The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
178
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structure length |
170
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Chain Sequence |
DAHSLWYNFTIIHLPRHGQQWCEVQSQVDQKNFLSYDCGSDKVLSMGHLEEQLYATDAWGKQLEMLREVGQRLRLELADTEPLTLQVRMSCECEADGYIRGSWQFSFDGRKFLLFDSNNRKWTVVHAGARRMKEKWEKDSGLTTFFKMVSMRDCKSWLRDFLMHRKKRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational plasticity revealed by the cocrystal structure of NKG2D and its class I MHC-like ligand ULBP3.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NKG2-D type II integral membrane protein
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| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
44
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| structure length |
170
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| sequence length |
178
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-11-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00129 | MHC_I | Class I Histocompatibility antigen, domains alpha 1 and 2 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1 | MHC class I-like antigen recognition-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5MEQ A; 3WUW A; 3BP7 A; 3E3Q A; 3RWJ A; 3VH8 A; 1S7X A; 5SWZ A; 3HPJ A; 3MGO A; 2P5W A; 1RK0 A; 3KXF A; 3RTQ A; 2XPG A; 4X6E A; 3JTS A; 1ZHB A; 1S7R A; 3P9M A; 3BO8 A; 4Z76 A; 4LNR A; 3VFV A; 1ZHN A; 1M05 A; 3DX7 A; 5FDW A; 1FZM A; 4ELM A; 2WY3 A; 3L3H A; 3TFK A; 3IT8 D; 4K7F A; 4O2E A; 2Q7Y A; 2BSR A; 5HHN A; 3LKO A; 3MV8 A; 4U6X A; 3X13 A; 1HHH A; 2AV1 A; 2HJK A; 4N0F A; 1ZT7 A; 1ZVS A; 3E6H A; 3OV6 A; 1T1Z A; 3KYN A; 4ZFZ A; 5C0B A; 4MJ6 A; 3CVH A; 3KPM A; 3MRI A; 4WUU A; 5EUO A; 4V3E B; 1ZHK A; 4PJI A; 5HHM A; 5AD0 A; 4HUW A; 1AGD A; 4Y4H A; 4IIQ C; 2X4T A; 4ZUS A; 1K8D A; 1T1X A; 3HCV A; 1JF1 A; 4Y2D A; 5C0A A; 2P5E A; 4PJB A; 3TBT A; 4S0U C; 1YN7 A; 5BRZ A; 3TID A; 3WL9 A; 3QI9 A; 4GUP A; 5FA3 A; 3MRG A; 2CLZ A; 2X4N A; 1P1Z A; 1WBY A; 3DX8 A; 2NW3 A; 3VFP A; 3VRJ A; 4Y4F A; 3GSO A; 3BVN A; 3RWI A; 3M1B A; 4Y4K A; 3X12 A; 5J6H A; 5MER A; 1QR1 A; 5EU6 A; 4F7T A; 4JQV A; 3VFM A; 2FO4 A; 1I1A A; 1FZO A; 3GML A; 1ONQ A; 2AK4 A; 4NO0 A; 4NO5 A; 3P73 A; 5MEO A; 5E9D A; 2XFX A; 3I6G A; 1FFO A; 3OXS A; 1B0R A; 5SWS A; 1KJ3 H; 4HUU A; 4QOK A; 5HGA A; 4U1K A; 3MRP A; 4PGD A; 5FA4 A; 4NNY A; 3MRM A; 4WO4 A; 5DDH A; 1S9W A; 4HX1 A; 3FQR A; 3FFC A; 4U1I A; 3OX8 A; 3GMR A; 3RGV C; 3H7B A; 3MA7 A; 3SCM A; 1RJZ A; 5B38 A; 4U1L A; 5GSR A; 3BXN A; 3MRB A; 1S7U A; 5J1A A; 4G43 A; 1QEW A; 2BNQ A; 2F53 A; 4WU7 A; 2VLR A; 3BW9 A; 2CIK A; 3LKQ A; 5EU3 A; 4F7M A; 3KPR A; 4MNG A; 5J6G A; 1K5N A; 4N0U A; 3MR9 A; 2H6P A; 1ZS8 A; 1M6O A; 5IND A; 3KPP A; 3KLA A; 3TBY A; 1AGE A; 5C09 A; 1S9Y A; 1W72 A; 3E6F A; 3W0W A; 3X14 A; 1PQZ A; 4PGC A; 4PJD A; 3MRQ A; 5GSV A; 2BST A; 4NNX A; 1FZK A; 3HG1 A; 3G08 A; 2VLJ A; 3QFJ A; 5FKP A; 4G42 A; 4PJ5 A; 5HGH A; 3DBX A; 3VXU A; 1IM3 A; 2FYY A; 2X4O A; 3O8X A; 1P4L A; 4FTV A; 5D9S A; 3GSN H; 3RWF A; 3GMN A; 1MHC A; 4MNQ A; 3VFW A; 4MX7 A; 5C0J A; 4MQ7 A; 1FG2 A; 1I7U A; 3L3D A; 4Y16 A; 1EEY A; 4JFP A; 1NAM H; 3D18 A; 4Z77 A; 2CLV A; 3VXN A; 3TZV C; 1XH3 A; 4PG9 A; 3TBS A; 1T20 A; 1QLF A; 1FFP A; 2OI9 A; 1ED3 A; 1BZ9 A; 3TVM A; 1ZHL A; 3GMQ A; 3ARB A; 1JUF A; 1KPV A; 3DTX A; 1VGK A; 2VAA A; 4HV8 A; 5C07 A; 3RL1 A; 3JTT A; 1JPG A; 1Q94 A; 1HHI A; 3BZF A; 3MRD A; 5EU5 A; 1FFN A; 2F74 A; 3PWP A; 4UQ3 A; 4PJG A; 1A1N A; 3RWE A; 4CVZ A; 5MEN A; 3LKR A; 3M17 A; 4G9D A; 4PDC E; 4QRR A; 3TJH A; 3MYJ A; 4MS8 A; 3C9N A; 3AU1 A; 1S8D A; 3KPN A; 2BVQ A; 3GJF A; 4IRS A; 2H26 A; 4F7C A; 3QFD A; 1TVB A; 2BSS A; 3QQ4 A; 3MV9 A; 3O3B A; 3QUX A; 3L3K A; 1S7S A; 2X4P A; 1I4F A; 4N5E A; 4PG2 A; 4F7P A; 1UXS A; 1MHE A; 3SDA A; 1DE4 A; 5IVX A; 3CH1 A; 3VXS A; 3VXO A; 1HHJ A; 1T22 A; 2VLK A; 4NO3 A; 2GUO A; 4JFF A; 1QO3 A; 5B39 A; 1S7V A; 4PRB A; 2GTW A; 3BHB A; 1I1Y A; 3SKM A; 4U1N A; 1IM9 A; 3I6L D; 3PWJ A; 3TBW A; 1DUZ A; 4MXQ A; 3I6K A; 3LKP A; 3W39 A; 3WS6 A; 3HE6 A; 4QRP A; 4APQ A; 3FQU A; 1L8J A; 4HWZ A; 4L3E A; 1XR8 A; 3FOL A; 4PJF A; 1VAD A; 3V5K A; 3ECB A; 3L3G A; 1S7Q A; 3GSQ A; 3QUZ A; 5DEF A; 3RL2 A; 2V2X A; 4N0C A; 1T7X A; 5IB4 A; 1A9B A; 4PJA A; 1LDP H; 3VFT A; 1GZQ A; 3VCL A; 4L8D A; 4QRS A; 3V5D A; 4JFD A; 1P7Q A; 2AV7 A; 3HAE A; 1KCG C; 4UQ2 A; 4ZUW A; 1XZ0 A; 3FON A; 5IB1 A; 1S7T A; 2FWO A; 1T1Y A; 3QUK A; 1DDH A; 4U1M A; 3MGT A; 4PJ9 A; 5E6I C; 3VWJ A; 5C0I A; 2HJL A; 1YPZ A; 3PWV A; 1S7W A; 4QRU A; 4U1S A; 3PWU A; 1FZJ A; 3RWH A; 2PO6 A; 1ZAG A; 1AGB A; 3ARG A; 3GMP A; 1HYR C; 3RUG A; 2ZSV A; 3QQ3 A; 5IM7 A; 4GKN A; 3LKS A; 3ILQ C; 4FFE X; 3FOM A; 4PJ7 A; 3U0P A; 1JE6 A; 3CZF A; 3MRF A; 5F7D A; 5ACZ A; 3TA3 A; 3LV3 A; 3FQX A; 5D2L A; 4PJX A; 1NAN H; 2GT9 A; 1ZSD A; 1ZT4 A; 3RWD A; 3ARF A; 3SDC A; 1FO0 H; 1YN6 A; 3SKO A; 3PAB A; 3GSW A; 5BXF A; 2V2W A; 5EU4 A; 5D7L A; 2MHA A; 2ZSW A; 5INC A; 4HUX A; 3GSR A; 4GKS A; 4JFQ A; 1LEK A; 2AXF A; 1JFM A; 2F54 A; 3L9R A; 3BH9 A; 4D0D A; 4ZUU A; 2HLA A; 2C7U A; 3KPS A; 5EO1 A; 3TO2 A; 1LK2 A; 4IRJ A; 3TPU E; 3PQY A; 2CKB H; 4X6D A; 3FQT A; 4WU5 A; 1JGE A; 3MRE A; 5IB3 A; 5DEG A; 3D25 A; 5F1I A; 4EUP A; 4L8S C; 3GIV A; 1HHG A; 4MJ5 A; 4MJI A; 4D0C A; 3VRI A; 4LCW A; 1U58 A; 4NT6 A; 2FIK A; 3GMO A; 5E00 A; 1OF2 A; 2VLL A; 3TF7 A; 1LQV A; 5HHO A; 5ENW A; 3TIE A; 4HUV A; 3BEV A; 4IHO A; 3O3A A; 4ZUT A; 4LHU A; 4NQE A; 1T21 A; 5H94 A; 2AXG A; 2X70 A; 3FQN A; 3P4M A; 2GTZ A; 3FRU A; 3WS3 A; 3SDX A; 3FTG A; 4JFE A; 4JQX A; 3AM8 A; 4L8B A; 5EFI A; 3VXM A; 4U6Y A; 1HHK A; 1BD2 A; 1KPR A; 3SDD A; 4LCY A; 5E8N A; 1CD1 A; 3HUJ A; 2J8U A; 4QRQ A; 1N5A A; 2BNR A; 3LKN A; 2JCC A; 5IEK A; 4U1H A; 3O3E A; 5SWQ A; 1T80 A; 2VE6 A; 1AGC A; 3HLA A; 4PJ8 A; 4Z78 A; 4U1J A; 5IB5 A; 3B3I A; 4EN3 C; 4PGE A; 1N3N A; 4I4W A; 1WBX A; 3CC5 A; 4PRI A; 3ARD A; 4G8I A; 1OSZ A; 1EXU A; 2D31 A; 2X4S A; 3CCH A; 1LD9 A; 3IXA A; 1A1M A; 1QSF A; 4JRY A; 4NQD A; 1T0N A; 4MVB A; 4WDI A; 3D3V A; 1MWA H; 4NHU E; 3TBV A; 1MI5 A; 1KJM A; 4PRE A; 3VFU A; 1G7P A; 3VFN A; 1SYS A; 3D2U A; 3QZW A; 3FT3 A; 3KPO A; 5EO0 A; 4L4T A; 3O3D A; 1G6R H; 3O9W A; 5EOT A; 3GSV A; 1EFX A; 3X11 A; 3JVG A; 4PRH A; 4PRP A; 5D2N A; 5L2J A; 3LN5 A; 2X4U A; 4QRT A; 1DUY A; 1JGD A; 1NEZ A; 3FQW A; 1S9X A; 1WBZ A; 2BVP A; 3CPL A; 3GSX A; 1E27 A; 3WLB A; 5F1N A; 3UTS A; 4V3D B; 5BS0 A; 3PWL A; 3UTQ A; 5C0F A; 5C0G A; 5IB2 A; 3UBX A; 2YPK A; 3MRN A; 4I48 A; 3MRO A; 4G9F A; 3DMM A; 3RZC A; 1XR9 A; 5F9J A; 1QSE A; 4NSK A; 4G8G A; 1QVO A; 4WJ5 A; 3RWG A; 4EI5 A; 2CLR A; 3O4L A; 5ISZ A; 1AGF A; 5IRO A; 1OGA A; 3BH8 A; 4NO2 A; 2E7L E; 3MRJ A; 5C0D A; 2GJ6 A; 1E28 A; 3ERY A; 3C8K A; 3ES6 A; 3MRL A; 4L8C A; 2ZOK A; 2X4Q A; 1T7Y A; 4WWK C; 4X6C A; 4CVX A; 1JPF A; 3E2H A; 3KPL A; 3H9S A; 4PJH A; 1AO7 A; 3D39 A; 1R3H A; 3CDG A; 3BZE A; 4L3C A; 5HHP A; 1INQ A; 4HS3 A; 4PV8 A; 3P4N A; 3GSU A; 5C0C A; 1C16 A; 4ZUV A; 1T0M A; 3FT4 A; 3V5H A; 4NQC A; 1I1F A; 1SYV A; 2GIT A; 2FZ3 A; 3KPQ A; 1TMC A; 4O2F A; 4PP8 C; 4PR5 A; 5HHQ A; 1BII A; 1W0V A; 4PV9 A; 3MV7 A; 1Z5L A; 5E8O A; 1I7T A; 3QEQ A; 4NQV A; 3BGM A; 5HYJ A; 3BP4 A; 1KPU A; 4WW2 C; 4ONO A; 1W0W A; 4XXC A; 4N8V A; 1T1W A; 3VXR A; 3GMM A; 4HKJ A; 1N2R A; 1B0G A; 1KTL A; 1N59 A; 2RFX A; 5JHD A; 1G7Q A; 3HE7 A; 4JFO A; 4PRD A; 2YPL A; 1OGT A; 3ROO A; 1I7R A; 5C08 A; 5IEH A; 5L2K A; 3T8X A; 3SPV A; 1QRN A; 1UQS A; 3VWK A; 3UPR A; 1KJV A; 3UTT A; 3P4O A; 3BWA A; 1T7W A; 3DXA A; 5E8P A; 3ILP A; 3VFO A; 3NFN A; 3T1F A; 3LN4 A; 4X6F A; 4L9L C; 4E0R A; 3QDJ A; 1A1O A; 1AKJ A; 4PGB A; 1CE6 A; 4ZAK A; 3DX6 A; 3KWW A; 1RJY A; 4PJE A; 1KBG H; 3FT2 A; 2YEZ A; 3TN0 A; 3VJ6 A; 3QUY A; 1VAC A; 4D0B A; 2BCK A; 1CG9 A; 3VXP A; 5D7I A; 1LP9 A; 3ROL A; 4NQX A; 1ZT1 A; 3RWC A; 1YDP A; 3ARE A; 4L29 A; 1QQD A; 2A83 A; 1GZP A; 2ESV A; 4G59 A; 3PWN A; 1BQH A; 5C9J A; 3JTC A; 1A9E A; 2HN7 A; 4K71 B; 4PJC A; 1KJ2 H; 2CII A; 3OXR A; 3QUL A; 4LCC C; 4PRN A; 3REW A; 2NX5 A; 3SJV A; 3QDG A; 1A6Z A; 5BJT A; 1LEG A; 5D5M A; 3VFS A; 1HSA A; 3MRR A; 3KYO A; 5HGD A; 3BUY A; 5HGB A; 1T7Z A; 4F7E A; 2OL3 H; 3BEW A; 3VFR A; 3TO4 A; 2AKR A; 1X7Q A; 3L3J A; 1JHT A; 3B6S A; 4PRA A; 3P9L A; 4E5X A; 3P77 A; 5D7J C; 1HSB A; 1HOC A; 1T7V A; 4CW1 A; 1TVH A; 4JRX A; 3S6C A; 3H9H A; 2X4R A; 2ZOL A; 3MRH A; 2UWE A; 1UXW A; 3MRK A; 2GAZ A; 5MEP A; 4L4V A; 1RK1 A; 5C0E A; 3MRC A; 2VAB A; 1B3J A; 3L3I A; 1EEZ A; 3QDM A; 4O2C A; 2DYP A; 2BVO A; 2PYE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5MEQ A; 3WUW A; 3BP7 A; 3E3Q A; 3RWJ A; 3VH8 A; 1S7X A; 5SWZ A; 3HPJ A; 3MGO A; 2P5W A; 1RK0 A; 3KXF A; 3RTQ A; 2XPG A; 4X6E A; 3JTS A; 1ZHB A; 1S7R A; 3P9M A; 3BO8 A; 4Z76 A; 4LNR A; 3VFV A; 1ZHN A; 1M05 A; 3DX7 A; 5FDW A; 1FZM A; 4ELM A; 2WY3 A; 3L3H A; 3TFK A; 3IT8 D; 4K7F A; 4O2E A; 2Q7Y A; 2BSR A; 5HHN A; 3LKO A; 3MV8 A; 4U6X A; 3X13 A; 1HHH A; 2AV1 A; 2HJK A; 4N0F A; 1ZT7 A; 4JO8 A; 1ZVS A; 3E6H A; 3OV6 A; 1T1Z A; 3KYN A; 4ZFZ A; 5C0B A; 4MJ6 A; 3CVH A; 3KPM A; 3MRI A; 4WUU A; 5EUO A; 4V3E B; 1ZHK A; 4PJI A; 5HHM A; 5AD0 A; 4HUW A; 1AGD A; 4Y4H A; 4IIQ C; 2X4T A; 4ZUS A; 1K8D A; 1T1X A; 3HCV A; 1JF1 A; 4Y2D A; 5C0A A; 2P5E A; 4PJB A; 3TBT A; 4S0U C; 1YN7 A; 5BRZ A; 3TID A; 3WL9 A; 3QI9 A; 4GUP A; 5FA3 A; 3MRG A; 2CLZ A; 2X4N A; 1P1Z A; 1WBY A; 3DX8 A; 2NW3 A; 3VFP A; 3VRJ A; 4Y4F A; 3GSO A; 3BVN A; 3RWI A; 3M1B A; 4Y4K A; 3X12 A; 5J6H A; 5MER A; 1QR1 A; 5EU6 A; 4F7T A; 4JQV A; 3VFM A; 2FO4 A; 1I1A A; 1FZO A; 3GML A; 1ONQ A; 2AK4 A; 4NO0 A; 4NO5 A; 3P73 A; 5MEO A; 5E9D A; 2XFX A; 3I6G A; 1FFO A; 3OXS A; 1B0R A; 5SWS A; 1KJ3 H; 4HUU A; 4QOK A; 5HGA A; 4U1K A; 3MRP A; 4PGD A; 5FA4 A; 4G59 C; 4NNY A; 3MRM A; 4WO4 A; 5DDH A; 1S9W A; 4HX1 A; 3FQR A; 3FFC A; 4U1I A; 3OX8 A; 3GMR A; 3RGV C; 3H7B A; 3MA7 A; 3SCM A; 1RJZ A; 5B38 A; 4U1L A; 5GSR A; 3BXN A; 3MRB A; 1S7U A; 5J1A A; 4G43 A; 1QEW A; 2BNQ A; 2F53 A; 4WU7 A; 2VLR A; 3BW9 A; 2CIK A; 3LKQ A; 5EU3 A; 4F7M A; 3KPR A; 4MNG A; 5J6G A; 1K5N A; 4N0U A; 3MR9 A; 2H6P A; 1ZS8 A; 1M6O A; 5IND A; 2NYK A; 3KPP A; 3KLA A; 3TBY A; 1AGE A; 5C09 A; 1S9Y A; 1W72 A; 3E6F A; 3W0W A; 3X14 A; 1PQZ A; 4PGC A; 4PJD A; 3MRQ A; 5GSV A; 2BST A; 4NNX A; 1FZK A; 3HG1 A; 3G08 A; 2VLJ A; 3QFJ A; 5FKP A; 4G42 A; 4PJ5 A; 5HGH A; 3DBX A; 3VXU A; 1IM3 A; 2FYY A; 2X4O A; 3O8X A; 1P4L A; 4FTV A; 5D9S A; 3GSN H; 3RWF A; 3GMN A; 1MHC A; 4MNQ A; 3VFW A; 4MX7 A; 5C0J A; 4MQ7 A; 1FG2 A; 1I7U A; 3L3D A; 4Y16 A; 1EEY A; 4JFP A; 1NAM H; 3D18 A; 3I0T A; 4Z77 A; 2CLV A; 3VXN A; 3TZV C; 1XH3 A; 4PG9 A; 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