5ILCA

The x-ray structure of the adduct formed in the reaction between hen egg white lysozyme a compound 2, a platin(ii) compound containing a o, s bidentate ligand
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Platinum(ii) O,S complexes as potential metallodrugs against Cisplatin resistance.
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5ilcA00
3W3EA 1Z55A 4H90A 5LYMA 1IX0A 1BQLY 5K7OA 1HMKA 1LZCA 2D4IA 4WL6A 1B7SA 1JWRA 1XGRC 2ZQ3A 1PZYA 1RE2A 5B07A 153LA 1NDGC 3CB7A 3AZ7A 1IVMA 1GFRA 1B0DA 4MSTA 1NKHA 4J0LA 4KL7A 1LZ8A 4J1BA 1EQ5A 1B2KA 4WM5A 4HTKA 1JIYA 1OUIA 4H9HA 4PHIA 1B5XA 1DQJC 4W94A 1BWJA 2Q0MX 1HSWA 4GCCA 1WQRA 3P65A 4XJFA 3AGIA 1V7TA 4BS7A 1LSDA 5LYZA 3WU9A 1ZMYL 1INUA 2MEFA 5T3FA 1YAOA 4NSHA 1KIPC 4HTQA 1G7LC 1GE3A 2W1LA 3AW7A 1GFJA 3CT0A 5KXOA 1B5VA 1FKVA 2ZWBA 4DT3A 3HBHA 1IWUA 4LT1A 4FDYA 3TXJA 4XJDA 2YVBA 2DQJY 4UWVA 1B7NA 4N5RA 4NEBA 4ZFPA 4WM2A 1CJ8A 1REYA 1YROA 4WLDA 3WPLA 2LZ2A 1F0WA 1ALCA 1JTTL 4H93A 1E8LA 4N1CC 2BQCA 2DQIY 2MECA 4R0FA 4BAPA 3WULA 1GBSA 5HNCA 1LYOA 4GN5C 3OK0A 4PRQA 1OUCA 1LSFA 4H9FA 1GF6A 4I0CA 5F81A 4AXTA 1LMCA 1LZ4A 2F30A 1LZ5A 2MEHA 2ZIKA 4HTNA 1GE1A 2EIZC 2A7DA 2F4AA 5HQ1A 1LHLA 1WVUA 4OW1A 1CJ9A 3WH1A 2MEIA 133LA 1HEWA 5LIOA 2YBHA 1NBYC 1XEIA 1SQ2L 4G9SA 3ATNA 4QEQA 5E9RA 1IP6A 1LHMA 4J1AA 4B1AA 1LSEA 1UIEA 2FYDA 4G4CA 5B1GA 1F10A 1AZFA 1IWZA 3LYZA 4WM6A 3WU8A 1B7MA 4H8YA 1HEPA 2BQGA 3WW6A 1YKZX 3WVXA 3RZ4A 5KXNA 4HPIA 1FLUA 4W96A 1G7IC 3E3DA 5KXTA 1UIBA 1CNSA 1JKBA 1WQOA 2C8OA 1B7RA 4QGZA 5LAGA 1C08C 3HFMY 4DD9A 1QDRA 5HMJA 1HC0A 1GF0A 1QIOA 1RI8B 1HHLA 4DD0A 1IP5A 5I4YA 4J7VA 3A3QA 2X0AA 2DQCY 1CKFA 3ZEKA 1H87A 3LHMA 1G7JC 4RLNA 1C43A 1GB8A 1DI3A 4XN6A 5KXLA 2I25L 1CKGA 1CJ6A 1HSXA 3A93A 4N8ZA 3WXUA 2DQAA 3D9AC 1LMTA 3CT5A 2BQEA 2ZNXY 3WUNA 1LSMA 1LSGA 4TWSA 4H1PA 3WW5A 4GCEA 4CGEA 1VDQA 5I4XA 2DQDY 1WVVA 4TSBA 4LT2A 1IY3A 1BVXA 1IR8A 1GFVA 1IWYA 2RSCA 4OWAA 4PPOA 3MGWA 5DL9A 4P2EA 1GXXA 1GF7A 3N9AA 4G4BA 1RJCB 2BQIA 1LMAA 4HV1A 1HEMA 5FSTA 4D9ZA 1IWXA 4NGVA 1DI4A 4H94A 4UWNA 5I4WA 4NHIA 2MEGA 2BQMA 3LYMA 4UWUA 1CJ7A 134LA 1GFUA 1VDSA 2XJWA 1VEDA 3ATOA 2DQHY 4OOOA 3AZ4A 1LMQA 2DBTA 2LYMA 1LJKA 5C6IA 5LA5A 1YAPA 1GPQC 5KXZA 1J1XY 1VDTA 5KXXA 3KAMA 1LZ1A 1J1PY 3EMSA 4H9AA 1GE2A 1HELA 5LVIA 1DZBX 4YEOA 1T6VL 1IP4A 1VAUA 3W6DA 1GFGA 1B9OA 9LYZA 1O23A 4IJ4A 5KXSA 3RU5A 1NMMA 1OUDA 1GB3A 1KXYA 4NGKA 4NSGA 1JISA 1NWGA 2I26L 3W6FA 1V7SA 4PRUA 1B7LA 1JJ0A 3WMKA 3P68A 1LPIA 2HECA 4HP0A 1C46A 1RFPA 4G49A 2LYZA 5F9UA 1UIAA 1IC5Y 1HENA 4QDNA 4NGOA 3VWOA 1TCYA 4NSIA 5APCA 4CFPA 1XGTC 2CGIA 2I6ZA 2ZQ4A 1GBWA 3EXDA 4MCKA 1D6PA 5B1FA 4H9CA 3A92A 4H9IA 3TXGA 4XJIA 4H9BA 5HLLA 1TDYA 2FBDA 1XSFA 5KXMA 3RT5X 1UCOA 3WUAA 2EQLA 2EKSC 3B6LA 4FJRA 3TXHA 1GWDA 5FELA 1TAYA 1YAQA 1GFAA 4ETEA 132LA 4WLYA 4B4JA 5D5CA 1WQQA 1LJEA 2AUBA 2GV0A 1IC4Y 1GBZA 1PS5A 1XGPC 2HU3A 1C7PA 1LZDA 4WG1A 1REZA 1LZYA 1D6QA 2FYCA 1H6MA 1LMNA 1UIHA 5LINA 4NWEA 4Z46A 154LA 5HMVA 1WQNA 2Z39A 2FBBA 1HFZA 3IWRA 4X3BA 3CQLA 1WQPA 2NWDX 1B7PA 3ULRA 1VATA 4TX7A 2WARA 4XJGA 1LYYA 4LFXA 1D0LA 4EMNA 4N0JA 4C3WA 1FLQA 1GXV2 1JSFA 3AGHA 4GCFA 2HUBA 3CSRA 1LZGA 4NG1A 5DN4A 1AT6A 1GFEA 4WM1A 4BAFA 5LXWA 4C5FA 5KXRA 1G7HC 4R6CA 3W6BA 4LT3A 1GBOA 1FLWA 1I56A 3WPKA 1OUHA 4WG7A 1NF5A 1A4VA 1DXJA 1B5ZA 2ZILA 4OWBA 3LYTA 1DKKA 4RW2A 5LYTA 1GF4A 3A8ZA 4B49A 5IELA 5AMYA 4RW1A 1IOQA 3TXFA 1GEVA 2HEBA 1NQIA 3P4ZA 4G4HA 2CDSA 2H5ZA 4GN4A 4E3UA 1P2CC 3G3AB 3G3BB 2H9KA 3WYHA 2ZIJA 1REMA 1UBZA 2MEDA 5DLAA 208LA 4U3XB 5KXKA 4WO6A 4CJ2A 1I1ZA 1LZTA 1D9UA 4GLVA 1FLYA 1JPOA 2Z2FA 5D5FA 1N4FA 1LZNA 1RCMA 1YIKA 1QDTA 1GHLA 1DI5A 3A3RX 1B7OA 207LA 1EQ4A 1NBZC 5F16A 3SP3A 4DD2A 5L3HA 1KIRC 1LHKA 4H9EA 4L41A 2HU1A 1GB9A 1YL1X 4LYMA 2Z37A 1UUZC 5ILFA 5APFA 3W6EA 1LKRA 3A90A 2BQFA 1LHIA 5F9XA 5DN5A 3OJPA 1GDXA 1IR9A 1DKJA 1LJIA 4ZEEA 1QQYA 1LZSA 1OUJA 1C10A 1GE4A 1HNLA 1JUGA 1LSCA 5LVJA 1QSWA 1JITA 3EBAB 4RDSA 1GAYA 2CWIA 4WO9A 3CSQA 3A91A 4MR1A 4ETBA 1IOCA 1UICA 5A3EA 3J4GA 1FBIX 1BGIA 1QSAA 1SLYA 4HJZA 5C6LA 2BQJA 4GCDA 2HTXA 4NY5A 4QY9A 1JJ3A 3B0KA 1KXXA 4H91A 5B06A 2DQGY 1HMLA 4OWCA 3RNXA 4Z98A 3TXIA 3B0IA 5KXPA 3HBEX 2DQEY 4Z41A 1GB5A 1YQVY 1HFYA 3TXBA 2Z12A 1LHJA 1XEKA 1IP7A 1GF5A 4BADA 1F6SA 1UA6Y 1G7MC 4LYBA 1GEZA 1CKCA 4NHSA 3WUMA 1LSAA 1GFHA 4DDCA 5B59A 4H92A 3AJNA 2C8PA 1JSEA 2HEEA 2YBMA 4GCBA 1GB7A 2LZTA 4ETAA 2A7FA 4I8SA 4NGWA 2BQDA 2MEBA 3A6BY 3WPJA 4YEMA 1LSPA 1BVKC 1JKCA 1VFBC 2F4GA 2PC2A 3AZ6A 5JENB 4PGJB 1W6ZA 1UACY 1IORA 2Z2EA 3AYQA 3RW8A 3TMWA 1LSNA 2YBNA 2MEAA 2XTHA 3N9CA 2XBSA 5FCPA 3TMUA 1IR7A 8LYZA 4YENA 1DPXA 5KXWA 1EQEA 1YILA 3D3DA 3K3TA 4ANRA 1MLCE 1IEEA 1LKSA 2BQNA 3B72A 1XEJA 1QUSA 4NSJA 2IHLA 6LYTA 4YM8A 1IO5A 1IWWA 4HV2A 2BQBA 1GF3A 3A94A 4NGJA 1LJJA 2H9JA 5KY1A 4KXIA 1J1OY 1BB3A 3IJVA 1IOSA 1QTEA 4LYCA 4ET8A 5APDA 4NG8A 5E4PA 1JKAA 1IP3A 5ILCA 1GAZA 1GDWA 4DDBA 4WM4A 5EBHA 3WU7A 4Z3MA 4ZIXA 5F14A 1TEWA 5B05A 3T6UA 4XJHA 1OQMA 5HNLA 1LJ4A 2D4KA 1JHLA 2DKVA 2G4QA 1HEOA 1UIFA 1B5YA 2D4JA 5KKIA 2YBLA 1LYSA 1GF9A 3AB6A 2BPUA 4H8ZA 2Z18A 7LYZA 3LN2A 4WL7A 1LZBA 4DD3A 4YF2A 1GF8A 1LJNA 4GLAA 2BLYA 2HEAA 1ZV5L 3BKVA 4DDAA 3FI7A 5C6JA 2LHMA 4TUNA 3TMVA 2YDGA 1LYZA 1BWHA 3TXDA 1AT5A 193LA 1BHZA 1REXA 1GBXA 1GD6A 1ZVHL 2ZYPA 4NFVA 3TMXA 3FE0A 2W1MA 2ZYCA 2W1XA 4XADA 3TXEA 2G4NA 1YKXX 5KXYA 4HJVA 1CKHA 2BAAA 1F6RA 1D0MA 2YBJA 3F6ZA 1OP9B 3M18B 4DWXA 5I5QA 1OUAA 4OWHA 5A3ZA 1FDLY 3GXRA 2N5ZA 2MEEA 1NDMC 4NWHA 4CFOA 135LA 3WVYA 1MELL 3LYOA 4N1EI 1GFTA 1LZEA 3ZVQB 2CJLA 2DQFC 1LJGA 5LAFA 4TTDA 1LJ3A 5J7CA 4LZTA 5IDDA 3M3UA 4YOPA 4HJYA 1I20A 1UIDA 1IOTA 1GB6A 3AW6A 1LCNA 3QY4A 1AKIA 1AM7A 1TBYA 1UC0A 2Z38A 4OOTA 5IHGA 1DPWA 1VDPA 2ZNWY 2XBRA 1B5UA 1KIQC 1OUGA 3GXKA 3EO5A 4WMGA 1XGQC 4LT0A 4B0DA 4NHPA 4ML7A 5I54A 3CSZA 4NHTA 1WQMA 1HFXA 2BQKA 5LVGA 1LJHA 5L9JA 4II8A 1LZ9A 5APEA 4WLTA 5II3A 5LVHA 1IWVA 1YANA 4GN3A 4NIJA 2HEDA 2W1YA 1KXWA 1BB4A 1IY4A 3LZTA 4NGIA 1JEFA 1JJ1A 1HF4A 2BQAA 1IP1A 3A95A 1EL1A 4IATA 5LVKA 4DC4A 1FN5A 5M1YA 1OUFA 1YL0X 1LHHA 2Z19A 2IFFY 4NGYA 5DM9A 3A34A 1LTMA 1YAMA 4WM3A 1BB5A 1B5WA 1JTOL 3P66A 1D0KA 3QNGA 1LZAA 4CHXA 1GBYA 4XYYA 4HSFA 194LA 1XGUC 4ETCA 4M4OA 2VB1A 2EPEA 4EOFA 4KT3A 5FHWA 3J6KA 1JKDA 2D6BA 2BQLA 4LGKA 1LOZA 2B5ZA 1UIGA 1C45A 3P64A 4PJ2C 4DYGA 4ETDA 1LMOA 5KJ9A 4O34A 1GFKA 4ET9A 1ZVYB 4NGZA 4LYZA 1LSZA 1BB6A 2YBIA 1IC7Y 4B4EA 4TSCA 1IP2A 2BQHA 1WTNA 3BKHA 1QUTA 1QTKA 2G4PA 4N9RA 4RLMA 5FDJA 1IIZA 1B7QA 1NHEA 1BWIA 1YKYX 4HPEA 1XFPL 4IASA 4KPMA 2BQOA 4WOAA 1HERA 5FEKA 2BLXA 3WXTA 4LYTA 1LZRA 1LSBA 1FKQA 5L3IA 3WL2A 4OWEA 1IWTA 1LAAA 3A67Y 3AGGG 1GB2A 1W08A 3QE8A 3TXKA 6LYZA 4M6DA 1GB0A 2F2NA 3IJUA 3CT1A 1GE0A 1LSYA 3N9EA 4LYOA 1LMPA 3ZVQA 1JTPL 4LFPA 3AZ5A 1T3PA 1HEQA 3B0OA 4AGAA 5I53A 3W6CA 4NHQA 1CKDA 3T36A 4A7DA 5KKJA 1LJFA 3HBDA 1LZ6A 2HEFA 4XENA 3W6AA 2D91A 1A2YC 3A6CY 4WLXA 3A96A 5LA8A 4B4IA 2LYOA 1WTMA 2YSSC 4DD7A 2Y8PA 1BB7A 1OUBA 4XJBA 4DD1A 3LZ2A 4NGLA 1OUEA 4H8XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HUQA 205LA 5LYMA 1IX0A 1BQLY 1HMKA 1LZCA 2D4IA 1DYEA 1RE2A 3CB7A 1L88A 1NKHA 4J0LA 4KL7A 1B2KA 4HTKA 1B5XA 1DQJC 4W94A 4GCCA 1HSWA 1L37A 3AGIA 1V7TA 1QTHA 3WU9A 2MEFA 1YAOA 1KIPC 3AW7A 1C69A 4FDYA 3TXJA 1OWYA 2B74A 4ZFPA 4WM2A 3WPLA 1YROA 225LA 2LZ2A 4H93A 2BQCA 3RUNA 2MECA 1L30A 5HNCA 237LA 4GN5C 4PRQA 4AXTA 2F30A 2ZIKA 1L58A 2EIZC 2A7DA 1CJ9A 3L64A 1HEWA 4ZPUA 1NBYC 4G9SA 4G4CA 3LYZA 3WW6A 1L05A 3WVXA 5KXNA 239LA 4W96A 1G7IC 2RAYX 1UIBA 1OVKA 5LAGA 3HFMY 5HMJA 1GF0A 2Q9EA 4DD0A 125LA 1IP5A 4EKSA 1KNIA 1QUOA 2DQCY 1CKFA 1L36A 3LHMA 261LA 1G7JC 1C43A 1L43A 4XN6A 3WXUA 2DQAA 3D9AC 1QT7A 3WUNA 4TWSA 4CGEA 1D3NA 1VDQA 1L20A 1GFVA 3MGWA 1CX7A 2BQIA 4HV1A 255LA 5FSTA 4D9ZA 1IWXA 1DI4A 4H94A 131LA 3LYMA 4UWUA 4LDEA 3ATOA 2DBTA 1C60A 1L14A 1OV7A 1YAPA 1L11A 5KXZA 113LA 4W56A 3C80A 1C6AA 1LZ1A 3KAMA 1GE2A 1HELA 1VAUA 2QB0B 2B6XA 1GFGA 9LYZA 4ARMB 4IJ4A 5KXSA 1GB3A 1C67A 1KXYA 4NSGA 1JISA 223LA 1UIAA 3VWOA 1L38A 4NSIA 5APCA 4CFPA 3SB6A 3EXDA 3A92A 4H9IA 4H9BA 3CDOA 3RT5X 1CUQA 5FELA 1TAYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W3E A;  1Z55 A;  4H90 A;  5LYM A;  1IX0 A;  1BQL Y;  5K7O A;  1HMK A;  1LZC A;  2D4I A;  4WL6 A;  1B7S A;  1JWR A;  1XGR C;  2ZQ3 A;  1PZY A;  1RE2 A;  5B07 A;  153L A;  1NDG C;  3CB7 A;  3AZ7 A;  1IVM A;  1GFR A;  1B0D A;  4MST A;  1NKH A;  4J0L A;  4KL7 A;  1LZ8 A;  4J1B A;  1EQ5 A;  1B2K A;  4WM5 A;  4HTK A;  1JIY A;  1OUI A;  4H9H A;  4PHI A;  1B5X A;  1DQJ C;  4W94 A;  1BWJ A;  2Q0M X;  1HSW A;  4GCC A;  1WQR A;  3P65 A;  4XJF A;  3AGI A;  1V7T A;  4BS7 A;  1LSD A;  5LYZ A;  3WU9 A;  1ZMY L;  1INU A;  2MEF A;  5T3F A;  1YAO A;  4NSH A;  1KIP C;  4HTQ A;  1G7L C;  1GE3 A;  2W1L A;  3AW7 A;  1GFJ A;  3CT0 A;  5KXO A;  1B5V A;  1FKV A;  2ZWB A;  4DT3 A;  3HBH A;  1IWU A;  4LT1 A;  4FDY A;  3TXJ A;  4XJD A;  2YVB A;  2DQJ Y;  4UWV A;  1B7N A;  4N5R A;  4NEB A;  4ZFP A;  4WM2 A;  1CJ8 A;  1REY A;  1YRO A;  4WLD A;  3WPL A;  2LZ2 A;  1F0W A;  1ALC A;  1JTT L;  4H93 A;  1E8L A;  4N1C C;  2BQC A;  2DQI Y;  2MEC A;  4R0F A;  4BAP A;  3WUL A;  1GBS A;  5HNC A;  1LYO A;  4GN5 C;  3OK0 A;  4PRQ A; 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 1LHH A;  2Z19 A;  2IFF Y;  4NGY A;  5DM9 A;  3A34 A;  1LTM A;  1YAM A;  4WM3 A;  1BB5 A;  1B5W A;  1JTO L;  3P66 A;  1D0K A;  3QNG A;  1LZA A;  4CHX A;  1GBY A;  4XYY A;  4HSF A;  194L A;  1XGU C;  4ETC A;  4M4O A;  2VB1 A;  2EPE A;  4EOF A;  4KT3 A;  5FHW A;  3J6K A;  1JKD A;  2D6B A;  2BQL A;  4LGK A;  1LOZ A;  2B5Z A;  1UIG A;  1C45 A;  3P64 A;  4PJ2 C;  4DYG A;  4ETD A;  1LMO A;  5KJ9 A;  4O34 A;  1GFK A;  4ET9 A;  1ZVY B;  4NGZ A;  4LYZ A;  1LSZ A;  1BB6 A;  2YBI A;  1IC7 Y;  4B4E A;  4TSC A;  1IP2 A;  2BQH A;  1WTN A;  3BKH A;  1QUT A;  1QTK A;  2G4P A;  4N9R A;  4RLM A;  5FDJ A;  1IIZ A;  1B7Q A;  1NHE A;  1BWI A;  1YKY X;  4HPE A;  1XFP L;  4IAS A;  4KPM A;  2BQO A;  4WOA A;  1HER A;  5FEK A;  2BLX A;  3WXT A;  4LYT A;  1LZR A;  1LSB A;  1FKQ A;  5L3I A;  3WL2 A;  4OWE A;  1IWT A;  1LAA A;  3A67 Y;  3AGG G;  1GB2 A;  1W08 A;  3QE8 A;  3TXK A;  6LYZ A;  4M6D A;  1GB0 A;  2F2N A;  3IJU A;  3CT1 A;  1GE0 A;  1LSY A;  3N9E A;  4LYO A;  1LMP A;  3ZVQ A;  1JTP L;  4LFP A;  3AZ5 A;  1T3P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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