OUHA 4N8ZA 1IP1A 1IWUA 2ZYPA 4OW1A 4NGVA 4PPOA 4WM2A 5FELA 3W6DA 5I4XA 1IIZA 1FKQA 3ATNA 5DN4A 2LZ2A 1C45A 1LJGA 3CQLA 3TXKA 2BQFA 1CKHA 1IP7A 1W6ZA 3FI7A 1HFZA 1YAMA 1LJKA 4OWAA 5EBHA 1YAPA 3RU5A 3TMVA 1NHEA 1LSCA 4Z46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IX0A 1KNIA 4DQ5A 1LHHA 3SB5A 3HT8A 120LA 1GFEA 4WM5A 1BB3A 135LA 1F6RA 1GFVA 2W1MA 3N9EA 5LVJA 4NHPA 1JTNA 1XJTA 2Z38A 161LA 4I7JA 1L64A 4DD1A 1JEFA 3LYMA 253LA 4DAJA 4RLNA 1CU3A 3WUMA 1C66A 3DN0A 4RW1A 4WL7A 4ETDA 1L23A 258LA 2HU1A 1C63A 5LYMA 5FSTA 1L39A 1L0KA 5ILFA 3A67Y 1GFKA 4N1CC 8LYZA 3GUKA 1TCYA 180LA 3K2RA 3C82A 1UA6Y 3HTDA 1TLAA 3GXRA 1HNLA 1IWVA 1QQYA 1TAYA 1L83A 4UWVA 1L91A 1FLUA 1NDMC 4WL6A 1LZCA 4DYGA 2XQOA 1GE0A 1L26A 1NHBA 5IDDA 4IJ4A 3WU7A 1XGPC 4NG8A 1KIQC 1L06A 1F0WA 4XJDA 2RB1X 5LVIA 3VW7A 1D9WA 1QIOA 1L43A 1D9UA 3M18B 1IWXA 1ALCA 1REXA 5II3A 1KIPC 4OO9A 4DD9A 4HP0A 1G7HC 4YEOA 1L46A 1L37A 1JPOA 197LA 1ZVYB 1L75A 4OWHA 1BVKC 2RSCA 5M1YA 185LA 4NSIA 5LINA 143LA 2Y8PA 131LA 1C69A 1C6LA 4CFPA 1RCMA 1C6EA 1L66A 1D6QA 3WPKA 1L08A 1AZFA 4W58A 3OE9A 2HUMA 3A3QA 1D6PA 1QDTA 4DC4A 159LA 2HEDA 3QE8A 4LT3A 1HF4A 1JTPL 1LOZA 4CJ2A 2ZILA 1G0PA 5FCPA 1GF7A 2Z2FA 1B7PA 1NBZC 2D91A 2VB1A 1MLCE 1L24A 1QT5A 2B6ZA 4HV1A 1VDTA 1CKDA 4I0CA 3C7WA 1UIEA 1CTWA 4QGZA 5LYZA 2FBBA 5AMYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A96 A;  3W6E A;  1IX0 A;  2DBT A;  1JJ3 A;  1B7M A;  1NDG C;  4YM8 A;  1GFG A;  1B5W A;  1XGQ C;  5F81 A;  1LJF A;  1LHH A;  4NGO A;  1GF5 A;  4B1A A;  1GFE A;  1LMA A;  4I8S A;  1OUC A;  4WM5 A;  4ZFP A;  1BB3 A;  1FN5 A;  135L A;  1LSG A;  2BQD A;  1F6R A;  1GFV A;  2W1M A;  3CT5 A;  4WM4 A;  5HMV A;  5HQ1 A;  3N9E A;  5LVJ A;  1HHL A;  2Z19 A;  4HJZ A;  3OK0 A;  4NHP A;  3HBH A;  4NHS A;  3WL2 A;  4XJG A;  4BAD A;  1C43 A;  2Z38 A;  2DQJ Y;  3BKV A;  1JSF A;  3AGH A;  1GAY A;  3RT5 X;  1GPQ C;  4WG1 A;  1FLY A;  4DD1 A;  2HUB A;  1JEF A;  3WW6 A;  5C6J A;  1LMN A;  1GXV 2;  3LYM A;  1B2K A;  1WTN A;  1YRO A;  3AZ6 A;  2D4J A;  1OUG A;  2NWD X;  4B49 A;  4RLN A;  2BQM A;  1LSA A;  3WUM A;  4ET8 A;  2FBD A;  3A94 A;  1REZ A;  3CT0 A;  1GDW A;  2MEC A;  2BQL A;  1ZVH L;  4RW1 A;  5L3I A;  1OP9 B;  4WL7 A;  4ETD A;  4ETC A;  1YAQ A;  4H9F A;  2F2N A;  4YF2 A;  1VAT A;  2HU3 A;  1GHL A;  2HU1 A;  2A7F A;  1IR7 A;  1XEJ A;  5LYM A;  4H9I A;  1LZ5 A;  1UID A;  5FST A;  4WM6 A;  1A2Y C;  2DQH Y; 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 1V7T A;  1VDP A;  1NMM A;  3AW7 A;  1IOT A;  3IJV A;  4H9B A;  2BAA A;  1CKF A;  1LZY A;  4HJY A;  4GCB A;  1HEL A;  2MEE A;  4MR1 A;  1TBY A;  3WVY A;  4NHQ A;  5KKJ A;  3WYH A;  1IWT A;  1GF4 A;  2BPU A;  1B0D A;  4N9R A;  2MEI A;  3RNX A;  2D4I A;  154L A;  3GXK A;  2HEC A;  2G4N A;  4NWE A;  3AGG G;  2Z18 A;  5LIO A;  4LYT A;  1QUS A;  5L3H A;  4NFV A;  4DD0 A;  5I54 A;  1AT6 A;  4G4C A;  1YIK A;  4WMG A;  1GBZ A;  4DD3 A;  1JIY A;  4NGZ A;  1BB6 A;  1O23 A;  1LKR A;  4H9C A;  3TXG A;  4LFP A;  3SP3 A;  5F14 A;  1IR8 A;  3WMK A;  1XEK A;  2YBJ A;  1QTK A;  3EO5 A;  3P68 A;  4R0F A;  1GFH A;  1DZB X;  4XEN A;  5DLA A;  1B7L A;  1GB5 A;  4HPE A;  1B7N A;  1J1P Y;  2DQE Y;  2FYC A;  4BS7 A;  5HNC A;  1IP6 A;  1QTE A;  3WH1 A;  4HTN A;  3LYT A;  4LYZ A;  1T6V L;  5FDJ A;  3CSZ A;  1HFX A;  3E3D A;  4X3B A;  1F6S A;  1AM7 A;  1LSF A;  4HTQ A;  1LZG A;  1LZB A;  3A6C Y;  3AZ4 A;  3EBA B;  3A34 A;  1LMQ A;  1LJ3 A;  2F30 A;  3N9A A;  1KXW A;  3AYQ A;  4LFX A;  3WPL A;  1JTT L;  1IR9 A;  1OUH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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