The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
91
|
structure length |
91
|
Chain Sequence |
GKIRASHILVADKKTAEEVEKKLKKGEKFEDLAKEYSTDSSASKGGDLGWFAKEGQMDETFSKAAFKLKTGEVSDPVKTQYGYHIIKKTEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Isomerase
|
| source organism |
Bacillus subtilis
|
| publication title |
NMR solution structure and characterization of substrate binding site of the PPIase domain of PrsA protein from Bacillus subtilis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Foldase protein prsA
|
| total genus |
20
|
| structure length |
91
|
| sequence length |
91
|
| ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
| pdb deposition date | 2005-05-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Chitinase A; domain 3 | Chitinase A; domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J4R A; 3LUO A; 1ROT A; 2ZQV A; 2M2A A; 4QT2 A; 3O5Q A; 2RUD A; 3OOB A; 2MNT A; 2PPO A; 4DZ3 A; 3FAP A; 3TC5 A; 4W9P A; 4ODP A; 4U84 A; 1HXV A; 2RUC A; 2FKE A; 5BXJ A; 3O5J A; 3IK8 A; 3UI6 A; 2VCD A; 4JFI A; 1D7J A; 2UZ5 A; 3UF8 A; 4DRH A; 1F40 A; 4TW8 A; 1BL4 A; 4DRJ A; 2XPB A; 3CGM A; 2LKN A; 2Q5A A; 3CGN A; 4LAV A; 4W9Q A; 2M1I A; 1W26 A; 1ZCN A; 2LJ4 A; 1Y0O A; 2XP4 A; 4J4O A; 4DZ2 A; 3H9R B; 1B6C A; 1JNS A; 1FKD A; 2KGJ A; 3IHZ A; 3KAG A; 4DH0 A; 1FKI A; 3EY6 A; 2XP7 A; 4TW7 A; 3VAW A; 3UI4 A; 2ZQS A; 1A7X A; 1D7H A; 3UI5 A; 1KT0 A; 1YAT A; 2RUR A; 2ZQT A; 1J4H A; 4JFM A; 2M08 A; 5J6E A; 1BKF A; 3TDB A; 4MGV A; 3O5L A; 1FKK A; 4JYS A; 4ODN A; 3I6C A; 5I98 A; 1Q1C A; 2MLX A; 5HW8 A; 3B7X A; 1FD9 A; 2MPH A; 3TCZ A; 5D75 A; 1FKJ A; 3RFW A; 3KAB A; 4DRP A; 3ODK A; 3IKG A; 1U79 A; 4DRM A; 3KAF A; 3MDY B; 3O5E A; 4GGQ A; 1NMV A; 1JNT A; 2F21 A; 5HWB A; 1NSG A; 4GIV A; 1NMW A; 2PV2 A; 4DRK A; 5HWC A; 3O5G A; 2KO7 A; 2LGO A; 2OFN A; 1FKF A; 1Q6I A; 2JZV A; 1P5Q A; 2DG3 A; 2KFW A; 4IQ2 A; 4TW6 A; 1L1P A; 3NI6 A; 3UQB A; 4QT3 A; 5HT1 A; 1FKG A; 3NRK A; 2ZR6 A; 4FN2 A; 1N1A A; 4C02 B; 4DRQ A; 1D6O A; 3PRB A; 1ZK6 A; 2KE0 A; 1QPL A; 4W9O A; 5HW6 A; 5HW7 A; 2F4E A; 2KI3 A; 1QPF A; 1FJD A; 1TCO C; 4JFK A; 2Y78 A; 4JFL A; 3KAC A; 2DG9 A; 3O5K A; 2XP9 A; 3JXV A; 4LAY A; 4MSP A; 4TYO A; 4TX0 A; 3WH0 A; 4U86 A; 2XP5 A; 4BF8 A; 3KAH A; 5HKG A; 1KT1 A; 2MLY A; 4R0X A; 1Q6U A; 4U85 A; 1FKB A; 1FKT A; 1JVW A; 2LPV A; 2DG4 A; 2F2D A; 2RQS A; 1J6Y A; 4G2P A; 1T11 A; 2PPN A; 3JYJ A; 3O5I A; 1J4I A; 3O5O A; 2PBC A; 3O5D A; 1C9H A; 2ITK A; 3GPK A; 4ODR A; 2MLZ A; 1ROU A; 1F8A B; 3PA7 A; 4FAP A; 1EQ3 A; 2XP3 A; 2K8I A; 2ZR5 A; 3O5F A; 4ODO A; 5B8I C; 1QZ2 A; 1FKH A; 1YW5 A; 2RUQ A; 4IQC A; 4NNR A; 3UQI A; 5HTG A; 1FKR A; 1EYM A; 3KZ7 A; 4ODL A; 1R9H A; 3KAI A; 4LAX A; 2ZQU A; 1M5Y A; 4IPX A; 4JFJ A; 3O5M A; 5DIT A; 3RGC A; 4DRO A; 3KCE A; 2PV3 A; 3NTP A; 3PRD A; 4N19 A; 4ODQ A; 4DRN A; 4J4N A; 1FAP A; 4ODM A; 4O2T A; 1FKS A; 1D7I A; 2RSE A; 2KR7 A; 2XP6 A; 3IKD A; 4DT4 A; 4ITZ A; 4LAW A; 4ODK A; 5DIU A; 3O5P A; 5HUA A; 3UQA A; 1Q6H A; 2AWG A; 4TNS A; 2VN1 A; 4G50 A; 4DRI A; 2D9F A; 2MF9 A; 3O5R A; 5GPG A; 1PBK A; 2PPP A; 2XPA A; 5DIV A; 3KAD A; 2PV1 A; 2FAP A; 2IF4 A; 2XP8 A; 3JYM A; 4QIB A; 2ZR4 A; 4DIP A; 1PIN A; 1FKL A; 2N87 A; 2L2S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1W1Y A; 2MNT A; 4MNM A; 3IK8 A; 1ZBV A; 2VCD A; 1X6N A; 1ZU8 A; 4IT6 A; 3CGM A; 1HKJ A; 3CGN A; 4L3N A; 4LAV A; 1EIB A; 1JNS A; 1FKD A; 3IHZ A; 3CHD A; 3EY6 A; 2A3A A; 1KT0 A; 1LL7 A; 2B31 A; 1HJV A; 2YBT A; 2MLX A; 3B9E A; 1X6L A; 3RFW A; 1E6Z A; 1U79 A; 3KAF A; 3O5E A; 4GGQ A; 4GIV A; 5HWC A; 1E9L A; 4Z2K A; 1SR0 A; 2JZV A; 2KFW A; 1L1P A; 4QT3 A; 5HT1 A; 3NRK A; 1N1A A; 3AQU A; 4W9O A; 3ARP A; 1FJD A; 4JFK A; 1ZBW A; 3KAC A; 2DG9 A; 3ARX A; 3O5K A; 1W9U A; 3WH0 A; 4TX0 A; 4P8V A; 1OGG A; 1FKB A; 1H0G A; 2LPV A; 2F2D A; 2DT2 A; 1T11 A; 4DWS A; 1J4I A; 3O5O A; 3O5D A; 4ODR A; 3WL1 A; 4DWS B; 2XP3 A; 5B8I C; 4ZPT R; 1QZ2 A; 2RUQ A; 4NNR A; 1FKR A; 4ODL A; 3KAI A; 2EUL A; 4N19 A; 1W9P A; 4O2T A; 1D7I A; 2XP6 A; 4ITZ A; 3WQW A; 3WD2 A; 4DRI A; 2G41 A; 1PBK A; 3KAD A; 2PV1 A; 2F23 A; 3B9A A; 4DIP A; 1PIN A; 1ITX A; 4IQC A; 1J4R A; 3LUO A; 1ROT A; 4QT2 A; 3O5Q A; 4HAR A; 2RUD A; 4DZ3 A; 2PPO A; 3FAP A; 4W9P A; 5BXJ A; 3O5J A; 3UI6 A; 1K9T A; 3G6L A; 3UF8 A; 2DSV A; 3ALF A; 1F40 A; 4AY1 A; 1W26 A; 2LJ4 A; 4Z2H A; 1Y0O A; 3ARV A; 1H0I A; 1B6C A; 4TW7 A; 1ZBC A; 2ZQS A; 4MNJ A; 5GPR A; 3RME A; 2DT1 A; 3UI5 A; 2OLH A; 2M08 A; 3O5L A; 4JYS A; 1LG1 A; 3I6C A; 3B7X A; 1FD9 A; 4PTM A; 1FKJ A; 4Q7N A; 4DRP A; 2ETN A; 3ODK A; 4Q22 A; 4DRM A; 1JND A; 5DO2 A; 4DRK A; 1UR9 A; 4MTV A; 2PI6 A; 2DG3 A; 4TW6 A; 3NI6 A; 1EHN A; 3UQB A; 4C02 B; 1FKG A; 4FN2 A; 3RM4 A; 1D6O A; 3ALG A; 3PRB A; 2KE0 A; 1WB0 A; 4NSB A; 5HW7 A; 3CH9 A; 3EIP A; 4P8W A; 3ARY A; 1TCO C; 4WKF A; 2G8Z A; 4LAY A; 1RD6 A; 4TYO A; 4LGX A; 4BF8 A; 4URI A; 1KT1 A; 4U85 A; 5HBF A; 1JVW A; 2DSU A; 4G2P A; 2PPN A; 4P8X A; 2ITK A; 3PA7 A; 4FAP A; 4Z2L A; 3O5F A; 4ODO A; 1KFW A; 4ML4 A; 1E6R A; 2DT0 A; 1R9H A; 2ZQU A; 4DRO A; 2PV3 A; 3NTP A; 2RSE A; 4DT4 A; 3ARU A; 3GTY X; 5DIU A; 1Q6H A; 3PR9 A; 4TNS A; 2P4V A; 3ARR A; 4S3J A; 2D9F A; 4WKA A; 2MF9 A; 3O5R A; 5GPG A; 2PPP A; 1W1P A; 2FAP A; 4QIB A; 3W4R A; 1OGB A; 3WKZ A; 1GUV A; 2ZQV A; 4ZS6 A; 1LL6 A; 3OOB A; 1SYT A; 3G6M A; 2FKE A; 1GPF A; 4JFI A; 1D7J A; 4ZPW R; 2LKN A; 4W9Q A; 1WAW A; 2M1I A; 3ART A; 4HBO A; 1O6I A; 3RM9 A; 2XP4 A; 4J4O A; 1UR8 A; 4DZ2 A; 3H9R B; 2KGJ A; 3KAG A; 4DH0 A; 1FKI A; 4WKH A; 1XRV A; 3UI4 A; 4WIW A; 1NWS A; 5DF0 A; 2RUR A; 1OWQ A; 2ZQT A; 4JFM A; 1J4H A; 5J6E A; 1HKK A; 1BKF A; 4ODN A; 4KR0 B; 1Q1C A; 5HW8 A; 4L72 B; 5D75 A; 4WK9 A; 1E15 A; 3KAB A; 3WD1 A; 3IKG A; 5HWB A; 1JNT A; 2PV2 A; 3O5G A; 3WD4 A; 1NWU A; 1FFR A; 1E6N A; 4IQ2 A; 1J6Y A; 5GQB A; 2ZR6 A; 1E6P A; 1ZK6 A; 1QPL A; 3FXY A; 2DSW A; 2F4E A; 1QPF A; 3AS1 A; 3CHF A; 2Y78 A; 4JFL A; 4Z2G A; 2A3B A; 2XP9 A; 2WK2 A; 3CHE A; 3WD3 A; 4MSP A; 2ESC A; 4R0X A; 1Q6U A; 1FKT A; 2AOS A; 2DG4 A; 2RQS A; 4XAK A; 4WJX A; 3JYJ A; 2PBC A; 1C9H A; 3ARQ A; 1ROU A; 2WLY A; 4Z2I A; 1F8A B; 1EQ3 A; 2ZR5 A; 4R5E A; 1W9V A; 1E44 A; 5HTG A; 3KZ7 A; 4LAX A; 5DIT A; 4JFJ A; 3KCE A; 3PRD A; 4UDM A; 2A3E A; 2DPE A; 4DRN A; 4MAV A; 4MNL A; 4ODM A; 2KR7 A; 4LAW A; 4HBE A; 2B5U B; 4ODK A; 2AWG A; 1HKI A; 4G50 A; 2A3C A; 1NWR A; 1LG2 A; 5DIV A; 2XPA A; 2IF4 A; 3JYM A; 1NWT A; 2ZR4 A; 1ZB5 A; 1FKL A; 3UQA A; 4P8U A; 3ARZ A; 1LL4 A; 2WM0 A; 2M2A A; 5JH8 A; 2YBU A; 2DT3 A; 3TC5 A; 4ODP A; 4U84 A; 1HXV A; 2RUC A; 1JNE A; 1VF8 A; 4KQZ A; 2UZ5 A; 3WD0 A; 3BMB A; 4DRH A; 3AS2 A; 4MPK A; 1BL4 A; 4TW8 A; 2XPB A; 4DRJ A; 1HJX A; 2Q5A A; 3QOK A; 1IX5 A; 1ZCN A; 1GRJ A; 4IT4 A; 3WIJ A; 3ARO A; 1CTN A; 2XP7 A; 3VAW A; 3AS3 A; 1A7X A; 1D7H A; 1YAT A; 1LJY A; 3TDB A; 2O9O A; 4MGV A; 1FKK A; 3WQV A; 1LQ0 A; 3RM8 A; 5I98 A; 4DWS D; 2MPH A; 1FFQ A; 3TCZ A; 3WL0 A; 2O92 A; 2QF8 A; 3OA5 A; 1W1T A; 1HJW A; 3MDY B; 1NMV A; 2F21 A; 1NSG A; 1NMW A; 2KO7 A; 2LGO A; 2OFN A; 1FKF A; 4NZC A; 1Q6I A; 1P5Q A; 3CZ8 A; 4S3K A; 4DRQ A; 4W5U A; 4Z2J A; 5HW6 A; 2DSZ A; 2KI3 A; 1JCH B; 3B8S A; 2IUZ A; 3CHC A; 3ARS A; 2FDM A; 3JXV A; 1ZL1 A; 3FY1 A; 4U86 A; 2XP5 A; 3KAH A; 5HKG A; 2MLY A; 3GU0 A; 1EDQ A; 4QZV B; 1WNO A; 3O5I A; 1W1V A; 1XHG A; 3GPK A; 2MLZ A; 4ZPV R; 2K8I A; 4DWS C; 1FKH A; 1YW5 A; 5DEZ A; 3UQI A; 1GOI A; 3BXW A; 1NH6 A; 1EYM A; 2WLZ A; 1M5Y A; 4IPX A; 3O5M A; 3RGC A; 4ODQ A; 3B9D A; 4J4N A; 1FAP A; 1D2K A; 1FKS A; 3AS0 A; 1ZBK A; 3IKD A; 4MNK A; 1TFV A; 3O5P A; 5HUA A; 2PN0 A; 2VN1 A; 3ARW A; 2XP8 A; 1HKM A; 2N87 A; 2L2S A; 3PRA A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1W1Y A; 2MNT A; 4MNM A; 3IK8 A; 1ZBV A; 2VCD A; 1X6N A; 1ZU8 A; 4IT6 A; 3CGM A; 1HKJ A; 3CGN A; 4L3N A; 4LAV A; 1EIB A; 1JNS A; 1FKD A; 3IHZ A; 3CHD A; 3EY6 A; 2A3A A; 1KT0 A; 1LL7 A; 2B31 A; 1HJV A; 2YBT A; 2MLX A; 3B9E A; 1X6L A; 3RFW A; 1E6Z A; 1U79 A; 3KAF A; 3O5E A; 4GGQ A; 4GIV A; 5HWC A; 1E9L A; 4Z2K A; 1SR0 A; 2JZV A; 2KFW A; 1L1P A; 4QT3 A; 5HT1 A; 3NRK A; 1N1A A; 3AQU A; 4W9O A; 3ARP A; 1FJD A; 4JFK A; 1ZBW A; 3KAC A; 2DG9 A; 3ARX A; 3O5K A; 1W9U A; 3WH0 A; 4TX0 A; 4P8V A; 1OGG A; 1FKB A; 1H0G A; 2LPV A; 2F2D A; 2DT2 A; 1T11 A; 4DWS A; 1J4I A; 3O5O A; 3O5D A; 4ODR A; 3WL1 A; 4DWS B; 2XP3 A; 5B8I C; 4ZPT R; 1QZ2 A; 2RUQ A; 4NNR A; 1FKR A; 4ODL A; 3KAI A; 4N19 A; 1W9P A; 4O2T A; 1D7I A; 2XP6 A; 4ITZ A; 3WQW A; 3WD2 A; 4DRI A; 2G41 A; 1PBK A; 3KAD A; 2PV1 A; 3B9A A; 4DIP A; 1PIN A; 1ITX A; 4IQC A; 1J4R A; 3LUO A; 1ROT A; 4QT2 A; 3O5Q A; 4HAR A; 2RUD A; 4DZ3 A; 2PPO A; 3FAP A; 4W9P A; 5BXJ A; 3O5J A; 3UI6 A; 1K9T A; 3G6L A; 3UF8 A; 2DSV A; 3ALF A; 1F40 A; 4AY1 A; 1W26 A; 2LJ4 A; 4Z2H A; 1Y0O A; 3ARV A; 1H0I A; 1B6C A; 4TW7 A; 1ZBC A; 2ZQS A; 4MNJ A; 5GPR A; 3RME A; 2DT1 A; 3UI5 A; 2OLH A; 2M08 A; 3O5L A; 4JYS A; 1LG1 A; 3I6C A; 3B7X A; 1FD9 A; 4PTM A; 1FKJ A; 4Q7N A; 4DRP A; 3ODK A; 4Q22 A; 4DRM A; 1JND A; 5DO2 A; 4DRK A; 1UR9 A; 4MTV A; 2PI6 A; 2DG3 A; 4TW6 A; 3NI6 A; 1EHN A; 3UQB A; 4C02 B; 1FKG A; 4FN2 A; 3RM4 A; 1D6O A; 3ALG A; 3PRB A; 2KE0 A; 1WB0 A; 4NSB A; 5HW7 A; 3CH9 A; 4P8W A; 3ARY A; 1TCO C; 4WKF A; 2G8Z A; 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