The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
92
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sequence length |
382
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structure length |
361
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Chain Sequence |
LSVDEEYDLWKSNVPLMYDFVSETRLTWPSLTVQWLPTPVQELDGGFIKQELIIGTHTSGEEENYLKFAEINLPKEILSNIRITAKYEHEEEITRARYMPQDPNIVATINGQGTTFLYSRSEGLQSTLKFHKDNGYALSFSTLVKGRLLSGSDDHTVALWEVGSGGDPTKPVRTWNDLHSDIINDNKWHNFNKDLFGTVSEDSLLKINDVRANNTTIDTVKCPQPFNTLAFSHHSSNLLAAAGMDSYVYLYDLRNMKEPLHHMSGHEDAVNNLEFSTHVDGVVVSSGSDNRLMMWDLKQIGAEQTPDDAEDGVPELIMVHAGHRSSVNDFDLNPQIPWLVASAEEENILQVWKCSHSLPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Hat2p recognizes the histone H3 tail to specify the acetylation of the newly synthesized H3/H4 heterodimer by the Hat1p/Hat2p complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Histone acetyltransferase type B catalytic subunit
|
| molecule tags |
Histone/transferase
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
92
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| structure length |
361
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| sequence length |
382
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| chains with identical sequence |
E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-03-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00400 | WD40 | WD domain, G-beta repeat |
| B | PF12265 | CAF1C_H4-bd | Histone-binding protein RBBP4 or subunit C of CAF1 complex |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | 7 Propeller | Methylamine Dehydrogenase; Chain H | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2B4E A; 5FQD A; 3UR4 A; 3OL2 A; 5FKS A; 1B9X A; 5I5J A; 4O45 A; 2UZY B; 4QQE A; 5I5M A; 4GZ8 A; 3IJ1 A; 4OZU A; 4FA5 D; 3DWL C; 4XYH A; 3HFQ A; 2J56 H; 3V7D B; 3OL2 B; 2H47 A; 4H5I A; 1N6F A; 3CFS B; 2XL2 A; 5TDH B; 3J80 g; 3C75 H; 3W15 A; 3RMZ D; 2AGZ A; 2CNX A; 4OWR A; 1GP2 B; 4QRJ A; 3EI4 A; 4J78 A; 4FA4 D; 5CXC A; 4CZY A; 1SQJ A; 1JMX B; 2G9A A; 3E0C A; 5AJA A; 2HKM A; 3KRX B; 4FA9 D; 5TF2 A; 1OMW B; 2YNP A; 4N14 A; 4MK0 B; 4GQ2 P; 4GGD A; 3N0E A; 3GFC A; 4JSP C; 1XKS A; 3EI4 B; 3RSE C; 5CXC B; 5IJ7 E; 2OVR B; 2AGL A; 3UVO A; 3SWS D; 2H9L A; 3DM0 A; 4GGC A; 3EI2 A; 1S4U X; 4A2L A; 4E54 A; 2IUQ A; 5B4W A; 2H9P A; 2IUR A; 3UVN A; 1U4C A; 5AMS A; 4QT8 A; 2O9K A; 1MG2 A; 2B5L A; 3GRE A; 4ERQ A; 4CI2 A; 2P9U C; 2H13 A; 2H68 A; 3EI2 B; 5THA A; 4E54 B; 4D6V A; 1K32 A; 2HYE A; 3BG1 A; 4J8G A; 4J86 A; 3JZN A; 2QC5 A; 2H9M A; 3OKW A; 3EWE A; 1NR0 A; 2I0S A; 2H6Q A; 4AOW A; 4I79 A; 3MKQ A; 3BG0 A; 4J77 A; 4ESG A; 3IKO A; 4X3E A; 1U2V C; 4UI9 R; 4TZ4 A; 3EMH A; 4EWR A; 4A0B A; 2H3X A; 2PM7 B; 3PVU B; 2P9N C; 2J55 H; 3AL8 A; 3F3G A; 4PBY A; 4BH6 A; 4HDJ A; 2PM6 B; 3SLE D; 3I7O A; 4NSX A; 4BUJ C; 3IJC A; 3ODT A; 3EU7 A; 3SBP A; 4ZOZ A; 4K3I D; 4E5Z A; 5H14 A; 5H1M A; 3AH8 B; 4J81 A; 3U4Y A; 4A0B B; 1PGU A; 3AL8 B; 2XU7 A; 4A09 B; 1P22 A; 3OKT A; 3IJ0 A; 3PVW B; 5C2W B; 5EMM B; 3CIK B; 4X60 B; 4A0A A; 3FGB A; 3EI3 A; 4E5Z B; 4ZN4 A; 1FWX A; 5EM2 A; 1GOT B; 1NEX B; 2YNN A; 3PXT D; 4D0K A; 4ES0 A; 4KFM B; 5EMK B; 4JSX C; 1QNI A; 3PE7 A; 3SVW D; 2YNO A; 4A0A B; 1VYH C; 4PNK B; 2HJB A; 3EI3 B; 4Z8L A; 4X63 B; 4CY3 A; 4Y5R D; 1L0Q A; 3JZG A; 2H6N A; 5EM2 B; 4O9D A; 5IT9 g; 3JPX A; 4ZOX A; 3F3P A; 2QXV A; 3IIY A; 4O3U B; 3C99 A; 2HJ4 A; 2PBI B; 5JWZ A; 4FAN D; 2UZX B; 3JZH A; 4X61 B; 5FLX g; 1MG3 A; 4CC9 A; 3AL9 A; 5GSA A; 5EAL A; 5HQG A; 3VH0 A; 1PEV A; 5A2Q g; 3CFV A; 4L1Q D; 4PSX B; 3JAM g; 2G99 A; 3V5W B; 2W18 A; 2H9N A; 1JJU B; 1N6D A; 4GGA A; 3UVM A; 3UKU C; 5EMJ B; 2AGY A; 3DSM A; 4FWW A; 4BL0 A; 3I8E A; 1JOF A; 3ULE C; 2AQ5 A; 5FKQ A; 4GM8 A; 4CI1 A; 2OJY A; 3IIW A; 5GXI A; 3RN0 D; 5HE3 B; 2YBA A; 5SXM A; 2CE9 A; 4J79 A; 5FKT A; 5EAM A; 4J87 A; 5IGO A; 3EG6 A; 2CE8 A; 1PI6 A; 5K19 A; 5GMK n; 4JT5 C; 3JB9 L; 3RLM D; 5IC7 A; 3JRP A; 2AH1 A; 4IMM A; 1TYQ C; 2CN2 A; 5HE2 B; 1MDA H; 3K27 A; 3NVQ A; 4PXW A; 1XIP A; 4Y7R A; 3I7P A; 4J8B A; 2HXC A; 2OK6 A; 1GXR A; 2I0R A; 4L9O A; 2Q7Q A; 3V9F A; 2GC4 A; 2MTA H; 2XYI A; 4FAV D; 3AFC A; 2EBS A; 4PC0 A; 3KRW B; 2Z2O A; 4XYI A; 3PXW D; 5HE0 B; 1N6E A; 5I5I A; 3RFH A; 2B5N A; 2B5M A; 3I8C A; 1R5M A; 2P9I C; 1RI6 A; 3F3F A; 2H14 A; 3B7F A; 3L4O D; 2BCJ B; 3JRO A; 4ERY A; 5HE1 B; 2GC7 A; 4YVD A; 2I3T A; 3SJL D; 4JSV C; 1YFQ A; 4GM3 A; 3OKY A; 5EML B; 3P4F A; 2AGW A; 2HES X; 3FM0 A; 3SFZ A; 2XL3 A; 3I89 A; 3N0D A; 2CN3 A; 4G56 B; 3UKR C; 3EI1 A; 1JMZ B; 4GMB A; 4QL1 A; 3OTT A; 3UVL A; 2IUV A; 4PBZ A; 4CZX A; 3I7H A; 4ZOV A; 3OKY B; 5KDO B; 4LGN A; 4O3T B; 4CI8 A; 2IWK A; 3VA6 A; 3MMY A; 4U7A A; 2OVQ B; 1GG2 B; 3RRM C; 5C9Z B; 3EI1 B; 2TRC B; 3I7L A; 4J0X A; 1SHY B; 5EAR A; 2Z2N A; 2Z2P A; 4JXM A; 4GQB B; 3I7K A; 3PXS D; 1A0R B; 3L4M D; 5AFU 3; 4ZOY A; 5FKR A; 4A08 A; 5C2V B; 5CYK A; 1ERJ A; 2P9L C; 3DXM C; 1B9Y A; 2OIZ A; 5TEF A; 4O1Q D; 3ZWL B; 1K8K C; 5CXB A; 4L3G D; 2IUP A; 3K26 A; 2PM9 A; 3SBQ A; 4A11 A; 4JT6 C; 3A0F A; 4CY5 A; 3SMR A; 2HKR A; 2AGX A; 4A2M A; 1TBG A; 5FXY A; 2OK4 A; 3SCY A; 4A08 B; 5CYK B; 5GXH A; 3ORV D; 3MKS B; 2IAA A; 3MXX A; 4J84 A; 2P9P C; 5CXB B; 4J82 A; 3FRX A; 3SN6 B; 2PM9 B; 5H17 A; 5EAP A; 4A11 B; 5IJ8 E; 2OVP B; 4U1E I; 3VGZ A; 3PSL A; 5K1C C; 3C5M A; 4JSN C; 1XHM A; 1OLZ A; 4CZV A; 2J57 G; 3MZK A; 2YB8 B; 4FHL A; 4AEZ A; 3UVK A; 3J81 g; 5IGQ A; 2GNQ A; 5TEE A; 5HYN B; 3I7N A; 4K3J B; 4R7A B; 3DXK C; 3SHF A; 2I0T A; 4CY1 A; 4A7J A; 2IWF A; 3SXT D; 2P9K C; 4ERZ A; 4XEI C; 1Q47 A; 2AH0 A; 3BWS A; 4LG9 A; 1SQ9 A; 3SBR A; 2CO0 C; 3MZL A; 4GQ1 A; 4IA9 A; 2I3S A; 3NVN A; 4J73 A; 5FA5 B; 4LG8 A; 3C9C A; 2H6K A; 2BBK H; 4PSW B; 4FA1 D; 4A09 A; 3NVX A; 3RFG A; 4CY2 A; 2CO0 A; 4JD2 C; 4GM9 A; 3PSC B; 4J0W A; 3OW8 A; 3RN1 D; 4L3H D; 4CI3 A; 4FB1 D; 2YMU A; 3I2N A; 1PBY B; 4H5J A; 2P9S C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2B4E A; 5FQD A; 3UR4 A; 3OL2 A; 5FKS A; 1B9X A; 5I5J A; 4O45 A; 1JTD B; 4AN0 A; 2UZY B; 4QQE A; 5I5M A; 4GZ8 A; 2VZ1 A; 3IJ1 A; 4MMX A; 4OZU A; 4FA5 D; 3DWL C; 4XYH A; 2EIC A; 3HFQ A; 5FFO A; 4DNU A; 2J56 H; 3V7D B; 3OL2 B; 2H47 A; 1UOO A; 2VDP A; 2VC2 A; 4H5I A; 1N6F A; 3CFS B; 3MUN A; 2XL2 A; 5TDH B; 3J80 g; 3C75 H; 3W15 A; 3RMZ D; 2AGZ A; 2CNX A; 4OWR A; 1GP2 B; 4QRJ A; 4G1M A; 3EI4 A; 4J78 A; 4FA4 D; 5CXC A; 4CZY A; 1GOG A; 1UOP A; 3QHY B; 3FCS A; 1SQJ A; 1JMX B; 2G9A A; 3E0C A; 5AJA A; 2EID A; 3ZDX A; 2HKM A; 3KRX B; 3GD1 I; 5TF2 A; 4FA9 D; 1OMW B; 2YNP A; 4N14 A; 4MK0 B; 5M5U A; 4GQ2 P; 4UM9 A; 4GGD A; 3N0E A; 3GFC A; 4JSP C; 1XKS A; 3EI4 B; 3RSE C; 5CXC B; 5IJ7 E; 2OVR B; 2AGL A; 3UVO A; 3SWS D; 2H9L A; 1VZ3 A; 3DM0 A; 3O4G A; 4GGC A; 3EI2 A; 1S4U X; 4A2L A; 2WQ8 A; 2IUQ A; 4E54 A; 5B4W A; 2H9P A; 2IUR A; 3UVN A; 1U4C A; 5AMS A; 4QT8 A; 2O9K A; 1MG2 A; 2B5L A; 3FCU A; 3GRE A; 1L5G A; 4ERQ A; 4CI2 A; 2P9U C; 2H13 A; 2H68 A; 4BCD A; 3EI2 B; 5THA A; 4E54 B; 4D6V A; 1K32 A; 2HYE A; 3BG1 A; 3EQ8 A; 4J8G A; 4J86 A; 1E8N A; 3JZN A; 2QC5 A; 2H9M A; 1H2Z A; 3K71 A; 4BP8 A; 3OKW A; 3EWE A; 1NR0 A; 2I0S A; 2H6Q A; 4AOW A; 4AX4 A; 4I79 A; 3MKQ A; 3BG0 A; 4J77 A; 4ESG A; 3IKO A; 4X3E A; 1U2V C; 4UI9 R; 4TZ4 A; 3EMH A; 4NBM A; 2VDR A; 1I2M B; 4JHN A; 4EWR A; 4A0B A; 2H3X A; 2PM7 B; 3PVU B; 2P9N C; 2J55 H; 3AL8 A; 3F3G A; 4PBY A; 4BH6 A; 4HDJ A; 2PM6 B; 3SLE D; 5C86 A; 3I7O A; 2VZ3 A; 4NSX A; 4BUJ C; 3NIF A; 3IJC A; 3ODT A; 3EU7 A; 3SBP A; 4ZOZ A; 4K3I D; 4E5Z A; 5H14 A; 3ZE0 A; 5H1M A; 3AH8 B; 4J81 A; 3U4Y A; 4A0B B; 1PGU A; 5FFG A; 4WK0 A; 3AL8 B; 2XU7 A; 3IUQ A; 4A09 B; 5E6R A; 1P22 A; 3OKT A; 3IJ0 A; 3PVW B; 5C2W B; 3K72 A; 5EMM B; 3CIK B; 4X60 B; 1C9I A; 4A0A A; 3FGB A; 3EI3 A; 5HDB A; 4E5Z B; 3K6S A; 4ZN4 A; 1FWX A; 5EM2 A; 1GOT B; 1NEX B; 4G55 A; 2YNN A; 3PXT D; 4D0K A; 4ES0 A; 2EIB A; 4KFM B; 5EMK B; 1QNI A; 4JSX C; 3PE7 A; 3QI0 A; 3SVW D; 2YNO A; 4A0A B; 1VYH C; 4PNK B; 1H2W A; 2XZG A; 4DNW A; 2HJB A; 3EI3 B; 4Z8L A; 3EQ7 A; 4X63 B; 3O4H A; 4CY3 A; 4Y5R D; 1L0Q A; 3IUJ A; 3JZG A; 2H6N A; 1O6G A; 1VE6 A; 4O9D A; 5EM2 B; 3IUM A; 4O2W A; 2QZP A; 4DNV A; 4RE6 A; 4MMY A; 5IT9 g; 3NID A; 3JPX A; 1E8M A; 4ZOX A; 3F3P A; 2QXV A; 3IIY A; 4O3U B; 3C99 A; 2HJ4 A; 2PBI B; 5JWZ A; 4FAN D; 2UZX B; 3JZH A; 4X61 B; 5FLX g; 1MG3 A; 4CC9 A; 3AL9 A; 5GSA A; 3EQ9 A; 1H2X A; 3ZDY A; 5EAL A; 5C92 A; 5HQG A; 2EIE A; 3T3M A; 2VDO A; 1A12 A; 1YR2 A; 3VH0 A; 1PEV A; 4BCB A; 5A2Q g; 3CFV A; 3DDU A; 4L1Q D; 4PSX B; 3JAM g; 2G99 A; 4D9S A; 3V5W B; 2W18 A; 2VDK A; 2H9N A; 1BPO A; 1JJU B; 1N6D A; 2QR5 A; 4GGA A; 3O4I A; 3UVM A; 3UKU C; 5EMJ B; 4Z7N A; 2AGY A; 3DSM A; 4FWW A; 4BL0 A; 3I8E A; 1JOF A; 3ULE C; 2AQ5 A; 5FKQ A; 4GM8 A; 4CI1 A; 2OJY A; 3IIW A; 3ZE1 A; 5GXI A; 3RN0 D; 5HE3 B; 2YBA A; 1E5T A; 5SXM A; 2CE9 A; 4J79 A; 5FKT A; 5EAM A; 4J87 A; 5IGO A; 3EG6 A; 4Z7Q A; 2CE8 A; 1PI6 A; 2VDQ A; 5K19 A; 5GMK n; 4JT5 C; 4WJK A; 3JB9 L; 3RLM D; 5IC7 A; 2XDW A; 3JRP A; 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