3WD3A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Serratia marcescens
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase B
total genus 161
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd3A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd3A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd3A01
2ZWYA 1C8YA 1UR9A 4J7RA 1KWKA 3D5HA 4P7OA 1UUQA 1MYRA 3PZMA 2VI0A 5DEZA 4Y7EA 4JL2A 1JD7A 2BS9A 1JF5A 4XZWA 2YL9A 3VD3A 1K6AA 1EOMA 5E6YA 2YIHA 3W26A 2WAGA 4DWSC 4DM1A 1E70M 5GNZA 2BY0A 1NWUA 4S3KA 4J3VA 3RMEA 3RO8A 3ZJ6A 3AXHA 3UEQA 1LL6A 3FW6A 2J25A 3CPUA 4RL3A 2ZXDA 4KGJA 1UWUA 1GHRA 5D4YA 4MNJA 1UWTA 4GI8A 1EHAA 4ZENA 2VCAA 3OZOA 3L4YA 1YHTA 4ATLA 3WUGA 4AY1A 3PHAA 1KQZA 1QBBA 4ACZB 2WHMA 3WL0A 4PMOA 2VX4A 1AQ0A 1UQYA 3BC9A 4H8VA 1BGGA 1NOWA 2E40A 2WKGA 4D6DA 2VOTA 4GPNA 5HOSA 6A3HA 3AHXA 1XH2A 1QPKA 1E9LA 4RE3A 1H4PA 1UKTA 3K4DA 4KGLA 1GVIA 1UYQA 3T2PA 1GQKA 1V6XA 4JCLA 2PC8A 2V3GA 1I75A 3GNRA 4TVCA 5GPRA 3BAKA 3O2LA 1PX4A 5A8MA 1V0LA 2FHBA 2VRQA 2OSXA 1CGWA 1FP8A 1US2A 1JIBA 4DWSA 2EPOA 4U3AA 2G4FA 2RGMA 2BNJA 1HJSA 2YL6A 1UD2A 3L4ZA 3IJ8A 5HDRA 2VVSA 4MB4A 2EEXA 2VZUA 1HKKA 1XC6A 2X1IA 3VUPA 5A8PA 3CZJA 3POHA 2X0YA 2OWXA 1JL8A 1OWQA 2DQXA 3CHEA 3VD9A 2Y24A 1KB3A 1UWSA 4QDMA 5M5DA 4QP0A 2QMJA 5CGTA 4TTGA 5A2CA 2DT0A 3G6MA 3CHDA 2UY2A 2WBGA 5A6BD 3EYPA 1LL7A 3VM5A 1UZ1A 3JUGA 4D6GA 1ZBWA 2AOSA 2D0HA 4R27A 2WANA 1BVZA 4D6JA 4LPCA 4YN5A 2C0HA 1KGWA 1UOKA 4D6IA 4CU8A 3WH9A 2ZUNA 2YDQA 1KXTA 2DGAA 1ISZA 2WC4A 4W93A 2GJXB 1SFSA 2WCGA 4KRTA 4FF5A 3VNYA 1RH9A 1G1YA 3QGVA 1BYDA 5IFPA 1CLXA 4HTYA 3ARTA 1JI1A 1E4LA 3CO4A 3W4RA 1J0JA 3OIHA 1ECEA 1LG1A 1DHKA 3MV11 4QFUA 1KR1A 1OIMA 1CBGA 2YL5A 2WSKA 1V3JA 3M6DA 1DEDA 2ESCA 2VRKA 2CESA 5JBFA 1EHNA 4F8XA 2ZUMA 2JIEA 4AXNA 4UZSA 1VF8A 3O6AA 2X8RA 1H0IA 3W0KA 1LF1A 4Z2LA 1TG7A 2OSYA 2NT1A 1E0XA 3BMWA 5A2BA 4JCMA 1JYVA 5I23A 1XH0A 1WO2A 2VZSA 1JZ3A 4PCSA 1RP8A 1HNYA 2O9RA 1ED7A 4UFKA 3SUWA 1GQLA 3VD4A 2J77A 1J10A 2XTKA 1H3GA 4OOUA 4AZGA 3W81A 3GNPA 1QI5A 3MANA 4H8UA 3W6MA 4PCTA 2PWFA 2Y8KA 3N15A 1QW9A 4CCDA 1NWSA 1U2YA 2WHJA 4A3YA 3VDHA 1EOKA 4V27A 2CBUA 1UH2A 2VX7A 3M07A 3AXXA 3WDPP 2XVKA 5BYWA 4W88A 1SR0A 4PTMA 2J7DA 2IXUA 4PMZA 2QV4A 5A6MA 4BQ3A 1ZJAA 4JFVA 5A69A 5BROA 2HVMA 4BZYA 1CXEA 1ITCA 3WBAA 4OOZA 3VINA 1MQRA 1XD0A 2W91A 1ISXA 1E3XA 2WMIB 7CGTA 4GXPA 5HNNA 1J9YA 1TVPA 1OSEA 2EO7A 2WWCA 1OD0A 1HJXA 1UZ4A 3LPPA 5JUVA 1WKYA 4Z2JA 3VIGA 2UY3A 2D2OA 4MAVA 2XFYA 3E1F1 4F9DA 2W92A 1WB0A 4UOJA 1EQPA 3TTSA 3VIFA 3VIPA 4MPKA 1H2JA 2Y5EA 1UD4A 4W5ZA 1JZ4A 5F7UA 1HX0A 2GJRA 3VO0A 1WPCA 1EDQA 3CZLA 4JKLA 3FAXA 1D3CA 2E3ZA 4PMUA 2JFEX 2GFTA 1AIWA 2ZXQA 1D2KA 4Q22A 3GZAA 3EMQA 3RDKA 1XYZA 1V0MA 2G3JA 4BQ5A 3W29A 5BCAA 1GW1A 2GVYA 3WEOA 1UA7A 1W9BM 3THCA 5JIWA 3NUKA 3NDZA 1QNPA 3ZJKA 8CGTA 3A3HA 3OA5A 3OZPA 2QF8A 3ALGA 4QLLA 5IHSA 2D3NA 3PZGA 4WKFA 2VCBA 1PZ2A 3UG5A 3CHCA 3TA9A 1KXHA 2JALA 3TONA 2JEPA 2W4XA 4UOZA 3EDFA 2W62A 1ODZA 1VBUA 1BF2A 4LYPA 6CGTA 1H41A 3QOKA 1LWJA 5A6AA 1MVYA 3B9DA 2Q8XA 4U33A 3BAJA 4PMRA 3W25A 3AIWA 1HVXA 2E9LA 2VX5A 1ISWA 4EK7A 4UFLA 1QHPA 1C8QA 5ABHA 3GTNA 4GO8A 2J8GA 4X0NA 3SCUA 3ZJ7A 4AZHA 3WD2A 3BAYA 4FLQA 3VGGA 3ZO9A 4AIEA 1EGZA 3QHNA 3EBVA 3HU7A 1HJUA 3SCSA 1DP0A 3UCQA 2V38A 3VOCA 4AZCA 3UERA 2J4GA 5A95A 4OBSA 1AMYA 1CIUA 4PN2A 1SMDA 3WQWA 4UQCA 1QI2A 3WF0A 1I1XA 3MO4A 2UWFA 1GNXA 3HMCA 2JE8A 1W1YA 3WQ6A 2VMFA 3WELA 1M53A 1W9VA 5I5RA 5CZKA 3ARWA 3SCVA 4UFHA 3UG3A 1K9EA 2XM1A 1V3MA 5ABFB 5HXMA 1WDSA 3BH4A 1VJZA 1KGXA 3BCFA 3VDAA 1XD1A 3WH6A 3UR8A 1ZU8A 2WW5A 3OGRA 3K46A 4H41A 4ZFMA 3NJ3A 1VFUA 2UY4A 5FIPA 4GZIA 1WZLA 4PMDA 3AS1A 1E5JA 3ZIZA 1V02A 1WE5A 5GQBA 1WDPA 1H49A 3N9KA 4E2OA 1KXQA 4CD5A 3AZTA 1EO7A 3NSMA 4PEEA 2WVUA 5E09A 3VPLA 5A6KA 4MNKA 2J7BA 4HZ6A 1UD5A 3WD0A 1BFNA 2RTSA 1BQCA 3AMGA 4U2YA 4GIAA 2AAAA 3GNOA 4GQQA 1PJ9A 3RIKA 3ZOAA 1Q6GA 2XVGA 2E4TA 2ZWZA 3SUVA 4UR9A 3ARRA 2PBOA 3VIOA 4CGTA 3ZQ9A 3T2OA 2TAAA 4BCEA 2CKSA 1JZ2A 4NI3A 4YHGA 2FHFA 2CNCA 1E71M 1MQPA 1TE1A 3WIJA 1ZBCA 3SUTA 3VX0A 1E0WA 3ARYA 2GJPA 1WDRA 1DWHM 3FNDA 1X6LA 5I24A 1W3HA 4LXFA 2VZOA 2J7EA 1R87A 1R8LA 2V5CA 4HZ7A 1OD8A 1V6VA 2EPNA 2WLYA 1GOKA 2DIEA 1JD9A 2PWEA 2VZVA 2XIIA 1O7AA 5I77A 2AMGA 1WAWA 3KL5A 4X0VA 3OLGA 1MW1A 4U5IA 2CHNA 1E55A 4DM2A 4MB3A 4WSJA 3FXYA 1W9PA 1CNVA 1KR0A 3QHOA 2WCSA 2WMGA 2DT3A 1A3HA 5JH8A 4ACZA 2WZHA 3AIQA 4M29A 3ZSTA 3WENA 1QHZA 2PWHA 3DHUA 3WFZA 3AMCA 1JZ7A 2BVDA 1J18A 1UR0A 2YDRA 4UOQA 3VGBA 3PN8A 4W87A 3GXDA 3B9EA 3ZSSA 3VDBA 1HT6A 3BAIA 4WIWA 1JG9A 4W86A 3S6TA 4HA4A 3K8MA 1UKPA 2A3CA 4PMVA 1ISVA 1E5NA 4MDOA 1FOBA 1OT1A 1VEPA 2EQDA 3GH5A 3J7HA 2XGIA 5HPOA 4JHZA 3WQ8A 2WSPA 4AZ5A 4DUVA 4P8XA 1DWJM 1CYGA 4MDPA 3L4UA 3BMVA 1MW0A 5D9NA 1HP5A 1B31A 1RP9A 2Y4SA 3CH9A 1MXDA 1QW8A 5BXPA 1M04A 2VR4A 1E1FA 4V28A 4TVUA 3O9NA 3WDJA 3AS2A 3SEPA 3MUAA 3W38A 1HJWA 3SCWA 5A2AA 3VIIA 4Z2KA 5I0DA 4WF7A 3PTMA 2J74A 3NYDA 5CPSA 3SCPA 2PBGA 3NDYA 4DWSD 1GHSA 1M7XA 3AS0A 4A3HA 1JDAA 3T09A 5D9OA 3I3BA 3DECA 4B9ZA 3BGAA 4CUCA 1Q6FA 1A47A 3TTOA 3N12A 4GINA 1NWTA 2W66A 1UKQA 1BYBA 2X2YA 2GJXA 3F4VA 4CD8A 3U7VA 3A6OA 4IUGA 2XYLA 5I6SA 2W61A 2ZXBA 3POCA 5FD0A 1JGIA 3SCNA 3IANA 1SMAA 1UKOA 4J3XA 1JZ8A 3MUIA 2WZEA 5A1AA 2E0PA 1L8NA 3CLWA 2YKKA 3AMDA 1KBKA 1TZ7A 1KCLA 1ISYA 2VVNA 3UG4A 1NH6A 3SIMA 4MB5A 4QLJA 2O9TA 4W84A 4QAWA 2XGBA 1HVQA 2VUYA 2ZIDA 1C8XA 2V5DA 4URIA 1AVAA 4BS0A 1QBAA 2BY1A 1J01A 1PIFA 4ZXLA 3SUSA 3VIHA 2X05A 2J8FA 4V2XA 2X09A 1JFHA 3SURA 1EDTA 3WUEA 3PTQA 1V0KA 3UESA 1GONA 1NOFA 2ZUTA 1E73M 1L0PA 1EA9C 2XFFA 3BLPX 1TCMA 2CERA 4P7QA 2WVVB 2WNWA 1VEMA 2BY3A 5LA2A 3RM9A 3ALFA 2XWEA 4CN1A 1HL9A 1W9UA 5DFAA 4W8LA 2ZE0A 1LJYA 4DWSB 4GI9A 2FGLA 2CETA 1K9DA 1C92A 3M46A 5A6LA 5BRQA 1PX8A 1U30A 4BF7A 4AD1A 2ZXAA 1WDQA 1B1YA 1R85A 3WF4A 1DWGM 5TD4A 1KQYA 1HKIA 5I78A 3L4VA 4KH2A 6TAAA 1Q6EA 2DT1A 1ESWA 1V3IA 2WBKA 3OLIA 3DHPA 2CPUA 2JF6A 3ARXA 1UWRA 2VT0A 1W32A 4AZ7A 3VD5A 2YBUA 4ZEPA 3WUFA 2DSUA 3W24A 4CN6A 3W82A 2EPMX 5DMYA 3W28A 1PX3A 1VBRA 4JFTA 1PZ3A 2CKRA 1JYWA 2DSKA 3S2CA 2E8ZA 1B0IA 4PMYA 2E8YA 4CVWA 2BXYA 5FOOA 1QI0A 3VM7A 1UA3A 2WMFA 4D6FA 2VC9A 4PRWA 2XUCA 3VGHA 4N42A 2IUZA 2EPKX 1EQCA 2DT2A 3WQVA 1CEOA 3F5KA 5E0FA 3NIYA 1E4MM 1OGBA 4JHOA 4U31A 4UQAA 3VD7A 3WDHA 3CZEA 4CCEA 1PEZA 1NARA 1Q6CA 2YOCA 3VILA 2NSXA 3VU2A 2C7FA 1N82A 5BWFA 1E6SM 1XSJA 2BVTA 3U5UA 3PZVA 3PZIA 4NF7A 2G41A 1V6YA 1BYAA 2J79A 2G3NA 2FH6A 3L2LA 5E0CA 4CU7A 3WUBA 1DWAM 1MQQA 4TVDA 4C7DA 1H11A 2CBVA 3IK2A 3UETA 5BXRA 4AD0A 1TVNA 1KGUA 1PPIA 1RD6A 4WKAA 1BVNP 4UCFA 1M03A 1HJQA 4HA3A 2XM2A 3WBEA 5JIPA 4W8AA 4IPNB 5ECUA 3L2MA 5CSYA 3MUY1 3NSXA 4UTFA 1GJWA 3GM8A 3T0BA 1C3FA 2RGLA 1E3ZA 2C8NA 5FL1A 1E1EA 1V03A 4CCCA 4M81A 3W6LA 1JF6A 1KFWA 1QNQA 1XYFA 2XWDA 3CBWA 3OG2A 2WHKA 4XV0A 5ABFA 1E6QM 3EMCA 4MNMA 1BSIA 2BHUA 5FKYA 2E9MA 1HF6A 3EDDA 4P8WA 4CN4A 2CHOA 4PUEA 3PZQA 4M80A 2BHZA 3K1DA 4PTWA 1OM0A 1ZL1A 1BAGA 4FK9A 2WC3A 2WMHA 4HOXA 4HPHA 4B9YA 1G5AA 1TR1A 2YLAA 1J0HA 4HOZA 1CGVA 1PBGA 1K9FA 4FMVA 1QOXA 2J78A 5M03A 4U5KA 4U3CA 2XHYA 4HPGA 2DDXA 3MU7A 3W53A 1BTCA 5EMYA 4AIOA 2O9PA 1NP0A 4EANA 2D3LA 1AQHA 4H7VA 3W37A 1UR1A 4F9JA 2D0FA 1J11A 2GDUA 1BGAA 5LA1A 2JIWA 1EH9A 1LQ0A 1V02E 3GXIA 3WH7A 2WVSA 4D6CA 3M7SA 2E9BA 1GOOA 4AD2A 1CWYA 1FFQA 4OUEA 3DYMA 2ZX5A 4UQDA 4AWEA 4H8HA 2XVNA 1OBAA 3ARSA 1S46A 1CDGA 2V3EA 1UD3A 3NSNA 4QCFA 1NP2A 4K68A 1X6NA 2BY2A 4UQEA 3N17A 4PMNA 1JYNA 3WDIA 3HJEA 3VTRA 4JKKA 1MFUA 1CECA 1V6WA 5IDIA 5EFDA 5JBEA 4AMCA 2OLHA 4W8BA 4GO9A 2BHYA 1ZB5A 1FP9A 1H5VA 5HPCA 5HBFA 2FGZA 2YLLA 1B3XA 2XVPA 5KZ6A 5LA0A 3B8SA 3RJYA 4TOQA 1UR2A 3MMUA 3U57A 2GUYA 2WB5A 3KEHA 4LYRA 2WM0A 2VTFA 2GK1B 1ODUA 4W7VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3QQ0 A;  1EZ2 A;  3T42 A;  1VGA A;  4NZJ A;  2QMJ A;  2DT0 A;  2PZN A;  4ILS A;  1UC4 A;  3CHD A;  2R1N A;  2WBG A;  5A6B D;  1WAU A;  1UZ1 A;  1ZBW A;  3CQ0 A;  2ZDR A;  3BOF A;  1W31 A;  4Y8E A;  4O4V A;  2OVL A;  4P5U A;  2C0H A;  3L25 A;  1KGW A;  1KXT A;  4A05 A;  3STF A;  1ISZ A;  2WC4 A;  4KBX A;  2Y7G A;  1KT1 A;  2ZBT A;  3C0S A;  4I9J A;  4KRT A;  3IPW A;  4FF5 A;  3VNY A;  1RH9 A;  1OFR A;  3QGV A;  1YNP A;  4H01 A;  3ART A;  2QCD A;  3A22 A;  3GS6 A;  4K39 A;  4ZGY A;  1UJP A;  2WSK A;  2Y2I A;  1JCM P;  4J35 A;  1RD5 A;  3IGS A;  2OJP A;  3TTE A;  3GTY X;  2Y7F A;  5HWN A;  4K37 A;  3UI6 A;  4TW8 A;  2CES A;  2M2A A;  3DKL A;  3M0L A;  1XDM A;  1VF8 A;  4UIO A;  4UB9 A;  2DJX A;  4I5X A;  1RCX B;  1LF1 A;  1TG7 A;  2E6D A;  1JYV A;  1XH0 A;  4PCS A;  3BGG A;  4OWG A;  1RP8 A;  4BHY A;  3ZLF A;  1FKG A;  2C6Q A;  2VGB A;  1ED7 A;  1UOZ A;  4CQ8 A;  4OQV A;  2A1Y A;  3VD4 A;  4QZV B;  1J10 A;  1TRI A;  3KCL A;  2XTK A;  3GQY A;  1A5O C;  4OOU A;  4HMN A;  1FKJ A;  1QI5 A;  1I0B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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