The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
42
|
sequence length |
149
|
structure length |
149
|
Chain Sequence |
IMRHLPYFCRGQVVRGFGRGSKQLGIPTANFPEQVVDNLPADISTGIYYGWASVGSGDVHKMVVSIGWNPYYKNTKKSMETHIMHTFKEDFYGEILNVAIVGYLRPEKNFDSLESLISAIQGDIEEAKKRLELPEYLKIKEDNFFQVSK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Ligand binding-induced conformational changes in riboflavin kinase: structural basis for the ordered mechanism.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein FLJ11149
|
| total genus |
42
|
| structure length |
149
|
| sequence length |
149
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.1.26: Riboflavin kinase. |
| pdb deposition date | 2003-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01687 | Flavokinase | Riboflavin kinase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 | Riboflavin kinase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VBU A; 3CTA A; 4UZE A; 5FO0 A; 1T6Y A; 2OYN A; 5A88 A; 5FO1 A; 1S4M A; 5TRD A; 1N07 A; 1N05 A; 4UZF A; 2P3M A; 1MRZ A; 1Q9S A; 2VBV A; 1NB0 A; 1T6X A; 1N06 A; 1NB9 A; 1P4M A; 3ZUG A; 2VBT A; 1T6Z A; 5FNZ A; 3OP1 A; 1N08 A; 2VBS A; 2I1L A; 5A89 A; 3BNW A; 5A8A A; 2X0K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQN B; 1PJ5 A; 5FO0 A; 5CDF A; 3G71 B; 5EMN A; 3CCE B; 1VQM B; 1XE1 A; 3ASP A; 1UMK A; 3Q39 A; 4Z1M A; 2RC6 A; 3W5U A; 3AVX A; 4KKS A; 4XLF A; 2JIZ A; 5GV7 A; 1KK0 A; 4J0Q A; 2DY1 A; 1XB2 A; 2V7U A; 4RM0 A; 4ZCL A; 3ZZU A; 4XLH A; 3LQ6 A; 4DK1 A; 1J9Z A; 1QFY A; 4OOV A; 4XR6 A; 4XD7 A; 2OK7 A; 4KKT A; 2FVG A; 2X53 S; 1VLY A; 4WZL A; 2V7X A; 2F4N A; 4QV2 A; 5IYR A; 1G7S A; 2GJR A; 3OW2 B; 4TMZ A; 4ZGQ B; 5B6I A; 2GK6 A; 2V7Q A; 5FL7 A; 1QGY A; 4QHY A; 4ZGN B; 4B3G A; 2XNJ A; 3AST A; 1QGZ A; 4G1V A; 1N05 A; 3CPW B; 5IYW A; 2PMD A; 1E79 A; 2R6H A; 3WBJ A; 4AF7 A; 4KKU A; 2ZL5 A; 3T56 B; 3VO2 A; 1VQP B; 4LBW A; 1VQ4 B; 1VQ6 B; 3BH4 A; 3AVY A; 1QUF A; 2CF4 A; 4X05 A; 4LBY A; 3PVD A; 2C4U A; 2D9R A; 3CD6 B; 3OEE A; 3AGQ A; 3W2I A; 4OOX A; 1OGJ A; 1UD5 A; 5FNZ A; 4G1B A; 3QFS A; 3CCU B; 3H94 A; 1N08 A; 1Y0R A; 3V76 A; 2I1L A; 1COW A; 4B44 A; 1QG0 A; 2X0K A; 3QSY A; 1WU8 A; 2OBT A; 2X6W A; 3BY1 A; 1TVC A; 2Q6I A; 1YHQ B; 1IJE A; 5A88 A; 1YIJ B; 3Q3A A; 3CW2 A; 2VNK A; 4XM3 A; 4Z4W A; 1GAW A; 2CC2 A; 1S0U A; 2GQF A; 3U6K A; 1QVG B; 2HMA A; 2AHO A; 3D26 A; 1HVX A; 3MHP A; 1BX0 A; 1M1K D; 4XKW A; 5AN9 A; 3WNB A; 4TN1 A; 4MYU A; 4QVA A; 4YAO A; 1A8P A; 2OTJ B; 1PKV A; 4RD3 A; 4XOP A; 3A3B A; 3B8H A; 3FPK A; 2X3U A; 3A3G A; 1E63 A; 2ZZG A; 3ZIA A; 4F7D A; 3ZC3 A; 4XLC A; 5FO1 A; 5IYQ A; 1W0K A; 5KW9 A; 3LVB A; 4II3 A; 1NJI D; 1G7R A; 2D3L A; 1GO2 A; 1MAB A; 4YAU A; 1IJF A; 4LBV A; 2ZBV A; 3CC2 B; 1EFU A; 1WSR A; 1JNY A; 2B7B A; 2YWF A; 2OBR A; 3G05 A; 4FK8 A; 3QFT A; 1TLL A; 5TY0 A; 1GJR A; 2PIA A; 4X0C A; 2WZP P; 1W87 A; 4HIZ A; 4P1V A; 4EH1 A; 3CB4 A; 2EIX A; 1XQB A; 2C77 A; 4M53 A; 1KTV A; 2ZBU A; 4HE6 A; 5J3O A; 2JJ2 A; 2PLF A; 2ZTG A; 4B3F X; 4TMW A; 3R6J A; 4XON A; 4IW3 B; 4M0L A; 2QGG A; 3CTA A; 3OE7 A; 1T6Y A; 3MMP A; 1Y0Y A; 2E1R A; 3ONY A; 3A8J A; 3FJO A; 3CC7 B; 1RQP A; 1KZL A; 4Z4T A; 3CCL B; 1Q81 D; 1B23 P; 1VLO A; 3KL9 A; 3ZPN A; 3CCQ B; 1H8E A; 4PC7 A; 1CNE A; 2NV4 A; 2ZZQ A; 4ROX A; 3A8I A; 4LBZ A; 3VMF A; 4OP7 A; 2QN6 A; 5HXB A; 1HA3 A; 1GAQ A; 1VQ8 B; 2CND A; 2BSA A; 2V7V A; 4RD4 A; 5HZB A; 4GQN A; 3CCR B; 2XND A; 1E62 A; 2C5H A; 4XQF A; 4XLE A; 4TMX A; 3W5V A; 3PUM A; 2DIE A; 1KJZ A; 2B5O A; 4N3N A; 4DNT B; 5TV2 A; 4G5G A; 4X7D A; 1V0E A; 2ZL6 A; 3SJZ A; 1JJ2 B; 3Q6Q A; 4OOS A; 1KMH A; 4K1X A; 3ZZT A; 1D8T A; 4U9U A; 3AVT A; 2F1L A; 4PC1 A; 2B7C A; 3SKB A; 3ZUG A; 1KK1 A; 2BPO A; 2JJ1 A; 4TSF A; 4XMY A; 3SLN A; 2BGI A; 1F60 A; 1VQK B; 3W2E A; 3KEW A; 1VHE A; 1YIT B; 1OGI A; 4TMV A; 1E3X A; 3HAG A; 2C2W A; 1KD1 D; 3CP8 A; 4RPB A; 1W9X A; 1PJ7 A; 1SKY B; 1ZM3 A; 4P26 A; 1WOP A; 4N3G A; 1YJW B; 2WJV A; 1BPL A; 2EFG A; 1FNB A; 1K8A D; 1QGA A; 1Q9S A; 1BJK A; 2BF4 A; 3OAA A; 3E20 A; 3WYA A; 1VF7 A; 2E1B A; 1Q82 D; 1T5E A; 2YWE A; 1QVF B; 2Z6B D; 4NBS A; 4RDK A; 5HZA A; 1EFT A; 4QFM A; 1WOS A; 2XZO A; 2RC5 A; 5JBQ A; 3WND A; 4II2 A; 3ASQ A; 1D2E A; 1G7T A; 3CXC B; 1I18 A; 3V7A A; 2NPF A; 2QEX B; 2ZIT A; 3OKX A; 3CMM A; 3JQQ A; 3G4S B; 1RQR A; 1WTH D; 2GJP A; 1S4M A; 5TRD A; 3QFR A; 4MYT A; 2F1M A; 3FPP A; 4UZF A; 2P3M A; 3CC4 B; 3AVU A; 2Q6K A; 4WZE A; 2VNH A; 5H5J A; 1E64 A; 3JQP A; 1QH0 A; 2DYI A; 4PC2 A; 4AC9 A; 1CQX A; 1YX2 A; 1QX4 A; 3I1F A; 4C0S A; 3AVW A; 4Z4U A; 1BX1 A; 3OEH A; 1R5B A; 1E3Z A; 4PAB A; 4YXW A; 4ACA A; 2DET A; 3OP1 A; 5TR9 A; 3SLD A; 3JU4 A; 1N8R D; 4AVZ A; 1K28 D; 3I55 B; 5H59 A; 4PAA A; 3U2Q A; 3VNV A; 3OZW A; 4TMT A; 4ZV4 A; 3A35 A; 5F4O A; 4ZCM A; 2WYR A; 4XN0 A; 5KNL A; 4L8J A; 2OBS A; 2CRV A; 2FX3 A; 2Q6O A; 4XOT A; 4H9G A; 4FXU A; 1FNC A; 4ZCI A; 1WPC A; 1YLO A; 3VO1 A; 2BN4 A; 4P25 A; 3B82 A; 4RCY A; 1B2R A; 2C78 A; 2V7W A; 4PGO A; 4ACB A; 1OB2 A; 1QUE A; 2XGJ A; 3ZBU A; 2CW5 A; 2OK8 A; 3RY8 A; 3VR6 A; 1BLI A; 1EWY A; 4LC0 A; 4B47 A; 4ASU A; 2ZXH A; 1YJN B; 1IHM A; 1VQL B; 4WZK A; 4X8I A; 2HDN B; 2XOK A; 1M90 D; 3OJW A; 1OHH A; 3OFN A; 1FND A; 2X8K A; 2GK7 A; 2OYN A; 3Q6R A; 3G6E B; 1H8H A; 2GJK A; 1EP3 B; 1QFZ A; 3P27 A; 4QVJ A; 4Z4S A; 3OPO A; 2QDX A; 3WXM A; 2CBX A; 5L46 A; 3J81 k; 2BGJ A; 3CPX A; 1KK3 A; 1NB0 A; 1T6X A; 2X85 A; 4RPD A; 2DCU A; 2QTZ A; 2V31 A; 1PJ6 A; 1N0V C; 5DN6 A; 3QFC A; 4RD6 A; 2D3N A; 1BMF A; 5IYP A; 5F4J A; 4TKO B; 3H9N A; 3LQE A; 1W0J A; 3DDY A; 1WP6 A; 3ES9 A; 4HE5 A; 3CRZ A; 4RDJ A; 2W6I A; 2XZP A; 2QA4 B; 2VYQ A; 1WSV A; 4AF6 A; 1SM4 A; 2HCJ B; 2ZXI A; 1ZM9 A; 3OZU A; 1UD2 A; 2W6J A; 4UAJ A; 1EP1 B; 4OPS A; 4B4D A; 4P12 A; 4TT3 A; 1WDT A; 4B3X A; 1AMO A; 3WNC A; 4R71 A; 4Y9U A; 1E1Q A; 3MCA A; 2LZJ A; 3CME B; 2V4D A; 4FWT A; 3GIR A; 2WSS A; 5IK2 A; 1XFO A; 1KC8 D; 4RD0 A; 3PA2 A; 4P3Y A; 4Y7C A; 3OJX A; 4PC3 A; 4X06 A; 1N06 A; 5HKK A; 1V0F A; 1VQ7 B; 1W35 A; 4RCZ A; 1WOO A; 2CK3 A; 1HZE A; 3E1Y E; 1E1R A; 2WZN A; 2DOG A; 3U6B A; 4RD1 A; 3GVK A; 3GSI A; 4M1K A; 2VBU A; 4UZE A; 4P6V F; 2WJY A; 5LMZ A; 1VJS A; 5THX A; 3BCD A; 3ZZ0 A; 4G7X A; 2VJJ A; 3AVV A; 1H85 A; 2VBV A; 1NRK A; 4Z4R A; 1QFJ A; 1DDG A; 3FKS A; 1W34 A; 5BSX A; 1VQO B; 3PEN A; 3Q38 A; 2HLD A; 2C5B A; 2M5S A; 1EFC A; 3W2F A; 1G7C A; 1DG1 G; 3W2H A; 2X6X A; 2XZL A; 3LO8 A; 4Z4Y A; 3ASS A; 2BM1 A; 1TTT A; 3BQJ A; 5DS0 A; 4P3I A; 4XKV A; 1N07 A; 3GVL A; 2QTL A; 3CES A; 4B48 A; 3CCV B; 1JB9 A; 1Q86 D; 4YAF A; 1V5V A; 3NE5 B; 1IB0 A; 3ISX A; 1JA0 A; 3ONU A; 3PUN A; 1UD6 A; 4Y9R A; 4BPR A; 4DK0 A; 1N0U A; 4UZU A; 4E0F A; 1I7P A; 4WZT A; 2VJI A; 1NDH A; 2GPJ A; 1AIP A; 3CCM B; 2KVO A; 2DER A; 2WPD A; 4XLA A; 4DQK A; 4M4S A; 1DDI A; 3WY9 A; 1KK2 A; 3R6K A; 3W5H A; 1TUI A; 1EP2 B; 3PA1 A; 3B78 A; 5FA6 A; 2BMW A; 4X7F A; 5FIU A; 2BVN A; 1MRZ A; 4XOR A; 1FDR A; 2GRE A; 2YWH A; 3GVJ A; 1YJ9 B; 1S72 B; 4Z4V A; 4YEL A; 1NBM A; 3LNN A; 3CMA B; 2VNJ A; 4Z4Z A; 4P9S A; 1F20 A; 1H42 A; 1NB9 A; 1P4M A; 2QE7 A; 2VBT A; 1UD8 A; 1GR1 A; 1FNM A; 2C4T A; 2D74 A; 4M2L A; 3OZV A; 1W2B B; 4WQM A; 1I8D A; 2VBS A; 4NNJ A; 2DEU A; 2JDI A; 3BNW A; 2JN9 A; 3W2G A; 4YHB A; 3T53 B; 1ZUN B; 2YWG A; 5GV8 A; 2ZZE A; 1OB0 A; 3BCF A; 4DQL A; 2V7T A; 1FX0 A; 4XNF A; 3CCJ B; 4P2N A; 4X7E A; 1ELO A; 2ZL7 A; 4C43 A; 4RD2 A; 2VNI A; 1FRN A; 4FN5 A; 4YAL A; 3QE2 A; 3JQR A; 4RLZ A; 3OOC A; 2Q6L A; 1D1N A; 2XEX A; 1K73 D; 1E43 A; 4B43 A; 3AGP A; 2QMU A; 1KRH A; 4YEJ A; 5DSZ A; 1VQ9 B; 2PE3 A; 3BC9 A; 3WBK A; 4Q7J B; 4G7W A; 1SKQ A; 5BSY A; 1ZM4 A; 4QUZ A; 4WWV A; 4P22 A; 2X6Y A; 1R5N A; 3OW7 A; 3WQZ A; 2F43 A; 4XN3 A; 5A8A A; 4NCN A; 1EFR A; 1DAR A; 2R9V A; 2VZL A; 4XL9 A; 1JA1 A; 1FRQ A; 5IYN A; 4JMQ A; 3SEJ A; 3SJP A; 1OB5 A; 2BM0 A; 2J7K A; 4P6Y A; 2XNC A; 4X7C A; 3GQB A; 4G6I A; 4OPO A; 3ASR A; 1UD3 A; 2WR8 A; 2ZTN A; 3VNU A; 2ZZF A; 3A1P A; 1VQ5 B; 2BV3 A; 1CNF A; 4OPV A; 3I56 B; 3ZBT A; 3CCS B; 1Q7Y D; 1YI2 B; 1GVH A; 4DNR B; 3P26 A; 1K9M D; 4RDL A; 4YAW A; 1T6Z A; 1U2R A; 3T51 B; 2OTL B; 4CQJ A; 3A8K A; 1UD4 A; 1EXM A; 3BY2 A; 1BQE A; 4PC6 A; 4X07 A; 5F4M A; 3CP2 A; 4RJL A; 5KSW B; 1R5O A; 5J35 A; 1KQS B; 5E6T A; 1WOR A; 1ZM2 A; 5A89 A; 1VHO A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2VBU A; 3CTA A; 4UZE A; 5FO0 A; 1T6Y A; 2OYN A; 5A88 A; 5FO1 A; 1S4M A; 5TRD A; 1N07 A; 1N05 A; 4UZF A; 2P3M A; 1MRZ A; 1Q9S A; 2VBV A; 1NB0 A; 1T6X A; 1N06 A; 1NB9 A; 1P4M A; 3ZUG A; 2VBT A; 1T6Z A; 5FNZ A; 3OP1 A; 1N08 A; 2VBS A; 2I1L A; 5A89 A; 3BNW A; 5A8A A; 2X0K A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
