1SR0A

Crystal structure of signalling protein from sheep(sps-40) at 3.0a resolution using crystal grown in the presence of polysaccharides
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Unknown function
source organism Ovis aries
publication title Crystal structure of signalling protein from sheep(SPS-40) at 3.0A resolution using crystal grown in the presence of polysaccharides
rcsb
molecule keywords signal processing protein
total genus 116
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1sr0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1sr0A01
3GXMA 3OLDA 1ZL1A 2D2OA 1W2PA 3WENA 4QFUA 1XH1A 2CYGA 3PTMA 4BA0A 5HBFA 2C8NA 2Y24A 4V2XA 1BHGA 2JF7A 6TAAA 1EDQA 5CGMA 2D3NA 1KXQA 4YPJA 1UUQA 1MXDA 1K9TA 2E9BA 3WBAA 4MNJA 2NSXA 3OLIA 2D1ZA 2PWEA 2VZSA 5M3WA 1QBBA 5ABHA 3OBAA 4BQ2A 4FK9A 1NOWA 3ARTA 4HP5A 1DHKA 5D4YA 3VO0A 2FDMA 5DFAA 1VEMA 1C8QA 2W91A 8A3HA 3AI0A 1KXVA 3EDJA 2UY5A 4ATLA 4D71A 3PZVA 3WNNA 2CKSA 1JYWA 3GYCA 4HZ8A 3QHMA 3UR7A 3FAXA 3AXHA 2GK1A 1J01A 3GH4A 3VKKA 1H0IA 3MUAA 1WP6A 1FH8A 4C7GA 1KGXA 4U3CA 2O9OA 1GOOA 4PRWA 2WK2A 3WNOA 1M03A 2DGAA 2XWDA 1WDPA 2OWWA 1HX0A 4MB5A 4PSPA 2VMFA 3BLKA 4ZFMA 1A3HA 3ZSTA 1VAHA 3NDZA 2PF0A 2XM2A 1UR8A 1MWOA 2VO5A 1RH9A 5HDRA 3I3DA 2OYKA 1RP9A 1CLXA 2BY2A 3N1AA 2E40A 2WAGA 4HPHA 2CCRA 3K4AA 1FA2A 3DYPA 1NWRA 4AXNA 3AMDA 4MB1A 2V3FA 3VGBA 1CECA 2WSKA 1OB0A 1VEOA 2DH2A 1NP0A 2E0PA 1JD9A 2O9PA 3FN9A 3AMLA 3RDKA 4ZXOA 3BCFA 3A4WA 2BV9A 2FH6A 1V6VA 4D6IA 2W5FA 3CZEA 5A3HA 5HNNA 3NUKA 2YKKA 4ML4A 4EAMA 1XSKA 3KZSA 2FHFA 2ZWZA 4AMCA 1KCKA 4E8CA 1HVQA 1V08A 2EJ1A 3K46A 3QGVA 2E8YA 4PYSA 4E4PA 1JNEA 5A69A 4BZYA 4S3KA 4OOUA 4PUDA 2J62A 4F8XA 1XYFA 4ZENA 4UR9A 2VZTA 4UZSA 1HKKA 4M81A 3KL0A 3VX1A 3GBDA 1W91A 4V28A 3RM9A 4GO9A 1G9HA 3WUBA 3CBWA 2OSWA 5D9PA 5JUVA 2WKLA 3U7VA 2X2YA 1P6WA 4ACYA 4UQDA 4M24A 2VOTA 2XVLA 4BQ3A 1O6IA 3GNOA 3NDYA 4IUGA 2DT1A 2WVVB 5A8OA 1NWUA 1FHLA 1V02A 3OG2A 3MV11 2V3GA 4P8XA 1JAEA 3W37A 4JFVA 2X05A 4CN6A 2OSXA 2VT0A 3PN8A 2XJ7A 3VDCA 3BH4A 1JZ3A 4A3YA 1V6UA 2J74A 6A3HA 3WH9A 1NM9A 1GVIA 1Q4NX 3TOPA 4JL2A 3AIVA 4PCSA 3WH5A 3WD2A 3O9NA 1TCMA 1F4AA 3PBGA 4FMVA 1NQ6A 4AZGA 3W29A 4X9YA 1SMDA 1EA9C 4OZOA 5I24A 4W7WA 4CCCA 1ZBKA 3CMJA 3CLWA 3SCVA 5C71A 2E3ZA 1WE5A 4LQ1A 4PMZA 4UQBA 1Z32X 4W88A 1VENA 2NW0A 1ISYA 4U33A 1B2YA 5IFPA 4W89A 3VOCA 4XZWA 1O7AA 2PWFA 4D6GA 1LG2A 5I2UA 1WZKA 1TUXA 3RO8A 2E9LA 1JYVA 3ZSSA 2EBNA 2EPOA 1BG4A 2ZUVA 4AD0A 3CMGA 4F66A 1DWHM 1B3XA 3T0DA 3NSMA 1J0KA 3POHA 4WJXA 4UQAA 1UD5A 4S3JA 2BVDA 1CGXA 2WVSA 1WO2A 2V5DA 2WWDA 4HTYA 1E70M 4B15A 3ZM8A 2XIBA 2BHUA 5DEZA 4CU8A 2AAAA 2VX6A 1V02E 3WD3A 3VVGA 5C70A 3WQVA 1Y7VA 3VU2A 2VX4A 5F7UA 1GHRA 1GJUA 4F9DA 2D0FA 3ARUA 1OGSA 1AQ0A 1Q6GA 2CPUA 2XM1A 5BXSA 4Z2LA 3KWXA 9CGTA 1QI0A 3DECA 2JE8A 2E8ZA 4NF7A 2WNWA 1CDGA 3IAQA 2F8QA 3B9DA 1V3JA 3AZRA 5AC5A 1EO5A 1XD0A 3BXWA 1W3KA 4LXFA 1LWHA 2BVTA 1V3KA 3OZOA 5HPCA 4LYQA 5A6MA 4DM1A 3ZO9A 4AIOA 1XCXA 2OLHA 1GPFA 3PHAA 2XHYA 2VC9A 1QI5A 2CBIA 3TP4A 1JF5A 2F61A 2J7EA 3VGGA 3ZT5A 1GHSA 4AC1X 1E0XA 3GDBA 3UR8A 1VFOA 5CLWA 4KRTA 4GQRA 4LPCA 4AWEA 3GM8A 4AZ6A 1UR0A 3AISA 1AMYA 1BQCA 4B3KA 2JIWA 1PIFA 3T0BA 2YBTA 3IJ8A 3L2MA 1MVYA 3MUIA 2WMGA 1BG9A 3QOKA 3N11A 3MUY1 1PX8A 1JDCA 1W9BM 4BF7A 1GOQA 2CERA 2CNCA 3EYPA 4N0RA 4IPLA 1QI3A 2CIPA 4H7VA 4HOZA 1OWQA 5FOOA 1KCLA 2ZWYA 1QHOA 1QW9A 2DQXA 1CGTA 3ARXA 1E40A 3CZLA 3AYRA 2JALA 3M7SA 3QR3A 4XUYA 4U3AA 1W1VA 2W62A 4GI8A 3NIYA 1EOMA 1VFUA 2IUZA 5I79A 1GQLA 4J3TA 2ZXQA 1H09A 2A3EA 4HMDA 3SUUA 2XVGA 2C7FA 1C3FA 1VF8A 4W8LA 2VJXA 4QAWA 5IFTA 5CGTA 2XPKA 3FHAA 1XD1A 2ZE0A 4ATDA 4U2ZA 2WMHA 3EDFA 3CUFA 1H11A 4D1IA 1C92A 3AHZA 5A6AA 3NYDA 1ZU8A 3W26A 2WLZA 1V3IA 5FCZA 4PMXA 5ABGA 4CD8A 4J3UA 1DWAM 4H8VA 5A2AA 1SYTA 4B3LA 3DHPA 1MQPA 3IANA 1K6AA 3NSXA 1V0NA 3CUGA 1GJWA 1UD3A 4QCEA 1JXJA 1E1FA 2G41A 2DPEA 2WCGA 4PN2A 3VMPA 4HA3A 3L4VA 4AD5A 4Z2KA 2QLYA 1B30A 3WUFA 1X6LA 4AY1A 1AQHA 5ABEA 2UY2A 4DWSA 4A3HA 1TE1A 2BY1A 2EXOA 1ZBVA 3GNPA 4P7OA 1MXGA 1W1YA 2UY3A 5LA0A 2VR5A 2DIEA 4H41A 1VB9A 1PZ2A 5HOSA 1HVXA 1HJVA 4CKQA 3AS1A 1EHNA 5LYRA 3B9EA 3AS2A 3VD7A 1E4LA 4GZIA 2DT0A 1I1WA 1PAMA 3BAKA 3CGTA 5D9NA 1KBKA 4JFSA 5M03A 2VQTA 4W8BA 3CZGA 3OA5A 3AS0A 4AW7A 2EPKX 3RMEA 5GQBA 4NZCA 4AIEA 1V0KA 2JEPA 2VQUA 3AIWA 4UOQA 1V3MA 3VPLA 2VCAA 2CITA 1LF1A 3IJ7A 4AZ5A 4UZUA 1D3CA 5FL1A 1JZ5A 3ARQA 2WVUA 1Q6EA 5CPSA 4D6HA 4W5ZA 3KE0A 4PTXA 1I1XA 2EPMX 3CHEA 4NRSA 4C7FA 3ARPA 4AEEA 3UG4A 1LL6A 4AZBA 3WDHA 3VIMA 1DWGM 1UOKA 4P7QA 1W1PA 1AVAA 1E3XA 4GPNA 1FFRA 4P7NA 3U5YA 3CUIA 2W66A 4W5UA 1OINA 1UR1A 1UQYA 4AISA 3SUVA 1TA3B 4WKHA 2JIEA 3D3AA 2QF8A 2D0GA 5BROA 4WK9A 1E55A 3UG3A 4WIWA 1UD2A 2QMKA 1E4NA 2CXGA 1GCYA 2RGLA 1FHDA 3WFLA 1R87A 5A8MA 2J7FA 3MU7A 1CTNA 3EDDA 5C8BB 2YL9A 4DWSD 1CENA 1H49A 1W9VA 2GFTA 3VMOA 1WB0A 3VUPA 3SCWA 1OM0A 3VILA 3OZPA 4GQQA 4W7UA 1H1NA 4GZJA 3W28A 2YL8A 4B9ZA 2FGZA 4R5EA 1UH3A 2TAAA 4GO8A 4IM4A 3WH7A 3AZSA 2BY3A 1HN1A 4R27A 4OBSA 3GXDA 1CGUA 3WH6A 4JKKA 2YA1A 3BLPX 2J8FA 1CXHA 8CGTA 2BNJA 2DEPA 4BQ4A 5DT5A 2CETA 2J79A 5AC4A 4Z2HA 1KFWA 3JUGA 1E71M 1E5JA 3CZKA 4RL3A 2VURA 3MANA 1UZ1A 6CGTA 3GH5A 2J25A 3WL0A 3IJ9A 1J12A 5I78A 2YDQA 4OOZA 1J10A 5CQ1A 1OGGA 2WMKA 1BYDA 3PTKA 3ARVA 5BRPA 3VNYA 1OT2A 2G3IA 1E6XM 3VIPA 4DUWA 1UWRA 3UCQA 3WUEA 1YHTA 2VZOA 1DWIM 4D6DA 2GJXA 1EQPA 3N17A 3W53A 5BXPA 3A47A 4JHZA 1CEOA 3OGVA 3WY1A 2QPUA 3BAJA 1JI2A 5IHSA 1V0MA 2YA2A 4UOZA 3BCDA 3BMVA 4YHGA 3AFBA 3BC9A 3VIIA 3LPFA 1K9DA 5BWFA 1FH9A 1OD0A 4UFIA 3T08A 3L4YA 4Z2JA 1UKPA 1ODUA 2PWDA 1D2KA 2ZUSA 4XB3A 2DSVA 1HL8A 1ODZA 3KL5A 1EIBA 2DT2A 5AYBA 2XFRA 3WF0A 2PB1A 4QLLA 1JZ6A 2WZIA 3N12A 3VM7A 3SCUA 1EO7A 2VX5A 2J7DA 1Q6FA 3AIEA 5GNZA 1EXPA 2VZUA 1GW1A 1H41A 2X8RA 2XIIA 1UR4A 4KWUA 4AZ7A 1DWJM 1C7SA 2JF6A 4M80A 1BSIA 3DYOA 1PEZA 1C8XA 1GQJA 4PBGA 2ZUWA 1BVZA 1E56A 5EMYA 4KGJA 5E6ZA 1RPKA 3AZTA 3EMQA 2HVMA 4ZE4A 1KR1A 1E15A 1UZ4A 3FY1A 1CGVA 4D1JA 3WEOA 1XH0A 1GORA 1QHZA 1V6YA 1QNOA 3TTYA 3VD5A 3POCA 3ZOAA 1VJSA 3U7BA 2WMJA 3ECQA 2V5CA 3AMKA 3PZMA 1U30A 3ZR6A 2DSKA 3WEMA 5DF0A 1TA3A 3L4XA 1B3ZA 1OSEA 3VGDA 1ISVA 3BGAA 4TUFA 3SUWA 4DWSC 1HP5A 3AJ7A 5I23A 5LA1A 3UERA 2VTFA 1HP4A 4M1RA 1FFQA 2VVNA 5D8ZA 4AZCA 1OIFA 3K4DA 1B90A 1C91A 5JBFA 3OIHA 3S6TA 1E0WA 3WF3A 3ZMRA 5A95A 3SCOA 1E4IA 3PZTA 5CSYA 2E9MA 3SUTA 3WDRA 1ECEA 1TVPA 1JF6A 1JG9A 4FLOA 3LPGA 3CHFA 5JBDA 1WDQA 4H2CA 1UWIA 3RIKA 4HMEA 3ZR5A 4MNMA 4U5KA 2BFGA 1FP8A 4U31A 1US2A 4AYSA 4RE3A 3WMSA 2WHKA 1KQYA 1C90A 1C7TA 4WKFA 1XRVA 1D7FA 3VIHA 2EPLX 4JL1A 1E73M 5ABFA 4HA1A 2VUYA 1BPLB 1G1YA 1QPKA 1EDTA 5IXEA 1J0ZA 1QOXA 4MNLA 1CZ1A 2DT3A 4TVUA 5EBAA 4ACZA 2ZUUA 3SURA 4JHOA 4ZEPA 2FH8A 1M7XA 2XYLA 5KZ6A 3AIRA 3WQ6A 3QHOA 3L4TA 1BYAA 1WAWA 1JI1A 4NI3A 4YN5A 4DWSB 3ARRA 2J8GA 3IK2A 4HZ6A 3VIGA 2IXUA 5D8WA 1GQIA 1PX4A 3NSNA 3MMUA 3A4XA 1XGZA 1B9ZA 5JH8A 1ZBWA 2OSYA 1M04A 1ZJBA 2VRJA 4MDOA 5BYWA 1CBGA 3ZJKA 2XGIA 2XVNA 4WSKA 3WL1A 4PTWA 2D0HA 4Q7NA 1JZ7A 5I6SA 1WDRA 1MW0A 1HJUA 1E1EA 3MMDA 1C8YA 2WC4A 1XHGA 1E43A 3EDEA 1Q6CA 1CYGA 1CIUA 3OLEA 4CD4A 2PBGA 4KGLA 1JYNA 4WLCA 4BS0A 1NOFA 2J7HA 3VX0A 1WZAA 2GJPA 2WCAA 1H4PA 4H8HA 3U5UA 3ALGA 2ZXDA 1KBBA 2YL6A 4GKLA 4W84A 2VI0A 4AD4A 3WSUA 1B1YA 1X6NA 3WD4A 1R7OA 2ZX6A 1V03A 1V3HA 2CBVA 2QPSA 3WELA 3G6LA 4CCDA 1CGWA 2D24A 1V6WA 3AXIA 1QBAA 3N04A 3VDBA 1UR9A 5I0DA 1KB3A 2RGMA 1ZB5A 1EOKA 2W4XA 3EMCA 1KWKA 3RCNA 3AQUA 3KEHA 5JIPA 2XTKA 2XSBA 4P8UA 2CESA 2XFYA 1LQ0A 1HJWA 3M46A 3W6LA 2Q8XA 1YQ2A 3GH7A 1GNXA 4YHEA 1CWYA 1QW8A 2QHAA 4LYRA 1J0IA 4JFTA 1E0VA 5FKYA 1LL7A 4Z2GA 2IXVA 3AIQA 1KXTA 2W63A 4MADA 3ARWA 1UKOA 3F5LA 3GZAA 2J77A 7A3HA 5A2CA 4PMVA 2WSPA 1JAKA 5AY7A 3AIUA 3WFZA 3MKKA 3BAWA 3CHDA 1UD6A 5CXPA 3AHYA 3ZT7A 2W61A 4A4AA 2WHJA 3AROA 4D6FA 3HMCA 4J3XA 2WC7A 2DSZA 5A8PA 2A3HA 3VD3A 1TFVA 4P8VA 4HMCA 4PEEA 1JFXA 1TR1A 1IT0A 2DIJA 3MS8A 5IHRA 2A3BA 4RE4A 4HU0A 3PTQA 4LGXA 1JL8A 2CHNA 3L4UA 2ZUTA 3WQ8A 1J0YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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