4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein, hydrolase
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
3HASA 1EHKB 243LA 1S53A 246LA 186LA 1F88A 245LA 2R4SA 1U19A 241LA 1C63A 2RAZX 3V2YA 231LA 2R4RA 4L6RA 2OE7X 1L29A 3SBAA 2HUKA 1C65A 1QKPA 2EI4A 3QJTB 3QJVB 5H2LA 3VHZA 4I7LA 1L65A 3DN4A 1L08A 1FBBA 1L86A 1HZXA 5C1MA 1C6TA 3HARA 201LA 1L13A 3FA0A 3HH6A 1L0JA 4EKQA 2B74A 3OE0A 172LA 4I7OA 4ARJA 5ETZA 1C6CA 1CTWA 4DJHA 4EA3A 1D3MA 235LA 5H2PA 1TN5A 5B2NA 196LA 2QARC 4X1HA 104LA 2B73A 4I7SA 2YCYA 1L28A 131LA 3HTFA 3JR6A 2Q9DA 5H2HA 2CUUA 2Y02A 2RBOA 1IW9A 4X31A 5AHYA 2B6YA 3RUNA 3DDLA 3ABWA 5BR5A 1Q5JA 1ZYTA 2QPDB 5ITCA 138LA 1CVKA 3C7WA 4ARMA 3PBLA 3GUMA 223LA 184LA 3SB7A 1X0I1 111LA 2F47A 4HYJA 4WW3A 1R84A 1C6NA 5LZMA 1DYAA 3HAPA 1LYHA 1P6YA 205LA 3F8VA 3A7KA 3C82A 162LA 5H2NA 167LA 3HT7A 1O0AA 4G70B 1M0KA 3DN8A 4HYXA 3PWHA 1P36A 3AYMA 1OWZA 1ZURA 1D3JA 1L83A 4ARPA 1QT4A 3SBBC 4XTOA 2Y03A 3S3DB 4AMIA 4G7QB 176LA 1AT9A 3HTBA 1G0GA 1P46A 3UONA 3VI0A 1GU8A 5ITEA 4IARA 1DYEA 182LA 214LA 1L09A 1C6FA 1EPYA 247LA 3DN2A 224LA 1CX7A 1T8AA 2NTHA 4I7QA 4NC3A 3L2XA 3DKEX 5EN0A 1K28A 2IGCA 2NTUA 2LNLA 1G0LA 1JGJA 2NTWA 1L75A 4MD1A 213LA 5G36A 137LA 1AP9A 4IAPA 2YDOA 1LYEA 3FADA 1L89A 2YDVA 3C9LA 3WQJA 4W59A 3F9LA 3OE8A 1KG8A 1QHJA 2I35A 3NYAA 1L39A 1L84A 155LA 112LA 150LA 3GULA 1BM1A 2YCWA 3HAOA 211LA 250LA 3HDEA 5G54A 1E12A 1L24A 4QIDA 1L50A 1QTDA 158LA 4EJ4A 1L0KA 107LA 4G71B 2YCZA 5AWZA 3C81A 1QSBA 4BVNA 4ARQB 1C62A 183LA 113LA 1M0LA 1L06A 1BRDA 1L92A 1L88A 1WTHA 4WAVA 5JJNA 1L27A 3HT8A 1OYUA 1L58A 3RFMA 1KS3A 2ZZLA 3EH4B 5G2AA 1P64A 2OU9A 191LA 1XIOA 1L97A 4EPIA 1L33A 1P5CA 123LA 1C64A 3UZAA 1L32A 5H2JA 171LA 1CU2A 251LA 1SSWA 3HAQA 1L70A 3PQRA 206LA 2HUMA 4BWBA 229LA 4W53A 1DYCA 239LA 4TL3A 2KSAA 1CU0A 1OV7A 221LA 3EH5B 3C8QA 3HTGA 173LA 141LA 2B6WA 262LA 2RBSA 2WJLA 1C61A 2ANXA 2RB2X 3C8RA 3P0GA 1QS9A 5B6WA 178LA 1L22A 3S8FB 1L02A 1IXFA 2PEDA 2F2QA 3SN6R 3AYNA 1QTVA 4OV0A 5B35A 1L15A 1UCQA 4LZMA 1SSYA 2Z73A 230LA 258LA 1S52A 3OAXA 1PQDA 3CDOA 4GBRB 5AHZA 4PXKA 2B72A 1DYDA 2YCXA 5H2MA 5AX0A 1QUGA 3GUJA 120LA 2BRDA 5A44A 4EIYA 3ZPRA 2Y00A 5H2IA 127LA 1OV5A 3DMXA 2HULA 3REYA 4YX7C 1LYJA 3NY9A 1L52A 1L94A 115LA 4ARMB 4PK0A 1QUHA 4I7MA 3VVKA 2M3GA 110LA 3T45A 3DQBA 3QBLA 4PJZA 3S8GB 4BEYA 3S3CB 143LA 1VJMA 4S0WA 5A45A 5KKHA 2B6ZA 1L10A 1L04A 4BEZA 1QKOA 2I20A 1PY6A 3HWLA 1SWYA 3HUQA 2B6XA 4KLYA 1L18A 4ZPUA 1G0PA 1CUPA 1KGBA 3COCA 1D2YA 1L73A 1G1VA 1C6PA 244LA 4XTNA 1XEPA 4MQSA 1L61A 1QTZA 129LA 174LA 219LA 4W52A 1LN6A 1L38A 1L07A 1L9HA 3GUKA 4N6HA 233LA 1L69A 6LZMA 1B6IA 1C6JA 118LA 4KNFA 170LA 1G07A 5H2KA 4IB4A 177LA 2RAYX 5DYSA 4GPOA 1P37A 1KMEA 1CV1A 5H2OA 3LZMA 4GRVA 4E97A 1XMEB 5G2DA 2RB0X 1L76A 130LA 3HT6A 126LA 1IW6A 4I7PA 3HT9A 1BRXA 1L67A 3QBKA 1L11A 254LA 4LDOA 1C6GA 1T97A 2Q9EA 5AX1A 1C8RA 3VGAA 1C6LA 1KG9A 3QAKA 248LA 5BR2A 4GYCA 187LA 4PXFA 169LA 4N4WA 1L46A 3C8SA 3UG9A 1MGYA 1L20A 4QI1A 2B6TA 1XJUA 149LA 3X3BA 4OO9A 180LA 1LGXA 2B7XA 2LC9A 4YXCA 2QPEB 1NHBA 3CDVA 165LA 1TLAA 4BV0A 1JTMA 4I7NA 1L26A 163LA 1L72A 4W56A 109LA 128LA 144LA 1G06A 3SB6A 1KW5A 1TN0A 1L96A 215LA 2I1XA 1CV5A 3G3VA 4J4QA 5J7AA 1P2LA 1ZWNA 1LI6A 4ARLA 1BRRA 1LW9A 3L64A 3HUKA 1L49A 103LA 192LA 1PQJA 210LA 4LDLA 142LA 164LA 3QJRB 256LA 1L85A 1L99A 2RBQA 1SX7A 3S3BB 1T8GA 1OWYA 1CU6A 1CWQA 1Q5IA 227LA 2KSBA 3NSBA 3HDFA 1T6HA 3CDTA 4G7SB 4XXJA 1PQOA 3C80A 216LA 4JKVA 1L21A 3QBIA 1L87A 4I7TA 3DMZA 1C8SA 5DHGA 1C6AA 1L34A 3HH3A 1LYFA 2QB0B 168LA 1PQIA 4IAQA 4I7RA 3CDRA 259LA 151LA 146LA 1QT5A 242LA 4UG2A 2RBRA 4I7JA 175LA 1CU5A 1DYFA 3DN6A 1OVHA 3GUPA 1L16A 140LA 1L37A 2LCBA 1L00A 2WJKA 166LA 2ZFEA 1VGOA 3FI5A 5JJEA 4GP8B 1I6SA 4YXAC 1F50A 1G0MA 1LI3A 5G53A 234LA 1OVKA 3UTVA 188LA 3C9MA 1P8HA 2AT9A 1QTBA 1G0JA 3GUIA 1D3FA 1QTHA 2Z55A 1CV4A 1DYBA 225LA 1KW7A 2O4WA 255LA 3HH5A 1GZMA 218LA 1H68A 2L78A 1JTNA 2JAGA 1C6IA 1C66A 3D4SA 4A4MA 1LPYA 2KS9A 1L03A 4EKRA 1S54A 5G28A 157LA 1QUDA 2ZIYA 125LA 220LA 2F93A 1C6HA 3G3XA 4DAJA 1M0MA 1L14A 160LA 181LA 4EKSA 1L45A 4FPDA 3DN3A 3QAPA 1L30A 4EKPA 1PXSA 1QT7A 3HU9A 1G0KA 1L43A 3VW7A 4EPFA 2OE4X 2G87A 1QSQA 1D3NA 145LA 1C3WA 2JAFA 2OTYX 3ZPQA 1C6QA 1QT8A 1PQKA 1L56A 3DNAA 3ZEVA 1CU3A 2OE9X 1CUQA 1C6EA 4FA7B 3C7YA 152LA 148LE 156LA 4LDEA 4XTLA 159LA 2RBNA 3OE9A 3V2WA 2J4YA 3SB5A 1L23A 3BVDB 3MBVA 1DZEA 1P8IA 3UTYA 2X72A 3QJQB 1CV6A 4G72B 4UHRA 1L63A 1JFPA 1P2RA 1L0MA 1L48A 5JJJA 3G3WA 1L35A 190LA 1L36A 1L79A 5B6XA 1C69A 1LYIA 232LA 4XT1A 1L57A 2RB1X 3DN0A 1R2NA 1SX2A 4BUOA 4GBRA 3GUOA 5B6ZA 4FAAB 1XJIA 3C83A 5I14A 3EH3B 102LA 1L68A 1L47A 228LA 1KY1A 1X0K1 3QJUB 2KSYA 1L64A 4W54A 1LWGA 1JV6A 1G0QA 1C68A 217LA 4I7KA 1E0PA 2HPYA 5A8EA 1L54A 1JV7A 3CAPA 5B0WA 249LA 1CV3A 198LA 185LA 1L31A 4W58A 2RH1A 1P8UA 1PQMA 4GP5B 1G1WA 2OU0X 3NS0A 1L40A 122LA 1XJTA 1S8JA 3EMLA 199LA 3SB9A 1T8FA 4Y9HA 1LYGA 3AM6A 1L62A 2A4TA 4XT3A 3GUNA 1KY0A 4W57A 5B34A 257LA 3PDSA 1L53A 1UAZA 1L59A 5AZDA 3CDQA 2VT4A 4X32A 1GUEA 1L01A 3HUAA 1OVJA 139LA 1LWKA 260LA 1LGWA 1KNIA 5TGZA 4MQTA 1L42A 1LI2A 1P7SA 2Y01A 3HANA 1C6KA 1P56A 1C6BA 237LA 1L82A 2ANVA 4W51A 1H2SA 4QRYA 2Z6BA 1S8LA 261LA 200LA 1CX6A 3QDCA 222LA 2B75A 1S51A 1QS5A 3HU8A 3C7ZA 2Y04A 3RZEA 1LGUA 114LA 4JR8A 2LZMA 4DKLA 1QT3A 3UTXA 161LA 1L44A 3DMVA 1D2WA 1JQUA 4L35A 2O7AA 2F95A 119LA 3K2RA 1L77A 3QBGA 1L25A 1L55A 253LA 4AQNA 2L6XA 2OEAX 2NTGA 4HWLA 5DHHA 4MD2A 1D9WA 212LA 1L71A 238LA 3UZCA 209LA 1C6MA 1L98A 108LA 5LWEA 1L91A 1L90A 240LA 1C6DA 1C60A 1LYDA 197LA 5F8UA 3NY8A 1C67A 4N4YB 3HTDA 1L05A 4MBSA 1L80A 236LA 5B6YA 4AMJA 1L95A 2OU8A 1QUOA 1L12A 1QT6A 2RBPA 252LA 5B6VA 4GP4B 3SB8A 4FBZA 1SWZA 1L51A 3X3CA 1DYGA 147LA 1F4ZA 1L19A 4K5YA 1QM8A 1X0SA 3ODUA 3PXOA 1FBKA 5G2CA 1L66A 1PXRA 1L17A 2F32A 4EXMA 4JQ6A 3VG9A 3CODA 1QTCA 4ARQA 1L74A 4G7RB 1L60A 1L93A 4W55A 3UTWA 1L81A 189LA 2OTZX 2I21A 3OE6A 226LA 1L41A 3HH4A 2O79A 7LZMA 2B70A 3KJ6A 3QJSB 5FJGA 1LLHA 1P3NA 195LA 1CV0A 3DN1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LYZA 3B0IA 2R4SA 1WTNA 1U19A 1C63A 4L6RA 5H2LA 1L29A 3LYOA 2HUKA 3QJTB 1FLYA 1FBBA 1C6TA 1IOCA 201LA 1CKCA 1L13A 5I4WA 4EKQA 2BLYA 3HH6A 1MLCE 4I7OA 6LYZA 172LA 1CTWA 1D3MA 3LHMA 4QY9A 5B2NA 1QTKA 196LA 3TXGA 2Z39A 104LA 2B73A 3JR6A 1B9OA 2MEFA 2Y02A 4WL7A 1IW9A 5AHYA 3DDLA 1ZYTA 2QPDB 4TTDA 1CVKA 2ZIJA 5LXWA 223LA 2DQGY 1LYHA 1P6YA 1JTOL 162LA 1O0AA 4G70B 2CJLA 1P36A 3A92A 1QT4A 4G7QB 1AT9A 1QSAA 3VI0A 1GU8A 5ITEA 4IARA 1QSWA 1EPYA 1CX7A 5KXTA 2LHMA 1AT6A 2LNLA 4MD1A 1BWJA 1B7QA 2YBMA 4IAPA 1KIRC 1LYEA 3C9LA 3WQJA 5LVHA 3OE8A 1G7JC 3HBHA 1LZ5A 1FBIX 1L84A 5DN5A 1LSCA 4NG8A 150LA 3GULA 5HQ1A 4KXIA 4N8ZA 2HU1A 1IP6A 4N5RA 1E12A 1L24A 1QTDA 2XBSA 4EJ4A 1L0KA 107LA 5F9XA 113LA 3T36A 1BRDA 5JJNA 4PRUA 5KXNA 1LSBA 1KS3A 2ZZLA 1CJ6A 5LVIA 2OU9A 2F2NA 191LA 1XIOA 1L33A 1P5CA 1LSFA 171LA 1CU2A 4WM2A 4J1BA 206LA 1GAZA 1EQEA 4BWBA 2HEFA 2A7DA 4PGJB 239LA 1XGTC 1UIDA 1OV7A 5I5QA 3HTGA 134LA 1B7MA 2RBSA 3C8RA 1HNLA 2HEAA 1J1OY 4G4CA 3ZEKA 4HPIA 1IXFA 1GB0A 1NWGA 1QTVA 1L15A 2Z73A 258LA 5AHZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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