3RZEA

Structure of the human histamine h1 receptor in complex with doxepin
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
435
structure length
428
Chain Sequence
MPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSERKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASIFSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSFLWVIPILGWNHRREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMVIAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Histamine H1 receptor, Lysozyme chimera
publication title Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 147
structure length 428
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3rzeA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3rzeA01
3DN4A 1CUQA 1CV5A 4EPIA 5AX1A 5G53A 4BEYA 1P2LA 4G71B 1L27A 1L54A 254LA 5A8EA 1OVHA 5G2CA 4HYJA 1DYFA 1LGWA 1L81A 1JTNA 4IAPA 1IXFA 4IAQA 4I7NA 5B2NA 2LC9A 1GZMA 5G36A 2JAFA 2YDOA 5JJEA 1L75A 4DJHA 4EIYA 2YCYA 200LA 4XT3A 3HAOA 102LA 1L53A 1OYUA 1QTCA 170LA 2QB0B 2I1XA 5B0WA 3HUQA 4GBRA 4MBSA 1QUOA 4DKLA 4GRVA 1L62A 1L90A 250LA 2OE7X 3HT9A 4MQTA 1P56A 1QUDA 1KY1A 3X3CA 1P36A 1P8UA 3QBGA 1G0PA 1XEPA 4NC3A 104LA 3QBIA 5H2LA 2B6XA 1KY0A 103LA 184LA 1L93A 1QT4A 110LA 2Y02A 3HTDA 1UAZA 5TGZA 4BVNA 147LA 4HWLA 1L66A 4I7QA 3HDFA 1C6TA 227LA 1T97A 2O7AA 1C6LA 2B74A 4W58A 5H2KA 1C61A 1L74A 3VVKA 182LA 1L28A 143LA 5H2HA 152LA 3GUPA 4E97A 4MD1A 1L08A 1P64A 3GUOA 4I7LA 1QT8A 3HH3A 1L77A 1LYHA 1L47A 243LA 1C6MA 1D2YA 114LA 1QTDA 2RBPA 1L52A 3T45A 2ANXA 3C8SA 1DYDA 5J7AA 1SWZA 3C8QA 1S54A 4G7RB 1L9HA 4AMIA 1GU8A 141LA 174LA 213LA 4DAJA 3GUMA 3V2YA 1L31A 3G3XA 261LA 1OVKA 2HUKA 1L91A 5H2PA 4BUOA 1C6GA 2RBSA 2ZZLA 3F8VA 1L88A 1XJTA 241LA 128LA 1C6BA 4PK0A 1L50A 229LA 1T8FA 1D3JA 3CDRA 5B6ZA 5FJGA 1QT7A 1C6HA 2KSAA 1PXRA 1CX6A 1P2RA 5AHYA 1C62A 1C6DA 1SX7A 251LA 3NS0A 2RB0X 252LA 5DHGA 3AYNA 1JQUA 3C8RA 2J4YA 4JKVA 1ZYTA 3BVDB 172LA 216LA 4EKSA 3C80A 1P37A 1PQKA 3C7YA 1IW9A 1Q5IA 3SB5A 1L76A 1L04A 2RBRA 4YXCA 1CU5A 3NSBA 148LE 2B73A 4K5YA 3REYA 3WQJA 1DYGA 2G87A 4ARPA 210LA 1L57A 1L29A 5B35A 180LA 5ITEA 1CU6A 3S3DB 4X1HA 4BWBA 3VGAA 1QTHA 1C66A 1L05A 2LCBA 1L98A 3PXOA 249LA 5G2DA 4W53A 3UG9A 1T8AA 1T8GA 171LA 1L60A 2R4SA 5H2NA 1HZXA 3QJQB 1OV7A 1DYCA 3ABWA 3DMXA 3HDEA 3DN1A 1L0KA 1LYDA 1JFPA 1L83A 4J4QA 1LI2A 3C7ZA 139LA 3DNAA 1L19A 3C7WA 1L46A 3QDCA 244LA 163LA 1LGUA 246LA 2ZFEA 1L51A 1L21A 1L0JA 5BR5A 2OE4X 236LA 2F32A 215LA 1L64A 1L22A 3SB6A 1S52A 3QJTB 248LA 1L34A 2WJLA 3GUIA 2L6XA 1L10A 1L32A 1KMEA 4PXKA 130LA 1L61A 2I21A 1H2SA 1BRXA 1L16A 1QS5A 1ZWNA 218LA 1F4ZA 4AQNA 1XMEB 1L97A 1SWYA 4WAVA 1QTBA 234LA 1L00A 1C60A 3EH3B 3DMVA 144LA 1G0LA 257LA 1L41A 225LA 122LA 4QRYA 235LA 2A4TA 2EI4A 1NHBA 1L12A 1L79A 2OE9X 1CTWA 192LA 3DN8A 1BM1A 1EPYA 1G1WA 3SB7A 1LPYA 1XIOA 1L25A 3UTXA 1P46A 4I7PA 1L65A 4W55A 3CDOA 3SBBC 3F9LA 4G70B 4GYCA 4N6HA 4XTNA 4ZPUA 4W57A 1CWQA 1D9WA 1PXSA 3ZPQA 115LA 5A44A 1DYBA 1C6JA 1D3NA 1L49A 7LZMA 4ARLA 175LA 164LA 2Y03A 3UZAA 1L36A 123LA 231LA 4HYXA 1DZEA 224LA 1G0QA 1QT3A 3GUNA 1PY6A 1X0K1 173LA 1PQIA 3SB8A 1L44A 1L39A 3PBLA 4L35A 3S3BB 119LA 158LA 1QUGA 245LA 5A45A 1LN6A 1L18A 1KS3A 1OV5A 1L56A 214LA 1KGBA 3DMZA 223LA 4PJZA 1L20A 1C65A 206LA 1LWKA 1C8RA 1PQJA 2YDVA 4W56A 3EH4B 3ZPRA 1G0JA 1L55A 233LA 1DYEA 156LA 189LA 118LA 1G0MA 2F95A 1L94A 4FPDA 2Z73A 3HT7A 1FBBA 1G0KA 2AT9A 3DN0A 1L80A 3QAKA 1WTHA 159LA 3HUKA 2O4WA 1F88A 1L99A 2ZIYA 2Q9EA 3S3CB 1P5CA 1C3WA 211LA 3PWHA 162LA 3ZEVA 1ZURA 259LA 2YCZA 4G7QB 5AZDA 137LA 1L23A 2HUMA 4I7KA 2RBQA 151LA 209LA 2B6WA 191LA 1VGOA 3QJSB 3HT6A 2HPYA 1E0PA 1QTZA 5EN0A 3C81A 3V2WA 3K2RA 4OV0A 4S0WA 1B6IA 1C68A 3FADA 3CDVA 167LA 2QARC 1KW5A 1Q5JA 1P3NA 160LA 201LA 1FBKA 2BRDA 2NTHA 3HARA 5H2IA 1C6AA 2PEDA 4JR8A 1L67A 1L35A 2O79A 6LZMA 4GPOA 1TN0A 3A7KA 3LZMA 1G06A 260LA 4A4MA 3AM6A 1OVJA 4I7JA 3C82A 1CU0A 1L86A 1G0GA 1MGYA 2JAGA 1O0AA 3HANA 4IARA 198LA 3HH6A 3C9LA 2Y04A 1P8IA 2RAYX 1C6NA 2CUUA 1C6EA 3HT8A 3VW7A 1G1VA 1QS9A 4BV0A 3SB9A 3P0GA 1SSWA 113LA 3DN6A 1PQOA 1CVKA 1QHJA 166LA 3HH5A 4G7SB 111LA 3HAPA 1JTMA 197LA 205LA 5I14A 3DN2A 1D2WA 125LA 222LA 3OE6A 1L30A 4XT1A 2IGCA 1C64A 3HTFA 1L01A 1L0MA 2WJKA 3FI5A 3C9MA 1SSYA 1KG8A 3QAPA 4FA7B 1L38A 2VT4A 4I7OA 4W52A 1P6YA 157LA 1L15A 1TN5A 3HWLA 1P7SA 187LA 4LDOA 5JJJA 2L78A 2RBOA 2LZMA 3HU8A 1QT6A 4I7RA 4LDLA 4EA3A 4GP8B 2QPDB 3NY9A 2YCWA 5AHZA 1C6PA 5JJNA 2I20A 4LZMA 1L72A 177LA 4EXMA 4OO9A 1KG9A 1LYFA 5B6WA 1F50A 3RZEA 5B6VA 1L45A 1L71A 2RH1A 1BRRA 1DYAA 1QKPA 181LA 4WW3A 149LA 5F8UA 1L43A 2F2QA 4MQSA 3HTGA 2B72A 108LA 1GUEA 247LA 2OU8A 3GULA 1S51A 1JGJA 4EKRA 1XJIA 1L70A 3VG9A 4UG2A 1L13A 3AYMA 3RFMA 5KKHA 1QUHA 3PDSA 230LA 238LA 5BR2A 2B6ZA 4I7SA 4EKQA 1LGXA 3NY8A 5DHHA 3HTBA 5H2JA 1OWYA 2RBNA 4BEZA 2B7XA 1CUPA 1C8SA 1R2NA 1G07A 1C69A 4FAAB 4LDEA 2M3GA 3VHZA 4EKPA 2X72A 169LA 4N4YB 1L02A 1C63A 1L69A 1L33A 2YCXA 3DQBA 4KLYA 1C6QA 1QTVA 2B75A 1R84A 3MBVA 3ODUA 4QIDA 1QKOA 5B6YA 185LA 4XTLA 2NTWA 2F93A 1AP9A 228LA 3CDTA 4TL3A 1P8HA 1QM8A 2Q9DA 1L96A 1L68A 3QBLA 1L37A 3UTYA 1LI6A 3OAXA 138LA 4ARQA 176LA 2OEAX 256LA 3PQRA 127LA 1EHKB 1M0MA 1X0I1 1L17A 3OE9A 145LA 1L63A 3D4SA 3HU9A 4L6RA 4Y9HA 253LA 1CV1A 1L87A 239LA 120LA 186LA 1S8LA 195LA 168LA 5DYSA 3CDQA 1LW9A 2RB2X 3OE0A 3SN6R 4N4WA 4W51A 4MD2A 4ARMA 3RUNA 5H2OA 4GBRB 1L07A 1L89A 1D3FA 1LWGA 1IW6A 2Y01A 1PQDA 4YX7C 1L84A 1H68A 4ARQB 4UHRA 4W59A 4AMJA 240LA 1L14A 5B6XA 4EJ4A 2RB1X 4G72B 1JV7A 1TLAA 226LA 3G3WA 3CAPA 4PXFA 3DDLA 3UTVA 5H2MA 1KNIA 5G28A 1L09A 109LA 4XTOA 1JV6A 217LA 2NTGA 3S8FB 2Y00A 2OU9A 1AT9A 1C6FA 3HASA 1VJMA 3OE8A 4ARMB 3COCA 5ETZA 161LA 183LA 1L26A 4QI1A 1L42A 4X31A 1L58A 5B34A 1T6HA 220LA 4I7MA 190LA 1L48A 1L40A 1PQMA 232LA 4GP5B 1C6KA 3JR6A 1X0SA 3SBAA 1LYEA 1L24A 3DN3A 1KW7A 1QSQA 4X32A 1C67A 129LA 4GP4B 1CV0A 3FA0A 4I7TA 3S8GB 3EH5B 1L06A 3G3VA 2ANVA 3HAQA 2I35A 2QPEB 4XXJA 2B6YA 4IB4A 1OWZA 2KS9A 188LA 142LA 1M0LA 1L03A 3QBKA 5G54A 4EPFA 1L73A 4W54A 5AX0A 155LA 1CV6A 5LWEA 3L64A 150LA 2Z6BA 2B70A 3CODA 126LA 131LA 2HULA 1S53A 1XJUA 2KSYA 3UTWA 1CU2A 1CX7A 165LA 1QT5A 219LA 2OTZX 1L11A 3GUKA 1L95A 3DKEX 1CU3A 2KSBA 1C6IA 4FBZA 3GUJA 2R4RA 3QJUB 140LA 2NTUA 3EMLA 2B6TA 3X3BA 3UONA 262LA 4KNFA 2OU0X 3C83A 4ARJA 4YXAC 5LZMA 4JQ6A 1L85A 5AWZA 2Z55A 258LA 1D3MA 5G2AA 1I6SA 1LI3A 1M0KA 3HUAA 146LA 3L2XA 3HH4A 1C6CA 196LA 1LLHA 3VI0A 1S8JA 2LNLA 3QJVB 5C1MA 3NYAA 2F47A 199LA 1SX2A 107LA 3KJ6A 2OTYX 3UZCA 237LA 112LA 255LA 1CV3A 1L92A 3QJRB 1LYGA 1U19A 178LA 1CV4A 1K28A 2RAZX 1BRDA 242LA 221LA 1E12A 1LYJA 1UCQA 1LYIA 1L82A 1L59A 212LA 1QSBA 5ITCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LJNA 4RLNA 5A8EA 5I53A 1OVHA 1AKIA 1CJ7A 1DYFA 1C08C 1LGWA 1QTEA 3SP3A 1EL1A 2MEIA 1LSBA 4IAQA 1NBZC 5G36A 2JAFA 2YDOA 3VWOA 3TMWA 1LSMA 102LA 1DZBX 2QB0B 3B72A 1LSFA 3HUQA 4I8SA 4MQTA 1QUOA 4QY9A 3HT9A 4MR1A 4BAPA 1FLYA 1YILA 4NSGA 1P8UA 3TMUA 3QBGA 1G0PA 1XEPA 104LA 3QBIA 5H2LA 3IWRA 5F16A 2YBLA 1DKJA 3D9AC 1FLQA 3WUMA 4HWLA 4I7QA 227LA 3AGGG 1T97A 4W58A 1L74A 1LJKA 1UCOA 4DD2A 1LZYA 1GDXA 152LA 3GUPA 208LA 3HBHA 1B5WA 4DQ7A 3T45A 2ANXA 2ZNXY 1DYDA 2Y8PA 4GCBA 5J7AA 3C8QA 1S54A 1GFJA 5LIOA 1L9HA 4AMIA 4NGIA 1GF7A 2H9JA 1L31A 4GLAA 1XGRC 1L91A 5H2PA 2FYCA 2RBSA 4BADA 1XJTA 4UWVA 1L50A 229LA 3CDRA 1KXYA 1QT7A 3AZ7A 4MSTA 2KSAA 4YF2A 1CX6A 1J1PY 1GFUA 251LA 5A3ZA 1JQUA 3C8RA 1XGUC 3EO5A 1NMMA 4JKVA 1ZYTA 172LA 3TXGA 3C80A 1P37A 3WUNA 3SB5A 4YXCA 1JJ1A 2BQEA 148LE 4DWXA 1DYGA 4RW2A 210LA 2DQCY 3WXUA 1QTHA 2XTHA 3AGIA 1GB2A 1L98A 1OUFA 5G2DA 4W53A 1T8AA 4OWEA 1L60A 1V7SA 4NHQA 3DMXA 3HDEA 3DN1A 1D9UA 4WM1A 139LA 4H9HA 1IO5A 3DNAA 3C7WA 1CKHA 1GBOA 4A7DA 4C3WA 4NGLA 1L51A 2F32A 1L64A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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