5I14A

Truncated and mutated t4 lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGGGSGGDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTHSLHALQHKHWDHAAVHLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords mutated and truncated T4 lysozyme
publication title Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 44
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5i14A00
185LA 3C7ZA 2B75A 3OE6A 1L60A 1QTCA 4DKLA 1CX7A 122LA 168LA 3HH3A 1JTMA 1L94A 1L13A 200LA 2OEAX 1C68A 1C62A 1G0LA 2OU9A 1G1VA 237LA 1L81A 4I7OA 4ARJA 1D2WA 1QUOA 1L55A 1C69A 210LA 4EKSA 211LA 257LA 243LA 3DN6A 3FADA 1QSQA 229LA 3DN4A 4YX7C 1L99A 147LA 1L28A 1LGXA 1LYJA 3UONA 143LA 167LA 1L40A 2QARC 4ARQA 1L84A 1C6GA 1ZWNA 1L14A 173LA 198LA 201LA 1L44A 181LA 1L90A 2L78A 1G0KA 1L37A 1L00A 3C82A 2RB1X 3V2WA 1C6AA 182LA 2OE7X 1C65A 3HH5A 3GUOA 254LA 1L35A 1L51A 1LLHA 1L0JA 1B6IA 3HH4A 2B72A 3DKEX 189LA 3NYAA 4W51A 1QSBA 1CV6A 1D3NA 1PQIA 1L32A 1QTVA 1C6BA 245LA 232LA 2RH1A 3HUQA 4EKRA 187LA 1DYFA 1L66A 1LI6A 213LA 1C63A 240LA 2RBNA 1G0GA 250LA 1L45A 1CUPA 1I6SA 1L27A 4GBRB 1CU0A 1L12A 1L07A 2RB0X 1G0QA 224LA 4EKPA 3LZMA 4W58A 2RBOA 1L22A 4W53A 1CV5A 1QT7A 233LA 2OTZX 4LZMA 3VW7A 2RBSA 1CV0A 1LWGA 262LA 4LDOA 2Q9EA 3C81A 1KW5A 3NY9A 4OO9A 1L52A 1PQOA 3EMLA 1CV1A 149LA 209LA 1CTWA 249LA 1QUHA 1XJUA 4I7KA 3DN1A 1QT5A 1PQMA 3C8SA 3HU8A 6LZMA 131LA 1L57A 1P36A 3HTBA 3HT6A 1JQUA 1L17A 230LA 145LA 119LA 102LA 2LCBA 3K2RA 1L92A 2IGCA 178LA 1L15A 1SWYA 261LA 4E97A 1QTZA 1L06A 219LA 227LA 112LA 2OU0X 140LA 1T6HA 1SWZA 3G3XA 1LYEA 1LWKA 1DYBA 1L72A 3HWLA 1C66A 1CV3A 1L65A 104LA 1L76A 1L42A 2ANVA 1D2YA 141LA 5I14A 4W55A 1L31A 1L24A 2LC9A 156LA 1L71A 1L43A 161LA 3GUJA 1D3FA 4EXMA 1C6PA 1L38A 2A4TA 1NHBA 139LA 1L82A 1SX2A 226LA 3CDTA 2OU8A 2CUUA 1QTDA 3G3VA 1CU2A 1D3MA 155LA 163LA 4K5YA 242LA 3CDRA 1KY0A 3FA0A 259LA 1C6MA 3G3WA 3HTGA 1OVHA 130LA 2B74A 1L48A 183LA 2OE9X 4LDEA 215LA 1L83A 3RUNA 1JTNA 1L86A 1LYIA 3L2XA 3OE9A 3HTDA 1L54A 2B6YA 1OWZA 1QT4A 114LA 235LA 260LA 3GUPA 1L59A 4W54A 4EPFA 2Q9DA 3JR6A 1KS3A 192LA 195LA 1CUQA 1L19A 1P56A 148LE 1P6YA 252LA 4W52A 184LA 2F32A 1LYGA 4ARMB 3HDEA 206LA 107LA 160LA 1L67A 190LA 191LA 246LA 4I7MA 186LA 3V2YA 1C60A 1LI2A 1C6NA 1OVJA 1L20A 188LA 223LA 3F8VA 4LDLA 1L11A 236LA 3C7WA 2RBRA 239LA 2RBPA 5LZMA 3HUAA 3SB5A 2B7XA 3D4SA 1OWYA 118LA 248LA 1L70A 3DMZA 1L63A 1QTBA 1L46A 1TLAA 3DN3A 234LA 4EKQA 113LA 1D3JA 1QT8A 129LA 4PJZA 1KY1A 4W56A 3GULA 2RAZX 152LA 3HT9A 1XJTA 4AQNA 1C6EA 1L21A 2B6WA 3RZEA 1C6JA 3C80A 244LA 115LA 2NTGA 1LW9A 1T97A 2O79A 1LGWA 1L23A 3HUKA 1L91A 3C7YA 128LA 176LA 1DYDA 1L09A 1PQDA 2QB0B 1CU3A 1P3NA 1PQKA 3GUMA 1L34A 1L16A 1CV4A 3SB7A 175LA 1L87A 1L68A 2F2QA 2O4WA 1D9WA 238LA 3SBBC 1L88A 256LA 1KW7A 1EPYA 225LA 4YXAC 137LA 1L03A 1P46A 4EJ4A 172LA 4ARMA 1CX6A 258LA 228LA 247LA 1K28A 1QS5A 123LA 4YXCA 1CU6A 169LA 2HUKA 111LA 4DJHA 1SSWA 1L49A 1XEPA 158LA 1L41A 1L05A 103LA 2LZMA 1L97A 2Z6BA 1P2RA 1ZYTA 4W57A 1L93A 1L02A 1CU5A 3CDVA 3HDFA 1L79A 3C83A 1L39A 1L69A 3ODUA 1QT6A 1C67A 1L75A 1QUGA 1L26A 217LA 3F9LA 1G1WA 1P2LA 1T8GA 2HULA 166LA 3SB9A 1CVKA 177LA 197LA 3HT7A 4I7QA 4W59A 1L50A 1OYUA 3CDOA 4IAPA 1L08A 3FI5A 7LZMA 3SBAA 146LA 2B73A 3PBLA 1T8FA 3OE0A 3L64A 1P64A 162LA 1L10A 3PDSA 1G0JA 1ZURA 174LA 2RBQA 1LYFA 164LA 1T8AA 1SSYA 3C8RA 1L56A 1OV7A 1L01A 3HTFA 3QAKA 127LA 214LA 165LA 199LA 1QT3A 180LA 1C6TA 2F47A 4DAJA 144LA 1L62A 120LA 1OVKA 1L73A 4ARLA 196LA 1C6KA 3HU9A 126LA 4S0WA 2B6TA 3DNAA 3CDQA 150LA 220LA 3SN6R 3HT8A 1C6IA 108LA 1L98A 1LYDA 138LA 151LA 4I7JA 4ARQB 4PK0A 1OV5A 1L30A 4ARPA 1L29A 1L04A 3DMVA 221LA 1C6HA 3SB8A 2B6ZA 1G07A 1L58A 1L96A 1QS9A 1L80A 1LI3A 1G0PA 1L25A 218LA 3GUNA 1KNIA 1LYHA 4I7TA 1L74A 3C8QA 125LA 1G0MA 1PQJA 2B70A 1C6QA 205LA 4I7SA 2OTYX 4EPIA 1QUDA 2O7AA 170LA 1C6LA 222LA 1L18A 1P7SA 1C64A 1DYAA 4ZPUA 216LA 241LA 4I7NA 1P5CA 4I7RA 1L95A 109LA 1C6DA 157LA 1L47A 3DMXA 3NY8A 1L89A 253LA 2HUMA 3DN0A 171LA 2RAYX 251LA 2RB2X 3HH6A 110LA 231LA 1C6FA 1L61A 2ANXA 1C61A 159LA 3DN8A 1L0KA 1L36A 3OE8A 1DYCA 255LA 3DN2A 1DYGA 1L77A 1WTHA 4GRVA 1P37A 2B6XA 3GUIA 142LA 1SX7A 1L85A 1L64A 1C6CA 212LA 2OE4X 1DYEA 4I7LA 1G06A 1LGUA 4I7PA 1L33A 3SB6A 1LPYA 2NTHA 3GUKA 1L53A 1QTHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
185LA 4N9RA 5E9RA 4NGVA 1XSFA 4HTKA 4DKLA 168LA 4PRQA 5KXXA 1LPIA 5J7CA 4H9CA 4I7OA 1D2WA 1QUOA 4H90A 4ARJA 4EKSA 211LA 3DN6A 3FADA 1LJ4A 1WQPA 2BQMA 1QSQA 1FLQA 147LA 4ZFPA 4H9AA 4Z3MA 1QUSA 1KIQC 2LZTA 2YVBA 1L40A 4ARQA 5C6JA 1GF7A 1JPOA 2MEDA 2HEDA 1GAZA 3F6ZA 1ZWNA 2HUBA 198LA 201LA 1L00A 1IWTA 2RB1X 1C6AA 3B0OA 4OW1A 4GLVA 4OWHA 1C65A 3HH5A 1L35A 1L51A 1LLHA 4OWAA 1IWXA 4MSTA 3LN2A 1D3NA 4C5FA 1C6BA 1LHHA 5T3FA 1FN5A 232LA 1WTNA 2RH1A 3HUQA 4LYOA 2EIZC 2IFFY 193LA 5A3EA 250LA 1CU0A 4DDCA 2G4PA 4P2EA 3CSZA 4NEBA 1L07A 4W58A 2RBOA 1GFGA 1QT7A 3VW7A 1LSMA 1LYSA 1LSDA 1LWGA 5APFA 4XYYA 1A2YC 3NY9A 5FELA 1L52A 4KPMA 1CV1A 4XENA 1XJUA 4M4OA 4I7KA 1QSWA 1QT5A 5DLAA 5KXTA 4LT1A 5FDJA 131LA 3QE8A 1NDMC 3HT6A 3AYQA 1L17A 2LCBA 2HEFA 2BQJA 1B2KA 1VFBC 1L92A 3ZVQB 2Z2FA 1B5YA 4J7VA 1YKZX 2CGIA 3AZ6A 1L06A 4OOTA 1LMOA 227LA 1YL0X 1T6HA 3HBEX 4WLDA 1DYBA 1KXYA 4GCEA 104LA 1XEIA 5I14A 1L24A 4XJGA 134LA 1L43A 1D3FA 139LA 1AT6A 5I53A 1IC4Y 1HEPA 3AW7A 4UWUA 5LA8A 1CU2A 1D3MA 163LA 1XGQC 4O34A 259LA 1C6MA 1JHLA 5B59A 2B74A 183LA 2OE9X 2DBTA 1HEOA 4BAPA 1JTNA 3W6FA 3WUMA 1IEEA 4WM4A 2AUBA 1OWZA 1YAOA 5APCA 3JR6A 4WLTA 1GFJA 192LA 3LYMA 1BGIA 4ARMB 5IELA 4CFOA 107LA 246LA 2XJWA 4NIJA 5HNLA 186LA 3ZVQA 1REZA 1LSYA 1OUAA 5KXKA 223LA 1IOCA 1QQYA 1LJFA 2W1MA 3LZ2A 2Z38A 1NDGC 2RBPA 3HUAA 5HQ1A 2MEIA 4ML7A 118LA 1IP4A 4TX7A 1LZYA 1QTBA 3DN3A 1LZ9A 234LA 4EKQA 1D3JA 5D5FA 4N0JA 1GF0A 3W6CA 5JENB 4W56A 3GULA 2RAZX 2Q0MX 3HT9A 1LYOA 1VEDA 3AZ7A 2O79A 4H8XA 3HUKA 1L09A 1PQDA 1DYDA 1IP5A 2QB0B 1DI3A 1JJ3A 5L9JA 1L16A 1P2CC 2X0AA 1LZTA 1GFUA 4N5RA 1G7LC 4H1PA 1D9WA 1GF4A 238LA 3WU9A 256LA 1JWRA 3AGHA 1L03A 4EJ4A 4ARMA 1IWVA 1IWWA 1LMTA 5B1GA 228LA 247LA 123LA 1VDSA 3WH1A 4GCBA 1XGPC 5LVKA 2HUKA 111LA 2A7DA 5EBHA 1GAYA 2LZMA 1TDYA 5HMJA 4ET8A 1B7PA 1DPWA 1L02A 5E4PA 1DI5A 1L39A 1L69A 2ZQ3A 3ODUA 4GCDA 5LYTA 1L75A 1LJJA 1JTPL 1YL1X 1GHLA 2HULA 1C08C 1CVKA 3HFMY 1YAPA 4B1AA 3D9AC 1L50A 1OYUA 194LA 2HEBA 5A3ZA 1CJ7A 162LA 4KL7A 1B7SA 1QSAA 1ZURA 2RBQA 3WXUA 164LA 2G4NA 1SSYA 4LZTA 1MELL 4PPOA 1QT3A 1DXJA 1HF4A 180LA 3HBHA 5LVIA 1OUFA 3RU5A 4GN4A 1L73A 2W1YA 3HU9A 3CDQA 5I54A 1LYDA 2CDSA 1GXV2 1GFRA 1LSNA 4I7JA 4PK0A 1LJHA 3N9EA 1L30A 4NHQA 1C6HA 1Z55A 2B6ZA 2W1LA 1ZV5L 1L80A 4XJDA 5KXSA 4ETEA 4HJZA 3A8ZA 1UICA 1L74A 125LA 4H9EA 3A67Y 4LT2A 1PQJA 4EPIA 4C3WA 1UA6Y 170LA 3IJUA 1DYAA 4G9SA 216LA 3AGIA 4AXTA 1V7SA 1L47A 3DMXA 171LA 4CFPA 1HEQA 2BQOA 1C6FA 4J0LA 2ANXA 4NGWA 2XBRA 1L0KA 3WPKA 255LA 1DYGA 1L77A 4DD1A 3RZ4A 1P37A 3TXHA 1L64A 1LSGA 1QIOA 4NWEA 212LA 1LJNA 3W6EA 1LPYA 1QTHA 4A7DA 1NWGA 2XQOA 2B75A 3C7ZA 1LCNA 2DQDY 1QTCA 1DKKA 4DQ7A 4LYTA 4L41A 2OEAX 1C68A 237LA 210LA 3B6LA 1CKGA 1L28A 143LA 167LA 1XGUC 3SP3A 2EPEA 6LYTA 1IOTA 4G4HA 173LA 3A94A 1L90A 2L78A 1L37A 4DDAA 3C82A 3CT5A 4WM1A 1LHIA 2NWDX 1B7LA 2B72A 2LYMA 1GE2A 1INUA 1CV6A 1B7OA 1IX0A 1L32A 3J6KA 4RLMA 1CJ8A 4TWSA 1ZVHL 4XJIA 3GXKA 1NMMA 1L66A 1D0MA 1LI6A 2ZIKA 4EKRA 3WYHA 4TSCA 4WL6A 1C63A 240LA 3AJNA 1NHEA 1L45A 1I6SA 1D0LA 1L12A 3TMUA 2RB0X 3TMVA 1REYA 1JKAA 4W53A 3RNXA 2RBSA 5LVHA 4LDOA 3TXIA 1BB6A 1IVMA 2D4IA 1PQOA 3CT0A 3TMXA 1QUHA 2N5ZA 1LYYA 3DN1A 1LHLA 1PQMA 3HU8A 4WM2A 4TTDA 4ETCA 1WQNA 3HTBA 5FHWA 230LA 2HU3A 5LAGA 5C6IA 119LA 1GBZA 4W96A 5KXYA 1IR7A 2YBHA 154LA 1D6QA 1I1ZA 1LZ1A 1CKCA 1HC0A 261LA 4E97A 2C8PA 3M3UA 2OU0X 112LA 140LA 1SWZA 1GFHA 1LWKA 1GWDA 4YM8A 1L72A 3HWLA 1CV3A 1KIPC 4II8A 2ANVA 2BQGA 2FBDA 4B4JA 4W55A 2Z37A 1ZVYB 4WLYA 156LA 1UC0A 1C6PA 2A4TA 1NF5A 3MGWA 2I25L 1SX2A 1LKSA 5I4YA 226LA 2OU8A 2CUUA 1RCMA 155LA 4RDSA 4K5YA 4WMGA 2W1XA 3M18B 1IP2A 3CDRA 1RI8B 3G3WA 1OVHA 1YKXX 1LSPA 2BQLA 4WO9A 3G3AB 1L48A 4J1AA 4LDEA 215LA 1LKRA 1HELA 3IWRA 3BKVA 2D91A 2HECA 3HTDA 1L54A 2B6YA 4BADA 1SLYA 235LA 114LA 260LA 5LYZA 4W54A 4EPFA 5KY1A 4UWVA 4PRUA 1CUQA 1WQRA 1B5VA 2H5ZA 4CHXA 1HSWA 1HFYA 1BB3A 191LA 1GB7A 1D6PA 1OUCA 1CNSA 3EXDA 4I7MA 3TXKA 1LI2A 1OVJA 4QEQA 1REXA 1I20A 2MEFA 4HP0A 4BS7A 1I56A 5II3A 4LDLA 5KKIA 236LA 239LA 207LA 5LZMA 1YIKA 4LT0A 3TXJA 2G4QA 3SB5A 4ETDA 1NKHA 248LA 1GBOA 1GXXA 4XJFA 1L63A 2VB1A 2RSCA 1XEKA 113LA 2I26L 1G7HC 1QT8A 2EKSC 1LZAA 208LA 6LYZA 1C6EA 1LSAA 3C80A 2LZ2A 244LA 1LHJA 4DD3A 128LA 1CU3A 2A7FA 1PQKA 1LZ8A 1CV4A 1IC7Y 1GBSA 1FBIX 1L87A 3WW5A 1VAUA 4H8YA 1L88A 225LA 1EPYA 137LA 2BQBA 1XEJA 172LA 5AMYA 1EQEA 3GXRA 1UBZA 1CX6A 1GFEA 1T3PA 3WU8A 1VDQA 4YXCA 1B5WA 1BVXA 1L49A 1L41A 4OWEA 2Z6BA 4W57A 1LJGA 1LSFA 1L79A 3C83A 1LZRA 1LSZA 4HV1A 3ATNA 2BQAA 1L26A 217LA 1GF3A 3F9LA 4H91A 1G1WA 3AZ4A 4NGJA 1GFVA 1B0DA 4B4IA 1UUZC 177LA 4QY9A 2ZWBA 3AZ5A 4NHSA 3IJVA 5F9XA 1L08A 1EQ5A 2DQFC 1UIAA 1OUIA 3SBAA 2YSSC 1QDTA 1LJ3A 1G0JA 153LA 4LT3A 3TXFA 1QUTA 3ATOA 3N9CA 1LMPA 1LJIA 3J4GA 1UACY 3TMWA 1GF9A 1JITA 3CSQA 3QAKA 127LA 165LA 2DQHY 2F47A 2WARA 4ARLA 3CSRA 1C6KA 1LSCA 3OJPA 4G4CA 4ZIXA 4ANRA 4S0WA 1VATA 1YKYX 3DNAA 150LA 3SN6R 1C6IA 108LA 3LHMA 133LA 2HEEA 2FYCA 1OV5A 5L3IA 1L29A 1AT5A 1JJ0A 1L04A 1BB7A 1G07A 4XJBA 1GB2A 1L96A 1L25A 1J1PY 218LA 4I7TA 1GE4A 3A6CY 1G0MA 2B70A 205LA 2OTYX 1LZ6A 1L18A 4ZPUA 2MECA 4I7NA 1P5CA 1L95A 109LA 5C6LA 3NY8A 157LA 1A4VA 1FKVA 1L89A 253LA 1PZYA 2HUMA 4NGOA 4B49A 2RAYX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 185L A;  4N9R A;  5E9R A;  4NGV A;  1XSF A;  4HTK A;  4DKL A;  168L A;  4PRQ A;  5KXX A;  1LPI A;  5J7C A;  4H9C A;  4I7O A;  1D2W A;  1QUO A;  4H90 A;  4ARJ A;  4EKS A;  211L A;  3DN6 A;  3FAD A;  1LJ4 A;  1WQP A;  2BQM A;  1QSQ A;  1FLQ A;  147L A;  4ZFP A;  4H9A A;  4Z3M A;  1QUS A;  1KIQ C;  2LZT A;  2YVB A;  1L40 A;  4ARQ A;  5C6J A;  1GF7 A;  1JPO A;  2MED A;  2HED A;  1GAZ A;  3F6Z A;  1ZWN A;  2HUB A;  198L A;  201L A;  1L00 A;  1IWT A;  2RB1 X;  1C6A A;  3B0O A;  4OW1 A;  4GLV A;  4OWH A;  1C65 A;  3HH5 A;  1L35 A;  1L51 A;  1LLH A;  4OWA A;  1IWX A;  4MST A;  3LN2 A;  1D3N A;  4C5F A;  1C6B A;  1LHH A;  5T3F A;  1FN5 A;  232L A;  1WTN A;  2RH1 A;  3HUQ A;  4LYO A;  2EIZ C;  2IFF Y;  193L A;  5A3E A;  250L A;  1CU0 A;  4DDC A;  2G4P A;  4P2E A;  3CSZ A;  4NEB A;  1L07 A;  4W58 A;  2RBO A;  1GFG A;  1QT7 A;  3VW7 A;  1LSM A;  1LYS A;  1LSD A;  1LWG A;  5APF A;  4XYY A;  1A2Y C;  3NY9 A;  5FEL A;  1L52 A;  4KPM A;  1CV1 A;  4XEN A;  1XJU A;  4M4O A;  4I7K A;  1QSW A;  1QT5 A;  5DLA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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