2G41A

Crystal structure of the complex of sheep signalling glycoprotein with chitin trimer at 3.0a resolution
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
publication title Carbohydrate binding properties and carbohydrate induced conformational switch in sheep secretory glycoprotein (SPS-40): crystal structures of four complexes of SPS-40 with chitin-like oligosaccharides
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIGNAL PROCESSING PROTEIN
total genus 119
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 2g41A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g41A01
2PBOA 1UYQA 3D5HA 1GORA 3W27A 1PZ3A 3VINA 2A3HA 1JAKA 3WD4A 1CZ1A 3GXFA 3UEQA 2FH6A 4CCEA 4UTFA 4ML4A 5I3DA 1XH0A 2VCCA 1W3LA 2OYMA 3AS2A 2GFTA 3POHA 4GI8A 4TX6A 3W28A 4B3KA 3U5YA 2ZIDA 3VVGA 5F7UA 1EH9A 1CPUA 4IUGA 3VIMA 3VDBA 1V02A 3N04A 1UQYA 1ZJBA 2VUYA 3PZIA 2D24A 2DH3A 1JZ3A 3K46A 3W37A 1PZ2A 4AZ7A 2FGZA 1UD6A 3GXMA 4TUFA 1E6ZA 3A4WA 4UFKA 4BQ2A 1E5NA 3WF4A 2DIJA 4WSJA 1OGBA 1WZLA 3MMWA 4PTMA 3WL0A 2XGBA 3T2OA 3QR3A 1H0GA 1ODZA 4MNKA 4WK9A 3VNZA 2CBUA 2XUCA 1LF1A 2VRKA 1BSIA 4ZXLA 2QF8A 1V6VA 4Z2GA 3AXIA 3CZLA 3K4AA 2ZOXA 2X2YA 1G5AA 4HMCA 4JHZA 3PN8A 1NARA 1XSJA 1UKPA 3KL3A 4J7RA 4YN5A 1UKSA 2A3CA 3AHXA 4OIFA 4F8XA 2CBIA 2PBGA 3WNOA 4AD2A 5A2BA 1UZ1A 3RM4A 3AHZA 2VZVA 3MMUA 2WVVA 4M29A 1GQJA 3AIBA 1QNPA 1R87A 2VO5A 2D3LA 2XYLA 5KEZA 3A6OA 1QNOA 1OGGA 1OT2A 4WSKA 1UZ4A 1QI5A 2VX5A 3OLIA 3PTQA 2E9BA 2VX7A 2ZE0A 3WH8A 5BXPA 1BGAA 1JFHA 3NDZA 3RM8A 1KXTA 1J9YA 4R27A 1HN1A 3AYRA 3K8MA 3CZ8A 1W1YA 2EO7A 3SCPA 1EO5A 3SEPA 5A6LA 2V5DA 3BAIA 1QI2A 4U3CA 5DF0A 2DSKA 1CWYA 4U2ZA 2PWHA 2G8ZA 4UZSA 3J7HA 3I3DA 2VL4A 4PUDA 3BH4A 4C7FA 1MXDA 4MNLA 4JHOA 2OYKA 3GBEA 4GPNA 2W5FA 1E43A 2E8YA 4DWSD 3N15A 2J78A 2JEPA 3W26A 3OZOA 3WD1A 1E1FA 2VURA 2DSZA 1UR8A 2J77A 1UH3A 2VCAA 1H5VA 4J3XA 2C7FA 3UG5A 1M01A 3MUZ1 4EK7A 4KWUA 4PEEA 4AZ6A 1CNVA 4X0VA 3OZPA 4V2XA 4S3KA 2AOSA 4B3LA 2YLLA 5E6ZA 2CHOA 1JYVA 3IJ7A 5D4YA 2CCRA 5CSYA 5DEZA 1RD6A 1QI3A 4MAVA 1EXPA 1QW8A 4GKLA 2JEQA 1B0IA 3VU2A 2ZWYA 2W62A 2ZUVA 1FH9A 2D2OA 2B31A 3L2LA 4AZIA 1QNSA 3ZJ8A 3LPPA 2WM0A 3LPFA 2OSYA 1TR1A 5M5DA 1G1YA 3UG4A 4ZENA 4CVWA 1E56A 4DWSB 1E0VA 5HPOA 1JF6A 1LL4A 4LX4A 3CZJA 4UFHA 3APGA 4CCCA 4IPLA 3WDQA 2VVSA 1MWOA 3LMYA 3WSUA 4TOQA 4JAWA 1ZU8A 1U33A 2FHFA 2Y5EA 1UH2A 3WNNA 3FAWA 1BYBA 4UFLA 3VILA 4HTYA 1LL7A 1US3A 3AROA 2IXUA 4GZEA 3QHMA 2EPNA 3TA9A 1ISVA 3CHFA 5GNZA 4B16A 2JF7A 1VEOA 2Z1SA 2G3IA 3SIMA 4DUVA 6CGTA 4YPJA 3BCDA 3DHPA 1J0JA 3AZRA 2ZXQA 1GQIA 3EDEA 4GQQA 3S6TA 2BVYA 3ARRA 1XYZA 1EDQA 3WDHA 3WENA 3MUY1 4J3TA 3VIHA 1C3FA 1RPKA 1DWHM 1CXLA 5LYRA 2A3BA 2YA1A 4UNIA 3FXYA 2OWWA 1JYXA 4ATWA 1JZ8A 4AXNA 1I1XA 3CGTA 3DYMA 1E6SM 3TTSA 2A3EA 1CBGA 2ZUTA 2UY4A 1ECEA 4WLCA 1DP0A 2W66A 2XHYA 4AD0A 1PJ9A 1OB0A 1GHRA 3PTKA 4W87A 6TAAA 4EKJA 2CESA 2XTKA 4KGJA 4LYPA 1C92A 2JIWA 4JL1A 1CXIA 2WMHA 2XVGA 4CU8A 5IFTA 3WMCA 3ZM8A 3N17A 1DWAM 2EPLX 4J3SA 1YHTA 5A8PA 1E4NA 1W9UA 1CEOA 5JH8A 5CPSA 1WP6A 3BC9A 1EHNA 3WF1A 1VBUA 2XGIA 4DUXA 5GNXA 1WAWA 1VENA 2RGLA 2PWEA 1QW9A 1B3YA 2FHCA 2YL8A 4D6EA 3EDDA 3VDCA 1OT1A 1UR2A 2OWXA 4PYSA 1JXKA 2GJXB 5CG0A 3A3HA 3VKKA 4HZ6A 5JIWA 1JD9A 1OINA 2WHJA 3CIVA 3ZMRA 2J25A 3WBEA 1W1TA 3K4DA 2WLZA 5A6KA 5EFFA 1M03A 4GO8A 2GDUA 2GSJA 2W63A 4WKHA 1N82A 1KB3A 1O7AA 1HL8A 3SCVA 1V0KA 3M07A 1R85A 1JFXA 3N18A 1R7OA 3PZTA 4AEFA 4LGXA 1V0LA 4HZ8A 1VFOA 2E3ZA 3DYOA 3WQ8A 1GQLA 1LWJA 1H41A 5E6YA 3G6LA 1HP5A 1HJVA 1QBAA 2XJ7A 2BY1A 3S2CA 3N9KA 1JF5A 1HJQA 4M8UA 1XD1A 3VTRA 4BF7A 4Z2LA 1V6YA 3PZQA 4QDMA 3VDHA 1XV8A 2GK1A 3ZIZA 2FDMA 1W32A 1O6IA 4LQ1A 4J3UA 3WUGA 2VTFA 1IT0A 5CZKA 1VEMA 1LWHA 1L8NA 1CGWA 4GI6A 2WAGA 1W2VA 4EE9A 5AY7A 3MSDA 3WDRA 3RO8A 3VPLA 2WVTA 3KEHA 4UCFA 4QFUA 1HIZA 2YOCA 3AZSA 1J0HA 2QPSA 2DEPA 2G3MA 2F61A 1MW1A 2V3FA 4JZ5A 2VVNA 4CD5A 1U2YA 2WWDA 4WKFA 1BHGA 2Q8XA 5HPCA 4DM2A 1WPCA 4TTUA 4H7VA 4CVUA 4ACZB 2VJXA 1JZ2A 1E6NA 2CEQA 3CTTA 1MFVA 2WHLA 3GNPA 4CN1A 1CECA 1J01A 2J79A 1EDTA 3KL5A 2WMIA 3WDIA 4MAZA 2PC8A 1CLVA 4D6FA 1BFNA 3W0KA 3ARYA 4JFTA 1I1WA 2WMGA 4MB4A 1TVNA 4GXPA 1DEDA 3NSNA 2XSBA 2X05A 1JNEA 4PMNA 1Q6EA 1KGXA 2XPKA 2WKLA 5A6AA 2WPGA 3WEZA 1XRVA 4JFSA 5DFAA 4F9JA 1UOKA 4PMZA 3CPUA 2CITA 1GCYA 2J8FA 2J7FA 5BRPA 4BCEA 5JBDA 1QOXA 1FH7A 1E3XA 5C8BB 3EDFA 1D2KA 5A2AA 2D0GA 2VC9A 4M24A 1ZBVA 3GXIA 1BYAA 2VX6A 4N42A 5I78A 1BYDA 2DT1A 4IPNB 2ZXBA 4BZYA 2VMFA 3OLDA 3ARTA 4BQ3A 1CGYA 2WWCA 1E6PA 3FHAA 1EIBA 4P8XA 1PX3A 3WUBA 2VZSA 2X0YA 4D6CA 1B3XA 3ARQA 5CQ1A 3ZT5A 2YL5A 3BXWA 2ZX9A 1K9EA 4UQEA 2PB1A 2PWFA 4PN2A 5FL1A 2CYGA 1KGUA 3AIQA 1OD0A 1CIUA 1UR0A 3RDKA 4KGLA 5CLTA 2GJPA 1KXQA 2D0FA 1DWIM 3WQ4A 3EDKA 2VZTA 1JYWA 1QHPA 3RJXA 1F4AA 2J7BA 3L4UA 4TTGA 3TOPA 3OBAA 4AD3A 2W67A 3WFZA 3CUFA 2DSVA 3BAWA 3DYPA 3THCA 1E6QM 4P7NA 4M1RA 4A3HA 2EEXA 2PI6A 4FLQA 2G4FA 4OUEA 4UOZA 3WF0A 1UKTA 3CZEA 3GTNA 5D9MA 3RILA 3F5LA 3WY1A 2WW5A 2BY3A 1OM0A 2BVTA 3NYDA 2WMKA 3BLKA 2BHYA 1KR0A 1FFRA 3VGEA 2NT1A 3BGAA 2PWDA 2WKGA 3WQVA 3VD9A 4BQ5A 5FCZA 3CUIA 3RMEA 4MDPA 3RCNA 2DT0A 2YDRA 2EXOA 4HMDA 3EMCA 4KRUA 1R86A 4WJXA 5I24A 1JZ4A 3ZOAA 1ZBCA 1C7SA 4V28A 4W93A 1WKYA 4GIAA 1EOMA 3GH7A 2QLYA 1ZBWA 1W9BM 1J10A 4F66A 3WH5A 1E72M 3QOMA 4HOWA 1Q4NX 1W9DM 4UQAA 1B3VA 1K9FA 3OGRA 4BS0A 1PBGA 1J0KA 3AFBA 4UQBA 2OSWA 4PBGA 1C8QA 3VGBA 1H4PA 4HP5A 3O6AA 3AQUA 3WQ6A 1Q6GA 1TFVA 2J7CA 3WL1A 2CKRA 3O2LA 3ARWA 1ZB5A 3FNDA 5D8ZA 3WMBA 1JIBA 3SUSA 2XVNA 3MKKA 4CD4A 1JI1A 4AIEA 1V3KA 1VAHA 2E8ZA 2CNCA 2WB5A 2F2HA 1WZAA 5ABFB 1GJUA 4HU0A 4AIUA 3FAXA 4UOJA 1GOIA 2UY3A 3VD3A 1BGGA 1UWSA 1NH6A 1H0IA 2XG9A 1CGXA 1MYRA 1TE1A 2JFEX 2FH8A 4W8AA 1OIMA 3NSMA 1VF8A 1Q6FA 5HDRA 3W6LA 3WDJA 3CLWA 4MADA 3CMGA 5I6SA 1GQKA 5I5RA 1H49A 3HMCA 5CGTA 1M04A 1CXHA 2ZUMA 1EDGA 1US2A 3VUPA 1J0ZA 5JBFA 4FK9A 3CMJA 4P7LA 4AW7A 1E4LA 1CLXA 1Q6DA 1UD4A 1XD0A 2W61A 2WXDM 5EMYA 2VQUA 1ISZA 5JBEA 3AMKA 2ZWZA 4TXEA 1RP8A 3O9NA 3AIRA 1EHAA 3ZSSA 3CHEA 2E9MA 9CGTA 1AQHA 3TTOA 4ZXOA 3WD0A 4XZBA 4CD8A 2WNWA 4DWSA 4U3AA 1YQ2A 1WCGA 3W25A 3EDJA 1B3WA 1KCLA 3L4YA 2XM2A 4PCTA 1HJXA 1S46A 1ZBKA 1B31A 1JGIA 4D6GA 3MANA 1V6XA 2D0HA 1JZ7A 2EJ1A 2D22A 1J0YA 3T0AA 2GUYA 2QMKA 1A47A 4GZJA 2VQTA 5HNNA 2G41A 4AMCA 1MW3A 1FHDA 4ATLA 4NRRA 1KFWA 5A95A 1C90A 4P7QA 2O9PA 3WQ5A 4PMQA 2YJQA 3SCNA 2J4GA 4JFVA 2YKKA 1BYCA 5DT7A 1JG9A 3ZR6A 1CYGA 2AMGA 3PZOA 1GUVA 1XC6A 2D3NA 4D6DA 4JFWA 5CGMA 3U7VA 1K9TA 1G0CA 3VIKA 1E6RA 2XVPA 3EMZA 4NZCA 3L2MA 3AIEA 1JAEA 2W4XA 4LPCA 1PPIA 4LYRA 2WHKA 1EQPA 3VM5A 3SUUA 3A4XA 4JKMA 2J7HA 2WCSA 3ECQA 4CD6A 3ZJ6A 2ZUNA 1TA3B 4J28A 3VD5A 4AYSA 1J12A 3WELA 4F9DA 5E9AA 1TMQA 1V6UA 4QAWA 1TUXA 1V3HA 5E0FA 4H8UA 2ZUUA 1UQZA 1J0IA 1IZJA 1GOQA 1QHZA 4NF7A 1RP9A 2A3AA 3VGFA 4YHGA 3NSXA 5LA2A 3AMDA 2OSXA 3FY1A 2XFYA 5ABEA 1KWGA 2YA2A 5C70A 1ZJAA 2J47A 5D9OA 1GZJA 2OWCA 2GJXA 7TAAA 1NQ6A 3LPGA 2ESCA 1FA2A 4UZUA 5I77A 3CO4A 4W8BA 1UKOA 4CD7A 2VI0A 2YIHA 4PMUA 2G3NA 3B9AA 4E8CA 3CZGA 5A6BD 3L4XA 1Q6CA 1A3HA 3VMPA 1V03A 1UHVA 2HISA 4AD5A 1CTNA 2Y8VA 3AYSA 1XYFA 4H8HA 1NOWA 4ATDA 2XM1A 5A69A 4FLRA 3AS1A 2PF0A 4QP0A 2E40A 4AY1A 5A6SA 4CCDA 3U7BA 3NJ3A 1QPKA 3ARVA 4J3VA 5I0DA 3BMWA 1B30A 1WO2A 4EAMA 3QHOA 1W3KA 4JCLA 5E70A 4H2CA 2Y24A 1AVAA 4AWEA 3SCWA 1V08A 4PMVA 5CPQA 2J8GA 3CUGA 1MQQA 1AMYA 3TTQA 2Y2WA 3F5KA 2DSUA 1ISYA 4PSPA 2NT0A 1NWSA 1D3CA 4DM1A 1QI4A 2E0PA 4OOZA 4P8VA 4WKAA 3AHTA 1WDQA 3W81A 1AQMA 4M82A 1UWRA 3RIKA 1SMAA 4AZHA 4PMRA 4PSRA 2WANA 3OB8A 1WZMA 4ACZA 3KWXA 1BG9A 3T0BA 2VR4A 3AISA 2VRJA 3N13A 4MPKA 5A8OA 3VMOA 3M7SA 3IAQA 4W88A 3T0DA 1QNRA 1K9DA 3MSGA 4W7UA 1EA9C 4MDOA 2OLHA 5JIPA 1CGUA 1HP4A 1VFFA 3RM9A 3W29A 2XFFA 1JYNA 4BQ4A 4X9YA 5TD4A 3G6MA 1FP9A 3SUVA 3OLEA 1GONA 1H09A 4Z2IA 4GI9A 4PUEA 4RE2A 4PTWA 1XH1A 1R7AA 1XCXA 2XIBA 3ARZA 2YDQA 3HJEA 4D6JA 1NWTA 2EQDA 1E6XM 1JXJA 2C0HA 4AZ5A 1V3MA 2D1ZA 1B3ZA 5A8MA 4TVCA 3UCQA 1UWTA 2WK2A 3PZVA 1E4IA 3IK2A 4C7GA 5A1AA 5BROA 1E15A 4RE4A 2DH2A 3AJ7A 1W3JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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