1E6RA

Chitinase b from serratia marcescens wildtype in complex with inhibitor allosamidin
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Serratia marcescens
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHITINASE B
total genus 166
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6rA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6rA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6rA01
3VD9A 1J11A 2V3GA 3FN9A 4EAMA 3LPFA 1E40A 5I3DA 1BYAA 1GONA 2J7DA 1LG2A 3LPPA 1ITXA 4JFUA 1V3LA 1ZBWA 4AZIA 3GYCA 1J9YA 2J7CA 1AVAA 4KGJA 1HKJA 5M3WA 3DHPA 1HJSA 4F9DA 5D9OA 3AZRA 2WBGA 1UD2A 3NCOA 4ZENA 1XCWA 4UFKA 3AIRA 3CZJA 2NT1A 4PMYA 3BAIA 2VO5A 1M04A 1GQLA 4NZCA 1BF2A 3THCA 3ZIZA 1OWQA 1JNDA 3VILA 1R86A 3N9KA 1V08A 4FLQA 2C0HA 4AZCB 3UR7A 4BQ5A 3CUIA 4QAWA 5D9NA 4AXNA 1K9TA 5HXMA 3ARXA 4EE9A 1YHTA 1KXVA 2FDMA 1QBBA 1XSKA 4FK9A 1V6UA 5CXPA 1CXIA 3A3HA 4H8UA 2BY2A 3BAWA 1DWHM 1UOKA 2QPUA 1V6XA 1CPUA 2OYKA 5CPSA 1V02E 1HN1A 1K9EA 2VNCA 1EDGA 4D6DA 4W87A 4W88A 3WBAA 1JIBA 1UWQA 2GDUA 4WLCA 1QNRA 1UHVA 2VQUA 1UR8A 3MS8A 1U33A 3POCA 5I24A 1WE5A 1KFWA 5A6BA 1VRXA 2E3ZA 1E1FA 1B1YA 4D71A 3FHQA 4S3KA 4PMNA 2XSAA 2VI0A 2OYLA 4F9JA 1UH3A 2VOTA 5KZ6A 3NIYA 2WZHA 1QPKA 3CZGA 2E0PA 1UH4A 4TX6A 1E9LA 1JZ6A 1HL8A 3WDPP 1TUXA 4Q7NA 3BGAA 1PX8A 2ESCA 3W28A 3VDCA 2Y4SA 2J75A 4ZE5A 4JL2A 4GI9A 5FIPA 1HJWA 1BG9A 2ZXBA 4PMRA 3NSMA 1VEMA 3EDEA 1CENA 1MFVA 2WVVA 4H41A 2HISA 2YKKA 1V3HA 1C91A 4HMDA 3WENA 1XH1A 3WH6A 2AOSA 1E56A 4UFIA 2XWEA 1FOBA 2YDRA 3ZSTA 3N1AA 1MQQA 3W27A 5BROA 1CLVA 2DQXA 2GFTA 3ZJKA 4B16A 1VFUA 1CGTA 3IK2A 3WH5A 5CLWA 2J77A 3DYOA 3M46A 3OIHA 3UERA 5GQBA 1R85A 2VRKA 3VD3A 3CMGA 4M56A 3LPOA 3F4VA 1EO5A 1UR1A 5JBDA 4OIFA 1GQKA 2YA1A 3L4VA 4HP5A 1E73M 2VVNA 2YL8A 3WUFA 2EJ1A 4UQCA 1G01A 3VIFA 3AYRA 1ZBCA 3SCTA 1OBAA 1KQZA 3RMEA 1XD0A 4PUEA 1JZ5A 3A6OA 1JL8A 3RILA 2JF7A 1NM9A 2VMFA 4MJ2A 1BFNA 4ATDA 3CZEA 1V0LA 4P7QA 3WF0A 1FH7A 2CCRA 4HMCA 4YN5A 4GQRA 1XC6A 5ECUA 3MUY1 2BXZA 4QCFA 1W1PA 3K8MA 2Y8VA 1PX4A 3WD3A 2AMGA 3M7SA 2XUCA 2CKSA 2EPNA 3ZT7A 2A3CA 3FAXA 1H41A 7TAAA 1B2YA 4AD2A 3CUGA 1FP8A 1E71M 2EBNA 2J79A 1MYRA 2VRQA 1EO7A 2BHUA 2ZX7A 2YBUA 5DFAA 3ARZA 4MB3A 5IDIA 4AD4A 4CN1A 1JI2A 4XX6A 2W4XA 3SUSA 3UESA 1W32A 4KRTA 2OYMA 3DHUA 3WH7A 5AY7A 3N04A 1U30A 3EMQA 3GXIA 2JF6A 3W37A 5LYRA 1IT0A 3TTOA 1GOOA 2Q8XA 2WVUA 5JUVA 1Q6CA 1E5JA 4OBRA 4NSBA 5A6BD 5GNYA 4DUVA 2XSBA 1B3ZA 3BMVA 1CTNA 1G94A 2DSZA 3ARUA 2O9PA 3A4XA 3MSDA 1F4HA 2ZIDA 3BCDA 4U3CA 1DWJM 1UKOA 1WPCA 4P7LA 3UCQA 3RIKA 4AISA 2JALA 3VGBA 2Y24A 1DWAM 2ZUSA 2W5FA 4GO8A 2ZX5A 1HVQA 5CLTA 3AS1A 4PUDA 2XGIA 4JL1A 4KRUA 3TP4A 2BFGA 3THDA 2CBUA 4BZYA 1NH6A 3ALFA 3G6LA 2WMJA 1EHAA 1BYDA 3AROA 3MMUA 1KWGA 3PZOA 2EO7A 2UY2A 5A1AA 4CCCA 1CDGA 5CJ5A 2YIHA 4WSJA 3FW6A 1E43A 2VTFA 2FH8A 1WDRA 2WZIA 2DEPA 3W53A 1VBRA 5A2CA 4CD8A 4PSPA 3WEMA 3VNYA 1H0IA 1VEPA 1LG1A 1WZAA 1NP2A 1HX0A 4PEEA 4GO9A 2DSKA 1I1WA 3L2LA 1ZU8A 4MNKA 5CG0A 2VL4A 1JAKA 3SCRA 2VZTA 5A8PA 1R87A 3AMGA 1UKQA 3BC9A 1TA3B 2WMKA 1QI4A 4NRRA 5EB8A 4PSRA 3WDIA 4D6FA 3L4UA 3ZM8A 4P8XA 1QNOA 2PWGA 2IXVA 1R7OA 4K68A 1RP8A 1WB0A 3N15A 4UQ9A 3IAQA 2BV9A 5ABHA 3W38A 4RE4A 3ZMRA 1NQ6A 1EOMA 2A3HA 1E3XA 1KXQA 3WL1A 2ZICA 3RM4A 2DIEA 3FY1A 3GDBA 4JKLA 3L2MA 1IZKA 1W1VA 1GOKA 4OKDA 1B90A 5BXTA 1V3JA 3A4WA 1QVBA 3RM9A 4D72A 1OGGA 1EXPA 1JAEA 6A3HA 3WN6A 4ZFMA 3RJXA 3OGSA 4HTYA 3UR8A 1LL7A 5DT7A 4PMXA 2W66A 5AC5A 1BAGA 1EDTA 2J8FA 2YDQA 2PWHA 2CIPA 3MMWA 3PZGA 3PZUA 3KEHA 4CCDA 1A3HA 3IAPA 4UNIA 1NOFA 3SEPA 4AD3A 1CWYA 2GK1B 1V03A 1WKYA 4B9ZA 5ABGA 1UA7A 4J3VA 3MO4A 4J3TA 4AMCA 4D1IA 3JUGA 3GXFA 2WXDM 3VDBA 1GOQA 2WNWA 4LQ1A 4PTXA 5D9MA 2FH6A 1DTUA 2Y8KA 5HPOA 4C7FA 5A8NA 4AD1A 1QHZA 1KCKA 1W3JA 4NI3A 4TOQA 4PMDA 4URIA 1FH8A 2VCCA 1PJ9A 3VKKA 4WF7A 1CECA 2UWFA 1CGXA 1WZKA 3ARSA 2XVKA 2MANA 2G8ZA 1WO2A 1GZJA 1V6YA 4UQAA 5KEZA 1TE1A 4Z2KA 4JCLA 1DWIM 7A3HA 4TTGA 2E4TA 1L0PA 1NARA 1CZ1A 3QHMA 1OIFA 4X9YA 1BHGA 1PEZA 3N11A 1BGGA 3W26A 3I3BA 4IPNB 4U3AA 2VZOA 1SMAA 1B3VA 1UQYA 4JHZA 4UZUA 1JZ4A 4AYSA 2WLZA 4Z2HA 4HPHA 2E9BA 3K8KA 1MW3A 3VINA 2E8YA 3AMDA 1C3FA 3SIMA 2ZE0A 1JF6A 3QHOA 5TD4A 1D3CA 1HXJA 1C7SA 3VD4A 1IV8A 4JFWA 3BAYA 2PF0A 1B30A 3TA9A 5A6JA 4RL3A 1DWGM 4HMEA 1Q6DA 1GOMA 2V3DA 4AZCA 2V5CA 1JDDA 2CERA 4HZ8A 3QOMA 3SCSA 3W24A 4GQQA 4M1RA 4PTWA 1W9VA 1E0VA 2YJQA 3CMJA 1V6WA 4P8UA 1E55A 4U33A 1GCYA 3T0BA 4J3UA 1MW1A 3WSUA 3WF4A 1L8NA 4CD4A 5AYIA 3W29A 1JYNA 2DDXA 2B31A 3CUFA 4TUFA 1FHLA 2XFRA 1DP0A 3WNKA 1UUQA 4PBGA 4AEFA 1UR9A 1CGYA 1E0WA 1CXKA 3O6AA 3U5UA 1JGIA 1NOWA 4ML4A 3WQ4A 1VAHA 4EKJA 5ABFB 1BTCA 3ALGA 3VM5A 1VJSA 1QNPA 2GJPA 4BA0A 3NDYA 4AZ6A 3PTKA 2ZUUA 2E9LA 2OSWA 3PBGA 5BRPA 2D0HA 2J7GA 5IXEA 2WCSA 1V6VA 1BVNP 5DT5A 2NT0A 3GH4A 4OJYA 3WQVA 1EOKA 4LYRA 1J0JA 4Z2GA 4MB1A 5EFDA 4YPJA 1ZBKA 3OZOA 1UKSA 2W92A 2VR5A 1TCMA 4JFVA 4B3KA 1K9FA 5CGMA 1X1NA 1M01A 4M8UA 2IUZA 4ZXLA 4Q22A 3PZTA 1UR4A 3MV11 4W89A 4PMZA 1W9PA 3AHZA 2QPSA 2WKGA 3VIMA 1C8XA 1E6RA 2VRJA 1ED7A 5A8QA 1GHSA 1G0CA 5A6SA 3FXYA 1QNSA 1G9HA 2RGMA 1KR1A 1OGBA 1JG9A 5E0CA 5I5RA 3T0DA 3BLPX 1Q6GA 2D3LA 3MUAA 1V3MA 4XV0A 2OWWA 5CQ1A 4W86A 1LWHA 1HF6A 4H04A 4A3HA 5I23A 1DWFM 5BWFA 3APGA 1JFHA 1J10A 3AHVA 4W8BA 1TFVA 3KL0A 3FHAA 2GJXA 4D6HA 1PPIA 4HOWA 3ARRA 3BAJA 3WF3A 1DEDA 1JYXA 3WDQA 3I3DA 1Q6FA 3AIWA 1H11A 1UWUA 1KGXA 1HKKA 3II1A 3VGHA 5M03A 3MANA 3LPGA 3VTRA 4AIUA 3WQWA 4NF7A 4E8CA 4IPLA 1ZS2A 1VB9A 2WWCA 4PCTA 4U5IA 4XB3A 3WNMA 4ATWA 4JKMA 1V3KA 3WMBA 3DC0A 2WMGA 2EPOA 3TTQA 3AHYA 2A3EA 1LJYA 2CESA 1QHOA 4JAWA 3CHCA 2D23A 1E4LA 1W9BM 3VIKA 2VURA 1DHKA 3T2OA 3ZT5A 3DECA 3PHAA 4L4PA 3FNDA 1Q4NX 3VGDA 1MFUA 2XVNA 4FF5A 1E0XA 3IJ9A 2FHCA 2XIBA 4AIEA 1E4IA 4HOXA 5A94A 2E8ZA 3TTSA 2J7EA 1VJZA 1FH9A 1MXDA 2CEQA 4J28A 2D2OA 3T0AA 2EQDA 2C8NA 3WFZA 2D49A 3B9AA 2WVVB 4MPKA 1W91A 1EQPA 4CN4A 4FLOA 1W2VA 2ZUTA 4UQBA 5CSUA 3VX0A 4XZWA 2WPGA 4AZHA 3GBEA 1W9DM 1QNQA 3SCVA 4U2ZA 1CGUA 1HJUA 3A47A 2A3AA 3AIEA 2PWDA 1J0IA 3N12A 3UG3A 4PMVA 2J62A 4QLKA 5A2BA 1C90A 1H1NA 1OGSA 1Y7VA 3OLDA 1HKIA 2CKRA 1BQCA 5I77A 3BAKA 4GI8A 4PMQA 3WQ8A 3POHA 1BG4A 4WKFA 3OGRA 1W9UA 5LA1A 1HP4A 4X0VA 2OSYA 4JKKA 2D24A 5HOSA 4HZ7A 3WD4A 5JBFA 2CBVA 2JFEX 1RH9A 1B31A 2QF8A 3U7BA 4D6CA 3F5LA 2XVPA 4U2YA 3AS2A 2E9MA 4TVUA 2J78A 2F2HA 1HT6A 3WNPA 5A8MA 4CGTA 2YL5A 2VX4A 4P7RA 3VNZA 2WMFA 3UG5A 1I75A 4HZ6A 5FL1A 6CGTA 1E15A 3EDFA 1TG7A 3RJYA 1J0ZA 2O9TA 1MQRA 5D4YA 4TVCA 2Z1KA 1FFRA 2JEQA 3BXWA 2ZX8A 4UQEA 5GPRA 5HDRA 3T2QA 2WSPA 4MJ4A 1VENA 1GJWA 3VO0A 1CXHA 2XGBA 3MMDA 1EQCA 1H2JA 2ZX9A 4P8WA 1KWKA 4S3JA 1JF5A 4XUYA 1ZJBA 4ZE4A 4MAZA 4TXEA 1TA3A 4HA1A 3KZSA 3N13A 3BAXA 3UEQA 4WKHA 1M53A 2CBJA 1ZBVA 4AZBA 2GDVA 1PAMA 3W6LA 3AZTA 1H4PA 3AJ7A 3VPLA 1W3KA 2V3EA 4Z2LA 1B3WA 2BS9A 1OM0A 4FMVA 1ESWA 5BCAA 2BVDA 4P8VA 1C8YA 2V5DA 1GQJA 1LL4A 4DWSA 1JDCA 4BF7A 4CVUA 2D1ZA 2E40A 4E4PA 2WHKA 1E6SM 3HJEA 4PCSA 3B9EA 4IUGA 2W63A 3AXHA 1OB0A 3GNRA 1GOWA 1MW0A 3GH7A 5EFFA 3L4TA 5AYBA 2VZVA 2WC7A 1RP9A 1CXEA 1AQHA 1ISZA 1UD8A 3BSHA 4PMUA 3N18A 2PC8A 2GVYA 3RDKA 1WDQA 4MDPA 1UD3A 2XPKA 1NOUA 1M03A 1VF8A 2GSJA 1WDSA 3GTNA 2EEXA 3ARPA 4PTVA 1JD9A 2WVTA 4UOJA 5A8OA 4NRSA 4MNLA 1NWUA 1GW1A 3WUBA 1US2A 4LX4A 2WKLA 3VVGA 2DSWA 3NSXA 1US3A 4HU8A 4AD0A 3BCFA 3U7VA 4UOQA 5A6MA 5I0DA 3VMNA 1OT2A 1KR0A 1QBAA 2JIEA 1JZ8A 1NWTA 2ZUNA 5LA0A 4DUXA 4AD5A 4MNMA 5IFTA 3EDJA 1OSEA 2WAGA 1WP6A 2XM1A 4WSKA 1GPFA 4CU6A 4CD7A 3DYPA 4W84A 5JH8A 3AMKA 8CGTA 3OLEA 1H5VA 3PTQA 1KGWA 4Y7EA 3SUTA 1B0IA 1M7XA 3BSGA 4AWEA 1UD5A 3W0KA 1ECEA 1XSIA 3PZQA 3WQ6A 5FKYA 3OB8A 5FOOA 3AHTA 4N0RA 4W7WA 3B9DA 5CPTA 1UWIA 2BXYA 2ZXAA 3K4AA 3AXXA 3KWXA 3U5YA 5IHSA 3ARQA 1YQ2A 4V28A 3NUKA 1J0HA 1UG6A 3PZ9A 2D22A 2WHJA 2WVSA 2PWFA 1CYGA 4E2OA 3AHXA 2Y5EA 3OA5A 1MVYA 2VCBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3IGS A;  3CEP A;  2HNH A;  4X61 A;  2EKC A;  3BIC A;  3LZ3 A;  1JZ6 A;  3WDP P;  3GR7 A;  3BW4 A;  2CLH A;  2QJH A;  1A49 A;  3VNJ A;  4KRZ A;  4LU0 A;  1HJW A;  1KV5 A;  1W3I A;  3R4I A;  1F6K A;  1WQ5 A;  4O53 A;  4JIC A;  1RR2 A;  3I6R A;  2WVV A;  1VHC A;  4R7J A;  1MRA A;  3L0G A;  3DBN A;  2WNN A;  4HBK A;  1XR2 A;  3I4E A;  2HIS A;  4GIS A;  1XRS A;  2NSO A;  2YKK A;  1V3H A;  3WEN A;  3WH6 A;  5DEL A;  2YDR A;  5BPV A;  4ODM A;  5EMM A;  1MQQ A;  3PVF A;  2UV8 G;  1J4I A;  3WLS A;  3ZJK A;  4XAY A;  3OW1 A;  4FIQ A;  1N8I A;  4L6H A;  1VP5 A;  3K1G A;  4KWV A;  3DYO A;  3OIH A;  3A24 A;  5K7J A;  1FWC C;  4ECL A;  3PS7 A;  3BGG A;  2FN2 A;  2RKX A;  1F8M A;  2YA1 A;  3GIP A;  3GVV A;  1WX0 A;  4Y9M A;  5K9D A;  2HDJ A;  2BZN A;  2B0M A;  4S3F A;  2EJ1 A;  4UQC A;  3AYR A;  3UPB A;  1ZBC A;  3RME A;  4PUE A;  4G6C A;  3M0X A;  2PDC A;  3B8V A;  3OYX A;  1Z3N A;  3CZE A;  4C6K A;  4P7Q A;  3K4W A;  3QR0 A;  2EG7 A;  4YN5 A;  4RJE A;  1DIE A;  3MUY 1;  1W1P A;  5C9U A;  5DO2 A;  2XUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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