4YXCA

Complex of flim(spoa)::flin fusion protein and flih(apar)::t4lysozyme fusion protein
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
GPVDMSNELPWQVWTPDDLAPPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein transport
molecule keywords Flagellar assembly protein H,Endolysin
publication title A common assembly module in injectisome and flagellar type III secretion sorting platforms.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar enteritidis str. se30663
total genus 61
structure length 182
sequence length 182
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4yxcA00
1SX2A 4PJZA 248LA 1CX6A 1LGXA 1L33A 2B6TA 3SB6A 1P2RA 1L49A 163LA 1L67A 1D2WA 119LA 3HTBA 5LZMA 2NTGA 241LA 1L36A 174LA 1C6JA 1L12A 4ARQA 1C6GA 3HTDA 1DYEA 4W51A 3LZMA 1L59A 3DN0A 2HULA 4W53A 1P56A 1L11A 4OO9A 1QTVA 3SBAA 1C6DA 243LA 3DN8A 1LGWA 3K2RA 2RAYX 4W58A 2NTHA 1G1WA 1L99A 255LA 1LWGA 1QUDA 2RB0X 210LA 1L25A 2QB0B 238LA 1QTBA 160LA 1L75A 224LA 1C67A 213LA 1C6KA 2O79A 1CV4A 1L0JA 1L97A 1QTZA 215LA 4I7LA 3NY9A 146LA 170LA 3GULA 159LA 242LA 3FA0A 1B6IA 196LA 253LA 4ZPUA 178LA 2RB1X 2B72A 1L16A 1T97A 1L20A 3SB9A 1D3FA 1L77A 3OE9A 1LI3A 2RAZX 218LA 1C6FA 118LA 1L0KA 245LA 157LA 3C7ZA 3DN6A 244LA 1P3NA 1L79A 1T8GA 1CU6A 1CUQA 257LA 259LA 4YXAC 1C6EA 3HH4A 4W52A 231LA 3DN2A 181LA 1P46A 2LC9A 1L15A 1ZURA 1QT5A 3DKEX 140LA 3GUNA 1KS3A 3HT8A 3L64A 2OE9X 260LA 2RBSA 198LA 2Z6BA 1L80A 3GUIA 1CX7A 3DNAA 4ARPA 2ANXA 1C61A 1L70A 1QSQA 2Q9DA 3FI5A 2OE7X 3SBBC 3V2YA 1L22A 3SB5A 1C64A 1L30A 221LA 3CDTA 1L19A 3DMVA 4I7NA 113LA 3GUPA 186LA 2RH1A 1G0MA 1L81A 177LA 191LA 1I6SA 1QSBA 148LE 206LA 1LI6A 1K28A 166LA 212LA 167LA 2F47A 4YXCA 2OTYX 3DMXA 4EKPA 217LA 3HUAA 3C80A 4I7OA 2OU8A 4EXMA 1L96A 3OE6A 141LA 1L58A 1L56A 3CDOA 1LI2A 114LA 3HDEA 237LA 1C6IA 1JTNA 1L09A 1L72A 4E97A 1PQOA 2O4WA 3HT7A 1C6LA 109LA 1L00A 161LA 1C69A 1G1VA 4W57A 169LA 201LA 3GUKA 1D3MA 1OVHA 1L62A 1L28A 240LA 3SB8A 176LA 1L43A 2B75A 1DYCA 3QAKA 1D9WA 1T6HA 1L64A 4LZMA 3OE0A 3FADA 4I7JA 1L91A 1L85A 2B6ZA 4PK0A 3L2XA 3G3XA 3RUNA 1CU2A 1LPYA 216LA 2IGCA 1QUOA 1PQDA 1NHBA 1L48A 1L42A 155LA 1L31A 1CV1A 102LA 1L46A 4W55A 1XEPA 162LA 1L18A 2O7AA 232LA 1C62A 3HDFA 1L03A 158LA 3HT9A 1PQJA 1DYBA 2Q9EA 1C6AA 164LA 1L29A 3PDSA 1C6HA 3HTFA 151LA 180LA 3C7WA 3ODUA 143LA 4I7SA 3G3WA 137LA 182LA 1L06A 1L54A 4S0WA 1CV5A 1SWYA 103LA 1L55A 3HWLA 3GUOA 1L66A 2LZMA 1G0QA 4DKLA 1L89A 4I7RA 229LA 3HU9A 1D3JA 1L07A 2RB2X 1PQMA 2HUKA 3VW7A 1QTHA 112LA 1SWZA 1QS9A 3DN3A 2OU9A 1PQIA 2OU0X 3CDQA 173LA 126LA 1G0KA 3F9LA 1L57A 1KW7A 251LA 1CV3A 205LA 2LCBA 1LYJA 3HU8A 1C6BA 1L26A 1OVKA 1L05A 1OWZA 130LA 1L71A 223LA 4EJ4A 1L92A 1P7SA 2A4TA 1LW9A 1ZWNA 254LA 1L44A 214LA 1L98A 3G3VA 4ARJA 1QT6A 3DMZA 1P2LA 128LA 138LA 1L74A 4GRVA 4IAPA 233LA 249LA 122LA 1T8FA 1CU3A 1KY0A 1L13A 1QT4A 246LA 3JR6A 1L88A 1CU0A 1LYGA 1C6MA 1L17A 1L87A 1L53A 247LA 1OVJA 200LA 4ARMB 236LA 1L21A 1EPYA 2B74A 3HTGA 209LA 1PQKA 187LA 184LA 199LA 2OE4X 3DN1A 147LA 1L65A 1OV5A 1LYFA 2ANVA 152LA 1L39A 2RBQA 183LA 142LA 2B6YA 197LA 1KY1A 1TLAA 1C65A 1P5CA 3F8VA 1L38A 1LYHA 1QTDA 1C68A 239LA 188LA 175LA 3HUKA 165LA 108LA 1C6CA 4I7MA 1JTMA 2OTZX 256LA 3GUMA 1CV6A 107LA 115LA 1L73A 3GUJA 1C6PA 2RBPA 1KNIA 1L47A 3NYAA 4LDEA 3HUQA 1L01A 4I7PA 3V2WA 3RZEA 4EKQA 4DAJA 4LDLA 3OE8A 1L83A 1L02A 4ARMA 2HUMA 168LA 1QUGA 1L41A 4I7QA 2B70A 3C83A 1QT3A 3CDVA 1L63A 1L90A 3SB7A 4EPIA 2B6XA 2L78A 131LA 3DN4A 1L35A 129LA 258LA 219LA 172LA 1L68A 1L37A 4GBRB 1DYAA 2OEAX 3HH5A 1L52A 4EKSA 1KW5A 3C81A 1L32A 2RBNA 4ARLA 145LA 111LA 195LA 1G0JA 1C63A 3C8RA 1L40A 4W59A 1C60A 1CV0A 4I7TA 1QTCA 1G0LA 1ZYTA 1SSWA 2B73A 4EKRA 1OWYA 125LA 1LYEA 235LA 1G0GA 1SX7A 1WTHA 2F32A 2CUUA 6LZMA 3D4SA 1DYFA 120LA 110LA 1P36A 1P37A 5I14A 225LA 1L86A 3HH3A 262LA 211LA 1L84A 4DJHA 1QT7A 1L24A 1L10A 228LA 4LDOA 2QARC 250LA 192LA 127LA 1L23A 1L04A 1L27A 2RBOA 227LA 1JQUA 1D2YA 1CVKA 3CDRA 2F2QA 3UONA 3HH6A 185LA 1P6YA 4EPFA 1C6TA 189LA 149LA 123LA 150LA 3C8SA 4W56A 1OV7A 1L82A 1L76A 3C8QA 1DYGA 3C7YA 1L61A 1CUPA 3EMLA 2RBRA 1L50A 1CTWA 2B6WA 4I7KA 1C6QA 252LA 1L93A 1L14A 1C66A 1OYUA 139LA 1T8AA 1SSYA 1LYIA 3PBLA 4K5YA 220LA 1L34A 4ARQB 230LA 1C6NA 1G0PA 3SN6R 1D3NA 1L45A 1LLHA 4AQNA 7LZMA 1LYDA 1P64A 2B7XA 222LA 1XJTA 234LA 1G06A 1L95A 190LA 1L69A 3C82A 1L60A 1L51A 1LGUA 1G07A 1DYDA 4W54A 1CU5A 1L08A 1QUHA 1XJUA 1QT8A 261LA 156LA 1LWKA 1QS5A 1L94A 104LA 3HT6A 4YX7C 144LA 226LA 3NY8A 171LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PJZA 4B49A 1CX6A 1LGXA 5II3A 4HJZA 1D2WA 4LYZA 1L12A 4ARQA 1C6GA 1DYEA 3DN0A 3EXDA 4HPEA 1L11A 1LGWA 3K2RA 3LHMA 2RAYX 2NTHA 1L99A 1LZ9A 1DKJA 1CNSA 1BWJA 210LA 4II8A 1QTBA 4HV2A 1L75A 1IOQA 1NWGA 4LT1A 1GE4A 1VDSA 1C67A 1B7NA 215LA 1UIBA 1BB7A 3J6KA 1HERA 5KXYA 4M4OA 1V7SA 1IC5Y 2YBLA 196LA 4ZPUA 178LA 2MEHA 3LN2A 1L77A 218LA 4J1AA 8LYZA 3C7ZA 1BB4A 1L79A 1T8GA 1CU6A 5LAGA 4PRQA 1TBYA 1CJ8A 5APEA 259LA 4G49A 4IATA 4WM5A 4OOTA 231LA 181LA 4UWNA 2XTHA 140LA 1YAQA 3W3EA 3HT8A 260LA 1YAPA 1UIAA 3A6BY 4ARPA 4WM3A 2EQLA 1L30A 1WQNA 221LA 4KPMA 3CDTA 3WMKA 1GB2A 1GF0A 4NFVA 113LA 5LA8A 1FDLY 2D4KA 1L81A 2BQIA 2YBIA 2MEEA 3WU7A 4YEMA 1YIKA 212LA 4R6CA 5I4WA 4YXCA 2F47A 3AZ5A 3C80A 2OU8A 2A7DA 4MSTA 1L96A 1L58A 1L56A 4XJIA 1GB3A 3HDEA 1C6IA 1JTNA 5HMJA 3A90A 1L00A 161LA 1C69A 9LYZA 3GUKA 1D3MA 3T36A 5F14A 1L28A 3SB8A 3WU9A 2ZYCA 1L91A 1B7LA 4PK0A 1JSFA 3BKVA 5L9JA 1B7SA 2BQFA 4H9FA 1KXWA 1QUOA 1C08C 1L42A 155LA 3CSQA 4NGWA 102LA 2DBTA 3P68A 1VATA 3TMXA 2XQOA 3ATNA 1DYBA 4EOFA 2CWIA 1CKDA 1LMQA 1GEZA 1C6HA 1LSPA 5J7CA 1IY3A 3G3WA 137LA 4CFPA 182LA 1L54A 1SWYA 1L55A 3HWLA 5C6IA 3GUOA 3SP3A 229LA 1L07A 2RB2X 1PQMA 2HUKA 4PHIA 112LA 5I53A 3WL2A 3HBEX 1PQIA 2XJWA 173LA 126LA 4LYBA 1CKFA 1LSDA 5DN4A 1G7MC 1ZMYL 2DQIY 4QGZA 5FDJA 1OWZA 1LPIA 1AZFA 1P7SA 1IP3A 1LSCA 3W6AA 4XN6A 3AW7A 4CGEA 3WPJA 1ZWNA 3WU8A 1LOZA 3G3VA 1QT6A 4TX7A 1IWYA 138LA 4NWEA 233LA 1LCNA 4E3UA 2YVBA 1L13A 1KY0A 3B0IA 4WO6A 5LXWA 1E8LA 1L88A 4RW2A 1LZRA 1GXXA 1L17A 1EL1A 1L53A 4DWXA 1GF6A 4LYMA 1LHJA 4ARMB 1C46A 2D6BA 5D5FA 2B74A 3HTGA 4KL7A 1HFYA 2W1YA 184LA 5KXOA 5F16A 1ZVHL 3DN1A 1L65A 3WH1A 1GFRA 152LA 142LA 1TLAA 1C65A 4OOOA 1NDMC 1H6MA 3WXTA 4I7MA 2OTZX 4CHXA 1C6PA 2RBPA 1EQ5A 1LHLA 3NYAA 4LDEA 3HUQA 3WW6A 1LZ8A 132LA 1FLUA 3RZEA 1G7HC 4H8YA 3OE8A 4LT0A 1QUGA 1LJ3A 3CDVA 1HEQA 1XGTC 2C8PA 2CJLA 1JKCA 131LA 4ZIXA 2ZYPA 2BQGA 1NBZC 4WM4A 2MEAA 219LA 2Z19A 1L68A 2HEFA 1LJEA 3HH5A 2EPEA 3C81A 1FLQA 1KIQC 5D5CA 3ZEKA 1LHMA 4NHIA 1C63A 3C8RA 5F9XA 1C60A 4DYGA 1QTCA 2Z2FA 1SSWA 2B73A 1UA6Y 1RFPA 4QDNA 235LA 1SX7A 1A4VA 120LA 1LSBA 1P36A 2DQDY 1L86A 4H9AA 1L10A 250LA 1NHEA 5HLLA 4WLDA 1L04A 2WARA 1L27A 227LA 208LA 1BHZA 4MCKA 1D2YA 1CVKA 3CDRA 4NGYA 1IORA 1P6YA 1C6TA 1DZBX 123LA 1REXA 1GFGA 1UIFA 2LZ2A 2F4GA 1SLYA 1JKDA 1L61A 1YKZX 2RBRA 1PS5A 3A94A 2BQKA 1IO5A 1C66A 4NHSA 1T8AA 3T6UA 4K5YA 4ARQB 1MLCE 1LHIA 1GBWA 1BB6A 7LZMA 1LYDA 5B05A 3QY4A 1N4FA 1B5ZA 1LJHA 1XGRC 1VFBC 1L60A 3QNGA 1IWUA 5I54A 1KIRC 3A93A 1L08A 2BQBA 1QT8A 4Z3MA 1QS5A 1P2CC 2BQEA 1NF5A 2BPUA 3HT6A 144LA 1B5UA 1WQPA 1IR7A 5LIOA 4FJRA 1LJNA 2DQFC 3SB6A 163LA 1JIYA 2BQAA 119LA 1LMTA 1LZGA 5KXLA 4Z41A 1EQ4A 4FDYA 1A2YC 1IP1A 3TMUA 1JJ3A 1GDXA 3LZMA 1L59A 2Z12A 1P56A 1FBIX 3SBAA 1LZSA 4P2EA 3A91A 1UIHA 255LA 4L41A 1I1ZA 1QUDA 2RB0X 3LZTA 3TXEA 4OWBA 4HTQA 3AYQA 4M6DA 4NGIA 224LA 2LYMA 1B5WA 4XJDA 1IOTA 1C6KA 2ZWBA 1GBOA 1GBYA 1L0JA 1L97A 1QTZA 1LZEA 2F4AA 1WQMA 146LA 1WTMA 170LA 3GULA 159LA 4HTKA 3WUNA 4J7VA 4XJHA 253LA 1GF8A 1D6PA 2I25L 1DI3A 2B72A 4GLVA 4H9CA 154LA 1HMKA 3OE9A 3HBHA 4GN4A 2Q0MX 245LA 244LA 1BGIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PJZ A;  4B49 A;  1CX6 A;  1LGX A;  5II3 A;  4HJZ A;  1D2W A;  4LYZ A;  1L12 A;  4ARQ A;  1C6G A;  1DYE A;  3DN0 A;  3EXD A;  4HPE A;  1L11 A;  1LGW A;  3K2R A;  3LHM A;  2RAY X;  2NTH A;  1L99 A;  1LZ9 A;  1DKJ A;  1CNS A;  1BWJ A;  210L A;  4II8 A;  1QTB A;  4HV2 A;  1L75 A;  1IOQ A;  1NWG A;  4LT1 A;  1GE4 A;  1VDS A;  1C67 A;  1B7N A;  215L A;  1UIB A;  1BB7 A;  3J6K A;  1HER A;  5KXY A;  4M4O A;  1V7S A;  1IC5 Y;  2YBL A;  196L A;  4ZPU A;  178L A;  2MEH A;  3LN2 A;  1L77 A;  218L A;  4J1A A;  8LYZ A;  3C7Z A;  1BB4 A;  1L79 A;  1T8G A;  1CU6 A;  5LAG A;  4PRQ A;  1TBY A;  1CJ8 A;  5APE A;  259L A;  4G49 A;  4IAT A;  4WM5 A;  4OOT A;  231L A;  181L A;  4UWN A;  2XTH A;  140L A;  1YAQ A;  3W3E A;  3HT8 A;  260L A;  1YAP A;  1UIA A;  3A6B Y;  4ARP A;  4WM3 A;  2EQL A;  1L30 A;  1WQN A;  221L A;  4KPM A;  3CDT A;  3WMK A;  1GB2 A;  1GF0 A;  4NFV A;  113L A;  5LA8 A;  1FDL Y;  2D4K A;  1L81 A;  2BQI A;  2YBI A;  2MEE A;  3WU7 A;  4YEM A;  1YIK A;  212L A;  4R6C A;  5I4W A;  4YXC A;  2F47 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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