The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
99
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sequence length |
376
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structure length |
376
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Chain Sequence |
QETQGQAAARAAAADLAAGQDDEPRILEAPAPDARRVYVNDPAHFAAVTQQFVIDGEAGRVIGMIDGGFLPNPVVADDGSFIAHASTVFSRIARGERTDYVEVFDPVTLLPTADIELPDAPRFLVGTYPWMTSLTPDGKTLLFYQFSPAPAVGVVDLEGKAFKRMLDVPDCYHIFPTAPDTFFMHCRDGSLAKVAFGTEGTPEITHTEVFHPEDEFLINHPAYSQKAGRLVWPTYTGKIHQIDLSSGDAKFLPAVEALTEAERADGWRPGGWQQVAYHRALDRIYLLVDQRDEWRHKTASRFVVVLDAKTGERLAKFEMGHEIDSINVSQDEKPLLYALSTGDKTLYIHDAESGEELRSVNQLGHGPQVITTADMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Methylamine utilization protein mauG
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| publication title |
Functional Importance of Tyrosine 294 and the Catalytic Selectivity for the Bis-Fe(IV) State of MauG Revealed by Replacement of This Axial Heme Ligand with Histidine .
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Paracoccus denitrificans
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| molecule tags |
Oxidoreductase/electron transport
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| total genus |
99
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| structure length |
376
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| sequence length |
376
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| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF06433 | Me-amine-dh_H | Methylamine dehydrogenase heavy chain (MADH) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | 7 Propeller | Methylamine Dehydrogenase; Chain H | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3C99 A; 4ZOV A; 5SXM A; 2CN2 A; 3C9C A; 4YVD A; 3W15 A; 3PXW D; 4NSX A; 2OVP B; 2CNX A; 1U2V C; 3PSL A; 4E54 A; 2BBK H; 3VGZ A; 5CXB B; 1SQJ A; 4FHL A; 1GOT B; 5IGO A; 3AH8 B; 4BH6 A; 2H6K A; 3VA6 A; 2P9U C; 3PE7 A; 2PM9 B; 4L3G D; 4GQ2 P; 4QT8 A; 4JSV C; 5IGQ A; 3SXT D; 4CC9 A; 5FQD A; 2GC7 A; 4LGN A; 3SLE D; 5FA5 B; 1MDA H; 4UI9 R; 2YMU A; 4FA9 D; 1OLZ A; 2J57 G; 3RMZ D; 3HFQ A; 3GRE A; 1SQ9 A; 4G56 B; 5AJA A; 3ULE C; 2IUV A; 4J73 A; 4XEI C; 2H6Q A; 1PBY B; 2J55 H; 2QC5 A; 3PVU B; 4OWR A; 4CZV A; 4ZOY A; 3OKY A; 2HXC A; 4X63 B; 4GQB B; 4Y5R D; 3SHF A; 5H14 A; 4D0K A; 3JRP A; 4PSX B; 4Y7R A; 4LG8 A; 5THA A; 4E54 B; 3I8E A; 4N14 A; 3AL8 B; 3DXK C; 3DM0 A; 4MK0 B; 2AGY A; 5C9Z B; 4XYI A; 2AGL A; 2P9N C; 3BG0 A; 2I3S A; 3RFH A; 4FAV D; 2O9K A; 4O3U B; 1S4U X; 4J81 A; 3UVM A; 3JPX A; 3SMR A; 3EWE A; 5H1M A; 1OMW B; 1GG2 B; 4X61 B; 2YB8 B; 3IKO A; 2HES X; 2IWF A; 2P9K C; 4CY1 A; 1JJU B; 2PM7 B; 5JWZ A; 3DSM A; 3C5M A; 4CI2 A; 2G99 A; 4PBY A; 2CE8 A; 1N6F A; 3V9F A; 4LG9 A; 3L4O D; 5GXH A; 5FLX g; 2XU7 A; 2EBS A; 1Q47 A; 5I5J A; 3OKY B; 3DWL C; 1K32 A; 2OK4 A; 4J79 A; 5A2Q g; 4A11 A; 1N6D A; 1TBG A; 2CN3 A; 4A0A A; 3JZH A; 2AH0 A; 3E0C A; 4GM8 A; 3SWS D; 3SCY A; 3ZWL B; 3UVO A; 4GGC A; 3K27 A; 1TYQ C; 5FKS A; 3FGB A; 5HYN B; 2GC4 A; 1MG2 A; 5FKQ A; 4O3T B; 4A0B A; 4A2L A; 2AGW A; 2OK6 A; 1R5M A; 4IMM A; 4GM9 A; 3I89 A; 2XL2 A; 4IA9 A; 3IJ1 A; 1K8K C; 4A7J A; 4X60 B; 3SN6 B; 3I7L A; 4GMB A; 3IJC A; 1NR0 A; 4CI8 A; 3PSC B; 3AFC A; 4K3J B; 4XYH A; 5C2V B; 3BWS A; 2CO0 C; 1MG3 A; 4U1E I; 2IAA A; 4L3H D; 4O1Q D; 5IJ7 E; 4CI3 A; 3EU7 A; 5TEE A; 3CFS B; 2H9L A; 1JMX B; 2MTA H; 4A08 A; 3P4F A; 1ERJ A; 4H5I A; 5I5M A; 4CZY A; 4A11 B; 3I7K A; 4A0A B; 5EMM B; 4J87 A; 2H6N A; 2BCJ B; 3IIY A; 3OKT A; 3JZN A; 3V5W B; 1QNI A; 4D6V A; 5FXY A; 1PEV A; 3EI4 A; 1B9X A; 4GM3 A; 2AGZ A; 2B5L A; 4A0B B; 5TF2 A; 5CXC A; 2Z2P A; 3RFG A; 3NVN A; 3PXT D; 4L1Q D; 4FB1 D; 2CE9 A; 1XIP A; 2Z2O A; 3B7F A; 3EI3 A; 4QRJ A; 5EML B; 1XHM A; 4L9O A; 5IJ8 E; 3IJ0 A; 4JD2 C; 5I5I A; 2I0T A; 5GMK n; 4KFM B; 1PGU A; 5EAL A; 5AFU 3; 4CZX A; 1B9Y A; 2H68 A; 4JSN C; 2G9A A; 4X3E A; 2CO0 A; 3L4M D; 4JXM A; 3OKW A; 3CFV A; 5FKT A; 2P9I C; 4A08 B; 2B4E A; 2P9L C; 5GXI A; 3J80 g; 1RI6 A; 2H47 A; 3EI1 A; 5C2W B; 5TDH B; 5K1C C; 2H14 A; 3F3G A; 4R7A B; 5EMJ B; 4A2M A; 1SHY B; 5IT9 g; 4JT5 C; 1N6E A; 3MKQ A; 2IUQ A; 3I7P A; 3EMH A; 4O45 A; 3KRW B; 3OL2 A; 5CXC B; 3PVW B; 2OIZ A; 3EI2 A; 3IIW A; 1PI6 A; 3FRX A; 5EAP A; 4FAN D; 3EI3 B; 3VH0 A; 3UVN A; 3MKS B; 2PM9 A; 4QL1 A; 4ERY A; 4O9D A; 2HYE A; 5EMK B; 3CIK B; 2IUR A; 3UR4 A; 1XKS A; 3OTT A; 3GFC A; 4J8B A; 1JOF A; 3RRM C; 3SBR A; 3FM0 A; 3NVQ A; 4BUJ C; 3F3F A; 5IC7 A; 4FA5 D; 4PSW B; 2P9P C; 2UZX B; 5HE3 B; 2YNO A; 3K26 A; 4OZU A; 5HE0 B; 1VYH C; 3MZL A; 4U7A A; 3SBP A; 4PNK B; 4A09 A; 3ORV D; 3I7H A; 3JZG A; 3AL9 A; 3MXX A; 2IWK A; 3EI1 B; 4ES0 A; 1GXR A; 4J86 A; 2H3X A; 1GP2 B; 5FKR A; 4I79 A; 4E5Z A; 1P22 A; 2PBI B; 2W18 A; 3RLM D; 1YFQ A; 3SFZ A; 2XL3 A; 3AL8 A; 3OL2 B; 3SBQ A; 3RN0 D; 3SVW D; 3N0D A; 4J77 A; 1A0R B; 3UKU C; 4JSP C; 4PBZ A; 3EI2 B; 5B4W A; 1L0Q A; 5EAM A; 3MMY A; 2OVR B; 4CY3 A; 3UVK A; 5H17 A; 5TEF A; 4CY5 A; 4J8G A; 2GNQ A; 2AH1 A; 2H9M A; 2I3T A; 4ERQ A; 2PM6 B; 3PXS D; 2AQ5 A; 3F3P A; 3MZK A; 4PXW A; 3BG1 A; 4GZ8 A; 5HE1 B; 1JMZ B; 4J78 A; 4JSX C; 4AOW A; 4CI1 A; 4A09 B; 4EWR A; 4J0X A; 2YNP A; 5CYK A; 4PC0 A; 3JB9 L; 3A0F A; 2HJ4 A; 3I7N A; 5EM2 A; 4FA1 D; 3I7O A; 5AMS A; 4QQE A; 2HKR A; 4GGA A; 5GSA A; 4E5Z B; 4K3I D; 4FA4 D; 1U4C A; 4ESG A; 4AEZ A; 3RN1 D; 4BL0 A; 4Z8L A; 3I2N A; 1NEX B; 2AGX A; 2IUP A; 3EG6 A; 2XYI A; 5HQG A; 3U4Y A; 3UKR C; 5EAR A; 3OW8 A; 2B5N A; 2Z2N A; 2P9S C; 3RSE C; 4GQ1 A; 2UZY B; 3J81 g; 2I0R A; 2HJB A; 3C75 H; 3EI4 B; 3V7D B; 5HE2 B; 3JRO A; 4TZ4 A; 5CXB A; 1FWX A; 3DXM C; 2YBA A; 5KDO B; 3SJL D; 3NVX A; 3N0E A; 4ZN4 A; 4J82 A; 4GGD A; 2B5M A; 4CY2 A; 3ODT A; 2OVQ B; 4HDJ A; 4FWW A; 4J0W A; 2J56 H; 5CYK B; 2I0S A; 2OJY A; 2Q7Q A; 4ZOZ A; 2H9P A; 5EM2 B; 2YNN A; 5K19 A; 4JT6 C; 4ZOX A; 2TRC B; 4ERZ A; 3KRX B; 2QXV A; 2HKM A; 2H13 A; 3I8C A; 4H5J A; 3JAM g; 3UVL A; 4J84 A; 2H9N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C99 A; 4ZOV A; 5SXM A; 3VI4 A; 2EIB A; 3O4J A; 3QHY B; 2CN2 A; 3C9C A; 4YVD A; 1GOF A; 3W15 A; 3PXW D; 3T3M A; 4NSX A; 4RE6 A; 3GD1 I; 2BKL A; 2OVP B; 2CNX A; 1U2V C; 3EQ9 A; 4G55 A; 2QR5 A; 3V4V A; 3ZDZ A; 3PSL A; 4E54 A; 2BBK H; 3VGZ A; 4RE5 A; 5CXB B; 1SQJ A; 4FHL A; 1GOT B; 3OF7 A; 5IGO A; 3ZE0 A; 4DNU A; 1U8C A; 3AH8 B; 4L1M A; 4BH6 A; 2H6K A; 3VA6 A; 2P9U C; 1BPO A; 3PE7 A; 2PM9 B; 2VDQ A; 4L3G D; 4Z7O A; 4GQ2 P; 3ZE1 A; 4D9S A; 4QT8 A; 4JSV C; 5IGQ A; 3SXT D; 4CC9 A; 5FQD A; 2GC7 A; 4LGN A; 3SLE D; 3K6S A; 5FA5 B; 1MDA H; 4UI9 R; 2YMU A; 4FA9 D; 1YR2 A; 1OLZ A; 1H2Y A; 2J57 G; 3RMZ D; 4WK2 A; 3HFQ A; 3GRE A; 1SQ9 A; 4G56 B; 5AJA A; 3ULE C; 2IUV A; 1L5G A; 4J73 A; 4O02 A; 4XEI C; 2H6Q A; 1PBY B; 2J55 H; 2QC5 A; 3PVU B; 4OWR A; 4CZV A; 4ZOY A; 3OKY A; 2HXC A; 4X63 B; 4GQB B; 1UOP A; 4Y5R D; 4Z7Q A; 3SHF A; 3QI0 A; 5H14 A; 4D0K A; 3JRP A; 4PSX B; 4Y7R A; 4BCB A; 3O4H A; 3VI3 A; 4LG8 A; 5THA A; 4E54 B; 3IUM A; 3I8E A; 4N14 A; 3AL8 B; 2VZ1 A; 3DXK C; 3DM0 A; 4MK0 B; 2AGY A; 5C9Z B; 4XYI A; 2AGL A; 2P9N C; 3BG0 A; 2I3S A; 3RFH A; 4FAV D; 2O9K A; 4O3U B; 4NEN A; 1S4U X; 4J81 A; 3UVM A; 3JPX A; 3SMR A; 3EWE A; 5H1M A; 1OMW B; 1JV2 A; 1GG2 B; 4AN1 A; 4X61 B; 2YB8 B; 3IKO A; 2HES X; 2IWF A; 2P9K C; 4CY1 A; 1JJU B; 1H2Z A; 2PM7 B; 5JWZ A; 4WK4 A; 3DSM A; 3C5M A; 4CI2 A; 2G99 A; 4PBY A; 2CE8 A; 1N6F A; 3V9F A; 4LG9 A; 3L4O D; 5GXH A; 5FLX g; 2XU7 A; 1E8N A; 2EBS A; 1Q47 A; 5I5J A; 5M61 A; 3OKY B; 1VZ2 A; 3KCI A; 3DWL C; 1K32 A; 2OK4 A; 4J79 A; 4WJK A; 5A2Q g; 2VDO A; 4A11 A; 1N6D A; 1TBG A; 2CN3 A; 4A0A A; 4AN0 A; 3JZH A; 2AH0 A; 3E0C A; 4GM8 A; 3SWS D; 3SCY A; 3ZWL B; 3UVO A; 5M5U A; 4AMZ A; 4GGC A; 3K27 A; 1TYQ C; 5FKS A; 3FGB A; 5HYN B; 2GC4 A; 1MG2 A; 5FKQ A; 5M5T A; 4O3T B; 4NAA A; 4A0B A; 4BCD A; 4A2L A; 2AGW A; 2OK6 A; 1R5M A; 4IMM A; 4GM9 A; 3K71 A; 4G1E A; 3I89 A; 2XL2 A; 3O4G A; 3ZE2 A; 4IA9 A; 2HU8 A; 3IJ1 A; 1K8K C; 4A7J A; 4X60 B; 3SN6 B; 3I7L A; 4GMB A; 3IJC A; 1NR0 A; 4CI8 A; 3PSC B; 3AFC A; 4K3J B; 4XYH A; 5C2V B; 3K72 A; 3BWS A; 2VDL A; 2CO0 C; 1MG3 A; 4U1E I; 2IAA A; 4L3H D; 1UOO A; 4AMY A; 4O1Q D; 5IJ7 E; 4CI3 A; 3EU7 A; 5TEE A; 3IUQ A; 3CFS B; 2H9L A; 1JMX B; 2MTA H; 4A08 A; 3P4F A; 3O4I A; 1ERJ A; 4H5I A; 3EQ7 A; 5I5M A; 4CZY A; 4A11 B; 3I7K A; 4A0A B; 5EMM B; 4J87 A; 2H6N A; 2XE4 A; 2BCJ B; 1I2M B; 3IIY A; 3OKT A; 3JZN A; 4G1M A; 5E6S A; 3V5W B; 5M5V A; 1QNI A; 1GOH A; 4D6V A; 5FXY A; 4O2W A; 1PEV A; 1VE6 A; 3EI4 A; 1B9X A; 4GM3 A; 2AGZ A; 2B5L A; 4A0B B; 2WQ8 A; 5TF2 A; 5CXC A; 2Z2P A; 3RFG A; 1UOQ A; 3NVN A; 2VDN A; 4AX4 A; 3PXT D; 4L1Q D; 4FB1 D; 2CE9 A; 5M5S A; 2VDK A; 1C9I A; 1XIP A; 2Z2O A; 3B7F A; 4IRZ A; 3EI3 A; 4QRJ A; 5EML B; 1XHM A; 4L9O A; 5IJ8 E; 3IJ0 A; 1VE7 A; 4JD2 C; 5I5I A; 2I0T A; 5GMK n; 3IVM A; 4KFM B; 1PGU A; 5EAL A; 5AFU 3; 5C86 A; 4CZX A; 1B9Y A; 2H68 A; 4JSN C; 2G9A A; 4X3E A; 2CO0 A; 3L4M D; 4JXM A; 3OKW A; 4MMZ A; 4BP8 A; 3CFV A; 5FKT A; 2P9I C; 4A08 B; 2B4E A; 2P9L C; 5GXI A; 4UM8 A; 4WK0 A; 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