3WIJA

Crystal structure of a plant class v chitinase mutant from cycas revoluta in complex with (glcnac)3
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cycas revoluta
publication title Crystal structure of a plant class V chitinase mutant from Cycas revoluta in complex with (GlcNAc)3
rcsb
molecule keywords Chitinase A
total genus 121
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wijA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wijA01
3SCQA 3M6DA 3SUWA 4TTUA 4L4PA 1E3XA 3EDKA 4AIEA 1JIBA 2JALA 4U5IA 3KL3A 7CGTA 1JD7A 5A1AA 4FMVA 3VGBA 2G3JA 3WNPA 4PTXA 4E8DA 3LPOA 4KH2A 5D9NA 2GK1A 3A3HA 1UWUA 5HDRA 1UR8A 4IPLA 2J8GA 3WQWA 3CZKA 4WKHA 4D6DA 3WF4A 2XTKA 1EDGA 4QP0A 4RE3A 3RM4A 4QFUA 4XB3A 1E40A 1F4HA 3F5JA 4MADA 3LPGA 4D72A 1ZBVA 1BG4A 3UESA 3SUUA 5AYIA 3AZRA 2XSAA 5JH8A 1UWIA 4D6JA 1X6LA 1UQZA 4B15A 4PTVA 5A8OA 2BS9A 4EANA 1GPFA 1M04A 5HPOA 1UH4A 5A8MA 2D0HA 5E70A 6TAAA 2WMGA 3CMGA 2JIWA 3AXIA 3ZJ7A 3EDDA 1HIZA 1J0JA 1RH9A 4PN2A 1E6ZA 1PZ2A 4U5KA 3VDCA 4CN4A 1MQRA 2WHMA 2PC8A 2MANA 4D1JA 5I6SA 3U5YA 1NP2A 3AMDA 2FDMA 4AYSA 2YL5A 3IJ8A 4W89A 2CBJA 1UWTA 4R27A 2FGLA 2WSPA 1HJXA 3ALGA 4MNMA 2IUZA 5AC4A 1JYVA 4Q22A 3VDAA 5EBAA 3AMCA 3WQVA 4TOQA 3BAWA 2GJXB 1O6IA 2D0GA 2W61A 1VFMA 4JCLA 5E6ZA 1J12A 2V38A 4M29A 3AJ7A 2W62A 1QHZA 2YDRA 3MU7A 1DWHM 3SIMA 3GXFA 5BRPA 2DPEA 3AROA 3QOMA 3BCFA 1VEOA 3CZGA 3WKZA 3WD3A 1LQ0A 4CD6A 5A6JA 5BXTA 3BC9A 3VIOA 3EMCA 4QCEA 4X9YA 5I3DA 4OOUA 1ISVA 4JFSA 4U2ZA 4AZBA 5I24A 1PPIA 4C7DA 4PTMA 1UD2A 4AY1A 1S46A 3ARRA 1R86A 6CGTA 1L8NA 2V5DA 1GNXA 1UZ4A 4S3JA 2DQXA 2D3LA 3RPMA 2YBUA 3DECA 2ZICA 1KR0A 1J0KA 4DM2A 4CGTA 4W85A 3MUZ1 1V0NA 1UD4A 4M1RA 1G1YA 4IM4A 1JL8A 2C8NA 4J28A 1UD5A 1UKPA 2FHBA 5EFDA 3VMPA 5IFPA 3BGAA 4UFKA 2A3HA 4BCEA 3L4TA 3ZIZA 3SCRA 1HKIA 2WCGA 2YIHA 4HA1A 1LF1A 4GKLA 4HOZA 1HJQA 4AC1X 2BVDA 2GJXA 3VVGA 2XVKA 1B3XA 4JCMA 1JNDA 3VIMA 1H41A 1VAHA 1JDDA 5FOOA 1KWKA 2EPKX 2XGIA 1EDQA 2J75A 2JF6A 3PZGA 4BQ5A 3OLGA 1UR1A 4UFJA 4X0NA 4H41A 2GSJA 5IDIA 1KWGA 1GOKA 2VT0A 3OB8A 4DWSB 1FHDA 1B3VA 3N18A 1UWRA 3WIJA 2D20A 1UYQA 1MW0A 3EDFA 2CITA 5A6KA 2PWEA 3T08A 1U2YA 3TTYA 2EPLX 1I1XA 1MWOA 1XSKA 2ZWZA 4PMRA 1KBKA 3B9EA 2Y24A 1HF6A 3GTNA 2YOCA 1C7SA 2WMKA 1DWFM 5CLWA 4DWSC 3ZR5A 4LQ1A 4PCTA 1CZ1A 3ZSTA 3KE0A 3KL0A 1KXHA 2BHYA 3BSHA 4W7UA 1BSIA 3U7VA 4XZBA 3CUIA 5CQ1A 3G6MA 1BGAA 1TVPA 4TUFA 2J7FA 3AFBA 2W66A 2UY4A 5BROA 1W3LA 4PMDA 2CIPA 3F5KA 3VGGA 3ZQ9A 3W53A 4CVUA 3RILA 1YHTA 2A3AA 3W81A 2O9RA 4H8VA 4HU8A 1QI3A 1WP6A 2WVTA 4JZ5A 2Q8XA 4W8BA 2ZX7A 2ZIDA 1OT2A 2ZUNA 4OBSA 4HPGA 3EBVA 3ZJ6A 4TVUA 3GZAA 1QI5A 3O6AA 4DWSA 4AD2A 3EDEA 1VBUA 5CG0A 1E43A 1WPCA 2XYLA 3N15A 5FL0A 1E15A 2DT0A 1QNPA 1J18A 1E4MM 4KGJA 4HOWA 2PWDA 5HNNA 4Z2HA 4FLRA 4ATDA 2UY3A 2XIIA 1E56A 3WSUA 1JZ8A 1HP5A 4LPCA 3AIUA 1AVAA 3TTOA 3FNDA 1W1YA 1OIFA 1RPKA 4UQ9A 3AZSA 1IZKA 4JAWA 3VGHA 1NP0A 2O92A 5EFFA 2QPSA 1XH0A 3CHDA 2CETA 2J77A 1NH6A 3WNKA 1VB9A 2DDXA 5CZKA 1CXFA 3GXMA 1OGGA 4WKAA 2QMKA 2CPUA 4P7QA 1UWSA 3GNRA 5ABHA 4CUCA 3VKKA 3FXYA 1PX4A 4RE4A 3TP4A 1FA2A 5D9OA 3ARVA 3KEHA 4OOZA 1JGIA 4NSBA 1FH7A 4EK7A 2ESCA 1KGWA 2QLYA 4TVDA 3POCA 2YKKA 4MDPA 4QLJA 4OKDA 1RD6A 2J78A 4IISA 1XD1A 1ITXA 4ATWA 5A3HA 2AAAA 5A8PA 1E55A 2VZOA 5CPQA 5BXSA 3PZ9A 2Y8KA 3M46A 1CXEA 3VGFA 4Y7EA 3ZJKA 2D0FA 3S2CA 4GIAA 3ZT7A 5TD4A 2VZSA 3CBWA 3CTTA 3QHMA 3VIHA 1B1YA 4AXNA 1VRXA 1WZLA 1XC6A 2DSUA 2WVUA 1W3HA 5ABEA 2F2HA 1LL6A 1QNQA 2UY5A 4D6EA 3IJ7A 1O7AA 2CNCA 3CHEA 2IXUA 3WL1A 2OSYA 1UG6A 1XRVA 1HKJA 1TVNA 1V02E 3L4UA 1E4LA 3VPLA 1UD3A 5C8BB 2XVPA 2EXOA 4CVWA 4IPNB 4P7RA 2X05A 1C90A 1E1EA 1C91A 4TX8A 2CXGA 5E6YA 4W7VA 1PX3A 1V3JA 1JAEA 4GZIA 1GOIA 2G3IA 1FHLA 3WF1A 1JI1A 3IJ9A 1TG7A 1QW8A 3W26A 5HXMA 3PZVA 3AS0A 4GI6A 3WUFA 5I5RA 2OSXA 2B31A 3VX0A 3T2PA 4BQ4A 3WQ6A 2YLLA 1Q6EA 1WZMA 4JKKA 5C71A 1C8QA 3VO0A 1DEDA 2CKSA 3EDJA 2GFTA 2WWCA 4PCSA 5DMYA 1GVYA 1V0LA 3UERA 4PUDA 1ECEA 2D24A 3K1DA 1BVZA 3VIFA 3U57A 3IAQA 2WC4A 2WMIB 3GBDA 4L4OA 4CCEA 1MVYA 1UD6A 1YQ2A 2G3MA 1M03A 1WDPA 2WCSA 4UFMA 1UKOA 3SCVA 1JYNA 1C7TA 1UQYA 3PTQA 2WMJA 1IV8A 3OG2A 1KXQA 4E4PA 4UQCA 2VQUA 3IAPA 1C8XA 3WNOA 2ZXBA 4EKJA 4PSPA 1EQCA 1UR0A 2CESA 2JE8A 4UR9A 2V3EA 2WNWA 3GM8A 3GNOA 1BAGA 3NSXA 3VIKA 3L2MA 1ZB5A 2BVYA 3MSGA 3CHFA 3WD0A 1L0PA 3CZ8A 2WYSA 1NQ6A 4UFHA 3ZR6A 2ZXAA 3UG5A 3ECQA 2WLZA 5E9AA 2CBVA 1AMYA 4PMUA 1HX0A 4PMQA 3VM7A 4B9ZA 5M17A 1E6PA 1LLOA 4D6HA 4YPJA 3OLIA 1WO2A 1DP0A 5AYBA 5JIPA 2OWCA 5IFTA 4W88A 2VMFA 1OINA 2WZHA 3WEOA 2A3EA 1W9BM 3WDJA 2J8FA 4DUVA 4ACYA 5A6LA 1EQPA 4CU7A 3SCSA 4PMNA 1W91A 4AZHA 3GH5A 1MW1A 3AS2A 3SCNA 2WMIA 2RGMA 3VD4A 1ZBKA 2J7DA 4UQAA 2EBNA 4BQ3A 2BNJA 3UG3A 3ARYA 1ODUA 3A4WA 4H04A 5JIWA 4GI9A 4MNLA 3ARPA 2BY2A 2EQDA 1US2A 3N11A 4CD4A 1XHGA 3B9DA 2UY2A 3WMCA 1KCKA 1V3IA 1I75A 3VNYA 4CD8A 1JF5A 4J27A 3CGTA 1E4NA 1H5VA 3DHUA 4N0RA 3RO8A 3ARWA 1CGTA 4PMOA 5JUVA 4JFTA 2DH2A 5ABFB 3U7BA 2XPKA 2VVNA 1E0VA 2Z1SA 1NWUA 4HPHA 1QNRA 4H8UA 3WMSA 1XCWA 2EJ1A 2D23A 1BG9A 2WKGA 1Q6GA 1GQKA 5EMYA 4AW7A 1PAMA 1C3FA 2NSXA 1MW3A 3SUSA 1B31A 4J3UA 6A3HA 4U2YA 3DHPA 1E6XM 1GOWA 1B30A 1K6AA 3FY1A 1GVIA 3WFZA 3PHAA 3ARQA 3WDIA 2G41A 4D6IA 3K46A 4NZCA 3EMQA 5A2BA 2XJ7A 1A47A 3WF0A 2YL9A 5KEZA 4HP5A 3N04A 1HNYA 2BXYA 4HA4A 2QF8A 2GUYA 3GNPA 5DF0A 4XV0A 1D3CA 2EPMX 2W5FA 4HZ8A 4MDOA 4DUWA 1W9PA 3MV01 5A6BD 1RP9A 2ZXDA 1TZ7A 2ZUTA 2WSKA 3VD3A 3RDKA 1J9YA 4M81A 4D71A 1MW2A 2WVVA 2C0HA 3PZQA 3WH5A 1WZKA 3NJ3A 5BWFA 1MQPA 2XFYA 4JL2A 1E4IA 1MXGA 4LYRA 4MB1A 4E2OA 2DT2A 4MB5A 2VX7A 1N82A 3MV11 1QVBA 3MUAA 1TCMA 4WKFA 1GOOA 2EPOA 2YDSA 3OGSA 5ABFA 4CN6A 2V3DA 2E0PA 5A69A 2O9OA 1WE5A 1B0IA 2WC3A 1MFVA 4AISA 4D6FA 4JFUA 5DEZA 5E09A 3PZOA 1ISWA 2J7BA 2DIJA 1JFXA 1V6XA 2UWFA 2XIBA 5A6BA 1GJWA 3OBAA 4D6CA 4P8XA 4QAWA 2BY3A 5GQBA 5CJ5A 1V6WA 1NM9A 4FF5A 4LYQA 2XFRA 5D8WA 4QLLA 4V2XA 3GBEA 1JDAA 2DSZA 2XSBA 4PMZA 4PMYA 2WANA 2XM1A 1G01A 3FW6A 1CXLA 2VVSA 2VURA 4FLSA 1E71M 3N17A 4D1IA 3FN9A 4H8HA 5CPTA 4KMQA 1AQ0A 1SMDA 3L2LA 1G9HA 3CZLA 3AYRA 3PTMA 4AIUA 3ARSA 4PRWA 4PUEA 2OLHA 4U3AA 8A3HA 2VQTA 2Y2WA 3RM9A 3WF3A 1JNEA 1HT6A 1G0CA 3MMWA 2F8QA 2JEPA 4GQQA 3NIYA 2W92A 2E40A 1KQZA 1WCGA 3MMDA 4XZWA 1FH8A 3I3BA 4H7VA 1XCXA 3BXWA 3PN8A 2XVNA 2ZWYA 3WN6A 3IK2A 1ITCA 3AOFA 2YL8A 3F5LA 4KRUA 3D3AA 3FHAA 1ESWA 4GZEA 1E5NA 2CKRA 3WUBA 1RP8A 1EO5A 1ZJAA 2ZUVA 4AD3A 2WWDA 3AMKA 1W9XA 1XYFA 3GYCA 3RJXA 2G4FA 5A8QA 4CN1A 3CHCA 3SCTA 2XVGA 2VL4A 3WBEA 1WDRA 1XH2A 3ZT6A 4LYPA 5D9MA 1JZ7A 2VCCA 1FP8A 1GUVA 4UFIA 3QHNA 1ISYA 3IANA 1JZ5A 3BCDA 3A4XA 4V27A 2VTFA 4GQRA 1KFWA 1CXKA 4AD0A 1V08A 2ZX9A 3SCUA 3THDA 1W9VA 4OIFA 2O9TA 3OIHA 1CXHA 1QOXA 4UCFA 3A47A 3OZOA 3POHA 3GH7A 3B9AA 1EXPA 4P8WA 3QGVA 2TAAA 1M7XA 3KWXA 1ZBWA 2VRJA 1SYTA 1HP4A 3HU7A 4KRTA 1H3GA 2ZX8A 5CLTA 4CCCA 3DYPA 2AOSA 1CGUA 1TFVA 3WD2A 1WAWA 1TE1A 3WELA 4MAZA 3GDBA 3WDQA 1JZ3A 3L4XA 1VFFA 1EHNA 2OWXA 3AS3A 1VFUA 2ZE0A 2ZUWA 1R7AA 3K4DA 3AIWA 5IHRA 4Z2GA 3CH9A 1D2KA 4J3XA 1HJVA 3W28A 3T0DA 2JFEX 4W8AA 1H09A 5HBFA 3WDPP 2E8ZA 1JI2A 4UOJA 4AD1A 1UKSA 3SURA 1LG2A 2E8YA 4FK9A 1K9EA 5CSYA 5F7UA 1QPKA 8CGTA 1CDGA 1BGGA 1FFQA 3W24A 1CECA 2D22A 4IUGA 1F4AA 1QBBA 1KXVA 2J47A 3MS8A 2YDQA 1DWGM 1U30A 3SEPA 4TX6A 1KBBA 3DYMA 3W6LA 3AIBA 2PBOA 3AQUA 4Z2KA 2CBUA 5GPRA 1VJZA 3OGRA 3VIPA 1UWQA 5HPCA 1KGXA 1EO7A 4C7FA 3L4WA 3BLPX 2NW0A 3B8SA 2NT0A 3WD1A 1J0HA 2DT1A 2WAGA 3W82A 1MFUA 1CLVA 3GH4A 1LWHA 2XM2A 1MYRA 1FH9A 5CXPA 2XFFA 1PBGA 2Z1KA 2XHYA 5E0FA 1V02A 2X8RA 5LA0A 1C8YA 2G3NA 1D7FA 3ARUA 4RL3A 5IHSA 1J11A 1C92A 2X2YA 3TA9A 1X6NA 1W2VA 2FHCA 4MAVA 2QPUA 2JIEA 2XGBA 2VRKA 3HMCA 3VD5A 1ODZA 1JAKA 1G5AA 2FH8A 2YA0A 4C7GA 2VNCA 4Q7NA 1CGWA 3MSDA 3MO4A 5BYWA 2WHLA 3ZJ8A 3A6OA 4U33A 3O9NA 2W4XA 1JD9A 4JKMA 4JFWA 1OM0A 3VIJA 1EA9C 4UZUA 1PEZA 1W1TA 3VMOA 4ZE4A 3WD4A 2PB1A 2ZX5A 3O2LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E5D A;  3EEZ A;  3TAO A;  3PAN A;  1T8X A;  3NTP A;  4TTU A;  3WBY A;  4AIE A;  2JAL A;  3KL3 A;  5A1A A;  2PV3 A;  5H8P A;  3SEC A;  4PTX A;  4C6P A;  3LHZ A;  3A3H A;  1DJW A;  2J8G A;  3CZK A;  4F2U A;  4WKH A;  3IKD A;  4D6D A;  4Q4K A;  4IPP A;  4HYR A;  2XTK A;  4QP0 A;  1O5K A;  2ZZ2 A;  3RM4 A;  4LVG A;  4MAD A;  3KBM A;  4KWO A;  3S2M A;  3CB3 A;  4D72 A;  4DJF D;  1DJG A;  4LVA A;  3SUU A;  5F4W A;  5CSR A;  2PLJ A;  3P0W A;  5JH8 A;  1AJ2 A;  1X6L A;  1WQ5 A;  3OJG A;  1XYL A;  3DBN A;  4OFC A;  1F6K A;  3PRB A;  4EAN A;  1RBA A;  5A8M A;  5E70 A;  1UB3 A;  3ZJ7 A;  1F7B A;  1WBJ A;  3EDD A;  4UTT C;  4HKP A;  2YXG A;  5H8U A;  1E6Z A;  4A6G A;  3QTP A;  5TAO A;  4Q33 A;  9RUB A;  4ORI A;  4Q4R A;  4QIS A;  2HBX A;  3SN4 A;  2PDC A;  4LAO A;  1TCO C;  2FDM A;  2DZV A;  4FAM A;  2FGL A;  1HJX A;  4Q4P A;  1L6S A;  3CQJ A;  1PO9 A;  1B5T A;  2OO0 A;  3WQV A;  5FSD C;  2FAP A;  5HKG A;  1H51 A;  2RFG A;  4JCL A;  5LIY X;  1IEX A;  4C6D A;  3AJ7 A;  2QUL A;  3NQM A;  4Z17 A;  2OZ3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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