4DWSC

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
539
structure length
526
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGKGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGEIYLKSISEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
total genus 184
structure length 526
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsC01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsC02
4PTVA 2UY4A 2XVPA 3VD7A 2VZUA 5FL0A 2FH6A 4KRTA 4W85A 1RP9A 5IHRA 2WBGA 3HMCA 1H2JA 4EAMA 2EEXA 2X8RA 1OIMA 3L4XA 3ARYA 4JAWA 1NARA 3T2PA 5JUVA 4AW7A 4WIWA 3OIHA 4J27A 1G9HA 4K68A 1MQPA 2X0YA 1JXKA 3K46A 4URIA 2VJXA 5BRPA 1E6QM 5M17A 3THCA 1JFHA 3VGEA 4AYSA 3NSNA 1CGYA 1JDDA 1V0KA 1S46A 1OINA 1VIWA 2F2HA 1JI1A 3W0KA 5DEZA 1KGXA 2JF7A 4JHOA 2J79A 2ZX5A 1D2KA 4AEEA 1KB3A 3EMZA 1LQ0A 4HOWA 2PI6A 4LXFA 1PIGA 1Q6DA 4PBGA 4EANA 4S3KA 2D0HA 3QHOA 3WQVA 5A69A 8CGTA 3N04A 1KGUA 5C71A 1BYBA 1V6XA 2XPKA 3K1DA 4BA0A 1I75A 1JDAA 4RE3A 5BCAA 1MQQA 1PBGA 3VGFA 3CZ8A 2WMIB 3GXMA 4BCEA 1V6UA 3EDKA 1WO2A 3N9KA 1OT1A 1E43A 3KEHA 5GQBA 1NH6A 2WM0A 1JAEA 2DSZA 1IV8A 5D9OA 4U2YA 1TMQA 3CUHA 4ZXLA 4WK9A 2EO7A 2J7HA 1ZU8A 1V02E 4UQAA 3WUBA 3T0AA 4AD5A 4ACZA 1BVNP 1VF8A 1FFQA 1DHKA 3CH9A 4LYPA 3OLIA 2DIEA 5D9NA 4MB5A 2E0PA 3WNLA 5JIPA 2WSPA 4P8XA 2VCBA 1BTCA 2J77A 4F79A 3WQ6A 2YBUA 3IJ9A 3DHPA 4PTXA 4D71A 3CZKA 2XTKA 4JFWA 4QCFA 3RJXA 5M03A 4PCTA 4H8UA 2DPEA 1JYNA 1TA3B 2Q8XA 3N17A 4X0NA 4B9ZA 1BF2A 4J3SA 5HPCA 4UNIA 3WD1A 1J9YA 4PSRA 3ZJ6A 2GSJA 2DQXA 3WDHA 1AMYA 3PZVA 2VX7A 2WLYA 4ZE4A 4UFIA 2OSYA 1ISYA 4D6JA 5D9PA 1WCGA 8A3HA 4MNMA 1B0IA 5E0FA 1KCKA 3GH7A 5AYBA 2DEPA 2WSKA 4AMCA 3NCOA 2EQDA 1JZ6A 3VX0A 3CMJA 1W1PA 3L4VA 5ABFB 2G4FA 1U33A 3TP4A 4TVDA 4DWSB 3AIVA 1B30A 4RE4A 1UR8A 1TR1A 2Y5EA 1E4MM 4P7RA 3IJ7A 4KMQA 2O9RA 1DWHM 1MW0A 4PMDA 3W26A 1C7SA 2J8FA 5A6BA 4KRUA 3ARZA 1LF1A 1E0VA 2PWHA 1V6WA 3RCNA 1CWYA 3RM9A 5DF0A 2VRQA 4TTGA 2ZXAA 4W89A 1MW1A 5BXRA 2VVSA 1J0ZA 3VIIA 1OD0A 2CNCA 4J3TA 1VENA 3SCPA 1V08A 2QMKA 4UFHA 2WZHA 1UYQA 2W91A 1GW1A 3TTOA 2XFYA 2J7BA 3GZAA 1NP0A 4MB3A 4WKAA 3AHYA 3ZO9A 3OLEA 3EDFA 3VMPA 3NYDA 1ZBVA 1XV8A 2Y2WA 1V3KA 1MQRA 2XVNA 3POHA 1WDRA 4M29A 1PAMA 1BGAA 1VFUA 4Q22A 1W9DM 4OUEA 3ARQA 5FCZA 4B3KA 4HA4A 3ARRA 1IT0A 1E5NA 2BFGA 5AC4A 3RO8A 1BG9A 4WF7A 3B9EA 3AI0A 1W9BM 2BHUA 1LG1A 3K4AA 4LYRA 4UOZA 1KFWA 2FGZA 2WCSA 1UD6A 1HN1A 2DSWA 4QP0A 1CXFA 2VX4A 3SUSA 1KWGA 4PMRA 1HJQA 2IUZA 1EIBA 3ZQ9A 2Z1SA 1ISZA 2QPSA 2PB1A 1UWQA 5IDIA 3BAYA 5KEZA 2YDRA 3RIKA 2YA0A 5A2BA 2VNCA 1WKYA 5E9AA 3SCUA 2VX6A 4PRWA 5CLTA 2YJQA 2ZOXA 3D5HA 3VDHA 1HP5A 1V0LA 5CJ5A 3AS2A 4R5EA 3NJ3A 3SUUA 1BG4A 2AAAA 1GUVA 5EFDA 2VUYA 3F5JA 4OKDA 2BV9A 1I1WA 3ZJ8A 1XHGA 1GOIA 1JFXA 2DT3A 2WC7A 2DDXA 2W67A 1ECEA 4OOUA 3O2LA 3RMEA 4XB3A 1TFVA 2E3ZA 2V38A 3PZOA 3ZSTA 1L0PA 1BQCA 2EPKX 2Y4SA 4ZE5A 4CD4A 5FL1A 1FA2A 4CD7A 4CGTA 4PMYA 4ACYA 4NF7A 4IUGA 2QLYA 4WSJA 2W62A 2UY2A 3E1F1 4CVUA 4UQEA 7A3HA 3U5YA 1CENA 1KBBA 4P8VA 1HF6A 4ZXOA 1L8NA 4PMNA 4PSPA 2D3NA 3AS3A 3W53A 3MUAA 4KWUA 1EXPA 1FFRA 3RM8A 1KGWA 1UKOA 1AQ0A 3WDQA 5FKYA 1TCMA 1ZBWA 3CHCA 3VU2A 1U30A 1QW9A 2OWWA 2BHYA 4PMOA 3AZSA 4EK7A 4RE2A 5A8PA 3WIJA 2Y8KA 4PMZA 2FHBA 2XHYA 1K6AA 3A47A 3CTTA 1HX0A 4PCSA 4B15A 1C92A 2W5FA 4LYQA 1K9EA 1JZ2A 1V0NA 2BNJA 2VOTA 2VCCA 1WZKA 2XUCA 3PZ9A 5KZ6A 3LPOA 3EDJA 3GNOA 1WDPA 2YL6A 1UKTA 3WQ4A 1B3ZA 1C8YA 4OOZA 5AYIA 2DT2A 1E1EA 2OSWA 3MO4A 2VURA 1E6RA 3BMVA 3QOMA 3VOCA 2BY1A 3WQWA 4QDMA 3G6LA 2XFRA 1GORA 3AROA 4JCLA 1V02A 3W37A 4LQ1A 1XSJA 3CZGA 3T0BA 4E4PA 2QMJA 3WDIA 2CBUA 4TVUA 2YLAA 1JNEA 3W25A 3UESA 3OB8A 1QOXA 2C7FA 2CETA 4UFMA 2A3CA 4ACZB 4N42A 4UQBA 5DFAA 1QI3A 1BYAA 1GQKA 2J47A 5M3WA 3GXFA 3UETA 2A3EA 1C8XA 2WHKA 3WNNA 1U2YA 3GTNA 6CGTA 3HU7A 4PMVA 3NSMA 2TAAA 1HVXA 1KXVA 4CD8A 2OYMA 4QLLA 4AEFA 1O6IA 1CEOA 5F7UA 4HMEA 2X2YA 1MYRA 4IM4A 1YQ2A 1J0YA 3MUIA 2XM2A 1QW8A 1W9PA 2VC9A 5A6BD 1VJSA 2BHZA 3QOKA 1C91A 2CEQA 4F8XA 1E4IA 5C8BB 2VZTA 1JNDA 3W24A 1EA9C 4PN2A 3VGBA 4ATLA 2CKSA 3VMNA 3AXXA 3CUIA 1TG7A 1JZ8A 1W3HA 1UD2A 3M6DA 1E4LA 2WC3A 2O9OA 5DT7A 3OZOA 1ZBKA 2WKLA 3AMLA 3IAPA 1QVBA 2ZIDA 2VTFA 2WVVB 1NOFA 3A4WA 3ALFA 1JYWA 1C90A 1DP0A 4M8UA 2HISA 3AFBA 5A6SA 2XWEA 2XSBA 4JKKA 2WMKA 2V5CA 3GH4A 2XJ7A 2WKGA 2BVTA 3QHNA 2D0FA 3S2CA 2VMFA 1PJ9A 3DYPA 1I1XA 4D6EA 5I5RA 4CN1A 4FLOA 2G3MA 1FHDA 4YPJA 2WC4A 4DUWA 1BHGA 4M80A 1E3ZA 3T0DA 3W28A 4FLQA 2JEPA 1VBRA 3MV11 2VT0A 4QAWA 2DT1A 2BVYA 4PTWA 2OYKA 1MFVA 3BAWA 3WEMA 2A3AA 5D4YA 1M01A 3FN9A 4HU8A 3POCA 1HJXA 3BAJA 2QPUA 4Y7EA 1EHNA 4E8CA 5LA0A 3GXDA 4DUVA 1QI0A 4WKFA 5E0CA 1LJYA 3PZNA 1W9UA 2UY5A 1ZJAA 1UH4A 3VIKA 4ATWA 2IXVA 7TAAA 1LL6A 2E4TA 4AY1A 1CZ1A 4GI9A 5CQ1A 2Y24A 3WNKA 3EDDA 1DWAM 2PWGA 1UD8A 2WZEA 3EBVA 5IHSA 1HVQA 5JBEA 1W3LA 3AIUA 1QHPA 1JIBA 3G6MA 1HNYA 2VX5A 2QF8A 4AWEA 1ISVA 5A1AA 3WL0A 1CBGA 1QI5A 4WLCA 3ARXA 4UQCA 5CGMA 4M1RA 4XUYA 1HT6A 2W61A 5DMYA 3WF0A 1J12A 2ZX9A 1KWKA 4HTYA 2FGLA 5A94A 4UFLA 1JZ4A 5D9MA 1VRXA 4AZBA 3VIMA 3CZLA 3T08A 3WBEA 1KQYA 5JH8A 4UZSA 3DYMA 4PMQA 4UR9A 2VVNA 1W91A 9CGTA 3VD4A 3CHFA 1C7TA 3WDRA 1GOKA 4TUFA 3IAQA 2Y8VA 3AHVA 2XM1A 3U7VA 1OD8A 4CCCA 5BROA 3OLDA 5E09A 3ARTA 3ARVA 1V3LA 3O6AA 3IK2A 4CU7A 1ZJBA 4X9YA 1WE5A 2D2OA 1NP2A 4MAVA 5A6AA 2VI0A 2VCAA 2CXGA 1UD5A 2EPNA 3SURA 1HKMA 1UA3A 5CSYA 3SIMA 3VPLA 3CLWA 1E3XA 1RP8A 4OZOA 1X6LA 3CGTA 2WBKA 2FH8A 5A6MA 3VIGA 1GONA 5E6YA 2XSAA 1LWHA 3SUVA 5A2CA 2YDSA 4HZ6A 3UERA 2DT0A 3LPPA 3KL0A 5JBDA 1FP8A 1X6NA 4BQ4A 1B1YA 1EQCA 3N15A 1UD3A 2D0GA 3WF3A 4U2ZA 2YL5A 3PZTA 1OWQA 2VZOA 4Z2HA 2NT0A 1XD0A 2W66A 1HIZA 2O9PA 1DWIM 1PEZA 1HJUA 2G41A 1LL4A 1WDQA 4M24A 3NSXA 3OGRA 4JKMA 4MNJA 3CUFA 4BS0A 1EGZA 2RGLA 1GOWA 3RILA 5CPTA 1B3VA 5I3DA 3VM7A 3MV01 4W8LA 1WAWA 2CBIA 5HNNA 1KBKA 3AIQA 3L4YA 3FXYA 4P7LA 1J0HA 3ZT6A 3AS0A 2JEQA 1CGUA 4DUXA 3K4DA 1W32A 3BLKA 3RPMA 2JIWA 3O9NA 2E9LA 3BC9A 4FLSA 5A8QA 4J28A 5FOOA 1TUXA 1V3IA 4UZUA 3SCNA 2EBNA 3SCRA 3WH9A 4CN4A 1TVNA 1CTNA 2BS9A 3VD3A 1R7OA 4TTUA 1WPCA 1XSIA 2BY0A 4P7OA 5IFPA 5A95A 3CHDA 5ABGA 2E9MA 3KL5A 4W8BA 1FHLA 1UKQA 2D23A 3ZOAA 4BQ2A 1GOOA 5A2AA 3B8SA 4AISA 2Z1KA 1DEDA 5A8NA 3WMCA 3U5UA 1GPFA 3KE0A 4GZJA 3AMCA 4LGXA 3MANA 3DECA 3J7HA 4W7UA 3S6TA 1ZBCA 2CCRA 2WMGA 4CU6A 1V03A 3PZUA 4C7GA 5A8OA 1EDQA 2VRJA 4MAZA 5FIPA 2JFEX 4F9DA 4GIAA 3LMYA 1OCQA 2OWCA 3F4VA 3SCTA 1E71M 1E70M 4JHZA 2PBGA 2WHJA 3B9DA 1Q6FA 2PWEA 1E6PA 4AIUA 4MNKA 3U7BA 4HPHA 3AMDA 4X0VA 3W29A 5BYWA 3AICA 3AQUA 2YKKA 3QGVA 1XGZA 3N12A 4U3AA 3VIFA 2WMHA 3BSGA 3ARPA 2UWFA 1EDTA 4AZ6A 2ZUUA 3OGVA 1JI2A 3OA5A 1GVIA 1VEMA 4HMDA 4W5ZA 2ZUVA 1SMDA 4OBSA 3VX1A 2WHMA 1WNOA 3QR3A 4PUEA 1ODUA 1K9FA 1JZ5A 1E40A 1W2PA 1XYZA 5BXSA 1ZS2A 4HA1A 3CUGA 4D1IA 2V3GA 4Z2KA 1BLIA 1JXJA 4U3CA 1HJVA 3AIBA 4JCMA 3AHXA 3RDKA 4RL3A 1HXJA 3WELA 2NW0A 2WMIA 2V3FA 4BQ5A 3MU7A 5E6ZA 3A3HA 1XD1A 4B16A 1IZJA 4CD5A 4M81A 1A47A 1B3XA 3AMGA 5M5DA 2WHLA 2WMFA 3PTQA 5AC5A 2J7DA 5ECUA 2J74A 2XGBA 2EPOA 1KXQA 1NWSA 4JFVA 4LX4A 2CESA 1B31A 3VKKA 4BF7A 1HJWA 3AHTA 3EYPA 1SMAA 3VINA 3CMGA 3L2MA 4JKLA 2YOCA 3SUTA 1V0MA 4AIEA 2DSKA 2VL4A 4HOXA 5ABEA 2J25A 2WMJA 2D1ZA 2A3BA 3VILA 3BAIA 1TA3A 3N18A 1TE1A 4C7FA 3WFLA 4AXNA 3AYRA 5I24A 1CPUA 3TTQA 3WH5A 5D8ZA 1RPKA 4KGLA 4R27A 2CKRA 5C70A 3BGAA 1AQMA 3VGHA 2PC8A 2BY3A 2WWCA 5I77A 1EOKA 1JZ3A 1EO5A 2B31A 3MMDA 4BQ3A 3BAKA 1KQZA 1E4NA 4TX8A 4GPNA 2EJ1A 3UG3A 4XZWA 1QPKA 2CBJA 1BPLB 1JDCA 4XV0A 3ZJ7A 4EKJA 3WMBA 1E6NA 3FW6A 4MDOA 3WDPP 5A3HA 2CERA 2ZXDA 4AC1X 4NI3A 4AIOA 4U5IA 6A3HA 3AIWA 2V3DA 5ABFA 4JFSA 4DWSA 3T2OA 1LG2A 1OIFA 2ZUSA 3ARSA 1R86A 4YHGA 5BXTA 2OLHA 2OWXA 3K8MA 3N13A 2DH2A 1OBAA 3EMCA 1ITCA 5JIWA 4MJ4A 1MWOA 1QNSA 4D6DA 1UQYA 4W84A 1CXHA 2YDQA 1JAKA 2YL9A 3W81A 4CUCA 3VM5A 1CGVA 1TZ7A 1AVAA 1W3JA 3ZSSA 1NOWA 4H41A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3SCS A;  1D7F A;  1KXT A;  2VO5 A;  1WDS A;  4H8V A;  1FH7 A;  1RH9 A;  3OLG A;  4UFK A;  1NWT A;  1VEP A;  2JF6 A;  3W4R A;  4Z2G A;  4FF5 A;  1E6Z A;  3ARU A;  3M46 A;  4EE9 A;  2O92 A;  2WVS A;  1EH9 A;  3JUG A;  5LA1 A;  1P6W A;  1UZ4 A;  2ZX8 A;  2YBT A;  1EO7 A;  3AMK A;  3MMU A;  1BYD A;  5CZK A;  4AZ7 A;  1LL7 A;  1EHA A;  2DH3 A;  4P8W A;  3THD A;  2WWD A;  3AIR A;  4S3J A;  2X09 A;  3IJ8 A;  2CIP A;  4TVC A;  2VQT A;  1GHR A;  3CHE A;  1Q6G A;  5E70 A;  3WMS A;  4AZC B;  2VZS A;  1EDG A;  4GI8 A;  1UKP A;  3CIV A;  1J0J A;  2J75 A;  3WH7 A;  1E73 M;  3II1 A;  3FND A;  4LPC A;  2X0H A;  1UWT A;  2G3N A;  1E0W A;  3BCD A;  4MB1 A;  3WD3 A;  2QV4 A;  4QLJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4AH7 A;  1LL7 A;  3ZXW A;  2OLS A;  2DH3 A;  4OT7 A;  3TFX A;  4AYG A;  1XQK A;  4DF0 A;  4H9Y A;  1VR6 A;  3AIR A;  3NDO A;  4BY3 A;  4IJB A;  3BLL A;  5HNT A;  3G0U A;  4L1W A;  1GHR A;  1Q6G A;  4AZC B;  1F8A B;  4F48 A;  4GI8 A;  4K3Z A;  3ZVH B;  1A5C A;  4NIR A;  3FND A;  4LPC A;  1S2W A;  3VE7 A;  1GVO A;  3W23 A;  4HBO A;  4K2S A;  5JVL A;  1Q8J A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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