1OGBA

Chitinase b from serratia marcescens mutant d142n
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDINWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
publication title Structure of the D142N Mutant of the Family 18 Chitinase Chib from Serratia Marcescens and its Complex with Allosamidin
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 172
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2003-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1ogbA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ogbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ogbA01
1E6PA 1E56A 3W82A 1V0KA 2MANA 1K9TA 3WEMA 1JZ8A 2Y5EA 2XVPA 1B1YA 4AZCA 3PZQA 5I2UA 4D6EA 1UR0A 1ZB5A 4P7LA 3HMCA 5M3WA 4AISA 2VCAA 4PMUA 1P6WA 5CGTA 3T08A 3W6MA 1HN1A 2XVGA 1U33A 1VFMA 3MUY1 3VGEA 3QHOA 3EMQA 2XVKA 1H0GA 4KH2A 2HISA 3ARSA 4F9DA 2JEPA 1S46A 2VR4A 4D6HA 3VDBA 1MW3A 4H7VA 1JYXA 1UR1A 5DT7A 2WCGA 2UY3A 8CGTA 3UETA 2XHYA 4UOJA 4C7FA 4Z2JA 3ARXA 2C8NA 4JKMA 3VOCA 1MFUA 1H5VA 3VGFA 4AD1A 3SCSA 5CPSA 3WDHA 3ARUA 1G9HA 4OBRA 2V5DA 4HA3A 3CZJA 2XG9A 1UD6A 2GJXB 1FH8A 1GOOA 3ALGA 1G94A 1NARA 4OOUA 4PTXA 5BXTA 4XX6A 1V6VA 1QNRA 3L4XA 1OCQA 1ISZA 3J7HA 3CUIA 5EFFA 3VIOA 1G5AA 1WDSA 2XPKA 2VX7A 2ZX9A 3PZ9A 5BWFA 2Y8KA 3MMUA 1UWIA 5DT5A 1JF5A 4AZ6A 1R85A 2JEQA 3F5JA 1WNOA 4U5KA 1ZBCA 1XH1A 2FGLA 2EO7A 1GNXA 1GOIA 1UWUA 4AZ7A 5FOOA 1B90A 3ZQ9A 1VB9A 3GBDA 2ZUTA 2WVSA 4GI9A 4K68A 3CHFA 1E71M 4CD4A 1MXDA 3NJ3A 3VILA 1M53A 1NOFA 3AFBA 4FLRA 1QNPA 2DQXA 1QHPA 1E72M 1UWRA 4DWSC 1FH7A 4V2XA 4D72A 2YLAA 4PMNA 2G3NA 3AOFA 2TAAA 1HJUA 2E3ZA 1FHDA 3OGSA 3TTOA 3BAKA 1VEPA 1CPUA 2J7GA 3D3AA 4ZENA 2XFYA 1DWFM 3VD3A 4QCFA 5HXMA 3L4WA 4W8AA 1LLOA 2FH8A 2YL5A 1Q4NX 4D71A 3BH4A 9CGTA 4NF7A 1MVYA 1NQ6A 3B9EA 1E70M 3UG3A 2EPLX 4JKKA 2OSWA 1V3KA 2D0FA 2NT1A 4CVWA 4TOQA 2IXVA 2DH2A 2WVVB 1B3XA 4JCMA 5M17A 3CZGA 5I6SA 4KRTA 1K9FA 4P8XA 1ISWA 4J3TA 1JZ6A 1NWUA 1L0PA 6A3HA 4TUFA 3WDRA 4J27A 3AYRA 1XRVA 1UOKA 1GOQA 2WHLA 4OOZA 1BTCA 3GNPA 2ZX7A 3OG2A 1GQLA 1KWGA 4Z2GA 1D2KA 2DSVA 2VJXA 1QOXA 1E6RA 2YL6A 2F2HA 4JIEA 1DWGM 3WF1A 1KQYA 1ZBVA 3WD0A 2ZWZA 4ZXOA 1LQ0A 3SURA 1KXVA 3TONA 5A6MA 2DDXA 2D0HA 1QI2A 4WKAA 2FHBA 4LYRA 5E0FA 1U2YA 1OWQA 2W91A 2J74A 1JNDA 1HJWA 1IT0A 3L4TA 4TTUA 5FCZA 3PN8A 3QHMA 4AD4A 3CZLA 1GJWA 3W0KA 3WF2A 5BROA 1PX8A 3B9AA 4AC1X 3EYPA 4CU7A 3I3BA 2DIJA 5A8MA 3N15A 3VGGA 1H1NA 3K4AA 4PSRA 5IDIA 5ABFA 3TTSA 3PZUA 2OSYA 4DM2A 4LX4A 3VIIA 4KWUA 1J0KA 1XSIA 3W26A 2BXYA 4DUVA 3WF4A 3MUAA 3UCQA 1C93A 1AQHA 1OGSA 3ZMRA 2VZUA 1ODUA 2DSZA 2Y4SA 1B2YA 2J78A 3WNMA 2BVTA 1GOKA 3A6OA 3EMCA 5JBEA 1JFHA 2RGMA 3RIKA 4NI3A 5IXEA 3FAXA 3AHZA 4E2OA 1N82A 5LA2A 1JZ7A 1VFFA 4JFWA 4AW7A 3N1AA 2BHYA 1UR9A 2PBGA 3KE0A 5CLWA 1RD6A 3EDKA 1H09A 2UY4A 2BS9A 2FHFA 2YDRA 3PTMA 3VMNA 4ACZB 3THDA 4MAZA 4W89A 4M81A 3VD5A 3MMWA 4P7QA 3RM8A 4NRRA 4AZGA 1CIUA 3FN9A 1BYBA 2X0HA 1GCYA 1O7AA 1OM0A 4GZIA 3WH8A 4JAWA 4LPCA 3WQWA 1VIWA 3MUZ1 1W1YA 1V3JA 4CD7A 1MYRA 1WDQA 1EOMA 4OZOA 5D9OA 5IHSA 3ARYA 3PZOA 4BS0A 4AD3A 4YPJA 2XFRA 1VAHA 2DT2A 1IZKA 3N13A 1E4IA 5JBDA 3NDYA 3IJ7A 1US2A 1GPFA 3VGDA 1UA7A 4H2CA 5C70A 4UOZA 4IPNB 4UR9A 3SCQA 1CXKA 2WNWA 3CLWA 2VX5A 1EA9C 3IAPA 2Q8XA 2VRJA 1X6NA 2VR5A 5BRQA 3SCWA 4PCTA 1J0ZA 1JG9A 1G0CA 3G6LA 2VC9A 4J7RA 4BQ4A 3PZIA 4WKHA 1L8NA 4UFJA 3DYMA 2QMJA 1J10A 3EBVA 4FK9A 4B9ZA 7A3HA 1HT6A 2XGIA 3CUFA 3WMBA 2J79A 4AEEA 3VIKA 1Q6DA 1KQZA 5I3DA 5CZKA 4UTFA 1OT1A 2RTSA 3GXMA 1J01A 1PX3A 2GK1B 2W92A 7TAAA 5LYRA 3GM8A 2D20A 1AVAA 4Z2IA 5JIPA 2WCSA 2A3BA 4U3CA 1HKIA 1UWQA 4H8UA 1WCGA 4UZSA 5A2AA 1V03A 1MW1A 2DIEA 5A8PA 2OLHA 3CUGA 2BVDA 3WNNA 4HMEA 2J4GA 4UQAA 3VD9A 1JI1A 1R7OA 1ED7A 3VTRA 2CBIA 3KZSA 5A8NA 4AZIA 2XGBA 3PZNA 4OJYA 4ZE4A 4C7DA 4DWSA 4GKLA 1EH9A 4W84A 3VNZA 1PAMA 2O9RA 1GORA 4M56A 4CN4A 2D22A 1FFRA 1C7TA 1V3MA 3OGVA 4LYQA 1PJ9A 2YBUA 2X09A 2ZUNA 3VD7A 1UR2A 3MU7A 3OIHA 1NP2A 1E6NA 1NOUA 4ACYA 3FW6A 4EK7A 4QLLA 4GO9A 3IJ8A 3PZMA 2V3FA 4KMQA 3RPMA 1PPIA 2DPEA 2WSKA 1OT2A 4NSBA 1E6ZA 2FHCA 1WO2A 1NWRA 1XD1A 3GZAA 3N18A 4FLOA 3BCDA 3AS3A 3WQ4A 5CSYA 1E4NA 3SUSA 1CXIA 3AJ7A 2NT0A 3AHXA 1UD3A 1CEOA 3VGBA 1HP5A 2V3DA 5E70A 1BPLB 3WEZA 2EPMX 3UG4A 4E4PA 1JD7A 4CN6A 1GUVA 4JFVA 5I24A 2CKSA 3LPGA 5A69A 1B3WA 4C7GA 1J18A 1J0JA 3AIQA 4PUEA 1SYTA 1FOBA 5HOSA 1CDGA 2WVUA 5HBFA 1EQCA 1GQKA 3B9DA 1HX0A 3VINA 1A47A 4W8BA 3SUWA 1HKKA 1JYNA 1PBGA 5IFTA 3MO4A 1W9DM 4UCFA 4D6FA 1EDGA 2ZX5A 2PWDA 2EEXA 3A47A 2XVLA 2CPUA 3WEOA 3FNDA 1E6QM 3NCOA 4FMVA 2YDQA 4PEEA 5FD0A 1JD9A 3EDDA 1BAGA 2GSJA 4PRWA 4ATDA 2GDUA 3F5LA 4DUWA 3EDEA 1ZJBA 3UR8A 1AIWA 4AYSA 5A6SA 1CYGA 1CLVA 1D7FA 2UY5A 3AXHA 4GI8A 2VRKA 3GH4A 4GXPA 4CGTA 4AD0A 2D49A 1PIGA 3ZT5A 1KXTA 1XYFA 1JI2A 1GW1A 1UA3A 5D8ZA 3B8SA 4HZ7A 4W7VA 1JZ4A 3AHTA 2QMKA 3RDKA 4OKDA 3AICA 4OBSA 3WD2A 2ZX8A 1E0WA 1JF6A 3AS2A 3MMDA 3K8KA 3BGAA 2FGZA 3CHEA 1OINA 1W3JA 1V3LA 2EXOA 4B15A 1HKJA 4UQEA 2IXUA 4B16A 3VNYA 4NRSA 3K4DA 3LPOA 3A4XA 4D6DA 3M6DA 3AIBA 4URIA 4A4AA 1E9LA 3W28A 2WLZA 4BF7A 2E9MA 4OIFA 4PUDA 3GNOA 4PMXA 1E4MM 4S3KA 1TG7A 1V6WA 3VM5A 3UERA 4CU6A 4PMOA 4HPHA 4MAVA 4PMRA 3T0BA 5CPTA 2W61A 1MXGA 3PHAA 1PZ2A 3I3DA 3NSNA 1HKMA 1BG4A 3WNLA 2X1IA 1BQCA 1LL6A 4AZCB 4PBGA 1AQ0A 2VVSA 1V02A 2PF0A 1UKOA 2WHKA 1EHNA 4CCDA 3AIEA 3WNPA 4CUCA 3VDAA 3ZM8A 5A2BA 2J7EA 1BSIA 1ITXA 1DWHM 1OD0A 2D23A 3GXFA 2C7FA 4ML4A 1A3HA 1HNYA 5D4YA 2BY0A 2WBGA 1M04A 4CU8A 1TVPA 3BLPX 1B3YA 1BG9A 2AOSA 4F9JA 1KGUA 4LGXA 4GZJA 2OYLA 2O9OA 1ECEA 1B3ZA 1DWJM 2WC4A 3DHUA 1G01A 1CZ1A 1CECA 3VIHA 5EB8A 2CXGA 3UESA 5AYBA 1M03A 1W3LA 1LL7A 1QHOA 4Z2KA 2CYGA 3ZJ7A 5CG0A 4ATWA 1R87A 4D6IA 1R7AA 4W86A 2A3AA 3HN3A 4CD6A 1OSEA 1UH4A 4HU0A 4GPNA 5EMYA 3SCNA 1HJSA 1RP8A 2WVVA 4DUXA 1Q6GA 3BAYA 3LPPA 4HZ8A 3AS0A 4MJ2A 3VD4A 1CWYA 1UQYA 4W7UA 3W29A 1HVXA 4NZCA 5ECUA 1E55A 4P7OA 2NW0A 3BCFA 5I0DA 3OLGA 3OLIA 1H41A 3NUKA 4HU8A 1GOWA 4GI6A 2CBJA 1W9PA 5E0CA 3W81A 1W3HA 4PN2A 2EBNA 1CTNA 1H49A 4JFTA 1BVNP 1J12A 4MJ4A 2PWFA 1V6YA 2WC3A 4DWSD 1XCWA 4AIEA 4U33A 3AMGA 3WBAA 4CD8A 2CIPA 1AQMA 1E3ZA 1V6XA 3VDHA 4LXFA 4E8DA 1TMQA 2PWGA 4PTWA 4TTGA 1CBGA 5ABGA 4EAMA 1VFOA 3GTNA 4XV0A 4QCEA 4PTVA 5BCAA 1VJSA 2DSKA 1LL4A 2ZUVA 3M46A 4WF7A 3ARRA 2VTFA 1C3FA 1H0IA 3VPLA 2XFFA 2BHUA 3U57A 4H04A 3ALFA 2W62A 2ESCA 4AZHA 1H4PA 3KWXA 3AHYA 3L4VA 3WH6A 2ZXQA 3AMDA 1JXJA 3WUBA 2G8ZA 1XGZA 5A6BA 2VI0A 3AMKA 2QLYA 4U5IA 3UR7A 1V08A 2WB5A 3SCVA 3MUIA 3BC9A 1J0IA 4JZ5A 2XSAA 1E3XA 4MDPA 3K8LA 5D9NA 4PMYA 3IAQA 3ZT7A 2B31A 3MV11 1K6AA 4M1RA 3VU2A 4KGLA 4MADA 4AMCA 1GHRA 1WZAA 4A3YA 2ZXDA 3SUTA 2Y24A 1E73M 3MS8A 1RP9A 1Q6FA 1C8QA 1GVIA 3VM7A 1UWSA 3RM9A 2XM1A 1TVNA 3ZSTA 2E9LA 2DSUA 3AI0A 4UQBA 2WK2A 1WE5A 4W85A 1ISXA 1CXEA 2G41A 2XTKA 2ZUSA 1BHGA 1R8LA 3WUEA 4UZUA 3WH5A 1JYWA 5BXSA 3ARTA 2BY3A 4QLJA 3MANA 3WUGA 3BAXA 4PMDA 1UKTA 1W2VA 1VBRA 2V5CA 4RE4A 4AIOA 1H3GA 4Y7EA 1VRXA 1XV8A 4HZ6A 2W66A 3NDZA 5D9MA 5GNZA 1CGTA 3U5YA 2E9BA 5I23A 5JBFA 3TP4A 1K9DA 1JZ5A 3BMVA 2ZICA 5AYIA 5BXPA 2CESA 1KCLA 5C8BB 2WHJA 1FFQA 2X0YA 1U30A 3E1F1 1WKYA 3CO4A 1Z32X 2XIBA 5M03A 2O9PA 4TVCA 5JH8A 1KBKA 1HL8A 1UD5A 4YHGA 3AZTA 2WMGA 3AIUA 4UFIA 1JIBA 1JZ2A 4YHEA 3L4YA 3VX0A 1E15A 1QNQA 3GH5A 5A1AA 2JFEX 3WFZA 4P7RA 1TE1A 3AS1A 2ZOXA 4UFMA 5A2CA 1CGXA 4MB4A 1M7XA 1WP6A 2XYLA 4M24A 2ZUMA 3JUGA 1GZJA 3WKZA 4AIUA 3SUVA 5BRPA 3IJ9A 2VCBA 3ARVA 1FHLA 3L4UA 3BMWA 5JUVA 4WK9A 2XJ7A 1V3HA 1XC6A 2J7HA 3RO8A 3EDFA 2DT1A 4PMQA 1OGBA 1CXLA 3WFLA 3CUHA 3PBGA 3KL5A 1EDQA 2DT0A 2DH3A 3F4VA 3IK2A 4UOQA 3WSUA 1MW2A 1WB0A 3CGTA 2WBKA 1GONA 1ODZA 3ZSSA 3T09A 1UD2A 3WQ8A 1EO5A 1SMDA 2ZXAA 4J3UA 1PZ3A 2D24A 4IM4A 1MQQA 3OA5A 1VBUA 2WMIB 1E1EA 2QPSA 1BYAA 1KXHA 4M82A 4MNKA 1W2PA 1QI3A 1SR0A 2WHMA 1LG1A 3CZKA 1E5NA 5E09A 3WH9A 1D3CA 1KBBA 2WMFA 2J8GA 3NSMA 2G4FA 4QFUA 1CGUA 4AXNA 4RL3A 1OIFA 2OWWA 5E6YA 2XVNA 3OB8A 2UY2A 3AIWA 1TZ7A 2G3JA 3WENA 4WSJA 1C8XA 4HTYA 2BHZA 3AROA 1QW9A 3GXDA 1KR0A 1LF1A 1UH2A 2JF7A 3ZJKA 1W1VA 4RE3A 4WKFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PX4 A;  2X8R A;  4BQ5 A;  1JXK A;  2VQU A;  8A3H A;  1C90 A;  3VO0 A;  3PTK A;  3GBE A;  3CH9 A;  4WLC A;  1XCX A;  3ZOA A;  4AD2 A;  1XD0 A;  3WNO A;  4J3W A;  3ZIZ A;  1W32 A;  5GQB A;  1X6L A;  2WKG A;  4MNL A;  1FH9 A;  1QBB A;  2BFG A;  2VX6 A;  2VCC A;  1TA3 A;  4ATL A;  4A3H A;  3DEC A;  4W88 A;  5KZ6 A;  2OYM A;  1J0Y A;  2GVY A;  5ABH A;  1GOM A;  1UR8 A;  4FF5 A;  3LMY A;  3N04 A;  1UD4 A;  2O92 A;  3G6M A;  3CHC A;  3GH7 A;  1WPC A;  2VRQ A;  3T0A A;  3WQ5 A;  4Z2L A;  1VJZ A;  1KWK A;  1TFV A;  1F4A A;  2WAG A;  2WLY A;  3BAI A;  4UFL A;  2F8Q A;  3WNK A;  3VKK A;  3CTT A;  2BY2 A;  1HL9 A;  4D6C A;  1Q6C A;  4H8H A;  3OZP A;  1W9B M;  1W3K A;  4WJX A;  1UG6 A;  2CER A;  5A6A A;  2OWX A;  3THC A;  2F61 A;  1RPK A;  2VZS A;  3TTQ A;  4IPL A;  1JAK A;  2CNC A;  4GIA A;  3W38 A;  2VZV A;  3CZ8 A;  1SMA A;  4AD5 A;  4BCE A;  1WZM A;  4DWS B;  1Y7V A;  4PMV A;  5A3H A;  5JIW A;  1V0M A;  3O9N A;  3ZT6 A;  4L4O A;  5GNX A;  2Y8V A;  4UQ9 A;  3BSG A;  5TD4 A;  2BNJ A;  3U7V A;  4JCL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ZBC A;  4HPN A;  3DG6 A;  3IRD A;  4G50 A;  2CHR A;  4GUH A;  3MSR A;  3P0X A;  4G6C A;  1TX2 A;  1AZ2 A;  1E71 M;  5FAJ A;  2PDH A;  1V79 A;  3W84 A;  3E12 A;  2ASH A;  4XUG A;  4HN4 A;  1CW2 A;  4Q8W A;  3VIL A;  2E68 A;  2PCQ A;  2WSR A;  2NXH A;  2YCJ A;  3AFB A;  3HPZ A;  5XIM A;  1RZM A;  4DEL A;  3HPX A;  2DQX A;  3JZU A;  3F1Q A;  2EAW A;  4K36 A;  1FQ0 A;  4IQC A;  2TAA A;  4GIE A;  2E3Z A;  9XIA A;  3MY9 A;  5BOO A;  1FHD A;  3TTO A;  2RUC A;  2PDX A;  3HGR A;  2XFY A;  1P48 A;  3TC6 A;  4W8A A;  2FH8 A;  4AF0 B;  1W5O A;  4PTD A;  9CGT A;  4NF7 A;  5BPV A;  1E70 M;  4JKK A;  1AL7 A;  3CGM A;  2FB2 A;  2IXV A;  2WVV B;  4JCM A;  4O50 A;  2NXI A;  4DBS A;  4IMD A;  2CLM A;  1L0P A;  6A3H A;  3W7O A;  2DOR A;  2NX9 A;  3WDR A;  1TPF A;  4J27 A;  1YDO A;  2Z24 A;  2FJK A;  4QJ4 B;  1BTC A;  3PWG A;  4H6Q A;  2FZ8 A;  2Y2Q A;  2AKM A;  3W7Q A;  1MUM A;  1D2K A;  2XP5 A;  1BTM A;  5TIM A;  2VJX A;  1JCL A;  3NOE A;  4IMG A;  1Y5V A;  3WF1 A;  1DWG M;  1ZBV A;  4GYP A;  5LGZ A;  3WD0 A; 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 3LHV A;  1F3W A;  9XIM A;  2WYS A;  4HA4 A;  4KQN A;  1PKN A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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