4S3JA

Crystal structure of the bacillus cereus spore cortex-lytic enzyme slel
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
431
structure length
429
Chain Sequence
FAIQIVTVRSGDSVYSLASKYGSTPDEIVKDNGLNPAETLVVGQALIVNTKGNNYYVQPGDSLYRISQTYNVPLASLAKVNNLSLKSILHVGQQLYVPKGTKRSVESIAYLQPSTIPIKESLVNATRAINPFLTYLAYFSFEAKRDGTLKEPTETAKIANIATQGQTIPMLVITNIENGNFSADLTSVILRDATIQNKFITNILQTAEKYGMRDIHFDFESVAPEDREAYNRFLRNVKIRLPSGYTLSTTLVPKTSSNQKFFEAHDYKAQGQIVDFVVIMTYDWGWQGGPPMAISPIGPVKEVLQYAKSQMPPQKIMMGQNLYGFDWKLPFKQGNPPAKAVSSVAAVALARKYNVPIRYDFTAQAPHFNYFDENGVQHEVWFEDARSIQSKFNLMKEQGIGGISYWKIGLPFPQNWRLLVENFTITKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
publication title Structural and functional analysis of SleL, a peptidoglycan lysin involved in germination of Bacillus spores.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cortical-lytic enzyme
total genus 148
structure length 429
sequence length 431
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4s3jA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4s3jA02
1BLIA 3POHA 1X6NA 4MDOA 1UH2A 5AC5A 3RM9A 3K4AA 2HVMA 4JFWA 3IK2A 3CZLA 3VNYA 3SCUA 1J0ZA 2G3MA 1E4MM 3RJYA 3W81A 3G6MA 3BMWA 1CENA 1D3CA 4PYSA 2YIHA 1JYNA 2ZUSA 3POCA 1KXTA 2BFGA 4GQRA 1WZMA 5DF0A 2CBUA 5BRQA 3NDYA 4JCMA 4KWUA 4JHOA 1EO5A 4ACZB 1W9XA 4QLJA 1HJVA 3QHMA 3MMWA 3BH4A 3MU7A 1UWQA 1QI0A 4XZBA 4U31A 3APGA 1E6SM 2D0GA 4GXPA 1BYCA 1QW9A 1CXHA 4ACZA 1QOXA 2WKGA 3EDEA 3O9NA 1M04A 1SFSA 5LA2A 2DH2A 2J7DA 1NOUA 3AHVA 1B3WA 1AQHA 2WMFA 1IT0A 2GUYA 1DWIM 4B9YA 4CN6A 5AY7A 3AHZA 3D5HA 2J47A 3CUGA 3W24A 3NYDA 3VD4A 1UA7A 3A6OA 2DIJA 1TVPA 3NIYA 3UG5A 2GK1B 1CWYA 2WVUA 3BAYA 4M81A 4OBSA 1ITCA 1HKJA 4C7DA 5HPOA 3L4VA 5A8PA 1M01A 1UQYA 4MJ2A 3CGTA 2VO5A 2DDXA 6TAAA 1W3KA 4KRUA 1RP9A 4AZGA 2EPNA 3VD9A 1DWFM 1NP0A 2GVYA 4PTVA 2JE8A 5A8NA 3AYRA 1CYGA 3OGRA 4UNIA 2X0YA 1C93A 1B3YA 3SCWA 4U2ZA 3WD2A 1EQCA 2X2YA 1I75A 1UYQA 1OGSA 1UZ4A 3AMKA 2YL9A 1JZ4A 1K9DA 1WKYA 4MB1A 3JUGA 4MNJA 5DT7A 1W1YA 4Z2GA 3UESA 5JIWA 2VX6A 2XFYA 3W38A 5E70A 4V2XA 1JF5A 4FK9A 4J3WA 4RE4A 1KB3A 2G4FA 2CHNA 1OB0A 2ZICA 3VDBA 2XWEA 4B3LA 1J0JA 1DWJM 4WKHA 3WFZA 1LG1A 2WXDM 4BS0A 5M03A 2EBNA 4PCTA 1A3HA 1Q6CA 3L4UA 3ZOAA 1E72M 4MAVA 4W8LA 4M80A 1BGAA 3FN9A 2DIEA 4D6IA 4CCCA 1MWOA 3SUTA 1DWAM 2VCCA 1U33A 2WVTA 1E1EA 1XH2A 1C8QA 4Z2IA 1QVBA 3RIKA 3BAXA 3BSGA 3W82A 4UCFA 1FP8A 4GZIA 5A6AA 1HVQA 1JFXA 3AIEA 5A6BA 1CGYA 1KFWA 4CCEA 3AOFA 5A8MA 3VVGA 3AIUA 1WDSA 4TVCA 1EXPA 1K9TA 3CHDA 2YDRA 3VX1A 5A69A 1GZJA 4CCDA 1XD1A 4H8HA 3L4XA 3B8SA 1Q6DA 3T0DA 1J9YA 2CBVA 4JFTA 3PZOA 2X0HA 3PZUA 4QCEA 4P8VA 3GH4A 1E56A 5E9AA 1Q6FA 4J3SA 3U5YA 3UG4A 1PBGA 1V6XA 3AS1A 5BCAA 4NRSA 4U2YA 2EPLX 2G41A 4U3AA 3L4YA 2XVNA 1NWUA 2WZHA 4K68A 4J7RA 3K4DA 3ZJ6A 1ZJBA 1PZ3A 4LYQA 3OLDA 3PTMA 1NH6A 1FFQA 2PI6A 3CHEA 4JCLA 1KGUA 3I3DA 1GONA 5E6YA 4PUEA 4N0RA 1UKOA 1E40A 2UY5A 3D3AA 4BF7A 4CD4A 4D1JA 1ECEA 3OBAA 4CU6A 2D3NA 1HJQA 3UG3A 4OOZA 1UR4A 3NJ3A 1E6XM 2VMFA 1LWHA 2OSYA 6A3HA 2D0FA 1GCYA 5E6ZA 3ZJ7A 4FLSA 4F9JA 3WF3A 1DWGM 3BXWA 4WIWA 1EHAA 3WH9A 4C7FA 1MFVA 2XVLA 5BXRA 3W29A 3AHXA 1WO2A 1VEOA 4XUYA 1TMQA 1V3JA 3WUFA 4PMDA 2VC9A 4W86A 4HU8A 1HP5A 1E6PA 2BVTA 3CBWA 1NOFA 1DP0A 2Z1KA 5ABFB 3ALGA 1BYDA 5A6MA 5A6LA 4URIA 1L8NA 4E4PA 1G94A 4AZCA 2BVDA 4GIAA 1GHSA 3VPLA 3WQVA 1GOQA 5ABFA 1K9EA 2WHMA 1VBRA 3CUIA 3WUGA 2YA2A 3VIOA 4KGLA 4F66A 4P8XA 4IUGA 1G01A 3BLPX 4D6HA 1E43A 4HPHA 2Y8VA 1XH1A 3L4WA 3WSUA 4P7RA 4H2CA 2XFRA 1CXIA 4JZ5A 4AZ7A 2GJPA 5FKYA 5JBFA 3RM8A 2WCGA 5IHSA 2F2HA 5A8QA 5I77A 1KWGA 2WWCA 1ESWA 2JIWA 1H4PA 1J0YA 3NSMA 2B31A 3GNRA 3WH5A 1KCKA 1ZBWA 2GJXA 1QW8A 1YHTA 1OGBA 3HMCA 1PX3A 1UR0A 1ZL1A 2J7BA 3ZM8A 2ZXDA 4PMOA 2J7FA 2E9LA 3FHQA 1ZBVA 5IXEA 4TX8A 2EQDA 3AHTA 2J4GA 4MNMA 1W9UA 4LXFA 1S46A 1H11A 1ITXA 1JYVA 3T2PA 2CETA 2YL6A 1CXKA 2D0HA 1M53A 2G8ZA 2DT1A 3ARZA 3GXDA 3N12A 5FD0A 4OBRA 3PTKA 5A3HA 3DYMA 1JG9A 4FLOA 2Y4SA 1UKQA 1E6QM 1G1YA 1QNSA 3ARXA 5I3DA 4W7VA 3VMNA 1SYTA 4WK9A 3VIMA 1TG7A 1UWUA 2XIBA 3VGHA 4L4OA 3UR8A 1WAWA 4CKQA 4KRTA 4B16A 5JH8A 1C8XA 1E5JA 1W9VA 1H49A 3BMVA 2J79A 1OINA 2OSXA 3MANA 1BYBA 3WDHA 3UCQA 2PBOA 5EBAA 2JIEA 2BY0A 4W84A 1UD5A 5FL1A 3RCNA 2FHFA 3WELA 1WNOA 2VQTA 1GQJA 5F7UA 4GKLA 1D2KA 3CZJA 1JDAA 4XB3A 5FCZA 1E6NA 2FGZA 3ARUA 3MMUA 4LYPA 2EPKX 2VX7A 1JAKA 1RD6A 4JFVA 3MO4A 3ZJKA 5LYRA 3GXFA 5IHRA 2E3ZA 1FH9A 2D23A 1PAMA 1UKPA 3GZAA 3W37A 2CESA 5BXPA 2V5CA 1VEMA 3A3HA 2X1IA 1WZLA 1CPUA 5GNXA 4GO9A 1CEOA 1V0NA 3CHCA 2V3FA 3DECA 4EKJA 2J7HA 6CGTA 1V08A 1B2YA 3WF4A 4X9YA 1KR1A 2BY2A 1KCLA 2V3DA 3SCVA 4Z2KA 2UY2A 1JD7A 2FGLA 4JFUA 5JBEA 1QBBA 3THDA 3AHYA 4AISA 1EGZA 2WZIA 3WBEA 4E2OA 4PSRA 5GNYA 4QAWA 3AIQA 4HOWA 5DMYA 2W62A 4IPLA 2FH8A 2ZXAA 2WK2A 3CUJA 4ATDA 3GM8A 4B15A 2F61A 1VB9A 1V6UA 5I79A 2ZX5A 3BAWA 2AOSA 3WDRA 2WMIB 1VF8A 4PSPA 1KXVA 3I3EA 3F5JA 4PRWA 3FXYA 3VIFA 1UR1A 1GOIA 4LGXA 1E0WA 2YA1A 4CD7A 1PJ9A 1WZKA 1MXDA 3AMGA 9CGTA 1CGVA 2WMIA 1U30A 4AW7A 1BFNA 4AD1A 5HDRA 3T0BA 3ARSA 1XSIA 2ZX9A 4X0VA 2A3AA 2IXVA 3WQ8A 3LPPA 3E1F1 2WZEA 1X6LA 2XGBA 3MSDA 4F9DA 5HPCA 5A6SA 2VCBA 1ISWA 1JDCA 4KH2A 4U3CA 1EHNA 4YHGA 4AY1A 4GI9A 3PZTA 3UR7A 1MW2A 4UQBA 2DQXA 1VENA 4J3XA 3CH9A 3EDKA 2XPKA 2BHYA 1HT6A 2DH3A 1HJUA 3OZOA 2CITA 3DHPA 1H0GA 1MW0A 1W9DM 1WDPA 1QI4A 3SCOA 3ZO9A 4OKDA 1NOWA 3VDHA 4P8UA 1BG9A 1SMDA 3PZ9A 8CGTA 1MFUA 3ZR6A 3BSHA 2OYMA 3VD3A 1HVXA 5BXSA 1X1NA 2WC3A 3BAKA 1ZU8A 2XM2A 3VU2A 1AMYA 1FH8A 2BNJA 2OWXA 2OYLA 3ARRA 4UQ9A 1DEDA 1RH9A 3AMCA 3RO8A 2D1ZA 3F5KA 3QHOA 1LL7A 3OLIA 4PTXA 4X0NA 1WP6A 3EMCA 3NUKA 4Z2JA 1UQZA 1XHGA 1LLOA 3N04A 5JUVA 3N1AA 2JFEX 3GXIA 1O6IA 1EO7A 1W3HA 3VKKA 3M46A 3SCPA 3OG2A 4L4PA 4UOQA 2WHJA 2YLAA 4PMQA 2V3EA 3VGFA 1HJWA 1JZ6A 4V27A 3RMEA 2ZIDA 4AXNA 1NWSA 3AMDA 1IZJA 2WBGA 2J8GA 3GH5A 4P7QA 2XG9A 3WH6A 4BQ5A 1V03A 3TOPA 3UERA 1BAGA 4NRRA 1US2A 4BCEA 1C7TA 1CIUA 4B9ZA 3EYPA 4E8DA 1XYZA 1B0IA 4FF5A 5CGMA 3SUVA 1E9LA 2Y2WA 5C71A 2VR4A 2QMJA 1FHDA 4TTUA 4UQAA 3N11A 1F4HA 1GJUA 2WHKA 4S3KA 4PMUA 5C8BB 2O9PA 1B90A 1GVIA 1HXJA 3DYOA 1B3XA 1HIZA 1HN1A 4H7VA 1H0IA 4TOQA 2PWEA 3WH7A 3VGGA 3WF1A 5E0CA 4P7NA 3EDDA 2WANA 2XM1A 4HMEA 1CGTA 1WPCA 3VOCA 3VIIA 3SUUA 5LA0A 5E09A 1QI2A 3RDKA 1ZB5A 2W67A 3MV01 3DC0A 3CLWA 3WF0A 2JALA 4QDMA 1GNXA 2X09A 1UWSA 1C92A 4AEEA 2OWWA 2ZXQA 5I5RA 1PEZA 1E15A 2ZWYA 1MYRA 5I24A 5CQ1A 3AZSA 4MB3A 3FW6A 1GW1A 1OT1A 3WNLA 1XD0A 1J01A 2WBKA 5A1AA 2QPSA 1HL9A 3IJ8A 4DM1A 3MV11 2YBTA 2VX4A 2JEPA 1UH4A 4HOZA 1DWHM 5CG0A 4JAWA 3SCSA 1BHGA 1AQ0A 4AEFA 1GQKA 1ISXA 3KL5A 4J28A 3ZQ9A 2EO7A 2J77A 4S3JA 4M8UA 3LMYA 3N9KA 2D22A 2J62A 2QPUA 5M5DA 2A3BA 3WD4A 1LQ0A 4UZSA 5M17A 4MTVA 2VUYA 3TTOA 3UETA 3VIGA 2C8NA 3PBGA 7TAAA 4JKMA 3B9AA 2WMHA 1NQ6A 4EANA 2XFFA 3IAQA 2DPEA 1GORA 2AAAA 2WKLA 3FY1A 2CKSA 2PF0A 2A3CA 3PTQA 4WJXA 1UWRA 1C8YA 3QR3A 1R85A 4NZCA 2O9OA 3CMGA 2PWFA 5I23A 2E40A 4LX4A 4AD2A 2CERA 4D6EA 3WD0A 2FHBA 3CMJA 1E1FA 1KGXA 2D24A 2YDQA 1E55A 3T0AA 4DUWA 2X8RA 4D71A 5BWFA 3ZT5A 1E6ZA 3OIHA 2ZX6A 1NWRA 5FOOA 1EOKA 4DUVA 1TFVA 4IPNB 4D6FA 2EPMX 1HJXA 3VTRA 1JI2A 4WSJA 5CJ5A 4W8BA 4Q22A 1J0HA 3W26A 4EAMA 1CXFA 3CIVA 3W6MA 2YJQA 3AIRA 4UOZA 3SUSA 4HA1A 1DTUA 1LL4A 2TAAA 3WD1A 2W92A 2VI0A 3TP4A 4LPCA 4Q7NA 2W63A 2YA0A 2UY4A 3VIKA 1JFHA 4BZYA 4E8CA 4M24A 3HN3A 7CGTA 3GBDA 2ZUWA 5IFPA 1HP4A 1UWTA 1UD6A 2ZUVA 5I6SA 3IJ9A 1XSKA 1PIFA 1EDGA 1JF6A 4GI8A 3KE0A 3KEHA 3BCFA 3WQ4A 4AZCB 5A6BD 1OD8A 3O6AA 3WBAA 4JHZA 1HKIA 1HKKA 2YBUA 2RGLA 4JKKA 3S6TA 1OSEA 1Q6GA 1CXLA 2J25A 4GZJA 3LPFA 2IXUA 4GZEA 1UZ1A 4ZXLA 3W27A 1SR0A 4W85A 5IDIA 2NSXA 5C70A 1E0XA 4W89A 3WDQA 1C90A 2BXYA 1VEPA 1V02A 2JEQA 1JNDA 1QNQA 2O9TA 1CXEA 4MB5A 3WNMA 1ZBCA 1E70M 1UUQA 5CGTA 4IISA 3PZMA 2BXZA 4TTGA 1W1PA 1TR1A 2JF7A 1IV8A 2QV4A 1W91A 3WMCA 1RPKA 1V6YA 2J74A 2VCAA 1CLXA 5A2CA 3N17A 2J75A 3LPOA 1E4IA 4BA0A 1VFFA 3WY1A 2GJXB 2VZOA 3M6DA 2BY1A 3CZ8A 4IM4A 4AD0A 3WIJA 4WKAA 1V0MA 3CUHA 3LPGA 4AYSA 1TZ7A 5M3WA 2EJ1A 2VL4A 2XJ7A 1B9ZA 2FHCA 4PMZA 5JBDA 2VJXA 1JD9A 3N18A 1W2PA 3G6LA 3J7HA 4HZ8A 4HTYA 2J78A 2DT0A 2NW0A 1HJSA 2WCAA 2CPUA 2IUZA 3K8MA 3AZTA 5DT5A 1E73M 4R27A 1VJZA 3W6LA 3A4AA 4H8UA 2YOCA 3AXIA 1PX4A 4W88A 3WL1A 1WZAA 1EDTA 1OBAA 3AIWA 3ARYA 1KXHA 3WNKA 1BYAA 5BRPA 1R8LA 4F79A 2ZE0A 4PTWA 4MB4A 3WQ6A 3GDBA 4BQ4A 1EIBA 1XYFA 3WUBA 3WKZA 3SIMA 5HXMA 3ARWA 2W4XA 5D9NA 4WLCA 2ZWZA 2A3HA 4MADA 1QI5A 1MQPA 5ECUA 5D9PA 2XSAA 2VZTA 3BAIA 4AD4A 3F4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3A47 A;  3RJX A;  2E8Y A;  2VX5 A;  1OGG A;  5A6J A;  2WMJ A;  1VJS A;  3S2C A;  1OIM A;  4GO8 A;  1B1Y A;  2FH6 A;  4HP5 A;  1TUX A;  4UTF A;  1UOK A;  2DEP A;  4PEE A;  1GOO A;  5HBF A;  3AI0 A;  3BGA A;  1JGI A;  1CGX A;  3AIV A;  5LA1 A;  3AJ7 A;  1DHK A;  1E71 M;  2PB1 A;  4ZEN A;  3K8L A;  1LJY A;  8A3H A;  1ISZ A;  3WMS A;  3SCQ A;  5I78 A;  1E4N A;  3DHU A;  4AMC A;  2VT0 A;  3WL0 A;  2BV9 A;  5AC4 A;  4N42 A;  3AZR A;  1V6W A;  1UWI A;  2VZU A;  4ML4 A;  1GQL A;  2E4T A;  4D6G A;  1W3L A;  4D72 A;  3VIN A;  3VX0 A;  1J0K A;  4XZW A;  1ISY A;  4GIN A;  4MAZ A;  3AIB A;  2ZXB A;  2WLY A;  2G3N A;  3U7B A;  3AYS A;  4CD6 A;  2VVN A;  2DSW A;  1QI3 A;  3WH8 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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