3SN6R

Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-gs protein complex
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
475
structure length
443
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKIDKSEGRCLKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/hydrolase
molecule keywords Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isofor
publication title Crystal structure of the beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 148
structure length 443
sequence length 475
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
R PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
R PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3sn6R01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3sn6R02
3X3CA 1L05A 3NY9A 3HT9A 1JFPA 4ARJA 165LA 3OE8A 2ZZLA 4LZMA 3QBLA 3QJTB 4PXKA 1X0I1 4QI1A 3S3DB 1DYEA 1L03A 2JAFA 5ITCA 1P2RA 4XT3A 1LYDA 1CU6A 2OE4X 1OV5A 3QJRB 3UTXA 4DJHA 4W53A 3QBIA 4TL3A 1QT5A 3HTBA 5BR2A 1L36A 1DYAA 1EHKB 3PXOA 3HAOA 1L52A 1LI6A 1G0PA 200LA 4BV0A 102LA 1L86A 3NY8A 1L49A 1TN0A 4BUOA 210LA 1QT3A 3CDTA 1KNIA 253LA 3S3BB 4PJZA 1L76A 1L70A 1JV7A 1CV1A 3UZCA 1L59A 183LA 1P2LA 3NS0A 1QT7A 4S0WA 3SB5A 4L6RA 3HT8A 4LDEA 4W54A 3C8RA 171LA 3DN6A 2RBPA 3ZPQA 221LA 5B2NA 1QTZA 1L0JA 223LA 3HH4A 3QAKA 3HAPA 2RBSA 3S8FB 3NYAA 2O4WA 1L57A 3DN4A 231LA 2YCYA 2B74A 4FAAB 5JJNA 1T8AA 1L97A 2Q9EA 1UAZA 2YCZA 2F95A 1JTNA 227LA 1L96A 4I7PA 170LA 2RBRA 1L31A 4X32A 1L08A 168LA 1L85A 3ZEVA 3AYNA 244LA 4BWBA 230LA 1L12A 1CUPA 1QTDA 2OE9X 1L24A 2OTYX 4I7KA 1S52A 1QSBA 3FA0A 4NC3A 218LA 128LA 228LA 3CDOA 2RB1X 3GUPA 4EXMA 1DZEA 5AHYA 1UCQA 2LZMA 3VW7A 2L78A 4KLYA 152LA 1OV7A 2ANVA 131LA 3C7YA 3OE9A 4ARMA 5JJEA 3V2WA 1L34A 1C6MA 1L37A 3ABWA 3UONA 1QUOA 1G07A 4GP8B 3X3BA 3PDSA 3DDLA 3VVKA 1C6LA 2OU9A 1S51A 4W59A 167LA 1PQKA 158LA 1G0LA 1SX7A 1P8HA 1XJTA 3PQRA 4EIYA 1C6IA 1XJIA 1KMEA 262LA 130LA 188LA 1L28A 1L42A 5H2KA 3REYA 1LYJA 1F88A 3L64A 2YCWA 4I7MA 3AYMA 1S53A 4ARLA 3FADA 3F8VA 4AMJA 4FA7B 3GUJA 4FBZA 5G28A 1VGOA 229LA 1CU2A 4G70B 1L94A 1IW6A 1L98A 2F2QA 4GRVA 173LA 3C9LA 3A7KA 247LA 113LA 160LA 2LC9A 2RBQA 5ETZA 1C6DA 3HUKA 5JJJA 1G0GA 5G2DA 5G2CA 3WQJA 4OV0A 2B6WA 4PK0A 2PEDA 109LA 1CX7A 182LA 4X1HA 1L00A 243LA 234LA 1D3FA 1L45A 1L71A 2X72A 137LA 4ARMB 1XEPA 2RH1A 139LA 3CDVA 1NHBA 1LI2A 4DAJA 6LZMA 3HANA 5F8UA 1OYUA 3HTGA 3NSBA 4IAQA 1L55A 5TGZA 118LA 1L15A 2A4TA 2Y00A 3ODUA 3HUQA 1LI3A 4L35A 1L13A 1LLHA 1C8RA 2I21A 1L77A 236LA 2JAGA 2WJKA 1L09A 4W58A 1XMEB 1C60A 181LA 4EKQA 1L01A 1GU8A 1L47A 2I20A 245LA 1KY0A 4GP5B 1U19A 4EPIA 115LA 129LA 1L69A 2QARC 1PQMA 235LA 1C6FA 2HUMA 1L35A 1CVKA 1PQDA 1P8UA 4BEYA 1DYBA 201LA 162LA 1PQIA 4MQSA 1S8LA 2YDOA 2OU8A 1L53A 4WW3A 5DHGA 1L84A 2B73A 3SB7A 1L40A 1M0LA 4ARQB 2B6TA 3EH5B 1L33A 2B70A 1PXSA 4IARA 1D3NA 169LA 1KS3A 249LA 4BVNA 2F32A 1L17A 1G1VA 1OWYA 5H2MA 1C6AA 4I7TA 3UZAA 2Y01A 3C7ZA 1C6BA 219LA 2KSAA 1L60A 3HH3A 4A4MA 1L89A 2NTWA 1PQJA 4EPFA 143LA 2ZIYA 4N6HA 1L91A 1LN6A 217LA 1G0MA 1LWKA 4G7QB 1S54A 114LA 1L62A 1DYFA 3HH5A 238LA 1L06A 220LA 1P3NA 1L81A 4W57A 4MD1A 2RB0X 5G36A 172LA 199LA 2AT9A 5B6ZA 1L02A 3GUKA 1P36A 257LA 5J7AA 1L66A 4QIDA 5B6XA 1H68A 1GUEA 1L87A 1C6JA 1CU5A 1KY1A 1QTVA 5DHHA 1L72A 1QUHA 144LA 125LA 112LA 1EPYA 261LA 2O79A 4G71B 5H2NA 255LA 3SB8A 119LA 192LA 126LA 1L38A 1QT6A 1C67A 149LA 1D2YA 155LA 2B72A 3GUIA 3HU9A 5H2HA 3SBBC 3G3WA 5A8EA 1KGBA 1L93A 2LCBA 1G0KA 178LA 180LA 5I14A 4YX7C 4I7QA 2YCXA 4N4WA 1MGYA 5H2PA 3G3XA 3KJ6A 1K28A 1LPYA 1D9WA 3V2YA 2OU0X 3CODA 1JTMA 4X31A 1C6HA 237LA 4LDOA 1L22A 2KSYA 1GZMA 2Z73A 212LA 1CU0A 4IAPA 1L16A 258LA 3RUNA 3DN8A 250LA 104LA 1CV4A 246LA 3RFMA 1QS9A 1R2NA 3HT7A 1C69A 5AX0A 1CUQA 2B7XA 198LA 5C1MA 1L10A 3QJUB 150LA 1L21A 1FBKA 1X0SA 1D3JA 1QTCA 5KKHA 1C61A 3L2XA 1L32A 2KS9A 4GYCA 1L90A 1JV6A 4UG2A 157LA 4MQTA 1HZXA 2YDVA 5BR5A 1C66A 1JGJA 3SBAA 4W51A 4YXAC 3MBVA 240LA 3HDEA 1L92A 4EKRA 2B6ZA 138LA 7LZMA 1C8SA 2Y02A 1G0QA 2F47A 1T97A 4ZPUA 3DMZA 1F50A 1L27A 1CTWA 1QT8A 1C6PA 3DNAA 191LA 2NTUA 3QJSB 1SWYA 4J4QA 2EI4A 4XT1A 2NTHA 3GUNA 1CWQA 4GBRA 215LA 1L68A 3DN1A 2L6XA 1C6NA 3GUOA 1BRRA 1Q5IA 1P5CA 184LA 3HTDA 5DYSA 1DYCA 4WAVA 1F4ZA 1OWZA 1QM8A 123LA 3C7WA 1B6IA 2O7AA 3HDFA 4I7RA 1M0KA 2I35A 3COCA 1KW5A 1L67A 1L99A 2RAYX 3C81A 3C8SA 1CU3A 1SWZA 5G2AA 4HWLA 1ZURA 1P46A 1L43A 3RZEA 1L58A 4Y9HA 1L19A 2LNLA 2Q9DA 3QJVB 1L61A 1SX2A 1T8FA 3OAXA 4EKPA 1IW9A 1L44A 5LWEA 187LA 151LA 1C62A 2Z6BA 3C80A 4QRYA 3C8QA 1LW9A 127LA 1LYEA 1E0PA 4XTLA 5FJGA 1QKPA 205LA 5LZMA 3QDCA 4JQ6A 1LYFA 1AP9A 1X0K1 3AM6A 1L54A 1L83A 1IXFA 4N4YB 1QTHA 1L80A 3S8GB 4HYJA 214LA 5A44A 1QKOA 1DYGA 2RBNA 248LA 166LA 1C63A 4K5YA 1P56A 4GBRB 111LA 2KSBA 5B35A 3PBLA 1L56A 1OVHA 1KW7A 4EA3A 2BRDA 1LWGA 1L14A 4MD2A 1P6YA 4I7LA 195LA 2B6XA 1P7SA 5AX1A 242LA 5G54A 4BEZA 4JKVA 3K2RA 4AQNA 3UG9A 260LA 1KG8A 3VI0A 1QT4A 2J4YA 3DMXA 3UTVA 4GP4B 107LA 3SN6R 4W55A 5A45A 108LA 2B75A 1R84A 1PY6A 1L30A 1C6CA 1CV6A 3UTWA 1QS5A 1T8GA 3EMLA 3G3VA 2QPDB 252LA 5EN0A 1TN5A 1C6TA 185LA 259LA 5G53A 1L51A 3LZMA 1L20A 1P8IA 3BVDB 1QHJA 254LA 1E12A 1L0MA 1CX6A 163LA 1D3MA 2F93A 1QUDA 1L25A 3C9MA 3DN3A 1H2SA 1DYDA 3D4SA 3T45A 1C65A 1L63A 2ANXA 256LA 2VT4A 2I1XA 1L0KA 1P64A 4I7OA 4FPDA 1XJUA 209LA 176LA 1FBBA 3QBGA 4AMIA 1L88A 1QSQA 3HUAA 3GULA 4JR8A 3EH4B 1LYGA 3HARA 3HWLA 1C3WA 1BM1A 2ZFEA 4XXJA 4KNFA 5H2JA 3HAQA 3EH3B 1VJMA 1KG9A 175LA 4G7SB 3FI5A 1L9HA 1L04A 1S8JA 222LA 5H2LA 3HTFA 1L46A 1L79A 189LA 141LA 1G0JA 216LA 4EJ4A 120LA 1Q5JA 1D2WA 4G72B 1L39A 1P37A 2WJLA 2HULA 110LA 1LYHA 196LA 2IGCA 1C6EA 233LA 3OE6A 1C6GA 1WTHA 3C83A 3DQBA 3VHZA 3DMVA 3HASA 4G7RB 1CV3A 3SB6A 2R4SA 2B6YA 1XIOA 5AZDA 1SSWA 1JQUA 1QUGA 4DKLA 5B34A 140LA 3ZPRA 1L11A 1OVKA 1ZYTA 3F9LA 146LA 4W56A 1L73A 3PWHA 4GPOA 1L07A 1C6QA 148LE 1G1WA 1CV5A 1LGWA 159LA 2OTZX 4EKSA 3VG9A 211LA 3VGAA 232LA 3QBKA 1C68A 1L23A 241LA 5H2OA 5B6VA 1LYIA 2Z55A 2NTGA 4XTOA 1C6KA 4I7JA 190LA 4UHRA 1PQOA 174LA 145LA 2HPYA 5AWZA 213LA 1L64A 5B6YA 1SSYA 4OO9A 5B0WA 1I6SA 226LA 177LA 2Y03A 1G06A 122LA 3CDRA 1OVJA 2M3GA 4YXCA 2QB0B 3DKEX 103LA 1LGUA 4W52A 4ARQA 3DN2A 2G87A 1L29A 1C64A 1LGXA 186LA 224LA 1L82A 1L95A 225LA 142LA 4E97A 3CAPA 1L50A 2OEAX 1M0MA 3CDQA 2RB2X 1L65A 3HH6A 1T6HA 251LA 3QJQB 1CV0A 239LA 156LA 1L41A 3HU8A 3OE0A 3SB9A 2OE7X 4I7NA 1O0AA 3C82A 3JR6A 4LDLA 2RBOA 1PXRA 2R4RA 3P0GA 3UTYA 3S3CB 3QAPA 5B6WA 1L75A 1BRDA 2QPEB 147LA 3HT6A 2CUUA 2HUKA 1L26A 3DN0A 4PXFA 1AT9A 4IB4A 5ITEA 4MBSA 1TLAA 4I7SA 1QTBA 206LA 4ARPA 164LA 1ZWNA 2Y04A 3GUMA 1L74A 161LA 2RAZX 1BRXA 1L18A 197LA 4XTNA 5AHZA 4HYXA 5H2IA 1L48A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 3TXIA 1KXXA 2ZZLA 3TXHA 1GDWA 2DQIY 1B5XA 4LYZA 2JAFA 1P2RA 1WQOA 2OE4X 1OV5A 4H9FA 4ETCA 3HTBA 1G0PA 102LA 1J1XY 1L86A 3NY8A 1L49A 1LMTA 1QT3A 3CDTA 1AT5A 135LA 2D4IA 1A2YC 2BLYA 1OUAA 4S0WA 3SB5A 4L6RA 4LDEA 1C46A 3C8RA 1L0JA 5F9XA 3QAKA 3HAPA 3NYAA 194LA 1B5ZA 4U3XB 2B74A 4FAAB 5DN5A 1UAZA 1JTNA 4I7PA 1L08A 4NGOA 1L12A 3B0OA 1HFXA 1IP7A 1S52A 3FA0A 128LA 1QDTA 228LA 2RB1X 5AHYA 1UCQA 2HU1A 4GN3A 1LSPA 1L34A 1XGRC 1TCYA 2HEDA 3ABWA 3HBDA 3X3BA 1JEFA 2D6BA 3DDLA 5KKIA 3WW6A 1G7IC 158LA 1G0LA 1HEWA 1XJTA 2FBDA 3PQRA 3WYHA 3TXFA 1XJIA 1KMEA 5H2KA 4NGZA 3REYA 193LA 1F88A 1GFEA 4I7MA 3W6EA 1CU2A 3QY4A 1IW6A 4GRVA 1L98A 4J0LA 160LA 2LZ2A 1C08C 5F14A 3WQJA 3WW5A 3P64A 109LA 2YBJA 243LA 4RLNA 1L71A 1GBWA 2X72A 4ARMB 139LA 1C45A 3CDVA 1LI2A 5F8UA 3G3BB 3NSBA 4IAQA 5KXMA 2Y00A 3HUQA 1HEQA 4Z46A 4L35A 2WJKA 1UIAA 5L3IA 181LA 1L01A 1IP1A 3A34A 1WQRA 1U19A 1GDXA 235LA 1C6FA 1L35A 4B4EA 2H5ZA 4C5FA 2YDOA 1T3PA 4WW3A 1L84A 2B73A 3SB7A 4N1CC 2B6TA 4DDAA 3A90A 2BLXA 4BVNA 1L17A 4H9HA 4I7TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2R4S A;  2B6Y A;  1XIO A;  5AZD A;  1SSW A;  1JQU A;  1QUG A;  4DKL A;  5B34 A;  140L A;  3ZPR A;  1L11 A;  1OVK A;  1ZYT A;  3F9L A;  146L A;  4W56 A;  1L73 A;  3PWH A;  4GPO A;  1L07 A;  1C6Q A;  148L E;  1G1W A;  1CV5 A;  1LGW A;  159L A;  2OTZ X;  4EKS A;  3VG9 A;  211L A;  3VGA A;  232L A;  3QBK A;  1C68 A;  1L23 A;  241L A;  5H2O A;  5B6V A;  1LYI A;  2Z55 A;  2NTG A;  4XTO A;  1C6K A;  4I7J A;  190L A;  4UHR A;  1PQO A;  174L A;  145L A;  2HPY A;  5AWZ A;  213L A;  1L64 A;  5B6Y A;  1SSY A;  4OO9 A;  5B0W A;  1I6S A;  226L A;  177L A;  2Y03 A;  1G06 A;  122L A;  3CDR A;  1OVJ A;  2M3G A;  4YXC A;  2QB0 B;  3DKE X;  103L A;  1LGU A;  4W52 A;  4ARQ A;  3DN2 A;  2G87 A;  1L29 A;  1C64 A;  1LGX A;  186L A;  224L A;  1L82 A;  1L95 A;  225L A;  142L A;  4E97 A;  3CAP A;  1L50 A;  2OEA X;  1M0M A;  3CDQ A;  2RB2 X;  1L65 A;  3HH6 A;  1T6H A;  251L A;  3QJQ B;  1CV0 A;  239L A;  156L A;  1L41 A;  3HU8 A;  3OE0 A;  3SB9 A;  2OE7 X;  4I7N A;  1O0A A;  3C82 A;  3JR6 A;  4LDL A;  2RBO A;  1PXR A;  2R4R A;  3P0G A;  3UTY A;  3S3C B;  3QAP A;  5B6W A;  1L75 A;  1BRD A;  2QPE B;  147L A;  3HT6 A;  2CUU A;  2HUK A;  1L26 A;  3DN0 A;  4PXF A;  1AT9 A;  4IB4 A;  5ITE A;  4MBS A;  1TLA A;  4I7S A;  1QTB A;  206L A;  4ARP A;  164L A;  1ZWN A;  2Y04 A;  3GUM A;  1L74 A;  161L A;  2RAZ X;  1BRX A;  1L18 A;  197L A;  4XTN A;  5AHZ A;  4HYX A;  5H2I A;  1L48 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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