4Z3MA

X-ray structure of the adduct formed in the reaction between lysozyme and a platinum(ii) complex with s,o bidentate ligands (9b)
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Platinum(II) Complexes with O,S Bidentate Ligands: Biophysical Characterization, Antiproliferative Activity, and Crystallographic Evidence of Protein Binding.
pubmed doi rcsb
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4z3mA00
3B0OA 1XGPC 1FDLY 2BQIA 2LYOA 3AGHA 5IDDA 3LN2A 3GXRA 5KXZA 3ZEKA 3OJPA 2BQEA 4HSFA 3VWOA 5I54A 4UWUA 4WLDA 5KJ9A 3GXKA 1H6MA 1TEWA 3WXUA 193LA 4DT3A 1JKAA 3EBAB 4NGYA 4GN4A 1NKHA 4NSJA 2W1MA 3AZ4A 4X3BA 4WM3A 1G7JC 3A94A 4NSGA 1HMLA 1IR8A 1JPOA 1KIRC 1LMAA 4GCDA 5APCA 4NHPA 4ML7A 1UCOA 1I56A 5KXKA 1NF5A 2A7DA 4ZFPA 4LZTA 2PC2A 1KIQC 1LSGA 2G4QA 1QTKA 1NDMC 1GF9A 1A2YC 5A3EA 3TXHA 3LYOA 1GE0A 1JSEA 1JTTL 5I5QA 5KY1A 1A4VA 1XGTC 4AGAA 3WVXA 3P4ZA 194LA 1LCNA 4BS7A 2MEFA 1F6SA 3G3BB 4QEQA 3ATNA 5HMJA 1GBYA 2DQIY 3FI7A 4NEBA 4G4CA 2I25L 4XN6A 1LHIA 1LMNA 3TXKA 2LZTA 4H9BA 3RT5X 1GF7A 2W1YA 3HFMY 1IC7Y 1CJ8A 1LSAA 1GDXA 2HTXA 3TXEA 2XTHA 1XEIA 4HPIA 4LT0A 1TCYA 2BQCA 3WU9A 1J1XY 4ET9A 4B4IA 4RLMA 1GB0A 3TXGA 4H91A 5KKJA 2D4JA 3TXJA 1OUAA 2Z38A 1LKRA 4H9EA 4I8SA 4PGJB 1DZBX 4G4HA 5I4WA 2MEBA 1DQJC 1LZ6A 4J1AA 1B7PA 1IR7A 2HU1A 4XJDA 4A7DA 2HU3A 1HNLA 4NG8A 1LSNA 2G4PA 4ANRA 1D6PA 1OUGA 4CFOA 1GF6A 1B5YA 4Z46A 1DXJA 1IIZA 1LSMA 1HF4A 3ZVQA 2MECA 1DKJA 1GFUA 1DI4A 3BKHA 5AMYA 5LYZA 4HTNA 4D9ZA 3BKVA 1JITA 1T6VL 5HMVA 2YBJA 1RE2A 1NMMA 1DPWA 4NG1A 4ET8A 1E8LA 4HV2A 4QDNA 2NWDX 2YBIA 1LYSA 4LT2A 1GB2A 2ZILA 5LA8A 2BLXA 2MEHA 2ZIKA 5C6IA 1GE2A 1GFVA 4GCEA 3M18B 3CT5A 5D5FA 1GFEA 1GAZA 5LVJA 1F10A 1FKVA 1UIBA 1IEEA 4XJBA 5DM9A 4ETCA 1LJEA 1H87A 3CSQA 5ILCA 4RW1A 5KXOA 4ETAA 1NHEA 2MEGA 4NGKA 3AGGG 2Z39A 1YAQA 1N4FA 1LZGA 2Y8PA 4OWEA 4LYMA 4CGEA 1BB4A 1Z55A 1BB7A 2YVBA 3A8ZA 1W08A 4OWHA 3N9EA 2BQMA 4N1EI 1CKDA 2I26L 3IJVA 1LZ5A 3A6BY 1ALCA 2YBMA 2Z37A 1V7SA 2G4NA 1F6RA 3WPKA 1HEWA 4RW2A 4H1PA 3T6UA 3P65A 1B7SA 1ZVYB 5APFA 5I4YA 1BGIA 1HELA 3A91A 1KXXA 1LSFA 4PJ2C 5LAFA 5JENB 1HFZA 1LZRA 1GPQC 5F14A 4CFPA 4B4EA 4LGKA 134LA 4DD9A 9LYZA 133LA 1GEVA 4J0LA 4XADA 2HECA 1HEOA 1AKIA 1B0DA 1B7MA 1UC0A 2I6ZA 5M1YA 5KXXA 4M4OA 2CDSA 154LA 4HJYA 1B7NA 1CKGA 3K3TA 5D5CA 1C46A 1D0LA 1IP5A 4GN3A 1LZDA 1AT5A 1UIHA 1OUCA 2D91A 4H9FA 5FELA 5C6LA 3WUMA 2DQAA 3B6LA 4NWHA 2BLYA 5L3HA 4QGZA 5ILFA 4CJ2A 1GE3A 4Z98A 4HJZA 1B2KA 1GE4A 1INUA 4NSIA 2BQJA 4UWVA 1B9OA 1GB5A 5APDA 4TX7A 3TXBA 3A3QA 1UACY 3AGIA 1LJNA 1LMPA 1B5WA 3WMKA 135LA 4N1CC 3N9CA 3W6CA 4NGZA 4ETBA 2LYMA 3LHMA 4DC4A 4N0JA 4BADA 1W6ZA 2HEAA 1VDPA 2ZNXY 5F9XA 4YOPA 2AUBA 1LJ4A 1WQMA 5T3FA 4OWAA 4WL6A 1GF3A 4LYZA 2LHMA 1HSXA 4CHXA 5B59A 3P64A 2D4KA 2DQDY 4OW1A 3WU7A 1GBZA 1IP6A 2LZ2A 1OQMA 1YL0X 4LYBA 3WPLA 1JUGA 1YKYX 3G3AB 3P66A 2IFFY 4DYGA 3J4GA 5B05A 3WPJA 6LYTA 1YAMA 4FJRA 1OUDA 3ATOA 5KXMA 1CJ7A 1HFXA 3D9AC 4WO6A 5FDJA 1LZYA 2BQGA 3EXDA 1UIGA 1LZAA 5KXLA 1IWZA 3TXIA 1LTMA 4H8ZA 1MELL 1LHJA 1GFHA 1KXYA 5KXTA 2YBNA 4NGOA 4U3XB 1BHZA 1XEKA 1FN5A 1WVVA 4E3UA 2Z19A 1IOTA 1BB3A 2HEDA 3RU5A 1NBYC 2CGIA 3LYMA 1GF5A 2EIZC 4BAPA 3AW7A 5KXSA 5KKIA 1C43A 2BQNA 1IO5A 4KL7A 4XJIA 3AZ5A 4H8XA 3CQLA 1IP2A 4NWEA 5C6JA 1YL1X 1B5UA 3IJUA 1GB7A 1JWRA 4HTQA 4WM2A 4YF2A 2MEAA 5DL9A 1OUFA 1B7LA 1IX0A 1LZSA 1VDQA 1ZV5L 4H92A 4NGLA 1XGUC 1YAOA 2WARA 5F9UA 4OWBA 3RZ4A 4WOAA 1FLWA 4ETDA 1BWJA 4XJFA 5LVHA 4I0CA 3J6KA 5E4PA 1UIAA 1GB6A 2HEEA 4OOOA 5LAGA 2IHLA 1GF8A 2Z2FA 3F6ZA 4G9SA 3TXDA 1HEMA 2BQKA 2BQOA 4NSHA 1WVUA 4TSBA 2DBTA 1B7RA 3M3UA 4LT3A 1BVKC 1LSZA 4H8YA 1HENA 3A96A 1YILA 1LHHA 5HQ1A 1GFGA 4ETEA 1IP3A 4B1AA 2C8PA 3AB6A 1GFJA 2BAAA 3MGWA 2CWIA 1JJ1A 2X0AA 4NGIA 2D4IA 1LMOA 1IP4A 3W6EA 1YIKA 1LPIA 1LZ9A 2XBRA 1BB6A 4RLNA 1JKDA 3A3RX 1FLYA 1WQQA 3HBHA 1UICA 4W94A 1REXA 3B72A 4H9HA 3TMXA 1FLQA 1QTEA 1ZMYL 4N5RA 2FBDA 2YDGA 1QIOA 1V7TA 2ZQ4A 2ZWBA 1IC5Y 1LJIA 1GFTA 3B0KA 4DDBA 3IWRA 4LFXA 3RW8A 1JIYA 1LSPA 1NWGA 1G7LC 1QSWA 1QQYA 3AZ6A 5E9RA 3QY4A 4EOFA 4B0DA 6LYZA 2N5ZA 1VEDA 3WH1A 4PRUA 4RDSA 1FBIX 1B5XA 3D3DA 1GF0A 4PPOA 5KXYA 2D6BA 4XYYA 1B7OA 1GB8A 2XBSA 4P2EA 4UWNA 4KT3A 1AT6A 4G49A 3QE8A 1GFAA 1GBSA 1GEZA 1LOZA 4NGJA 4TUNA 4WO9A 4YENA 208LA 3AW6A 5KXPA 4H9AA 1JKCA 2FYCA 1REYA 1HEPA 5FHWA 1JSFA 1GF4A 1TBYA 2C8OA 2Q0MX 3AYQA 1VFBC 1LAAA 4HP0A 4J7VA 4NHSA 1O23A 2CJLA 4KXIA 5DN5A 4DD2A 1HEQA 1LJHA 1BWIA 1C45A 4LYOA 4MCKA 1VAUA 1GFKA 1YKXX 4H94A 1B7QA 4HV1A 5B1FA 3WW5A 4LT1A 1B5ZA 1LHKA 1MLCE 4NFVA 4W96A 5DN4A 1XEJA 4NHTA 5APEA 5K7OA 2Z12A 1GBOA 1P2CC 1LKSA 1IORA 1LJFA 1GDWA 3A6CY 4IATA 1GFRA 2HEBA 4FDYA 1CKCA 1XSFA 1DI3A 4KPMA 1D0KA 2DQGY 4WM6A 1XGRC 1D9UA 4NIJA 5HNLA 5LYTA 1OUEA 4H9CA 1G7HC 4GLAA 4XJGA 1UBZA 5KXRA 2YBHA 1UIFA 5B1GA 2EPEA 1IWXA 1CJ6A 4GLVA 5F81A 1LJKA 4XENA 3ULRA 1LHMA 2EQLA 4NGWA 1JEFA 4WLTA 3LYTA 1OUHA 4TSCA 3W6FA 5HLLA 1GBXA 3T36A 1C08C 4R0FA 1LJGA 1F0WA 4DDAA 2H9JA 4WMGA 4O34A 4WLYA 3WULA 2B5ZA 1CNSA 3ZVQB 1BB5A 2H5ZA 3WUNA 2ZYCA 4WL7A 4WM5A 1C7PA 4HPEA 5LA5A 153LA 4C3WA 5IELA 1UA6Y 2BQHA 1QDTA 3TXFA 2YSSC 5L3IA 4N8ZA 3WUAA 4H93A 1LZEA 4WM1A 4DD0A 1VDTA 1LMCA 1LZCA 2LYZA 4II8A 5FEKA 5L9JA 4PRQA 5I53A 2DQEY 2DKVA 4DDCA 2XJWA 3LZ2A 1DI5A 1GXV2 4OOTA 5LXWA 207LA 1LZ8A 1EQEA 3TMUA 4LFPA 1J1OY 4IJ4A 1IY3A 3A34A 1IWWA 1YKZX 1CKHA 3HBEX 2FYDA 1IY4A 4H9IA 4DWXA 1RFPA 1UIDA 1WQOA 2Z2EA 4L41A 3A92A 1JKBA 4DD7A 3W6BA 3CT0A 3W6AA 1HHLA 3LYZA 1I1ZA 1ZVHL 4NY5A 5KXWA 2W1LA 3WU8A 5HNCA 3EMSA 1LYOA 2DQFC 4HTKA 3WL2A 7LYZA 1LJJA 4IASA 5FSTA 3WYHA 4TWSA 4G4BA 5LIOA 1T3PA 4R6CA 2ZIJA 1DPXA 1OUIA 2FBBA 3SP3A 3KAMA 1LZBA 1UUZC 5EBHA 1IP1A 2BPUA 1VATA 1WQNA 2MEDA 5J7CA 1RJCB 2EKSC 1IC4Y 2H9KA 1XGQC 2ZQ3A 3E3DA 1LMQA 3HBDA 5LYMA 1YANA 2ZYPA 2BQDA 5B07A 5A3ZA 1GB9A 1JTPL 3CT1A 4GN5C 5DLAA 1LJ3A 1OUBA 3B0IA 3W3EA 4OWCA 2MEEA 1JJ0A 4DD3A 5IHGA 2BQBA 4YEOA 1G7IC 1LSYA 4XJHA 5F16A 1FKQA 4YEMA 1HERA 1JJ3A 2F4AA 4BAFA 1D0MA 1GAYA 1IR9A 3EO5A 4M6DA 1CKFA 2BQLA 3CSZA 4PHIA 4AXTA 1LZTA 1AM7A 1WTMA 4WG1A 5KXNA 1NBZC 4GCBA 4EMNA 3WW6A 1LSCA 1NQIA 3WXTA 1LMTA 3RNXA 4MR1A 5LVIA 1LZ1A 2F2NA 1LSBA 1LSDA 4H90A 5LVKA 1BWHA 1LSEA 1EQ4A 1NDGC 1OUJA 3A95A 1PS5A 2RSCA 2YBLA 2BQFA 1HC0A 3FE0A 2F30A 3A93A 1LYZA 1IOQA 3OK0A 3W6DA 1HSWA 1LYYA 1UIEA 1B5VA 1LHLA 1QDRA 1WTNA 4Z3MA 2HEFA 3A90A 1FLUA 4B4JA 1XFPL 2GV0A 1G7MC 3QNGA 1QUSA 1SLYA 2DQJY 1J1PY 2ZNWY 4WG7A 1QUTA 1SQ2L 2MEIA 4TTDA 3AJNA 1IWVA 2W1XA 1IOSA 4B49A 4DD1A 1GD6A 1IWYA 3N9AA 3CB7A 5LINA 1JISA 1BQLY 4C5FA 1BVXA 4LYTA 4WM4A 3LZTA 1I20A 1GHLA 1RCMA 4YM8A 1OP9B 4GCCA 2DQHY 1GB3A 5II3A 4HJVA 4WLXA 4NHQA 1RI8B 4GCFA 3TMWA 2DQCY 1IOCA 1YQVY 1GXXA 1EL1A 1KXWA 1WQPA 1LZ4A 2F4GA 1IWUA 1HFYA 1LZNA 4MSTA 1YROA 1EQ5A 1YAPA 3A67Y 1HMKA 4QY9A 8LYZA 1REMA 2BQAA 3P68A 4ZEEA 4J1BA 1IP7A 2VB1A 3AZ7A 1IWTA 1PZYA 1REZA 1WQRA 4LYCA 2A7FA 4ZIXA 1GWDA 1JTOL 4NHIA 1VDSA 3CSRA 5B06A 132LA 1GE1A 3TMVA 1AZFA 1QSAA 4N9RA 4NGVA 1GBWA 1TDYA 1TAYA 5FCPA 2HUBA 1C10A 1D6QA 1IVMA 4Z41A 1KIPC 2Z18A 3WVYA 5LVGA 5I4XA 1DKKA 1JHLA 1CJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JTMA 1SX2A 187LA 3GXRA 150LA 3OJPA 3VWOA 4WLDA 4S0WA 3GXKA 1JKAA 1NKHA 4ARQB 151LA 247LA 1G7JC 3C7ZA 104LA 1UCOA 1I56A 1OV7A 1KIQC 1LSGA 2CUUA 3LYOA 3TXHA 1L97A 4AGAA 194LA 4QEQA 1GBYA 152LA 3HTGA 1L62A 1ZYTA 2NTHA 1GF7A 3RT5X 3ODUA 1IC7Y 1CJ8A 1GDXA 4LT0A 1J1XY 4H91A 1QS5A 3TXJA 4I8SA 1DZBX 2RBQA 1DQJC 4XJDA 1L63A 1LSNA 2G4PA 3FI5A 1OUGA 1B5YA 4EJ4A 4W57A 1HF4A 1G0QA 4HTNA 3C81A 2YBJA 4ET8A 1E8LA 4HV2A 2YBIA 1GB2A 2BLXA 2RBRA 2ZIKA 2F47A 262LA 1F10A 2OEAX 1H87A 4RW1A 120LA 4CGEA 225LA 3A8ZA 1BB7A 4OWHA 2BQMA 4N1EI 230LA 3A6BY 1ALCA 2NTGA 190LA 4H1PA 253LA 1BGIA 1G07A 1L51A 4I7LA 1HFZA 1CV5A 1GPQC 3RUNA 4LGKA 1GEVA 1L16A 3V2YA 3K2RA 1UC0A 2I6ZA 195LA 128LA 201LA 173LA 1UIHA 1AT5A 3WUMA 4NWHA 2BLYA 1L70A 1QTZA 1LYFA 4NSIA 4UWVA 1B9OA 1GB5A 1LJNA 1LMPA 1P3NA 143LA 4N1CC 4NGZA 1LYIA 3LHMA 2HEAA 1PQIA 5F9XA 5T3FA 1L20A 4WL6A 1DYFA 1CX7A 1C69A 1GBZA 1DYCA 259LA 3WPLA 1YKYX 3G3AB 3P66A 1CUPA 2IFFY 3J4GA 1L46A 5KXMA 3D9AC 1L48A 1L68A 1C6AA 1L01A 1UIGA 3DN8A 161LA 4NGOA 4U3XB 1B6IA 2HEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3B0O A;  1XGP C;  1FDL Y;  2BQI A;  2LYO A;  3AGH A;  5IDD A;  3LN2 A;  3GXR A;  5KXZ A;  3ZEK A;  3OJP A;  2BQE A;  4HSF A;  3VWO A;  5I54 A;  4UWU A;  4WLD A;  5KJ9 A;  3GXK A;  1H6M A;  1TEW A;  3WXU A;  193L A;  4DT3 A;  1JKA A;  3EBA B;  4NGY A;  4GN4 A;  1NKH A;  4NSJ A;  2W1M A;  3AZ4 A;  4X3B A;  4WM3 A;  1G7J C;  3A94 A;  4NSG A;  1HML A;  1IR8 A;  1JPO A;  1KIR C;  1LMA A;  4GCD A;  5APC A;  4NHP A;  4ML7 A;  1UCO A;  1I56 A;  5KXK A;  1NF5 A;  2A7D A;  4ZFP A;  4LZT A;  2PC2 A;  1KIQ C;  1LSG A;  2G4Q A;  1QTK A;  1NDM C;  1GF9 A;  1A2Y C;  5A3E A;  3TXH A;  3LYO A;  1GE0 A;  1JSE A;  1JTT L;  5I5Q A;  5KY1 A;  1A4V A;  1XGT C;  4AGA A;  3WVX A;  3P4Z A;  194L A;  1LCN A;  4BS7 A;  2MEF A;  1F6S A;  3G3B B;  4QEQ A;  3ATN A;  5HMJ A;  1GBY A;  2DQI Y;  3FI7 A;  4NEB A;  4G4C A;  2I25 L;  4XN6 A;  1LHI A;  1LMN A;  3TXK A;  2LZT A;  4H9B A;  3RT5 X;  1GF7 A;  2W1Y A;  3HFM Y;  1IC7 Y;  1CJ8 A;  1LSA A;  1GDX A;  2HTX A;  3TXE A;  2XTH A;  1XEI A;  4HPI A;  4LT0 A;  1TCY A;  2BQC A; 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 1LZ1 A;  2F2N A;  1LSB A;  1LSD A;  4H90 A;  5LVK A;  1BWH A;  1LSE A;  1EQ4 A;  1NDG C;  1OUJ A;  3A95 A;  1PS5 A;  2RSC A;  2YBL A;  2BQF A;  1HC0 A;  3FE0 A;  2F30 A;  3A93 A;  1LYZ A;  1IOQ A;  3OK0 A;  3W6D A;  1HSW A;  1LYY A;  1UIE A;  1B5V A;  1LHL A;  1QDR A;  1WTN A;  4Z3M A;  2HEF A;  3A90 A;  1FLU A;  4B4J A;  1XFP L;  2GV0 A;  1G7M C;  3QNG A;  1QUS A;  1SLY A;  2DQJ Y;  1J1P Y;  2ZNW Y;  4WG7 A;  1QUT A;  1SQ2 L;  2MEI A;  4TTD A;  3AJN A;  1IWV A;  2W1X A;  1IOS A;  4B49 A;  4DD1 A;  1GD6 A;  1IWY A;  3N9A A;  3CB7 A;  5LIN A;  1JIS A;  1BQL Y;  4C5F A;  1BVX A;  4LYT A;  4WM4 A;  3LZT A;  1I20 A;  1GHL A;  1RCM A;  4YM8 A;  1OP9 B;  4GCC A;  2DQH Y;  1GB3 A;  5II3 A;  4HJV A;  4WLX A;  4NHQ A;  1RI8 B;  4GCF A;  3TMW A;  2DQC Y;  1IOC A;  1YQV Y;  1GXX A;  1EL1 A;  1KXW A;  1WQP A;  1LZ4 A;  2F4G A;  1IWU A;  1HFY A;  1LZN A;  4MST A;  1YRO A;  1EQ5 A;  1YAP A;  3A67 Y;  1HMK A;  4QY9 A;  8LYZ A;  1REM A;  2BQA A;  3P68 A;  4ZEE A;  4J1B A;  1IP7 A;  2VB1 A;  3AZ7 A;  1IWT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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