1WB0A

Specificity and affinity of natural product cyclopentapeptide inhibitor argifin against human chitinase
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE 1
total genus 128
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1wb0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1wb0A01
2QMKA 3W29A 4NZCA 4HA3A 1CTNA 2XM2A 4WKAA 4OKDA 3UESA 1LG2A 3RDKA 7CGTA 5I3DA 3RJYA 2D0HA 1W3LA 1JG9A 2WC7A 1NWTA 1R86A 4ATDA 4EAMA 3TOPA 2VR4A 3ZIZA 5C8BB 1GJUA 2F61A 1LQ0A 4HMEA 3THCA 2WZIA 3UEQA 2UY2A 1SFSA 2ZX8A 4IUGA 2VX6A 1UA7A 5AC4A 3T2OA 2W91A 3VKKA 2BNJA 3WQ5A 1E43A 5FOOA 4LGXA 2BVTA 3UG5A 5BRPA 3MUY1 1E5NA 1F4HA 1CENA 1FHLA 3CUFA 2X0HA 3MUIA 4M81A 5I23A 3VX1A 9CGTA 5A8MA 3AIBA 1HIZA 4MB5A 3CBWA 5E9AA 3KL0A 4AD4A 1GORA 3HMCA 2BXYA 3BAYA 5BROA 4R5EA 1ZU8A 2XIBA 2VX4A 2AAAA 2NT1A 1SMDA 5HPCA 3VIMA 1W2VA 3WF2A 3O2LA 1VFOA 1LWJA 3AZSA 4JFWA 1LWHA 4S3KA 3T2QA 1MW3A 3WFZA 5A6BD 3VIOA 3ARPA 2CESA 4BA0A 1KR1A 5HXMA 4P8VA 2VMFA 3K4AA 1QW8A 1QBBA 4W8AA 3OG2A 4DWSB 4W5ZA 4GI6A 4XZWA 1MQPA 1J12A 2XM1A 3A4AA 4JL1A 5D8WA 4AIOA 2CBJA 2C0HA 5A69A 1GJWA 4UZUA 2Y24A 1NOFA 3HN3A 3F5LA 4KH2A 4Q22A 1E9LA 2PWFA 3AI0A 3JUGA 2PF0A 5IDIA 5CXPA 2XFRA 3N17A 3WDHA 3SCTA 3ARSA 3G6MA 1OM0A 3QHOA 3UG3A 2FHBA 1UA3A 3WUGA 3AS2A 1TUXA 3IJ9A 1E1EA 3O6AA 3WDPP 3AIEA 4GI8A 1NM9A 4HPGA 2WANA 4XV0A 2XGIA 3EDEA 4HZ7A 1V6VA 4BZYA 3PBGA 3UR7A 1HF6A 4AY1A 2WCGA 1GOWA 4YHGA 2J25A 1Q6GA 1JDCA 3T08A 3T0BA 4ZENA 5C71A 1K6AA 2WC3A 2VZUA 3K8MA 2CBVA 3VM5A 4D6JA 3WEOA 4LPCA 2QF8A 1QHOA 3K8LA 2J47A 1KGUA 3ZJKA 4KWUA 3RO8A 1QI3A 2VQUA 1GNXA 3MO4A 1HXJA 4U3AA 4B15A 4DUXA 1C8QA 1HVQA 3N1AA 2WCSA 1JZ6A 2W4XA 4JKLA 2OLHA 1EH9A 1PIFA 2J4GA 2WSKA 1UKTA 3TTSA 1UR9A 2XFYA 1H41A 3CUGA 3NDYA 1LL4A 1DWJM 3KWXA 4KGJA 5E09A 4E8DA 2CYGA 4LQ1A 4W86A 3VGEA 2A3AA 1CBGA 2YOCA 1XH0A 1LL7A 3VIHA 3WKZA 1XD0A 3L4UA 4QLJA 1KWGA 2NT0A 3W25A 1B3YA 3OZPA 2WMJA 1J0HA 1R85A 1PX8A 4ZE4A 4GZJA 1V3IA 3MUZ1 2GFTA 2IXVA 1HKKA 5IXEA 3KE0A 2A3EA 1WPCA 4PMNA 4X0VA 4HPHA 1VEPA 3QOMA 2W67A 3FAXA 2ESCA 4CCCA 4AD3A 1VENA 5C70A 1JAKA 1KGWA 1VJSA 1JFXA 4M82A 1V3JA 1WZKA 4PMXA 4ML4A 4UZSA 3W26A 1QHZA 4W8LA 2WZHA 1JXKA 4M29A 4IISA 3OGSA 3TONA 2X8RA 3MUAA 2OWCA 3IANA 1WP6A 1EOKA 2HISA 2VCAA 2W92A 1HJVA 3A47A 4HU0A 1FH8A 2XVGA 4JKMA 3RCNA 4P8WA 2D20A 1QI0A 2XG9A 5I79A 1XSJA 2ZUWA 1FHDA 2DT3A 1M53A 3WDRA 2B31A 2XGBA 1WZMA 3VOCA 4F79A 5EMYA 4MADA 1E0WA 1H3GA 3KEHA 3BAIA 4H8VA 3AHYA 4WSKA 3PN8A 4AZGA 1Q4NX 2WBGA 2WMIA 2OWWA 1Q6CA 4OIFA 4D1JA 4MPKA 2J75A 3DHUA 1ISXA 2Y8KA 4EE9A 1BYDA 1BTCA 1ISVA 3AIVA 2JALA 3APGA 4H41A 2PB1A 3CLWA 2BY3A 2XTKA 3CHEA 2CIPA 4HZ6A 4W84A 4UR9A 1GVYA 5D9NA 3DECA 4LYQA 3BCDA 3MMDA 1DEDA 3CUHA 5D9MA 3ARXA 1DWAM 4XUYA 5BWFA 2V5DA 1CXKA 4B9YA 1CGVA 1B0IA 3L4YA 3K8KA 3SCVA 3NIYA 2JF7A 3CZJA 1ZBVA 2GJXA 1MVYA 1E0XA 1SMAA 1H0IA 1EXPA 1OIMA 1TMQA 2C8NA 4N0RA 3WL0A 5A8PA 3ZT6A 3ZSSA 1MW0A 3WNKA 2VJXA 3RM8A 1I1WA 4RE3A 3SCRA 2WHJA 1KWKA 1E3XA 1EDGA 2FHFA 1J10A 3QR3A 4FLRA 4GZEA 4MAZA 1R87A 3BMWA 3FN9A 3QHMA 4B9ZA 3W27A 1E5JA 1JYXA 3U5UA 1R8LA 2W61A 3NYDA 1QNRA 1XC6A 2WVVA 2J7EA 1FP8A 1E4NA 5LA1A 2PI6A 4DWSD 3N11A 4H8HA 4GO9A 5A6BA 4J3SA 5GNXA 4LYRA 1KXQA 3M7SA 1X1NA 2Y8VA 3OGVA 1E6SM 1G0CA 5CSUA 3WUBA 1C92A 1BGAA 2WBKA 1NWSA 2EPLX 4UFMA 1JYNA 2WHKA 5BCAA 3VDCA 3WFLA 5HPOA 4NF7A 1A47A 3HU7A 1QHPA 2OYLA 2J7BA 2GDUA 2J7GA 1NOUA 4MB1A 5ABEA 2V3FA 2X0YA 3CO4A 4AMCA 1V02E 1AQHA 4JFTA 3UCQA 5DT5A 2VC9A 3ZR5A 1FFQA 1UKOA 1E72M 4J3UA 3W28A 1CXHA 1GQJA 2J7DA 1EQPA 1HJXA 4AZBA 5KEZA 1V3LA 3BCFA 3BAXA 2WB5A 4AD5A 1MQRA 2BHUA 3BGAA 3NSNA 2YBUA 3AXIA 3L4VA 4AIEA 3T0DA 3E1F1 1UWIA 1PAMA 3SCWA 1JI1A 1VBRA 4PMRA 3VDHA 4TX6A 4BQ3A 3W4RA 2YLAA 5DO8A 1VJZA 3VILA 1BG9A 5A8OA 1TA3A 1H4PA 5EFDA 1GZJA 3L4XA 1QI5A 1ZS2A 4E8CA 1K9FA 1FH7A 4OUEA 2GVYA 1G1YA 1H49A 3PZNA 2E9BA 2D24A 5A6KA 3VGDA 1CXIA 1VEMA 1AVAA 2BHYA 1UD4A 1VIWA 4PSPA 1B90A 4Z2GA 3NCOA 3BXWA 4JCMA 2A3CA 1UD3A 2CHOA 4AISA 2DSWA 1QPKA 1HKJA 3AQUA 4PTXA 1QNSA 3VTRA 5A94A 4CN4A 1QNQA 4AZCB 3ALFA 3OLDA 3WNNA 4L4OA 3CZEA 1KBBA 5E0CA 4J3TA 3VINA 2DH2A 5ABFB 5JBDA 4D1IA 5A2BA 1V6XA 2CPUA 2E8ZA 4AC1X 1ZL1A 2A3HA 3VIFA 4MDOA 4BQ2A 4P7NA 2WNWA 3I3DA 3ZT7A 2J77A 1CYGA 5IFPA 2YL6A 5M03A 2DEPA 1VRXA 4W85A 2CNCA 3F5KA 4UOJA 4MJ2A 3NUKA 5HOSA 3BSGA 3RPMA 2JIEA 1K9DA 5CGTA 2YA2A 2EO7A 3G6LA 4ZE5A 3WDQA 2VOTA 2O9PA 3T0AA 4W7UA 4JHZA 4UFIA 1MFVA 3AISA 2GJPA 3POHA 1LF1A 3WEZA 1G94A 3SUVA 2DSKA 3ZJ6A 1UR2A 1BVNP 2WKLA 3GZAA 1X6LA 1NARA 4WKHA 1E40A 1OD0A 4KRUA 5D9OA 4AD2A 4Q7NA 5EB8A 3AXXA 2XHYA 2XPKA 3AROA 2X09A 3EBVA 4CCEA 1V02A 2UWFA 1LG1A 3WF0A 4BQ4A 4UFLA 5CPQA 5GPRA 4NRSA 3WH7A 5FIPA 5A1AA 1IV8A 3NSXA 1JFHA 1BFNA 2VVSA 3KZSA 1Q6FA 2VURA 3WELA 2O9OA 1B3ZA 4FLQA 2XSAA 3ZJ8A 2WZEA 2ZX5A 3RM4A 2UY4A 7TAAA 1UWRA 1H0GA 4GXPA 1UD8A 3CMJA 2GSJA 1A3HA 2IXUA 3WH5A 1K9TA 3ARZA 1GOMA 3VIPA 3SUTA 4AIUA 4J3VA 5A6JA 4W7VA 4H2CA 5JIPA 2WCAA 4CU8A 2JE8A 2WMHA 3WUFA 3PZOA 1KXVA 2VUYA 1ODZA 1LLOA 3AMLA 3IK2A 3I3EA 3PZQA 1KCKA 5FL0A 1LJYA 4U2YA 2PC8A 3AS3A 1EHNA 4TXEA 1Y7VA 1H2JA 2D1ZA 3BC9A 1UZ1A 1E73M 1V08A 3PZIA 2CBIA 3RJXA 3AIQA 3ZMRA 2BVDA 1WZLA 2PBGA 1V6WA 3VMNA 2J74A 4AZ7A 5A2CA 5BYWA 1IZKA 1XCWA 1B3VA 2DT0A 5TD4A 1XCXA 3AMKA 1UKPA 3CZGA 1C90A 1KR0A 1EHAA 4TTGA 3VD4A 2BY1A 1JD7A 5ABGA 2PWEA 4YPJA 4OBRA 4X9YA 4JHOA 3SCQA 4IPNB 1KQYA 1E6XM 3WDIA 1NWRA 1C7TA 4U5KA 2XSBA 4DWSA 1U33A 5A8QA 1PPIA 4D6CA 8A3HA 2GK1B 4ZEPA 1V6YA 1P6WA 2YL5A 2VO5A 4GKLA 3WH8A 1EA9C 5A6AA 4CKQA 1WDSA 3ECQA 1E4LA 3VO0A 1TR1A 4KRTA 1WCGA 1ZBCA 3S2CA 3MMUA 1KGXA 2X2YA 1UR0A 3GH4A 3K46A 3UETA 4D6GA 2E3ZA 3GM8A 3L4TA 3OLEA 3MANA 1RP8A 2J7FA 1V3HA 4OBSA 3SCUA 2G3MA 4CVUA 3VU2A 1HJQA 4AZIA 4JCLA 1GHSA 2VL4A 1PX3A 2Z1SA 3FY1A 1CZ1A 1HP4A 2ZXAA 1RPKA 4MNKA 1CLVA 3IJ7A 5AY7A 5LYRA 2WYSA 3ZR6A 2V38A 2ZXQA 4PTVA 1EGZA 4C7GA 2BVYA 1HL8A 3MMWA 1W1YA 4PMDA 3WQ4A 4QCEA 5CPTA 1JNEA 3VUPA 2DIJA 2VZOA 1XV8A 4J3WA 2D23A 1W91A 3N15A 4M24A 5BXTA 2WMFA 2TAAA 3GNRA 3U57A 1G9HA 1OD8A 3AIRA 1HNYA 5BXSA 2A3BA 5I77A 4AZ5A 1UH2A 2J79A 4TVCA 1L0PA 3WIJA 3AYRA 3VNZA 4PUEA 4WSJA 2XVPA 3B9EA 3CZKA 4B3KA 4HOZA 2ZUTA 2VQTA 3DHPA 1HT6A 2D3LA 5IHSA 4GPNA 4PYSA 2EBNA 1B9ZA 2AMGA 2PWHA 3LMYA 3THDA 1BQCA 2O9RA 1FOBA 5CPSA 3F4VA 3ARWA 1GCYA 4F9DA 3SCOA 3WMCA 3M07A 1GQIA 1M03A 1B31A 3U7BA 2W63A 3CGTA 3CZ8A 1OCQA 3VMPA 3CZLA 4JIEA 1GW1A 2WWDA 3WD4A 1PBGA 4PCTA 2CKSA 1B30A 1AQ0A 5GQBA 1MXGA 4ACZB 3GYCA 2ZOXA 2EPMX 3W24A 2WVTA 4UOZA 4IM4A 2G3IA 2VT0A 1UUQA 2G3JA 4EK7A 3II1A 3I3BA 2DT2A 4L4PA 1PEZA 1XHGA 5A3HA 3BLPX 2YA0A 3AHXA 4URIA 4D71A 3ARVA 1XYFA 2FGZA 2ZUSA 3GDBA 4WJXA 1RP9A 3L4WA 2YLLA 1J01A 2OYMA 1CDGA 3OB8A 5JUVA 1EIBA 1MWOA 4ZXOA 3GBDA 1FH9A 1CEOA 2VNCA 4DM1A 2FDMA 4HMDA 3GXIA 2ZUMA 3L2MA 3QGVA 3BAJA 1CGUA 4W93A 2YDRA 3RILA 3BSHA 3WD0A 3MS8A 2J8GA 2EPNA 4PMOA 1KQZA 1CGWA 5ABHA 3SCNA 4UOQA 1V3KA 3WUEA 1S46A 4CUCA 4UCFA 3ZO9A 1R7OA 2XWEA 1VFUA 2XFFA 2VCCA 2JFEX 2J78A 2CCRA 2JIWA 5EFFA 4PMYA 1HJSA 2QLYA 3CMGA 1QOXA 3PZMA 3EDFA 2BHZA 1E3ZA 2E9MA 1HKMA 3WQVA 4ATLA 2D0GA 3OLGA 3WNPA 1CNVA 1GOKA 4UFKA 3AMCA 4AD1A 5CQ1A 3PZVA 3OIHA 5JIWA 1O7AA 2EPKX 3N04A 1UD6A 1UD2A 3LPPA 2WAGA 3WBEA 4D6HA 2D22A 4U33A 3MSGA 4WKFA 4M56A 1GPFA 4U2ZA 3VIIA 2BY0A 2X1IA 1E6NA 4WIWA 1R7AA 3WD1A 1GOIA 1UH3A 3U7VA 1JZ4A 4BS0A 1H5VA 3ZSTA 5E6ZA 1U30A 3VDBA 4FLOA 4DUVA 3VX0A 3W0KA 2E0PA 1HJUA 5A6LA 3ZM8A 4OOZA 1G01A 1VFMA 3EDDA 1DWHM 1CGTA 3ARQA 1XD1A 3QHNA 3GXFA 4HA1A 1UYQA 4JFUA 1DTUA 3RIKA 1CGYA 5D8ZA 2IUZA 1E6PA 1BAGA 3DC0A 2VI0A 1C91A 4AZHA 5A6MA 2PWGA 1JF5A 2WM0A 3WDJA 3TP4A 2VZVA 1UWSA 1BSIA 6TAAA 1C3FA 4K68A 3UG4A 4HOXA 1JZ2A 4FLSA 3TTOA 3U5YA 1C7SA 2VZSA 3WQWA 1BYAA 2CITA 2MANA 2VX7A 1W9DM 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2WC4 A;  4F9J A;  1UHV A;  4CD7 A;  4QDM A;  3N18 A;  4PMQ A;  1JI2 A;  3MV0 1;  1KCL A;  4DWS C;  3A3H A;  2E8Y A;  3CH9 A;  5CLW A;  4PTM A;  4FMV A;  1UWT A;  1TZ7 A;  1BVZ A;  4QLL A;  4AWE A;  2DSZ A;  1J0I A;  1AQM A;  3L4Z A;  1LL6 A;  4AZC A;  1TVP A;  3VM7 A;  5EBA A;  4H04 A;  5GNY A;  5LA0 A;  4HMC A;  2WVS A;  4A3H A;  4A3Y A;  1E6Q M;  2ZWZ A;  4GZI A;  1UH4 A;  3K1D A;  3TTQ A;  5M3W A;  2ZX6 A;  1UOK A;  2Y2W A;  4AXN A;  4DUW A;  4AEF A;  1CXF A;  1W9V A;  4QP0 A;  5I5R A;  2ZUU A;  3VD3 A;  4UFH A;  1JGI A;  4PSR A;  3CTT A;  4PEE A;  3VD5 A;  1JL8 A;  3AOF A;  1JD9 A;  2VTF A;  2WXD M;  4HP5 A;  2CXG A;  1EO5 A;  4MJ4 A;  5CG0 A;  3AYS A;  2YKK A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CD5 A;  2Y5J A;  1FFR A;  2Z7K A;  1U2Y A;  4RX0 A;  3VC5 A;  5CGM A;  4PMV A;  4P7L A;  4PRW A;  1JCH B;  1TE6 A;  2C18 A;  3V7P A;  4I5X A;  1SFL A;  2BZN A;  1US3 A;  3LS9 A;  3VGH A;  1B4E A;  4NIR A;  1IF2 A;  4Q8M A;  4O1E A;  3TE9 A;  4JNM A;  4GXM A;  4D72 A;  2WLZ A;  4E2O A;  2V3E A;  3T9P A;  2L5H A;  2J7C A;  1XQK A;  2PDK A;  4RE2 A;  3T44 A;  3SUW A;  2OYK A;  5F2L A;  3GTN A;  1TA3 B;  3PZ9 A;  5HMD A;  5E93 A;  1E4M M;  2CWN A;  3UGR A;  4M7T A;  4Y8F A;  4QCF A;  1NH6 A;  2R8W A;  1IEW A;  1V03 A;  2RGM A;  3VNY A;  5FSD C;  4QG9 A;  3W71 A;  5D2Y A;  4QIB A;  3CWN A;  3CT7 A;  4NX0 A;  1CW2 A;  2GWN A;  3FIG A;  2QEZ A;  4E3T A;  1G7V A;  3D46 A;  5HWJ A;  2TSY A;  2ZX9 A;  1FKJ A;  4BCE A;  1VS1 A;  1UZ4 A;  5HJL A;  2ACS A;  2FFI A;  3VGB A;  1FKL A;  2LGO A;  2OKO A;  3FYY A;  4J7R A;  4HYW A;  4GAC A;  3AAL A;  2OPJ A;  1XIB A;  2WC4 A;  2WNN A;  4XVD A;  4E4F A;  2QCG A;  3IWP A;  4PMQ A;  3MV0 1;  3A3H A;  4FMV A;  1DE6 A;  1UWT A;  2H3D A;  1BVZ A;  1F9C A;  3KAD A;  3URN A;  3QYS A;  3A24 A;  5EBA A;  3LUT A;  5GNY A;  5HW8 A;  4HMC A;  3STP A;  1ONX A;  3BVJ A;  4GGQ A;  4A3Y A;  1E6Q M;  2P3E A;  2ZWZ A;  1TV4 A;  3QC3 A;  4DZI A;  1UPP A;  5C6M A;  1JCY A;  2OO6 A;  4AXN A;  4ZO6 A;  4DUW A;  1OFE A;  1CXF A;  2XDF A;  3PPC A;  4ZQO A;  3BW2 A;  4B2D D;  2GYI A;  3VD5 A;  3MWC A;  1JD9 A;  2VTF A;  3AYS A;  2YKK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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