The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
GDLAGKWQLRQYQYADGTSEKVDSVFYNFQKGSFSAICLLKDGGLTTFFGNYSLKGAEISIILLPESVNDKNYDTYFGWPEGKCTFKVEDLSYSSLRLEYEGTKSIFRKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Hypothetical protein
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| publication title |
Crystal structure of a hypothetical protein (BACUNI_01346) from Bacteroides uniformis ATCC 8492 at 1.79 A resolution
rcsb |
| source organism |
Bacteroides uniformis atcc 8492
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| total genus |
23
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| structure length |
110
|
| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Lipocalin | Lipocalin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5BYP A; 4QRL A; 3HTY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KT3 A; 3CQN A; 2OVS A; 3EC5 A; 5L8N A; 3OE3 A; 1U18 A; 5LJG A; 1JBH A; 1KGL A; 1EII A; 1QQS A; 1E2T A; 4GZV A; 4C5P A; 5B11 O; 1L6M A; 1SY2 A; 4GKC A; 1HMS A; 1WBI A; 1SRF A; 2K23 A; 2X34 A; 4XMD A; 3BY0 A; 1LDO A; 1K24 A; 1HN2 A; 3AEH A; 3BX8 A; 1FDQ A; 1NP1 A; 5IRU A; 1VWO B; 1RST B; 2UYW A; 3S26 A; 1NGL A; 2GTL M; 1SLE B; 2G5L A; 1STS B; 1VWC B; 3MG5 A; 4HPD A; 4K19 A; 2FS7 A; 4HPC A; 4ZH6 A; 4DNE A; 4ALO A; 3U0D A; 3P6E A; 4LKT A; 1DF3 A; 1LCW A; 1BRQ A; 2MWH A; 2IZK A; 1UZ2 X; 3HOE A; 5DPQ A; 4ZR2 A; 1AQB A; 2BS6 A; 5B27 A; 2FKJ A; 1SRI A; 2A13 A; 4GRJ A; 4AZQ A; 2RTP B; 4NLJ A; 1JJX A; 3D96 A; 3NR3 A; 4D6A A; 4U8U N; 2QOS C; 4YKO A; 1I04 A; 2OY8 A; 1SWG A; 3RSW A; 1VWJ B; 2Q4N A; 3FA6 A; 4IMN A; 5LJK A; 1JMX A; 1PMP A; 4NP1 A; 5H8T A; 2FHL A; 1Y53 X; 3PK2 A; 1H91 A; 3VG2 A; 4M6S A; 2POA A; 1A3Y A; 3SZJ A; 1KT5 A; 4BX5 B; 2IZG B; 3CR6 A; 3VPJ E; 1MX8 A; 3CQR A; 4I9R A; 3VGW A; 1YIV A; 1QFV A; 3WZQ A; 3FMZ A; 5B10 O; 3NBX X; 4JO6 A; 4ZHC A; 3U9P C; 5HA0 A; 4FGI B; 2RTJ A; 3P02 A; 3ELZ A; 2Q9S A; 1Y0G A; 2X45 A; 3FW5 A; 1STP A; 4GGZ A; 1ICN A; 4O3W A; 2GTL N; 2RTM A; 3RBY A; 4QGV A; 4OS8 A; 3ZI8 A; 1I4U A; 1CBS A; 1W4T A; 3RY1 A; 2FWV A; 3I17 A; 4ORY A; 5EEE A; 4YVB A; 2RTG B; 1JYJ A; 2OF9 A; 2HNX A; 1FEN A; 3FDC A; 1G74 A; 2L67 A; 1LFO A; 1VWL B; 3FR2 A; 3EBK A; 5AQ6 A; 1I06 A; 1GX9 A; 3HWG A; 4CPH B; 1XKI A; 3PP6 A; 1Y9L A; 3FEP A; 4YFP A; 1SWQ A; 1KL3 A; 1LCV A; 1MX7 A; 2C4I A; 1A2D A; 2FT9 A; 2JU8 A; 3ZUI A; 2VFC A; 1G85 A; 1I78 A; 3APU A; 5FQ8 E; 1W5R A; 4AZM A; 4ZFX A; 4FBR A; 2FR3 A; 4N7C A; 4Z2P A; 3OJY C; 3WZO A; 2A5C A; 1LCZ A; 1SWA A; 1YWD A; 1QG5 A; 2QOM A; 2RTA A; 1SRJ A; 2VDF A; 2DJG A; 5F1E A; 3B2H A; 3BU1 A; 4Y0R A; 3WJB A; 1SWJ A; 3VHH A; 3ZQ3 A; 4ORW A; 1IW2 A; 1X89 A; 3T2X A; 3UEX A; 1U0X A; 1AVE A; 1ML7 A; 2X8F A; 1SWU A; 2MF6 A; 4QGW A; 3S5X A; 3ZW1 B; 3CWK A; 3RZY A; 3EBW A; 2RTD B; 5H9K A; 1EAL A; 1EUO A; 1ICM A; 1GXA A; 1GKA A; 3BX7 A; 4GD9 A; 1RBP A; 1LPJ A; 4ODD A; 2W2F A; 2IZC B; 2OVA A; 3EW2 A; 2JW1 A; 1KT7 A; 1AVD A; 1EPB A; 2QO5 A; 4YGZ A; 2FRS A; 2AL0 X; 2LKK A; 2RTH B; 2XST A; 4A60 A; 4ZGU A; 3H3I A; 1ZNG A; 2FLJ A; 2QCB A; 3RWX A; 1X8Q A; 3EYC A; 5HWZ A; 4RUN A; 2OL6 O; 3IA8 A; 1KT4 A; 4CK4 A; 4PJ2 A; 1N4J A; 1RXJ A; 1YWA A; 4CPH A; 3L4R A; 4U9C A; 2Y32 A; 5KIC A; 2IZA A; 1LIF A; 5B3M O; 1LF7 A; 3T1D A; 3BU9 A; 5HCD C; 1VYO A; 1ZNL A; 1KZW A; 4TKH A; 2AT6 X; 4AYH A; 2FGS A; 2P8G A; 2RTB B; 1SA8 A; 2FKG A; 4O49 A; 3HK1 A; 3HPE A; 2OVE A; 4GET A; 4GK9 A; 4GNY A; 3SLT A; 1Y9T A; 1EW3 A; 2ACP X; 2HZR A; 2QO4 A; 4ML7 B; 2JU7 A; 3UEW A; 4ZH9 A; 1BWY A; 4M7M A; 4WFV A; 1NP4 A; 1IJ8 A; 2GJ5 A; 1DZJ A; 3APV A; 4IMO A; 1SXW A; 2IZH B; 4MIS A; 4U3Q A; 5LKE A; 4ON1 A; 3RE6 A; 2CZT A; 4U46 A; 3SLJ A; 4LZU A; 3MM0 A; 1DFV A; 3WZN A; 3LV4 A; 5HZ9 A; 2JOZ A; 1DV9 A; 3V8U A; 3APW A; 2JGS A; 1HMR A; 2RTR B; 2AKQ A; 2QM9 A; 4GDA A; 4U8U M; 4AW8 A; 1E5P A; 4N7D A; 4ORS A; 4NV8 A; 4ARH A; 3VHM A; 3TGC A; 2NP1 A; 2WSJ A; 1ZNK A; 1KQX A; 2BSZ A; 2R73 A; 4GH7 A; 4XME A; 1GKA B; 2BC3 A; 2PI3 O; 1TVQ A; 1BJ7 A; 1GX8 A; 3D9W A; 3RE5 A; 3FA9 A; 1SY1 A; 2X8S A; 1D3S A; 2JMB A; 4XMG A; 5HZ6 A; 3PEC A; 4BCS A; 1RXK A; 5D47 A; 1AEL A; 2L5P A; 1CBR A; 5L3Y A; 2CM4 A; 4UU3 A; 2VFB A; 5BVT A; 1DZM A; 1SLF B; 1EIO A; 3EW1 A; 1DF8 A; 2G79 A; 1SWN A; 3X00 A; 4GE1 A; 1LKE A; 2OVD A; 1N7Y A; 1SMP I; 5DG4 A; 4CDC A; 3FIQ A; 4Z27 A; 2EU7 X; 1OBP A; 5HAE A; 3EMM A; 1MM9 A; 3GAQ A; 2R74 A; 1LUQ A; 4XMF A; 2RCQ A; 2Z4I A; 4Y0S A; 2X55 A; 4Z2V A; 1YWB A; 3ELX A; 4YFR A; 1RSU B; 4NYQ A; 4IB8 A; 3KQ0 A; 1O1V A; 1MUP A; 1PBY A; 1FE3 A; 1SXU A; 2K62 A; 3PH6 A; 4WFU A; 4YCE A; 2CBR A; 2G8C O; 1HMT A; 2HMB A; 4IAX A; 4DQ3 A; 1OEE A; 3NQK A; 3VG6 A; 4OS0 A; 4FQB B; 1OEJ A; 2C1Q A; 3D95 A; 3VU1 A; 3ZW1 A; 1GT5 A; 2A3F X; 4EFG A; 1RXH A; 1OPB A; 3GE2 A; 4GGT A; 1KZX A; 5F2B A; 2LFO A; 2RTL A; 2Q2M A; 3NAD A; 4O3X B; 4O4U A; 2ANS A; 4NNT A; 2ASN X; 1URE A; 3RDO A; 3MBT A; 2NNQ A; 4ALB A; 2C1S A; 4A8Z A; 3KZA A; 4FBO A; 2WUT A; 3FR4 A; 1B8E A; 1VWD B; 1VWR B; 1HQP A; 1SXY A; 2RQ0 A; 5CYB A; 4Z28 A; 5HTE A; 1BLR A; 2OZQ A; 1O8V A; 3VG5 A; 4TJZ A; 3HOL A; 4IAW A; 4YFQ A; 5BYP A; 1NQM A; 2XKL A; 1IKJ A; 4QNI A; 4MEE A; 2RTC B; 3G7X A; 3NX2 A; 3ZZV A; 3WJD A; 4YH0 A; 2IZI A; 1IIU A; 3D97 A; 3PPT A; 4EKV A; 2WPU A; 4BOE A; 4CPF A; 3KFF A; 1CBI A; 1VWN B; 1VPR A; 2IFB A; 3WYQ A; 4AZR A; 3E3C A; 1KL5 A; 2Y3E A; 1SLD B; 3PQS A; 4MIR A; 2RTO B; 1CJ5 A; 2IZB A; 1KL4 A; 1E06 A; 2RTQ B; 1SWD A; 2X46 A; 3WJC A; 1KFF A; 1HY2 A; 1MK5 A; 4Y0Q A; 1D2U A; 1N43 A; 5HTD A; 2F01 A; 4KC8 A; 3ZUO A; 1LIE A; 1S2P A; 4KCA A; 3VG7 A; 4GJV A; 3TGA A; 4QAE A; 2AT8 X; 2Y3F A; 4I6S A; 1SY3 A; 2FHN X; 3HWD A; 3VG4 A; 5IO7 A; 1EI5 A; 2GTF X; 4COT A; 5HCC C; 4QYN A; 4TKJ A; 3B2L A; 1ERX A; 4LZV A; 1VWA B; 3RDS A; 3VE1 A; 3HWE A; 5L8O A; 5CE4 A; 2IZF B; 1Y52 X; 2IZD B; 1W6F A; 2LBV A; 4OMX A; 3JSQ A; 3Q6L A; 1WUB A; 4O4X A; 4UU2 A; 3TF6 A; 5IO5 A; 2YMS A; 1TOW A; 1JQP A; 2WWP A; 1X8O A; 1X8U A; 5KID A; 3S60 A; 3CBC A; 1TXL A; 3KFH A; 4BX6 B; 2X32 A; 2L68 A; 2LBA A; 3LHN A; 2WEX A; 4CV7 A; 1VYG A; 2PY1 A; 1UYN X; 2RTF B; 4O9S A; 4XMH A; 2OL7 A; 4BQU A; 1MDC A; 4ZHG A; 1JMZ A; 1LDQ A; 2IZE B; 2JU3 A; 4LQZ A; 5EDC A; 1SRH A; 5IO6 A; 1A57 A; 2FR2 A; 1QWD A; 5CHK A; 1YUP A; 1FTP A; 4B55 A; 1BBP A; 5EED A; 1HXL A; 2AT3 X; 4ZJ0 A; 3PQU A; 3QQ2 A; 3PED A; 2R56 A; 5KHP A; 2AMM X; 3I0A A; 2MHD A; 2W2A A; 3NQ9 A; 4QQ1 A; 1VWK B; 1YP6 A; 4TKB A; 3ZW0 A; 1IFB A; 1LEL A; 2WEW A; 3UEV A; 3WJG A; 4O4O A; 3FA8 A; 1T68 X; 1SRG A; 3P24 A; 3DTQ A; 2ACO A; 3CKF A; 3B2I A; 1BEB A; 3C77 X; 1TW4 A; 3FEK A; 4GDZ A; 3U03 A; 4EXZ A; 3AKN A; 1BSO A; 4HWM A; 1YP7 A; 1STR B; 4IB6 A; 4CSB A; 1QY2 A; 5HZ8 A; 1VWI B; 3JQO A; 4IRW A; 1PEE A; 1KQW A; 2RD7 C; 3P6C A; 3UEU A; 1I05 A; 1X8P A; 3QKG A; 3WZP A; 3RDU A; 4YDA A; 1Z24 A; 3Q34 A; 1S7D A; 1GX3 A; 3NPO A; 3OBL A; 1OSP O; 1HXZ A; 4HPB A; 5C0N A; 1PBO A; 4Z2O A; 1G7N A; 2RTK A; 3WBG A; 2G78 A; 3VG3 A; 1SLG B; 3CMP A; 2LA7 A; 1EXS A; 4BX7 B; 4GU8 A; 5HZ5 A; 1LID A; 3BDR A; 3C78 X; 5LKF A; 3BRN A; 1VYF A; 1FJ1 E; 3EM0 A; 1SWS A; 3TZS A; 3WYP A; 3VE2 A; 1TOU A; 4A1H A; 4OEM A; 1O1U A; 2N93 A; 1U17 A; 1JJJ A; 3PH5 A; 2MJI A; 3P6F A; 1SWT A; 5FQ7 E; 1SWE A; 1ZRY A; 1NQN A; 2F09 A; 3FLL A; 3WOV A; 2O62 A; 4Y59 A; 3F8A A; 5D45 A; 3MX7 A; 3UAQ A; 2OL8 O; 4JHQ A; 1N0S A; 2HYS A; 1UYO X; 4CPI A; 1KOI A; 1SWR A; 3DSZ A; 3RKG A; 3SZI A; 2Z4H A; 4YBU A; 3WJF A; 5AEO A; 3K3L A; 3PDF A; 2KD2 A; 3ZW0 B; 1HQQ A; 1NDJ A; 3APX A; 1QY0 A; 2WQ9 A; 5LJC A; 4TLJ A; 5BVS A; 1GGL A; 2OFA A; 3RDQ A; 3VHI A; 1RLB E; 4CDE A; 2X4M A; 2BT9 A; 2I5Z O; 1P6P A; 3O19 A; 4I3C A; 1A18 A; 3T6L A; 1HBQ A; 2L9C A; 4ORU A; 1B56 A; 1JJU A; 2OFR X; 3TGB A; 3S5V A; 1VWH B; 1MEP A; 2MO5 A; 4MVK A; 1ACD A; 2KTS A; 4YMY A; 4QYP A; 4BGF A; 5FQ6 E; 4QZU A; 1NC9 A; 2NNE A; 2OY1 O; 2QO6 A; 3OD9 A; 1SWO A; 5CSE A; 5LJE A; 1SWH A; 5H9N A; 4JGL A; 5H9A A; 4BX6 A; 2MM3 A; 2AH7 X; 5EDB A; 1MOY A; 5LJH A; 1OBU A; 4YCH A; 2RTI B; 4IB7 A; 3FEL A; 1B4M A; 1QFT A; 5IXG A; 1AVG I; 1EQD A; 3FR5 A; 5F7G A; 3BS2 A; 3IFB A; 3JS1 A; 1X71 A; 2W2B A; 4CDF A; 2ZAI A; 2GC9 A; 4ZHD A; 1IKE A; 2ZAG A; 1EPA A; 3STN A; 3ZW2 A; 1VWE B; 4HFO A; 2RN4 A; 3RDX A; 4CPE A; 4LKP A; 5HZQ A; 3N91 A; 4YBP A; 4I9S A; 1ZNE A; 3HWF A; 4I95 A; 3SLO A; 4DCB A; 1SXX A; 1T0V A; 1KXO A; 1R0U A; 3FW4 A; 4I3B A; 1ERB A; 5B29 A; 4IBA A; 2CM9 A; 4XMC A; 1N9Y A; 3KFI A; 3SAO A; 2M4L A; 4EDE A; 5IRW A; 1X8N A; 4NYR A; 1PTS A; 2UZ2 A; 5F6B A; 5FFH A; 4YGG A; 2A0A A; 3BLG A; 1OPA A; 2A8G A; 4MVI A; 1JV4 A; 4NNS A; 4MVL A; 4GNW A; 2F73 A; 5EPQ A; 1JZU A; 3O2Y A; 3NP1 A; 2AT5 X; 3SOT A; 1QAB E; 2E4J A; 2AF5 A; 2BS5 A; 2DM5 A; 3FYF A; 3KFG A; 1HBP A; 2AVI A; 3BSZ E; 5BVQ A; 3WVM A; 2A5B A; 3MVF A; 3FA7 A; 4OS3 A; 1K3B A; 1ADL A; 2Q2P A; 1B0O A; 2DJF A; 4WBK A; 2HKD A; 2KT4 B; 4GGR A; 5D4A A; 5B5F A; 5K06 A; 2HLV A; 1DZK A; 1IFC A; 2BLG A; 1BSY A; 4BX7 A; 3F6Z B; 1KT6 A; 2WQA E; 2I5V O; 3FID A; 3F9D A; 4L3R A; 4NLI A; 4QRL A; 1N9M A; 4OEL A; 3T2W A; 4INN A; 2A2U A; 1BM5 A; 4TNN A; 1AB0 A; 1JIW I; 4ID2 A; 4KT5 A; 2KW1 A; 3P6G A; 3STK A; 2ALL X; 4I60 A; 3STM X; 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2CBS A; 4ORR A; 1S44 A; 3CBS A; 3RDM A; 5HA1 A; 2FS6 A; 1SWB A; 4O3Y A; 1GT1 A; 2GTL O; 2FTB A; 4GJS A; 5D8J A; 1JYD A; 3P6D A; 5JR8 A; 3KVN A; 2OY7 A; 1FEM A; 5H9L A; 4TQ2 A; 2AT0 X; 4QZT A; 4ZHH A; 1LIC A; 1SWF A; 1GT3 A; 1SWL A; 4L1N A; 4OKA A; 4PSQ A; 5B2A O; 2BHV A; 4HPA A; 4BX5 A; 5K67 A; 1BRP A; 4EEJ A; 2IZJ A; 2OYB O; 2A2G A; 2HZQ A; 3RY2 A; 4BBO A; 5L8I A; 2RCT A; 3SZH A; 5B5G A; 2OY5 O; 3B2K A; 4Y0P A; 4Z6J A; 1XCA A; 3D4R A; 4IB9 A; 1Y55 X; 1OEK A; 1QY1 A; 4EQA C; #chains in the Genus database with same CATH homology 1KT3 A; 3CQN A; 2OVS A; 5L8N A; 1JBH A; 3OE3 A; 1U18 A; 5LJG A; 1KGL A; 1EII A; 1QQS A; 4GZV A; 1L6M A; 1SY2 A; 4GKC A; 1HMS A; 2K23 A; 4XMD A; 3BY0 A; 1HN2 A; 3BX8 A; 1FDQ A; 1NP1 A; 3S26 A; 1NGL A; 2GTL M; 4K19 A; 4ZH6 A; 4HPD A; 2FS7 A; 4HPC A; 3U0D A; 1DF3 A; 4ALO A; 3P6E A; 4LKT A; 1BRQ A; 2MWH A; 3HOE A; 1UZ2 X; 5DPQ A; 4ZR2 A; 1AQB A; 2BS6 A; 5B27 A; 2A13 A; 4GRJ A; 4AZQ A; 4NLJ A; 3D96 A; 3NR3 A; 4D6A A; 4U8U N; 2QOS C; 4YKO A; 1I04 A; 3RSW A; 2Q4N A; 3FA6 A; 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