7LZMA

Comparison of the crystal structure of bacteriophage t4 lysozyme at low, medium, and high ionic strengths
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Comparison of the crystal structure of bacteriophage T4 lysozyme at low, medium, and high ionic strengths.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 7lzmA00
181LA 3C81A 1L24A 3LZMA 1C6TA 1D3NA 180LA 139LA 168LA 3C7YA 2B6TA 2LZMA 2RBQA 3SB7A 3DN6A 1PQMA 1LYHA 2RH1A 1L01A 1L20A 1G0LA 2Q9DA 2QARC 3SB8A 1C6GA 1L37A 223LA 1L65A 169LA 3L2XA 1C6DA 2B6WA 1L22A 3SBAA 2IGCA 1SSWA 4EKSA 245LA 1KNIA 1L13A 2O79A 1L36A 215LA 4EPFA 4YXCA 1QT7A 3HT7A 171LA 5I14A 3DKEX 2RAZX 1QTHA 1G0MA 1ZWNA 142LA 1L83A 4IAPA 2B6ZA 2OU8A 198LA 1L34A 237LA 2NTHA 3C7WA 4EKRA 1L26A 1L49A 2L78A 109LA 258LA 2LC9A 3HDFA 131LA 3C7ZA 1CV3A 1LW9A 1P6YA 1L15A 1L87A 125LA 192LA 1L46A 3C8QA 4I7OA 4I7SA 3V2WA 1L91A 3OE9A 4EXMA 187LA 1CU0A 1L06A 1C6LA 1TLAA 112LA 184LA 2NTGA 228LA 2HUKA 3HU8A 176LA 111LA 1L93A 1P5CA 3G3VA 1L62A 2ANVA 3EMLA 155LA 3GUKA 205LA 3HWLA 1CU6A 1CVKA 1L35A 4LZMA 1L54A 4GBRB 1L52A 1L80A 4GRVA 3L64A 4ARQB 1L59A 3HT8A 1JTMA 1L19A 3SB5A 3UONA 1L69A 1L0KA 1L56A 1G07A 1L17A 157LA 3F9LA 1L89A 186LA 1OVKA 1OVHA 1CX6A 167LA 1L58A 1L32A 3RUNA 1D2YA 3HH6A 2B7XA 3GUOA 1C6IA 1CU3A 161LA 3GUIA 190LA 2OU0X 1PQKA 235LA 1P37A 114LA 1P36A 110LA 229LA 218LA 1L39A 3HH3A 3HT9A 1OYUA 1L25A 254LA 1L81A 3D4SA 1L10A 3JR6A 3OE6A 259LA 3OE0A 213LA 1L45A 1L84A 1L86A 1L07A 1G0QA 262LA 4ARMA 123LA 1KY1A 2ANXA 2HULA 150LA 1QSQA 224LA 234LA 1C68A 4W52A 219LA 149LA 3HU9A 4I7MA 4W55A 1QS5A 4W58A 5LZMA 238LA 3DN2A 1XJTA 4W51A 103LA 2RBRA 1L97A 4EKPA 3GUJA 1C66A 1L98A 2RBSA 2B73A 1L94A 1L28A 1QTCA 1I6SA 3HUQA 1KS3A 4W56A 1CUQA 1P46A 143LA 1C6EA 160LA 250LA 1L61A 4EJ4A 7LZMA 3GUMA 3C8SA 144LA 4ARQA 4DAJA 1LI2A 1QT8A 243LA 1C6MA 221LA 4DKLA 1P2LA 1PQOA 2HUMA 2OE4X 206LA 115LA 1DYGA 1C64A 1L70A 2F2QA 3FADA 113LA 3SB9A 226LA 2F32A 1QTZA 1L40A 4EPIA 191LA 1LWKA 1QS9A 1DYDA 1QTDA 1C62A 1L99A 1OVJA 4I7PA 6LZMA 3HUAA 3DMVA 2OTYX 255LA 1D3FA 253LA 4YX7C 256LA 3PDSA 174LA 1G1WA 4W57A 2OU9A 1PQDA 239LA 4ZPUA 4ARMB 3FI5A 159LA 166LA 4LDOA 1QUGA 257LA 248LA 1QTBA 3NY8A 1C6CA 1L68A 2B72A 3CDRA 4DJHA 158LA 1C63A 1L02A 2B6YA 172LA 1QT4A 146LA 3HUKA 195LA 148LE 1G1VA 1CV6A 1QUDA 232LA 210LA 1T97A 2OE9X 4I7TA 118LA 244LA 1QT6A 1L04A 3DMZA 1D9WA 2Z6BA 1L42A 1L18A 1L72A 1QT3A 225LA 260LA 4W53A 3HTBA 102LA 2QB0B 1P56A 3GUNA 1SWYA 3CDOA 1QSBA 1L48A 1CV1A 1C67A 227LA 4ARJA 197LA 1ZURA 1C60A 1P2RA 1L27A 1C65A 175LA 163LA 122LA 1T6HA 1C6JA 2B6XA 4PJZA 4S0WA 1C6FA 3C80A 130LA 1PQJA 1LYEA 1CV0A 1L31A 3SN6R 1LGXA 222LA 1LGWA 1T8FA 183LA 1QUOA 3DMXA 1DYCA 1L14A 4ARLA 137LA 1L09A 178LA 236LA 4PK0A 1L82A 1L85A 1G0KA 1L63A 252LA 1KW7A 1LI6A 1L47A 156LA 4OO9A 4W59A 182LA 1L92A 1CX7A 1OV5A 1L43A 2OEAX 108LA 1L50A 1KW5A 246LA 4ARPA 2OTZX 3DNAA 1QT5A 3C83A 3DN1A 3HT6A 4I7NA 251LA 1C6NA 1L11A 2B70A 4EKQA 3C8RA 170LA 1LGUA 2RB1X 1DYAA 3OE8A 1LYJA 1L66A 3G3XA 2F47A 3CDVA 1CU5A 3HDEA 1C6PA 1G06A 1L23A 1L67A 1L95A 214LA 119LA 1WTHA 1L88A 2O4WA 1G0PA 3QAKA 3SBBC 230LA 1C6HA 1L21A 1L64A 1XJUA 1L55A 261LA 211LA 1L90A 1L76A 1K28A 212LA 4YXAC 1L00A 220LA 1P3NA 1L73A 4E97A 4W54A 1L96A 189LA 1SSYA 1SX2A 3ODUA 199LA 1EPYA 1L74A 217LA 1G0JA 3VW7A 147LA 1L03A 3DN8A 1P64A 1LYDA 1T8GA 4I7RA 196LA 1C6KA 1OV7A 241LA 1CTWA 2RAYX 1L60A 104LA 3HTFA 1DYFA 1C6BA 1L51A 1L38A 2B75A 3GUPA 1QUHA 1L57A 1LYIA 1CU2A 2B74A 173LA 185LA 1C6QA 1L05A 3HH4A 151LA 3FA0A 3HTGA 3NY9A 1L77A 247LA 1L75A 3K2RA 2RBPA 3RZEA 231LA 3DN0A 1JQUA 1L33A 1LPYA 1CUPA 162LA 1JTNA 3DN3A 145LA 249LA 165LA 1KY0A 128LA 2RBNA 177LA 1DYEA 1LYGA 1L41A 233LA 152LA 1G0GA 1L08A 188LA 2RBOA 1DYBA 242LA 4I7KA 3NYAA 3DN4A 1L44A 1C6AA 4I7QA 1PQIA 4I7JA 3V2YA 201LA 1SWZA 107LA 2O7AA 1SX7A 1XEPA 126LA 1CV5A 3CDQA 1ZYTA 2OE7X 3PBLA 1NHBA 1LYFA 1LI3A 1D2WA 4LDLA 1LWGA 1L79A 129LA 1L71A 1OWZA 3HTDA 1L12A 141LA 4AQNA 4K5YA 1B6IA 200LA 127LA 1L53A 3C82A 3G3WA 4LDEA 1L29A 2Q9EA 2CUUA 2RB0X 4I7LA 140LA 3GULA 120LA 3CDTA 1L0JA 2A4TA 240LA 1D3JA 1T8AA 138LA 2LCBA 1L30A 1LLHA 3SB6A 1C61A 1D3MA 216LA 3HH5A 1OWYA 1L16A 1QTVA 1P7SA 209LA 1CV4A 164LA 3F8VA 2RB2X 1C69A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AW6A 181LA 1F6SA 1LJ4A 5DN5A 1D3NA 5KXTA 5KXWA 5LINA 5B1FA 2B6TA 1ZV5L 2LZMA 1LYHA 5A3EA 169LA 3HBHA 3T6UA 1GF9A 4HP0A 3SBAA 5LA5A 1KNIA 215LA 1ZVYB 1QT7A 171LA 5I14A 2RAZX 1QTHA 1D9UA 1JTTL 1NBZC 1ZWNA 1HSWA 1IC4Y 1IWVA 2DQIY 1XEIA 1B5XA 4H9EA 2LC9A 3HDFA 5FSTA 4NGIA 3B0OA 3P64A 1P6YA 1L15A 5LYZA 1LMAA 1L46A 1YILA 2Z18A 5I53A 2EQLA 3OE9A 1L06A 1GBOA 4GCBA 1GE0A 2HUKA 4DQ7A 4H9IA 4HTKA 5LAFA 134LA 176LA 2I26L 4DDAA 5DL9A 4EOFA 1P5CA 2ANVA 1TCYA 205LA 3HWLA 1CVKA 1L35A 1UIEA 1L54A 4GBRB 4QEQA 1B7RA 1NDMC 1L59A 2W1LA 4J7VA 1L19A 2EKSC 1JEFA 4NGLA 167LA 3RUNA 3ZVQA 3AJNA 2B7XA 1UIGA 3TMXA 190LA 2DBTA 4GN4A 1JUGA 2XJWA 2X0AA 3CB7A 1P36A 229LA 218LA 1LAAA 1OYUA 254LA 1L81A 5KXOA 3AGHA 2BQKA 259LA 4BAPA 1IIZA 1GFEA 1G0QA 1LKSA 4ZIXA 123LA 2ANXA 2HULA 3A94A 150LA 1JJ3A 1GXV2 1OUIA 219LA 5C6IA 1IVMA 1JJ1A 1LJFA 1NKHA 1QS5A 3WH1A 1L97A 3GUJA 2B73A 1L28A 5LA8A 5HNLA 2HEFA 1CUQA 1LMNA 1P46A 4O34A 1C6EA 160LA 250LA 3C8SA 1WVVA 2DQGY 1HNLA 144LA 3QY4A 1QT8A 221LA 4DKLA 1WQOA 1BWIA 1DYGA 2IHLA 3FADA 2AUBA 2F32A 2CJLA 3TXGA 1QS9A 1DYDA 4WOAA 1LSDA 3HBDA 4I7PA 4DYGA 255LA 1HEOA 1GFJA 253LA 3PDSA 174LA 4W57A 2OU9A 1PQDA 1QTKA 3WPJA 2N5ZA 1JPOA 4XJIA 248LA 3NY8A 1C6CA 4CFPA 4NHPA 1C63A 172LA 3TXKA 1QT4A 3WXTA 4R0FA 1LSCA 1OUEA 1J1OY 1AZFA 4I7TA 1JITA 1MELL 2A7FA 2MEDA 4CJ2A 4J1AA 4B4JA 3IJUA 4XJFA 3A3RX 4NIJA 1LSFA 3WU7A 225LA 4G9SA 3W6BA 3HTBA 2BQMA 3WPKA 1P56A 1SWYA 1C10A 1VDTA 1QSBA 3WMKA 1WQRA 4ARJA 5A3ZA 2XBSA 1KIPC 1P2RA 2XTHA 1IWTA 4DWXA 2LHMA 1C6JA 4DDBA 2B6XA 4PJZA 4S0WA 130LA 2Z12A 3SN6R 5D5CA 1XGPC 1T8FA 183LA 3DMXA 1YANA 4ARLA 1HERA 1KXWA 4AXTA 178LA 4PK0A 3B72A 5L9JA 6LYZA 1L85A 1G0KA 1L63A 1LZRA 4ZEEA 4W59A 1LZ4A 1L92A 1KW5A 4ARPA 1DKKA 1RCMA 3DN1A 1L11A 1TDYA 1GFKA 1CKDA 1DYAA 1IP3A 1LYJA 2F47A 1C6PA 3RT5X 1G06A 1L23A 1L67A 154LA 4ETBA 214LA 1IP5A 1C43A 1WTHA 3D9AC 2F4AA 3QAKA 3SBBC 1KXXA 1L55A 261LA 4OWHA 211LA 4HTQA 1L76A 1K28A 4YXAC 4KT3A 220LA 1L73A 1LSEA 1L96A 2EIZC 1SX2A 3A90A 3A92A 3VW7A 147LA 2F4GA 1DPWA 196LA 4OWEA 4PGJB 2WARA 241LA 4TSBA 2RAYX 4A7DA 1JTPL 2LYMA 1DYFA 4NGOA 5HMVA 1QUHA 185LA 4H93A 4G4HA 2HU1A 1NWGA 1LZ6A 3RZEA 4H9FA 1GFTA 1UIFA 231LA 1JTNA 5E4PA 4QDNA 2LYZA 145LA 5LYTA 249LA 3LZ2A 2RBNA 1LJ3A 1B2KA 1L08A 4Z3MA 1GB8A 2D91A 2ZYCA 3V2YA 1SX7A 2OE7X 1NHBA 1PS5A 1LI3A 1B9OA 1LWGA 129LA 1OWZA 4EMNA 4AQNA 4K5YA 1B6IA 200LA 4TUNA 4YOPA 3BKHA 4FJRA 1L29A 1UBZA 2Q9EA 2RB0X 4NY5A 140LA 1B7QA 4WMGA 5IELA 1JKDA 4GLVA 1B5ZA 1YKYX 1LLHA 1BGIA 1GAYA 1D3MA 3B6LA 216LA 3HH5A 5B06A 4GCEA 1P7SA 1LZTA 4RW2A 1FLQA 209LA 5KXYA 3G3BB 2RB2X 4KPMA 2LZTA 3C81A 1L24A 1QSWA 4NFVA 3WUAA 1J1PY 2MECA 4R6CA 1GE1A 168LA 2RBQA 4II8A 4DD0A 4NSIA 1G0LA 2BQIA 4LT0A 1RFPA 4OOTA 3SB8A 1L37A 3LHMA 2B6WA 1L22A 1LSMA 4M6DA 4NGJA 2O79A 1L36A 3DKEX 1LSGA 3ZEKA 2FYCA 5F14A 2PC2A 1GF7A 1IWUA 198LA 1L34A 2NTHA 3C7WA 4EKRA 1L49A 1GBSA 258LA 2YBMA 1LYYA 2DQJY 1LYZA 5II3A 4ET8A 5F9XA 4I7OA 4HV2A 3WVXA 1TLAA 184LA 2NTGA 228LA 3WPLA 2H5ZA 4B0DA 4XJDA 4WLYA 1BB7A 1IOTA 1W08A 5ILFA 4UWNA 1WQQA 3G3VA 155LA 4DD3A 4HJZA 4WO9A 3QNGA 3CT5A 4LZMA 1BWJA 1L52A 3WUMA 4GRVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3AW6 A;  181L A;  1F6S A;  1LJ4 A;  5DN5 A;  1D3N A;  5KXT A;  5KXW A;  5LIN A;  5B1F A;  2B6T A;  1ZV5 L;  2LZM A;  1LYH A;  5A3E A;  169L A;  3HBH A;  3T6U A;  1GF9 A;  4HP0 A;  3SBA A;  5LA5 A;  1KNI A;  215L A;  1ZVY B;  1QT7 A;  171L A;  5I14 A;  2RAZ X;  1QTH A;  1D9U A;  1JTT L;  1NBZ C;  1ZWN A;  1HSW A;  1IC4 Y;  1IWV A;  2DQI Y;  1XEI A;  1B5X A;  4H9E A;  2LC9 A;  3HDF A;  5FST A;  4NGI A;  3B0O A;  3P64 A;  1P6Y A;  1L15 A;  5LYZ A;  1LMA A;  1L46 A;  1YIL A;  2Z18 A;  5I53 A;  2EQL A;  3OE9 A;  1L06 A;  1GBO A;  4GCB A;  1GE0 A;  2HUK A;  4DQ7 A;  4H9I A;  4HTK A;  5LAF A;  134L A;  176L A;  2I26 L;  4DDA A;  5DL9 A;  4EOF A;  1P5C A;  2ANV A;  1TCY A;  205L A;  3HWL A;  1CVK A;  1L35 A;  1UIE A;  1L54 A;  4GBR B;  4QEQ A;  1B7R A;  1NDM C;  1L59 A;  2W1L A;  4J7V A;  1L19 A;  2EKS C;  1JEF A;  4NGL A;  167L A;  3RUN A;  3ZVQ A;  3AJN A;  2B7X A;  1UIG A;  3TMX A;  190L A;  2DBT A;  4GN4 A;  1JUG A;  2XJW A;  2X0A A;  3CB7 A;  1P36 A;  229L A;  218L A;  1LAA A;  1OYU A;  254L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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