4MNJA

Crystal structure of gh18 chitinase from cycad, cycas revoluta
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
344
structure length
342
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYEYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDSKFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal Structure of GH18 Chitinase from Cycad, Cycas revoluta
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 117
structure length 342
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4mnjA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mnjA01
2CHOA 1E5NA 3ZT7A 3CHFA 2XPKA 2WMJA 3L4WA 2BXYA 4LYQA 4E2OA 1UR1A 2VZUA 4U33A 4OBRA 2OYMA 2YA1A 2WCSA 1MVYA 4OOUA 2W61A 3ALFA 4MTVA 1B0IA 1E6ZA 5ABGA 1E6PA 1KWGA 1AMYA 5C70A 4M8UA 1UR8A 1E0VA 3VIHA 2CIPA 1HJSA 3AS1A 5A94A 5HXMA 1EOMA 3WBEA 3RJXA 2ZXBA 3AOFA 1E6XM 1RP8A 1PBGA 2QPSA 1XSJA 2Y8KA 1JD7A 5JUVA 4H8HA 4ACYA 3D3AA 1VEOA 3OGRA 4IPNB 4LGXA 1W1TA 4P7NA 4MPKA 3T08A 3AXXA 5AC5A 2D0FA 1Q6FA 2ZUNA 3OBAA 1JAEA 1Q6GA 3MUZ1 4Z2JA 2E4TA 4U2YA 3W6LA 1KGXA 5A6SA 1G5AA 1HJUA 1O7AA 2WC7A 1WPCA 3RILA 1WO2A 2XIBA 4XV0A 2NSXA 2FGLA 3AMKA 3U5UA 1PJ9A 1QI0A 4TVCA 1GQJA 4GKLA 4J7RA 3G6MA 4W5UA 1FH8A 4AD1A 1WDRA 1J11A 4ATWA 1JNEA 2X0HA 3QGVA 3W53A 3I3EA 1E9LA 3AROA 4AZ6A 1BYAA 1DEDA 2YDRA 4Y7EA 1B3VA 1H41A 4PMQA 1L0PA 2J77A 2VX6A 3A4WA 5KZ6A 1UH4A 3CIVA 5CLTA 3NYDA 1GOMA 1OD8A 5EMYA 3NIYA 2B31A 4ACZA 8CGTA 1NP0A 4QAWA 3N13A 3AYSA 1GQLA 4JFVA 3ZM8A 1XC6A 1PZ2A 4CN6A 4P7QA 5BCAA 2ZX9A 1TFVA 4IUGA 1M7XA 5E0FA 3AZTA 1CXLA 3VIMA 1B3YA 1UA7A 1DP0A 2WANA 4CVWA 4M29A 3MUAA 5A8NA 1DTUA 1ZBVA 1KXVA 3BC9A 5D9NA 2PB1A 3D5HA 1IZKA 3RIKA 3II1A 4GIAA 4CCEA 4TTGA 3A47A 6TAAA 4D1JA 4FLSA 3WNMA 4OIFA 2VT0A 5A8PA 3DC0A 2GJRA 4TOQA 3KL3A 1C91A 2DQXA 2XSAA 4DUWA 5AYBA 1KR0A 2V5CA 2VX4A 3W28A 2HISA 3GNPA 5M17A 1XV8A 4B16A 4TVUA 5D8WA 1FOBA 3ECQA 2WMKA 3M07A 4UFMA 3OLEA 4ZE5A 5ABHA 4M56A 1DWFM 3I3DA 1WZAA 5C71A 3L4VA 3SIMA 1NOWA 1BG9A 3ARZA 1V08A 2VZTA 2W5FA 2X1IA 4HU0A 3U5YA 2EPOA 4W85A 2VRQA 3AIVA 1XRVA 4MJ2A 3AHZA 4B3LA 1GCYA 2WWCA 3HJEA 4JFWA 4PUDA 1V3MA 2CNCA 1EHAA 4FLRA 1Y7VA 1SYTA 4WSJA 5A6JA 3NDYA 1H49A 2JIEA 1W3JA 3T2QA 1JF5A 3VD4A 1TR1A 2VR4A 5IHSA 1QHPA 3APGA 1HKJA 2V3GA 1WE5A 1EQPA 1K9DA 3AMDA 3W24A 1ZB5A 1D7FA 3LPGA 2DDXA 2D2OA 4W8AA 4CD7A 1HF6A 4N42A 4U3CA 2UY3A 1J0ZA 5I24A 3AHTA 1B9ZA 2EPNA 1E40A 4LPCA 3GXFA 3O2LA 3KL0A 4QLJA 1DHKA 2YIHA 1GQIA 4JZ5A 3WMCA 5CZKA 3B9EA 1UWSA 4U2ZA 1JYVA 4D71A 1PX4A 1JZ2A 3EDJA 2D0GA 3VX0A 2OWXA 1M53A 2CBIA 1CNVA 2EPKX 3BGAA 5IXEA 4UNIA 1H09A 5I79A 5AC4A 3WEMA 2CKRA 4GI8A 5DMYA 2D22A 3CHDA 2AMGA 1NWUA 4LX4A 2BY0A 3UEQA 2CERA 4PMVA 2AAAA 3WF3A 4W88A 1UR0A 1WDPA 1ISZA 1RPKA 3E1F1 1B31A 1TMQA 4WKHA 3I3BA 1WAWA 4CU7A 1VEPA 2WVUA 1OGSA 3AMLA 2YA0A 3N15A 3DYPA 3KEHA 1ITCA 4JFTA 3PZOA 2G3MA 1E71M 2D3NA 3BAIA 4MNMA 1W3LA 1CWYA 4EAMA 1JFXA 4UOQA 1TCMA 4PYSA 2O9PA 1MFVA 1CGUA 5HPOA 2Y24A 3IJ8A 3HU7A 3CHEA 2UY5A 2CBJA 3SUSA 1VEMA 1GVIA 3OZOA 4F9DA 1WZMA 3VOCA 4Z2HA 7TAAA 3IJ7A 2OWWA 2VVNA 3VIFA 1FHDA 1KFWA 3PTKA 4PMNA 4PSRA 2J8GA 5IDIA 3WEZA 1LL7A 1S46A 5A8MA 3BCDA 3AIEA 2J8FA 4HA3A 3WQ5A 4UTFA 1UWUA 2ZICA 1V03A 2VO5A 3WNLA 3PZNA 4HOWA 4UFKA 3ARWA 2EO7A 3VIOA 2WXDM 2A3HA 4D6DA 4UQDA 1E5JA 2ZXAA 1M03A 1R7OA 4AC1X 5LA2A 1W9UA 2VRKA 2WVVB 3AIRA 3VIPA 4PMYA 4E8CA 1KQYA 4BZYA 1CXKA 1C8YA 2ZXDA 4XB3A 3W29A 3IJ9A 2X0YA 3GNOA 1GZJA 4PMXA 2XIIA 5M5DA 3BLPX 3VINA 1V3HA 1V0KA 2VMFA 2GJXB 2CETA 3PZMA 3A4XA 4L4OA 4ZXOA 5JIWA 2NT0A 4L4PA 5I5RA 3CZ8A 4GZJA 2VVSA 5BWFA 4PRWA 4B9YA 3EBVA 3WF0A 4AD3A 1F4AA 3PZIA 1I1XA 4D6GA 4CCDA 1UZ4A 2J4GA 1QI4A 2XFYA 2X8RA 2J62A 2BY2A 2J7FA 1QNSA 1E3XA 2D20A 2E3ZA 4FLOA 3NJ3A 3VVGA 1JZ6A 3BLKA 8A3HA 1V6VA 1CLVA 3F5KA 1OD0A 2XYLA 1CBGA 1H0GA 4HMEA 2YDSA 5EBAA 1EDQA 1XD0A 1CIUA 2E8YA 5BXSA 1GONA 2GK1B 4D6FA 1US3A 1BSIA 1NP2A 1Q6EA 3VGDA 4BQ4A 5A2CA 3J7HA 2V38A 2GJPA 4DWSA 4ML4A 1C7TA 4MB4A 4NI3A 3WSUA 1QVBA 3HMCA 2DIJA 2YA2A 4CD5A 1BYBA 1Q6DA 4R5EA 3WMSA 3WNOA 1UH2A 3MKKA 2IXVA 1BGGA 1UKTA 1FA2A 2DH2A 2WKLA 1JI1A 1CGYA 2F61A 3BAXA 2OLHA 3WD4A 3WDHA 2ZE0A 3G6LA 2GUYA 3K8LA 3N1AA 3OLDA 3UG3A 3AIQA 3ALGA 5A3HA 1CXEA 3WUGA 3BAYA 1D3CA 4BQ5A 3L2MA 3ARPA 3SUUA 4C7DA 1GUVA 2GJXA 3VNZA 1XSKA 3SUWA 1E1FA 5IHRA 4QLLA 1HL9A 3N18A 4MDPA 4UFJA 1GHRA 2J7GA 1VFUA 4AIEA 1ZL1A 2WHJA 4URIA 3W26A 4EKJA 1OGBA 3GBEA 4ZFMA 3CPUA 1PZ3A 3DHPA 4ZE4A 5GQBA 3EMZA 1NWRA 2J79A 3TTQA 3N11A 3N17A 5D9PA 3ZT6A 1U2YA 1V3IA 2WMHA 3PHAA 2VX7A 1MW0A 1V6UA 3AXHA 5D9OA 1UH3A 1QW8A 3AJ7A 1FH9A 3GH4A 1DWGM 4HZ6A 3ARUA 1VIWA 3GH5A 2PF0A 1W91A 1QW9A 2OSWA 1GVYA 1E1EA 3SCSA 5BXPA 4F9JA 2G3NA 2WM0A 3VMNA 3T0DA 1KGWA 4NRRA 4DWSC 3KE0A 3CMGA 3OGSA 2W92A 5E6YA 1UD4A 1E6NA 4OOZA 3ARVA 1DWIM 1TE1A 3ZSTA 2XTKA 4JFUA 1QNOA 2PWGA 1VFOA 3WUEA 3MV01 2OSYA 1JI2A 4JKLA 1ZU8A 3DHUA 1E0XA 2XGBA 4QFUA 5I3DA 1U30A 2ZUVA 2PBOA 4PMDA 3WBAA 5BRQA 1C7SA 1CTNA 4W8LA 1V02A 1WKYA 1E4NA 3RO8A 2G41A 2G3JA 2YDQA 3VDBA 3O9NA 3S2CA 1ISYA 3CZLA 1CENA 4HP5A 4UFIA 1EXPA 5DFAA 2DT3A 3L4UA 4HU8A 3W0KA 1KB3A 3EDFA 5IFTA 2C7FA 4UR9A 1R7AA 1BPLB 4DWSD 5CPTA 2ZX7A 4PSPA 4ATLA 4JIEA 4AY1A 2TAAA 4S3KA 5I78A 1RD6A 3SCUA 1MYRA 1F4HA 3VIIA 4KRTA 2J7DA 4HPGA 4MDOA 5CPSA 2VNCA 4FLQA 2GDVA 2X09A 4P8UA 1JYXA 4U31A 3VNYA 1QNQA 4OBSA 2WYSA 1VAHA 4MNKA 2F2HA 3BMWA 3GYCA 3OA5A 1OGGA 2WWDA 2RGLA 4HA4A 2BFGA 3VGFA 1K9EA 1I1WA 2XWEA 4M24A 2W63A 1V0MA 4WIWA 1JFHA 1TA3B 4GO8A 1JZ3A 4J3SA 1C93A 5CSYA 2QHAA 4NSBA 5CLWA 3M46A 4X9YA 2BVTA 2CEQA 1G0CA 1MW3A 3O6AA 4JL2A 2VR5A 2BHUA 2JFEX 5I77A 2CITA 3CUIA 3OG2A 3T0BA 5KEZA 4H2CA 5BRPA 4AZHA 3WF4A 2BHZA 4AXNA 1FP9A 4UQBA 1GOQA 1US2A 5LA1A 1EH9A 3AHVA 5JH8A 1KBBA 4PMRA 3T2OA 4BF7A 2WMFA 4CCCA 5F7UA 1OT2A 2W67A 1PPIA 3GDBA 4JKKA 2VURA 1ZJAA 2WZHA 3WF1A 1FFRA 3GXMA 3SURA 1OSEA 2EEXA 3K46A 2PBGA 1IV8A 1P6WA 2ZUWA 2VQTA 1E6RA 1UD8A 3MV11 1H1NA 2BHYA 4KMQA 1ODUA 1OIMA 1ISVA 2JF6A 4B15A 3MSDA 4KWUA 2VTFA 3VIJA 2WK2A 1PX3A 1LWJA 4CN4A 4WK9A 4M82A 3AZSA 1GOWA 4FK9A 2J7BA 4OZOA 3PZQA 3VO0A 3EMQA 1VFMA 4BS0A 3T0AA 4D6CA 2W4XA 3CTTA 2PI6A 1KCLA 3AHYA 1TZ7A 3CZKA 1UG6A 4N0RA 4B9ZA 2VI0A 3UG5A 1HKKA 1B1YA 1LL6A 4AD5A 1A3HA 1CPUA 3GXDA 3SCVA 2XVGA 1PIFA 2WMIB 1B3XA 3PTQA 4AZBA 1TG7A 2G4FA 4XUYA 1ZBWA 3PZ9A 1PEZA 3WL0A 2PWEA 3FHQA 4PTMA 2IXUA 3QHOA 4GZEA 1W32A 1QPKA 1BVZA 3W81A 3K4DA 4A3HA 1JIBA 4GXPA 5CSUA 1W9VA 1JZ7A 4YN5A 5A8QA 1BAGA 4EANA 4AIOA 3CLWA 3LPPA 2VRJA 1H5VA 2WW5A 2X05A 3N12A 3MMDA 1QI5A 2DEPA 2OSXA 2E0PA 2YBTA 2G3IA 1JZ8A 3ZJ6A 2DT1A 2BNJA 2PWHA 4XZBA 1BFNA 3SCPA 1NM9A 4AD2A 4PMUA 4UZSA 3TP4A 3MU7A 3TTSA 3ARQA 4AZIA 3N9KA 1FFQA 3UERA 3A6OA 3KZSA 4U5KA 4YPJA 1MFUA 3PZUA 3ARTA 3BAKA 1WZKA 3SCOA 1E6QM 3WMBA 1BLIA 2HVMA 3TTYA 4CD8A 2W62A 2ZXQA 1C3FA 4HTYA 3VD7A 1KBKA 3VD9A 1V02E 4NZCA 1XCXA 2ZUTA 4E8DA 2DT0A 4X0NA 5JIPA 3NSXA 1WNOA 2J25A 4GO9A 5A6KA 3WUFA 4GQRA 3NUKA 2DGAA 5A95A 3GNRA 2VJXA 3DYOA 2CBVA 3SCQA 3AI0A 2WBGA 4CU8A 3WUBA 3WELA 2MANA 2E9MA 2X2YA 1KXHA 4QLKA 5JBDA 1JDAA 3U7BA 1UR4A 1U33A 1HT6A 5FL1A 3AQUA 3VMOA 3ZQ9A 1UD6A 3VX1A 1NOFA 4WLCA 1R87A 2WC4A 1XD1A 1HVXA 4MAZA 2AOSA 1QI2A 5FCZA 1CGWA 1EDGA 4AWEA 1E4MM 2J75A 2WHKA 3IAQA 4C7FA 2W66A 1QHZA 2PWDA 2ZUUA 3K4AA 5CJ5A 4PUEA 3ZMRA 1E6SM 1OBAA 3ZJKA 1WP6A 1J0HA 4B3KA 4KGLA 5AYIA 3WDPP 1UKPA 4AEEA 1ITXA 3VILA 1B3WA 2QF8A 2O9RA 4QP0A 1BYCA 1Q6CA 3AMCA 3CZGA 1EGZA 4RL3A 2EPMX 5E6ZA 1UWIA 3LMYA 4TVDA 2F8QA 1G94A 1ZJBA 4MADA 2XFRA 2XSBA 4DM2A 3POHA 4E4PA 1N82A 1MXDA 3AS0A 4BQ3A 2UY4A 3QHNA 1LL4A 5E9AA 2WHMA 3AIUA 1MQRA 4P7LA 4ZEPA 2QMKA 3EDDA 3IANA 4PN2A 1HIZA 3CUFA 4Q22A 4UFHA 4W86A 4NRSA 4W5ZA 3WL1A 2EQDA 5HNNA 2DH3A 2Y2WA 4OKDA 6CGTA 2JIWA 3VIGA 2J7HA 3EMCA 3WDQA 4WF7A 4J27A 3WENA 1C92A 4JHZA 4TX8A 2Y4SA 2O9TA 3WQWA 4IISA 5HOSA 4AZCB 2WAGA 2BY3A 4UQ9A 3IK2A 1EOKA 4W7VA 1CDGA 1I75A 1UQZA 3SCWA 3TONA 1JXKA 4KH2A 4HMDA 1JNDA 4WKAA 1E4LA 3BAWA 2J47A 2W91A 2FDMA 1VB9A 1UUQA 3VGGA 4CU6A 2VCCA 4AMCA 1DWJM 3GBDA 1AQ0A 1FP8A 3BCFA 3B9DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2CBU A;  2V3F A;  1HL8 A;  3VGE A;  3AZR A;  1H0I A;  1CGT A;  2QV4 A;  2WKG A;  2DSZ A;  3EDK A;  5A8O A;  3RM8 A;  3WF2 A;  1XHG A;  4HZ8 A;  3AIS A;  3RPM A;  2YLL A;  1CGX A;  1CXI A;  4AD4 A;  3WDI A;  2D3L A;  4MJ4 A;  3VDC A;  1EIB A;  4HA1 A;  3WH8 A;  1BVN P;  2G8Z A;  4V2X A;  2E9L A;  3MS8 A;  3HN3 A;  1GJW A;  2ZWY A;  3BSH A;  1QHO A;  3F5L A;  1SMD A;  4F66 A;  2ZX5 A;  3OIH A;  4QDM A;  3VMP A;  1KR1 A;  4H04 A;  3WQ6 A;  2PC8 A;  3NDZ A;  1QBA A;  5EB8 A;  3MUY 1;  1TUX A;  1DWA M;  3AIC A;  1UYQ A;  1HJV A;  5FD0 A;  5FKY A;  1O6I A;  3GXI A;  1H3G A;  1V3J A;  2CXG A;  2DSW A;  1B3Z A;  1MW2 A;  3AS3 A;  1HKM A;  3QOM A;  1SMA A;  3SUV A;  3T09 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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