4WKFA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (2.5mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitotriosidase-1
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 368
sequence length 368
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkfA01
2J8GA 1VF8A 3QOKA 1BYDA 2VRJA 3AYSA 2X8RA 4U5IA 3K46A 3M07A 2GUYA 3FY1A 2J7CA 1HKJA 3VIOA 4PSRA 3LMYA 2WC7A 4KRUA 3T09A 3AMDA 4D1JA 1B3ZA 2CXGA 3KL3A 3A4AA 2J7HA 3AFBA 1W2PA 2BY0A 3PTQA 5E0FA 3VVGA 3VO0A 1G1YA 1QNQA 3CO4A 3LPGA 1PBGA 3VM7A 2OSWA 3UCQA 2ZUWA 1BFNA 3UERA 4ZE4A 1HKMA 1KWKA 4J3TA 4QDMA 2YL8A 1G9HA 1JZ2A 3GXDA 5CLWA 1NOWA 1E6PA 3GBEA 1WNOA 5HXMA 3GNRA 4KWUA 3TP4A 4JKMA 2X05A 4JHZA 1KXQA 4HMEA 1ITXA 3K8KA 3AIQA 3SCQA 3BXWA 3AXXA 5DO8A 1G01A 2ZE0A 4E8CA 3VIPA 3L4TA 1UWSA 4WKHA 1DTUA 4W88A 3LPOA 3AXIA 3VNYA 1R7OA 1GUVA 3MANA 2G4FA 4H7VA 2BV9A 2D2OA 1C8YA 1E4MM 2NSXA 1W1PA 4PMOA 4S3JA 2RGMA 5AY7A 4Q7NA 1UZ1A 4F79A 3M6DA 3NYDA 1M53A 1FP8A 3ZT6A 4CD7A 3I3DA 1KWGA 3AZRA 5I3DA 2VR4A 1SFSA 3CMJA 3AIRA 1M7XA 4XB3A 1LF1A 3MS8A 5DEZA 4LXFA 3VDHA 3WY1A 5TD4A 4H8VA 3PZOA 1W9DM 2JFEX 1FH8A 1UKQA 1UWRA 4J28A 2WMFA 3AHZA 3ZJ6A 3BH4A 3WN6A 1Q6GA 1VFOA 2D3LA 2O9PA 4L4PA 4AWEA 5JBEA 4M1RA 1E6XM 1OINA 4YHGA 2QMKA 1C7SA 4UOJA 3ZJ8A 1E6NA 1JF5A 1HJQA 3TTOA 3WDPP 3ARWA 1NOUA 3CIVA 1TVNA 3K8MA 3ARYA 2WBGA 1PIGA 5EMYA 3T0BA 3MO4A 3MMWA 3KEHA 1JDAA 2GVYA 1AVAA 2WKGA 1CNVA 2C0HA 2CBIA 1B1YA 4AEEA 3VM5A 1GONA 1VBRA 4JCLA 5JH8A 2D1ZA 2WVSA 5I77A 4ATWA 2ZXBA 4AZCB 1KCKA 2A3AA 1B3YA 1EDGA 4OUEA 2CHNA 1FFRA 5CXPA 2WC4A 3RILA 1K9FA 1O7AA 2O9TA 2GK1B 1HL8A 2GFTA 3EDDA 2J4GA 5EFFA 4AZ5A 1VIWA 2JE8A 4R27A 1OSEA 1GVIA 1QBBA 4ZXLA 1EHNA 3WQ5A 3QHOA 2CKSA 4W7WA 5E09A 2D22A 2Y4SA 4B3LA 4DM2A 3GH4A 3SUWA 3VX0A 2QF8A 2XSAA 4PMVA 2YLAA 4W7UA 1WDQA 1SMAA 1B31A 2W62A 4D72A 1L0PA 1G5AA 2CYGA 4GQRA 2E4TA 3DHPA 5ECUA 2Y8KA 1H4PA 3WDQA 4A3YA 1HVQA 1J10A 4UFLA 3OA5A 1JYVA 2Y24A 2CITA 3RJYA 1B3XA 2YA0A 2VZSA 4D6GA 1ECEA 4DWSA 3NIYA 5ABFB 2BFGA 4IISA 5I2UA 3APGA 2BVDA 5CGMA 1E3XA 1EQCA 1LG1A 1BF2A 1VEPA 4UFMA 1E56A 1J0ZA 2PWHA 1ZJBA 5AC5A 1HJWA 4MNLA 1ESWA 2CPUA 1DWGM 4QCFA 5D9MA 3QR3A 1V02E 3GXFA 3VIJA 1I75A 1OIMA 3N11A 1XSIA 3QGVA 2X2YA 3ZSTA 1VEMA 1VB9A 3WBEA 1UOKA 1MQRA 5C8BB 1O6IA 2WMIA 1HJXA 3HJEA 4UFHA 3PZGA 2WMGA 4QLJA 1HF6A 3VMOA 1XHGA 3T0AA 1V3LA 4AMCA 4D6HA 4IPNB 4Z2IA 7CGTA 4W8AA 4CCEA 3VGBA 3VPLA 2DT3A 3M7SA 1PJ9A 2ZICA 2AMGA 2J7FA 3RMEA 2WWDA 4KGLA 1AQ0A 4AXNA 1HJVA 2D3NA 2TAAA 4BS0A 2VCBA 3VGDA 4ZEPA 4UQ9A 1JAKA 1OT2A 3U5YA 3AISA 1JI1A 2ZX5A 3UESA 1J0KA 2ZX7A 3WH7A 1RH9A 4UCFA 1G0CA 4C7GA 2V3FA 1X1NA 1EOMA 4P8WA 3AHVA 3WMSA 1W3JA 4HPHA 4UQEA 4X9YA 2DT1A 4ZE5A 4P7LA 4M8UA 7TAAA 5A2BA 2VUYA 1LWJA 4OBRA 4CCCA 2DSVA 5ABGA 4JKKA 2XTKA 5I5RA 1CZ1A 1SMDA 1R8LA 2XWEA 2BHZA 1OBAA 1NP0A 4HA4A 2ZXDA 1BTCA 1UR1A 1H3GA 2XVLA 1CGTA 3NUKA 3RO8A 3VDAA 5IHSA 2IXUA 1K9DA 4URIA 1UYQA 2QHAA 1JAEA 5A6BA 4BQ3A 5A6AA 2FH8A 2VT0A 4HPGA 2E9BA 3L4WA 1KXHA 2E8YA 2OSXA 4FK9A 3BAWA 1QNSA 2J78A 3VUPA 2UWFA 3ARSA 4W5UA 1UA3A 1OWQA 5JIWA 1V0MA 5DT5A 2WB5A 3VIFA 5JBDA 4HOXA 3WNLA 4NI3A 3ZIZA 1UA7A 2CETA 2YL6A 4PTVA 4Z2GA 3CBWA 3WFLA 1WO2A 1CGXA 2EO7A 2WVVB 3D3AA 4MB5A 1E6QM 1KBBA 5CSYA 2ESCA 1PAMA 2QPUA 5A8NA 3SCVA 2GK1A 5KZ6A 4H41A 1H11A 4AD1A 2WHMA 4ZFMA 3POHA 5D9NA 3VINA 2G3NA 1WDSA 2ZUTA 2UY4A 2OSYA 2V5DA 2YOCA 4AYSA 3AS3A 4RE3A 2J77A 1CLVA 3MSDA 1H41A 4PCTA 3VGEA 1XC6A 2WCAA 1KQYA 3OZPA 2WZIA 5IDIA 4AZHA 4FMVA 2WK2A 3WUFA 5A2CA 6CGTA 4W5ZA 3ARVA 3OZOA 4GI8A 1QI2A 2C7FA 5HPOA 3WMCA 2FH6A 1JFXA 3SCRA 4UOQA 1V3JA 1E9LA 2GJRA 2O9RA 3AQUA 2ZUSA 2CCRA 2G3IA 1UD6A 4ATLA 3N12A 1E71M 2DSZA 3MV11 3BGAA 2RGLA 4GZEA 2J7EA 3THDA 3W25A 2W5FA 5A8OA 1A47A 5A6SA 3VD3A 1KR1A 5E9AA 1QNOA 1CGWA 1VRXA 1WP6A 3FNDA 1E4NA 3IAPA 4MDOA 1KCLA 3SCPA 1BGGA 5I23A 4AZ7A 3ZJ7A 1W91A 2A3CA 4D6DA 1EQPA 1E5NA 2ZUUA 3UG3A 3U7VA 2J7BA 2OYLA 4Z2LA 2WC3A 2YJQA 1J11A 4CU8A 3ARRA 4TOQA 2PWGA 1H1NA 3ZR5A 1J12A 1NH6A 3WNMA 4LPCA 2UY3A 1XYZA 1BAGA 1DEDA 4Y7EA 2WYSA 4S3KA 1WKYA 5CLTA 3WUGA 1E4LA 1LLOA 1QW8A 1EO7A 3FHQA 1PEZA 1CXFA 3N04A 2F8QA 4NF7A 2EPOA 3S2CA 4H04A 2UY5A 3U57A 2WBKA 2ZUNA 1W9PA 3N17A 3WDRA 4TTGA 4RE4A 5BRPA 4GZIA 3WH5A 4GIAA 3W4RA 2W91A 2EXOA 2XPKA 4EAMA 1MQQA 3WD2A 3SEPA 5AYIA 1BYAA 3S6TA 1UKTA 1C7TA 3SUUA 1VFFA 4Z2KA 5ABHA 3WKZA 1H0GA 2XUCA 3PZVA 3GNPA 1JZ8A 1R87A 5LA2A 1K9TA 4PTMA 2XFYA 3BSGA 3ZSSA 5D9OA 4TUFA 1G94A 4PSPA 2PWFA 3ARQA 2VZOA 4CD5A 4HZ8A 5D8ZA 1UWIA 5D4YA 1X6NA 1C90A 2ZIDA 4J3XA 3AIVA 1JG9A 5A95A 3VDBA 4RL3A 2WMIB 5A6KA 1E15A 4HP5A 2W67A 1H49A 5CG0A 2YA1A 5CPTA 2BS9A 4JL2A 1GPFA 3UG4A 3EDFA 5A6LA 3ZO9A 2ZWYA 1E6RA 2YBTA 4M80A 4AD2A 4D71A 4HZ6A 2DH3A 1JZ6A 1LQ0A 1JNEA 4V27A 3PZMA 2CBVA 1JZ4A 1OCQA 2J62A 1TUXA 2W4XA 3WL0A 1BPLB 1LJYA 1MQPA 1HNYA 3GZAA 2VZUA 2WMJA 3OBAA 5I24A 1UD5A 3SCSA 1ZBVA 3B9EA 1LWHA 3TTYA 1V0KA 1U2YA 3SUTA 2J7DA 3PTMA 1GHRA 3VIGA 4AIEA 1CGYA 1JFHA 1NWSA 2E0PA 2WVVA 1J9YA 3AHYA 3ARPA 8A3HA 4UNIA 3N1AA 3W0KA 5EFDA 3EMCA 3WMBA 1OD8A 1QW9A 4CD8A 2DSKA 2WCGA 5JBFA 3W26A 1MXDA 4PUEA 4XX6A 3GTNA 1QI5A 2XGIA 1US3A 3AOFA 2YIHA 4P7OA 1CYGA 1Q6EA 5A69A 1UWUA 5ABEA 4PTWA 1FHDA 3WQ8A 2W63A 1IZKA 5HBFA 1LL6A 3CHCA 3AHXA 2DDXA 5JUVA 4XZBA 4A4AA 3VGFA 1WB0A 1NARA 3GH7A 3EYPA 1TA3A 3GXMA 4OZOA 3UG5A 2VL4A 3WNPA 2WKLA 1CWYA 5D9PA 2G3MA 2XVPA 1UD3A 2W66A 1UKSA 4GINA 3ARXA 4WLCA 2VVSA 2W61A 1I1WA 4U3AA 3WF1A 1IZJA 3OLEA 3MU7A 2Z1KA 3WNOA 2DGAA 4KH2A 3WEOA 3QHMA 4HA1A 1XH1A 1TR1A 1OGBA 4JZ5A 3RPMA 1E0VA 1X6LA 1JYWA 3PZUA 1R86A 2OLHA 1W32A 3AHTA 3F5JA 3BAYA 5E0CA 4L4OA 3L4YA 4GPNA 3KL0A 5A94A 3EDJA 1ODZA 3A4WA 3GH5A 2A3HA 2VURA 3CMGA 1PZ2A 1HIZA 2XHYA 3OG2A 4HMCA 4AW7A 2W92A 2VR5A 1KXVA 2XIIA 4JFUA 3POCA 4V28A 3WENA 1HJSA 1E0WA 1IT0A 3JUGA 3ALGA 1YHTA 1DWJM 5E70A 4M24A 4MAVA 1GZJA 2E8ZA 3ARUA 3WDIA 1DWIM 4EANA 4PMNA 3WEMA 2PBGA 2BXZA 3GYCA 2PF0A 1CIUA 2HISA 1UD4A 3AJ7A 4HTYA 5DFAA 1QNRA 3MMUA 4Q22A 4PEEA 4QFUA 1J0HA 1HVXA 3B9AA 1VENA 5A8QA 3CZ8A 1QBAA 1ZB5A 2J47A 4C7DA 4KRTA 5CGTA 1F4HA 1V6UA 4GZJA 4NRRA 1WPCA 2BVYA 2GJPA 3ZOAA 2WPGA 4TVDA 5A3HA 1W9UA 3BAJA 3MUIA 4PBGA 2XGBA 3FXYA 3K8LA 2E9MA 8CGTA 3VNZA 5CJ5A 4W8BA 1A3HA 3OLDA 1OT1A 2BHYA 1CXHA 3F5LA 2VJXA 1CDGA 1GORA 3T2OA 5CQ1A 3VKKA 3HU7A 1JDCA 1ISXA 3RM8A 4OOZA 1XGZA 3VIKA 4IPLA 1Q6DA 2WVTA 1KB3A 3FHAA 2XM2A 1LL7A 1FP9A 4U5KA 2VX4A 1XSJA 3T0DA 1GQLA 3A47A 5JIPA 1WZMA 1CEOA 4GO9A 4UOZA 5CPSA 1UZ4A 1UR8A 1DWAM 1HKIA 3DHUA 5FKYA 5BRQA 4WKFA 3T2PA 4AZ6A 3PZQA 1JZ5A 2VCAA 9CGTA 3MUY1 4ACZB 4TTUA 2HVMA 1U30A 4GXPA 1M03A 3WD1A 4YHEA 1E70M 6A3HA 2G41A 1JL8A 1KR0A 4D6IA 5DMYA 3PN8A 3EDEA 1DHKA 1OGSA 4WSJA 3T08A 2MANA 4AEFA 3OIHA 2VTFA 1CGVA 1CXKA 1V6VA 4CD6A 1RD6A 3CHEA 1W2VA 1WZAA 4P8VA 1VJSA 2DIJA 6TAAA 4C7FA 1FHLA 5GNYA 4JFSA 4PMZA 1B3WA 3VDCA 3F5KA 5M3WA 3M46A 3ZJKA 3KL5A 3VMPA 3SCTA 4CCDA 4MJ2A 3CUJA 4CU6A 1ZBWA 5CZKA 1UKPA 1UH2A 3RM9A 1PIFA 3RJXA 1NWTA 1KBKA 3U7BA 1UR0A 3BCDA 4TXEA 2WWCA 1V3IA 2GJXB 4UFJA 4LYPA 2CIPA 3K1DA 1PZ3A 3L4VA 1Q6FA 4BZYA 3RM4A 1KQZA 4JCMA 4NZCA 2JF7A 3VOCA 2V38A 5LA1A 2ZXAA 2GDVA 1GJUA 3W81A 1QPKA 1E73M 3CGTA 3PTKA 4W84A 3NSNA 1ZL1A 4CGTA 1BGAA 2VI0A 1HJUA 3AS0A 4OOUA 4W86A 5I0DA 4WK9A 4P7RA 1H0IA 2VX7A 1KFWA 4H8UA 1LG2A 1K9EA 2BVTA 3LPPA 3K4AA 4PMQA 3SCUA 3IAQA 3TTQA 3CH9A 2Q8XA 4UTFA 4DWSD 2BNJA 3UEQA 2NT1A 4BQ2A 3W82A 1WE5A 1I1XA 3W37A 1C91A 1L8NA 1ZJAA 3SIMA 2WMKA 4D6CA 2DPEA 2J25A 1HXJA 2Y5EA 2FGLA 4DM1A 4WJXA 4W85A 4EE9A 3W24A 2JALA 1KGXA 4BQ4A 1JD7A 1GHSA 1UR9A 1M04A 3IJ9A 4AD5A 4ZENA 4AZIA 3CZLA 4Z2HA 4A3HA 1EDQA 4PMYA 3TA9A 2WNWA 1OGGA 4B16A 3CZKA 4UZUA 1UG6A 3EMQA 1XD1A 4FLOA 2FDMA 2CHOA 2WHLA 1TFVA 1UR4A 4MDPA 1HN1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3W2L A;  3PZV A;  3GR8 A;  1JZ8 A;  3L0N A;  4Q6X A;  4MGV A;  2P5N A;  3QQ1 A;  4RDZ A;  3OU8 A;  2PDG A;  1WV2 A;  1G94 A;  2HNH A;  1JGM A;  2VZO A;  1KRM A;  4GGB A;  1M7O A;  1UWI A;  3W84 A;  3AIV A;  3SN1 A;  3BQ5 A;  2EG6 A;  4X61 A;  3PR9 A;  3VDB A;  3M5Y A;  5A6K A;  4LVA A;  3NXF A;  1JEZ A;  2YA1 A;  4MG4 A;  2RUC A;  3UQI A;  1UR3 M;  2C1H A;  5DCD A;  4IPP A;  1FCU A;  5DXY A;  4W9O A;  3HQO A;  3TJ4 A;  1E6R A;  1ZZM A;  3W01 A;  4AD2 A;  5G1Y A;  3EIP A;  1JNE A;  1XIN A;  2YZR A;  1VC4 A;  1LJY A;  1HNY A;  3Q67 A;  1UD5 A;  1QU4 A;  3SIZ A;  5EA9 A;  1HXV A;  3FEQ A;  3P2V A;  3ELF A;  3B9E A;  1LWH A;  3ZLH A;  5HWM A;  5DN1 A;  1CGY A;  1JFH A;  2E0P A;  2O0T A;  1J9Y A;  3DI0 A;  4DNH A;  2FTY A;  5EMK A;  3EMC A;  3C5Q A;  3S2N A;  2WCG A;  1XGD A;  4PUE A;  4AG0 A;  1QI5 A;  2IQD A;  2XGI A;  3AOF A;  4P7O A;  1CYG A;  5CKS A;  4ZTX A;  3EWZ A;  4DBS A;  5BMX A;  4KPL A;  3PNU A;  4PTW A;  2OOD A;  4AVN A;  3UF8 A;  2F9R A;  1URO A;  1IZK A;  3M0X A;  3SM0 A;  4AMA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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