The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
85
|
structure length |
85
|
Chain Sequence |
KLANGDIAIIDFTGIVDNKKLASASAQNYELTIGSNSFIKGFETGLIAMKVNQKKTLALTFPSDYHVKELQSKPVTFEVVLKAIK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR solution structure and dynamics of the peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain of the trigger factor from Mycoplasma genitalium compared to FK506-binding protein.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Mycoplasma genitalium
|
| molecule keywords |
TRIGGER FACTOR
|
| total genus |
8
|
| structure length |
85
|
| sequence length |
85
|
| ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
| pdb deposition date | 2001-01-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Chitinase A; domain 3 | Chitinase A; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1EQ3 A; 3IHZ A; 3EY6 A; 4DZ2 A; 1TCO C; 1W26 A; 1KT0 A; 3UQA A; 1Q6U A; 3WH0 A; 3PRB A; 1FD9 A; 1Y0O A; 2D9F A; 2KFW A; 2ZQV A; 4QIB A; 4JFI A; 4DRJ A; 2DG3 A; 4JFM A; 1FKI A; 4GGQ A; 4QT3 A; 4C02 B; 2UZ5 A; 1D6O A; 2XP8 A; 4JFL A; 2XP5 A; 2LPV A; 1P5Q A; 1FKD A; 3IK8 A; 4DRI A; 4DRQ A; 4MSP A; 4DH0 A; 1L1P A; 3IKG A; 2ZQU A; 2MLX A; 3KAB A; 3KAG A; 3O5D A; 4DRO A; 2OFN A; 3KZ7 A; 3CGN A; 4DIP A; 4MGV A; 1EYM A; 4R0X A; 1F40 A; 3JYM A; 2PPO A; 2LKN A; 4IQ2 A; 2L2S A; 4LAY A; 2RUR A; 4DT4 A; 5BXJ A; 3UF8 A; 1NMV A; 5HWB A; 5I98 A; 3I6C A; 4GIV A; 1PIN A; 3VAW A; 3JXV A; 1YW5 A; 5DIT A; 1QPF A; 2RUD A; 1FKF A; 4TNS A; 2KR7 A; 2PPN A; 3KAD A; 4DRM A; 2LJ4 A; 3FAP A; 4TW7 A; 1ROT A; 2KI3 A; 3B7X A; 1FAP A; 3UQB A; 1JVW A; 3RFW A; 3UQI A; 1FJD A; 2FKE A; 2KE0 A; 4TW8 A; 1FKK A; 3RGC A; 1JNT A; 5HUA A; 2ITK A; 1HXV A; 2XP9 A; 4DZ3 A; 1Q1C A; 5HTG A; 3KCE A; 4TW6 A; 3O5J A; 1FKG A; 2XP4 A; 4NNR A; 4QT2 A; 2MLY A; 1FKR A; 2RSE A; 2XPA A; 3UI6 A; 4IQC A; 2F4E A; 1FKH A; 5D75 A; 5HT1 A; 2IF4 A; 4ODO A; 2PBC A; 2F2D A; 2FAP A; 3O5K A; 2RUQ A; 1NMW A; 4LAV A; 2RUC A; 3GPK A; 2M2A A; 3LUO A; 4ODR A; 1D7H A; 1YAT A; 2M1I A; 2VCD A; 4J4O A; 4ODL A; 3OOB A; 4U86 A; 1JNS A; 1B6C A; 2ZR6 A; 3H9R B; 4IPX A; 2ZQT A; 3NTP A; 2M08 A; 5DIU A; 4DRP A; 3O5L A; 4JFK A; 2ZR5 A; 2PV2 A; 2PPP A; 1M5Y A; 4G50 A; 4DRN A; 5HW6 A; 3KAC A; 3KAF A; 3O5M A; 2VN1 A; 2ZR4 A; 2PV3 A; 1NSG A; 3KAI A; 4ODK A; 3IKD A; 4FAP A; 4ODM A; 5GPG A; 1FKL A; 4ODP A; 5DIV A; 3O5E A; 2JZV A; 4U85 A; 2KO7 A; 1T11 A; 2XPB A; 4O2T A; 1ZK6 A; 3O5I A; 5B8I C; 3O5R A; 2XP7 A; 2LGO A; 4ITZ A; 3CGM A; 1C9H A; 1J4I A; 1J4H A; 1Q6I A; 2XP3 A; 2RQS A; 3NI6 A; 3NRK A; 3O5P A; 3O5G A; 2MNT A; 2MLZ A; 4W9P A; 4W9O A; 2DG4 A; 2MF9 A; 4BF8 A; 4N19 A; 1ZCN A; 1Q6H A; 2ZQS A; 3MDY B; 1BKF A; 1QZ2 A; 3O5O A; 4LAW A; 5HW8 A; 5HWC A; 2PV1 A; 3O5Q A; 4FN2 A; 2Y78 A; 2Q5A A; 3PRD A; 4G2P A; 4JFJ A; 4TYO A; 5HKG A; 2K8I A; 3ODK A; 4J4N A; 5HW7 A; 1FKT A; 1KT1 A; 4JYS A; 4DRK A; 1ROU A; 2AWG A; 1F8A B; 3JYJ A; 1D7J A; 1FKB A; 1A7X A; 1D7I A; 4W9Q A; 3UI4 A; 1J6Y A; 4DRH A; 1FKJ A; 1QPL A; 2DG9 A; 2XP6 A; 3PA7 A; 1R9H A; 1J4R A; 1FKS A; 1PBK A; 3UI5 A; 3TC5 A; 5J6E A; 4ODQ A; 4ODN A; 1BL4 A; 1N1A A; 1U79 A; 2N87 A; 4LAX A; 3KAH A; 2MPH A; 3O5F A; 3TDB A; 3TCZ A; 4U84 A; 2F21 A; 2KGJ A; 4TX0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EY6 A; 2DT2 A; 1KT0 A; 1LQ0 A; 3WH0 A; 3AS1 A; 3PRB A; 4L72 B; 5GPR A; 1ZBV A; 4QIB A; 1FKI A; 4GGQ A; 4QT3 A; 4C02 B; 2XP8 A; 4URI A; 3IK8 A; 4DRQ A; 1GRJ A; 4DH0 A; 1L1P A; 4DRO A; 1WNO A; 3O5D A; 1HKK A; 3WD3 A; 1SYT A; 5DF0 A; 5I98 A; 3I6C A; 1YW5 A; 4TNS A; 2PPN A; 3KAD A; 4DWS B; 3FAP A; 1XHG A; 2ETN A; 3B7X A; 1NWT A; 1WAW A; 1WB0 A; 2FKE A; 5HUA A; 1HXV A; 1Q1C A; 4QT2 A; 4QZV B; 1E6Z A; 4IQC A; 4DWS D; 2F4E A; 2DSV A; 4XAK A; 4ODO A; 2FAP A; 5DO2 A; 2RUQ A; 2RUC A; 3G6M A; 1FFR A; 1YAT A; 2VCD A; 3B8S A; 3OOB A; 4U86 A; 3EIP A; 2ZQT A; 2M08 A; 4MTV A; 1HJV A; 1E6N A; 2ZR5 A; 4DRN A; 3KAF A; 3O5M A; 1LJY A; 2VN1 A; 2PV3 A; 1OGG A; 1W9P A; 4WKA A; 4ODK A; 5GPG A; 5DIV A; 3FXY A; 2XPB A; 1ZK6 A; 3BMB A; 2XP7 A; 3BXW A; 1W1Y A; 3RME A; 3CGM A; 1H0I A; 1J4H A; 3NRK A; 4ML4 A; 2DG4 A; 1Q6H A; 3QOK A; 1QZ2 A; 4L3N A; 2DT3 A; 3RM8 A; 4FN2 A; 4JFJ A; 4TYO A; 5HKG A; 1FKT A; 1KT1 A; 1E44 A; 4DRK A; 1ROU A; 3JYJ A; 5HWB A; 3UI5 A; 1R9H A; 1NWU A; 1PBK A; 4R5E A; 3TC5 A; 2IUZ A; 4ODQ A; 4ODN A; 1U79 A; 1RD6 A; 5DEZ A; 4Z2L A; 3PR9 A; 2KGJ A; 1EQ3 A; 3IHZ A; 4DZ2 A; 1TCO C; 3WD2 A; 1FD9 A; 1Y0O A; 4MNM A; 4MNK A; 4DRJ A; 3ARY A; 1ZBW A; 1P5Q A; 3CH9 A; 1ZL1 A; 4MSP A; 3ARU A; 4Q22 A; 1K9T A; 3ARQ A; 2PN0 A; 2MLX A; 4ZPT R; 4MGV A; 1EYM A; 2PPO A; 1E9L A; 2L2S A; 3ARR A; 2YBU A; 4W5U A; 3UF8 A; 2DSU A; 1PIN A; 3VAW A; 1ZB5 A; 5DIT A; 2KI3 A; 2G41 A; 3UQB A; 1JVW A; 1FFQ A; 2A3E A; 2KE0 A; 1FKK A; 3RGC A; 4NZC A; 1JND A; 1W1P A; 1GOI A; 3KCE A; 4TW6 A; 3O5J A; 1FKG A; 2MLY A; 1FKR A; 3UI6 A; 1OGB A; 1UR9 A; 5D75 A; 5HT1 A; 2PBC A; 1ITX A; 2F2D A; 3O5K A; 4WJX A; 4Z2G A; 2M2A A; 2M1I A; 4ODL A; 1B6C A; 1GUV A; 3H9R B; 5DIU A; 3O5L A; 4JFK A; 2B31 A; 3ARV A; 2PPP A; 1D2K A; 3KAC A; 4MAV A; 2ZR4 A; 3W4R A; 3ARP A; 3WL0 A; 2P4V A; 3KAI A; 4KQZ A; 4FAP A; 4HBE A; 4ODP A; 4O2T A; 2DSW A; 4ZS6 A; 3O5R A; 1Q6I A; 3O5P A; 4KR0 B; 4N19 A; 2AOS A; 3FY1 A; 1HKM A; 4LAW A; 3WL1 A; 5HWC A; 2G8Z A; 4DWS A; 3WQW A; 1E15 A; 4P8W A; 2QF8 A; 3CHF A; 2K8I A; 3RM4 A; 4IT6 A; 4LGX A; 2EUL A; 4WKH A; 1QPL A; 3PA7 A; 1LG2 A; 5J6E A; 1FKS A; 3AS3 A; 4LAX A; 4DWS C; 2MPH A; 2YBT A; 4ZPV R; 4U84 A; 2F21 A; 1JNE A; 3UQA A; 1W9V A; 2DT0 A; 2ZQV A; 2D9F A; 3ARZ A; 4JFI A; 1D6O A; 4JFL A; 3WIJ A; 1FKD A; 3IKG A; 5JH8 A; 3ARW A; 2A3C A; 2ZQU A; 3KAB A; 1LG1 A; 2OFN A; 3ARS A; 3KZ7 A; 4DIP A; 3ALG A; 3B9D A; 4IQ2 A; 2RUR A; 1NMV A; 2O92 A; 2FDM A; 2RUD A; 1E6R A; 2KR7 A; 4DRM A; 2LJ4 A; 1X6N A; 4TW7 A; 1EDQ A; 4P8U A; 3RFW A; 3UQI A; 1FJD A; 4Z2H A; 1TFV A; 3ART A; 1LL4 A; 1O6I A; 2XP4 A; 2XPA A; 2IF4 A; 3WKZ A; 4LAV A; 3GPK A; 1HKJ A; 4ODR A; 3CHD A; 4P8X A; 2PI6 A; 4NSB A; 3ARO A; 3WQV A; 3OA5 A; 4G50 A; 5HBF A; 1M5Y A; 4S3K A; 1NH6 A; 2ESC A; 4ODM A; 3O5E A; 1HKI A; 2JZV A; 1VF8 A; 3CHE A; 3WD4 A; 3O5I A; 5B8I C; 2LGO A; 3GTY X; 1EHN A; 1C9H A; 1J4I A; 3WD0 A; 2XP3 A; 2RQS A; 3NI6 A; 4Q7N A; 4W9O A; 2MNT A; 2MLZ A; 2ZQS A; 3MDY B; 5HW8 A; 2O9O A; 2Y78 A; 2Q5A A; 3PRD A; 4G2P A; 3G6L A; 3GU0 A; 1F8A B; 1D7J A; 1FKB A; 4MNL A; 4W9Q A; 1J6Y A; 4DRH A; 3AS2 A; 3WD1 A; 1FKJ A; 2DG9 A; 1J4R A; 1OWQ A; 1BL4 A; 1N1A A; 2N87 A; 3RM9 A; 1KFW A; 3O5F A; 1IX5 A; 4WIW A; 4TX0 A; 1X6L A; 2DT1 A; 2DSZ A; 1W26 A; 1Q6U A; 1ZBC A; 2KFW A; 4S3J A; 2DG3 A; 4JFM A; 1XRV A; 2UZ5 A; 4PTM A; 2XP5 A; 2LPV A; 4DRI A; 2WM0 A; 1NWS A; 3KAG A; 2B5U B; 3CGN A; 2WLZ A; 4R0X A; 1F40 A; 4AY1 A; 1EIB A; 3JYM A; 2LKN A; 1GPF A; 4LAY A; 4DT4 A; 5BXJ A; 2A3A A; 3B9A A; 1H0G A; 1LL7 A; 2A3B A; 4GIV A; 4Z2I A; 3JXV A; 1QPF A; 1FKF A; 4ZPW R; 3AQU A; 4IT4 A; 1LL6 A; 1ROT A; 1FAP A; 4HBO A; 4TW8 A; 1JNT A; 1UR8 A; 2ITK A; 2XP9 A; 4DZ3 A; 5HTG A; 4NNR A; 2RSE A; 4MNJ A; 1FKH A; 1NMW A; 1CTN A; 1E6P A; 3LUO A; 1D7H A; 4J4O A; 1W9U A; 2WK2 A; 3PRA A; 1JNS A; 2ZR6 A; 4IPX A; 4UDM A; 4DRP A; 1W1T A; 1NWR A; 4MPK A; 2PV2 A; 5HW6 A; 1JCH B; 1NSG A; 3IKD A; 3AS0 A; 3ARX A; 1FKL A; 4U85 A; 2KO7 A; 1T11 A; 4Z2J A; 2DPE A; 4ITZ A; 2OLH A; 3O5G A; 5GQB A; 1W1V A; 4W9P A; 4BF8 A; 2MF9 A; 1ZCN A; 3O5O A; 1BKF A; 2F23 A; 3B9E A; 3CZ8 A; 2PV1 A; 3O5Q A; 5HW7 A; 3ODK A; 4J4N A; 4JYS A; 2AWG A; 1HJW A; 1A7X A; 1D7I A; 3UI4 A; 4WKF A; 1ZU8 A; 2XP6 A; 1HJX A; 1ZBK A; 3CHC A; 3KAH A; 4WK9 A; 3TDB A; 4P8V A; 4HAR A; 2WLY A; 3TCZ A; 3ALF A; 3NTP A; 4Z2K A; 1SR0 A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3EY6 A; 2DT2 A; 1KT0 A; 1LQ0 A; 3WH0 A; 3AS1 A; 3PRB A; 4L72 B; 5GPR A; 1ZBV A; 4QIB A; 1FKI A; 4GGQ A; 4QT3 A; 4C02 B; 2XP8 A; 4URI A; 3IK8 A; 4DRQ A; 1L1P A; 4DH0 A; 4DRO A; 1WNO A; 3O5D A; 1HKK A; 3WD3 A; 1SYT A; 5DF0 A; 5I98 A; 3I6C A; 1YW5 A; 4TNS A; 2PPN A; 3KAD A; 4DWS B; 3FAP A; 1XHG A; 3B7X A; 1NWT A; 1WAW A; 1WB0 A; 2FKE A; 5HUA A; 1HXV A; 1Q1C A; 4QT2 A; 4QZV B; 1E6Z A; 4IQC A; 4DWS D; 2F4E A; 2DSV A; 4XAK A; 4ODO A; 2FAP A; 5DO2 A; 2RUQ A; 2RUC A; 3G6M A; 1FFR A; 1YAT A; 2VCD A; 3B8S A; 3OOB A; 4U86 A; 2ZQT A; 2M08 A; 4MTV A; 1HJV A; 1E6N A; 2ZR5 A; 4DRN A; 3KAF A; 3O5M A; 1LJY A; 2VN1 A; 2PV3 A; 1OGG A; 1W9P A; 4WKA A; 4ODK A; 5GPG A; 5DIV A; 3FXY A; 2XPB A; 1ZK6 A; 2XP7 A; 3BXW A; 1W1Y A; 3RME A; 3CGM A; 1H0I A; 1J4H A; 3NRK A; 4ML4 A; 2DG4 A; 1Q6H A; 3QOK A; 1QZ2 A; 4L3N A; 2DT3 A; 3RM8 A; 4FN2 A; 4JFJ A; 4TYO A; 5HKG A; 1FKT A; 1KT1 A; 4DRK A; 1ROU A; 3JYJ A; 5HWB A; 3UI5 A; 1R9H A; 1NWU A; 1PBK A; 4R5E A; 3TC5 A; 2IUZ A; 4ODQ A; 4ODN A; 1U79 A; 1RD6 A; 5DEZ A; 4Z2L A; 3PR9 A; 2KGJ A; 1EQ3 A; 3IHZ A; 4DZ2 A; 1TCO C; 3WD2 A; 1FD9 A; 1Y0O A; 4MNM A; 4MNK A; 4DRJ A; 3ARY A; 1ZBW A; 1P5Q A; 3CH9 A; 1ZL1 A; 4MSP A; 3ARU A; 4Q22 A; 1K9T A; 3ARQ A; 2MLX A; 4ZPT R; 4MGV A; 1EYM A; 2PPO A; 1E9L A; 2L2S A; 3ARR A; 2YBU A; 4W5U A; 3UF8 A; 2DSU A; 1PIN A; 3VAW A; 1ZB5 A; 5DIT A; 2KI3 A; 2G41 A; 3UQB A; 1JVW A; 1FFQ A; 2A3E A; 2KE0 A; 1FKK A; 3RGC A; 4NZC A; 1JND A; 1W1P A; 1GOI A; 3KCE A; 4TW6 A; 3O5J A; 1FKG A; 2MLY A; 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3WKZ A; 4LAV A; 3GPK A; 1HKJ A; 4ODR A; 3CHD A; 4P8X A; 2PI6 A; 4NSB A; 3ARO A; 3WQV A; 3OA5 A; 4G50 A; 5HBF A; 1M5Y A; 4S3K A; 1NH6 A; 2ESC A; 4ODM A; 3O5E A; 1HKI A; 2JZV A; 1VF8 A; 3CHE A; 3WD4 A; 3O5I A; 5B8I C; 2LGO A; 1EHN A; 1C9H A; 1J4I A; 3WD0 A; 2XP3 A; 2RQS A; 3NI6 A; 4Q7N A; 4W9O A; 2MNT A; 2MLZ A; 2ZQS A; 3MDY B; 5HW8 A; 2O9O A; 2Y78 A; 2Q5A A; 3PRD A; 4G2P A; 3G6L A; 1F8A B; 1D7J A; 1FKB A; 4MNL A; 4W9Q A; 1J6Y A; 4DRH A; 3AS2 A; 3WD1 A; 1FKJ A; 2DG9 A; 1J4R A; 1OWQ A; 1BL4 A; 1N1A A; 2N87 A; 3RM9 A; 1KFW A; 3O5F A; 1IX5 A; 4WIW A; 4TX0 A; 1X6L A; 2DT1 A; 2DSZ A; 1W26 A; 1Q6U A; 1ZBC A; 2KFW A; 4S3J A; 2DG3 A; 4JFM A; 1XRV A; 2UZ5 A; 4PTM A; 2XP5 A; 2LPV A; 4DRI A; 2WM0 A; 1NWS A; 3KAG A; 3CGN A; 2WLZ A; 4R0X A; 1F40 A; 4AY1 A; 1EIB A; 3JYM A; 2LKN A; 1GPF A; 4LAY A; 4DT4 A; 5BXJ A; 2A3A A; 3B9A A; 1H0G A; 1LL7 A; 2A3B A; 4GIV A; 4Z2I A; 3JXV A; 1QPF A; 1FKF A; 4ZPW R; 3AQU A; 4IT4 A; 1LL6 A; 1ROT A; 1FAP A; 4HBO A; 4TW8 A; 1JNT A; 1UR8 A; 2ITK A; 2XP9 A; 4DZ3 A; 5HTG A; 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