5II3A

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme and compound 3, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ii3A00
1JJ1A 5C6IA 1GF5A 1HEQA 3OK0A 1ZVHL 4XYYA 1INUA 5I5QA 4Z41A 2FYDA 1HFYA 2G4NA 2YSSC 5JENB 1UICA 3WU7A 1LSMA 1NBYC 2YBMA 4DDAA 1XGTC 3AZ5A 3WXTA 1B7NA 1XGPC 1B9OA 2BQGA 4DD1A 4ETCA 1GFAA 1GDXA 1GBXA 2ZYCA 1DI5A 1LJ4A 1GPQC 4B4JA 2GV0A 4BAPA 1KXXA 4AGAA 4EMNA 2D4IA 2ZQ4A 5KXYA 5LVKA 4ETEA 4M4OA 4NGIA 1TDYA 4Z3MA 3TXGA 1GF8A 2DQFC 3WPKA 4CHXA 5E4PA 4M6DA 1HFZA 4EOFA 5ILFA 9LYZA 5C6LA 1LAAA 3F6ZA 5LXWA 3WH1A 4ET8A 1LHIA 1GB3A 1GHLA 3HBHA 2BQKA 1OUGA 1GFTA 3CSZA 2I25L 4NG1A 3WL2A 2N5ZA 4DD2A 2FYCA 4GCCA 1WQQA 1JKAA 1JSEA 5E9RA 4LT2A 1B7QA 1IC7Y 3AZ6A 4OWEA 1EQ4A 1GBWA 5KXNA 3A8ZA 1REMA 4RW1A 5F14A 193LA 1D0LA 1IC4Y 1PS5A 1UIGA 1HHLA 2BQCA 4BS7A 4GLAA 4E3UA 4LYZA 1KIRC 1YL0X 4HPIA 4HSFA 4YOPA 2ZYPA 4B49A 1LZCA 1LYOA 1LZAA 1QQYA 1IR7A 1E8LA 3J4GA 3AGIA 1OUCA 3FI7A 5LIOA 6LYTA 1YIKA 2MEHA 3RU5A 4HTKA 1UUZC 1GB9A 4FDYA 3B0OA 5II3A 1JUGA 1T3PA 3CB7A 1AKIA 5HLLA 1LZYA 1JEFA 1QUTA 3KAMA 3RT5X 2MEIA 1HMKA 3EO5A 2DQAA 3N9CA 4I0CA 1IR9A 1GE1A 5KXXA 5L3IA 1UIHA 3TMWA 1HELA 2C8OA 4NGYA 1UACY 3EBAB 5M1YA 1LZ8A 5J7CA 3LZ2A 5B59A 4H8YA 4NGKA 1WQNA 1LPIA 1J1OY 1GE0A 3WXUA 1VATA 2BQBA 4LFPA 2D4JA 1A2YC 1GF6A 4DD9A 5I4WA 3WVXA 1LYZA 4WM3A 5HMVA 3D9AC 1YANA 1G7IC 1IWXA 4LYOA 3FE0A 2ZIKA 1YAPA 4H91A 2Z2FA 5DLAA 4NHIA 1BGIA 1IY4A 2BQDA 1GBSA 1IWWA 3A34A 3TXFA 1HF4A 4W94A 5APCA 3CSRA 3WU8A 3RNXA 1FLQA 1IWUA 2BQAA 3LHMA 1NHEA 3P66A 2MECA 4L41A 1DI3A 3D3DA 4H8XA 5B06A 1LSPA 1CKCA 1OUFA 4N5RA 1BB3A 1DKKA 2XTHA 1LJNA 5F16A 1MELL 1WTMA 1EQEA 1FN5A 3A67Y 4W96A 3SP3A 4H1PA 154LA 3WUNA 4KL7A 1UCOA 4GN5C 3TMXA 2IHLA 4YEMA 2H9JA 1DI4A 2LYMA 1IEEA 4WO9A 1LJEA 5B07A 2LYZA 2D91A 1YQVY 4G9SA 1UBZA 5FCPA 1P2CC 2Z38A 1IWTA 8LYZA 4PHIA 4PGJB 3AYQA 5DM9A 1QDRA 2BQJA 1OUEA 3T36A 1XGQC 3ULRA 2LYOA 1DKJA 1JHLA 2LHMA 3MGWA 4H9AA 1GFUA 2F30A 4TUNA 4RW2A 4CJ2A 3BKVA 1LHJA 2DBTA 2EIZC 3LYMA 1GEVA 2B5ZA 4NWHA 3TXIA 1GDWA 1CJ7A 1SLYA 3ATOA 4NHQA 5KY1A 1MLCE 2Z2EA 1JJ0A 1OUDA 4LT3A 1B0DA 1IORA 1GE3A 1GF4A 2ZIJA 2YBHA 3RZ4A 4PRQA 1FBIX 5KXMA 4WLDA 1UIFA 3M18B 4NSHA 1GBZA 2A7DA 3TXDA 4DDCA 2RSCA 1RJCB 4LZTA 3CT1A 1IP5A 4H9HA 4HJVA 4LT0A 4KPMA 3IWRA 5C6JA 4H90A 2AUBA 1J1PY 1O23A 1G7LC 4YF2A 4HTNA 4OWBA 2BLXA 1GE2A 1QSWA 3K3TA 1GF9A 4B1AA 3LYTA 5LAFA 134LA 1GF0A 1D0KA 1HFXA 3ZEKA 1F0WA 4XENA 4OWHA 2F4GA 4GCFA 1LJFA 3WUAA 1QIOA 3N9AA 1N4FA 1VDQA 4FJRA 4UWNA 133LA 1BB6A 3WW6A 153LA 2YBIA 1LSEA 1GFRA 1D0MA 4XJBA 1CKHA 1YAMA 1SQ2L 4NGOA 5LA8A 3A92A 4XJIA 1IWVA 3LYOA 4DC4A 3A3QA 4RLMA 1WQOA 5LYTA 2HU3A 2Z18A 4PRUA 1BB5A 1XEKA 2MEEA 1UA6Y 1WVVA 1QUSA 1J1XY 3B6LA 4NGZA 3G3BB 1B5XA 4QGZA 4CGEA 3WMKA 1B5ZA 1QTEA 3EMSA 4II8A 4YM8A 5I4YA 2G4QA 3AJNA 5A3ZA 5EBHA 1XEIA 3GXRA 4GCEA 1WQPA 4LGKA 3RW8A 2CJLA 1LSDA 6LYZA 7LYZA 5KJ9A 1C7PA 2YBJA 1C43A 3W6DA 1CNSA 2I26L 5A3EA 2YBLA 1B7MA 1IP1A 2A7FA 3W6FA 5KXLA 1JKBA 1F6SA 1GF3A 1NDGC 4DD7A 1DZBX 3A90A 1D9UA 4XN6A 5HMJA 4XJHA 2VB1A 2F2NA 4N0JA 2DKVA 1I20A 3P4ZA 1B5UA 4GCDA 132LA 3P68A 1LZ5A 1JTTL 1IP4A 5I4XA 1YKXX 1W08A 4R6CA 2BQIA 2ZILA 3OJPA 4QEQA 1IOCA 4UWUA 5IELA 1UIBA 2LZTA 1GBYA 1NWGA 2FBBA 2XBSA 4N8ZA 4PJ2C 4WG1A 4NGVA 1I56A 3B72A 4R0FA 4H93A 1HC0A 4G49A 2ZQ3A 2BPUA 4HJYA 4ZIXA 3BKHA 3A3RX 4C5FA 4IASA 5L9JA 1GF7A 2ZNXY 4MCKA 2BQNA 3QNGA 1LHLA 2BLYA 3WYHA 4WL7A 1IOQA 1YL1X 2WARA 1BWJA 5DL9A 5F9XA 5LA5A 4G4BA 3A95A 1ALCA 4CFPA 1CKFA 1B5YA 4OWCA 2FBDA 3M3UA 1C08C 1W6ZA 4NWEA 1KIQC 1ZV5L 1JWRA 1JTOL 1YKZX 2YVBA 3VWOA 1B7OA 2BQFA 4N9RA 2MEDA 135LA 1DXJA 1OQMA 1Z55A 1IR8A 1HEPA 3CQLA 1I1ZA 4ETBA 5IHGA 1KXWA 2CGIA 2HEAA 3ATNA 4TWSA 5K7OA 1HMLA 4LYMA 4TX7A 4HJZA 1VDTA 4C3WA 4DD3A 1LJ3A 4ZEEA 1LZSA 2YBNA 1AZFA 2XBRA 3J6KA 1JJ3A 1BVXA 1AT5A 2G4PA 1LKSA 207LA 2PC2A 4XJFA 3A91A 1V7SA 1BHZA 1WQMA 1ZMYL 1B7SA 4RDSA 4BADA 4DYGA 4NHSA 5FSTA 1T6VL 1ZVYB 4G4CA 1YILA 5KXRA 4HV2A 4NSGA 1GFVA 1GB2A 1LHHA 3A6BY 4KXIA 4X3BA 1C45A 4A7DA 1B7PA 1FLYA 1YROA 2DQDY 2ZWBA 2CDSA 1YAQA 5LVHA 4GN4A 2BQLA 1IWYA 1FLUA 4H9CA 1JKCA 1GB0A 1JKDA 4B4IA 4WLTA 1LZEA 4NEBA 1LMTA 1RFPA 1H87A 3WVYA 3WPLA 1TAYA 3CT0A 5I54A 1F6RA 2Q0MX 5KXWA 1REZA 1IVMA 3W3EA 3AGHA 1RI8B 4DWXA 2HU1A 2NWDX 5KKJA 4Z46A 1LHMA 4OW1A 1F10A 1UIEA 4XADA 3TMVA 1JITA 1XFPL 2Z12A 3B0IA 4B0DA 5B1FA 3T6UA 1EQ5A 1BVKC 3IJUA 1IP3A 1KXYA 5LVJA 1VEDA 2HEEA 1DPXA 2MEAA 3WU9A 1BB4A 1GB6A 4NGWA 3EXDA 2D6BA 1LZ4A 4H9EA 1LJHA 1JIYA 4I8SA 1KIPC 3AZ7A 1G7MC 1DQJC 1VDSA 2IFFY 3W6CA 1IO5A 1GWDA 1XSFA 1B5VA 1LSBA 1LZ1A 1RCMA 3E3DA 1IP7A 4P2EA 1GFGA 1NF5A 2Z39A 1NKHA 1GE4A 4YENA 1IX0A 5F81A 2BAAA 2F4AA 4MR1A 5DN4A 5APFA 2MEFA 1VFBC 4DDBA 4NGJA 1DPWA 1VAUA 5AMYA 1TEWA 3AW6A 5KXPA 1LSCA 3TXKA 4LYCA 1CKDA 1GFHA 2BQEA 1LSAA 5APEA 1BQLY 2XJWA 3WPJA 3HBEX 4Z98A 4LT1A 2DQCY 3WW5A 1LSFA 1EL1A 1LCNA 2HEDA 5HNLA 1C10A 1LMOA 3P64A 1REXA 4H9BA 3A94A 4NSIA 1A4VA 1LZGA 4J1BA 3TMUA 2EQLA 3N9EA 1NDMC 1BB7A 1LSGA 1LZNA 1FLWA 4TTDA 1JTPL 4H9IA 3WUMA 1LTMA 4ANRA 5KXKA 1CJ8A 2YDGA 3QE8A 4NHTA 5KKIA 4ZFPA 4TSCA 4H8ZA 1NQIA 1B7LA 5FDJA 2Y8PA 2D4KA 5F9UA 5FHWA 1WVUA 3A93A 1OUJA 5LAGA 1HNLA 4WM2A 2Z19A 3TXHA 4DD0A 2MEBA 5D5CA 1LMCA 5L3HA 1LYSA 4WO6A 1UIAA 4U3XB 1G7JC 1HEWA 2DQEY 4WM4A 4J0LA 4IJ4A 3WULA 1IOTA 1G7HC 2DQIY 4NGLA 4D9ZA 1LZ6A 5B05A 1IC5Y 1IP2A 1JSFA 5HNCA 2Z37A 1GB7A 2BQMA 4GCBA 4J1AA 5T3FA 1IWZA 4N1CC 1CJ6A 2EPEA 4HPEA 2C8PA 4BAFA 5FEKA 3CSQA 3TXJA 3HFMY 2HUBA 1GAYA 2HECA 1GAZA 1HEMA 1NMMA 1XEJA 1LSZA 208LA 3B0KA 4NHPA 1HSWA 4O34A 3TXBA 4DT3A 1OUBA 2I6ZA 3W6EA 1LYYA 1LZRA 1FKVA 2DQHY 1GEZA 4YEOA 5D5FA 4QDNA 1LSYA 2H9KA 3W6BA 1JPOA 4B4EA 1LHKA 1QDTA 4WLYA 1VDPA 1OUIA 3A96A 1LZ9A 1NBZC 3P65A 1UIDA 3QY4A 4LFXA 1XGUC 1FKQA 3AW7A 3LN2A 2BQOA 4G4HA 4NG8A 5KXZA 2W1XA 2BQHA 5DN5A 3ZVQB 194LA 3LYZA 1GBOA 1GFKA 1LSNA 1IIZA 4WG7A 3ZVQA 3GXKA 4IATA 1AM7A 1B2KA 1GXV2 2HEFA 1AT6A 3AGGG 1D6PA 4H94A 4LYBA 1LMPA 4GN3A 4WLXA 1WQRA 4HTQA 3LZTA 4RLNA 4TSBA 2CWIA 4NIJA 5IDDA 2HTXA 3IJVA 1GB5A 1D6QA 4ETDA 5ILCA 1GFJA 1YAOA 4H9FA 4WM1A 1C46A 5LYMA 1LMAA 1LJGA 4OOOA 4UWVA 5LINA 4WM6A 1GFEA 1LJJA 4NFVA 4ML7A 5LVIA 5KXTA 1V7TA 2W1LA 1HSXA 1TBYA 1HERA 5LVGA 2W1MA 4AXTA 1UC0A 1HENA 1PZYA 2X0AA 4KT3A 1LZBA 5I53A 5LYZA 1QSAA 4J7VA 4ETAA 1FDLY 1GD6A 4WOAA 3AZ4A 1JISA 1LZDA 3W6AA 4GLVA 4ET9A 4OOTA 5FELA 4PPOA 1YKYX 3CT5A 1IP6A 2HEBA 2LZ2A 1CKGA 1GXXA 1LMQA 4LYTA 4MSTA 1LJIA 4WMGA 1BWIA 4WM5A 1LZTA 4NSJA 4XJDA 5APDA 2EKSC 4HP0A 5HQ1A 1REYA 5B1GA 1QTKA 1H6MA 1OUAA 1GB8A 1OUHA 1HEOA 4H92A 1XGRC 1IOSA 5KXOA 1B5WA 1LJKA 2MEGA 3TXEA 3AB6A 3HBDA 4N1EI 1BWHA 4OWAA 1IY3A 1RE2A 3G3AB 2DQGY 1TCYA 1B7RA 2ZNWY 4WL6A 4QY9A 1LKRA 1OP9B 3A6CY 1WTNA 1LOZA 4NY5A 4XJGA 2DQJY 5KXSA 1CJ9A 4HV1A 4CFOA 2H5ZA 2W1YA 1LMNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RBRA 1HEQA 3OK0A 1INUA 1HFYA 1C66A 4DDAA 3WXTA 4W55A 1DYEA 3HH5A 1L15A 1D9WA 2GV0A 112LA 4ETEA 4NGIA 4YXAC 1P6YA 4CHXA 127LA 5LXWA 1GHLA 4EPFA 1GFTA 4NG1A 5E9RA 2QARC 1LYDA 2IGCA 1GBWA 1REMA 182LA 1L76A 193LA 1IC4Y 1UIGA 4LYZA 4HSFA 1QQYA 1E8LA 1L62A 2RBNA 1OUCA 4E97A 3RU5A 1GB9A 1G1VA 1JUGA 5II3A 212LA 4EKSA 5L3IA 1HELA 173LA 5J7CA 1GE0A 2D4JA 1GF6A 3WVXA 1IWXA 236LA 1L68A 1YAPA 4H91A 3DN2A 2O4WA 1GBSA 3TXFA 5APCA 3WU8A 1CU3A 1IWUA 2BQAA 1NHEA 3P66A 2MECA 1SSWA 4L41A 1DI3A 3D3DA 1KW5A 1CKCA 137LA 171LA 3A67Y 187LA 1L07A 205LA 3WUNA 1T6HA 4AQNA 4YEMA 2H9JA 1LJEA 5B07A 2LYZA 5FCPA 1IWTA 4PGJB 1L44A 3T36A 216LA 4H9AA 2B6YA 2F30A 1L00A 4CJ2A 3BKVA 1LHJA 2EIZC 3LYMA 1GEVA 4DQ7A 1SLYA 1L97A 1L05A 166LA 1B0DA 4ARQA 3M18B 4NSHA 3TXDA 2A7DA 3DN4A 4LZTA 1IP5A 4HJVA 4KPMA 3IWRA 222LA 1J1PY 4YF2A 4OWBA 4B1AA 3GUJA 1GF0A 1D0KA 1HFXA 1F0WA 3RZ4A 1VDQA 2YBIA 1LSEA 1D0MA 4XJBA 4ARLA 5LA8A 4XJIA 1IWVA 1G0MA 4RLMA 4ARMA 4K5YA 1L41A 1B5XA 130LA 1QTEA 260LA 3OE0A 1L20A 2I26L 2YBLA 230LA 5KXLA 1NDGC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JJ1 A;  5C6I A;  1GF5 A;  1HEQ A;  3OK0 A;  1ZVH L;  4XYY A;  1INU A;  5I5Q A;  4Z41 A;  2FYD A;  1HFY A;  2G4N A;  2YSS C;  5JEN B;  1UIC A;  3WU7 A;  1LSM A;  1NBY C;  2YBM A;  4DDA A;  1XGT C;  3AZ5 A;  3WXT A;  1B7N A;  1XGP C;  1B9O A;  2BQG A;  4DD1 A;  4ETC A;  1GFA A;  1GDX A;  1GBX A;  2ZYC A;  1DI5 A;  1LJ4 A;  1GPQ C;  4B4J A;  2GV0 A;  4BAP A;  1KXX A;  4AGA A;  4EMN A;  2D4I A;  2ZQ4 A;  5KXY A;  5LVK A;  4ETE A;  4M4O A;  4NGI A;  1TDY A;  4Z3M A;  3TXG A;  1GF8 A;  2DQF C;  3WPK A;  4CHX A;  5E4P A;  4M6D A;  1HFZ A;  4EOF A;  5ILF A;  9LYZ A;  5C6L A;  1LAA A;  3F6Z A;  5LXW A;  3WH1 A;  4ET8 A;  1LHI A;  1GB3 A;  1GHL A;  3HBH A;  2BQK A;  1OUG A;  1GFT A;  3CSZ A;  2I25 L;  4NG1 A;  3WL2 A;  2N5Z A;  4DD2 A;  2FYC A;  4GCC A;  1WQQ A;  1JKA A;  1JSE A;  5E9R A;  4LT2 A;  1B7Q A;  1IC7 Y;  3AZ6 A;  4OWE A;  1EQ4 A;  1GBW A;  5KXN A;  3A8Z A;  1REM A;  4RW1 A;  5F14 A;  193L A;  1D0L A;  1IC4 Y;  1PS5 A;  1UIG A;  1HHL A;  2BQC A;  4BS7 A;  4GLA A;  4E3U A;  4LYZ A;  1KIR C; 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 1GFK A;  1LSN A;  1IIZ A;  4WG7 A;  3ZVQ A;  3GXK A;  4IAT A;  1AM7 A;  1B2K A;  1GXV 2;  2HEF A;  1AT6 A;  3AGG G;  1D6P A;  4H94 A;  4LYB A;  1LMP A;  4GN3 A;  4WLX A;  1WQR A;  4HTQ A;  3LZT A;  4RLN A;  4TSB A;  2CWI A;  4NIJ A;  5IDD A;  2HTX A;  3IJV A;  1GB5 A;  1D6Q A;  4ETD A;  5ILC A;  1GFJ A;  1YAO A;  4H9F A;  4WM1 A;  1C46 A;  5LYM A;  1LMA A;  1LJG A;  4OOO A;  4UWV A;  5LIN A;  4WM6 A;  1GFE A;  1LJJ A;  4NFV A;  4ML7 A;  5LVI A;  5KXT A;  1V7T A;  2W1L A;  1HSX A;  1TBY A;  1HER A;  5LVG A;  2W1M A;  4AXT A;  1UC0 A;  1HEN A;  1PZY A;  2X0A A;  4KT3 A;  1LZB A;  5I53 A;  5LYZ A;  1QSA A;  4J7V A;  4ETA A;  1FDL Y;  1GD6 A;  4WOA A;  3AZ4 A;  1JIS A;  1LZD A;  3W6A A;  4GLV A;  4ET9 A;  4OOT A;  5FEL A;  4PPO A;  1YKY X;  3CT5 A;  1IP6 A;  2HEB A;  2LZ2 A;  1CKG A;  1GXX A;  1LMQ A;  4LYT A;  4MST A;  1LJI A;  4WMG A;  1BWI A;  4WM5 A;  1LZT A;  4NSJ A;  4XJD A;  5APD A;  2EKS C;  4HP0 A;  5HQ1 A;  1REY A;  5B1G A;  1QTK A;  1H6M A;  1OUA A;  1GB8 A;  1OUH A;  1HEO A;  4H92 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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