3CHDA

Crystal structure of aspergillus fumigatus chitinase b1 in complex with dipeptide
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Aspergillus fumigatus
publication title Structure-based dissection of the natural product cyclopentapeptide chitinase inhibitor argifin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
total genus 145
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2008-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3chdA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3chdA01
3LPPA 1ZBKA 1PAMA 1C8QA 2Z1SA 3VD4A 4JIEA 3UERA 4URIA 1W3JA 1WCGA 4PMQA 3MSGA 5FKYA 1J11A 4PMYA 1QHOA 1E56A 5GNZA 5ECUA 1X1NA 1GCYA 4JHZA 2WANA 1OWQA 1QVBA 2C7FA 1CDGA 5LA0A 3EDJA 3ARQA 1PIGA 4ML4A 2PWDA 1PZ3A 4E8CA 3FAWA 3ZSTA 1W2VA 3EDFA 1QW9A 3OB8A 1V3KA 1B3YA 3CO4A 1E70M 4PUDA 4ZE5A 3ZIZA 3WSUA 1D2KA 3AFBA 4H2CA 5EBAA 4DWSD 1CLVA 5C8BB 3VX0A 2WSKA 3MMUA 1GHRA 4D72A 2XSBA 5A6BA 2WMIB 4AZCB 3ARPA 3MO4A 1Q6CA 5CJ5A 3MU7A 3W82A 3T2OA 4UZUA 3ZO9A 1E5NA 3WMBA 4W86A 3UG3A 3NSMA 1M04A 3L4ZA 1KXTA 1E3XA 2GFTA 1W1TA 4ZE4A 1OM0A 1OIFA 1ODZA 3UETA 2FGZA 1DWHM 1VIWA 1EO7A 2YL6A 5CSYA 4AY1A 1QNQA 3OG2A 5I6SA 1MW3A 1WZKA 2VOTA 2XVGA 5ABHA 2QMKA 4MDPA 1CGYA 5GNXA 4AZ6A 2VX7A 4H8VA 5LYRA 8A3HA 9CGTA 2NSXA 2QF8A 3N04A 2WVSA 2DT1A 2OLHA 1EA9C 4KGJA 4M82A 1CWYA 2VZSA 3CIVA 1UUQA 8CGTA 1FFRA 4WSJA 1W91A 3QHOA 1I1XA 5D9PA 5ABEA 4CU6A 1MQRA 4P7RA 3FY1A 3AMDA 1MW1A 4JKMA 4WLCA 4MAZA 4M56A 3ZMRA 2UY4A 4HOXA 1CXFA 4MDOA 2VO5A 1W1PA 1CLXA 1UG6A 3WD3A 2VVSA 3M07A 1VBRA 3WEMA 5FD0A 4EAMA 3ZOAA 2EPLX 3WH5A 3WF1A 4BF7A 4F9JA 4ZENA 5EMYA 2Y8KA 5E6ZA 1C7SA 3KEHA 3WL0A 2J79A 2J7DA 3AS0A 4H8HA 3CHCA 1XHGA 3AROA 4R27A 1X6LA 4PMOA 1XCWA 1OGSA 3U5YA 3KZSA 1M01A 1ZBWA 4CUCA 1HF6A 3I3EA 2FHBA 3WD4A 1BFNA 2PBGA 2WBKA 3AOFA 3N18A 3IAQA 1FH9A 2XFRA 3CLWA 4U31A 3CZJA 4RL3A 3ARZA 4DWSC 3GNOA 1W9XA 3BH4A 1US2A 1XD1A 4GPNA 1G9HA 4AZHA 3TP4A 5BXSA 2AMGA 2WCAA 3MV11 3L2LA 2OWWA 1UKSA 1JYWA 3MUZ1 4J3UA 4CKQA 4CD7A 1S46A 3QHMA 4PRWA 4U2ZA 3WDJA 4PTMA 1KFWA 1W1VA 5DT7A 2BVYA 2VJXA 1FP9A 2VRQA 3EDKA 1KXVA 3L4VA 1UD5A 1U33A 1J18A 1E6SM 3VD9A 1R85A 4AD3A 1JZ3A 4V27A 3PHAA 3W0KA 3KL3A 7A3HA 1UKPA 3T0AA 2NT1A 3RIKA 1E55A 3GH5A 4B3LA 2QHAA 1EO5A 5LA2A 2QPUA 2V3FA 3WF3A 4U33A 2J77A 1XH1A 1HXJA 5EFDA 2BHYA 3BSHA 4QP0A 1DWJM 1GJWA 1KXQA 1JZ5A 3PZGA 2VCBA 2XM2A 1OD8A 5AYIA 1D3CA 1BG4A 1E6RA 3N17A 1E3ZA 4W7WA 1WKYA 1GQLA 5LA1A 3AZTA 2ZUUA 1BGGA 1UR2A 3U7BA 1JYXA 1CBGA 2WZEA 3IJ8A 1K9TA 3NDYA 5CQ1A 2VT0A 3MKKA 2AOSA 2F61A 2GK1B 2X0YA 3SEPA 5EB8A 1JL8A 2V3GA 4FF5A 4A3HA 4J3WA 2A3CA 4U5KA 3BGAA 2CYGA 3CUHA 4Z2JA 1ISZA 1DTUA 3WUGA 1GOWA 3VD5A 2GK1A 1W32A 1GQIA 2OYKA 3TTOA 1AQMA 4UFKA 1UH2A 2PWGA 1B3ZA 2XG9A 3OZOA 1CPUA 1O7AA 3TTSA 1JDAA 2YL9A 1XYFA 2W62A 2WCGA 1UR8A 3ALGA 4W8LA 2XPKA 3BAWA 4ZFMA 3WF0A 1VF8A 4CD4A 1IV8A 4JFTA 1QNRA 1UH3A 3CZ8A 5HPCA 4OBSA 1TUXA 3BMWA 1NOFA 2WHJA 4MB3A 3NIYA 1P6WA 2RGLA 1WZAA 1ISVA 2CHNA 3VU2A 4AYSA 4QLJA 6A3HA 2EXOA 1JAKA 4NSBA 1JIBA 3GBDA 2D0HA 4LPCA 1ISWA 4QLLA 2D1ZA 2YLLA 5BRQA 1QHZA 3F5JA 3UG5A 1Q6DA 3VMNA 1F4HA 2XVLA 3W25A 2O9OA 5BCAA 3K4DA 3SCOA 2CBIA 4ACYA 1DWFM 1UD4A 1B3VA 1XSIA 1JI2A 1JZ6A 2VVNA 1ITCA 3BLKA 3WIJA 4JFWA 4U2YA 3WD0A 3CTTA 2J7CA 3SUWA 2OSXA 1WZLA 1F4AA 3RM8A 1SMDA 2FHFA 2GJXB 2ZX6A 1FHDA 4ACZB 3WQWA 2G3NA 5BWFA 1JZ8A 1JYNA 1RP9A 2J75A 4M24A 3W6MA 1VB9A 3S2CA 3FW6A 5CLTA 2ZX7A 3WQVA 2XSAA 1LL4A 4IPNB 3II1A 2DIEA 4YPJA 2B31A 4WKAA 4W8AA 4B9YA 4BCEA 1BGAA 1LL7A 1A3HA 1WDQA 2WC7A 4L4OA 3VIHA 2XVNA 2VQUA 1R86A 3WDHA 1V0MA 4NZCA 3GYCA 4IM4A 1EDTA 1B1YA 2F8QA 2V3DA 1NARA 3PZOA 2XFYA 2E4TA 3ZM8A 2ESCA 5IFPA 3OGVA 3W26A 4OZOA 2PF0A 5CG0A 2DH2A 3BMVA 3SCQA 4BQ3A 1GOIA 1V6WA 1BLIA 4CD5A 4Z2IA 4W85A 3PZNA 4AXNA 1JF6A 2EO7A 3OLDA 4CD6A 1PX3A 1HKIA 3K46A 4HMEA 3BSGA 3WH9A 4D1IA 1G5AA 3FHQA 2X09A 5CGTA 1XSKA 1H1NA 3S6TA 2DGAA 4UQBA 3A4AA 1HX0A 3SCPA 1QNSA 3L4XA 4DUWA 1DWIM 2GJPA 2WLZA 3EBVA 1LG1A 4TXEA 1E6ZA 4XV0A 1W9UA 1OGBA 3GH4A 2EJ1A 1KCLA 2XHYA 4Q7NA 3OGSA 5A6AA 5M3WA 1GOQA 1V3LA 2DSKA 2ZWYA 3CZEA 2YDQA 5FL1A 3QOKA 2BXYA 2XJ7A 2W4XA 5I79A 1CENA 1LJYA 3WD1A 7CGTA 1JI1A 3M46A 3IAPA 1XD0A 4C7GA 1TA3B 3SIMA 1JD9A 3WNNA 3AMKA 1E6NA 4LYRA 1LLOA 4EANA 3VDAA 3T08A 1C90A 3IANA 1NP0A 1KQYA 5JBEA 4UOJA 1HJWA 1TFVA 4TUFA 1TA3A 3HJEA 5M17A 4WKFA 4M81A 1K9DA 3DC0A 5A8MA 5CPQA 1BAGA 3GXIA 3AXIA 5GNYA 3EMCA 4U3CA 3SUSA 4PSPA 5DEZA 2UWFA 4ZXOA 3F5LA 1VJZA 1WP6A 1QNOA 3AHTA 1UR9A 3APGA 2CHOA 2F2HA 4OIFA 3D3AA 4ATLA 1GUVA 5AC4A 3WNKA 1OT1A 1YHTA 3AYRA 1Q6GA 4DM2A 1KGUA 2NW0A 3EDEA 3GNRA 4OKDA 2AAAA 4PBGA 3T09A 5DMYA 3VUPA 1HJSA 1JXJA 2WVTA 4LGXA 4A4AA 4D71A 5IDIA 1Q6EA 1E6PA 3W38A 1UD3A 2V38A 1J0KA 2WMGA 1G1YA 3AIEA 2OYLA 3RDKA 3WELA 5A95A 2DH3A 1WB0A 1V03A 2BS9A 5GPRA 1JGIA 3RO8A 2A3BA 1SR0A 1EXPA 2WSPA 4UFMA 4AZ7A 4BS0A 3DHPA 5ABFB 2GVYA 4JL1A 5A3HA 5KZ6A 2DSWA 3BAYA 3EDDA 3THCA 1CXEA 3AS2A 4LYPA 1EQPA 2Y8VA 1HP4A 2EPNA 5ABFA 3U7VA 3VNYA 3QOMA 1TE1A 1E0WA 3VIGA 3ARXA 1ZJAA 2Y2WA 2WZHA 3W37A 2QMJA 1L0PA 4UZSA 1H3GA 2J74A 4H8UA 3ARSA 3RM9A 1WO2A 1EDGA 3LMYA 2O9PA 1KXHA 4AZBA 3CZGA 4AZ5A 3WUEA 2ZUSA 3WH8A 3NSNA 3N11A 5I78A 4QCEA 3VMOA 3UEQA 1JDDA 2X8RA 3KE0A 4K68A 1BQCA 3N12A 5IHSA 5CXPA 1W1YA 4AD1A 3WENA 4D6JA 3VILA 3VD3A 2D23A 4X9YA 1OIMA 1BPLB 1VFOA 3I3DA 5AYBA 2JIWA 2VZOA 2W91A 4JKLA 3AI0A 1V6YA 5AC5A 4X0VA 1HKJA 2WMKA 2DIJA 3M7SA 1FP8A 4W5ZA 3MUY1 2XVKA 4J27A 2DSZA 3AXXA 3BXWA 4Z2HA 2YBUA 1OBAA 2HISA 4AEFA 3T0BA 4AD0A 4J3XA 4FLSA 5M03A 4MAVA 1PJ9A 4FK9A 1E4LA 3MANA 3A47A 1UR1A 1GVIA 2J7BA 1OT2A 2FGLA 1EIBA 4KRUA 1FH8A 1C92A 4EE9A 1WDSA 1W3HA 4J3TA 3QGVA 3GZAA 1WAWA 4QDMA 4BQ5A 5KEZA 3PZ9A 1Q6FA 5D9OA 3K4AA 2ZXQA 1QPKA 1WZMA 1JZ7A 1HJQA 2VZTA 3WD2A 2JEPA 2GUYA 5E0CA 2XYLA 6TAAA 1CGTA 2DSUA 4P7OA 1E71M 4M8UA 1UD6A 5A8OA 3TOPA 3AHYA 2OSWA 1K6AA 2BNJA 4MTVA 3MUAA 4QFUA 3VIFA 2YOCA 4HOZA 1G94A 4Q22A 2GSJA 2CETA 1N82A 3WBEA 5DF0A 4NI3A 1GQJA 4JCLA 3GTNA 2VX6A 3BAIA 4J7RA 3TTYA 4AW7A 3G6MA 3VGFA 4D6FA 2GDUA 3KL0A 1H09A 1LQ0A 3LPFA 2EPMX 2V3EA 3HU7A 2J7GA 1M03A 4V28A 4UOQA 3AYSA 2OWXA 2VMFA 2VUYA 4AEEA 1HJXA 2DPEA 4PCTA 3W28A 2OYMA 2D22A 1E40A 1LF1A 4CN4A 1NOUA 4LXFA 2FH8A 5I23A 3AXHA 4UQAA 2VNCA 4PTWA 4BZYA 1B31A 4CVUA 3BCFA 3NJ3A 1UOKA 2WC4A 4X0NA 4TTGA 1UWTA 2WMFA 3KL5A 4N42A 1GQKA 1AMYA 3VGDA 1OSEA 1U2YA 1JFXA 3AIUA 1WNOA 2E0PA 2QLYA 2WW5A 4EK7A 3PZQA 3VIJA 2ZXBA 3WQ4A 4CN6A 2PWFA 2EEXA 1J0JA 2D24A 3VDCA 3CHDA 1QI3A 1FFQA 2VX4A 1NWSA 3POHA 1HN1A 1XH2A 1DHKA 2J78A 5BXTA 1OCQA 1V02E 2DQXA 3SURA 3VD7A 1MW2A 1EOKA 4UQEA 3L4UA 1E1EA 2ZUMA 1ZU8A 4DWSB 5EFFA 2Q8XA 1EHAA 1KWKA 3SCTA 3BCDA 1H4PA 2D3LA 5D9MA 1QI0A 2CKSA 3GXFA 3CBWA 4OUEA 2VCAA 2XTKA 3K8LA 1XH0A 4B9ZA 2JE8A 4DWSA 4U3AA 1UWUA 4J3VA 1XRVA 2GDVA 1U30A 2ZX5A 4B16A 2E9BA 3J7HA 3GH7A 4H04A 2XM1A 1BHGA 4D6DA 1NWUA 1MQQA 3CUGA 4TX8A 3BLPX 1X6NA 3D5HA 3T2QA 4W7VA 1KR0A 3WQ5A 3ZT7A 3OBAA 4W88A 3GXMA 4MJ4A 4NRRA 5E0FA 1ZS2A 3B9EA 1AQHA 3SCNA 2MANA 4J3SA 5A6MA 1C7TA 1VAHA 3O2LA 2C0HA 2JIEA 4HA1A 2WYSA 1V3JA 4AD2A 4W8BA 2J47A 1CIUA 1W2PA 2CNCA 3L4WA 5A6BD 3T2PA 4F79A 1VRXA 3K1DA 5JIPA 2O92A 3ARUA 2YBTA 1KR1A 2YA1A 2FDMA 2PWEA 3DHUA 3AISA 3A4XA 1ZJBA 4HP5A 4WKHA 1CXKA 1GVYA 2ZUWA 3K8MA 5BYWA 3WFLA 5A1AA 4DUXA 1H49A 1LWJA 3MUIA 4HOWA 5IHRA 3L4YA 4MNMA 3ZJ8A 2CBUA 4A3YA 2QPSA 3SCWA 1NOWA 1HVQA 4HTYA 5A69A 2ZE0A 3I3BA 3ARVA 3NYDA 1NQ6A 2PWHA 4AC1X 3DYOA 1GNXA 2PI6A 2DT3A 1HP5A 2NT0A 2FHCA 3O6AA 3VX1A 4D6CA 5CSUA 3F4VA 3L4TA 1PIFA 3AIVA 1WDPA 1BTCA 5A94A 4YHGA 1AQ0A 2WC3A 2X05A 4RE2A 1BF2A 1AVAA 2J8FA 3OA5A 1C8YA 5FL0A 5BROA 2VZUA 4CU8A 3AJ7A 4PSRA 3VINA 3ZJKA 2WKGA 2J7HA 1CECA 1HVXA 3AS1A 2VR4A 3AZSA 4OJYA 2BHUA 3F5KA 1PEZA 3GDBA 2YA2A 1ESWA 3WH7A 1JZ4A 3WNOA 1BSIA 3ZJ7A 2V5CA 2QV4A 1HL8A 4MB5A 4P7NA 3PZIA 3W81A 3VKKA 2W63A 3WEZA 1SFSA 5D8WA 3CZKA 5JUVA 1UQYA 3VGEA 5HXMA 3RJYA 4C7FA 1QBAA 5HBFA 3SUTA 5I24A 3CH9A 5GQBA 4FLRA 3WUBA 5E70A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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